Farmaceutische wetenschappen BSc - Vrije Universiteit Amsterdam
Farmaceutische wetenschappen BSc - Vrije Universiteit Amsterdam
Farmaceutische wetenschappen BSc - Vrije Universiteit Amsterdam
You also want an ePaper? Increase the reach of your titles
YUMPU automatically turns print PDFs into web optimized ePapers that Google loves.
<strong>Farmaceutische</strong> <strong>wetenschappen</strong> <strong>BSc</strong><br />
<strong>Vrije</strong> <strong>Universiteit</strong> <strong>Amsterdam</strong> - Faculteit der Exacte Wetenschappen - B <strong>Farmaceutische</strong> Wetenschappen - 2010-2011<br />
<strong>Vrije</strong> <strong>Universiteit</strong> <strong>Amsterdam</strong> - Faculteit der Exacte Wetenschappen - B <strong>Farmaceutische</strong> Wetenschappen - 2010-2011 I
De opleiding <strong>Farmaceutische</strong> Wetenschappen richt zich op de bestudering van medicijnen, op het doen van<br />
wetenschappelijk onderzoek hiernaar en op de toepassing van de verworven kennis. Het is een combinatie van<br />
Scheikunde, Biologie en Medische Vakken.<br />
Binnen de bacheloropleiding doe je kennis op van alle gebieden binnen de <strong>Farmaceutische</strong> Wetenschappen:<br />
Biomolecular Drug Analysis, Computational MEdicinal Chemistry and Toxicology, Drug Design and Synthesis,<br />
Molecular Pharmacology en Molecular Toxicology.<br />
Met de opleiding wordt beoogd zodanige kennis, vaardigheid en inzicht bij te brengen op het gebied van de<br />
<strong>Farmaceutische</strong> Wetenschappen dat de afgestudeerde in aanmerking kan komen voor een masteropleiding in de<br />
<strong>Farmaceutische</strong> Wetenschappen. Dit kan een onderzoeksrichting zijn, maar ook een opleiding op het gebied van<br />
Communicatie en Educatie of een meer maatschappijgerichte opleiding.<br />
Eveneens is het essentieel dat de afgestudeerde zich bekwaamd heeft in het verantwoord kiezen in<br />
wetenschappelijke problematieken. Om deze doelstellingen te bereiken is in de eerste plaats een brede<br />
basisopleiding nodig met daarin ook aandacht voor algemene academische vorming. Daarnaast is het noodzakelijk<br />
dat de student gedurende enige tijd actief deelneemt aan het farmaceutisch onderzoek.<br />
Meer opleidingsinformatie is te vinden op de de FEW-website.<br />
Een complete beschrijving van deze opleiding is te vinden in de Onderwijs- en Examenregeling op de FEW-website.<br />
Klik op de onderstaande links om informatie over de vakken te bekijken. Voor meer informatie voer de opleiding zelf<br />
kun je terecht bij je studieadviseur.<br />
<strong>Vrije</strong> <strong>Universiteit</strong> <strong>Amsterdam</strong> - Faculteit der Exacte Wetenschappen - B <strong>Farmaceutische</strong> Wetenschappen - 2010-2011 II
Inhoudsopgave<br />
Eerste jaar bachelor FAR 1<br />
Verplichte vakken 1<br />
Verplichte algemene onderdelen 2<br />
Tweede jaar bachelor FAR 2<br />
Verplichte keuze 1 uit 2 3<br />
Verplichte vakken 3<br />
Derde jaar bachelor FAR 3<br />
Individuele vakken 4<br />
Bachelor project 4<br />
Keuze ruimte 6<br />
Verdiepingsvakken Analytical chemistry and applied Spectroscopy 6<br />
Verdiepingsvakken Farmacochemie 7<br />
Verdiepingsvakken Fysische chemie 7<br />
Verdiepingsvakken Organische chemie 8<br />
Verdiepingsvakken Theoretische chemie 8<br />
Derde jaar bachelor FAR keuzevakken CEM Orientatie op de C/E/M-variant 8<br />
Verplichte vakken 8<br />
Vak: Bachelorproject Bio-analytische screeningstechnieken 9<br />
Vak: Bachelorproject Bio-analytische screeningstechnieken 9<br />
Vak: Bachelorproject Farmacochemie BMA 10<br />
Vak: Bachelorproject Farmacochemie BMA 11<br />
Vak: Bachelorproject Imaging en Laser Control van Foto-Chemie 11<br />
Vak: Bachelorproject Imaging en Laser Control van Foto-Chemie 12<br />
Vak: Bachelorproject Imaging en Laser Control van Foto-Chemie 13<br />
Vak: Bachelorproject Med. Chem., Drug Disc. & Target Find. 13<br />
Vak: Bachelorproject Med. Chem., Drug Disc. & Target Find. 14<br />
Vak: Bachelorproject Mol. Tox., Comp. Med. Chem. & Tox. 14<br />
Vak: Bachelorproject Mol. Tox., Comp. Med. Chem. & Tox. 14<br />
Vak: Bachelorproject Mol. Tox., Drug, Disp. and Saf. Assessm. 15<br />
Vak: Bachelorproject Mol. Tox., Drug, Disp. and Saf. Assessm. 15<br />
Vak: Bachelorproject Multidimensionale scheidingstechnieken 16<br />
Vak: Bachelorproject Multidimensionale scheidingstechnieken 16<br />
Vak: Bachelorproject Organometaal synthese 17<br />
Vak: Bachelorproject Organometaal synthese 18<br />
Vak: Bachelorproject Organometaal synthese 18<br />
Vak: Bachelorproject Spectroscopische detectie- en identificatietechnieken 19<br />
Vak: Bachelorproject Spectroscopische detectie- en identificatietechnieken 20<br />
Vak: Bachelorproject Spectroscopische detectie- en identificatietechnieken 20<br />
Vak: Bachelorproject Synthese en structuuranalyse 21<br />
Vak: Bachelorproject Synthese en structuuranalyse 22<br />
Vak: Bachelorproject Synthese en structuuranalyse 23<br />
Vak: Bachelorproject Theoretical Chemistry 24<br />
Vak: Bachelorproject Theoretical Chemistry 24<br />
<strong>Vrije</strong> <strong>Universiteit</strong> <strong>Amsterdam</strong> - Faculteit der Exacte Wetenschappen - B <strong>Farmaceutische</strong> Wetenschappen - 2010-2011 III
Vak: Bachelorproject Theoretical Chemistry 25<br />
Vak: Bachelorproject Toegepaste theoretische chemie 26<br />
Vak: Bachelorproject Toegepaste theoretische chemie 27<br />
Vak: Bachelorproject Toegepaste theoretische chemie 28<br />
Vak: Basischemie 29<br />
Vak: Basispracticum farmacochemie 30<br />
Vak: Basispracticum Farmacochemie 31<br />
Vak: Basiswiskunde 31<br />
Vak: Bioanalyse eiwitten 32<br />
Vak: Bio-Analytical Chemistry 32<br />
Vak: Biochemie 32<br />
Vak: Biochemie 34<br />
Vak: Blusinstructie: Praktijk S&F/N&S/SBI incl MNW. 35<br />
Vak: Blusinstructie: Theorie: S&F/N&S/W/I/SBI gelijktijdig in Q1 35<br />
Vak: BP Farmacochemie MC, DD&S 35<br />
Vak: BP Farmacochemie MC, DD&S 35<br />
Vak: Calculus 1 35<br />
Vak: Chemie / farmacochemie en samenleving 36<br />
Vak: Chemische binding 37<br />
Vak: Computational (Pharmaco)Chemistry 37<br />
Vak: Computationele organische chemie Computational Organic Chemistry 38<br />
Vak: <strong>Farmaceutische</strong> toxicologie 38<br />
Vak: Farmacochemie in context 39<br />
Vak: Farmacokinetiek en ADME processen 39<br />
Vak: FEW individueel vak intern 39<br />
Vak: Fysica en medische fysica 1 40<br />
Vak: Geschiedenis van de natuur<strong>wetenschappen</strong> 40<br />
Vak: Heterologe expressie van biotransformatie enzymen 41<br />
Vak: Identificatietechnieken 42<br />
Vak: Inleiding computergebruik 42<br />
Vak: Innovatieproject geneesmiddelen 43<br />
Vak: Integrated Practical Course 43<br />
Vak: Keuzevak BioAnalytische massaspectrometrie 44<br />
Vak: Keuzevak BioAnalytische screeningstechnieken 45<br />
Vak: Keuzevak Fysische Chemie 45<br />
Vak: Keuzevak Fysische Chemie 46<br />
Vak: Keuzevak Luminescence Spectr. and Mol-Mol interaction 46<br />
Vak: Keuzevak Luminescence Spectr. and Mol-Mol interaction 47<br />
Vak: Keuzevak Med. Chem., Drug Design & Synth. 47<br />
Vak: Keuzevak Med. Chem., Drug Design & Synth. 47<br />
Vak: Keuzevak Med. Chem., Drug Disc. & Target Find. 48<br />
Vak: Keuzevak Med. Chem., Drug Disc. & Target Find. 48<br />
Vak: Keuzevak Mol. Tox., Comp. Med. Chem. & Tox. 48<br />
Vak: Keuzevak Mol. Tox., Comp. Med. Chem. & Tox. 49<br />
Vak: Keuzevak Mol. Tox., Drug, Disp. and Saf. Assessm. 50<br />
<strong>Vrije</strong> <strong>Universiteit</strong> <strong>Amsterdam</strong> - Faculteit der Exacte Wetenschappen - B <strong>Farmaceutische</strong> Wetenschappen - 2010-2011 IV
Vak: Keuzevak Multidimensionale scheidingstechnieken 50<br />
Vak: Keuzevak Spectroscopische detectie- en identificatietechniek 51<br />
Vak: Keuzevak Spectroscopische detectie- en identificatietechniek 51<br />
Vak: Keuzevak Theoretische Chemie 52<br />
Vak: Keuzevak Theoretische Chemie 52<br />
Vak: Levende chemie 53<br />
Vak: Maatschappelijke aspecten van de natuur<strong>wetenschappen</strong> 53<br />
Vak: Macromoleculen en katalyse 54<br />
Vak: Mathematische methoden 55<br />
Vak: Medische (patho)fysiologie 2 56<br />
Vak: Medische fysiologie 1 56<br />
Vak: Medische fysiologie II 57<br />
Vak: Mentoraat / Tutoraat 57<br />
Vak: Modern Developments in Pharmacochemistry 58<br />
Vak: Moleculaire mechanismen van ziekten 58<br />
Vak: Moleculaire modeling 59<br />
Vak: Natuurstoffen 60<br />
Vak: Open House Analytical Chemistry and applied Spectroscopy 60<br />
Vak: Open house Chemical Biology 61<br />
Vak: Open House Comp. Med. Chem. & Tox. 61<br />
Vak: Open House DDS 61<br />
Vak: Open House Drug Discovery & Target Finding 61<br />
Vak: Open House MolTox 62<br />
Vak: Organische chemie 1 62<br />
Vak: Organische chemie 2 62<br />
Vak: Organische chemie 3: moderne organische synthese 63<br />
Vak: Organometaalchemie 64<br />
Vak: Oriëntatie op de M-variant 64<br />
Vak: Oriëntatie science educatie 65<br />
Vak: Practicum Bio-analytische chemie 67<br />
Vak: Practicum Moderne synthetische methoden 67<br />
Vak: Project Bio-analytische chemie 68<br />
Vak: Radiofarmacochemie 69<br />
Vak: Statistiek 70<br />
Vak: Structuurbiologie 70<br />
Vak: Studie en loopbaan 70<br />
Vak: Synthese practicum 71<br />
Vak: Thermodynamics 71<br />
Vak: Van atoom tot (bio)molecuul 72<br />
Vak: Van molecuul tot medicijn 73<br />
Vak: Veiligheidsinstructie S, F, MNW en SBI 30min 74<br />
Vak: Voorlichting door studentendecanen en CSL 74<br />
Vak: Wetenschapscommunicatie voor Bèta-onderzoekers 74<br />
Vak: Why Chemical Reactions Happen 75<br />
Vak: Wijsgerige vorming: natuur<strong>wetenschappen</strong>, filosofie en ethiek 76<br />
<strong>Vrije</strong> <strong>Universiteit</strong> <strong>Amsterdam</strong> - Faculteit der Exacte Wetenschappen - B <strong>Farmaceutische</strong> Wetenschappen - 2010-2011 V
Eerste jaar bachelor FAR<br />
Eerste jaar voor studenten gestart in 2010/2011<br />
In het eerste jaar zijn alle vakken verplicht, er zijn geen keuzevakken.<br />
Het programma in het eerste jaar vormt een basis; het geeft een eerste<br />
overzicht van de <strong>Farmaceutische</strong> Wetenschappen en is bedoeld als een<br />
verbreding van de kennis op diverse terreinen.<br />
Het eerste jaar van de bachelor heeft een oriënterende en selecterende<br />
functie. De student kan zich tijdens het eerste studiejaar oriënteren op<br />
de gekozen opleiding, dat wil zeggen: voldoet de opleiding aan de<br />
verwachting en is men er geschikt voor. Het programma van het eerste<br />
jaar geeft een eerste overzicht van de opleiding en geeft een verbreding<br />
van de kennis.<br />
De selecterende functie komt vooral tot uiting in de studieresultaten.<br />
De studieresultaten worden gevolgd door de studieadviseur. Als het nodig<br />
is worden studenten opgeroepen voor een gesprek. Op grond van de cijfers<br />
wordt aan het eind van het eerste jaar aan elke eerstejaars een (niet-<br />
bindend) schriftelijk studieadvies gestuurd.<br />
Opleidingsdelen:<br />
-<br />
-<br />
Verplichte vakken<br />
Verplichte algemene onderdelen<br />
Verplichte vakken<br />
Vakken:<br />
Naam Periode Credits Code<br />
Basischemie Periode 1 3.0 X_435077<br />
Basispracticum<br />
farmacochemie<br />
Basispracticum<br />
Farmacochemie<br />
3.0 X_430561<br />
Periode 1 4.0 X_435078<br />
Basiswiskunde 3.0 X_401069<br />
Bio-Analytical Chemistry Periode 5 3.0 X_430094<br />
Biochemie 3.0 X_430562<br />
Biochemie Periode 2 6.0 X_435051<br />
Calculus 1 Periode 2 3.0 X_400300<br />
Chemie / farmacochemie en<br />
samenleving<br />
Periode 4 3.0 X_435080<br />
Chemische binding Periode 2 3.0 X_435079<br />
Farmacochemie in context 3.0 X_430566<br />
Farmacokinetiek en ADME<br />
processen<br />
Periode 6 3.0 X_435084<br />
Identificatietechnieken Periode 5 6.0 X_435081<br />
<strong>Vrije</strong> <strong>Universiteit</strong> <strong>Amsterdam</strong> - Faculteit der Exacte Wetenschappen - B <strong>Farmaceutische</strong> Wetenschappen - 2010-2011 8-6-2012 - Pagina 1 van 76
Innovatieproject<br />
geneesmiddelen<br />
Verplichte algemene onderdelen<br />
Vakken:<br />
Tweede jaar bachelor FAR<br />
Tweede jaar voor studenten gestart in 2009/2010<br />
Periode 3 6.0 X_435095<br />
Levende chemie 3.0 X_430569<br />
Medische fysiologie 1 Periode 1 3.0 X_430059<br />
Organische chemie 1 Periode 5 3.0 X_435091<br />
Practicum Bio-analytische<br />
chemie<br />
Project Bio-analytische<br />
chemie<br />
Periode 6 3.0 X_435085<br />
In het tweede studiejaar wordt beoogd een verdieping van kennis, inzicht<br />
en vaardigheden op deelgebieden van de farmaceutische Wetenschappen tot<br />
stand te<br />
brengen. Dit vormt de basis voor de differentiatie in het derde jaar.<br />
In periode 4 is er een verplichte keuze tussen de vakken<br />
Maatschappelijke aspecten van<br />
natuur<strong>wetenschappen</strong> en Geschiedenis van de natuur<strong>wetenschappen</strong>.<br />
Daarnaast volg je het verplichte onderdeel Studie en Loopbaan in periode<br />
5. Tijdens deze cursus wordt er expliciet aandacht besteed aan jouw<br />
competenties en vaardigheden, zodat jij je bewust wordt van jouw sterke<br />
punten. Daarnaast krijg je meer inzicht in keuzemogelijkheden binnen de<br />
opleiding en mogelijkheden na de bacheloropleiding.<br />
6.0 X_430577<br />
Van atoom tot (bio)molecuul 6.0 X_430580<br />
Van molecuul tot medicijn 3.0 X_430581<br />
Why Chemical Reactions<br />
Happen<br />
Periode 4 3.0 X_435088<br />
Naam Periode Credits Code<br />
Blusinstructie: Praktijk<br />
S&F/N&S/SBI incl MNW.<br />
Blusinstructie: Theorie:<br />
S&F/N&S/W/I/SBI gelijktijdig<br />
in Q1<br />
Periode 1 0.0 X_000002<br />
Periode 1 0.0 X_000003<br />
Inleiding computergebruik 0.0 X_000004<br />
Mentoraat / Tutoraat Periode 1 0.0 X_000008<br />
Veiligheidsinstructie S, F,<br />
MNW en SBI 30min<br />
Voorlichting door<br />
studentendecanen en CSL<br />
Periode 1 0.0 X_000019<br />
0.0 X_000007<br />
<strong>Vrije</strong> <strong>Universiteit</strong> <strong>Amsterdam</strong> - Faculteit der Exacte Wetenschappen - B <strong>Farmaceutische</strong> Wetenschappen - 2010-2011 8-6-2012 - Pagina 2 van 76
Opleidingsdelen:<br />
-<br />
-<br />
Verplichte keuze 1 uit 2<br />
Verplichte vakken<br />
Vakken:<br />
Naam Periode Credits Code<br />
Studie en loopbaan Periode 1, Periode 5 0.0 X_000018<br />
Verplichte keuze 1 uit 2<br />
Verplichte keuze van 1 uit 2<br />
Vakken:<br />
Naam Periode Credits Code<br />
Geschiedenis van de<br />
natuur<strong>wetenschappen</strong><br />
