Lucidi - Università degli Studi di Siena
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Microscopia Ottica ed<br />
Elettronica per la Biologia<br />
dei Beni Culturali
Scopi del corso<br />
Conoscere la microscopia ottica ed elettronica ma soprattutto il modo <strong>di</strong><br />
operare <strong>di</strong> alcune delle principali tecniche <strong>di</strong> analisi per i Beni Culturali. Queste<br />
tecniche sono rivolte a dare un contributo nei seguenti campi:<br />
• Diagnosi Artistica (stu<strong>di</strong>o del Bene in restauro, pigmenti, colori usati, materiali<br />
impiegati storia delle tecniche artistiche, conservazione e restauro etc.)<br />
• Diagnosi Archeologica (stu<strong>di</strong>o dei se<strong>di</strong>menti, Palinologia, Carpologia,<br />
Antracologia, conoscenze aggiuntive sul sito <strong>di</strong> scavo)
Le tecniche<br />
Light Microscopy (LM), Scanning Electron Microscopy (SEM),<br />
Transmission Electron Microscopy (TEM), Confocal Microscopy (CM)<br />
Analisi della composizione chimica <strong>di</strong> un campione<br />
Caratterizzazione morfologica e strutturale Deteriogeni<br />
Indagini Palinologiche, Carpologica, Antracologica
Microscopia applicata ai Beni Culturali<br />
Per poter comprendere le potenziali informazioni fornite dalle tecniche citate è<br />
necessario comprendere le leggi fisiche su cui si basano<br />
La loro comprensione permette inoltre <strong>di</strong> non commettere errori nel restauro<br />
delle opere d’arte o l’interpretazione archeologiche, una indagine scientifica<br />
sbagliata potrebbe portare a risultati sbagliati o danneggiare il Bene<br />
Leonardo da Vinci (1452-1519)<br />
The Last Supper (1495-1498)
Microscopia Ottica ed Elettronica<br />
1) L’occhio come sistema ottico modello<br />
2) Il microscopio ottico come punto <strong>di</strong> partenza<br />
3) La storia del microscopio a Trasmissione (TEM), principi <strong>di</strong><br />
funzionamento<br />
4) Il microscopio elettronico a Scansione (SEM)<br />
5) Esempi applicativi <strong>di</strong> TEM, SEM e confocale
L’occhio, preso come modello originario a cui si rapportano gli strumenti<br />
Lente<br />
Composta,<br />
costituita<br />
dalla lente,<br />
cornea ed<br />
umore<br />
acqueo<br />
Diaframma,<br />
L’iride regola<br />
il fascio <strong>di</strong><br />
luce che<br />
entra<br />
nell’occhio<br />
Rivelatore,<br />
Sono i<br />
recettori<br />
(coni e<br />
bastoncelli)<br />
presenti<br />
sulla retina<br />
che<br />
confluiscono<br />
nel nervo<br />
ottico
Fotorecettori<br />
Bastoncelli<br />
Coni<br />
120 milioni <strong>di</strong>stribuiti su tutta la retina<br />
fuorch nella fovea<br />
Molto sensibili alla luce (visione notturna)<br />
Insensibili al colore<br />
Bassa risoluzione<br />
6-7 milioni concentrati nella fovea<br />
Poco sensibili (visione <strong>di</strong>urna)<br />
Sensibili al colore (tre tipi <strong>di</strong>versi R G B)<br />
Alta risoluzione<br />
Bastoncelli (rods) e coni<br />
(immagine SEM)<br />
Bastoncelli (Immagine TEM)
Sorgente/Oggetto<br />
L’occhio come sistema ottico modello<br />
Sistema<br />
ottico<br />
segnale segnale<br />
Immagine/Rivelatore<br />
d = K L<br />
d = risoluzione<br />
K = costante relativa<br />
alla lente usata<br />
L = lungh. d’onda
Il microscopio ottico come punto <strong>di</strong> partenza<br />
• Per ingran<strong>di</strong>re un oggetto basta una semplice lente<br />
Il potere <strong>di</strong> risoluzione è la capacità <strong>di</strong> mantenere una<br />
visualizzazione nitida dell’oggetto ingran<strong>di</strong>to<br />
• Il Microscopio ottico semplice permette <strong>di</strong> ingran<strong>di</strong>re e<br />
mantenere le proporzioni dell’oggetto osservato (la lente <strong>di</strong><br />
ingran<strong>di</strong>mento deforma l’oggetto)<br />
• I’ingran<strong>di</strong>mento è definito dal rapporto che c’è tra la<br />
<strong>di</strong>mensione dell’immagine ingran<strong>di</strong>ta e quella dell’oggetto<br />
osservato.<br />
• Il potere risolutivo è dato dal prodotto <strong>di</strong> una costante per la<br />
lunghezza d’onda della ra<strong>di</strong>azione utilizzata (Abbe)<br />
• La risoluzione è inversamente proporzionale alla lunghezza<br />
d’onda impiegata<br />
• È impossibile percepire <strong>di</strong>stintamente un oggetto <strong>di</strong><br />
<strong>di</strong>mensioni paragonabili a quelle della lunghezza d’onda dalla<br />
ra<strong>di</strong>azione impiegata
Il microscopio ottico<br />
• Le prime informazioni sull'uso <strong>di</strong> lenti risalgono all'antica Grecia, grazie<br />
alla comme<strong>di</strong>a Le nuvole <strong>di</strong> Aristofane (424 a.C.), in cui si fa menzione la<br />
lente come strumento per concentrare i raggi solari ed accendere un fuoco.<br />
• Plinio il vecchio menziona il primo uso come strumento <strong>di</strong> correzione<br />
ottica: durante i giochi, Nerone guardava i gla<strong>di</strong>atori attraverso uno<br />
smeraldo <strong>di</strong> sezione concava, presumibilmente per correggere una miopia.<br />
• Seneca descrive l'effetto ingrandente <strong>di</strong> un recipiente sferico <strong>di</strong> vetro<br />
pieno d'acqua.<br />
•Il matematico arabo Alhazen, intorno all'anno 1000 scrisse il primo grande<br />
trattato <strong>di</strong> ottica, in cui descrive come nell'occhio umano il cristallino formi<br />
un'immagine sulla retina.<br />
• Microscopio ottico composto: alla fine del 1600 ad opera dei fratelli<br />
Jonssen in Olanda e Galileo Galilei in Italia<br />
• Dal 18° secolo in poi la microscopia ottica ha raggiunto livelli <strong>di</strong> grande<br />
qualità, dovuti allo sviluppo <strong>di</strong> componenti ottici e meccanici<br />
• 1900 Viene raggiunto il limite teorico della risoluzione ottica.
Il Sistema Internazionale <strong>di</strong> misura (SI)<br />
Nel sistema SI le unità <strong>di</strong> base sono sette e precisamente:<br />
Lunghezza: METRO [m]<br />
Quantità <strong>di</strong> sostanza: MOLE [mol]<br />
Temperatura termo<strong>di</strong>namica: KELVIN [K]<br />
Intensità <strong>di</strong> corrente elettrica: AMPERE [A]<br />
Tempo: SECONDO [s]<br />
Massa: KILOGRAMMO [kg]<br />
Intensità luminosa: CANDELA [cd]
Sistema <strong>di</strong> misura SI <strong>di</strong>mensioni:<br />
yottametro= Ym = 10 24 m<br />
zettametro= Zm = 10 21 m<br />
exametro= Em = 10 18 m<br />
petametro= Pm = 10 15 m<br />
terametro= Tm = 10 12 m<br />
gigametro= Gm = 10 9 m<br />
megametro= Mm = 10 6 m<br />
chilometro= kilometro = km = 10 3 m = 1000 m<br />
ettometro= hm = 10 2 m = 100 m<br />
decametro= dam = 10 1 m = 10 m<br />
metro = m<br />
decimetro= dm = 10 −1 m = 0,1 m = 1/10 m<br />
centimetro= cm = 10 −2 m = 0,01 m = 1/100 m<br />
millimetro = mm = 10 −3 m = 0,001 m = 1/1000 m<br />
micrometro= micron= μm = 10 −6 m<br />
nanometro= nm = 10 −9 m<br />
Amstrong =Å= 10 −10 m<br />
picometro= pm = 10 −12 m
Limite dell’occhio umano<br />
75 μm<br />
Limite microscopio elettronico<br />
4 Å<br />
Onde<br />
ra<strong>di</strong>o<br />
Infrarosso<br />
Limite microscopio ottico a luce<br />
bianca 1μm 1<br />
Limite microscopio ottico a luce<br />
Visibile<br />
ultravioletta<br />
0,2-0,1μm 0,2-0,1 Ultravioletto<br />
Scala delle <strong>di</strong>mensioni<br />
1mm<br />
100 μm<br />
10 μm<br />
1 μm<br />
0,1 μm m (1000 Å)<br />
0,01 μm m (100 Å)<br />
0,001 μm m (10 Å)<br />
0,0001 μm m (1 Å)<br />
Cellule epiteliali 40 μm<br />
Emazie 6-7 μm<br />
•Batteri Batteri 2μm 2<br />
Micoplasmi 0,1-0,2 μm<br />
Virus 0,1-0,01μm<br />
0,1-0,01<br />
Proteine<br />
0,005-0,01μm<br />
0,005-0,01<br />
Aminoaci<strong>di</strong><br />
8-12 Å<br />
Atomi<br />
1-4 Å
Esempi Tempo a ritroso (anni fa)<br />
Oggi: prima lezione 0 anni<br />
Nasce mia figlia Isotta 1.998 10-1 anni<br />
Inizio della rivoluzione russa<br />
Einstein formula la teoria della relatività ristretta e dell’effetto fotoelettrico (1.908) 10-2anni<br />
Viene inventato il <strong>di</strong>odo<br />
Me<strong>di</strong>oevo: Enrico II scende in Italia, primi Normanni in sud Italia (1.008) ≈ 10-3 anni<br />
Inizia il neolitico, Lavorazione della ceramica, agricoltura<br />
addomesticazione <strong>degli</strong> animali (10.000 a.C.) ≈10-4<br />
anni<br />
Paleolitico me<strong>di</strong>o: uomo <strong>di</strong> Neandertal (100.000 a.C.) ≈10-5<br />
anni<br />
Paleolitico inferiore: Homo Erectus, Scoperta del fuoco (1.000.000 a.C.) ≈10-6<br />
anni<br />
Inizio del pliocene: scimmie antropomorfe (10.000.000 a.C.) ≈ 10-7
Microscopio elettronico a trasmissione (TEM)<br />
Un po’ <strong>di</strong> storia...<br />
• H. Geissler (1814-79) tubi in vetro provvisti <strong>di</strong> elettro<strong>di</strong> e<br />
sotto vuoto si produceva fluorescenza nelle zone del catodo <strong>di</strong><br />
carica negative come quella dell’elettrone (raggi cato<strong>di</strong>ci)<br />
• E.Wiechert (1826-1911) raggi cato<strong>di</strong>ci potevano essere<br />
concentrati in un punto utilizzando un campo magnetico<br />
(prototipo <strong>di</strong> lente magnatica per elettroni)<br />
• Busch 1926 teorizzo l’utilizzo <strong>di</strong> una bobina <strong>di</strong><br />
concentrazione per ottica elettronica<br />
• Gabor 1927 costruì una bobina corta in grado <strong>di</strong> agire su un<br />
fascio elettronico con proprietà focalizzatrici analoghe a<br />
quelle <strong>di</strong> una lente <strong>di</strong> vetro su un fascio <strong>di</strong> luce.
