Polarizáció fogalma
Polarizáció fogalma
Polarizáció fogalma
Create successful ePaper yourself
Turn your PDF publications into a flip-book with our unique Google optimized e-Paper software.
Kiselőadás!<br />
Fluoreszcencia<br />
polarizáció,<br />
anizotrópia<br />
FRAP<br />
2011.02.14.<br />
Polarizált fény,<br />
polarizáció<br />
<strong>Polarizáció</strong> <strong>fogalma</strong><br />
• Az elektromágneses sugárzás elektromos (és mágneses)<br />
térerősségének vektora meghatározott görbe mentén mozog (térbeli<br />
irányultság!).<br />
• Ha a görbe egyenes: lineáris v. sík polarizáció<br />
• Ha a görbe kör: cirkuláris polarizáció<br />
• (Ha a görbe elipszis: elliptikus polarizáció)<br />
• A polarizálatlan fényben a polarizációs síkok keverednek.<br />
• A polarizált fényben a polarizációs síkok összhangban vannak<br />
(azonosak).<br />
Hogyan számolja ki egy foton energiáját és impulzusát?<br />
Milyen függvény szerint csökken a fény intenzitása optikailag homogén<br />
közegben?<br />
Mi az abszorpció definíciója?<br />
Mi a különbség fluoreszcencia és foszforeszcencia között?<br />
Mia különbség a gerjesztési és az abszoprciós spektrum között?<br />
Mi a kvantumhatásfok?<br />
Elektromágneses hullámok<br />
<strong>Polarizáció</strong><br />
Lineáris polarizáció: adott pont rezgésének orientációja egy egyenesbe esik<br />
Cirkuláris polarizáció: adott pont rezgésének iránya egyenletesen körbejár<br />
Megjelenés fotózáskor!<br />
Miért van ilyen hatása?<br />
1
Polarizált fény Síkban polarizált fény<br />
A polarizátor<br />
• Definíció: A polarizátor egy olyan eszköz<br />
mely képes a polarizálatlan<br />
elektromágneses sugárzást (fény) olyan<br />
sugárzássá alakítani, melyben csak egyféle<br />
polarizációs sík van jelen.<br />
Hol találkoztunk már polarizátorral?<br />
Polarizátor elve<br />
2<br />
= max cos I I<br />
Korábbi ismereteink: pl. optikai aktivitás<br />
Optikai aktivitás: poláros fény sikját elforgatják<br />
Fényforrás<br />
Polarizátor<br />
Mintatartó<br />
• királis molekulák<br />
• nem kell gerjeszteni!<br />
α ⎡α ⎤ lc<br />
t<br />
= ⎣ λ ⎦<br />
Analizátor<br />
Megfigyelő<br />
Θ<br />
Polariméter<br />
2
gerjesztés<br />
Polarizátor<br />
<strong>Polarizáció</strong>, intenzitások<br />
x<br />
z<br />
θ A<br />
Intenzitás egy adott<br />
irányban:<br />
Ι=Ι Θ<br />
2<br />
max cos<br />
Párhuzamos állás:<br />
Θ = 0°, I = Imax Merőleges állás:<br />
Θ = 90°, I = 0<br />
abszorpciós vektor: megszabja a foton abszorpciójának valószínűségét.<br />
E r<br />
E<br />
M A = abszorpciós vektor<br />
y<br />
Mila Zinkova:<br />
Minta (víz)<br />
Tárgylemez (üveg)<br />
Teljes belső visszaverődés<br />
mikroszkópia (TIRF)<br />
Teljes visszaverődés<br />
A fény abszorpciója Fotoszelekció<br />
θ A<br />
Nincs abszorpció (θ= 90 o )<br />
Maximális abszorpció (θ= 0 o )<br />
Abszorpció ~ cos 2 θ A (max=1)<br />
A fotoszelekció eredménye Fluoreszcencia emisszió<br />
gerjesztés<br />
I Z = I V<br />
