Phyre 2 Results for C6KSU6

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Phyre 2 Results for C6KSU6

Secondary structure and

disorder prediction

Email l.a.kelley@imperial.ac.uk

Description C6KSU6

Mon Jul 23 09:47:29 BST

Date

2012

Unique Job

ID f17d549b3ba32d67

1 . . . . . . . . 10 . . . . . . . . . 20 . . . . . . . . . 30 . . . . . . . . . 40 . . . . . . . . . 50 . . . . . . . . . 60

Sequence M M D E N H K D D N I H Y D K E S S L F I Y D I N S D K E K D E E K K L G E S N K Y S N I E Q N N V N N N K L E N N V D

Secondary

structure

SS

confidence

Disorder ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ?

Disorder

confidence

. . . . . . . . . 70 . . . . . . . . . 80 . . . . . . . . . 90 . . . . . . . . . 100 . . . . . . . . . 110 . . . . . . . . . 120

Sequence D V N N D D V L K Y Y N I V K N N K I N D E I L Q L Q I Q H L L N F N K K S E T Y E E K Q K R V M L G Y L N D D D I D Y

Secondary

structure

SS

confidence

Disorder ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ?

Disorder

confidence

. . . . . . . . . 130 . . . . . . . . . 140 . . . . . . . . . 150 . . . . . . . . . 160 . . . . . . . . . 170 . . . . . . . . . 180

Sequence M L Y D K S D E E F L S N F M E D L N N F K N I H L I E K H E S N I K K N G I I Y S I D Y E K I I Y K E R R L P D I N N

Secondary

structure

SS

confidence

Disorder ? ? ? ? ? ? ? ? ? ?

Disorder

confidence

. . . . . . . . . 190 . . . . . . . . . 200 . . . . . . . . . 210 . . . . . . . . . 220 . . . . . . . . . 230 . . . . . . . . . 240

Sequence M N I N N I L Y Y Y

Secondary

structure

SS

confidence

F Y S N Q E Y L M N I K N R N I Y T Y D S Y I F E N D Q M S D F S Q D E K Y N S Y S D S Q S T I S D

Disorder

Disorder

confidence

? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ?

. . . . . . . . . 250 . . . . . . . . . 260 . . . . . . . . . 270 . . . . . . . . . 280 . . . . . . . . . 290 . . . . . . . . . 300

Sequence E D L L L L R Y D D N S E Y D D E A K I

Secondary

structure

SS

confidence

Y M N K K R R K N K R D R K K N K R G K G N K K K M I P V E K R R H H N N M Y D

Disorder

Disorder

confidence

? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ?

. . . . . . . . . 310 . . . . . . . . . 320 . . . . . . . . . 330 . . . . . . . . . 340 . . . . . . . . . 350 . . . . . . . . . 360

Sequence N N N N N N Y D D D D D D D N D N D N D N D D Y K S Y K Y N D K K K K Y N E K L

Secondary

structure

SS

confidence

L K T A E P S K M N K E I E A M M N K A

Disorder ?

Disorder

confidence

? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ?

. . . . . . . . . 370 . . . . . . . . . 380 . . . . . . . . . 390 . . . . . . . . . 400 . . . . . . . . . 410 . . . . . . . . . 420

Sequence N N C Y I N Q N F N E C I I L L E K V I

Secondary

structure

SS

confidence

Disorder

Disorder

confidence

K K S P C L H D P F H L L G L I Y E R E Y K N L K K A I N Y Y L I A A H L S H G

. . . . . . . . . 430 . . . . . . . . . 440 . . . . . . . . . 450 . . . . . . . . . 460 . . . . . . . . . 470 . . . . . . . . . 480

Sequence D F L S WY N I I D L C K I E K E Y N V V I Y C L Y K V L K F Y K R K K Y K C K K N Y V E Y D E N N E WQ H N Q N F I S


Secondary

structure

SS

confidence

Disorder ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ?