F= forza che subiscono gli elettroni in movimento<br />
e= energia <strong>degli</strong> elettroni<br />
E= energia cinetica<br />
v= velocità <strong>degli</strong> elettroni<br />
B= Campo magnetico
L’inverso del fuoco f<br />
È proporzionale ad alfa (angolo<br />
con il quale gli elettroni entrano<br />
nella lente<br />
B è la componente del campo magnetico<br />
E è l’energia cinetica che <strong>di</strong>pende dalla<br />
velocità <strong>degli</strong> elettroni
Microscopio elettronico a trasmissione (TEM)<br />
Un po’ <strong>di</strong> storia...<br />
• Berlino 1931: 1931:<br />
Prof. Ernst Ruska (Nobel nel 1986),<br />
perfezionò le lenti elettromagnetiche<br />
• 7 Aprile 1931: 1931:<br />
Ruska & Coll del gruppo del Prof. Max Knoll<br />
ottengono la prima foto al microscopio Elettronico (17.400 X)<br />
Nascita Nascita della Microscopia Elettronica<br />
• 1933: E. Ruska sviluppa il vero prototipo <strong>di</strong> Microscopio<br />
Elettronico a Trasmissione (TEM)<br />
• 1939: 1939:<br />
TEM <strong>di</strong>sponibile sul mercato
Microscopio elettronico a trasmissione (TEM)<br />
(TEM<br />
Un po’ <strong>di</strong> storia...<br />
• E. Ruska si rese conto che la formazione dell’immagine era<br />
legata al contrasto e questo non <strong>di</strong>pendeva solo<br />
dall’assorbimento <strong>di</strong> elettroni ma anche dalla loro <strong>di</strong>ffusione<br />
quin<strong>di</strong> l’elettrone aveva poco potere penetrativo ed il<br />
campione doveva essere molto sottile. In questo caso i<br />
singoli punti del campione <strong>di</strong>ffondevano gli elettroni ad angoli<br />
<strong>di</strong>versi a seconda dello spessore della massa (teoria del<br />
contrasto)<br />
• Ruska e Knoll primo stu<strong>di</strong>o sulla preparazione dei materiali<br />
biologici
Microscopio elettronico a trasmissione (TEM)<br />
(TEM<br />
Un po’ <strong>di</strong> storia...<br />
• Morton 1934 Per prevenirne la <strong>di</strong>struzione il campione da<br />
osservare era posto su un supporto metallico Morton utilizzò<br />
una pellicola <strong>di</strong> nitrocellulosa e questa resistette molto bene<br />
al fascio elettronico<br />
• Vennero messi a punto meto<strong>di</strong> <strong>di</strong> colorazione dei campione<br />
• Il contrasto dei campioni <strong>di</strong>pendeva dall’apertura<br />
dell’obiettivo<br />
• Per avere un maggior contrasto gli elettroni dovevano essere<br />
deflessi <strong>di</strong> un angolo piccolissimo ma per campioni cosi sottili<br />
solo una parte <strong>di</strong> elettroni sarebbe stata deflessa dall’obiettivo<br />
• Borries, Ruska e Ardenne (1938), introdussero un <strong>di</strong>aframma<br />
mobile da inserire durante l’osservazione dell’immagine<br />
• Morton aveva mostrato la possibilità d’esaminare sostanze<br />
organiche senza che queste venissero danneggiate in modo<br />
irreparabile dall’interazione col fascio elettronico
Microscopio Elettronico<br />
a Trasmissione<br />
REQUISITI DEL CAMPIONE:<br />
CAMPIONE:<br />
sezioni sottili (60-80nm) <strong>di</strong> materiale<br />
incluso in resine plastiche, oppure preparati liberi <strong>di</strong> spessore molto<br />
limitato.<br />
INFORMAZIONI OTTENIBILI: OTTENIBILI relative alla struttura interna del<br />
campione.<br />
SISTEMA ILLUMINANTE:<br />
ILLUMINANTE:<br />
sorgente ottenuta da un filamento <strong>di</strong><br />
tungsteno riscaldato sotto vuoto. Il fascio elettronico originato viene<br />
focalizzato sul campione me<strong>di</strong>ante lenti elettromagnatiche.<br />
elettromagnatiche<br />
SISTEMA DI FORMAZIONE DELL’IMMAGINE:<br />
DELL’IMMAGINE:<br />
l’immagine della zona<br />
osservata viene ottenuta in modo simultaneo su <strong>di</strong> un apposito<br />
schermo fluorescente sotto il campione.<br />
LIMITE DI RISOLUZIONE: RISOLUZIONE in relazione ai parametri <strong>di</strong> osservazione<br />
scelti può essere molto elevato: 0,2-0,3nm.
Microscopio Elettronico<br />
a Scansione<br />
REQUISITI DEL CAMPIONE:<br />
CAMPIONE:<br />
frammenti <strong>di</strong> materiale da pochi mm 3<br />
sino all’or<strong>di</strong>ne <strong>di</strong> cm 3 (per i campioni biologici, da cellule in coltura a<br />
frammenti <strong>di</strong> tessuti).<br />
INFORMAZIONI OTTENIBILI: OTTENIBILI relative, nella modalità principale <strong>di</strong><br />
osservazione, alla superficie del campione, con la formazione <strong>di</strong><br />
immagini <strong>di</strong> aspetto tri<strong>di</strong>mensionale.<br />
SISTEMA ILLUMINANTE:<br />
ILLUMINANTE:<br />
stessa sorgente del TEM<br />
SISTEMA DI FORMAZIONE DELL’IMMAGINE:<br />
DELL’IMMAGINE:<br />
non esistono lenti<br />
magnetiche al <strong>di</strong> fuori <strong>di</strong> quelle utilizzate per la focalizzazione del<br />
fascio. L’immagine viene ottenuta sulla superficie <strong>di</strong> un tubo a raggi<br />
cato<strong>di</strong>ci, me<strong>di</strong>ante elaborazione elettronica del segnale proveniente<br />
dal campione.<br />
LIMITE DI RISOLUZIONE: RISOLUZIONE in relazione ai vari parametri 25 <strong>di</strong> osservazione<br />
scelti può essere da 5 a 30nm.