Maatschappelijke aspecten<br />
van de<br />
natuur<strong>wetenschappen</strong><br />
Verplichte vakken<br />
Vakken:<br />
Derde jaar bachelor FAR<br />
Derde jaar voor studenten gestart in 2008/2009<br />
Periode 4 3.0 X_420148<br />
Periode 4 3.0 X_420153<br />
Naam Periode Credits Code<br />
Bioanalyse eiwitten Periode 1 3.0 X_435099<br />
<strong>Farmaceutische</strong> toxicologie Periode 1 3.0 X_430103<br />
Fysica en medische fysica 1 Periode 4 3.0 X_430060<br />
Integrated Practical Course Periode 5 12.0 X_430516<br />
Mathematische methoden Periode 4 6.0 X_401022<br />
Medische (patho)fysiologie<br />
2<br />
Periode 2 6.0 X_436503<br />
Medische fysiologie II 6.0 X_430102<br />
Moleculaire modeling Periode 6 6.0 X_435103<br />
Organische chemie 2 Periode 1 3.0 X_435007<br />
Statistiek Periode 1+2 6.0 X_420223<br />
Synthese practicum Periode 2, Periode 3 6.0 X_435192<br />
Thermodynamics Periode 2 3.0 X_430513<br />
Het derde studiejaar is opgebouwd uit een aantal verplichte vakken,<br />
<strong>Vrije</strong> <strong>Universiteit</strong> <strong>Amsterdam</strong> - Faculteit der Exacte Wetenschappen - B <strong>Farmaceutische</strong> Wetenschappen - 2010-2011 8-6-2012 - Pagina 3 van 76
daarnaast is er veel keuzeruimte die ingevuld moet worden met een<br />
eindproject en daarnaast keuzevakken. In het tweede deel van het derde<br />
studiejaar zijn ook de cursussen oriëntatie op de C-, E-, en M-variant<br />
geprogrammeerd.<br />
Je moet, voordat je begint aan de afronding van de bacheloropleiding,<br />
goedkeuring van je programma vragen aan de examencommissie via het<br />
formulier 'aanvraag goedkeuring bachelorprogramma'. De studieadviseur<br />
zal je hier tijdig op wijzen en je helpen bij het invullen. Ook de<br />
coördinatoren van de secties<br />
kunnen advies en ondersteuning bieden bij de keuzes die gemaakt moeten<br />
worden.<br />
Opleidingsdelen:<br />
-<br />
-<br />
-<br />
-<br />
Individuele vakken<br />
Bachelor project<br />
Keuze ruimte<br />
Verplichte vakken<br />
Vakken:<br />
Naam Periode Credits Code<br />
Open House Analytical<br />
Chemistry and applied<br />
Spectroscopy<br />
Open house Chemical<br />
Biology<br />
Open House Comp. Med.<br />
Chem. & Tox.<br />
Individuele vakken<br />
Vakken:<br />
Bachelor project<br />
Periode 1 0.0 X_000009<br />
Periode 1 0.0 X_000010<br />
Periode 1 0.0 X_000011<br />
Open House DDS Periode 1 0.0 X_000012<br />
Open House Drug<br />
Discovery & Target Finding<br />
Periode 1 0.0 X_000013<br />
Open House MolTox Periode 1 0.0 X_000014<br />
Naam Periode Credits Code<br />
FEW individueel vak intern 6.0 X_INDVAKI_09<br />
Verplichte keuze van 1 project van minimaal 18 ects en max 24 ects in<br />
het gebied van de <strong>Farmaceutische</strong> Wetenschappen (X_430524, X_430525, X_<br />
430527, X_430528, X_430530, X_430531, X_430533, X_430534, X_430536 en X_<br />
430537). Binnen een project van<br />
24 ects is een combinatie van twee verschillende disciplines mogelijk.<br />
<strong>Vrije</strong> <strong>Universiteit</strong> <strong>Amsterdam</strong> - Faculteit der Exacte Wetenschappen - B <strong>Farmaceutische</strong> Wetenschappen - 2010-2011 8-6-2012 - Pagina 4 van 76
Vakken:<br />
Naam Periode Credits Code<br />
Bachelorproject Bioanalytische<br />
screeningstechnieken<br />
Bachelorproject Bioanalytische<br />
screeningstechnieken<br />
Bachelorproject<br />
Farmacochemie BMA<br />
Bachelorproject<br />
Farmacochemie BMA<br />
Bachelorproject Imaging en<br />
Laser Control van Foto-<br />
Chemie<br />
Bachelorproject Imaging en<br />
Laser Control van Foto-<br />
Chemie<br />
Bachelorproject Imaging en<br />
Laser Control van Foto-<br />
Chemie<br />
Bachelorproject Med.<br />
Chem., Drug Disc. & Target<br />
Find.<br />
Bachelorproject Med.<br />
Chem., Drug Disc. & Target<br />
Find.<br />
Bachelorproject Mol. Tox.,<br />
Comp. Med. Chem. & Tox.<br />
Bachelorproject Mol. Tox.,<br />
Comp. Med. Chem. & Tox.<br />
Bachelorproject Mol. Tox.,<br />
Drug, Disp. and Saf.<br />
Assessm.<br />
Bachelorproject Mol. Tox.,<br />
Drug, Disp. and Saf.<br />
Assessm.<br />
Bachelorproject<br />
Multidimensionale<br />
scheidingstechnieken<br />
Bachelorproject<br />
Multidimensionale<br />
scheidingstechnieken<br />
Bachelorproject<br />
Organometaal synthese<br />
Bachelorproject<br />
Organometaal synthese<br />
Bachelorproject<br />
Organometaal synthese<br />
Ac. Jaar (september) 18.0 X_435117<br />
Ac. Jaar (september) 24.0 X_435118<br />
Ac. Jaar (september) 18.0 X_430524<br />
Ac. Jaar (september) 24.0 X_430525<br />
Ac. Jaar (september) 12.0 X_435052<br />
Ac. Jaar (september) 18.0 X_435114<br />
Ac. Jaar (september) 24.0 X_435116<br />
Ac. Jaar (september) 18.0 X_430530<br />
Ac. Jaar (september) 24.0 X_430531<br />
Ac. Jaar (september) 18.0 X_430533<br />
Ac. Jaar (september) 24.0 X_430534<br />
Ac. Jaar (september) 18.0 X_430536<br />
Ac. Jaar (september) 24.0 X_430537<br />
Ac. Jaar (september) 18.0 X_435122<br />
Ac. Jaar (september) 24.0 X_435123<br />
Ac. Jaar (september) 12.0 X_435104<br />
Ac. Jaar (september) 18.0 X_435133<br />
Ac. Jaar (september) 24.0 X_435134<br />
<strong>Vrije</strong> <strong>Universiteit</strong> <strong>Amsterdam</strong> - Faculteit der Exacte Wetenschappen - B <strong>Farmaceutische</strong> Wetenschappen - 2010-2011 8-6-2012 - Pagina 5 van 76
Bachelorproject<br />
Spectroscopische detectieen<br />
identificatietechnieken<br />
Bachelorproject<br />
Spectroscopische detectieen<br />
identificatietechnieken<br />
Bachelorproject<br />
Spectroscopische detectieen<br />
identificatietechnieken<br />
Bachelorproject Synthese<br />
en structuuranalyse<br />
Bachelorproject Synthese<br />
en structuuranalyse<br />
Bachelorproject Synthese<br />
en structuuranalyse<br />
Bachelorproject Theoretical<br />
Chemistry<br />
Bachelorproject Theoretical<br />
Chemistry<br />
Bachelorproject Theoretical<br />
Chemistry<br />
Bachelorproject Toegepaste<br />
theoretische chemie<br />
Bachelorproject Toegepaste<br />
theoretische chemie<br />
Bachelorproject Toegepaste<br />
theoretische chemie<br />
BP Farmacochemie MC,<br />
DD&S<br />
BP Farmacochemie MC,<br />
DD&S<br />
Keuze ruimte<br />
De keuzeruimte van 24, 18 of 12 ec kan worden ingevuld met een keuze uit<br />
onderstaande vakken.<br />
Voor de invulling van de keuzeonderdelen is de goedkeuring van de<br />
examencommissie vereist.<br />
Opleidingsdelen:<br />
-<br />
-<br />
-<br />
-<br />
-<br />
-<br />
Verdiepingsvakken Analytical chemistry and applied Spectroscopy<br />
Verdiepingsvakken Farmacochemie<br />
Verdiepingsvakken Fysische chemie<br />
Verdiepingsvakken Organische chemie<br />
Verdiepingsvakken Theoretische chemie<br />
Derde jaar bachelor FAR keuzevakken CEM Orientatie op de C/E/M-variant<br />
Verdiepingsvakken Analytical chemistry and applied Spectroscopy<br />
Vakken:<br />
Ac. Jaar (september) 18.0 X_435119<br />
Ac. Jaar (september) 24.0 X_435121<br />
Ac. Jaar (september) 12.0 X_435470<br />
Ac. Jaar (september) 18.0 X_435128<br />
Ac. Jaar (september) 24.0 X_435129<br />
Ac. Jaar (september) 12.0 X_435550<br />
Ac. Jaar (september) 12.0 X_430517<br />
Ac. Jaar (september) 18.0 X_435126<br />
Ac. Jaar (september) 24.0 X_435127<br />
Ac. Jaar (september) 18.0 X_435131<br />
Ac. Jaar (september) 24.0 X_435132<br />
Ac. Jaar (september) 12.0 X_435570<br />
Ac. Jaar (september) 18.0 X_430527<br />
Ac. Jaar (september) 24.0 X_430528<br />
<strong>Vrije</strong> <strong>Universiteit</strong> <strong>Amsterdam</strong> - Faculteit der Exacte Wetenschappen - B <strong>Farmaceutische</strong> Wetenschappen - 2010-2011 8-6-2012 - Pagina 6 van 76
Naam Periode Credits Code<br />
Keuzevak BioAnalytische<br />
massaspectrometrie<br />
Keuzevak BioAnalytische<br />
screeningstechnieken<br />
Keuzevak Luminescence<br />
Spectr. and Mol-Mol<br />
interaction<br />
Keuzevak Luminescence<br />
Spectr. and Mol-Mol<br />
interaction<br />
Keuzevak Multidimensionale<br />
scheidingstechnieken<br />
Keuzevak Spectroscopische<br />
detectie- en<br />
identificatietechniek<br />
Keuzevak Spectroscopische<br />
detectie- en<br />
identificatietechniek<br />
Verdiepingsvakken Farmacochemie<br />
Vakken:<br />
Verdiepingsvakken Fysische chemie<br />
Vakken:<br />
Ac. Jaar (september) 3.0 X_435026<br />
Ac. Jaar (september) 3.0 X_435028<br />
Ac. Jaar (september) 3.0 X_435032<br />
Ac. Jaar (september) 6.0 X_435033<br />
Ac. Jaar (september) 3.0 X_435037<br />
6.0 X_430568<br />
Ac. Jaar (september) 3.0 X_435039<br />
Naam Periode Credits Code<br />
Heterologe expressie van<br />
biotransformatie enzymen<br />
Keuzevak Med. Chem.,<br />
Drug Design & Synth.<br />
Keuzevak Med. Chem.,<br />
Drug Design & Synth.<br />
Keuzevak Med. Chem.,<br />
Drug Disc. & Target Find.<br />
Keuzevak Med. Chem.,<br />
Drug Disc. & Target Find.<br />
Keuzevak Mol. Tox., Comp.<br />
Med. Chem. & Tox.<br />
Keuzevak Mol. Tox., Comp.<br />
Med. Chem. & Tox.<br />
Keuzevak Mol. Tox., Drug,<br />
Disp. and Saf. Assessm.<br />
Ac. Jaar (september) 6.0 X_430549<br />
Ac. Jaar (september) 3.0 X_430542<br />
Ac. Jaar (september) 6.0 X_430543<br />
Ac. Jaar (september) 3.0 X_430544<br />
Ac. Jaar (september) 6.0 X_430545<br />
Ac. Jaar (september) 3.0 X_430546<br />
Ac. Jaar (september) 6.0 X_430547<br />
Ac. Jaar (september) 3.0 X_430548<br />
Naam Periode Credits Code<br />
<strong>Vrije</strong> <strong>Universiteit</strong> <strong>Amsterdam</strong> - Faculteit der Exacte Wetenschappen - B <strong>Farmaceutische</strong> Wetenschappen - 2010-2011 8-6-2012 - Pagina 7 van 76
Keuzevak Fysische Chemie Ac. Jaar (september) 3.0 X_430540<br />
Keuzevak Fysische Chemie Ac. Jaar (september) 6.0 X_430541<br />
Verdiepingsvakken Organische chemie<br />
Vakken:<br />
Naam Periode Credits Code<br />
Computationele organische<br />
chemie Computational<br />
Organic Chemistry<br />
Verdiepingsvakken Theoretische chemie<br />
Vakken:<br />
Derde jaar bachelor FAR keuzevakken CEM Orientatie op de C/E/M-variant<br />
Vakken:<br />
Verplichte vakken<br />
Vakken:<br />
Ac. Jaar (september) 9.0 X_435017<br />
Macromoleculen en katalyse Ac. Jaar (september) 6.0 X_435450<br />
Natuurstoffen Ac. Jaar (september) 6.0 X_435440<br />
Organische chemie 3:<br />
moderne organische<br />
synthese<br />
Periode 3 3.0 X_435109<br />
Organometaalchemie Ac. Jaar (september) 3.0 X_435018<br />
Practicum Moderne<br />
synthetische methoden<br />
Ac. Jaar (september) 9.0 X_435016<br />
Naam Periode Credits Code<br />
Keuzevak Theoretische<br />
Chemie<br />
Keuzevak Theoretische<br />
Chemie<br />
Ac. Jaar (september) 3.0 X_430538<br />
Ac. Jaar (september) 6.0 X_430539<br />
Naam Periode Credits Code<br />
Oriëntatie op de M-variant Periode 4 6.0 X_400375<br />
Oriëntatie science educatie Periode 4 6.0 O_ORIBETA<br />
Wetenschapscommunicatie<br />
voor Bèta-onderzoekers<br />
Periode 4 6.0 AB_470185<br />
<strong>Vrije</strong> <strong>Universiteit</strong> <strong>Amsterdam</strong> - Faculteit der Exacte Wetenschappen - B <strong>Farmaceutische</strong> Wetenschappen - 2010-2011 8-6-2012 - Pagina 8 van 76
Naam Periode Credits Code<br />
Computational<br />
(Pharmaco)Chemistry<br />
Modern Developments in<br />
Pharmacochemistry<br />
Moleculaire mechanismen<br />
van ziekten<br />
Bachelorproject Bio-analytische screeningstechnieken<br />
Doel vak<br />
Het verwerven van praktisch en theoretisch inzicht omtrent een bepaald<br />
thema aan de hand van het zelfstandig opzetten en uitvoeren van een<br />
onderzoeksproject.<br />
Inhoud vak<br />
Het primaire doel is het ontwikkelen van complete bioanalytische<br />
systemen waarmee zowel de selectiviteit als de gevoeligheid verbeterd<br />
kan worden. Bovendien wordt het in de industrie en de kliniek steeds<br />
belangrijker om grote aantallen monsters in een korte tijd te kunnen<br />
analyseren, vandaar dat de ontwikkeling en optimalisering van<br />
geautomatiseerde multidimensionale systemen een belangrijke plaats<br />
inneemt. Het gaat hierbij om toepassing van biospecifieke en<br />
massaspectrometrische technieken. Centraal staan de ontwikkeling van<br />
methoden voor peptiden, eiwitten en metabolieten in een complexe matrix.<br />
Onderwijsvorm<br />
Zelfstandig opzetten en uitvoeren van een onderzoeksproject.<br />
Literatuur<br />
Praktische handleidingen en basisliteratuur.<br />
Doelgroep<br />
3F, 3S<br />
Periode 2 6.0 X_435350<br />
Periode 2 3.0 X_430515<br />
Periode 3 3.0 X_430104<br />
Radiofarmacochemie Periode 1 3.0 X_436502<br />
Structuurbiologie Periode 1 6.0 X_430080<br />
Wijsgerige vorming:<br />
natuur<strong>wetenschappen</strong>,<br />
filosofie en ethiek<br />
Periode 1 3.0 X_435340<br />
Vakcode X_435117 (435117)<br />
Periode Ac. Jaar (september)<br />
Credits 18.0<br />
Voertaal Nederlands<br />
Faculteit Faculteit der Exacte Wetenschappen<br />
Coördinator dr. H. Lingeman<br />
Overige informatie<br />
Dit bachelorproject bestaat in drie varianten. De basisvariant van 12<br />
studiepunten (vakcode 435460) kan in overleg met de coördinator worden<br />
uitgebreid naar 18 studiepunten (vakcode 435117) of 24 studiepunten<br />
(vakcode 435118).<br />
Bachelorproject Bio-analytische screeningstechnieken<br />
<strong>Vrije</strong> <strong>Universiteit</strong> <strong>Amsterdam</strong> - Faculteit der Exacte Wetenschappen - B <strong>Farmaceutische</strong> Wetenschappen - 2010-2011 8-6-2012 - Pagina 9 van 76
Vakcode X_435118 (435118)<br />
Periode Ac. Jaar (september)<br />
Credits 24.0<br />
Voertaal Nederlands<br />
Faculteit Faculteit der Exacte Wetenschappen<br />
Coördinator dr. H. Lingeman<br />
Doel vak<br />
Het verwerven van praktisch en theoretisch inzicht omtrent een bepaald<br />
thema aan de hand van het zelfstandig opzetten en uitvoeren van een<br />
onderzoeksproject.<br />
Inhoud vak<br />
Het primaire doel is het ontwikkelen van complete bioanalytische<br />
systemen waarmee zowel de selectiviteit als de gevoeligheid verbeterd<br />
kan worden. Bovendien wordt het in de industrie en de kliniek steeds<br />
belangrijker om grote aantallen monsters in een korte tijd te kunnen<br />
analyseren, vandaar dat de ontwikkeling en optimalisering van<br />
geautomatiseerde multidimensionale systemen een belangrijke plaats<br />
inneemt. Het gaat hierbij om toepassing van biospecifieke en<br />
massaspectrometrische technieken. Centraal staan de ontwikkeling van<br />
methoden voor peptiden, eiwitten en metabolieten in een complexe matrix.<br />
Onderwijsvorm<br />
Zelfstandig opzetten en uitvoeren van een onderzoeksproject.<br />
Literatuur<br />
