Ellenberg Indicator Values in JUICE 6.5 - Vegetationsanalyse ...

Heike Culmsee & Florent Beck – Ergänzungen zum JUICE-Skript I – Stand: 08 Mai 2008 1Ellenberg Indicator Values in JUICE 6.5Heike Culmsee & Florent BeckAbt. Vegetationsanalyse & Phytodiversität, Albrecht-von-Haller Institut fürPflanzenwissenschaften der Universität GöttingenKontakt: heike.culmsee@bio.uni-goettingen.deA. GrundlagenÖkologische Gruppen sind aus dem Vergleich von Vegetation und Standort resultierendeGruppen von Pflanzensippen annähernd gleicher Existenz.Die ökologischen Zeigerwerte wurden von Prof. Dr. Heinz Ellenberg (Ellenberg et al., 2003)für Mitteleuropa auf Grundlage von langjähriger standortskundlicher Forschung entwickelt.Entlang eines Standortgradienten, der in mehrere Klassen unterteilt ist (Faktorenzahlen),werden die Arten entsprechend ihres ökologischen Verhaltens angeordnet. Das Vorkommender Arten wird dabei im Gefälle der Umweltfaktoren unter Freilandbedingungen, d.h. beistarker natürlicher Konkurrenz, betrachtet. Die Zeigerwerte sagen also nichts über die„Ansprüche“ (das physiologische Verhalten) aus.Die betrachteten Standortsgradienten beziehen sich auf klimatische Faktoren undBodenparameter:L Lichtzahl (Light)T Temperaturzahl (Temperature)K Kontinentalitätszahl (Continentality)F Feuchtezahl (Moisture)R Reaktionszahl (Reaction)N Stickstoffzahl (Nutrients)S Salzzahl (in JUICE nicht vorhanden)Übersicht über die Bedeutung der Zeigerwertzahlen für Mitteleuropa:

Heike Culmsee & Florent Beck – Ergänzungen zum JUICE-Skript I – Stand: 08 Mai 2008 2Zu beachten ist, dass die Ellenberg-Zeigerwerte jeweils nur regional anwendbar sind. Esliegen jedoch für andere Teile Europas, z.B. Griechenland und Italien, bereits weitere Listenmit Ellenberg-Zeigerwerten vor (siehe Böhling et al. 2002, Godefroid & Dana, 2007, Pignatti2005).Weiterführende Literatur (Auswahl):Böhling, N., Greuter, W. & Raus, T. (2002) Indicator values for vascular plants in theSouthern Aegean (Greece). Braun-Blanquetia, 32: 1–109.Diekmann, M. (2003): Species indicator values as an important tool in applied plant ecology -a review. Basic and Applied Ecology, 4: 493-506.Ellenberg, H., Weber, H.E., Düll, R., Wirth, V. & Werner, W. (2001): Zeigerwerte vonPflanzen in Mitteleuropa. Scripta Geobotanica 18, 3. Auflage, 262 S.Godefroid, S. & Dana, E.D. (2007): Can Ellenberg's indicator values for Mediterranean plantsbe used outside their region of definition? Journal of Biogeography, 34: 62–68.Pignatti, S., with coll. of Menegoni, P., Pietrosanti, S. (2005): Valori di bioindicazione dellepiante vascolari della Flora d’Italia. Bioindicator values of vascular plants of the Flora ofItaly. Braun-Blanquetia, 39: 3–95.Schwabe, A., Kratochwil, A. & Pignatti, S. (2007): Plant indicator values of a highphytodiversitycountry (Italy) and their evidence, exemplified for model areas withclimatic gradients in the southern inner Alps. Flora, 202: 339–349.B. Anwendung der Ellenberg Indicator Value Funktionen in JUICEAchtung :Ellenberg-Zeigerwerte können nur angezeigt werden, wenn ein Projekt mitAufnahme- und Artendaten geladen ist.1. Initialisierung der Ellenberg Indicator Value FunktionenDie Daten bezüglich der Ellenberg Zeigerwerte werden in JUICE 6.5 nicht automatischangezeigt. Sie müssen deshalb vor jede Bearbeitung eingeladen werden. Der Ellenberg-Datenimport erfolgt in Form einer Datei in Textformat (*.txt).Hierbei wird im “Indicator Values”-Menü der Befehl “Initiation” gewählt. (Abb. 1).Abb. 1: “Indicator Values”-MenüIm geöffneten Fenster (Abb. 2, Pfeil 1) wird nun der “Initiation of indicator values”-Buttongedrückt. Die Datei “ELLENB.txt” wird über die angezeigte Verzeichnisstruktur gesucht. DieDatei wurde bei der Installation von JUICE 6.5 im Programmordner abgelegt und ist beiStandardinstallation in folgendem Verzeichnis zu finden: C:\Programme\JUICE6.5\ELLENB.txt. Falls nur eingeschränkte Schreibrechte bestehen sollten, kann die Dateiauch in jedes beliebige Verzeichnis kopiert und dort initialisiert werden.