Ottico<br />
Confronto tra MO, TEM e SEM<br />
Elettronico<br />
a scansione<br />
Elettronico<br />
a trasmissione<br />
26
Ottico consente <strong>di</strong> <strong>di</strong>stinguere oggetti che hanno <strong>di</strong>mensioni ½ della lunghezza d’onda della ra<strong>di</strong>azione<br />
luminosa impiegata (0.55 micrometri)<br />
♦<strong>Stu<strong>di</strong></strong> <strong>Stu<strong>di</strong></strong> strutturali e citochimici <strong>di</strong> cellule o tessuti in vivo<br />
♦ <strong>Stu<strong>di</strong></strong> citochimici <strong>di</strong> tessuti e cellule anche in vivo<br />
Elettronico a trasmissione grazie alla lunghezza d’onda dell’elettrone può ingran<strong>di</strong>re gli oggetti fino ad<br />
un milione <strong>di</strong> volte ma nessun esemplare vivente può sopravvivere sotto il loro vuoto e fascio elettronico e<br />
non possono mostrare i movimenti che caratterizzano una cellula vivente<br />
♦<strong>Stu<strong>di</strong></strong> <strong>Stu<strong>di</strong></strong> ultrastrutturali ed alterazione delle strutture interne <strong>di</strong> cellule o tessuti<br />
trattati<br />
♦Microanalisi Microanalisi e stu<strong>di</strong> chimici quantitativi<br />
♦Osservazione Osservazione microorganismi<br />
Elettronico a scansione<br />
♦Morfologia Morfologia <strong>di</strong> superficie ed alterazioni della stessa,<br />
♦Localizzazione Localizzazione e stu<strong>di</strong> chimici per mezzo della microanalisi
Microscopio confocale laser<br />
♦ Localizzazione <strong>di</strong> molecole autofluorescenti o marcate con<br />
sonde fluorescenti<br />
♦ Visualizzazione <strong>di</strong> strutture cellulari (es. citoscheletro)<br />
♦ Osservazioni sul ciclo cellulare (marcatura del nucleo con<br />
opportuni coloranti fluorescenti)
REQUISITI DEL CAMPIONE: CAMPIONE:<br />
tecnologia non invasiva, consentendo l’osservazione del<br />
preparato a pressione ambiente, è ideale per lo stu<strong>di</strong>o <strong>di</strong> campioni biologici viventi (es. cellule in<br />
coltura) rendendo accessibile lo stu<strong>di</strong>o <strong>di</strong>namico dei fenomeni vitali. Inoltre, sono osservabili<br />
tutti i campioni i cui componenti, strutturali e non, siano stati in qualche modo “colorati “ con<br />
sostanze o capaci <strong>di</strong> emettere luce colorata se colpite da un raggio laser (fluorocromi) od in<br />
grado <strong>di</strong> deviare il laser stesso (es. atomi ad alto peso molecolare come oro, argento, platino,<br />
cadmio)<br />
INFORMAZIONI OTTENIBILI: OTTENIBILI:<br />
relative alla <strong>di</strong>stribuzione, nell’intero volume del campione (sia<br />
esso un frammento <strong>di</strong> tessuto o cellule in coltura) <strong>di</strong> componenti strutturali e non dello stesso<br />
capaci <strong>di</strong> emettere, da soli od in seguito ad opportune colorazioni, un segnale luminoso quando<br />
colpito da un raggio laser.<br />
SISTEMA ILLUMINANTE: ILLUMINANTE:<br />
una sorgente <strong>di</strong> luce laser costituita da una miscela <strong>di</strong> gas tale da<br />
generare raggi luminoso nell’intero spettro della luce visibile od ultravioletta.<br />
SISTEMA DI FORMAZIONE DELL’IMMAGINE: DELL’IMMAGINE:<br />
l’immagine viene ottenuta sulla superficie <strong>di</strong> un<br />
tubo a raggi cato<strong>di</strong>ci, me<strong>di</strong>ante elaborazione elettronica del segnale proveniente dal campione. campione<br />
LIMITE DI RISOLUZIONE:<br />
RISOLUZIONE:<br />
circa 0,2μm 0,2<br />
Microscopio Confocale<br />
Laser (CLSM ( CLSM)
Il laser: la sorgente luminosa<br />
Si utilizzano lasers a gas ionizzato e ciascun tipo <strong>di</strong> laser ha delle<br />
linee <strong>di</strong> emissione per un limitato numero <strong>di</strong> λ.<br />
Tipi <strong>di</strong> lasers:<br />
ARGON Blu (488nm) e Verde (514nm) (514nm<br />
He-Ne Verde (543nm) e Rosso (633nm)<br />
KRIPTON Giallo (568nm) e Rosso (647nm)<br />
ARGON ad alta potenza<br />
ELIO-CADMIO<br />
Ultravioletto λ < 400nm<br />
Necessitano <strong>di</strong> un sistema <strong>di</strong> raffreddamento liquido (molto<br />
costosi)
Vantaggi<br />
Microscopio Confocale<br />
Laser (CLSM ( CLSM)<br />
Informazioni relative ai vari piani focali del campione<br />
(informazioni <strong>di</strong> profon<strong>di</strong>tà)<br />
Maggiore nitidezza delle immagini<br />
Struttura tri<strong>di</strong>mensionale del campione
Preparazione <strong>di</strong> campioni<br />
per la Microscopia Elettronica a<br />
Trasmissione
• la luce del microscopio ed il fascio <strong>di</strong> elettroni possono<br />
attraversare solo materiale <strong>di</strong> spessore molto ridotto<br />
• il tessuto deve essere sezionato me<strong>di</strong>ante speciali apparecchi, detti<br />
microtomi ed utramicrotomi<br />
• la maggioranza dei tessuti biologici sono molli<br />
• prima del taglio, il tessuto deve essere indurito<br />
– Fissazione (Chimica o fisica)<br />
– Inclusione<br />
TEM<br />
• i tessuti sono normalmente quasi incolori e privi <strong>di</strong> contrasto<br />
• prima dell’osservazione al microscopio, il tessuto deve essere colorato o<br />
contrastato<br />
• coloranti con affinità per componenti cellulari e tissutali <strong>di</strong>verse possono<br />
essere combinati nella stessa sezione istologica
Fasi della preparazione<br />
• Prelievo<br />
• Fissazione<br />
• Disidratazione<br />
• Inclusione<br />
• Taglio<br />
• Colorazione
Prelievo<br />
• Il prelievo è l’operazione fisica con la quale si ottiene<br />
il campione da esaminare<br />
• Deve essere eseguito da materiale biologico vivente<br />
• Deve essere eseguito il più velocemente possibile<br />
• Riduzione 10x10x3 mm per la microscopia ottica<br />
Spessore ≤ 2 mm per la microscopia elettronica
La Fissazione<br />
Ha lo scopo <strong>di</strong> bloccare i processi <strong>di</strong> degenerazione del tessuto prelevato rendendolo<br />
stabile nel tempo ed inalterabile all’azione dei successivi trattamenti<br />
Mantiene inalterate le caratteristiche strutturali del campione, preservandone<br />
la morfologia<br />
Protegge il campione da danni osmotici<br />
FISICA<br />
CHIMICA<br />
Esposizione del tessuto a Temp. molto basse:<br />
Congelamento in Propano o -160°C<br />
Uso <strong>di</strong> sostanze chimiche:<br />
Perfusione<br />
Immersione<br />
vapori
Fissazione chimica<br />
Ha lo scopo <strong>di</strong> immobilizzare tutti i componenti molecolari e<br />
macromolecolari dell’architettura cellulare, provocando l’arresto istantaneo<br />
<strong>di</strong> tutte le attività chimico-fisiche cellulari<br />
Tipi <strong>di</strong> fissativi (+ usati):<br />
a) GLUTERALDEIDE 2-4% reticola le proteine<br />
b) TETROSSIDO DI OSMIO 1-2% fissa lipi<strong>di</strong> T, pareti cellulari<br />
membrane e proteine<br />
I fissativi sono veicolati da un opportuno tampone.<br />
Principali tamponi:<br />
a) Tampone fosfato (+ usato);<br />
b) Tampone caco<strong>di</strong>lato (so<strong>di</strong>o metil arsenato);<br />
c) Tampone veronal-acetato (altamente tossico)
LE ALDEIDI<br />
FORMALDEIDE<br />
• usata in soluzione (4-10%) in<br />
tampone pH 7.4<br />
• elevato potere <strong>di</strong> penetrazione<br />
( 0.8 mm/h)<br />
• agisce formando legami crociati<br />
con gli amminoaci<strong>di</strong> delle proteine (reversibili)<br />
• preserva una buona morfologia<br />
PARAFORMALDEIDE<br />
• preserva la reattività delle macromolecole<br />
• in<strong>di</strong>cata per indagini biochimiche<br />
La fissazione chimica<br />
Microscopia Ottica<br />
Formaldeide 4-10%<br />
+ Saccarosio 2%<br />
in PBS pH 7.4<br />
4 ore 4°C<br />
PFA 10%<br />
+ Saccarosio 2%<br />
in PBS pH 7.4<br />
4 ore 4°C
LE ALDEIDI<br />
GLUTARALDEIDE CH2(CH2.CHO)2<br />
• penetra bene nei tessuti, ma meno<br />
rapidamente della formaldeide<br />
• forma cross-legami più velocemente<br />
e più stabilmente della formaldeide<br />
• non fissa i lipi<strong>di</strong>, quin<strong>di</strong> per preservare<br />
le membrane<br />
Post-fissazione con Osmio Tetrossido<br />
• Fissa i lipi<strong>di</strong> insaturi<br />
• agisce rapidamene, ma penetra<br />
molto poco Fissativo 2°<br />
• reagisce in modo <strong>di</strong>fferente con i<br />
vari componenti cellulari accentuando<br />
le <strong>di</strong>fferenze <strong>di</strong> densità e fornendo una<br />
sorta <strong>di</strong> colorazione<br />