Praktische handleidingen en basisliteratuur.<br />
Doelgroep<br />
3F, 3S<br />
Overige informatie<br />
Dit bachelorproject bestaat in drie varianten. De basisvariant van 12<br />
studiepunten (vakcode 435460) kan in overleg met de coördinator worden<br />
uitgebreid naar 18 studiepunten (vakcode 435117) of 24 studiepunten<br />
(vakcode 435118).<br />
Bachelorproject Farmacochemie BMA<br />
Vakcode X_430524 (430524)<br />
Periode Ac. Jaar (september)<br />
Credits 18.0<br />
Voertaal Nederlands<br />
Faculteit Faculteit der Exacte Wetenschappen<br />
Coördinator dr. H. Lingeman<br />
Inhoud vak<br />
De inhoud van het bachelorproject wordt in overleg met de docent<br />
bepaald. Dit geldt ook voor het aantal contacturen en te gebruiken<br />
studiemateriaal. Neem tijdig contact op met de docent.<br />
Overige informatie<br />
<strong>Vrije</strong> <strong>Universiteit</strong> <strong>Amsterdam</strong> - Faculteit der Exacte Wetenschappen - B <strong>Farmaceutische</strong> Wetenschappen - 2010-2011 8-6-2012 - Pagina 10 van 76
Dit bachelorproject bestaat in drie varianten. De basisvariant van 12<br />
studiepunten (vakcode 430523) kan in overleg met de coordinator worden<br />
uitgebreid naar 18 studiepunten (vakcode 430524) of 24 studiepunten<br />
(vakcode 430525).<br />
Bachelorproject Farmacochemie BMA<br />
Vakcode X_430525 (430525)<br />
Periode Ac. Jaar (september)<br />
Credits 24.0<br />
Voertaal Nederlands<br />
Faculteit Faculteit der Exacte Wetenschappen<br />
Coördinator dr. H. Lingeman<br />
Inhoud vak<br />
De inhoud van het bachelorproject wordt in overleg met de docent<br />
bepaald. Dit geldt ook voor het aantal contacturen en te gebruiken<br />
studiemateriaal. Neem tijdig contact op met de docent.<br />
Overige informatie<br />
Dit bachelorproject bestaat in drie varianten. De basisvariant van 12<br />
studiepunten (vakcode 430523) kan in overleg met de coordinator worden<br />
uitgebreid naar 18 studiepunten (vakcode 430524) of 24 studiepunten<br />
(vakcode 430525).<br />
Bachelorproject Imaging en Laser Control van Foto-Chemie<br />
Vakcode X_435052 (435052)<br />
Periode Ac. Jaar (september)<br />
Credits 12.0<br />
Voertaal Nederlands<br />
Faculteit Faculteit der Exacte Wetenschappen<br />
Coördinator prof. dr. M.H.M. Janssen<br />
Doel vak<br />
Verkrijgen van inzicht in het verloop van elementaire chemische<br />
processen, met name laser geinduceerde foto-chemische processen, en in<br />
de krachten die een rol spelen bij het vormen en breken van een<br />
chemische binding. Kennismaking met experimentele technieken op het<br />
gebied van (ultrasnelle) lasers, moleculaire bundels en geavanceerde<br />
imaging detectoren.<br />
Inhoud vak<br />
Er zijn twee onderzoeksthema's waarbinnen een eindproject kan worden<br />
uitgevoerd:<br />
- Tijdoplgeloste fotodynamica, coherent control en imaging met behulp<br />
van ultrasnelle femtoseconde lasers.<br />
- Fotodynamica van niet-adiabatische chemie.<br />
Voor een globale omschrijving van deze twee onderzoeksthema's wordt<br />
verwezen naar de beschrijving van de onderzoeksstage<br />
('Laserspectroscopie') in de masterfase. Belangrijke aspecten bij het<br />
uitvoeren van het eindproject zijn dat nadat het onderwerp is besproken<br />
<strong>Vrije</strong> <strong>Universiteit</strong> <strong>Amsterdam</strong> - Faculteit der Exacte Wetenschappen - B <strong>Farmaceutische</strong> Wetenschappen - 2010-2011 8-6-2012 - Pagina 11 van 76
met de begeleider, de student zelf een onderzoeksplan opstelt, het<br />
onderzoek uitvoert en hiervan verslag doet.<br />
Literatuur<br />
Praktische handleidingen, boeken en literatuur.<br />
Doelgroep<br />
3S, 3F<br />
Overige informatie<br />
Dit bachelorproject bestaat in drie varianten. De basisvariant van 12<br />
studiepunten (vakcode 435052) kan in overleg met de coordinator worden<br />
uitgebreid naar 18 studiepunten (vakcode 435114) of 24 studiepunten<br />
(vakcode 435116).<br />
Bachelorproject Imaging en Laser Control van Foto-Chemie<br />
Vakcode X_435114 (435114)<br />
Periode Ac. Jaar (september)<br />
Credits 18.0<br />
Voertaal Nederlands<br />
Faculteit Faculteit der Exacte Wetenschappen<br />
Coördinator prof. dr. M.H.M. Janssen<br />
Doel vak<br />
Verkrijgen van inzicht in het verloop van elementaire chemische<br />
processen, met name laser geinduceerde foto-chemische processen, en in<br />
de krachten die een rol spelen bij het vormen en breken van een<br />
chemische binding. Kennismaking met experimentele technieken op het<br />
gebied van (ultrasnelle) lasers, moleculaire bundels en geavanceerde<br />
imaging detectoren.<br />
Inhoud vak<br />
Er zijn twee onderzoeksthema's waarbinnen een eindproject kan worden<br />
uitgevoerd:<br />
- Tijdoplgeloste fotodynamica, coherent control en imaging met behulp<br />
van ultrasnelle femtoseconde lasers.<br />
- Fotodynamica van niet-adiabatische chemie.<br />
Voor een globale omschrijving van deze twee onderzoeksthema's wordt<br />
verwezen naar de beschrijving van de onderzoeksstage<br />
('Laserspectroscopie') in de masterfase. Belangrijke aspecten bij het<br />
uitvoeren van het eindproject zijn dat nadat het onderwerp is besproken<br />
met de begeleider, de student zelf een onderzoeksplan opstelt, het<br />
onderzoek uitvoert en hiervan verslag doet.<br />
Literatuur<br />
Praktische handleidingen, boeken en literatuur.<br />
Doelgroep<br />
3S, 3F<br />
Overige informatie<br />
Dit bachelorproject bestaat in drie varianten. De basisvariant van 12<br />
studiepunten (vakcode 435052) kan in overleg met de coordinator worden<br />
uitgebreid naar 18 studiepunten (vakcode 435114) of 24 studiepunten<br />
<strong>Vrije</strong> <strong>Universiteit</strong> <strong>Amsterdam</strong> - Faculteit der Exacte Wetenschappen - B <strong>Farmaceutische</strong> Wetenschappen - 2010-2011 8-6-2012 - Pagina 12 van 76
(vakcode 435116).<br />
Bachelorproject Imaging en Laser Control van Foto-Chemie<br />
Vakcode X_435116 (435116)<br />
Periode Ac. Jaar (september)<br />
Credits 24.0<br />
Voertaal Nederlands<br />
Faculteit Faculteit der Exacte Wetenschappen<br />
Coördinator prof. dr. M.H.M. Janssen<br />
Doel vak<br />
Verkrijgen van inzicht in het verloop van elementaire chemische<br />
processen, met name laser geinduceerde foto-chemische processen, en in<br />
de krachten die een rol spelen bij het vormen en breken van een<br />
chemische binding. Kennismaking met experimentele technieken op het<br />
gebied van (ultrasnelle) lasers, moleculaire bundels en geavanceerde<br />
imaging detectoren.<br />
Inhoud vak<br />
Er zijn twee onderzoeksthema's waarbinnen een eindproject kan worden<br />
uitgevoerd:<br />
- Tijdoplgeloste fotodynamica, coherent control en imaging met behulp<br />
van ultrasnelle femtoseconde lasers.<br />
- Fotodynamica van niet-adiabatische chemie.<br />
Voor een globale omschrijving van deze twee onderzoeksthema's wordt<br />
verwezen naar de beschrijving van de onderzoeksstage<br />
('Laserspectroscopie') in de masterfase. Belangrijke aspecten bij het<br />
uitvoeren van het eindproject zijn dat nadat het onderwerp is besproken<br />
met de begeleider, de student zelf een onderzoeksplan opstelt, het<br />
onderzoek uitvoert en hiervan verslag doet.<br />
Literatuur<br />
Praktische handleidingen, boeken en literatuur.<br />
Doelgroep<br />
3S, 3F<br />
Overige informatie<br />
Dit bachelorproject bestaat in drie varianten. De basisvariant van 12<br />
studiepunten (vakcode 435052) kan in overleg met de coordinator worden<br />
uitgebreid naar 18 studiepunten (vakcode 435114) of 24 studiepunten<br />
(vakcode 435116).<br />
Bachelorproject Med. Chem., Drug Disc. & Target Find.<br />
Vakcode X_430530 (430530)<br />
Periode Ac. Jaar (september)<br />
Credits 18.0<br />
Voertaal Nederlands<br />
Faculteit Faculteit der Exacte Wetenschappen<br />
Coördinator dr. J.N.M. Commandeur<br />
<strong>Vrije</strong> <strong>Universiteit</strong> <strong>Amsterdam</strong> - Faculteit der Exacte Wetenschappen - B <strong>Farmaceutische</strong> Wetenschappen - 2010-2011 8-6-2012 - Pagina 13 van 76
Inhoud vak<br />
De inhoud van het bachelorproject wordt in overleg met de docent<br />
bepaald. Dit geldt ook voor het aantal contacturen en te gebruiken<br />
studiemateriaal. Neem tijdig contact op met de docent.<br />
Overige informatie<br />
Dit bachelorproject bestaat in drie varianten. De basisvariant van 12<br />
studiepunten (vakcode 430529) kan in overleg met de coordinator worden<br />
uitgebreid naar 18 studiepunten (vakcode 430530) of 24 studiepunten<br />
(vakcode 430531).<br />
Bachelorproject Med. Chem., Drug Disc. & Target Find.<br />
Vakcode X_430531 (430531)<br />
Periode Ac. Jaar (september)<br />
Credits 24.0<br />
Voertaal Nederlands<br />
Faculteit Faculteit der Exacte Wetenschappen<br />
Coördinator dr. J.N.M. Commandeur<br />
Inhoud vak<br />
De inhoud van het bachelorproject wordt in overleg met de docent<br />
bepaald. Dit geldt ook voor het aantal contacturen en te gebruiken<br />
studiemateriaal. Neem tijdig contact op met de docent.<br />
Overige informatie<br />
Dit bachelorproject bestaat in drie varianten. De basisvariant van 12<br />
studiepunten (vakcode 430529) kan in overleg met de coordinator worden<br />
uitgebreid naar 18 studiepunten (vakcode 430530) of 24 studiepunten<br />
(vakcode 430531).<br />
Bachelorproject Mol. Tox., Comp. Med. Chem. & Tox.<br />
Vakcode X_430533 (430533)<br />
Periode Ac. Jaar (september)<br />
Credits 18.0<br />
Voertaal Nederlands<br />
Faculteit Faculteit der Exacte Wetenschappen<br />
Coördinator dr. J.N.M. Commandeur<br />
Inhoud vak<br />
De inhoud van het bachelorproject wordt in overleg met de docent<br />
bepaald. Dit geldt ook voor het aantal contacturen en te gebruiken<br />
studiemateriaal. Neem tijdig contact op met de docent.<br />
Overige informatie<br />
Dit bachelorproject bestaat in drie varianten. De basisvariant van 12<br />
studiepunten (vakcode 430532) kan in overleg met de coordinator worden<br />
uitgebreid naar 18 studiepunten (vakcode 430533) of 24 studiepunten<br />
(vakcode 430534).<br />
Bachelorproject Mol. Tox., Comp. Med. Chem. & Tox.<br />
<strong>Vrije</strong> <strong>Universiteit</strong> <strong>Amsterdam</strong> - Faculteit der Exacte Wetenschappen - B <strong>Farmaceutische</strong> Wetenschappen - 2010-2011 8-6-2012 - Pagina 14 van 76
Vakcode X_430534 (430534)<br />
Periode Ac. Jaar (september)<br />
Credits 24.0<br />
Voertaal Nederlands<br />
Faculteit Faculteit der Exacte Wetenschappen<br />
Coördinator dr. J.N.M. Commandeur<br />
Inhoud vak<br />
De inhoud van het bachelorproject wordt in overleg met de docent<br />
bepaald. Dit geldt ook voor het aantal contacturen en te gebruiken<br />
studiemateriaal. Neem tijdig contact op met de docent.<br />
Overige informatie<br />
Dit bachelorproject bestaat in drie varianten. De basisvariant van 12<br />
studiepunten (vakcode 430532) kan in overleg met de coordinator worden<br />
uitgebreid naar 18 studiepunten (vakcode 430533) of 24 studiepunten<br />
(vakcode 430534).<br />
Bachelorproject Mol. Tox., Drug, Disp. and Saf. Assessm.<br />
Vakcode X_430536 (430536)<br />
Periode Ac. Jaar (september)<br />
Credits 18.0<br />
Voertaal Nederlands<br />
Faculteit Faculteit der Exacte Wetenschappen<br />
Coördinator dr. J.N.M. Commandeur<br />
Inhoud vak<br />
De inhoud van het bachelorproject wordt in overleg met de docent<br />
bepaald. Dit geldt ook voor het aantal contacturen en te gebruiken<br />
studiemateriaal. Neem tijdig contact op met de docent.<br />
Overige informatie<br />
Dit bachelorproject bestaat in drie varianten. De basisvariant van 12<br />
studiepunten (vakcode 430535) kan in overleg met de coordinator worden<br />
uitgebreid naar 18 studiepunten (vakcode 430536) of 24 studiepunten<br />
(vakcode 430537).<br />
Bachelorproject Mol. Tox., Drug, Disp. and Saf. Assessm.<br />
Vakcode X_430537 (430537)<br />
Periode Ac. Jaar (september)<br />
Credits 24.0<br />
Voertaal Nederlands<br />
Faculteit Faculteit der Exacte Wetenschappen<br />
Coördinator dr. J.N.M. Commandeur<br />
Inhoud vak<br />
De inhoud van het bachelorproject wordt in overleg met de docent<br />
bepaald. Dit geldt ook voor het aantal contacturen en te gebruiken<br />
studiemateriaal. Neem tijdig contact op met de docent.<br />
<strong>Vrije</strong> <strong>Universiteit</strong> <strong>Amsterdam</strong> - Faculteit der Exacte Wetenschappen - B <strong>Farmaceutische</strong> Wetenschappen - 2010-2011 8-6-2012 - Pagina 15 van 76
Overige informatie<br />
Dit bachelorproject bestaat in drie varianten. De basisvariant van 12<br />
studiepunten (vakcode 430535) kan in overleg met de coordinator worden<br />
uitgebreid naar 18 studiepunten (vakcode 430536) of 24 studiepunten<br />
(vakcode 430537).<br />
Bachelorproject Multidimensionale scheidingstechnieken<br />
Vakcode X_435122 (435122)<br />
Periode Ac. Jaar (september)<br />
Credits 18.0<br />
Voertaal Nederlands<br />
Faculteit Faculteit der Exacte Wetenschappen<br />
Coördinator dr. H. Lingeman<br />
Doel vak<br />
Het doel is het verwerven van praktisch en theoretisch inzicht over een<br />
bepaald thema aan de hand van het zelfstandig opzetten en uitvoeren van<br />
een onderzoeksproject.<br />
Inhoud vak<br />
Het primaire doel is het ontwikkelen van complete analytische systemen,<br />
waarmee zowel de selectiviteit als de gevoeligheid verbeterd kan<br />
worden. Met name de ontwikkeling en optimalisering van geautomatiseerde<br />
multi-dimensionale systemen neemt een centrale plaats in bij dit type<br />
onderzoek. Het gaat hierbij om de koppeling van gaschromatografische of<br />
vloeistofchromatografische systemen met elkaar en met verschillende<br />
detectiesystemen.<br />
Onderwijsvorm<br />
Zelfstandig opzetten en uitvoeren van een onderzoeksproject.<br />
Doelgroep<br />
3F, 3S<br />
Overige informatie<br />
Dit bachelorproject bestaat in drie varianten. De basisvariant van 12<br />
studiepunten (vakcode 435490) kan in overleg met de coordinator worden<br />
uitgebreid naar 18 studiepunten (vakcode 435122) of 24 studiepunten<br />
(vakcode 435123).<br />
Bachelorproject Multidimensionale scheidingstechnieken<br />
Vakcode X_435123 (435123)<br />
Periode Ac. Jaar (september)<br />
Credits 24.0<br />
Voertaal Nederlands<br />
Faculteit Faculteit der Exacte Wetenschappen<br />
Coördinator dr. H. Lingeman<br />
Doel vak<br />
<strong>Vrije</strong> <strong>Universiteit</strong> <strong>Amsterdam</strong> - Faculteit der Exacte Wetenschappen - B <strong>Farmaceutische</strong> Wetenschappen - 2010-2011 8-6-2012 - Pagina 16 van 76