Heike Culmsee & Florent Beck – Ergänzungen zum JUICE-Skript I – Stand: 08 Mai 2008 31Abb. 2: Initiation der Indicator ValuesMitunter sind nicht alle in den Aufnahmen vorkommenden Arten in der importierten Tabellevorhanden. Diese Arten sind in roter Schrift gesetzt und die Indikator-Werte werden für sienicht angezeigt. Dies gilt in unserem Bielstein-Datensatz z.B. für den Dornigen WurmfarnDryopteris carthusiana. Über den Button „Manual selection of species“ können wirüberprüfen, ob die Art tatsächlich in der Liste fehlt (Abb. 3).Abb. 3: Manuelle Auswahl von ArtenEs öffnet sich in der rechten Hälfte der Registerkarte die vollständige Liste der DateiELLENB.txt. Über „Find name“ kommen wir schnell zu den Einträgen zur GattungDryopteris. Es stellt sich heraus, dass die vollständige Eintragung in der ELLENB.txt Dateilautet:3787.Dryopteris carthusiana (spinulosa) 5 x 3 x 4 3

Heike Culmsee & Florent Beck – Ergänzungen zum JUICE-Skript I – Stand: 08 Mai 2008 4In unserer in JUICE hinterlegten Referenzartenliste GERMANSL.txt lautet jedoch der Eintragfür dieselbe Art:2032DRYOCAR Dryopteris carthusianaBei ersterem Eintrag wird neben dem derzeit gültigen Namen Dryopteris carthusiana (Vill.)H.P.Fuchs noch in Klammern das Synonym Dryopteris spinulosa (O.F.Müller) Kuntzeangegeben. Damit sind die Namen von JUICE nicht mehr kongruent erkennbar.Wir wählen im rechten Feld Dryopteris carthusiana (spinulosa)aus (Anklicken desNamens und darauf erfolgende Blau-Färbung) und ersetzen Dryopteris carthusiana überden Button „Replace“.Die Liste auf der linken Seite wird Art für Art auf Vollständigkeit überprüft und dieSynonyme ersetzt. Für Arten, die nicht bis zur Art bestimmt wurden, wie z.B. Betula species,kann dabei keine Angabe der Zeigerwerte erfolgen. Für einige Arten wurden bisher keineEllenberg-Zeigerwerte ermittelt, so für Aesculus hipposcastanum L.Auch für Rubus fruticosus agg. gibt es keine Angaben. Wenn die Gattung Rubus bis zurKleinart bestimmt wurde, können die Ellenberg-Zeigerwerte manuell nachgetragen werden.Sie liegen in separater Liste in Ellenberg et al. (2001) vor.Ebenso liegen in Ellenberg et al. (2001) Listen für Moose und Flechten vor, die bisher nicht indie ELLENB.txt Datei integriert wurden und daher manuelle eingefügt werden müssen.Dies soll hier am Beispiel des Mooses Dicranum scoparium (Ellenberg et al. 2001, S. 190)gezeigt werden (Abb. 4).Abb. 4: Manuelles Einfügen von Ellenberg-Zeigerwerten am Beispiel des Mooses Dicranumscoparium nach der Liste von Ellenberg et al. (2001)Für Dicranum scoparium tragen wir die Zeigerwerte: 5 x 5 4 4 untereinander in dieFelder in der Mitte des Fensters ein. Beachten Sie, dass es in der Moos-Liste N-Werte nichtgibt.Wenn alle Arten in der Liste überprüft und die fehlenden Ellenberg-Zeigerwerte, soweitmöglich, ergänzt wurden, schließen Sie bitte das „Indicator Values – Initiation“ Fenster überden „OK“-Button.