La fissazione chimica<br />
Microscopia Elettronica<br />
GA 2-4%<br />
in Tampone Fosfato pH 7.4<br />
2-4 ore 4°C<br />
OsO 4 1-2%<br />
In Tampone Fosfato pH 7.4<br />
2 ore 4°C buio
I Tamponi<br />
I fissativi devono essere <strong>di</strong>luiti in tamponi a pH 7-7.4 in modo che non ci sia <strong>di</strong>versità<br />
<strong>di</strong> pH fra il tessuto e la soluzione fissativa e per evitare artefatti dovuti a <strong>di</strong>fferenze <strong>di</strong><br />
osmolarità<br />
Gli stessi tamponi utilizzati per <strong>di</strong>luire i fissativi devono essere impiegati per effettuare<br />
i lavaggi che seguono la fissazione (1-2 ore)<br />
PBS<br />
Tampone fosfato <strong>di</strong> Sorensen<br />
Fosfato biso<strong>di</strong>co 0.2M + Fosfato monoso<strong>di</strong>co 0.2M<br />
Tampone Caco<strong>di</strong>lato<br />
Caco<strong>di</strong>lato <strong>di</strong> Na 0.24M + HCl 0.2M<br />
Più stabile nel tempo, ma contiene arsenico che è tossico
La Disidratazione<br />
E’ il passaggio che permette la sostituzione dell’acqua contenuta nel tessuto con un<br />
solvente dei mezzi <strong>di</strong> inclusione (Paraffina o resine)<br />
La <strong>di</strong>sidratazione si effettua me<strong>di</strong>ane passaggi del campione in soluzioni <strong>di</strong> alcool<br />
in una scala crescente <strong>di</strong> concentrazioni<br />
Alcool 70%<br />
Alcool 90%<br />
Alcool 100%<br />
Chiarificazione<br />
Ulteriore fissazione con Acetato <strong>di</strong> Uranile<br />
in alcool 70% (T.E.M.)<br />
L’ultimo agente deve essere miscibile con i mezzi <strong>di</strong> inclusione<br />
Xilolo<br />
Acetone assoluto<br />
Etanolo, metanolo<br />
Paraffina<br />
Resine idrofobiche per T.E.M.<br />
Infiltrazione<br />
Dopo aver concluso la <strong>di</strong>sidratazione del campione bisogna sostituire gradualmente<br />
lo xilolo o l’acetone con il mezzo <strong>di</strong> inclusione in forma liquida (liqui<strong>di</strong> organici:mezzo <strong>di</strong> inclusione)<br />
3:1 2:1 1.1 1:2 1:3
Inclusione<br />
E’ il passaggio che permette <strong>di</strong> impregnare il campione in un materiale abbastanza<br />
duro ed omogeneo tale da poter essere tagliato in fette molto sottili<br />
PARAFFINA<br />
(M.O.)<br />
• Miscela <strong>di</strong> idrocarburi saturi<br />
• solida a T ambiente<br />
• punto <strong>di</strong> fusione a 54-60°<br />
• insolubile in H 2 O, solubile in xilolo<br />
RESINE<br />
(T.E.M.)<br />
• Epon, Aral<strong>di</strong>te<br />
• liquida a Temp. ambiente<br />
• polimerizza a 60-70°C<br />
• insolubile in H 2 O, solubile in liq. organici<br />
• si preparano a partire da soluzioni <strong>di</strong><br />
monomeri, da sostanze plasticizzanti che<br />
migliorano la consistenza finale del<br />
polimero e da un acceleratore chimico<br />
per la reazione <strong>di</strong> polimerizzazione<br />
Il campione viene immerso in paraffina<br />
o resina pura per completarne<br />
l’infiltrazione
Polimerizzazione<br />
Paraffina (m.o.)<br />
Temp. ambiente<br />
4°C<br />
Blocchetti pronti<br />
per essere<br />
tagliati in<br />
sezioni<br />
Resina (T.E.M)<br />
60-70°C
ULTRAMICROTOMO<br />
Strumento usato per sezionare i blocchetti <strong>di</strong> resina<br />
in sezioni molto sottili<br />
SEMIFINI: sezioni <strong>di</strong> 1 uM <strong>di</strong> spessore, la cui<br />
osservazione al m.o. permette <strong>di</strong> selezionare i<br />
campi utili destinati ell’esame ultrastrutturale<br />
al T.E.M.
SEZIONI ULTRAFINI<br />
Il taglio<br />
delle sezioni<br />
retino<br />
Lama <strong>di</strong><br />
<strong>di</strong>amante<br />
Raccolta delle<br />
sezioni
COLORANTI PER MICROSCOPIA OTTICA<br />
I tessuti assumono i coloranti in base alle caratteristiche delle strutture<br />
che li compongono<br />
ACIDI carica negativa<br />
formano sali con basi<br />
colorano citoplasma<br />
BASICI carica positiva<br />
formano sali con aci<strong>di</strong><br />
colorano i nuclei<br />
NEUTRI formati dall’unione <strong>di</strong> un<br />
colorante acido con uno<br />
NATURALI<br />
animali : es. carminio (colorante<br />
acido nucleare)<br />
vegetali: es. ematossilina<br />
(colorante acido)<br />
ARTIFICIALI<br />
eosina (colorante basico citoplasmatico)<br />
fucsina, violetto <strong>di</strong> genziana<br />
(coloranti nucleari)
• FISICHE: FISICHE precipitazione <strong>di</strong> metalli su strutture biologiche<br />
Es. impregnazione argentica Sali d’argento + sostanza riducente<br />
liberazione <strong>di</strong> Ag metallico che si deposita sulle strutture biologiche<br />
argentofile (fibre nervose)<br />
• CHIMICO-FISICHE : meccanismo <strong>di</strong> assorbimento elettrico<br />
substrato e colorante hanno cariche <strong>di</strong>verse e<br />
formano sali fra loro<br />
EOSINA<br />
EMATOSSILINA
LA COLORAZIONE TEM<br />
• il contrasto <strong>di</strong>pende dal numero atomico <strong>degli</strong> atomi del campione<br />
• piu’ e’ alto il numero atomico, piu’ elettroni sono <strong>di</strong>spersi, maggiore e’ il<br />
contrasto<br />
• le molecole biologiche sono costituite da atomi con numero atomico basso (H,<br />
C, O)<br />
• le sezioni vengono contrastate con sali <strong>di</strong> metalli pesanti<br />
Acetato <strong>di</strong> Uranile<br />
e<br />
Citrato <strong>di</strong> Piombo
…un esempio <strong>di</strong> applicazione<br />
semifini<br />
fini
1) Critical Point Drying<br />
Completa la <strong>di</strong>sidratazione del campione, permettendo <strong>di</strong> mantenere il più possibile inalterata<br />
la superficie del campione<br />
Passaggi:<br />
Etanolo assoluto + Acetone assoluto (1:1) 15min<br />
Acetone assoluto 15min<br />
CO 2 liquida<br />
2) Montaggio<br />
Me<strong>di</strong>ante vernicette colloidali costituite da elementi conduttivi<br />
(Ag, Cu, C) o nastri adesivi.<br />
Attacco del campione al substrato<br />
Assicura la conducibilità termica ed elettrica<br />
3) Ricopertura<br />
Perché la ricopertura:<br />
> conducibilità elettrica del campione minori effetti <strong>di</strong> carica<br />
< danneggiamento termico<br />
> emissione elettronica secondaria<br />
53
1) Fissazione<br />
Fasi principali della preparazione <strong>di</strong> campioni per la<br />
Un fissativo ottimale deve:<br />
A) Mantenere l’antigenicità del campione<br />
B) Minimizzare la comparsa <strong>di</strong> artefatti.(es. la gluteraldeide dà origine a derivati<br />
autofluorescenti, da non usare)<br />
In genere si usa paraformaldeide (2-4%) o metanolo a freddo<br />
2) Immunomarcatura<br />
Antigeni <strong>di</strong> superficie: immunomarcatura e poi fissazione<br />
Antigeni <strong>di</strong> superficie: immunomarcatura e poi fissazione<br />
3) Controcolorazione, per evidenziare strutture cellulari (nucleo, citischeletro etc.)
La Biologia per i Beni<br />
Culturali<br />
BIODETERORIAMENTO<br />
CONSERVAZIONE
Esempi <strong>di</strong> restauro e conservazione<br />
• Chiesa S.S.Annunziata, <strong>Siena</strong><br />
Cappella Cappella del Sacro Chiodo [Complesso<br />
Museale S.M. Della Scala, <strong>Siena</strong>]
Tecniche <strong>di</strong> analisi: impatto sull’oggetto<br />
Le tecniche preferibili sono quelle non <strong>di</strong>struttive in quanto è possibile<br />
ottenere informazioni dall’oggetto sotto stu<strong>di</strong>o senza apportarvi alcuna<br />
alterazione. Le tecniche non <strong>di</strong>struttive forniscono molte informazioni sulle<br />
opere d’arte ma in molti casi sono limitate.<br />
Un semplice esempio <strong>di</strong> tecnica non <strong>di</strong>struttiva è l’analisi ra<strong>di</strong>ografica con<br />
raggi x che può permettere <strong>di</strong> ottenere informazioni sugli strati interni<br />
dell’opera senza neppure toccarla.<br />
Per ottenere informazioni più approfon<strong>di</strong>te è necessario prelevare un piccolo<br />
campione dal reperto ed analizzarlo successivamente in laboratorio con<br />
tecnologie più sofisticate (Tecniche <strong>di</strong>struttive). Questo si potrà fare quando<br />
l’asportazione <strong>di</strong> un campione non compromette l’integrità globale<br />
dell’oggetto (un piccolo foro nel basamento <strong>di</strong> una statua lignea, all’interno <strong>di</strong><br />
un vaso o in un mattone oppure una piccola quantità <strong>di</strong> stoffa da un tessuto<br />
etc.