Het doel is het verwerven van praktisch en theoretisch inzicht over een<br />
bepaald thema aan de hand van het zelfstandig opzetten en uitvoeren van<br />
een onderzoeksproject.<br />
Inhoud vak<br />
Het primaire doel is het ontwikkelen van complete analytische systemen,<br />
waarmee zowel de selectiviteit als de gevoeligheid verbeterd kan<br />
worden. Met name de ontwikkeling en optimalisering van geautomatiseerde<br />
multi-dimensionale systemen neemt een centrale plaats in bij dit type<br />
onderzoek. Het gaat hierbij om de koppeling van gaschromatografische of<br />
vloeistofchromatografische systemen met elkaar en met verschillende<br />
detectiesystemen.<br />
Onderwijsvorm<br />
Zelfstandig opzetten en uitvoeren van een onderzoeksproject.<br />
Doelgroep<br />
3F, 3S<br />
Overige informatie<br />
Dit bachelorproject bestaat in drie varianten. De basisvariant van 12<br />
studiepunten (vakcode 435490) kan in overleg met de coordinator worden<br />
uitgebreid naar 18 studiepunten (vakcode 435122) of 24 studiepunten<br />
(vakcode 435123).<br />
Bachelorproject Organometaal synthese<br />
Vakcode X_435104 (435104)<br />
Periode Ac. Jaar (september)<br />
Credits 12.0<br />
Voertaal Nederlands<br />
Faculteit Faculteit der Exacte Wetenschappen<br />
Coördinator dr. J.C. Slootweg<br />
Doel vak<br />
Kennismaken met geavanceerde experimentele organometaalchemie.<br />
Inhoud vak<br />
In dit vak maak je kennis met synthetische technieken in de<br />
organometaal chemie. In dit project dat nauw gelieerd is aan lopend<br />
onderzoek werk je aan nieuwe organofosfor verbindingen en reagentia,<br />
katalysatoren, en (macro)cyclische structuren. Je leert technieken die<br />
de moderne chemicus tot zijn beschikking heeft om zuurstof en<br />
vochtgevoelige verbindingen te synthetiseren, en je gebruikt<br />
verschillende NMR methodes voor je analyses en chromatografische<br />
methodes voor de scheiding van je verbindingen; van kristallen worden,<br />
indien relvevant, X-ray structuren gemeten.<br />
Onderwijsvorm<br />
Practicumverslag<br />
Aanbevolen voorkennis<br />
Organische chemie I & II, practicum organische synthese.<br />
Doelgroep<br />
<strong>Vrije</strong> <strong>Universiteit</strong> <strong>Amsterdam</strong> - Faculteit der Exacte Wetenschappen - B <strong>Farmaceutische</strong> Wetenschappen - 2010-2011 8-6-2012 - Pagina 17 van 76
3S, 3F<br />
Overige informatie<br />
Dit bachelorproject bestaat in drie varianten. De basisvariant van 12<br />
studiepunten (vakcode 435104) kan in overleg met de coordinator worden<br />
uitgebreid naar 18 studiepunten (vakcode 435133) of 24 studiepunten<br />
(vakcode 435134).<br />
Bachelorproject Organometaal synthese<br />
Vakcode X_435133 (435133)<br />
Periode Ac. Jaar (september)<br />
Credits 18.0<br />
Voertaal Nederlands<br />
Faculteit Faculteit der Exacte Wetenschappen<br />
Coördinator dr. J.C. Slootweg<br />
Doel vak<br />
Kennismaken met geavanceerde experimentele organometaalchemie.<br />
Inhoud vak<br />
In dit vak maak je kennis met synthetische technieken in de<br />
organometaal chemie. In dit project dat nauw gelieerd is aan lopend<br />
onderzoek werk je aan nieuwe organofosfor verbindingen en reagentia,<br />
katalysatoren, en (macro)cyclische structuren. Je leert technieken die<br />
de moderne chemicus tot zijn beschikking heeft om zuurstof en<br />
vochtgevoelige verbindingen te synthetiseren, en je gebruikt<br />
verschillende NMR methodes voor je analyses en chromatografische<br />
methodes voor de scheiding van je verbindingen; van kristallen worden,<br />
indien relvevant, X-ray structuren gemeten.<br />
Onderwijsvorm<br />
Practicumverslag<br />
Aanbevolen voorkennis<br />
Organische chemie I & II, practicum organische synthese.<br />
Doelgroep<br />
3S, 3F<br />
Overige informatie<br />
Dit bachelorproject bestaat in drie varianten. De basisvariant van 12<br />
studiepunten (vakcode 435104) kan in overleg met de coordinator worden<br />
uitgebreid naar 18 studiepunten (vakcode 435133) of 24 studiepunten<br />
(vakcode 435134).<br />
Bachelorproject Organometaal synthese<br />
Vakcode X_435134 (435134)<br />
Periode Ac. Jaar (september)<br />
Credits 24.0<br />
Voertaal Nederlands<br />
Faculteit Faculteit der Exacte Wetenschappen<br />
Coördinator dr. J.C. Slootweg<br />
<strong>Vrije</strong> <strong>Universiteit</strong> <strong>Amsterdam</strong> - Faculteit der Exacte Wetenschappen - B <strong>Farmaceutische</strong> Wetenschappen - 2010-2011 8-6-2012 - Pagina 18 van 76
Doel vak<br />
Kennismaken met geavanceerde experimentele organometaalchemie.<br />
Inhoud vak<br />
In dit vak maak je kennis met synthetische technieken in de<br />
organometaal chemie. In dit project dat nauw gelieerd is aan lopend<br />
onderzoek werk je aan nieuwe organofosfor verbindingen en reagentia,<br />
katalysatoren, en (macro)cyclische structuren. Je leert technieken die<br />
de moderne chemicus tot zijn beschikking heeft om zuurstof en<br />
vochtgevoelige verbindingen te synthetiseren, en je gebruikt<br />
verschillende NMR methodes voor je analyses en chromatografische<br />
methodes voor de scheiding van je verbindingen; van kristallen worden,<br />
indien relvevant, X-ray structuren gemeten.<br />
Onderwijsvorm<br />
Practicumverslag<br />
Aanbevolen voorkennis<br />
Organische chemie I & II, practicum organische synthese.<br />
Doelgroep<br />
3S, 3F<br />
Overige informatie<br />
Dit bachelorproject bestaat in drie varianten. De basisvariant van 12<br />
studiepunten (vakcode 435104) kan in overleg met de coordinator worden<br />
uitgebreid naar 18 studiepunten (vakcode 435133) of 24 studiepunten<br />
(vakcode 435134).<br />
Bachelorproject Spectroscopische detectie- en identificatietechnieken<br />
Vakcode X_435119 (435119)<br />
Periode Ac. Jaar (september)<br />
Credits 18.0<br />
Voertaal Nederlands<br />
Faculteit Faculteit der Exacte Wetenschappen<br />
Coördinator prof. dr. C. Gooijer<br />
Doel vak<br />
Het doel is het verwerven van praktisch en theoretisch inzicht omtrent<br />
een bepaald thema aan de hand van het zelfstandig opzetten en uitvoeren<br />
van een onderzoeksproject.<br />
Inhoud vak<br />
Het ontwikkelen van nieuwe spectroscopische technieken die voor<br />
analytische toepassingen kunnen worden gebruikt. Het gaat hier met name<br />
om laser detectiesystemen voor de chromatografie of electroforese en op<br />
Raman spectroscopische en hoge-resolutie spectroscopie systemen voor de<br />
specifieke en gevoelige detectie van organische verbindingen.<br />
Onderwijsvorm<br />
Zelfstandig opzetten en uitvoeren van een onderzoeksproject.<br />
Literatuur<br />
<strong>Vrije</strong> <strong>Universiteit</strong> <strong>Amsterdam</strong> - Faculteit der Exacte Wetenschappen - B <strong>Farmaceutische</strong> Wetenschappen - 2010-2011 8-6-2012 - Pagina 19 van 76
Praktische handleidingen en basisliteratuur.<br />
Doelgroep<br />
3S, 3F<br />
Overige informatie<br />
Dit bachelorproject bestaat in drie varianten. De basisvariant van 12<br />
studiepunten (vakcode 435470) kan in overleg met de coordinator worden<br />
uitgebreid naar 18 studiepunten (vakcode 435119) of 24 studiepunten<br />
(vakcode 435121).<br />
Bachelorproject Spectroscopische detectie- en identificatietechnieken<br />
Vakcode X_435121 (435121)<br />
Periode Ac. Jaar (september)<br />
Credits 24.0<br />
Voertaal Nederlands<br />
Faculteit Faculteit der Exacte Wetenschappen<br />
Coördinator prof. dr. C. Gooijer<br />
Doel vak<br />
Het doel is het verwerven van praktisch en theoretisch inzicht omtrent<br />
een bepaald thema aan de hand van het zelfstandig opzetten en uitvoeren<br />
van een onderzoeksproject.<br />
Inhoud vak<br />
Het ontwikkelen van nieuwe spectroscopische technieken die voor<br />
analytische toepassingen kunnen worden gebruikt. Het gaat hier met name<br />
om laser detectiesystemen voor de chromatografie of electroforese en op<br />
Raman spectroscopische en hoge-resolutie spectroscopie systemen voor de<br />
specifieke en gevoelige detectie van organische verbindingen.<br />
Onderwijsvorm<br />
Zelfstandig opzetten en uitvoeren van een onderzoeksproject.<br />
Literatuur<br />
Praktische handleidingen en basisliteratuur.<br />
Doelgroep<br />
3S, 3F<br />
Overige informatie<br />
Dit bachelorproject bestaat in drie varianten. De basisvariant van 12<br />
studiepunten (vakcode 435470) kan in overleg met de coordinator worden<br />
uitgebreid naar 18 studiepunten (vakcode 435119) of 24 studiepunten<br />
(vakcode 435121).<br />
Bachelorproject Spectroscopische detectie- en identificatietechnieken<br />
Vakcode X_435470 (435470)<br />
Periode Ac. Jaar (september)<br />
Credits 12.0<br />
Voertaal Nederlands<br />
Faculteit Faculteit der Exacte Wetenschappen<br />
<strong>Vrije</strong> <strong>Universiteit</strong> <strong>Amsterdam</strong> - Faculteit der Exacte Wetenschappen - B <strong>Farmaceutische</strong> Wetenschappen - 2010-2011 8-6-2012 - Pagina 20 van 76
Coördinator prof. dr. C. Gooijer<br />
Doel vak<br />
Het doel is het verwerven van praktisch en theoretisch inzicht omtrent<br />
een bepaald thema aan de hand van het zelfstandig opzetten en uitvoeren<br />
van een onderzoeksproject.<br />
Inhoud vak<br />
Het ontwikkelen van nieuwe spectroscopische technieken die voor<br />
analytische toepassingen kunnen worden gebruikt. Het gaat hier met name<br />
om laser detectiesystemen voor de chromatografie of electroforese en op<br />
Raman spectroscopische en hoge-resolutie spectroscopie systemen voor de<br />
specifieke en gevoelige detectie van organische verbindingen.<br />
Onderwijsvorm<br />
Zelfstandig opzetten en uitvoeren van een onderzoeksproject.<br />
Literatuur<br />
Praktische handleidingen en basisliteratuur.<br />
Doelgroep<br />
3S, 3F<br />
Overige informatie<br />
Dit bachelorproject bestaat in drie varianten. De basisvariant van 12<br />
studiepunten (vakcode 435470) kan in overleg met de coordinator worden<br />
uitgebreid naar 18 studiepunten (vakcode 435119) of 24 studiepunten<br />
(vakcode 435121).<br />
Bachelorproject Synthese en structuuranalyse<br />
Vakcode X_435128 (435128)<br />
Periode Ac. Jaar (september)<br />
Credits 18.0<br />
Voertaal Nederlands<br />
Faculteit Faculteit der Exacte Wetenschappen<br />
Coördinator prof. dr. ir. R.V.A. Orru<br />
Doel vak<br />
Zelfstandig onderzoek.<br />
Inhoud vak<br />
In dit project zal op een geïntegreerde wijze binnen de sectie OAC<br />
gewerkt gaan worden. Tijdens het praktisch werk aan een<br />
meerstaps-synthese komt een aantal aspecten van organisch chemisch<br />
onderzoek aan de orde: karakteriseren van verbindingen (spectroscopie),<br />
bepalen van eigenschappen (rekenen) en mechanistisch onderzoek<br />
(kinetiek).<br />
Onderwijsvorm<br />
Zelfstandig onderzoek binnen de sectie.<br />
Toetsvorm<br />
Het project wordt afgesloten met schriftelijke en mondelinge<br />
verslaglegging (proeve van bekwaamheid).<br />
<strong>Vrije</strong> <strong>Universiteit</strong> <strong>Amsterdam</strong> - Faculteit der Exacte Wetenschappen - B <strong>Farmaceutische</strong> Wetenschappen - 2010-2011 8-6-2012 - Pagina 21 van 76
Literatuur<br />
Wordt per project aangegeven.<br />
Aanbevolen voorkennis<br />
435090: Organische chemie 1<br />
435160: Organische chemie 2<br />
435140: Anorganische chemie 1<br />
435290: Anorganische chemie 2<br />
435192: Practicum Synthese<br />
Doelgroep<br />
3S<br />
Overige informatie<br />
Dit bachelorproject bestaat in drie varianten. De basisvariant van 12<br />
studiepunten (vakcode 435550) kan in overleg met de coordinator worden<br />
uitgebreid naar 18 studiepunten (vakcode 435128) of 24 studiepunten<br />
(vakcode 435129).<br />
Bachelorproject Synthese en structuuranalyse<br />
Vakcode X_435129 (435129)<br />
Periode Ac. Jaar (september)<br />
Credits 24.0<br />
Voertaal Nederlands<br />
Faculteit Faculteit der Exacte Wetenschappen<br />
Coördinator prof. dr. ir. R.V.A. Orru<br />
Doel vak<br />
Zelfstandig onderzoek.<br />
Inhoud vak<br />
In dit project zal op een geïntegreerde wijze binnen de sectie OAC<br />
gewerkt gaan worden. Tijdens het praktisch werk aan een<br />
meerstaps-synthese komt een aantal aspecten van organisch chemisch<br />
onderzoek aan de orde: karakteriseren van verbindingen (spectroscopie),<br />
bepalen van eigenschappen (rekenen) en mechanistisch onderzoek<br />
(kinetiek).<br />
Onderwijsvorm<br />
Zelfstandig onderzoek binnen de sectie.<br />
Toetsvorm<br />
Het project wordt afgesloten met schriftelijke en mondelinge<br />
verslaglegging (proeve van bekwaamheid).<br />
Literatuur<br />
Wordt per project aangegeven.<br />
Aanbevolen voorkennis<br />
435090: Organische chemie 1<br />
435160: Organische chemie 2<br />
435140: Anorganische chemie 1<br />
435290: Anorganische chemie 2<br />
435192: Practicum Synthese<br />
<strong>Vrije</strong> <strong>Universiteit</strong> <strong>Amsterdam</strong> - Faculteit der Exacte Wetenschappen - B <strong>Farmaceutische</strong> Wetenschappen - 2010-2011 8-6-2012 - Pagina 22 van 76
Doelgroep<br />
3S<br />
Overige informatie<br />
Dit bachelorproject bestaat in drie varianten. De basisvariant van 12<br />
studiepunten (vakcode 435550) kan in overleg met de coordinator worden<br />
uitgebreid naar 18 studiepunten (vakcode 435128) of 24 studiepunten<br />
(vakcode 435129).<br />
Bachelorproject Synthese en structuuranalyse<br />
Vakcode X_435550 (435550)<br />
Periode Ac. Jaar (september)<br />
Credits 12.0<br />
Voertaal Nederlands<br />
Faculteit Faculteit der Exacte Wetenschappen<br />
Coördinator prof. dr. ir. R.V.A. Orru<br />
Doel vak<br />
Zelfstandig onderzoek.<br />
Inhoud vak<br />
In dit project zal op een geïntegreerde wijze binnen de sectie OAC<br />
gewerkt gaan worden. Tijdens het praktisch werk aan een<br />
meerstaps-synthese komt een aantal aspecten van organisch chemisch<br />
onderzoek aan de orde: karakteriseren van verbindingen (spectroscopie),<br />
bepalen van eigenschappen (rekenen) en mechanistisch onderzoek<br />
(kinetiek).<br />
Onderwijsvorm<br />
Zelfstandig onderzoek binnen de sectie.<br />
Toetsvorm<br />
Het project wordt afgesloten met schriftelijke en mondelinge<br />
verslaglegging (proeve van bekwaamheid).<br />
Literatuur<br />
Wordt per project aangegeven.<br />
Aanbevolen voorkennis<br />
435090: Organische chemie 1<br />
435160: Organische chemie 2<br />
435140: Anorganische chemie 1<br />
435290: Anorganische chemie 2<br />
435192: Practicum Synthese<br />
Doelgroep<br />
3S<br />
Overige informatie<br />
Dit bachelorproject bestaat in drie varianten. De basisvariant van 12<br />
