Az MTA Mezőgazdasági Kutatóintézet kutatóinak a

MOLEKULÁRIS GENOMIKAI ADATOK INTEGRÁLÁSA AMARTONVÁSÁRI NEMESÍTÉSI INFORMÁCIÓS RENDSZERBEKuti Csaba, Láng László, Bedő ZoltánMTA Mezőgazdasági Kutatóintézet, MartonvásárAz elmúlt évek során Martonvásáron létrehoztunk, és folyamatosan fejlesztünk egynemesítési és informatikai ismereteket egyaránt ötvöző információs rendszert, amelyrendszerezi és kezeli az évente beállított kísérletek közel 100.000 parcellájához tartozó,mintegy 3-4 millió azonosító, megfigyelési, mérési és egyéb adatát.A jelenlegi rendszer kidolgozásának célja a Martonvásári nemesítési és szántóföldikutatási programok méretének és hatékonyságának növelése az adatkezelés és mindenneműtevékenység szervezésének egységesítése volt. A rendszer alkalmas a teljes nemesítési anyagnyilvántartására, a szántóföldi és laboratóriumi kísérletek tervezésére, az adatok onlinegyűjtésére és gyors kiértékelésére. Alkalmazásával az intézet gabona génbankjánaknyilvántartása és az alapanyagcsere a nemesítési adatokkal és az ott létrehozott pedigréadatbázissal egységes rendszerben történik.A biotechnológia rendkívül gyors fejlődése az utóbbi években a nemesítők figyelmét amolekuláris nemesítés módszereinek a hagyományos fenotípus-pedigré rendszerbe történőintegrálásának lehetőségére irányította. Az új technológia intenzív alkalmazásával, a nemesítésiprogramok versenyképességének növelése a cél, és azon belül is kiemelt fontosságú amolekuláris markerszelekció (MAS) lehetőségeinek vizsgálata és felhasználása.A molekuláris marker vizsgálatok számának növekedése rövid időn belül nagyszámú újtémakör és még több új típusú adat megjelenését vonta maga után. Ezeknek az elhelyezése akb. 10 éve tervezett nemesítési adatmodellben nem volt megoldható, ezért kapcsolatbahozataluk a meglévő fenotípusos adatokkal és felhasználásuk a nemesítés (szelekció) soránrossz hatékonysággal történt.Az előadás célja bemutatni azt az új adatstruktúrát, amelyben helyet kapnak azok atémakörök, amelyek a tevékenységekhez kapcsolódó általános molekuláris adatok és számoskiegészítő adat mellett elsősorban a primerek, markerek, gének tulajdonságait, jellemzőit írjákle. Megmutatjuk a témakörök közti kapcsolatokat, valamint ezek kapcsolatát a meglévő pedigré(génforrás) adatbázisokkal. Bemutatjuk azt a szoftveres modult, amely biztosítja, hogy aköltségesen előállított biotechnológiai adatok a szelekciós döntések meghozatalára alkalmasszakmai szempontok szerint hasznosulhassanak, azaz lehetővé teszi: (1) a genomikaiadatbázisban fellelhető hasznos gének azonosítását, (2) olyan markerek felfedését és tárolását,amelyek a nemesítő szempontjából fontos genetikai alapanyagok esetében megkönnyíthetik amarkerszelekciót, (3) a nemesítő számára valós idejű információk szolgáltatását, a keresztezésipartnerek kiválasztásának megkönnyítésére, (4) átjárhatóságot a nemesítési (keresztezési)programok és kísérletek között.A fejlesztést támogatta a Prebázis Kft. GOP-2007-1.3.1 pályázatának keretéből.16