SCHWERPUNKT – ROTARY
SCHWERPUNKT – ROTARY SUISSE LIECHTENSTEIN – APRIL 2024 Un employé du ministère de la Santé du Darfour du Nord (Soudan) procède à un échantillonnage environnemental pour la polio à l’extérieur d’un établissement de santé à Al-Fasher. Les autorités s’efforcent de maintenir le niveau de surveillance requis pour détecter rapidement toute nouvelle apparition du virus 36 tôme de la polio. On peut alors confirmer, grâce à l’échantillon, si le virus est à l’origine de ce cas. Farrell Tobolowsky, épidémiologiste médicale à la division Vaccination du CDC, utilise la métaphore de la pêche à la ligne pour décrire la surveillance de la PFA. «N’oubliez jamais le filet que vous lancez lorsque vous pêchez, dit-elle, la polio est un poisson que l’on y attrape.» Au Malawi, les cliniciens ont prélevé un échantillon de selles sur la fillette, comme le veut le protocole, mais le dernier cas de polio dans ce pays remontant à 30 ans, le virus était loin d’être présent dans les esprits. L’échantillon a ensuite été envoyé en janvier au laboratoire de référence le plus proche, en Afrique du Sud. Les techniciens de laboratoire ont ensuite placé l’échantillon sur une culture cellulaire pour voir si le poliovirus se développait. En séquençant le virus, ils ont constaté qu’il s’agissait d’un poliovirus sauvage de type 1. L’échantillon a enfin été envoyé à un laboratoire spécialisé du CDC à Atlanta où des tests supplémentaires ont confirmé le résultat et déterminé que la séquence génétique de l’échantillon était liée à une chaîne de transmission observée pour la dernière fois dans la province pakistanaise de Sindh en octobre 2019. Les gènes agissent comme une sorte «d’horloge moléculaire», explique Ousmane Diop, coordinateur du réseau mondial de laboratoires pour la polio à l’OMS. Lorsque que le poliovirus est transmis, il connaît environ neuf mutations par an. En comptant le nombre de mutations au sein de l’échantillon, les scientifiques peuvent déterminer depuis combien de temps le virus est en circulation. M. Ahmed affirme que le séquençage génétique du virus a été importé dans la région. «Il a muté, mais il est clair qu’il circulait depuis au moins deux ans», dit-il. LA SURVEILLANCE PORTE SES FRUITS En juin 2022, lorsqu’un homme de 20 ans non vacciné de l’État de New York s’est présenté aux urgences avec des douleurs au dos et à l’estomac, une raideur de la nuque, une légère fièvre et une faiblesse dans les deux jambes, les cliniciens étaient à la recherche d’une maladie ressemblant à la polio, appelée myélite flasque aiguë (MFA). Avec l’arrivée de l’été, une période fréquente pour la MFA, l’État de New York a envoyé une alerte aux cliniciens leur demandant de surveiller les patients présentant une faiblesse musculaire soudaine. Constatant l’absence de réflexes et de force dans les jambes de ce patient, les médecins ont prélevé des échantillons de selles, entre autres, pour effectuer des tests de dépistage de la MFA. À la surprise générale, l’échantillon de selles s’est révélé positif au poliovirus. Le séquençage génétique a révélé qu’il s’agissait d’un variant du poliovirus de type 2 apparenté aux souches circulant à Londres et à Jérusalem. De nombreuses épidémies de ce variant circulent dans des communautés sous-vaccinées à travers le monde. «C’était incroyable de voir tout le travail que nous avions fait depuis 2014 pour mettre en place le système de surveillance [de la MFA] porter ses fruits, déclare GUETTER LA POLIO La surveillance de la paralysie flasque aiguë (PFA) est la référence absolue pour détecter les cas de polio. Les quatre étapes de la surveillance sont: • Identifier les enfants atteints de PFA et signaler les cas • Transporter les échantillons de selles pour l’analyse • Isoler et identifier le poliovirus en laboratoire • Cartographier le virus pour déterminer l’origine de la souche Source: Initiative mondiale pour l’éradication de la polio