Microscopia ottica<br />
L’analisi al microscopio ottico <strong>di</strong> un campione da <strong>di</strong>pinti fa<br />
parte della <strong>di</strong>agnostica <strong>di</strong>struttiva e fornisce<br />
un’importante serie <strong>di</strong> informazioni riguardanti sia la<br />
tecnica esecutiva che lo stato <strong>di</strong> conservazione.<br />
Le opere d’arte, in particolare i <strong>di</strong>pinti, sono costituiti da<br />
una struttura a strati sovrapposti dei quali solo alcuni<br />
sono visibili, gli stessi interventi <strong>di</strong> restauro hanno una<br />
localizzazione a strati.<br />
E’ notevole il contributo che l’analisi <strong>di</strong> una sezione <strong>di</strong> un<br />
frammento, prelevato da un’opera, fornisce per la<br />
conoscenza della storia delle tecniche artistiche.
Microscopia elettronica<br />
La microscopia elettronica a Trasmissione (TEM) e<br />
Scansione (SEM) permettono indagini<br />
ultrastrutturali <strong>di</strong> un campione<br />
Le informazioni ricavabili me<strong>di</strong>ante l’utilizzo del SEM<br />
sono <strong>di</strong> tipo morfologico-qualitativo <strong>di</strong> particolari del<br />
campione relativi soprattutto alla superficie esterna<br />
con grande risoluzione nei dettagli.<br />
Le informazioni ricavabili me<strong>di</strong>ante l’utilizzo del TEM<br />
sono anch’esse <strong>di</strong> tipo morfologico-quantitativo ma<br />
relativi ad indagini ultrastrutturali dell’interno dei<br />
campioni.
Microanalisi elettronica<br />
La microanalisi fornisce l’analisi <strong>degli</strong> elementi chimici presenti<br />
nella porzione indagata e quin<strong>di</strong>, nel caso <strong>di</strong> una stratigrafia,<br />
dei <strong>di</strong>fferenti strati. Dall’analisi elementale si risale al composto<br />
e quin<strong>di</strong> alla componente pittorica.<br />
Si può mettere in evidenza particolari relativi alla tecnica<br />
pittorica o ai fenomeni <strong>di</strong> alterazione del materiale o <strong>di</strong><br />
degrado dell’opera d’arte.<br />
E’ possibile, quin<strong>di</strong>, trovare nell’ambito <strong>di</strong> qualche millimetro o<br />
in spessori anche assai minori <strong>di</strong> una sezione stratigrafica, una<br />
molteplicità <strong>di</strong> materiali <strong>di</strong>fferenti ognuno con un proprio ruolo<br />
positivo o negativo, intenzionale o indotto, nel contesto<br />
generale dell’opera.
e incidente<br />
lacuna<br />
e emesso<br />
Microanalisi<br />
e emesso<br />
Quando un elettrone vicino all’atomo<br />
è colpito da un elettrone incidente si<br />
ha una instabilità per cui vengono<br />
richiamati elettroni dalle orbite più<br />
esterne.<br />
Nel salto elettronico <strong>di</strong> stabilizzazione<br />
si ha liberazione <strong>di</strong> energia sotto<br />
forma <strong>di</strong> raggi X caratteristici, tipici<br />
per ogni particolare<br />
atomo la cui<br />
energia è la<br />
<strong>di</strong>fferenza <strong>di</strong><br />
legame tra i due<br />
rispettivi strati
Analisi condotta con il<br />
microscopio ottico a luce<br />
riflessa (30x).<br />
Microscopia Ottica<br />
Si nota la presenza <strong>di</strong><br />
quattro strati:<br />
1° strato: base preparatoria<br />
bianca (gesso e colla)<br />
2° strato: colla animale<br />
3° strato: sostanza<br />
comprente (biacca?)<br />
4° strato: pigmento verde<br />
(acetato <strong>di</strong> rame?)<br />
Crocifissione, Cappella Sacro Chiodo, Complesso museale S.M. Della Scala,<br />
<strong>Siena</strong>
Fotografia al SEM<br />
Microscopia elettronica a Scansione/EDX<br />
Spettro n°1: strato <strong>di</strong> preparazione<br />
gesso - elevata concentrazione <strong>di</strong><br />
zolfo e calce colla - quantità inferiore<br />
<strong>di</strong> carbonio e ossigeno<br />
Crocifissione, Cappella Sacro Chiodo, Complesso museale S.M. Della Scala,<br />
<strong>Siena</strong>
Microscopia elettronica a Scansione/EDX<br />
Fotografia al SEM<br />
Spettro n°2: strato <strong>di</strong> colla<br />
animale - alta concentrazione <strong>di</strong><br />
carbonio<br />
Crocifissione, Cappella Sacro Chiodo, Complesso museale S.M. Della Scala,<br />
<strong>Siena</strong>
Fotografia al SEM<br />
Microscopia elettronica a Scansione/EDX<br />
Spettro n°3: strato bianco <strong>di</strong><br />
biacca - alta concentrazione <strong>di</strong><br />
piombo<br />
Crocifissione, Cappella Sacro Chiodo, Complesso museale S.M. Della Scala,<br />
<strong>Siena</strong>
Fotografia al SEM<br />
Microscopia elettronica a Scansione/EDX<br />
Spettro n°4: strato <strong>di</strong> pigmento<br />
acetato <strong>di</strong> rame - elevata<br />
concentrazione <strong>di</strong> rame<br />
Crocifissione, Cappella Sacro Chiodo, Complesso museale S.M. Della Scala,<br />
<strong>Siena</strong>
• Chiesa S.S. Annunziata Sebastiano Conca (1731-32)<br />
C<br />
B<br />
A<br />
Tecniche<br />
impiegate<br />
TEM,<br />
SEM/EDX<br />
Bio. Mol.
Microscopia Elettronica a Trasmissione<br />
Fotografia al microscopio<br />
elettronico a Trasmissione<br />
(30000x)<br />
..<br />
Si notano due strati:<br />
1° strato pittorico<br />
2° deteriogeni
Cappella Cappella del Sacro Chiodo Lorenzo <strong>di</strong> Pietro<br />
'Il Vecchietta' (1446-1449)<br />
Pochi mg <strong>di</strong> campione,<br />
1mmX1mmX0.5mm<br />
Le tecniche<br />
impiegate<br />
LM, SEM/EDX,<br />
TEM, Bio. Mol.<br />
http://www.unisi.it<br />
/ricerca/<strong>di</strong>p/dba/l<br />
abcm/S.M.S/web/i<br />
ndex.html
Cappella del Sacro Chiodo Lorenzo <strong>di</strong> Pietro<br />
'Il Vecchietta' (1446-1449) Totale<br />
Estrazione DNA MICROFLORA TOTALE da patina pittorica original, lunghezza me<strong>di</strong>a delle sequenze ottenute:<br />
827 bp, N° cloni ottenuti: 95.<br />
Phylum % Genus [% of probability]<br />
Actinobacteria 1Corynebacterium[100%]<br />
Actinobacteria 2Kocuria[100%]<br />
Actinobacteria 1Propionibacterium[100%]<br />
Actinobacteria 5Rothia[100%]<br />
Alphaproteobacteria 1Asaia[100%]<br />
Alphaproteobacteria 3Bradyrhizobium[100%]<br />
Alphaproteobacteria 6Gluconobacter[100%]<br />
Alphaproteobacteria 3Sphingomonas[100%]<br />
Alphaproteobacteria 3Sphingopyxis[88%]<br />
Bacteroidetes 1Pedobacter[100%]<br />
Bacteroidetes 3Prevotella[100%]<br />
Betaproteobacterium 9Burkholderiales Incertae se<strong>di</strong>s [100%] (Ralstonia-like)<br />
Betaproteobacterium 1Burkholderiales Incertae se<strong>di</strong>s [99%] (Leptothrix_like)<br />
Betaproteobacterium 2Neisseriaceae[94%] (Vitreoscilla-like)<br />
Betaproteobacterium 2Neisseriaceae[98%] (Simonsiella-like)<br />
Betaproteobacterium 1Oxalobacteraceae[100%]<br />
Betaproteobacterium 1Ralstonia[100%]<br />
Firmicutes 2Abiotrophia[100%]<br />
Firmicutes 2Anaerococcus[100%]<br />
Scene VecchioTestamento,<br />
Giu<strong>di</strong>zio Universale, 1447.<br />
La maggior parte dei cloni è identificabile a<br />
livello <strong>di</strong> genere, il genere più abbondante<br />
è Streptococcus (27%).<br />
Firmicutes 1Bacillus[100%]<br />
Firmicutes 1Clostri<strong>di</strong>um[100%]<br />
Firmicutes 3Dolosigranulum[100%]<br />
Firmicutes 5Granulicatella[100%]<br />
Firmicutes 27Streptococcus[100%]<br />
Fusobacteria 1Fusobacterium[100%]<br />
Gammaproteobacteria 2Gammaproteobacteria[96%] (Oceanospirillales-like)<br />
Gammaproteobacteria 1Haemophilus[95%]<br />
Gammaproteobacteria 2Moraxella[100%]<br />
Gammaproteobacteria 2Nevskia[100%]<br />
Gammaproteobacteria 1Xanthomonadaceae[100%] (Lysobacter-like)
Raggi X per i Beni Culturali<br />
I raggi X sono onde elettromagnetiche costituite da fotoni <strong>di</strong><br />
energia che non subiscono fenomenti <strong>di</strong> riflessione o rifrazione : tramite<br />
il loro assorbimento nella materia forniscono in<strong>di</strong>cazioni dettagliate sulla<br />
geometria interna e sulla composizione dei manufatti artistici.<br />
A causa <strong>di</strong> un bombardamento da parte <strong>degli</strong> elettroni che, strappando<br />
elettroni atomici dai livelli profon<strong>di</strong>, rendono possibili transizioni<br />
elettroniche dai livelli a maggiore energia.<br />
La ra<strong>di</strong>azione avviene a causa del passaggio <strong>di</strong> un elettrone molto<br />
energetico in prossimità del nucleo mentre vengono emessi fotoni con<br />
una <strong>di</strong>stribuzione continua <strong>di</strong> energie.