E<br />
I x = I H<br />
I Y = I H<br />
z<br />
I X<br />
I Z<br />
x<br />
θ E<br />
I Y<br />
ME = emissziós vektor<br />
ME ~ Intenzitás<br />
y<br />
Detektor<br />
I sum = I Z + I X + I Y<br />
I sum = I V + I H + I H<br />
I sum = I Z + 2I H<br />
emissziós vektor: megszabja a foton emissziójának valószínűségét.<br />
3
Fluoreszcencia polarizáció<br />
Emissziós anizotrópia<br />
Az anizotrópia jelentése és<br />
alkalmazásai<br />
Polarizált fény<br />
Fluoreszcencia polarizáció<br />
• dimenzió nélküli<br />
p = (I VV -GI VH) / (I VV + GI VH)<br />
• nem függ a fluorofór koncentrációjától<br />
• a fluorofór rotációs diffúziós mozgása befolyásolja<br />
• nem additív !!!<br />
• értéke 0-tól 1-ig változhat<br />
• dimenzió nélküli<br />
Emissziós anizotrópia<br />
r = (I VV -GI VH) / (I VV + 2GI VH)<br />
• nem függ a fluorofór koncentrációjától<br />
• a fluorofór rotációs diffúziós mozgása befolyásolja<br />
• additív !!!<br />
• értéke 0-tól 1-ig változhat<br />
Fluoreszcencia emisszió<br />
z<br />
I X<br />
I Z<br />
x<br />
θ E<br />
I Y<br />
y<br />
τ<br />
Rotációs diffúzió<br />
z<br />
I X<br />
I Z<br />
x<br />
θ E<br />
G = I HV / I HH<br />
I Y<br />
G = I HV / I HH<br />
y<br />
Részben polarizált fény<br />
4
Határérték anizotrópia (r 0)<br />
A teljes mozdulatlan, „fagyott” fluorofór anizotrópiája.<br />
2<br />
2 ⎛ 3cos<br />
β −1<br />
⎞<br />
r = ⎜ ⎟<br />
0 ⎜ ⎟<br />
5 ⎝ 2 ⎠<br />
β: az abszorpciós és emissziós vektor által bezárt szög.<br />
β<br />
0<br />
45<br />
54.7<br />
90<br />
r0 0.4<br />
0.1<br />
0<br />
-0.2<br />
Perrin egyenlet<br />
r0<br />
r0<br />
r = =<br />
τ<br />
1+<br />
1+<br />
6Dτ<br />
Θ<br />
Alkalmazások<br />
x<br />
z<br />
β<br />
r ~<br />
• r0 • 1/τ<br />
• Θ<br />
• 1/D<br />
Abszorpciós vektor<br />
Emissziós vektor<br />
Szerkezeti tulajdonságok vizsgálata<br />
• Fehérje denaturáció nyomonkövetése<br />
• Protein-ligand kölcsönhatás vizsgálata<br />
• Szerkezet vizsgálata a környezeti paraméterek (pH, ionok)<br />
változásának függvényében<br />
Dinamikus tulajdonságok vizsgálata<br />
• Membránhoz kötött fluorofórok anizotrópiája informálhat a<br />
membrán belsejében lévő viszkozitásról<br />
•Fehérjékhez kötött fluorofórok anizotrópiája informálhat a<br />
fehérjemátrix flexibilitásáról<br />
y<br />
r<br />
Perrin egyenlet:<br />
Francis Perrin - 1926<br />
ROTÁCIÓS DIFFÚZIÓ ⇒ flureszcencia depolarizáció<br />
r0<br />
r0<br />
r = =<br />
τ<br />
1+<br />
1+<br />
6Dτ<br />
Θ<br />
Rotációs korrelációs idő<br />
határérték anizotrópia<br />
ηV<br />
Θ =<br />
RT<br />
diffúziós állandó<br />
Az anizotrópia időfüggése<br />
I(t) = I 0 exp -t/τ<br />
r( t)<br />
= r0<br />
∑ai<br />
exp( −t<br />
/ θ )<br />
Példa alkalmazásra<br />
t<br />
Mire emlékeztet az időfüggés?<br />
5
Dimer<br />
Nucleation<br />
De De novo novo polymerisation of actin<br />
Actin monomer Actin filament<br />
Trimer<br />
Kutatási kérdés<br />
Depolymerisation<br />
Elongation<br />