Disorder

confidence

. . . . . . . . . 490 . . . . . . . . . 500 . . . . . . . . . 510 . . . . . . . . . 520 . . . . . . . . . 530 . . . . . . . . . 540

Sequence N N I T Y D T V N L H D N I L N M C D D V V WG N K E I N T H K E N N N D D G N N N V D G N N N D D D N N N N D D N N N

Secondary

structure

SS

confidence

Disorder ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ?

Disorder

confidence

. . . . . . . . . 550 . . . . . . . . . 560 . . . . . . . . . 570 . . . . . . . . . 580 . . . . . . . . . 590 . . . . . . . . . 600

Sequence N N C N N N N F Y G Y N K K D D Y S L N N Q F D N F M R H I Y F N L A F T Y I L L E D Y K N A L K N L F I L K N N N Y S

Secondary

structure

SS

confidence

Disorder ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ?

Disorder

confidence

. . . . . . . . . 610 . . . . . . . . . 620 . . . . . . . . . 630 . . . . . . . . . 640 . . . . . . . . . 650 . . . . . . . . . 660

Sequence S Y D L I I D I Y I

Secondary

structure

SS

confidence

C I C L V H I N N A S D C Y N F L K N I Y V Y N I C K R K N E E N Y S Y S Y Q E K V L I C L L M Q T

Disorder

Disorder

confidence

? ?

. . . . . . . . . 670 . . . . . . . . . 680 . . . . . . . . . 690 . . . . . . . . . 700 . . . . . . . . . 710 . . . . . . . . . 720

Sequence Q I L N N K Y D E C I F V Y K T L T K E N D Y V H I D I F L Q F I K A V I M R G H M E S S Y L I R T H F L Q I I L A S Y

Secondary

structure

SS

confidence

Disorder ?

Disorder

confidence

. . . . . . . . . 730 . . . . . . . . . 740 . . . . . . . . . 750 . . . . . . . . . 760 . . . . . . . . . 770 . . . . . . . . . 780

Sequence Y L F E D I I Y S L

Secondary

structure

SS

confidence

G D T Y Y L K N M F E G A I Y F Y T L I Y K K R K H T Y F K N I R S I K N G H K T N S G N N K I N D

Disorder

Disorder

confidence

? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ?

. . . . . . . . . 790 . . . . . . . . . 800 . . . . . . . . . 810 . . . . . . . . . 820 . . . . . . . . . 830 . . . . . . . . . 840

Sequence N R N N K I N D N R N N K I N E S I N D Y V N F N V N N N P Q N N H T S G WN T H L M T S L K N E N S T K H P N F S N I

Secondary

structure

SS

confidence

Disorder ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ?

Disorder

confidence

. . . . . . . . . 850 . . . . . . . . . 860 . . . . . . . . . 870 . . . . . . . . . 880 . . . . . . . . . 890 . . . . . . . . . 900

Sequence Y L E N E E M N N M M Y S Q M D N I I W F D N K I N F I Q V

Secondary

structure

SS

confidence

I Y K L V K S Y Y Y I E N Y I K A E K I I L K I L N N E H I

Disorder

Disorder

confidence

?

. . . . . . . . . 910 . . . . . . . . . 920 . . . . . . . . . 930 . . . . . . . . . 940 . . . . . . . . . 950 . . . . . . . . . 960

Sequence E K N N I E I D L K T L Y I D I L Y K L K K Y N E S I N V L L S I R E K K L R F I C S I P K P L N N K E R E I L L L K I

Secondary

structure

SS

confidence

Disorder ? ? ?


Disorder

confidence

. . . . . . . . . 970 . . . . . . . . . 980 . . . . . . . . . 990 . . . . . . . . . 1000 . . . . . . . . . 1010 . . . . . . . . . 1020

Sequence L N K K N K L L L Y

Secondary

structure

SS

confidence

T Q H N N Y I L H I F Y I Y K Q N K N Y N S T N Y Q Y D N Y L L N K D I N D I I Q I Q K N I C F C Y

Disorder

Disorder

confidence

? ? ? ? ? ? ? ?

