Phyre 2 Results for C6KSN4

sbg.bio.ic.ac.uk

Phyre 2 Results for C6KSN4

Secondary structure and

disorder prediction

Email l.a.kelley@imperial.ac.uk

Description C6KSN4

Mon Jul 23 09:47:14 BST

Date

2012

Unique Job

ID e70de1e0bba16a97

1 . . . . . . . . 10 . . . . . . . . . 20 . . . . . . . . . 30 . . . . . . . . . 40 . . . . . . . . . 50 . . . . . . . . . 60

Sequence M E K D E F Y E K Y

Secondary

structure

SS

confidence

K E Y Y G D D I S D I P L M V P G R N I G L H D L Y L S V L K H G G Y S C V S R N A K WL K I A K E

Disorder ?

Disorder

confidence

? ? ? ?

. . . . . . . . . 70 . . . . . . . . . 80 . . . . . . . . . 90 . . . . . . . . . 100 . . . . . . . . . 110 . . . . . . . . . 120

Sequence F N L I N K E K N I K I I E T K S I K E Y Y L N Y L R E F E R I H D N L K K G K I V T K R Y R N C K S N N N I E V K D K

Secondary

structure

SS

confidence

Disorder ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ?

Disorder

confidence

. . . . . . . . . 130 . . . . . . . . . 140 . . . . . . . . . 150 . . . . . . . . . 160 . . . . . . . . . 170 . . . . . . . . . 180

Sequence K K K G T T N K K K K E K G N E N L N G T V E N N I C G A L S N N L D G A L T N N L N G A L T N N L N G A L T N N L N G

Secondary

structure

SS

confidence

Disorder ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ?

Disorder

confidence

. . . . . . . . . 190 . . . . . . . . . 200 . . . . . . . . . 210 . . . . . . . . . 220 . . . . . . . . . 230 . . . . . . . . . 240

Sequence S L T N N L N G A L T N N L N G T V A N N L Y G S F P N H V G N N F T N N L S V C L P N N M I K T Q E L I N N N T C P N

Secondary

structure

SS

confidence

Disorder ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ?

Disorder

confidence

. . . . . . . . . 250 . . . . . . . . . 260 . . . . . . . . . 270 . . . . . . . . . 280 . . . . . . . . . 290 . . . . . . . . . 300

Sequence N F Y N N V N D G T Y R R N A L A L N M D T I H N M N N M N I C R N E N N N E I P I N S D Y N I Y N N I Y N N I H N S E

Secondary

structure

SS

confidence

Disorder ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ?

Disorder

confidence

. . . . . . . . . 310 . . . . . . . . . 320 . . . . . . . . . 330 . . . . . . . . . 340 . . . . . . . . . 350 . . . . . . . . . 360

Sequence C S N V H N S I Q N N I H N N I Y N S I P N N M D N C I N N N V Q N N I Y N N N N N N N S N Y Y Y Y Y L T N M V Y N G K

Secondary

structure

SS

confidence

Disorder ? ? ? ? ? ? ?

Disorder

confidence

. . . . . . . . . 370 . . . . . . . . . 380 . . . . . . . . . 390 . . . . . . . . . 400 . . . . . . . . . 410 . . . . . . . . . 420

Sequence T L E N N N N N N M N D N I I P Y S A N M T Y M N N L P Y M T N P S I Y T Y K E Y I N N N I Y T N K E WE N N N I Y V N

Secondary

structure

SS

confidence

Disorder ?

Disorder

confidence

. . . . . . . . . 430 . . . . . . . . . 440 . . . . . . . . . 450 . . . . . . . . . 460 . . . . . . . . . 470 . . . . . . . . . 480

Sequence K T Y M N N N N N N N N N N N S S S S V S S S R Y N V R Y G E Y C P Y L Y N N K L S P L A P S N F A R M N I K D S L N N

Secondary


Secondary

structure

SS

confidence

Disorder ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ?

Disorder

confidence

. . . . . . . . . 490 . . . . . . . . . 500 . . . . . . . . . 510 . . . . . . . . . 520 . . . . . . . . . 530 . . . . . . . . . 540

Sequence D M S K Y F K Q T Y M G M M N N G N G N G Y G N V L Y D N T Y M N Y Y N N M Y M G Y N N Y Y N N K Y M G Y N N N M V R D

Secondary

structure

SS

confidence

Disorder ? ? ? ? ? ? ? ? ?