SCHWERPUNKT – ROTARY SUISSE LIECHTENSTEIN – APRIL 2024 Mme Routh, et d’être en mesure d’identifier le premier cas [de polio] aux États- Unis depuis très longtemps.» Partant du principe que la polio circulait en Afrique depuis deux ans, l’OMS, le CDC et d’autres partenaires internationaux se sont mis en ordre de marche dans les jours qui ont suivi la confirmation du cas de poliovirus sauvage au Malawi. Leur premier objectif était de préparer la vaccination de plus de 33 millions d’enfants au Malawi et dans les pays voisins (Mozambique, Tanzanie, Zambie et Zimbabwe). Simultanément, les autorités ont formé le personnel de l’ensemble du système médical de ces cinq pays et les agents de santé étaient à l’affût des symptômes de la polio lorsqu’ils se déplaçaient de maison en maison pour vacciner les enfants. Cette surveillance ren - forcée a permis d’identifier huit autres enfants et adolescents paralysés par la polio au Mozambique. «Vous pouvez imaginer le pandémonium qui s’est installé», déclare Stella Anyangwe, membre du Rotary club de Pretoria (Afrique du Sud), qui s’est rendue au Mozambique pour participer à un examen de la réponse de l’Initiative mondiale pour l’éradication de la poliomyélite. Les cas mozambicains étaient circonscrits à la province de Tete, au nord-ouest du pays, que les autorités considèrent aujourd’hui comme l’épicentre de l’épidémie. «Nous pensons que la première importation a eu lieu au Mozambique, explique M. Diop, et que le cas détecté au Malawi l’a été parce que la surveillance y est plus sensible.» Aux États-Unis, les autorités ont également réagi rapidement, partant du principe qu’un cas de polio de type 2 pouvait se traduire par des milliers d’infections bénignes ou asymptomatiques. Le CDC a organisé un séminaire en ligne à l’intention des médecins et a renforcé la vigilance à l’égard des faiblesses musculaires soudaines. Les autorités sanitaires se sont aussi efforcées d’augmenter les taux de vaccination; dans le comté de Rockland, où vivait l’homme chez qui la polio a été diagnostiquée, seuls 60 % des enfants de deux ans avaient reçu les trois doses recommandées de vaccin contre la polio, y compris dans un quartier où seuls 37 % des enfants de cet âge étaient complètement vaccinés – la moyenne nationale étant de 93 %. SURVEILLER L’ENVIRONNEMENT AUSSI Pour se faire une idée de la durée de l’épidémie et de son étendue, le CDC a eu recours à un autre outil indispensable: la surveillance environnementale. Le monde étant sur le point d’éradiquer la polio, très peu d’enfants sont paralysés par la ma - ladie chaque année, mais ces enfants sont représentatifs de milliers d’infections asymptomatiques. La surveillance de la paralysie flasque aiguë permet de détecter les cas de paralysie. Mais comment trouver les autres? Une fois de plus, on en revient aux échantillons de matières fécales. Les scientifiques utilisent le même processus que celui utilisé pour analyser les selles d’un enfant paralysé, mais ils analysent des échantillons provenant des égouts. Ce processus de surveillance environnementale leur permet d’étudier toute une population d’enfants plutôt qu’un seul. En reprenant l’analogie du filet de pêche de Mme Tobolowsky, la surveillance environnementale permet d’élargir le filet en recherchant le virus dans les eaux usées. L’IMEP a commencé à rechercher le poliovirus dans des échantillons d’eaux usées en 2000 en Égypte où la polio était 37 Au Pakistan, l’un des deux derniers pays où la polio est endémique, la surveillance environnementale joue un rôle important dans la détection du virus. En juin 2023, le pays comptait 114 sites de collecte des eaux usées; 1 % des échantillons ont été testés positifs au virus au cours des six premiers mois de l’année