T. D. Pollard: Cell, 112, 453-465, 2003.<br />
Hogyan változik meg az aktin filamentumok<br />
szerkezete a forminok kötődésének<br />
hatására?<br />
A mérések alapelve<br />
bending<br />
monomer<br />
rotation<br />
twisting<br />
segmental<br />
motion<br />
longer rotational<br />
correlation time (ns)<br />
A forminok domén dom szerkezete<br />
GBD FH3 FH1<br />
FH2<br />
DAD<br />
Mammalian Diaphanous-related formins<br />
Formin homology (FH) domains: FH1, FH2, FH3<br />
Rho-GTPase binding domain (GBD):<br />
Autoregulation<br />
Diaphanous Autoregulatory domén (DAD):<br />
Alkalmazott módszerek m dszerek<br />
800<br />
600<br />
400<br />
200<br />
Fehérj Feh rjék (formin, miozin miozin,<br />
, aktin, a tin, tropomiozin<br />
tropomiozin)<br />
)<br />
prepar preparálása<br />
sa.<br />
Mérések sek fluoreszcencia anizotrópia anizotr pia lecsengés lecseng s<br />
módszer dszerével. vel.<br />
0<br />
shorter rotational<br />
correlation time (ns)<br />
Anisotrópia lecsengés mérése<br />
5<br />
4<br />
3<br />
2<br />
1<br />
0<br />
0 1 2 3 4 5<br />
[mDia1-FH2] (μM)<br />
A<br />
0 1 2 3 4 5<br />
[mDia1-FH2] (μM)<br />
half angle (degree)<br />
30<br />
25<br />
20<br />
15<br />
C<br />
0 1 2 3 4 5<br />
[mDia1-FH2] (μM)<br />
A forminok megnövelték az aktin filamentumok flexibilitását.<br />
6
Hogyan értelmezhetjük az eredményeket?<br />
Side - binding<br />
End - binding<br />
A „Photobleaching” <strong>fogalma</strong><br />
fluorofór irreverzibilis fotokémiai destrukciója<br />
gerjesztő fény tönkreteszi a fluoreszcens molekulát<br />
elkerülése:<br />
• anti-photobleaching oldat (pl. glükóz<br />
oxidáz – kataláz – merkaptoetanol)<br />
• expoziciós idő csökkentése<br />
• pulzusszerű gerjesztés<br />
• alacsonyabb intenzitású gerjesztő fény<br />
• ellenállóbb fluorofor (pl. Alexa)<br />
használata:<br />
• háttér eliminálása<br />
• autoquenching<br />
• FLIP, FRAP<br />
Alkalmazás<br />
• Membránkomponensek laterális diffúziója<br />
• Monomer turnover / beépülés<br />
• Fehérje motilitás<br />
• Diffúziós konstans meghatározás<br />
2<br />
ω<br />
D =<br />
4t<br />
1/2<br />
flexibility (arb. units)<br />
3,0<br />
2,5<br />
2,0<br />
1,5<br />
T = 30 o C<br />
1,0<br />
0,0 0,2 0,4 0,6 0,8 1,0<br />
[mDia1-FH2+linker] : [actin]<br />
www.microscopyu.com<br />
FRAP<br />
(„Fluorescence Recovery After Photobleaching”)<br />
• cél: membrán-fehérjék laterális diffúziójának<br />
(DL) vizsgálata<br />
• • Fehérjék szelektív jelölése fluorofórral<br />
• • Fényforrás: lézer<br />
• • Mikroszkóp a fluoreszcencia detektálására<br />
• • „Photobleaching” = fotohalványodás<br />
(kifehéredés)<br />
1. Fluoreszcens minta<br />
2. Meghatározott terület<br />
„kiégetése” (pl. lézerrel)<br />
3. Fluoreszcencia<br />
helyreállás<br />
4. Egyensúly beállta<br />
(általában: y < x)<br />
Módszer<br />
Relativ<br />
fluoreszcencia (%)<br />
I0<br />
I0<br />
2<br />
Photobleach<br />
x y<br />
0 t 1/2<br />