Disorder

confidence

. . . . . . . . . 550 . . . . . . . . . 560 . . . . . . . . . 570 . . . . . . . . . 580 . . . . . . . . . 590 . . . . . . . . . 600

Sequence N L K T N K I N D Y K K V I R K L K E N K C I D I Y R I L L S I H R R K E K V A D F I F C L N L F Y S I S M M K D I I S

Secondary

structure

SS

confidence

Disorder ? ?

Disorder

confidence

. . . . . . . . . 610 . . . . . . . . . 620 . . . . . . . . . 630 . . . . . . . . . 640 . . . . . . . . . 650 . . . . . . . . . 660

Sequence L K Q I N I I I C L L I V T L E D I L K I F Y H N F N F K K R S L N I M I E S F S E Y L L D N E E V Q I L E F F Q K L N

Secondary

structure

SS

confidence

Disorder ? ? ? ? ? ? ? ? ? ?

Disorder

confidence

. . . . . . . . . 670 . . . . . . . . . 680 . . . . . . . . . 690 . . . . . . . . . 700 . . . . . . . . . 710 . . . . . . . . . 720

Sequence N E N V V S D K D N Y I L S R F N K M I D E R I K D V L K Q K K R K N I Y Q Q E I I K D F I I D N E K P L D E N G K N S

Secondary

structure

SS

confidence

Disorder ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ?

Disorder

confidence

. . . . . . . . . 730 . . . . . . . . . 740 . . . . . . . . . 750 . . . . . . . . . 760 . . . . . . . . . 770 . . . . . . . . . 780

Sequence V D I I K S L S H E E I N I M D I F R L Y S F Y D Y Y R K Y K K R K V K K I K N K D T S R N R K G S N N M I S N K M K K

Secondary

structure

SS

confidence

Disorder ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ?

Disorder

confidence

. . . . . . . . . 790 . . . . . . . . . 800 . . . . . . . . . 810 . . . . . . . . . 820 . . . . . . . . . 830 . . . . . . . . . 840

Sequence I H I L S E D D N K R N I N V D K R K G H N M D N N K N I A S Q S C E C N S N G Y S S L N S S D I E H L F S K K K K K R

Secondary

structure

SS

confidence

Disorder ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ?

Disorder

confidence

. . . . . . . . . 850 . . . . . . . . . 860 . . . . . . . . . 870 . . . . . . . . . 880 . . . . . . . . . 890 . . . . . . . . . 900

Sequence C S F N I Y K D K K E K K E Y L A Q K S C F E F V Y L I L Y I L N N L F L I D E Y N L Y F S N I K I Y Y K K D K Y Q K M

Secondary

structure

SS

confidence

Disorder ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ?

Disorder

confidence

. . . . . . . . . 910 . . . . . . . . . 920 . . . . . . . . . 930 . . . . . . . . . 940 . . . . . . . . . 950 . . . . . . . . . 960

Sequence K N I N N N K S S C N M V K N D N I I K N K E Q I Q K D N N K K K N E N I T N D T I M C N K R K I F K H N E K V D D D Y

Secondary

structure

SS

confidence

Disorder ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ?

Disorder


confidence

. . . . . . . . . 970 . . . . . . . . . 980 . . . . . . . . . 990 . . . . . . . . . 1000 . . . . . . . . . 1010 . . . . . . . . . 1020

Sequence Y Y Y Y N R D G N I K R S N Y C F N N C I D T T Y S N N N I F L R K R D C E K N N I I V D D D I S C I Y V S D H L V S S

Secondary

structure

SS

confidence

Disorder ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ?

Disorder

confidence

. . . . . . . . . 1030 . . . . . . . . . 1040 . . . . . . . . . 1050 . . . . . . . . . 1060 . . . . . . . . . 1070 . . . . . . . . . 1080

Sequence S S C S S S S I N S M Y S Y K K A K G S N K K I N R G I T R S Y A K I L N D K K T K N V E N I E C A R K V G N D N Q E N

Secondary

structure

SS

confidence

Disorder ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ?

Disorder

confidence

. . . . . . . . . 1090 . . . . . . . . . 1100 . . . . . . . . . 1110 . . . . . . . . . 1120 . . . . . . . . . 1130 . . . . . . . . . 1140

Sequence N N F F S K E G R I S N T R D V I K N E E K H S K K H F N I L Q K K R G H M N I Y C E Q N N N I M G K K K K Q K Y N I V

Secondary

structure

SS

confidence

Disorder ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ?

Disorder

confidence

. . . . . . . . . 1150 . . . . . . . . . 1160 . . . . . . . . . 1170 . . . . . . . . . 1180 . . . . . . . . . 1190 . . . . . . . . . 1200

Sequence N D K F Y S N Y D D S S A F V D WF N S G T F I K D S I S T I G D T K M D V H K L N Y I P I N N Y K I N K N N N I N E G

Secondary

structure

SS

confidence

Disorder ? ? ? ? ? ? ? ?