studiepunten (vakcode 435550) kan in overleg met de coordinator worden<br />
uitgebreid naar 18 studiepunten (vakcode 435128) of 24 studiepunten<br />
(vakcode 435129).<br />
<strong>Vrije</strong> <strong>Universiteit</strong> <strong>Amsterdam</strong> - Faculteit der Exacte Wetenschappen - B <strong>Farmaceutische</strong> Wetenschappen - 2010-2011 8-6-2012 - Pagina 23 van 76
Bachelorproject Theoretical Chemistry<br />
Vakcode X_430517 (430517)<br />
Periode Ac. Jaar (september)<br />
Credits 12.0<br />
Voertaal Nederlands<br />
Faculteit Faculteit der Exacte Wetenschappen<br />
Coördinator prof. dr. L. Visscher<br />
Doel vak<br />
Het aanleren van de vaardigheden die gebruikt worden in de<br />
quantumtheoretische chemie.<br />
Inhoud vak<br />
Het doen van berekeningen om een beter inzicht te krijgen in<br />
moleculaire structuur, reactiemechanismen of spectroscopie is niet meer<br />
weg te denken uit de moderne chemie. In dit bachelorproject wordt onder<br />
gekeken naar hoe de theorie achter deze methoden tot stand komt en hoe<br />
deze theorie kan worden gebruikt in moderne quantumchemische software<br />
(ADF, DIRAC). Daarnaast krijgt de toepassing en validatie van recent<br />
ontwikkelde methoden veel aandacht. Actuele onderwerpen die aan bod<br />
kunnen komen zijn subsysteem dichtheids-functionaaltheorie, ab initio<br />
moleculaire dynamica, responstheorie, chemie en spectroscopie van<br />
f-elementen lanthanides, actinides).<br />
Onderwijsvorm<br />
De student krijgt in de eerste weken een verdieping van de stof die aan<br />
de orde is gekomen in de cursus Computational Chemistry. Hierbij zal de<br />
nadruk liggen op technieken die relevant zijn voor het gekozen<br />
onderzoeksproject. Daarna worden deze methoden toegepast in een<br />
onderzoeksproject onder dagelijkse begeleiding van een van de<br />
promovendi en/of postdocs van de sectie.<br />
Literatuur<br />
Atkins, P.W., Molecular Quantum Mechanics 3rd ed. Oxford: Oxford<br />
University Press.<br />
Selectie van recente review artikelen.<br />
Doelgroep<br />
3S, 3F<br />
Overige informatie<br />
Dit bachelorproject bestaat in drie varianten. De basisvariant van 12<br />
studiepunten (vakcode 430517) kan in overleg met de coordinator worden<br />
uitgebreid naar 18 studiepunten (vakcode 435126) of 24 studiepunten<br />
(vakcode 435127).<br />
Bachelorproject Theoretical Chemistry<br />
Vakcode X_435126 (435126)<br />
Periode Ac. Jaar (september)<br />
Credits 18.0<br />
Voertaal Nederlands<br />
<strong>Vrije</strong> <strong>Universiteit</strong> <strong>Amsterdam</strong> - Faculteit der Exacte Wetenschappen - B <strong>Farmaceutische</strong> Wetenschappen - 2010-2011 8-6-2012 - Pagina 24 van 76
Faculteit Faculteit der Exacte Wetenschappen<br />
Coördinator prof. dr. L. Visscher<br />
Doel vak<br />
Het aanleren van de vaardigheden die gebruikt worden in de<br />
quantumtheoretische chemie.<br />
Inhoud vak<br />
Het doen van berekeningen om een beter inzicht te krijgen in<br />
moleculaire structuur, reactiemechanismen of spectroscopie is niet meer<br />
weg te denken uit de moderne chemie. In dit bachelorproject wordt onder<br />
gekeken naar hoe de theorie achter deze methoden tot stand komt en hoe<br />
deze theorie kan worden gebruikt in moderne quantumchemische software<br />
(ADF, DIRAC). Daarnaast krijgt de toepassing en validatie van recent<br />
ontwikkelde methoden veel aandacht. Actuele onderwerpen die aan bod<br />
kunnen komen zijn subsysteem dichtheids-functionaaltheorie, ab initio<br />
moleculaire dynamica, responstheorie, chemie en spectroscopie van<br />
f-elementen lanthanides, actinides).<br />
Onderwijsvorm<br />
De student krijgt in de eerste weken een verdieping van de stof die aan<br />
de orde is gekomen in de cursus Computational Chemistry. Hierbij zal de<br />
nadruk liggen op technieken die relevant zijn voor het gekozen<br />
onderzoeksproject. Daarna worden deze methoden toegepast in een<br />
onderzoeksproject onder dagelijkse begeleiding van een van de<br />
promovendi en/of postdocs van de sectie.<br />
Literatuur<br />
Atkins, P.W., Molecular Quantum Mechanics 3rd ed. Oxford: Oxford<br />
University Press.<br />
Selectie van recente review artikelen.<br />
Doelgroep<br />
3S, 3F<br />
Overige informatie<br />
Dit bachelorproject bestaat in drie varianten. De basisvariant van 12<br />
studiepunten (vakcode 430517) kan in overleg met de coordinator worden<br />
uitgebreid naar 18 studiepunten (vakcode 435126) of 24 studiepunten<br />
(vakcode 435127).<br />
Bachelorproject Theoretical Chemistry<br />
Vakcode X_435127 (435127)<br />
Periode Ac. Jaar (september)<br />
Credits 24.0<br />
Voertaal Nederlands<br />
Faculteit Faculteit der Exacte Wetenschappen<br />
Coördinator prof. dr. L. Visscher<br />
Doel vak<br />
Het aanleren van de vaardigheden die gebruikt worden in de<br />
quantumtheoretische chemie.<br />
<strong>Vrije</strong> <strong>Universiteit</strong> <strong>Amsterdam</strong> - Faculteit der Exacte Wetenschappen - B <strong>Farmaceutische</strong> Wetenschappen - 2010-2011 8-6-2012 - Pagina 25 van 76
Inhoud vak<br />
Het doen van berekeningen om een beter inzicht te krijgen in<br />
moleculaire structuur, reactiemechanismen of spectroscopie is niet meer<br />
weg te denken uit de moderne chemie. In dit bachelorproject wordt onder<br />
gekeken naar hoe de theorie achter deze methoden tot stand komt en hoe<br />
deze theorie kan worden gebruikt in moderne quantumchemische software<br />
(ADF, DIRAC). Daarnaast krijgt de toepassing en validatie van recent<br />
ontwikkelde methoden veel aandacht. Actuele onderwerpen die aan bod<br />
kunnen komen zijn subsysteem dichtheids-functionaaltheorie, ab initio<br />
moleculaire dynamica, responstheorie, chemie en spectroscopie van<br />
f-elementen lanthanides, actinides).<br />
Onderwijsvorm<br />
De student krijgt in de eerste weken een verdieping van de stof die aan<br />
de orde is gekomen in de cursus Computational Chemistry. Hierbij zal de<br />
nadruk liggen op technieken die relevant zijn voor het gekozen<br />
onderzoeksproject. Daarna worden deze methoden toegepast in een<br />
onderzoeksproject onder dagelijkse begeleiding van een van de<br />
promovendi en/of postdocs van de sectie.<br />
Literatuur<br />
Atkins, P.W., Molecular Quantum Mechanics 3rd ed. Oxford: Oxford<br />
University Press.<br />
Selectie van recente review artikelen.<br />
Doelgroep<br />
3S, 3F<br />
Overige informatie<br />
Dit bachelorproject bestaat in drie varianten. De basisvariant van 12<br />
studiepunten (vakcode 430517) kan in overleg met de coordinator worden<br />
uitgebreid naar 18 studiepunten (vakcode 435126) of 24 studiepunten<br />
(vakcode 435127).<br />
Bachelorproject Toegepaste theoretische chemie<br />
Vakcode X_435131 (435131)<br />
Periode Ac. Jaar (september)<br />
Credits 18.0<br />
Voertaal Nederlands<br />
Faculteit Faculteit der Exacte Wetenschappen<br />
Coördinator prof. dr. F.M. Bickelhaupt<br />
Doel vak<br />
Het begrijpen en voorspellen van moleculaire structuren en chemische<br />
reactiviteit op het gebied van de organische, anorganische, fysische en<br />
biologische chemie.<br />
Inhoud vak<br />
De theoretische chemie is niet meer weg te denken uit de moderne<br />
scheikunde. Tal van eigenschappen kunnen met chemische nauwkeurigheid<br />
berekend worden, waardoor experimenteel moeilijk of niet te achterhalen<br />
grootheden alsnog bestudeerd of voorspeld kunnen worden. Toch is het<br />
potentieel van de theoretische chemie hiermee nog lang niet uitgeput.<br />
Om syntheses, katalysatoren of farmacologisch actieve moleculen in<br />
sterkere mate langs rationele weg (en dus in mindere mate door<br />
<strong>Vrije</strong> <strong>Universiteit</strong> <strong>Amsterdam</strong> - Faculteit der Exacte Wetenschappen - B <strong>Farmaceutische</strong> Wetenschappen - 2010-2011 8-6-2012 - Pagina 26 van 76
"uitproberen") te kunnen ontwerpen is het van cruciaal belang om<br />
nauwkeurigheid te verbinden met gefundeerd en diepgaand inzicht in de<br />
achterliggende mechanismen in de electronische structuur. Dit geldt ook<br />
als het onderzoek in de vorm van computational chemistry geschiedt.<br />
Inzicht kan hierbij verkregen worden d.m.v. nadere analyse van de<br />
berekende golffunctie en bindingsenergie. Het doel van deze basiscursus<br />
is het verwerven van de vaardigheden, die nodig zijn om de aard van een<br />
chemisch fenomeen in detail te begrijpen, waarbij het in de zogenaamde<br />
Kohn-Sham-dichtheidsfunctionaaltheorie besloten molecuul-orbitaal-(MO)<br />
model een centrale rol speelt.<br />
Onderwijsvorm<br />
De cursus bestaat uit een intensieve theoretische inleiding in de<br />
eerste week, gevolgd door een onderzoeksfase, waarbij de student<br />
deelneemt aan een onderzoeksproject binnen de afdeling.<br />
Literatuur<br />
Fragmenten uit:<br />
Albright, T.A., Burdett, J.K., and Whangbo, M.H., Orbital Interactions<br />
in Chemistry, New York: Wiley-Interscience, 1985.<br />
Bickelhaupt, F.M., and Baerends, E.J., Kohn-Sham Density Functional<br />
Theory: Predicting and Understanding Chemistry. in Rev. Computational<br />
Chemistry, Volume 15, Eds. Lipkowitz, K.B. and Boyd, D.B. New York:<br />
Wiley-VCH, Vol. 15.<br />
Cramer, C.J., Essentials of Computational Chemistry: Theories and<br />
Models, Chichester: Wiley-VCH, 2002.<br />
Doelgroep<br />
3S, 3F<br />
Overige informatie<br />
Dit bachelorproject bestaat in drie varianten. De basisvariant van 12<br />
studiepunten (vakcode 435570) kan in overleg met de coordinator worden<br />
uitgebreid naar 18 studiepunten (vakcode 435131) of 24 studiepunten<br />
(vakcode 435132).<br />
Bachelorproject Toegepaste theoretische chemie<br />
Vakcode X_435132 (435132)<br />
Periode Ac. Jaar (september)<br />
Credits 24.0<br />
Voertaal Nederlands<br />
Faculteit Faculteit der Exacte Wetenschappen<br />
Coördinator prof. dr. F.M. Bickelhaupt<br />
Doel vak<br />
Het begrijpen en voorspellen van moleculaire structuren en chemische<br />
reactiviteit op het gebied van de organische, anorganische, fysische en<br />
biologische chemie.<br />
Inhoud vak<br />
De theoretische chemie is niet meer weg te denken uit de moderne<br />
scheikunde. Tal van eigenschappen kunnen met chemische nauwkeurigheid<br />
berekend worden, waardoor experimenteel moeilijk of niet te achterhalen<br />
grootheden alsnog bestudeerd of voorspeld kunnen worden. Toch is het<br />
potentieel van de theoretische chemie hiermee nog lang niet uitgeput.<br />
<strong>Vrije</strong> <strong>Universiteit</strong> <strong>Amsterdam</strong> - Faculteit der Exacte Wetenschappen - B <strong>Farmaceutische</strong> Wetenschappen - 2010-2011 8-6-2012 - Pagina 27 van 76
Om syntheses, katalysatoren of farmacologisch actieve moleculen in<br />
sterkere mate langs rationele weg (en dus in mindere mate door<br />
"uitproberen") te kunnen ontwerpen is het van cruciaal belang om<br />
nauwkeurigheid te verbinden met gefundeerd en diepgaand inzicht in de<br />
achterliggende mechanismen in de electronische structuur. Dit geldt ook<br />
als het onderzoek in de vorm van computational chemistry geschiedt.<br />
Inzicht kan hierbij verkregen worden d.m.v. nadere analyse van de<br />
berekende golffunctie en bindingsenergie. Het doel van deze basiscursus<br />
is het verwerven van de vaardigheden, die nodig zijn om de aard van een<br />
chemisch fenomeen in detail te begrijpen, waarbij het in de zogenaamde<br />
Kohn-Sham-dichtheidsfunctionaaltheorie besloten molecuul-orbitaal-(MO)<br />
model een centrale rol speelt.<br />
Onderwijsvorm<br />
De cursus bestaat uit een intensieve theoretische inleiding in de<br />
eerste week, gevolgd door een onderzoeksfase, waarbij de student<br />
deelneemt aan een onderzoeksproject binnen de afdeling.<br />
Literatuur<br />
Fragmenten uit:<br />
Albright, T.A., Burdett, J.K., and Whangbo, M.H., Orbital Interactions<br />
in Chemistry, New York: Wiley-Interscience, 1985.<br />
Bickelhaupt, F.M., and Baerends, E.J., Kohn-Sham Density Functional<br />
Theory: Predicting and Understanding Chemistry. in Rev. Computational<br />
Chemistry, Volume 15, Eds. Lipkowitz, K.B. and Boyd, D.B. New York:<br />
Wiley-VCH, Vol. 15.<br />
Cramer, C.J., Essentials of Computational Chemistry: Theories and<br />
Models, Chichester: Wiley-VCH, 2002.<br />
Doelgroep<br />
3S, 3F<br />
Overige informatie<br />
Dit bachelorproject bestaat in drie varianten. De basisvariant van 12<br />
studiepunten (vakcode 435570) kan in overleg met de coordinator worden<br />
uitgebreid naar 18 studiepunten (vakcode 435131) of 24 studiepunten<br />
(vakcode 435132).<br />
Bachelorproject Toegepaste theoretische chemie<br />
Vakcode X_435570 (435570)<br />
Periode Ac. Jaar (september)<br />
Credits 12.0<br />
Voertaal Nederlands<br />
Faculteit Faculteit der Exacte Wetenschappen<br />
Coördinator prof. dr. F.M. Bickelhaupt<br />
Doel vak<br />
Het begrijpen en voorspellen van moleculaire structuren en chemische<br />
reactiviteit op het gebied van de organische, anorganische, fysische en<br />
biologische chemie.<br />
Inhoud vak<br />
De theoretische chemie is niet meer weg te denken uit de moderne<br />
scheikunde. Tal van eigenschappen kunnen met chemische nauwkeurigheid<br />
berekend worden, waardoor experimenteel moeilijk of niet te achterhalen<br />
<strong>Vrije</strong> <strong>Universiteit</strong> <strong>Amsterdam</strong> - Faculteit der Exacte Wetenschappen - B <strong>Farmaceutische</strong> Wetenschappen - 2010-2011 8-6-2012 - Pagina 28 van 76
grootheden alsnog bestudeerd of voorspeld kunnen worden. Toch is het<br />
potentieel van de theoretische chemie hiermee nog lang niet uitgeput.<br />
Om syntheses, katalysatoren of farmacologisch actieve moleculen in<br />
sterkere mate langs rationele weg (en dus in mindere mate door<br />
"uitproberen") te kunnen ontwerpen is het van cruciaal belang om<br />
nauwkeurigheid te verbinden met gefundeerd en diepgaand inzicht in de<br />
achterliggende mechanismen in de electronische structuur. Dit geldt ook<br />
als het onderzoek in de vorm van computational chemistry geschiedt.<br />
Inzicht kan hierbij verkregen worden d.m.v. nadere analyse van de<br />
berekende golffunctie en bindingsenergie. Het doel van deze basiscursus<br />
is het verwerven van de vaardigheden, die nodig zijn om de aard van een<br />
chemisch fenomeen in detail te begrijpen, waarbij het in de zogenaamde<br />
Kohn-Sham-dichtheidsfunctionaaltheorie besloten molecuul-orbitaal-(MO)<br />
model een centrale rol speelt.<br />