. . . . . . . . . 1030 . . . . . . . . . 1040 . . . . . . . . . 1050 . . . . . . . . . 1060 . . . . . . . . . 1070 . . . . . . . . . 1080

Sequence F C V K Y N F V I L

Secondary

structure

SS

confidence

N Y I Y L Y N I F H I L Y N K Q I N S S S F M K N K Q I L W N I Y K F R K Y L Q Y L T S S F S I L K

Disorder

Disorder

confidence

? ? ? ? ? ? ? ? ? ?

. . . . . . . . . 1090 . . . . . . . . . 1100 . . . . . . . . . 1110 . . . . . . . . . 1120 . . . . . . . . . 1130 . . . . . . . . . 1140

Sequence K G K K V L Y D WD I I H K N F Q S K E

Secondary

structure

SS

confidence

T K L F Y K G V M I I D I K N F I Y D N K K N N R N D D I N R Y D D I N R Y D D

Disorder ?

Disorder

confidence

? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ?

. . . . . . . . . 1150 . . . . . . . . . 1160 . . . . . . . . . 1170 . . . . . . . . . 1180 . . . . . . . . . 1190 . . . . . . . . . 1200

Sequence I N R Y D D I N R Y

Secondary

structure

SS

confidence

D D I N H Y D D I N H Y D D I N H Y D D I N H Y D D I N C Y D K G D V N V Y Q N I K E N K I E E H K

Disorder ?

Disorder

confidence

? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ?

. . . . . . . . . 1210 . . . . . . . . . 1220 . . . . . . . . . 1230 . . . . . . . . . 1240 . . . . . . . . . 1250 . . . . . . . . . 1260

Sequence K K E D G E E P F P C A Q K L S N A S L I N N N N N K D D H H I N D K K N N V I I E E F Y K N I Y K Y K C N I E S E I L

Secondary

structure

SS

confidence

Disorder ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ?

Disorder

confidence

. . . . . . . . . 1270 . . . . . . . . . 1280 . . . . . . . . . 1290 . . . . . . . . . 1300 . . . . . . . . . 1310 . . . . . . . . . 1320

Sequence N S K I I M K F Y K F S Y N F F Y L L Y E M E R D F N R I Q T Y M E K E N L N F R S K N N Q K N N V E M N K K K N N E Y

Secondary

structure

SS

confidence

Disorder ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ?

Disorder

confidence

. . . . . . . . . 1330 . . . . . . . . . 1340 . . . . . . . . . 1350 . . . . . . . . . 1360 . . . . . . . . . 1370 . . . . . . . . . 1380

Sequence D D H K R N E E A P

Secondary

structure

SS

confidence

S Y G K K I L M D N K M D D G D D D D D Y Y Y Y D D N Y F N D K Y S D K E N D H D N Y T H M N V H L

Disorder ?

Disorder

confidence

? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ?

. . . . . . . . . 1390 . . . . . . . . . 1400 . . . . . . . . . 1410 . . . . . . . . . 1420 . . . . . . . . . 1430 . . . . . . . . . 1440

Sequence E N I E K S L I N K T N T K N M Q R F R R I S F L L T K K R L N F F S F E S Y L G L Y F S L L F L E E C F F L I S I M N

Secondary

structure

SS

confidence

Disorder ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ?

Disorder

confidence

. . . . . . . . . 1450 . . . . . . . . . 1460 . . . . . . . . . 1470 . . . . . . . . . 1480 . . . . . . . . . 1490 . . . . . . . . . 1500

Sequence L Y E D S I H M L S V Y L R N R K S N K M K S L T Y F K S I K N E F K K Y H I N N N L L N L N F Y F F D N V Y T N N I R


Secondary

structure

SS

confidence

Disorder ?