Uso dei raggi x per lo stu<strong>di</strong>o dei Beni Culturali<br />
Esempio <strong>di</strong> ra<strong>di</strong>ografia: “La festa <strong>degli</strong> dei” <strong>di</strong> Bellini<br />
Sono evidenti strutture che nella realizzazione finale non sono state mantenute, come la<br />
foresta <strong>di</strong> alberi.
Uso dei raggi x per lo stu<strong>di</strong>o dei Beni Culturali<br />
Nell’immagine tomografica<br />
<strong>di</strong> questo vaso è possibile<br />
osservare, su <strong>di</strong>versi livelli,<br />
materiale in esso contenuto
Le datazioni <strong>di</strong> un reperto<br />
Le tecniche <strong>di</strong> datazione sono quelle a cui la fisica e la scienza dei materiali<br />
hanno dato un contributo sostanziale<br />
Datare un oggetto non è una cosa semplice, specialmente se il suo<br />
ritrovamento avviene al <strong>di</strong> fuori <strong>di</strong> un contesto conosciuto (ed anche in questo<br />
caso possono esserci dubbi sulla sua attribuzione)<br />
Le datazioni <strong>di</strong> un oggetto possono essere:<br />
Relativo: la datazione fornisce solo una comparazione <strong>di</strong> età tra oggetti<br />
(stesso stile, stesso periodo) ed una eventuale sequenza cronologica senza<br />
però fornire una data (es. templi Maya)<br />
Assoluto: il risultato dell’analisi è una data assoluta (correlata della relativa<br />
incertezza) relativa ad un particolare momento della “vita” dell’oggetto (es:<br />
anno della morte per il carbonio 14 o dell’ultima cottura per la<br />
termoluminescenza)
Tecniche <strong>di</strong> datazione relativa<br />
• Meto<strong>di</strong> stratigrafici: tutti i reperti trovati in uno stesso strato (non perturbato!) sono<br />
coevi. Gli strati alti sono più recenti <strong>di</strong> quelli posti in basso. Lo strato <strong>di</strong> superficie è il<br />
presente, andando verso il basso si incontrano strati sempre più antichi. La<br />
numerazione <strong>degli</strong> strati avviene partendo dal livello sterile in basso e andando verso la<br />
superficie<br />
• Meto<strong>di</strong> stilistici e tipologici: i manufatti simili in stile o tipologia sono in linea <strong>di</strong><br />
principio coevi<br />
• Cronologie relative da iscrizioni su manufatti: nomi <strong>di</strong> sovrani su monete o su lapi<strong>di</strong>.<br />
•Analisi del polline e dei semi: <strong>di</strong>versamente dalla cellulosa vegetale che non si<br />
conserva, i tessuti del polline e dei semi si conservano per migliaia <strong>di</strong> anni. L'analisi<br />
pollinica dei semi (specie e quantità) dà informazioni sul clima <strong>di</strong> un'area geografica in<br />
un certo momento storico.<br />
<strong>Stu<strong>di</strong></strong>o del DNA.
Tecniche <strong>di</strong> datazione assoluta Ra<strong>di</strong>ocarbonio (14C)<br />
azoto negli strati alti dell’atmosfera cattura neutroni termici perde 1 prot.<br />
n (neutroni Termici)+14N ----- 14C +1H<br />
N numero at. 7 C numero at. 6 14C 6protoni+8neutroni<br />
In natura ogni essere vivente è formato in parte <strong>di</strong> carbonio ed una<br />
piccola quantità <strong>di</strong> questo è ra<strong>di</strong>oattivo (14C).<br />
Quando un uomo, animale, pianta muore smette <strong>di</strong> assimilare carbonio<br />
dall’ambiente (cibo, respirazione etc.).<br />
Il 14C inizia a decadere con una vita me<strong>di</strong>a <strong>di</strong> 5730 anni per cui la<br />
quantità <strong>di</strong> 14C nell’organismo si riduce nel tempo. Questa legge si<br />
chiama legge del deca<strong>di</strong>mento ra<strong>di</strong>oattivo.<br />
Il rapporto tra il 14C massimo con quello presente in un reperto organico<br />
appartenuto ad un organismo morto tempo ad<strong>di</strong>etro ci dà la possibilità <strong>di</strong><br />
risalire alla data in cui è avvenuto il trapasso.
Metodo del ra<strong>di</strong>ocarbonio misurato con lo spettrografo <strong>di</strong> massa<br />
I lembi dei campioni sono stati trattati per estrarre carbonio<br />
Gli atomi <strong>di</strong> 14C sono fatti passare sotto vuoto tra un magnete e<br />
deflessi<br />
Ciascun 14C in base al suo peso percorrerà<br />
una traiettoria <strong>di</strong>versa per massa<br />
La posizione dell’impatto su un rivelatore<br />
viene detto spettro <strong>di</strong> massa e lo strumento<br />
Accelerator Mass Spectrometry (AMS)
Cacciatori <strong>di</strong> molecole: alla ricerca del DNA antico<br />
Un elemento molto importante venne da due pubblicazioni (la<br />
prima su un animale estinto simile alla zebra e la seconda su<br />
un’antica mummia cinese) in cui risultò la possibilità <strong>di</strong><br />
recuperare DNA antico da questi campioni:<br />
•Wang GH, Lu CL (1981) Isolation and identification of nucleic<br />
acids of the liver from a Corpse from the Changssha Han Tomb.<br />
In “Shen Wu Hua Hsueh Yu Sheng Wu Li Chin Chan”, 17:<br />
70-75.<br />
•Higuchi R et al. (1984) DNA sequences from the Quagga, an<br />
extinct member of the horse family. Nature, 312: 282-284.<br />
Il DNA poteva essere trovata sui reperti archeologici. Questa<br />
scoperta era innovativa in quanto apriva numerose nuove<br />
frontiere perché ora campioni quali ossa, denti, semi, legno ed<br />
insetti non erano solo oggetti da catalogare ed esporre nel museo<br />
ma vere e proprie miniere <strong>di</strong> informazioni.
“Il nostro DNA non sbia<strong>di</strong>sce come un’antica pergamena, non<br />
arrugginisce nel terreno come la spada <strong>di</strong> un guerriero morto molti<br />
anni prima, non viene eroso dal vento o dalla pioggia e non è<br />
neppure ridotto ad un cumulo <strong>di</strong> rovine da incen<strong>di</strong> o terremoti. Il<br />
nostro DNA è il viaggiatore proveniente da una terra antica che vive<br />
in ciascuno <strong>di</strong> noi” Bryan Sykes<br />
Per poter utilizzare le informazioni contenute nel DNA è<br />
necessario poter isolare determinate sequenze geniche, ma questa<br />
operazione risulta abbastanza complessa data non solo la ridotta<br />
quantità <strong>di</strong> DNA recuperabile ma anche per le cattive con<strong>di</strong>zioni<br />
del DNA estratto (che risulta molto degradato).<br />
Uno strumento essenziale per risolvere tale problema venne<br />
sviluppato a metà <strong>degli</strong> anni ’80 da Kary Mullis ed è la PCR<br />
(reazione a catena della polimerasi).
Sono reperibili quantità molto ridotte <strong>di</strong> DNA, la PCR permette <strong>di</strong><br />
superare i problemi posti dalla scarsità <strong>di</strong> DNA dei campioni fossili:<br />
• Paabo S, Gifford JA, Wilson AC (1989) Ancient DNA and the<br />
polymerase chain reaction. J. Biol. Chem. 264: 9709-12.<br />
• Poinar HN, Cano R, Poinar GO (1993) DNA from extinct plant,<br />
Nature 262: 677.<br />
L’analisi dei DNA estratti da campioni <strong>di</strong> <strong>di</strong>versa età hanno mostrato<br />
che la degradazione del DNA non <strong>di</strong>pende tanto dall’età assoluta<br />
quanto dalla velocità con cui tale campione è stato <strong>di</strong>sidratato e<br />
dall’ambiente anaerobico. La permanenza dell’acqua e dell’ossigeno<br />
nel campione porta infatti ad una depurinazione con conseguente<br />
indebolimento della doppia elica.