Onderwijsvorm<br />
De cursus bestaat uit een intensieve theoretische inleiding in de<br />
eerste week, gevolgd door een onderzoeksfase, waarbij de student<br />
deelneemt aan een onderzoeksproject binnen de afdeling.<br />
Literatuur<br />
Fragmenten uit:<br />
Albright, T.A., Burdett, J.K., and Whangbo, M.H., Orbital Interactions<br />
in Chemistry, New York: Wiley-Interscience, 1985.<br />
Bickelhaupt, F.M., and Baerends, E.J., Kohn-Sham Density Functional<br />
Theory: Predicting and Understanding Chemistry. in Rev. Computational<br />
Chemistry, Volume 15, Eds. Lipkowitz, K.B. and Boyd, D.B. New York:<br />
Wiley-VCH, Vol. 15.<br />
Cramer, C.J., Essentials of Computational Chemistry: Theories and<br />
Models, Chichester: Wiley-VCH, 2002.<br />
Doelgroep<br />
3S, 3F<br />
Overige informatie<br />
Dit bachelorproject bestaat in drie varianten. De basisvariant van 12<br />
studiepunten (vakcode 435570) kan in overleg met de coordinator worden<br />
uitgebreid naar 18 studiepunten (vakcode 435131) of 24 studiepunten<br />
(vakcode 435132).<br />
Basischemie<br />
Vakcode X_435077 (435077)<br />
Periode Periode 1<br />
Credits 3.0<br />
Voertaal Nederlands<br />
Faculteit Faculteit der Exacte Wetenschappen<br />
Coördinator dr. K. Retra<br />
Doel vak<br />
Het doel van de cursus is het aanleren van de basisprincipes van chemie<br />
en de farmacochemie, het gelijktrekken van het beginniveau van alle<br />
studenten.<br />
Inhoud vak<br />
<strong>Vrije</strong> <strong>Universiteit</strong> <strong>Amsterdam</strong> - Faculteit der Exacte Wetenschappen - B <strong>Farmaceutische</strong> Wetenschappen - 2010-2011 8-6-2012 - Pagina 29 van 76
In een geïntegreerd hoor-/werkcollege komen veel onderwerpen van de<br />
middelbare school weer aan orde, zoals zuur/base berekeningen,<br />
evenwichten, vormingsenergieën en elektrochemie. De nadruk ligt hierbij<br />
op berekeningen. Verder zullen nieuwe begrippen worden geïntroduceerd<br />
zoals thermodynamische begrippen en stofeigenschappen zoals pKa<br />
waarden. Tevens zal aandacht besteed worden aan de achtergrond van de<br />
basispractica.<br />
Onderwijsvorm<br />
Geïntegreerd hoor-/werkcollege.<br />
Literatuur<br />
Zumdahl, S.S., Chemical Principles 6th ed.<br />
En een studiehandleiding verstrekt door de docent.<br />
Doelgroep<br />
1F, 1S<br />
Basispracticum farmacochemie<br />
Vakcode X_430561 ()<br />
Credits 3.0<br />
Voertaal Nederlands<br />
Faculteit Faculteit der Exacte Wetenschappen<br />
Coördinator dr. J.N.M. Commandeur<br />
Doel vak<br />
Het aanleren van basisvaardigheden die nodig zijn voor het uitvoeren<br />
van experimenten alsmede een eerste kennismaking met het onderzoek dat<br />
wordt uitgevoerd bij de verschillende secties die betrokken zijn bij de<br />
opleiding <strong>Farmaceutische</strong> Wetenschappen.<br />
Inhoud vak<br />
Het aanleren van basisvaardigheden die nodig zijn voor het uitvoeren<br />
van experimenten alsmede de kennismaking met (experimentele)<br />
technieken/methoden in de verschillende farmacochemische richtingen. Op<br />
het practicum worden enkele experimenten/projecten uitgevoerd waarin<br />
een aantal basisvaardigheden wordt geoefend. Deze vaardigheden worden<br />
daarna gebruikt bij het uitvoeren van onderzoeksprojecten later in het<br />
curriculum. Die vaardigheden betreffen o.a. het bestuderen van de<br />
theorie/literatuuronderzoek, definiëren van een hypothese, opstellen<br />
van een plan van aanpak, ontwerpen van een experiment, uitvoeren van<br />
het experiment, bijhouden van een labjournaal, kritische beoordeling<br />
van de resultaten, alsmede mondelingen en schriftelijke rapportage.<br />
Onderwijsvorm<br />
Het practicum wordt wordt uitgevoerd als projectmatig onderwijs,<br />
waarbij de student aan de hand van opdrachten zelf alle noodzakelijke<br />
gegevens, de theoretische achtergrond en de voorschriften moet opzoeken<br />
en het experiment zelf vormgeven.<br />
Toetsvorm<br />
Verslagen, Meetrapporten en Labjournaal<br />
Literatuur<br />
<strong>Vrije</strong> <strong>Universiteit</strong> <strong>Amsterdam</strong> - Faculteit der Exacte Wetenschappen - B <strong>Farmaceutische</strong> Wetenschappen - 2010-2011 8-6-2012 - Pagina 30 van 76
Tijdens het practicum zal voldoende literatuur aanwezig zijn om de<br />
opdrachten te kunnen uitvoeren.<br />
Doelgroep<br />
1F<br />
Overige informatie<br />
Het met een voldoende afronden van het Basispracticum Farmacochemie is<br />
alleen dan mogelijk, indien de brandblusinstructie en de<br />
veiligheidsinstructie naar behoren zijn afgerond.<br />
Basispracticum Farmacochemie<br />
Vakcode X_435078 (435078)<br />
Periode Periode 1<br />
Credits 4.0<br />
Voertaal Nederlands<br />
Faculteit Faculteit der Exacte Wetenschappen<br />
Coördinator dr. J.N.M. Commandeur<br />
Docent(en) dr. J.N.M. Commandeur<br />
Lesmethode(n) Hoorcollege, Practicum<br />
Onderwijsvorm<br />
Het practicum wordt wordt uitgevoerd als projectmatig onderwijs,<br />
waarbij de student aan de hand van opdrachten zelf alle noodzakelijke<br />
gegevens, de theoretische achtergrond en de voorschriften moet opzoeken<br />
en het experiment zelf vormgeven.<br />
Toetsvorm<br />
Verslagen, Meetrapporten en Labjournaal<br />
Literatuur<br />
Tijdens het practicum zal voldoende literatuur aanwezig zijn om de<br />
opdrachten te kunnen uitvoeren.<br />
Doelgroep<br />
1F<br />
Basiswiskunde<br />
Vakcode X_401069 ()<br />
Credits 3.0<br />
Faculteit Faculteit der Exacte Wetenschappen<br />
Coördinator drs. J.A. Los<br />
Doel vak<br />
Het doel van deze cursus is het ophalen en bijbrengen van wiskundige<br />
basisvaardigheden die nodig zijn in vervolgcolleges zoals Calculus en<br />
Statistiek.<br />
Inhoud vak<br />
De cursus begint met een herhaling van vwo stof. Sommige onderwerpen<br />
zullen op wiskunde b niveau afgesloten worden. Ook komen een aantal<br />
<strong>Vrije</strong> <strong>Universiteit</strong> <strong>Amsterdam</strong> - Faculteit der Exacte Wetenschappen - B <strong>Farmaceutische</strong> Wetenschappen - 2010-2011 8-6-2012 - Pagina 31 van 76
nieuwe onderwerpen aan bod (deels afhankelijk van je vwo-voorkennis):<br />
integreren, goniometrie, limieten, complexe getallen en bewijzen met<br />
volledige inductie.<br />
Onderwijsvorm<br />
Gemengd hoor- en werkcollege en huiswerkopgaven.<br />
Toetsvorm<br />
Een afsluitend schriftelijk tentamen en een tussentoets.<br />
Literatuur<br />
Basisboek wiskunde (tweede editie), Jan van de Craats en Rob Bosch,<br />
Pearson, ISBN 978-90-430-1673-5. Aangevuld met een dictaat.<br />
Doelgroep<br />
1F, 1MNW, 1S, 1SBI<br />
Bioanalyse eiwitten<br />
Vakcode X_435099 (435099)<br />
Periode Periode 1<br />
Credits 3.0<br />
Voertaal Nederlands<br />
Faculteit Faculteit der Exacte Wetenschappen<br />
Coördinator dr. J. Kool<br />
Docent(en) dr. J. Kool<br />
Lesmethode(n) Werkcollege<br />
Bio-Analytical Chemistry<br />
Vakcode X_430094 (430094)<br />
Periode Periode 5<br />
Credits 3.0<br />
Voertaal Nederlands<br />
Faculteit Faculteit der Exacte Wetenschappen<br />
Coördinator prof. dr. H. Irth<br />
Docent(en) dr. H. Lingeman, prof. dr. H. Irth<br />
Lesmethode(n) Hoorcollege<br />
Toetsvorm<br />
De toetsing bestaat uit verschillende onderdelen, o.a. theoretische<br />
voorbereiding, experimentele vaardigheden, schriftelijke<br />
verslaglegging, motivatie/inzicht.<br />
Literatuur<br />
Tijdens het practicum zal voldoende literatuur aanwezig zijn om de<br />
opdrachten te kunnen uitvoeren.<br />
Biochemie<br />
Vakcode X_430562 ()<br />
<strong>Vrije</strong> <strong>Universiteit</strong> <strong>Amsterdam</strong> - Faculteit der Exacte Wetenschappen - B <strong>Farmaceutische</strong> Wetenschappen - 2010-2011 8-6-2012 - Pagina 32 van 76
Credits 3.0<br />
Voertaal Nederlands<br />
Faculteit Faculteit der Exacte Wetenschappen<br />
Coördinator J.C. Vos<br />
Doel vak<br />
Het hoorcollege dient om inzicht te geven in de basisprincipes van de<br />
bouw van levende cellen, de chemische structuur van de bestanddelen van<br />
deze cellen en de manier waarop cellen energie winnen uit de afbraak<br />
van voedingsstoffen en deze energie gebruiken voor groei en deling, als<br />
ook basisprincipes van de moleculaire biologie van de levende cel, de<br />
manier waarop genetische informatie in cellen wordt opgeslagen en de<br />
verwerking van deze informatie tot de eiwitten van de cel. Ook de<br />
belangrijkste aspecten van recombinant DNA technologie worden behandeld.<br />
Inhoud vak<br />
Aandacht voor de genetische informatiestroom DNA -> RNA -> eiwit en de<br />
manier waarop deze informatiestroom wordt gereguleerd. Tenslotte komen<br />
de belangrijkste onderdelen van de recombinant DNA technologie aan de<br />
orde (genetische modificatie, DNA volgorde analyse, PCR, etc.).<br />
Vervolgens wordt bekeken op welke manier een cel zijn energie verkrijgt<br />
uit voedsel. De afbraakroutes van de belangrijkste voedingsstoffen<br />
(koolhydraten en vetten) worden besproken, gevolgd door de structuur en<br />
functie van biologische membranen die een centrale rol spelen in de<br />
omzetting van de zo gewonnen energie in een voor de cel bruikbare vorm<br />
(ATP). Ook de fotosynthese komt aan bod.<br />
Onderwijsvorm<br />
Hoorcollege. Op de de Blackboard site behorend bij dit vak worden<br />
vragen aangeboden aan de hand waarvan de studenten zichzelf kunnen<br />
toetsen.<br />
Toetsvorm<br />
Biochemie zal worden getoetst aan de hand van twee deeltentamens, Het<br />
eerste deel zal gaan over de hoofdstukken waarin cellen, celbouw,<br />
bouwstenen van biochemisch belangrijke macromoleculen, DNA, eiwit<br />
alsmede enzymfunctie wordt behandeld. Het tweede deeltentamen zal de<br />
hoofdstukken toetsen waarin DNA repair, transcriptie en translatie,<br />
genomes, moleculair biologische technieken en cellulair metabolisme en<br />
energiehuishouding aan de orde komen.<br />
Literatuur<br />
Alberts, B. e.a., Essential Cell Biology 3rd ed, 2009. Voornamelijk de<br />
hoofdstukken 7-9, 10-14, zoals aangegeven in de studiehandleiding bij<br />
<strong>Vrije</strong> <strong>Universiteit</strong> <strong>Amsterdam</strong> - Faculteit der Exacte Wetenschappen - B <strong>Farmaceutische</strong> Wetenschappen - 2010-2011 8-6-2012 - Pagina 33 van 76
dit college.<br />
Aanbevolen voorkennis<br />
Levende Chemie<br />
Doelgroep<br />
1F, 1MNW, mBio<br />
Biochemie<br />
Vakcode X_435051 (435051)<br />
Periode Periode 2<br />
Credits 6.0<br />
Voertaal Nederlands<br />
Faculteit Faculteit der Exacte Wetenschappen<br />
Coördinator dr. M.H. Siderius<br />
Doel vak<br />
Het hoorcollege dient om inzicht te geven in de basisprincipes van de<br />
bouw van levende cellen, de chemische structuur van de bestanddelen van<br />
deze cellen en de manier waarop cellen energie winnen uit de afbraak<br />
van voedingsstoffen en deze energie gebruiken voor groei en deling, als<br />
ook basisprincipes van de moleculaire biologie van de levende cel, de<br />
manier waarop genetische informatie in cellen wordt opgeslagen en de<br />
verwerking van deze informatie tot de eiwitten van de cel. Ook de<br />
belangrijkste aspecten van recombinant DNA technologie worden behandeld.<br />
Inhoud vak<br />
Er wordt begonnen met het bespreken van de structurele en functionele<br />
opbouw van de levende cel, waarna de verschillende soorten<br />
(macro)moleculen die in de cel aanwezig zijn worden behandeld.<br />
Vervolgens wordt bekeken op welke manier een cel zijn energie verkrijgt<br />
uit voedsel. De afbraakroutes van de belangrijkste voedingsstoffen<br />
(koolhydraten en vetten) worden besproken, gevolgd door de structuur en<br />
functie van biologische membranen die een centrale rol spelen in de<br />
omzetting van de zo gewonnen energie in een voor de cel bruikbare vorm<br />
(ATP). Ook de fotosynthese komt aan bod. Tevens de behandeling van de<br />
structuur en functie van DNA en de manier waarop DNA in de celkern is<br />
opgevouwen tot chromosomen. Vervolgens de genetische informatiestroom<br />
DNA -> RNA -> eiwit en de manier waarop deze informatiestroom wordt<br />
gereguleerd. Tenslotte komen de belangrijkste onderdelen van de<br />
recombinant DNA technologie aan de orde (genetische modificatie, DNA<br />
volgorde analyse, PCR, etc.).<br />
Onderwijsvorm<br />
Hoorcollege. Op de de Blackboard site behorend bij dit vak worden<br />
vragen aangeboden aan de hand waarvan de studenten zichzelf kunnen<br />
toetsen.<br />
Toetsvorm<br />
Biochemie zal worden getoetst aan de hand van twee deeltentamens, Het<br />
eerste deel zal gaan over de hoofdstukken waarin cellen, celbouw,<br />
bouwstenen van biochemisch belangrijke macromoleculen, DNA, eiwit<br />
alsmede enzymfunctie wordt behandeld. Het tweede deeltentamen zal de<br />
hoofdstukken toetsen waarin DNA repair, transcriptie en translatie,<br />
genomes, moleculair biologische technieken en cellulair metabolisme en<br />
<strong>Vrije</strong> <strong>Universiteit</strong> <strong>Amsterdam</strong> - Faculteit der Exacte Wetenschappen - B <strong>Farmaceutische</strong> Wetenschappen - 2010-2011 8-6-2012 - Pagina 34 van 76
energiehuishouding aan de orde komen.<br />
Literatuur<br />
Alberts, B. e.a., Essential Cell Biology 3rd ed, 2009. delen hieruit<br />
zoals aangegeven in de studiehandleiding bij dit college.<br />
Doelgroep<br />
1F, 1MNW, 1S, 1SBI, 1W-B<br />
Blusinstructie: Praktijk S&F/N&S/SBI incl MNW.<br />
Vakcode X_000002 ()<br />
Periode Periode 1<br />
Credits 0.0<br />
Voertaal Nederlands<br />
Faculteit Faculteit der Exacte Wetenschappen<br />
Lesmethode(n) Practicum<br />
Blusinstructie: Theorie: S&F/N&S/W/I/SBI gelijktijdig in Q1<br />
Vakcode X_000003 ()<br />
Periode Periode 1<br />
Credits 0.0<br />
Voertaal Nederlands<br />
Faculteit Faculteit der Exacte Wetenschappen<br />
Lesmethode(n) Hoorcollege<br />
BP Farmacochemie MC, DD&S<br />
Vakcode X_430527 (430527)<br />
Periode Ac. Jaar (september)<br />
Credits 18.0<br />
Voertaal Nederlands<br />
Faculteit Faculteit der Exacte Wetenschappen<br />
Coördinator dr. J.N.M. Commandeur<br />
BP Farmacochemie MC, DD&S<br />
Vakcode X_430528 (430528)<br />
Periode Ac. Jaar (september)<br />
Credits 24.0<br />
Voertaal Nederlands<br />
Faculteit Faculteit der Exacte Wetenschappen<br />
Coördinator dr. J.N.M. Commandeur<br />
Calculus 1<br />
<strong>Vrije</strong> <strong>Universiteit</strong> <strong>Amsterdam</strong> - Faculteit der Exacte Wetenschappen - B <strong>Farmaceutische</strong> Wetenschappen - 2010-2011 8-6-2012 - Pagina 35 van 76
Vakcode X_400300 ()<br />