Példák (mozik)<br />
Idő<br />
Lippincott-Schwartz, 2003<br />
7
A polarizátorok típusai<br />
• Definíció: A polarizátor egy olyan eszköz mely képes a polarizálatlan<br />
elektromágneses sugárzást (fény) olyan sugárzássá alakítani, melyben csak<br />
egyféle polarizációs sík van jelen.<br />
• Típusai:<br />
–Prizmás (Nicol; Glan-Thomson; Glan-<br />
Taylor)<br />
–Film-polarizátor (kinyújtott polimer<br />
háló – nagy tűrőképesség – lézerekben<br />
gyakran előfordul)<br />
Θ = arcsin<br />
1<br />
Snellius –Descart törvény<br />
sin Θ<br />
sin Θ<br />
1<br />
2<br />
n 2<br />
=<br />
=<br />
n<br />
1<br />
c<br />
c<br />
1<br />
2<br />
Θ1<br />
Θ 2<br />
Teljes visszaverődés<br />
sin Θ1<br />
n2<br />
=<br />
sin Θ n<br />
2<br />
1<br />
1<br />
sin Θ1<br />
n2<br />
=<br />
o<br />
sin 90 n<br />
sin Θ1<br />
n2<br />
=<br />
1 n<br />
n2<br />
Θ1<br />
= arc sin<br />
n<br />
1.<br />
55<br />
1.<br />
658<br />
o<br />
Θ1<br />
= 69.<br />
2<br />
1<br />
1<br />
Θ = arcsin<br />
1<br />
1.<br />
55<br />
1.<br />
486<br />
Θ1<br />
= ! ?!<br />
Θ1<br />
Θ 2<br />
n 1<br />
n 2<br />
n 1<br />
n 2<br />
A polarizátorok működése<br />
v 2<br />
v 2<br />
sin Θ<br />
68°<br />
22 °<br />
2<br />
β<br />
Refrakció és teljes visszaverődés<br />
α<br />
α h<br />
v 1<br />
levegő<br />
v 1<br />
sin Θ1n<br />
=<br />
n<br />
2<br />
n 2<br />
n 1<br />
víz<br />
levegő<br />
n 2<br />
n 1<br />
víz<br />
Snellius-Descartes törvény<br />
sinα<br />
sin β<br />
v<br />
1 = = n21<br />
v2<br />
Teljes visszaverődés<br />
1. komponens<br />
13.06 °<br />
76.94<br />
90 ° 90°<br />
°<br />
90 °<br />
CaCO 3<br />
1<br />
22 °<br />
sinα h = n21<br />
n levegő =1.00028<br />
n Nicol1 =1.658<br />
n Nicol2 =1.486<br />
n Kanada-balzsam =1.555<br />
8
sin Θ<br />
68°<br />
22 °<br />
2<br />
90 °<br />
14.6 °<br />
90 °<br />
sin Θ1n<br />
=<br />
n<br />
2<br />
2. komponens<br />
CaCO 3<br />
1<br />
90 °<br />
75.4 ° 22.37 °<br />
67.63 °<br />
22 °<br />
67.63 °<br />
75.4 °<br />
n levegő =1.00028<br />
n Nicol1 =1.658<br />
n Nicol2 =1.486<br />
n Kanada-balzsam =1.555<br />
Glan-Thomson prizma<br />
ordinárius sugár<br />
Összefoglalás<br />
kötőanyag<br />
-Polarizált fény;<br />
-Fotoszelekció;<br />
-Fluoreszcencia polarizáció és anizotrópia;<br />
-FRAP<br />
Segédanyagok:<br />
extra ordinárius sugár<br />
http://www.invitrogen.com/site/us/en/home/References/Molecular-Probes-The-Handbook<br />
http://micro.magnet.fsu.edu/primer/techniques/index.html<br />
http://chemistry.rutgers.edu<br />
http://calvino.polito.it<br />
http://www.microscopyu.com/articles/fluorescence<br />
Kettős törés!!<br />
Határszög!!<br />
68 °<br />
Kanada-balzsam<br />
Nicol-prizma<br />
CaCO 3<br />
ordinárius sugár<br />
CaCO 3<br />
extra ordinárius sugár<br />
William Nicol (1768 – 1851) Skót fizikus, geológus, a Nicol prizma megalkotója<br />
(1828).<br />
Glan-Taylor prizma<br />
ordinárius sugár<br />
levegő<br />
extra ordinárius sugár<br />
9