Formica fossile inclusa nell’ambra<br />
Poinar GO, Poinar HN, Cano RJ (1994)<br />
DNA from amber inclusions, in B.<br />
Hermann, S. Hummel (Eds), Ancient DNA,<br />
Springer-Verlag, New York, 92- 103.<br />
L’ipotesi dell’ambra come capsula del tempo per il DNA <strong>di</strong>ede<br />
imme<strong>di</strong>atamente ottimi risultati portando ad avere a <strong>di</strong>sposizione DNA<br />
<strong>di</strong> insetti rimasti bloccati nella resina oltre 130 milioni <strong>di</strong> anni fa.<br />
La PCR è in grado <strong>di</strong> amplificare anche ridotte tracce <strong>di</strong> DNA e<br />
lavorando con campioni <strong>di</strong> insetti in ambra alcuni gruppi riuscirono a<br />
<strong>di</strong>mostrare come una parte del DNA estratto fosse riconducibile non ad<br />
insetti bensì a mammiferi, batteri e funghi. Il RISCHIO DI<br />
CONTAMINAZIONE <strong>di</strong> un campione da parte dell’operatore risultò<br />
quin<strong>di</strong> molto elevato.
Un problema dei campioni conservati<br />
in ambra è la loro scarsità oltre al<br />
fatto che solo piccoli organismi<br />
possono essere considerati. Dato<br />
questo presupposto, suscitò grande<br />
entusiasmo la scoperta che buone<br />
quantità <strong>di</strong> DNA potevano essere<br />
estratte dalle ossa e dai denti.<br />
Hagelberg E, Sykes BC, HedgesRM<br />
(1989) Ancient bone DNAamplified.<br />
Nature 342: 485.<br />
Non era però possibile estrarre DNA antico da campioni con più <strong>di</strong> 50-100.000 anni e il<br />
DNA ritrovato era dovuto ad agenti contaminanti. Questo limite causò gran<strong>di</strong> <strong>di</strong>spiaceri<br />
a tutti coloro che speravano <strong>di</strong> poter utilizzare il DNA antico per capire qualche cosa in<br />
più su <strong>di</strong>nosauri o piante molto antiche, ma dava la conferma sul fatto che il DNA<br />
antico potesse essere utilizzato come strumento in campo archeologico.
I dati presentati in<strong>di</strong>cano che il DNA antico può essere estratto e<br />
fornire informazioni:<br />
• Costituzione <strong>di</strong> un albero filogenetico per l’identificazione <strong>di</strong> una<br />
specie (sia animale che vegetale);<br />
analisi faunistica<br />
analisi botanica<br />
L’identificazione <strong>di</strong> una specie consiste nell’amplificare e sequenziare<br />
geni noti confrontando la sequenza ottenuta con una sequenza <strong>di</strong><br />
riferimento. Questo approccio oltre ad identificare una specie ci permette<br />
anche <strong>di</strong> inserirla in un contesto <strong>di</strong> tipo evoluzionistico.<br />
Inoltre la PCR può far ottenere un fingerprint genetico <strong>di</strong> una data<br />
specie. Ciascuno <strong>di</strong> noi ha infatti un’organizzazione tipica <strong>di</strong> alcune<br />
sequenze (note come microsatelliti). Lo stesso vale per tutte le specie<br />
(sia animali che vegetali). Avendo a <strong>di</strong>sposizione uno standard <strong>di</strong><br />
riferimento è possibile assegnare un determinato campione biologico ad<br />
una data specie.
La Biologia per i Beni<br />
Culturali<br />
ARCHEBOTANICA
•Resti Resti <strong>di</strong> vino<br />
•Parti Parti <strong>di</strong><br />
Grappolo<br />
•Resti Resti <strong>di</strong> pece<br />
•Resine Resine<br />
•Miele Miele<br />
•Salse Salse <strong>di</strong><br />
Pesce<br />
•Resti Resti <strong>di</strong><br />
conchiglie<br />
•Acqua Acqua <strong>di</strong><br />
mare<br />
Anfore a Pompei.
Albinia, Orbetello,<br />
Grosseto, sito, Archeologico<br />
II, I sec. d.C.
Amphi-Phorein (a due anse).<br />
a. cananea, del 18° sec. a.C., b. fenicio-punica, c. etrusca, d. gallica, e.<br />
marsigliese, f. africana, g. greco-italica, h. Falerno, i. Dressel 24 <strong>di</strong><br />
Pompei, l. greca <strong>di</strong> Pompei.
Lo scavo archeologico<br />
Caivano (NA), località Padula, veduta <strong>degli</strong> scavi
Bollo, Dressel 30, Museo delle<br />
anfore, S.Benedetto del Tronto.<br />
A:anfora contenente vino vecchio con<br />
pece<br />
B:Anfora contenente vino <strong>di</strong> Creta<br />
C:Anfora contenente vino <strong>di</strong> Beziers<br />
dal vitigno Amineo AMINeum,<br />
BAETerrense VETus
Vasi da vino del periodo<br />
magnogreco ed etrusco<br />
utilizzati nei simposi e<br />
nelle cerimonie religiose<br />
a. Cratere a colonnette<br />
ed a campana<br />
b. Hydria<br />
c. Pelike<br />
d. Psikter
Vasi da vino del periodo<br />
magnogreco ed etrusco<br />
a. Oinochoe<br />
b. Kàntharos<br />
c. Skyphos<br />
d. Kylix
Kylix a figure rosse <strong>di</strong><br />
Douris, da Vulci 490 a.C.<br />
ceramica <strong>di</strong>pinta alt. cm<br />
10,6 - <strong>di</strong>am. cm 31, Musei<br />
Vaticani, inv. 16561<br />
Kylix a figure nere, da Vulci,<br />
attribuita al VI sec. a. C.<br />
Monaco <strong>di</strong> Baviera, Staatliche<br />
Antikensammlungen und<br />
Glyptothek
Ulisse riceve un<br />
otre da Marone<br />
<strong>di</strong> Ismaro.<br />
Cratere,<br />
IV sec. a. C.,<br />
Museo Eoliano,<br />
Lipari, Messina
La “Coppa <strong>di</strong> Nestore“, iscrizione metrica in greco, emporion<br />
Pithekoussai, 730 a.C. (Buchner 1952)<br />
Di Nestore la coppa buona a bersi…XI Canto dell’O<strong>di</strong>ssea
Reperti paleobotanici<br />
Fecce <strong>di</strong> vino, tomba egizia, 5000 a.C.<br />
Dendrologia, tralci <strong>di</strong> vite giorgiani montati<br />
in manicotti d’argento, 4000 a.C.
Palinologia<br />
Il termine Palinologia fu proposto nel 1944 dai botanici inglesi Hyde e Williams per<br />
In<strong>di</strong>care la scienza delle particelle polverulente (palynein dal greco <strong>di</strong>ffondere,<br />
pollen dal latino fior <strong>di</strong> farina)<br />
Gli antichi conoscevano il ruolo del polline, i bassorilievi del palazzo del Re assiro<br />
Ashuirnasirpal (895-883) rappresentano figure mistiche intenti ad agitare<br />
infiorescenze maschili della palma da dattero sopra quelle femminili (Pacini 1987)<br />
Nel XVI secolo Camerarius <strong>di</strong>mostrava che l’ovulo <strong>di</strong> una pianta non poteva<br />
svilupparsi in seme se prima non era sottoposto all’azione del polline (Pons 1970)<br />
Grazie alla scoperta del microscopio ottico (metà del<br />
XVII secolo) <strong>di</strong>venne possibile intrapredere i primi stu<strong>di</strong> sulla<br />
morfologia dei granuli pollinici (Malpighi e Grew primi<br />
<strong>di</strong>segni sui granuli)<br />
Nascita dell’analisi pollinica <strong>di</strong> un substrato è attribuita agli<br />
stu<strong>di</strong> <strong>di</strong> Von Post geologo svedese che nel 1916 presenta i<br />
primi <strong>di</strong>agrammi ottenuti da se<strong>di</strong>menti (Faegri 1989)<br />
Nineveh, northern Iraq Neo-Assyrian, about 645 BC
Colonna stratigrafica ricostruzione<br />
paleoambientale e climatica<br />
Pollini fossili: storia della<br />
vegetazione e del clima
Palinologia,<br />
perio<strong>di</strong> climatici,<br />
attività antropologiche<br />
1 Granulo pollinico <strong>di</strong> Tilia;<br />
2. spore <strong>di</strong> Thelypteris<br />
palustris; 3. spora <strong>di</strong><br />
Zygnematacea; 4. spora<br />
fungina; 5. seme <strong>di</strong> Juncus;<br />
6. sclerei<strong>di</strong> <strong>di</strong> Nymphaea.
Carpologia, Vitis Vinifera, tomba <strong>di</strong> Matelica, età<br />
Picena
Reperti carpologici
Reperti carpologici a Firenze e nel Castello <strong>di</strong> Miranduolo (<strong>Siena</strong>)
Structure of tegument cells of Vitis vinifera seeds observed by TEM, SEM, LM<br />
Microscopy.