Periode Periode 2<br />
Credits 3.0<br />
Voertaal Nederlands<br />
Faculteit Faculteit der Exacte Wetenschappen<br />
Coördinator drs. J.A. Los<br />
Docent(en) dr. C.M. Quant, drs. J.A. Los<br />
Lesmethode(n) Hoorcollege, Werkcollege<br />
Chemie / farmacochemie en samenleving<br />
Vakcode X_435080 (435080)<br />
Periode Periode 4<br />
Credits 3.0<br />
Voertaal Nederlands<br />
Faculteit Faculteit der Exacte Wetenschappen<br />
Coördinator dr. J.E. van Muijlwijk-Koezen<br />
Doel vak<br />
1. De studenten krijgen inzicht in de wereld van de chemie. Ze leren<br />
mensen en organisaties uit de chemie kennen en bouwen een netwerk op.<br />
2. De studenten ontdekken hoe de samenleving eruit ziet, wat de<br />
samenleving weet van chemie en hoe de samenleving denkt over chemie.<br />
3. De studenten ontwikkelen (verder) een aantal academische<br />
vaardigheden zoals projectmatig werken, presenteren, rapporteren,<br />
doelgericht interviewen, bewust zijn van eigen competenties en<br />
motivatie voor het opleidingsgebied, feedback geven en kritisch<br />
beoordelen.<br />
4. De drie bovenstaande doelen hebben tot resultaat dat de studenten<br />
een houding ontwikkelen om een goed ambassadeur voor hun vak te zijn.<br />
Inhoud vak<br />
Tijdens de cursus wordt in projectvorm gewerkt. De wereld van de chemie<br />
wordt ingeleid met drie gastcolleges gegeven door drie chemici werkend<br />
voor organisaties die een belangrijke rol spelen in die wereld. Ook<br />
moeten de studenten drie chemici van buiten de VU interviewen uit het<br />
onderzoek, de industrie en het onderwijs.<br />
De studenten verkennen de samenleving door het uitvoeren van een<br />
onderzoek naar het imago van de chemie in de samenleving. Dit onderzoek<br />
wordt uitgevoerd in groepen. De studenten rapporteren mondeling en<br />
schriftelijk over dit onderzoek, waarbij verschillende vaardigheden aan<br />
bod komen.<br />
De cursus wordt feestelijk afgesloten met een borrel, waar de studenten<br />
zullen strijden om de eer van de beste elevator pitch over chemie, een<br />
van de individuele opdrachten.<br />
Onderwijsvorm<br />
Hoor- en werkcolleges, groepsopdrachten en individuele opdrachten<br />
Toetsvorm<br />
Beoordeling vindt plaats aan de hand van:<br />
- Het functioneren in het groepswerk.<br />
- De resultaten van de groepsopdrachten.<br />
<strong>Vrije</strong> <strong>Universiteit</strong> <strong>Amsterdam</strong> - Faculteit der Exacte Wetenschappen - B <strong>Farmaceutische</strong> Wetenschappen - 2010-2011 8-6-2012 - Pagina 36 van 76
- De resultaten van de individuele opdrachten.<br />
Doelgroep<br />
1S, 1F<br />
Chemische binding<br />
Vakcode X_435079 (435079)<br />
Periode Periode 2<br />
Credits 3.0<br />
Voertaal Nederlands<br />
Faculteit Faculteit der Exacte Wetenschappen<br />
Coördinator prof. dr. C. Gooijer<br />
Doel vak<br />
Doel van het college is de introductie van quantummechanische concepten<br />
voor het beschrijven van atomen en moleculen om zicht te krijgen op hun<br />
chemische eigenschappen.<br />
Inhoud vak<br />
Na een introductie in de quantumwereld wordt het waterstofatoom<br />
behandeld en vervolgens de opbouw van het periodiek systeem besproken.<br />
Vervolgens komt het concept van chemische binding aan de orde eerst op<br />
basis van Lewis-structuren en daarna op basis van elektronen orbitals.<br />
Tenslotte zullen de elektronenspectroscopie en de vibratiespectroscopie<br />
worden geintroduceerd.<br />
Onderwijsvorm<br />
Gecombineerd hoorcollege en werkcollege<br />
Literatuur<br />
Zumdahl, S.S., Chemical Principles 6th ed, Houghton Mifflin Comp, 2009<br />
(ISBN 0-618-94690-X). chapters 12, 13 and 14.<br />
Doelgroep<br />
1F, 1S<br />
Computational (Pharmaco)Chemistry<br />
Vakcode X_435350 (435350)<br />
Periode Periode 2<br />
Credits 6.0<br />
Voertaal Nederlands<br />
Faculteit Faculteit der Exacte Wetenschappen<br />
Coördinator prof. dr. F.M. Bickelhaupt<br />
Docent(en) prof. dr. F.M. Bickelhaupt<br />
Lesmethode(n) Hoorcollege, Practicum<br />
Doel vak<br />
Het leren van moderne quantumchemische methoden en met name het<br />
toepassen daarvan bij het computerondersteund oplossen van chemische<br />
problemen.<br />
<strong>Vrije</strong> <strong>Universiteit</strong> <strong>Amsterdam</strong> - Faculteit der Exacte Wetenschappen - B <strong>Farmaceutische</strong> Wetenschappen - 2010-2011 8-6-2012 - Pagina 37 van 76
Onderwijsvorm<br />
De cursus bestaat uit een hoorcollege en een practicum, waarin een kort<br />
researchproject is opgenomen.<br />
Literatuur<br />
Cramer, C.J. Essentials of Computational Chemistry: Theories and<br />
Models. Chichester: Wiley-VCH, 2002.<br />
Doelgroep<br />
3F, 3S<br />
Overige informatie<br />
In verband met het verschil in voorkennis van de studenten S en F is er<br />
voor een aantal colleges onderscheid gemaakt in verplichte en<br />
vrijwillige college-uren.<br />
De twee college-uren "Symmetrie en Hückel-theorie" zijn verplicht voor<br />
3F studenten en vrijwillig voor 3S studenten.<br />
De twee college-uren "Modeling" zijn verplicht voor 3S studenten en<br />
vrijwillig voor 3F studenten.<br />
Computationele organische chemie Computational Organic Chemistry<br />
Vakcode X_435017 (435017)<br />
Periode Ac. Jaar (september)<br />
Credits 9.0<br />
Voertaal Nederlands<br />
Faculteit Faculteit der Exacte Wetenschappen<br />
Coördinator dr. A.W. Ehlers<br />
Doel vak<br />
Kennismaken met moderne "computational chemistry" methoden om de<br />
structuur, eigenschappen en de reactiviteit van organische moleculen te<br />
onderzoeken.<br />
Onderwijsvorm<br />
Practicumproject.<br />
Literatuur<br />
Foresman, J.B., and Frisch, A., Exploring Chemistry with Electronic<br />
Structure Methods 2nd ed. Gaussian Inc. of in overleg met de docent.<br />
Doelgroep<br />
3S, 3F<br />
<strong>Farmaceutische</strong> toxicologie<br />
Vakcode X_430103 (430103)<br />
Periode Periode 1<br />
Credits 3.0<br />
Voertaal Nederlands<br />
Faculteit Faculteit der Exacte Wetenschappen<br />
Coördinator dr. J.N.M. Commandeur<br />
Docent(en) dr. J.N.M. Commandeur<br />
<strong>Vrije</strong> <strong>Universiteit</strong> <strong>Amsterdam</strong> - Faculteit der Exacte Wetenschappen - B <strong>Farmaceutische</strong> Wetenschappen - 2010-2011 8-6-2012 - Pagina 38 van 76
Lesmethode(n) Werkcollege<br />
Doel vak<br />
Het verkrijgen van inzicht in de wijze waarop de risicoschatting van<br />
nieuwe (kandidaat)geneesmiddelen plaatsvindt op basis van pre-klinische<br />
en klinische studies.<br />
Onderwijsvorm<br />
Hoorcolleges.<br />
Literatuur<br />
Mulder, G.J., and Dencker, L., Pharmaceutical Toxicology: Safety<br />
Sciences of Drugs, Pharmaceutical Press, 2007 (ISBN: 10-0-85369 593 8).<br />
Farmacochemie in context<br />
Vakcode X_430566 ()<br />
Credits 3.0<br />
Voertaal Nederlands<br />
Faculteit Faculteit der Exacte Wetenschappen<br />
Coördinator dr. E. Ruijter<br />
Farmacokinetiek en ADME processen<br />
Vakcode X_435084 (435084)<br />
Periode Periode 6<br />
Credits 3.0<br />
Voertaal Nederlands<br />
Faculteit Faculteit der Exacte Wetenschappen<br />
Coördinator dr. J.N.M. Commandeur<br />
Docent(en) dr. J.N.M. Commandeur<br />
Lesmethode(n) Hoorcollege<br />
Doel vak<br />
Het verkrijgen van kennis en inzicht in de onderliggende processen die<br />
de lotgevallen van een geneesmiddel in het lichaam bepalen en de<br />
mathematische beschrijving hiervan met behulp van compartimentmodellen.<br />
Onderwijsvorm<br />
Hoorcolleges, werkcolleges.<br />
Literatuur<br />
Shargel, L. e.a., Applied Biopharmaceutics and Pharmacokinetics 5th ed,<br />
McGraw-Hill, 2005 (ISBN: 0-07-137550-3).<br />
Doelgroep<br />
1F<br />
FEW individueel vak intern<br />
Vakcode X_INDVAKI_09 ()<br />
<strong>Vrije</strong> <strong>Universiteit</strong> <strong>Amsterdam</strong> - Faculteit der Exacte Wetenschappen - B <strong>Farmaceutische</strong> Wetenschappen - 2010-2011 8-6-2012 - Pagina 39 van 76
Credits 6.0<br />
Faculteit Faculteit der Exacte Wetenschappen<br />
Fysica en medische fysica 1<br />
Vakcode X_430060 (430060)<br />
Periode Periode 4<br />
Credits 3.0<br />
Voertaal Nederlands<br />
Faculteit Faculteit der Exacte Wetenschappen<br />
Coördinator prof. dr. K.S.E. Eikema<br />
Docent(en) prof. dr. K.S.E. Eikema, dr. R.N. Frese<br />
Lesmethode(n) Hoorcollege, Werkcollege<br />
Doel vak<br />
Doelstelling van het college Fysica en medische fysica I is de<br />
basisbegrippen van de natuurkunde te introduceren die ten grondslag<br />
liggen aan de mechanische verschijnselen in de levende natuur.<br />
Inhoud vak<br />
Fysica is de wetenschap die de eigenschappen van de materie beschrijft<br />
in termen van natuurwetten. De fysica speelt bij het begrijpen van de<br />
eigenschappen van de levende materie en het menselijk lichaam een<br />
essentiële rol. In dit college zullen eerst de wetten van Newton<br />
behandeld worden waarmee de bewegingen van voorwerpen onder invloed van<br />
krachten beschreven kunnen worden. Het gedrag van vloeistoffen en de<br />
stabiliteit van vaste structuren en mechanische trillingen komen<br />
vervolgens aan de orde. In een aantal voorbeelden worden diverse<br />
toepassingen besproken.<br />
Onderwijsvorm<br />
Voorstudie, hoorcollege met demonstraties en discussie, werkcollege en<br />
zelfstudie.<br />
Literatuur<br />
Giancoli, D.C., Physics for Scientists and Engineers with Modern<br />
Physics 4th ed. New Jersey: Prentice Hall.<br />
Aanbevolen voorkennis<br />
Het college sluit aan op Practicum Natuurkunde. Het college bereidt<br />
voor op:<br />
- Fysica en medische fysica II<br />
- Natuurkunde en gezondheid, Structuur van de materie (MNW)<br />
- Thermodynamica, Kernenergie en Duurzame energie (SBI)<br />
Doelgroep<br />
1MNW, 1SBI, 2F<br />
Geschiedenis van de natuur<strong>wetenschappen</strong><br />
Vakcode X_420148 (420148)<br />
Periode Periode 4<br />
Credits 3.0<br />
<strong>Vrije</strong> <strong>Universiteit</strong> <strong>Amsterdam</strong> - Faculteit der Exacte Wetenschappen - B <strong>Farmaceutische</strong> Wetenschappen - 2010-2011 8-6-2012 - Pagina 40 van 76
Voertaal Nederlands<br />
Faculteit Faculteit der Exacte Wetenschappen<br />
Coördinator prof. dr. F.H. van Lunteren<br />
Docent(en) prof. dr. F.H. van Lunteren<br />
Lesmethode(n) Hoorcollege<br />
Doelgroep<br />
2F, 2MNW, 2N, 2S<br />
Heterologe expressie van biotransformatie enzymen<br />
Vakcode X_430549 (430549)<br />
Periode Ac. Jaar (september)<br />
Credits 6.0<br />
Voertaal Nederlands<br />
Faculteit Faculteit der Exacte Wetenschappen<br />
Coördinator dr. J.N.M. Commandeur<br />
Doel vak<br />
Dit vak heeft tot doel de student zich te laten verdiepen in de<br />
strategieën en experimentele benaderingen die worden gebruikt om<br />
specifieke biotransformatie-enzymen (zoals P450s, glutathione<br />
transferases, etc.) tot expressie te brengen in cellulaire organismen.<br />
Inhoud vak<br />
Biotransformatie, ook wel metabolisme genoemd, speelt een zeer<br />
belangrijke rol in de verwerking van geneesmiddelen door het lichaam.<br />
Aan de ene kant is biotransformatie vaak bepalend voor de<br />
halfwaardetijd waarmee een geneesmiddel wordt geëlimineerd vanuit het<br />
plasma. Aan de andere kant kunnen bij metabolisme reactieve<br />
metabolieten ontstaan die met cellulair materiaal reageren, zoals<br />
eiwitten, DNA of membranen. Het menselijke genoom codeert voor enkele<br />
honderden enzymen die in meer of mindere mate bij het metabolisme van<br />
geneesmiddelen betrokken kunnen zijn. Om de rol van de enzymen beter<br />
te kunnen bestuderen, zijn voor de belangrijkste<br />
biotransformatie-enzymen expressiesystemen ontwikkeld in verschillende<br />
organismes, zoals Escherichia coli, gist, insectcellen, Salmonella<br />
typhimurium, zoogdiercellen, etc. De keuze van het organisme hangt af<br />
van het doel wat wordt beoogd, bijv. grote schaal expressie (mg-gram)<br />
voor biocatalyse of kristallisatie, lage schaal expressie voor in vitro<br />
(geno)toxiciteit experimenten.<br />
Onderwijsvorm<br />
Aan de hand van een lijst van opdrachten zal een literatuurstudie<br />
worden uitgevoerd naar eigenschappen, expressie en mutagenese van een<br />
specifiek biotransformatie-enzym. Op verschillende momenten zal de<br />
voortgang worden besproken met de docenten.<br />
Toetsvorm<br />
Van de literatuurstudie wordt een rapport gemaakt, dat in een<br />
nabespreking mondeling dient te worden toegelicht.<br />
Aanbevolen voorkennis<br />
<strong>Vrije</strong> <strong>Universiteit</strong> <strong>Amsterdam</strong> - Faculteit der Exacte Wetenschappen - B <strong>Farmaceutische</strong> Wetenschappen - 2010-2011 8-6-2012 - Pagina 41 van 76
Dit vak borduurt voort op theorie die is behandeld in de cursus<br />
Biochemie (1e jaar) en de expressie-experimenten die zijn uitgevoerd in<br />
het Geintegreerde practicum (2e jaar). Ter ondersteuning van de<br />
literatuurstudie wordt aanbevolen het volgende boek aan te schaffen of<br />
te lenen: Primrose and Twyman, Principles of Gene Manipulation and<br />
Genomics 8th ed. Dit boek wordt later ook gebruikt voor het vak<br />
'Chemistry of life' in de master Drug Discovery and Safety.<br />
Doelgroep<br />
3F, 3S<br />
Identificatietechnieken<br />
Vakcode X_435081 (435081)<br />
Periode Periode 5<br />
Credits 6.0<br />
Voertaal Nederlands<br />
Faculteit Faculteit der Exacte Wetenschappen<br />
Coördinator dr. F. Ariese<br />
Docent(en) dr. F.J.J. de Kanter, dr. H. Lingeman, dr. F. Ariese<br />
Lesmethode(n) Hoorcollege, Practicum<br />
Doel vak<br />
Het doel van deze cursus is om inzicht en praktische vaardigheden te<br />
verwerven op het gebied van moleculaire spectroscopische technieken en<br />
hun toepassingen voor de identificatie van verbindingen.<br />
Inhoud vak<br />
Achtergronden van de verschillende spectroscopische technieken worden<br />
behandeld, waarbij steeds verbanden worden gelegd met de structuur van<br />
moleculen. De volgende technieken zullen aan bod komen: UV-Vis<br />
absorptiespectroscopie, vibratiespectroscopie (infrarood en Raman),<br />
fluorescentiespectroscopie, kernspin resonantie (NMR) en<br />
massaspectrometrie. (Bio)analytische toepassingen van deze technieken<br />
zullen aan bod komen. Spectroscopische berekeningen en interpretatie<br />
van spectra zullen worden geoefend.<br />
Onderwijsvorm<br />
Hoorcollege, werkcollege en practicum.<br />
Literatuur<br />
Harris, D.C., Quantitative Chemical Analysis.<br />
Collegedictaat.<br />
Doelgroep<br />
1F<br />
