Package 'MuMIn'

2 MuMIn-package
R topics documented:
MuMIn-package . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 2
AICc . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 3
Beetle . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 5
Cement . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 7
dredge . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 8
Formula manipulation . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 13
gamm-wrapper . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 14
get.models . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 15
importance . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 16
Information criteria . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 17
Model utilities . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 18
model.avg . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 20
model.sel . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 23
MuMIn-models . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 25
par.avg . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 26
pdredge . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 27
predict.averaging . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 29
QAIC . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 32
QIC . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 34
r.squaredGLMM . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 35
r.squaredLR . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 37
subset.model.selection . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 38
Weights . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 40
Index 42
MuMIn-package Multi-model inference
Description
Details
The package MuMIn contains functions to streamline information-theoretic model selection and
carry out model averaging based on the information criteria.
The collection of functions includes:
dredge performs automated model selection with subsets of the supplied ‘global’ model, and optional
choices of other model properties (such as different link functions). The set of models
may be generated either with ‘all possible’ combinations, or tailored according to the conditions
specified.
pdredge does the same, but can parallelize model fitting process using a cluster.
model.sel creates a model selection table from hand-picked models.
model.avg calculates model averaged parameters, with standard errors and confidence intervals.