Disorder

confidence

. . . . . . . . . 1210 . . . . . . . . . 1220 . . . . . . . . . 1230 . . . . . . . . . 1240 . . . . . . . . . 1250 . . . . . . . . . 1260

Sequence V P S Y Y L E Y N L D K L Y G K Y WK K G G K K N Y T F S L L E Y E K I S N D P R G I Y I D H K R K E K N D K G V N N G

Secondary

structure

SS

confidence

Disorder ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ?

Disorder

confidence

. . . . . . . . . 1270 . . . . . . . . . 1280 . . . . . . . . . 1290 . . . . . . . . . 1300 . . . . . . . . . 1310 . . . . . . . . . 1320

Sequence F T N C R R N F T Y P L I N G T F D D I S I K C Y G K K N I T E V Y N T C D N I K K K Q N I N Y L M N K T F V N D T N E

Secondary

structure

SS

confidence

Disorder

Disorder

confidence

. . . . . . . . . 1330 . . . . . . . . . 1340 . . . . . . . . . 1350 . . . . . . . . . 1360 . . . . . . . . . 1370 . . . . . . . . . 1380

Sequence N V Y S S F F N T T N F N T P N N D T T N Y D N I G Y N Y I V T N Y N T P H V C N N N T V WN Q N G D Y S E L C T I E K

Secondary

structure

SS

confidence

Disorder ? ? ? ? ? ? ? ?

Disorder

confidence

. . . . . . . . . 1390 . . . . . . . . . 1400 . . . . . . . . . 1410 . . . . . . . . . 1420 . . . . . . . . . 1430 . . . . . . . . . 1440

Sequence H L N N T N L R C E M N G I N Y I D D V N N M N Y V D D V N D M G Y M N N V N N I N S M N S M N N I N S I N S M N N M N

Secondary

structure

SS

confidence

Disorder ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ?

Disorder

confidence

. . . . . . . . . 1450 . . . . . . . . . 1460 . . . . . . . . . 1470 . . . . . . . . . 1480 . . . . . . . . . 1490 . . . . . . . . . 1500

Sequence T M N S M N S M H N M N S M N S M Y N M N S M N S M N S L N N V N N M I N M Y D M N N N L Y V L N N Y Y D D M N Y Y N I

Secondary


structure

SS

confidence

Disorder ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ?

Disorder

confidence

. . . . . . . . . 1510 . . . . . . . . . 1520 . . . . . . . . . 1530 . . . . . . . . . 1540 . . . . . . . . . 1550 . . . . . . . . . 1560

Sequence P M N S Y N E C Y K N E T F F P M C H N N N C Y Y N N L D N I N D K T N D E I L N D E I I L N N N Y S T G D N L F C H N

Secondary

structure

SS

confidence

Disorder ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ?

Disorder

confidence

. . . . . . . . . 1570 . . . . . . . . . 1580 . . . . . . . . . 1590 . . . . . . . . . 1600 . . . . . . . . . 1610 . . . . . . . . . 1620

Sequence C C D G M S N K A S S I E WD H K N N I I K N K K E G I D F T D E N V L K D N N K N C E T N N K E E C R K F Y R D L K N

Secondary

structure

SS

confidence

Disorder ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ?

Disorder

confidence

. . . . . . . . . 1630 . . . . . . . . . 1640 . . . . . . . . . 1650 . . . . . . . . . 1660 . . . . . . . . . 1670 . . . . . . . . . 1680

Sequence E M Y E D M K K I F H R N K I K K N Q Y K L M H Y L D I S K F I S I F E I I L L K N L E N I L Y Y E K V V E N I Y M N M

Secondary

structure

SS

confidence

Disorder ? ? ? ? ? ? ?

Disorder

confidence

. . . . . . . . . 1690 . . . . . . . . . 1700 . . . . . . . . . 1710 . . . . . . . . . 1720 . . . . . . . . . 1730 . . . . . . . . . 1740

Sequence F I C I D I L N N E F D K N I S L K Y V F F P I C F F G Y E K K L K V V V H M N E K N K V F V K S K Y L T R E S T K L D

Secondary

structure

SS

confidence

Disorder ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ?

Disorder

confidence

. . . . . . . . . 1750 . . . . . . . . . 1760 . . . . . . . . . 1770 . . . . . . . . . 1780 . . . . . . . . . 1790 . . . . . . . . . 1800

Sequence T S K I K N E R R H K K V S D D K N E Y L I C M E E K H S S H D K D T N R L C T S T N K T K D L L L K D D V F K E N E K

Secondary

structure

SS

confidence

Disorder ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ?