Heike Culmsee & Florent Beck – Ergänzungen zum JUICE-Skript I – Stand: 08 Mai 2008 52. Anzeigen von Indicator Values für die ArtenJeweils einer der ökologischen Zeigerwerte L, T, K, F, R oder N kann in JUICE artspezifischangezeigt werden.Wir stellen die Anzeige über das Menu „Species“ – „Species Data“ – „Indicator Value“ –Auswahl der verschiedenen Indicator Values ein. In der dritten Spalte (nach Artnamen undLayer) werden nun die jeweils gewählten Indicator Values angezeigt (Abb. 5).Abb. 5: Anzeigen von Indicator Values für die Arten.In den Fällen, in denen keine Angaben über den jeweiligen Zeigerwert vorliegen, wird dieZeichenfolge angezeigt (Abb. 6).Abb. 6: Anzeige von nicht vorhandenen Indikatorwerten.

Heike Culmsee & Florent Beck – Ergänzungen zum JUICE-Skript I – Stand: 08 Mai 2008 63. Berechnung von durchschnittlichen Zeigerwerten für AufnahmenÜber das Menü „Indicator Values“ – „Calculation for Relevés” verwandelt sich derMauszeiger in ein Fragezeichen, mit dem man auf eine der Aufnahmen klicken kann.Es öffnet sich ein Fenster, in dem die durchschnittlichen Ellenberg-Zeigerwerte für dieausgewählte Aufnahme kalkuliert werden (Abb. 7).Abb. 7: Berechnung der Zeigerwerte für eine bestimmte AufnahmeIn dem in Abb. 7 gezeigten Beispiel ist Light rot hervorgehoben. Fährt man mit der Maus überdie Bezeichnungen Light, Continentality etc., so verwandelt sich die Maus in einenschwarzen, aufwärts zeigenden Pfeil (). Mit diesem Pfeil kann man jeden beliebigen derZeigerwert-Gruppen auswählen.Der jeweils rot markierte Zeigerwert kann über den Button „Add value LIGHT to the head“(oder entsprechend „Add value TEMPERATURE to the head“ etc.) in die Kopfzeile derTabelle geladen werden. Dort wird dieser Zeigerwert nicht nur für die ursprünglichausgwählte Aufnahme, sondern dann für alle Aufnahmen angezeigt. Der Kopf ließt sich ineiner Spalte von oben nach unten, z.B. 2.4.4. Export von Ellenberg-ZeigerwertenDer Button „Export Values for COLOR relevés” (Abb. 7) ermöglicht den Export für eineausgewählte Anzahl von Aufnahmen, die zuvor in der Hauptansicht mit einer bestimmtenFarbe markiert wurden. Falls jedoch nur eine einzige Farbe vorhanden ist (z.B. WHITE), dannkann über diese Funktion auch die vollständige Liste der Ellenberg-Zeigerwerte für alleAufnahmen exportiert werden.Achtung: Beachten Sie, dass jeweils die Farbe genannt wird, die in der Symbolleiste aktiv ist.Der Export erfolgt in Form einer Text-Datei (ECOL.txt, Abb. 8).

Heike Culmsee & Florent Beck – Ergänzungen zum JUICE-Skript I – Stand: 08 Mai 2008 7Abb. 8: Exportierte ECOL.txt Datei.Die erste Zeile der Text-Datei enthält Namen von Variablen. Neben den Ellenberg IndicatorValues werden dabei auch die Aufnahme-Nummer und verschiedene Diversitäts-Indices (noof all species = richness; Shannon-Wiener index) exportiert.In der zweiten Zeile folgen die Werte für die erste Aufnahme, in der dritten Zeile für diezweite Aufnahme etc.Die Variablen/Werte sind durch Semikola voneinander getrennt (semikolon delimited textfile). Dies ermöglicht uns das problemlose Einlesen der Text-Datei in Excel über folgendeArbeitsschritte: Wir starten das Programm Microsoft-Excel über Start – Programme. Über Datei – Öffnen öffnen wir die Datei ECOL.txt. Hierbei muss der Dateityp „AlleDateien“ ausgewählt werden, damit auch die Text-Datei sichtbar wird. Es öffnet sich ein Textkonvertierungs-Assistent (Abb. 9).Abb. 9: Textkonvertierungs-Assistent in MS Excel Weiter – Auswahl von „Semikolon“ als Trennzeichen. Die Daten werden in das Excel- Spalten- und Zeilen-Format eingelesen und könnenweiter ausgewertet werden.