<strong>Stu<strong>di</strong></strong>o Antracologico<br />
Deriva dal francese anthracologie che ha la sua etimologìa dal greco<br />
anthrax "carbone" col suffisso -logia "stu<strong>di</strong>o scientifico"<br />
Piani <strong>di</strong> frattura in<br />
rapporto al modo con<br />
cui vengono ottenuti: la<br />
sezione trasversale<br />
perpen<strong>di</strong>colare all'asse<br />
<strong>di</strong> accrescimento del<br />
fusto, la ra<strong>di</strong>ale<br />
parallela a tale asse e<br />
passante per il centro, la<br />
tangenziale pure<br />
parallela all'asse e<br />
corrispondente alla<br />
tangente del cerchio<br />
costituito dal piano<br />
trasversale .
<strong>Stu<strong>di</strong></strong>o Antracologico<br />
La cellulosa (50%) forma l’impalcatura del legno, la lignina (25%) è<br />
elastica e resistente alla compressione, emicellulosa (25%) biomassa<br />
materile organico.<br />
Il legno ancora vivo può subire attacchi da parte da organismi lignivori,<br />
microorganismi, funghi , insetti ecc.<br />
Con la morte dell’albero se il legno permane in ambiente anaerobico il<br />
processo <strong>di</strong> degradazione può arrestarsi (carbone)<br />
Il carbone sia naturale che ottenuto per combustione (origine antropica)<br />
non è attaccabile da microorganismi quin<strong>di</strong> non vi sono limiti <strong>di</strong><br />
conservazione, è molto fragile, subisce restringimento rispetto al legno<br />
fresco.<br />
Campionatura: lavaggio, setacciamento, asciugatura, osservazioni al<br />
binoculare , riconoscimento (interpretazione) , schedatura, <strong>di</strong>agramma.
Latifoglie, legno eteroxilo, costituito da una tessitura con vasi per il<br />
trasporto (angiosperme)
Aghifoglie, legno omoxilo, è costituito da trachel<strong>di</strong> cellule a forma<br />
<strong>di</strong> fuso (gimnosperme)
<strong>di</strong>stribuzione spaziale in percentuale<br />
dei resti antracologici rinvenuti<br />
nel granaio<br />
Reperti Antracologici<br />
Castello <strong>di</strong> Miranduolo<br />
posizionamento della<br />
griglia <strong>di</strong> campionatura<br />
e prelievo dei campioni
Shahr-e Sukhteh<br />
With its 150-hectare area of land,<br />
Shahr-e Sukhteh is one of the largest<br />
and richest archaeological sites.<br />
Located 55 kms to the south of Zabol<br />
in Sistan Baluchestan province was<br />
the capital of the region for more<br />
than 1000 years (3200-2100 bC).
Shahr-e Sukhteh<br />
Activity areas
Area industriale
Campionamenti palinologici
Estrazione DNA totale da terreno archeologico
Necropoli, I due Fanciulli
Fitoiconologia e le rappresentazioni vegetali per l'interpretazione delle piante<br />
Simone Martini, 1328, asse<strong>di</strong>o <strong>di</strong><br />
Montemassi, Montemassi,<br />
cm 340 per cm 968, Palazzo<br />
Pubblico <strong>di</strong> <strong>Siena</strong>.<br />
Domenico <strong>di</strong> Bartolo,<br />
l’educazione <strong>degli</strong> orfani, orfani,<br />
1444,<br />
Spedale della Scala, <strong>Siena</strong>, (Particolare).
Caravaggio,<br />
Bacco,<br />
1595,Galleria<br />
<strong>degli</strong> Uffizi <strong>di</strong><br />
Firenze
Caravaggio, Bacchino malato, 1593-94, Galleria Borghese, Roma
Cy<strong>di</strong>a<br />
Monilia<br />
Fusicla<strong>di</strong>um<br />
Coryneum<br />
Fusicla<strong>di</strong>um
Caravaggio, Riposo durante la fuga in Egitto, 1595,Galleria Doria Pamphilij Ro
Giuseppe e l'angelo (dettaglio) Maria e Gesù (dettaglio)
Calcatores, II sec. d.C. Museo archeologico <strong>di</strong> Venezia
Leandro Bassano, le quattro stagioni, palazzo vescovile, Bressanone
Giuseppe Gambarini, Allegoria dell’autunno, 1720, Pinacoteca Naz. Bo
Giovanni Bellini, 1515, derisione <strong>di</strong> Noè, Museo <strong>di</strong> Besancon<br />
Vecchio Testamento, Genesi 20 Noè, coltivatore della terra, cominciò a piantare una<br />
vigna. avendo bevuto il vino, si ubriacò e giacque scoperto all'interno della sua tenda
Fitoiconologia<br />
Duccio da Buoninsegna, Maestà, 1308-11<br />
ingresso <strong>di</strong> Cristo a Gerusalemme<br />
Simone Martini, Lippo Memmi<br />
,<br />
Annunciazione, 1333, Uffizi, FI
Gonfalone del Bonfigli (1472) chiesa Santa Maria a Corciano
Simone Martini, 1328,<br />
Palazzo Pubblico <strong>di</strong> <strong>Siena</strong>
Torna In<br />
Arte e territorio<br />
Vino e Città, territorio rurale
Ambrogio Lorenzetti, Effetti del Buongoverno, 1337-1340, Palazzo Pubblico, <strong>Siena</strong><br />
Esempio <strong>di</strong> prodotti tipici<br />
e Beni Culturali<br />
PRODOTTI SUINI DI CINTA SENESE:<br />
La Cinta Senese è una razza autoctona toscana, più precisamentedella Montagnola Senese nel comune <strong>di</strong> Casole d’Elsa (<strong>Siena</strong>).<br />
Vi sono alcune testimonianze artistiche che testimoniano l’antica origine come l’affresco <strong>di</strong> Ambrogio Lorenzetti (1319-1348)<br />
intitolato “Effetti del buon governo in città e campagna”. Le carni hanno un colore rosso, con grasso intramuscolare al 3%,<br />
tenore ottimale per fornire gusto e sapi<strong>di</strong>tà alla carne...........
Pubblicazioni Biodeterioramento<br />
•C. MILANESI, F. BALDI, S. BORIN, R. VIGNANI, F. CIAMPOLINI, C.<br />
FALERI, M. CRESTI-Biodeterioration of a fresco by biofilm forming bacteria,<br />
(pubblicazione su rivista, 2006), INTERNATIONAL BIODETERIORATION &<br />
BIODEGRADATION ( Vol. 57, 168-173).<br />
• C. MILANESI, F. BALDI, R. VIGNANI, F. CIAMPOLINI, C. FALERI, M.<br />
CRESTI-Fungal deterioration of me<strong>di</strong>eval wall fresco determined by analysing<br />
small fragments containing copper, (pubblicazione su rivista, 2006),<br />
INTERNATIONAL BIODETERIORATION & BIODEGRADATION, Vol. 57,<br />
7-13.<br />
•C. MILANESI, F. BALDI, SARA BORIN, R. VIGNANI, F. CIAMPOLINI, C.<br />
FALERI, M. CRESTI- A strain grows on endogenous carbon of deteriorated<br />
fresco fragments (Santissima Annunziata, <strong>Siena</strong>) producing a biofilm on the<br />
surface (atto <strong>di</strong> convegno, 2005), 25° convegno Società Italiana <strong>di</strong> Microbiologia<br />
Generale & Biotecnologie Microbiche Orvieto (Italia), 8/6/2006- 10/6/2006, 8.<br />
•C. MILANESI, F. BALDI, R. VIGNANI, F. CIAMPOLINI, C. FALERI, M.<br />
CRESTI-A strain of Penicillium crysogenum removed copper from painting<br />
surface causing me<strong>di</strong>eval fresco deterioration (atto <strong>di</strong> convegno, 2005), FISV<br />
2005, Riva del Garda (Italia), 22/9/2005- 25/9/2005, 6-7.
Pubblicazioni Archeo<br />
C. MILANESI, R. VIGNANI, F. CIAMPOLINI, C. FALERI, A. MORONI, M.<br />
CRESTI, Ultrastructure and DNA Sequence Analysis of Single Fossil Se<strong>di</strong>ment<br />
Cells, (2007), CARYOLOGIA, 60,129-132.<br />
C. MILANESI, R. VIGNANI, F. CIAMPOLINI, C. FALERI, L. CATTANI, A.<br />
MORONI,S. ARRIGHI, M. SCALI, P. TIBERI, E. SENSI, W. WANG, M.<br />
CRESTI- Ultrastructure and DNA sequence analysis of single Concentricystis cell<br />
from Alta Val Tiberina Holocene se<strong>di</strong>ment, (2006), Journal of Archaeological<br />
Science, Vol.33, 1081-1087.<br />
C. MILANESI, R. VIGNANI, F. CIAMPOLINI, C. FALERI, A. MORONI, M.<br />
CRESTI, Analisi ultrastrutturali e molecolari <strong>di</strong> singole particelle paleobotaniche<br />
(26-28/2006), Abstract Convegno, SBI,Biologia cell. molec. biotecn. <strong>di</strong>fferenz.,<br />
Alessandria (Italia), 23.