Disorder

confidence

. . . . . . . . . 1810 . . . . . . . . . 1820 . . . . . . . . . 1830 . . . . . . . . . 1840 . . . . . . . . . 1850 . . . . . . . . . 1860

Sequence N D Q N H N N S N N N I D T S V K D K N K D N K L F T R K K Y D Y T I N E H N N K I Y N C E N A K E L N K N K I C R K K

Secondary

structure

SS

confidence

Disorder ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ?

Disorder

confidence

. . . . . . . . . 1870 . . . . . . . . . 1880 . . . . . . . . . 1890 . . . . . . . . . 1900 . . . . . . . . . 1910 . . . . . . . . . 1920

Sequence I N G N E Y K D M M K T L F L K I F K K N N D K Y N I Y K R I D Y K Y L K K N Y H Y N M N V G H K F C K E K Y K Y K K S

Secondary

structure

SS

confidence

Disorder ? ? ? ? ? ? ? ?

Disorder

confidence

. . . . . . . . . 1930 . . . . . . . . . 1940 . . . . . . . . . 1950 . . . . . . . . . 1960 . . . . . . . . . 1970 . . . . . . . . . 1980

Sequence I I L Y L H E I T K K T L L K V Y K R V N I C L N I A T L S L N I L A H I L Y L I P K K M F M A S F I P S I L N K I I N

Secondary

structure

SS

confidence

Disorder

Disorder


confidence

. . . . . . . . . 1990 . . . . . . . . . 2000 . . . . . . . . . 2010 . . . . . . . . . 2020 . . . . . . . . . 2030 . . . . . . . . . 2040

Sequence V K C L Y T Y L N V P L C I L N Y N G F L F L E T M M K F I I Q M V V N K T I P L H S Y M F S Y L R L C T V P L Y I Y L

Secondary

structure

SS

confidence

Disorder

Disorder

confidence

. . . . . . . . . 2050 . . . . . . . . . 2060 . . . . . . . . . 2070 . . . . . . . . . 2080 . . . . . . . . . 2090 . . . . . . . . . 2100

Sequence Y F D I P L S H T L I L T S L S S L Y H L I T Y D P H F L A T G M L R K R Q P S K N S F K F N K K G Y E N T Y G K K K T

Secondary

structure

SS

confidence

Disorder ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ?

Disorder

confidence

. . . . . . . . . 2110 . . . . . . . . . 2120 . . . . . . . . . 2130 . . . . . . . . . 2140 . . . . . . . . . 2150 . . . . . . . . . 2160

Sequence Q N N K R G K V C N N I T D M G T F K R K G A K R N Y R I N K L S M E R K E L L D N T F L I T I I L F L K K S I Y F K S

Secondary

structure

SS

confidence

Disorder ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ?

Disorder

confidence

. . . . . . . . . 2170 . . . . . . . . . 2180 . . . . . . . . . 2190 . . . . . . . . . 2200 . . . . . . . . . 2210 . . . . . . . . . 2220

Sequence I F N C G N I N E K E E L I A D S K K V K M I L K K WN L S N L K E E N E K E K P E Q K N E D N Q F I N E K D K L Y F S

Secondary

structure

SS

confidence

Disorder ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ?

Disorder

confidence

. . . . . . . . . 2230 . . . . . . . . . 2240 . . . . . . . . . 2250 . . . . . . . . . 2260 . . . . . . . . . 2270 . . . . . . . . . 2280

Sequence N I E N K V F Y L H D N L L L Y A L D N L T I S N N A K D R K M C E N I K K Q Y I N K N V A S N D L L C D F F N S G N S

Secondary

structure

SS

confidence

Disorder ? ? ? ? ? ? ? ? ?

Disorder

confidence

. . . . . . . . . 2290 . . . . . . . . . 2300 . . . . . . . . . 2310 . . . . . . . . . 2320 . . . . . . . . . 2330 . . . . . . . . . 2340

Sequence K I Q K L S I Y C H S I V S I L L F L S S H P M L WE C I S S H I P L I T Q M A F I P T D I R C S L WI I L K E Y H F R

Secondary

structure

SS

confidence

Disorder ? ? ? ?

Disorder

confidence

. . . . . . . . . 2350 . . . . . . . . . 2360 . . . . . . . .

Sequence S L S K K K K K K K K G T N Y Y F N S K L V K V E K I K

Secondary

structure

SS

confidence

Disorder ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ?

Disorder

confidence

Confidence Key

High(9) Low (0)

? Disordered

Alpha helix

Beta strand

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