Disorder

confidence

. . . . . . . . . 1510 . . . . . . . . . 1520 . . . . . . . . . 1530 . . . . . . . . . 1540 . . . . . . . . . 1550 . . . . . . . . . 1560

Sequence N E I K N E Y C N L

Secondary

structure

SS

confidence

K H M N K Y I D C K Y Y I F R I N L L L N K L Y I S A G N Y D K Q I K C L N D I Y I F N K K Q K E E

Disorder

Disorder

confidence

? ? ?

. . . . . . . . . 1570 . . . . . . . . . 1580 . . . . . . . . . 1590 . . . . . . . . . 1600 . . . . . . . . . 1610 . . . . . . . . . 1620

Sequence Y K I L K Y Y S D I

Secondary

structure

SS

confidence

Disorder

Disorder

confidence

V L T G K F C H D F L T S I S K S K N K N I L I S F R L F L V R S I H Y K K S N P F L L Y L I G H I

. . . . . . . . . 1630 . . . . . . . . . 1640 . . . . . . . . . 1650 . . . . . . . . . 1660 . . . . . . . . . 1670 . . . . . . . . . 1680

Sequence C N I S C M I T N A V H E F T R A Y T F L L K N R R E N K E K M D N F R N Q D V K WM K K N K H E M V N E E E D Q E V D

Secondary

structure

SS

confidence

Disorder ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ?

Disorder

confidence

. . . . . . . . . 1690 . . . . . . . . . 1700 . . . . . . . . . 1710 . . . . . . . . . 1720 . . . . . . . . . 1730 . . . . . . . . . 1740

Sequence D D D D D D D N D G D D S D G D D N D G D D S D G D D N D G D D S D G D D N D G D D S D G D D N D G D D S D E F L Y D Y

Secondary

structure

SS

confidence

Disorder ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ?

Disorder

confidence

. . . . . . . . . 1750 . . . . . . . . . 1760 . . . . . . . . . 1770 . . . . . . . . . 1780 . . . . . . . . . 1790 . . . . . . . . . 1800

Sequence P Y N R N I Q Q E K

Secondary

structure

SS

confidence

L I T G R Q F D D A N S Y D N S D K G D Q G E H D D N E D R F L F A D L K L S S N N N K E K D E E Y

Disorder ?

Disorder

confidence

? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ?

. . . . . . . . . 1810 . . . . . . . . . 1820 . . . . . . . . . 1830 . . . . . . . . . 1840 . . . . . . . . . 1850 . . . . . . . . . 1860

Sequence I N S F E N I C D N I N F L F S L T V S Y F N Y S S C F R V E N R E S V I M T S F C L L N E Y I Y K R Y E Q K I L N K K

Secondary

structure

SS

confidence

Disorder

Disorder

confidence

. . . . . . . . . 1870 . . . . . . . . . 1880 . . . . . . . . . 1890 . . . . . . . . . 1900 . . . . . . . . . 1910 . . . . . . . . . 1920

Sequence K K Y K K Y S L F Y K I Y K Y I Y L A E I L Y N L A R A L H H L S Y Y N E C M K L Y L T V I D L I K A A D K E I L WV I

Secondary

structure

SS

confidence

Disorder

Disorder

confidence

. . . . . . . . . 1930 . . . . . . . . . 1940 . . . . . . . . . 1950 . . . . . . . . . 1960 . . . . . . . . . 1970 . . . . . . . . . 1980

Sequence K R N N L N I N E R F I Y N Y V I N M N K C M C F T C L N F S F R N N K S C Y N K L I N Y F L N L N T K Y S N F Y L L F

Secondary

structure

SS

confidence

Disorder ? ?


Disorder

confidence

. . . . . . . . . 1990 . . . . . . . . . 2000 . . . . . . . . . 2010 . . . . . . .

Sequence F D K K H L L F S A

Secondary

structure

SS

confidence

S Y N L S V I F R K F N R F E Q A K Y I L N N I I WD

Disorder

Disorder

confidence

? ?

Confidence Key

High(9) Low (0)

? Disordered

Alpha helix

Beta strand

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