Inleiding computergebruik<br />
Vakcode X_000004 ()<br />
Credits 0.0<br />
Voertaal Nederlands<br />
Faculteit Faculteit der Exacte Wetenschappen<br />
<strong>Vrije</strong> <strong>Universiteit</strong> <strong>Amsterdam</strong> - Faculteit der Exacte Wetenschappen - B <strong>Farmaceutische</strong> Wetenschappen - 2010-2011 8-6-2012 - Pagina 42 van 76
Innovatieproject geneesmiddelen<br />
Vakcode X_435095 (435095)<br />
Periode Periode 3<br />
Credits 6.0<br />
Voertaal Nederlands<br />
Faculteit Faculteit der Exacte Wetenschappen<br />
Coördinator dr. C. de Graaf<br />
Docent(en) dr. C. de Graaf<br />
Lesmethode(n) Hoorcollege<br />
Doel vak<br />
Het verwerven van kennis en inzicht in het ontwikkelingstraject van<br />
nieuwe geneesmiddelen, als voorbeeld van een innovatieproces.<br />
Onderwijsvorm<br />
Na een introductie wordt in gemengde groepjes (studenten <strong>Farmaceutische</strong><br />
Wetenschappen, Science, Business & Innovation, en Medische<br />
Natuur<strong>wetenschappen</strong>) gewerkt aan een uitgebreide case waarin de<br />
ontwikkeling van een geneesmiddel voor een bepaalde ziekte aan bod<br />
komt. De nadruk ligt aan de bèta-kant op de moleculaire processen die<br />
aan de ziekte ten grondslag liggen en het zelfstandig doornemen van de<br />
verschillende randvoorwaarden waaraan dit type geneesmiddel moet<br />
voldoen. Aan de gamma-kant ligt het zwaartepunt op het toepassen van<br />
het bedrijfskundige concepten.<br />
Aan de case wordt gedurende de hele periode gewerkt. Daarnaast vinden<br />
(gast)colleges plaats waarin de verschillende stappen in het<br />
geneesmiddelontwikkelings- en vermarketingstraject worden besproken.<br />
Enkele stappen worden nader bestudeerd door het maken van een korte<br />
opdracht.<br />
Het volgen van een aantal (gast)colleges is verplicht; tijdens de<br />
eerste bijeenkomst zal worden aangegeven om welke colleges het gaat.<br />
Literatuur<br />
De te bestuderen stof en achtergrond informatie worden tijdens de<br />
cursus via Blackboard ter beschikking gesteld.<br />
Doelgroep<br />
1F, 1SBI<br />
Integrated Practical Course<br />
Vakcode X_430516 (430516)<br />
Periode Periode 5<br />
Credits 12.0<br />
Voertaal Nederlands<br />
Faculteit Faculteit der Exacte Wetenschappen<br />
Coördinator dr. J.N.M. Commandeur<br />
Docent(en) dr. J.N.M. Commandeur, dr. J. Kool<br />
<strong>Vrije</strong> <strong>Universiteit</strong> <strong>Amsterdam</strong> - Faculteit der Exacte Wetenschappen - B <strong>Farmaceutische</strong> Wetenschappen - 2010-2011 8-6-2012 - Pagina 43 van 76
Lesmethode(n) Hoorcollege, Werkcollege, Practicum<br />
Doel vak<br />
Het verkrijgen van inzicht in de toepassing van biochemische,<br />
moleculair biologische, farmacologische/toxicologische en<br />
(bio)analytische technieken in (farmaco)chemisch onderzoek.<br />
Het ontwikkelen van praktische vaardigheden om deze technieken toe te<br />
passen in een geïntegreerd onderzoeksproject.<br />
Het leren mondeling en schriftelijk presenteren van verkregen<br />
onderzoeksresultaten.<br />
Onderwijsvorm<br />
Dit practicum heeft de opzet van een geïntegreerd onderzoeksproject en<br />
wordt afgesloten met een plenaire posterpresentatie.<br />
Literatuur<br />
Practicumhandleiding en aangeleverde literatuur.<br />
Doelgroep<br />
2F, 2S<br />
Keuzevak BioAnalytische massaspectrometrie<br />
Vakcode X_435026 (435026)<br />
Periode Ac. Jaar (september)<br />
Credits 3.0<br />
Voertaal Nederlands<br />
Faculteit Faculteit der Exacte Wetenschappen<br />
Coördinator dr. H. Lingeman<br />
Doel vak<br />
Het introduceren van massaspectrometrische technieken die gebruikt<br />
kunnen worden voor de analyse van biologisch actieve verbindingen.<br />
Inhoud vak<br />
Massaspectrometrie is tegenwoordig de meest gebruikte methode om<br />
chemische verbindingen te karakteriseren, te identificeren en<br />
kwantitatief te bepalen. Allereerst zullen alle onderdelen van de<br />
verschillende typen massaspectrometers worden besproken, van<br />
massaspectometrie met de verschillende scheidingsmethoden. Tot slot<br />
zullen toepassingen aan de orde komen op het gebied van de bio-analyse,<br />
metabolieten onderzoek, schreeningsmonitoringsprogramma's en<br />
karakteriseren en identificatie van complexe macro-moleculaire (bijv.<br />
eiwitten) systemen.<br />
Onderwijsvorm<br />
Het studieonderdeel bestaat uit twee onderdelen waarvan het theoretisch<br />
deel (hoorcollege, werkcollege) voorafgaande aan het praktisch deel<br />
gevolgd moet worden. Het theoretisch deel (3 studiepunten) kan ook<br />
afzonderlijk worden gevolgd.<br />
Literatuur<br />
<strong>Vrije</strong> <strong>Universiteit</strong> <strong>Amsterdam</strong> - Faculteit der Exacte Wetenschappen - B <strong>Farmaceutische</strong> Wetenschappen - 2010-2011 8-6-2012 - Pagina 44 van 76
Basisliteratuur en informatie van het internet.<br />
Aanbevolen voorkennis<br />
Basiskennis analytische chemie.<br />
Doelgroep<br />
3F, 3S, 3MNW<br />
Keuzevak BioAnalytische screeningstechnieken<br />
Vakcode X_435028 (435028)<br />
Periode Ac. Jaar (september)<br />
Credits 3.0<br />
Voertaal Nederlands<br />
Faculteit Faculteit der Exacte Wetenschappen<br />
Coördinator dr. H. Lingeman<br />
Doel vak<br />
Het doel is het verwerven van van theoretisch en/of praktisch inzicht<br />
aan de hand van een goed gedefinieerd bio-analytisch probleem.<br />
Inhoud vak<br />
De verschillende vormen van vloeistofchromatografie zijn tegenwooordig<br />
de meest gebruikte methoden om chemische verbindingen kwalitatief en/of<br />
kwantitatief te bepalen. Allereerst zullen de verschillende vormen van<br />
vloeistofchromatografie en de hierbij horende detectietechnieken worden<br />
besproken. Vervolgens zal uitgebreid worden inggegaan op de<br />
monstervoorbewerkingstechnieken die gebruikt kunnen worden. Tot slot<br />
zullen toepassingen aan de orde komen op het gebied van de bio-analyse,<br />
metabolieten onderzoek, screeningsmonitoringsprogramma's en<br />
karakteriseren en identificatie van complexe macro-moleculaire (bijv.<br />
eiwitten) systemen.<br />
Onderwijsvorm<br />
Het studieonderdeel bestaat uit twee onderdelen waarvan het theoretisch<br />
deel (hoorcollege, werkcollege) voorafgaande aan het praktisch deel<br />
gevolgd moet worden. Het theoretisch deel (3 studiepunten) kan ook<br />
afzonderlijk worden gevolgd.<br />
Literatuur<br />
Basisliteratuur en informatie van het internet.<br />
Aanbevolen voorkennis<br />
Basiskennis analytische chemie.<br />
Keuzevak Fysische Chemie<br />
Vakcode X_430540 (430540)<br />
Periode Ac. Jaar (september)<br />
Credits 3.0<br />
Voertaal Nederlands<br />
Faculteit Faculteit der Exacte Wetenschappen<br />
Coördinator prof. dr. M.H.M. Janssen<br />
<strong>Vrije</strong> <strong>Universiteit</strong> <strong>Amsterdam</strong> - Faculteit der Exacte Wetenschappen - B <strong>Farmaceutische</strong> Wetenschappen - 2010-2011 8-6-2012 - Pagina 45 van 76
Inhoud vak<br />
De inhoud van het keuzevak wordt in overleg met de docent bepaald. Dit<br />
geldt ook voor het aantal contacturen en te gebruiken studiemateriaal.<br />
Neem tijdig contact op met de docent.<br />
Keuzevak Fysische Chemie<br />
Vakcode X_430541 (430541)<br />
Periode Ac. Jaar (september)<br />
Credits 6.0<br />
Voertaal Nederlands<br />
Faculteit Faculteit der Exacte Wetenschappen<br />
Coördinator prof. dr. M.H.M. Janssen<br />
Inhoud vak<br />
De inhoud van het keuzevak wordt in overleg met de docent bepaald. Dit<br />
geldt ook voor het aantal contacturen en te gebruiken studiemateriaal.<br />
Neem tijdig contact op met de docent.<br />
Keuzevak Luminescence Spectr. and Mol-Mol interaction<br />
Vakcode X_435032 (435032)<br />
Periode Ac. Jaar (september)<br />
Credits 3.0<br />
Voertaal Nederlands<br />
Faculteit Faculteit der Exacte Wetenschappen<br />
Coördinator dr. F. Ariese<br />
Doel vak<br />
Het introduceren van luminescentietechnieken die gebruikt kunnen worden<br />
voor de analyse van biologisch actieve verbindingen.<br />
Inhoud vak<br />
De onderwerpen die aan de orde komen omvatten de principes van<br />
fluorescentie, fosforescentie, lang-levende luminescentie,<br />
chemiluminescentie en bioluminescentie. Verder zal er aandacht worden<br />
besteed aan 'energy-transfer' mechanismen en andere processen die de<br />
luminescentie van organische processen beinvloeden. De mogelijkheden<br />
van het invoeren van luminescentie 'probes' en hoge resolutietechnieken<br />
zullen eveneens aan de orde komen. Tot slot zullen een aantal<br />
bio-analytische toepassingen worden besproken waarbij technieken als<br />
laser fluorescentie en tijd-opgelost meten niet vergeten zullen worden.<br />
Onderwijsvorm<br />
Het studieonderdeel bestaat uit een theoretisch en een praktisch<br />
gedeelte. Het theoretisch deel kan afzonderlijk gevolgd worden (zie de<br />
opmerking bij deze vakomschrijving).<br />
Aanbevolen voorkennis<br />
Basiskennis analytische en fysische chemie.<br />
<strong>Vrije</strong> <strong>Universiteit</strong> <strong>Amsterdam</strong> - Faculteit der Exacte Wetenschappen - B <strong>Farmaceutische</strong> Wetenschappen - 2010-2011 8-6-2012 - Pagina 46 van 76
Doelgroep<br />
3F, 3S<br />
Keuzevak Luminescence Spectr. and Mol-Mol interaction<br />
Vakcode X_435033 (435033)<br />
Periode Ac. Jaar (september)<br />
Credits 6.0<br />
Voertaal Nederlands<br />
Faculteit Faculteit der Exacte Wetenschappen<br />
Coördinator dr. F. Ariese<br />
Doel vak<br />
Het introduceren van luminescentietechnieken die gebruikt kunnen worden<br />
voor de analyse van biologisch actieve verbindingen.<br />
Inhoud vak<br />
De onderwerpen die aan de orde komen omvatten de principes van<br />
fluorescentie, fosforescentie, lang-levende luminescentie,<br />
chemiluminescentie en bioluminescentie. Verder zal er aandacht worden<br />
besteed aan 'energy-transfer' mechanismen en andere processen die de<br />
luminescentie van organische processen beinvloeden. De mogelijkheden<br />
van het invoeren van luminescentie 'probes' en hoge resolutietechnieken<br />
zullen eveneens aan de orde komen. Tot slot zullen een aantal<br />
bio-analytische toepassingen worden besproken waarbij technieken als<br />
laser fluorescentie en tijd-opgelost meten niet vergeten zullen worden.<br />
Onderwijsvorm<br />
Het studieonderdeel bestaat uit een theoretisch en een praktisch<br />
gedeelte. Het theoretisch deel kan afzonderlijk gevolgd worden (zie de<br />
opmerking bij deze vakomschrijving).<br />
Aanbevolen voorkennis<br />
Basiskennis analytische en fysische chemie.<br />
Doelgroep<br />
3F, 3S<br />
Keuzevak Med. Chem., Drug Design & Synth.<br />
Vakcode X_430542 (430542)<br />
Periode Ac. Jaar (september)<br />
Credits 3.0<br />
Voertaal Nederlands<br />
Faculteit Faculteit der Exacte Wetenschappen<br />
Coördinator dr. I.J.P. de Esch<br />
Inhoud vak<br />
De inhoud van het keuzevak wordt in overleg met de docent bepaald. Dit<br />
geldt ook voor het aantal contacturen en te gebruiken studiemateriaal.<br />
Neem tijdig contact op met de docent.<br />
Keuzevak Med. Chem., Drug Design & Synth.<br />
<strong>Vrije</strong> <strong>Universiteit</strong> <strong>Amsterdam</strong> - Faculteit der Exacte Wetenschappen - B <strong>Farmaceutische</strong> Wetenschappen - 2010-2011 8-6-2012 - Pagina 47 van 76
Vakcode X_430543 (430543)<br />
Periode Ac. Jaar (september)<br />
Credits 6.0<br />
Voertaal Nederlands<br />
Faculteit Faculteit der Exacte Wetenschappen<br />
Coördinator dr. I.J.P. de Esch<br />
Inhoud vak<br />
De inhoud van het keuzevak wordt in overleg met de docent bepaald. Dit<br />
geldt ook voor het aantal contacturen en te gebruiken studiemateriaal.<br />
Neem tijdig contact op met de docent.<br />
Keuzevak Med. Chem., Drug Disc. & Target Find.<br />
Vakcode X_430544 (430544)<br />
Periode Ac. Jaar (september)<br />
Credits 3.0<br />
Voertaal Nederlands<br />
Faculteit Faculteit der Exacte Wetenschappen<br />
Coördinator dr. I.J.P. de Esch<br />
Inhoud vak<br />
De inhoud van het keuzevak wordt in overleg met de docent bepaald. Dit<br />
geldt ook voor het aantal contacturen en te gebruiken studiemateriaal.<br />
Neem tijdig contact op met de docent.<br />
Keuzevak Med. Chem., Drug Disc. & Target Find.<br />
Vakcode X_430545 (430545)<br />
Periode Ac. Jaar (september)<br />
Credits 6.0<br />
Voertaal Nederlands<br />
Faculteit Faculteit der Exacte Wetenschappen<br />
Coördinator dr. I.J.P. de Esch<br />
Inhoud vak<br />
De inhoud van het keuzevak wordt in overleg met de docent bepaald. Dit<br />
geldt ook voor het aantal contacturen en te gebruiken studiemateriaal.<br />
Neem tijdig contact op met de docent.<br />
Keuzevak Mol. Tox., Comp. Med. Chem. & Tox.<br />
Vakcode X_430546 (430546)<br />
Periode Ac. Jaar (september)<br />
Credits 3.0<br />
Voertaal Nederlands<br />
Faculteit Faculteit der Exacte Wetenschappen<br />
Coördinator dr. J.N.M. Commandeur<br />
<strong>Vrije</strong> <strong>Universiteit</strong> <strong>Amsterdam</strong> - Faculteit der Exacte Wetenschappen - B <strong>Farmaceutische</strong> Wetenschappen - 2010-2011 8-6-2012 - Pagina 48 van 76
Doel vak<br />
Vertrouwd raken met modellen en methoden die gebruikt worden in<br />
computersimulaties aan eiwitten.<br />
Inhoud vak<br />
Biomoleculaire modeling en simulatie is een belangrijke 'tool' om<br />
biochemische, farmaceutische en moleculair-toxicologische processen<br />
zoals (mis)vouwing van eiwitten en de interactie van medicijnen met<br />
eiwitten/enzymen te kunnen begrijpen en voorspellen. In de afgelopen<br />
jaren zijn biomoleculaire modellen (krachtvelden, interaction finger<br />
print methoden) steeds nauwkeuriger geworden, en zijn er steeds<br />
efficientere in silico methoden (virtual screening, free-energy<br />
methoden) ontwikkeld om bindingsaffiniteiten te berekenen.<br />
Onderwijsvorm<br />
Tijdens de cursus zullen, aan de hand van door de docent aangereikte<br />
literatuur, belangrijke recente ontwikkelingen op het gebied van<br />
bindingsaffiniteits-berekeningen en/of krachtveld-ontwikkeling in kaart<br />
worden gebracht.<br />
Toetsvorm<br />
Toetsing vindt mondeling of schriftelijk plaats.<br />
Literatuur<br />
Wordt beschikbaar gesteld door de docent.<br />
Aanbevolen voorkennis<br />
Dit vak bouwt verder op theorie die is behandeld in vakken als<br />
Moleculaire Modeling voor Farmacochemici (2F), en Computational<br />
(Pharmaco)Chemistry (3F en 3S).<br />
Doelgroep<br />
3F<br />
Keuzevak Mol. Tox., Comp. Med. Chem. & Tox.<br />
Vakcode X_430547 (430547)<br />
Periode Ac. Jaar (september)<br />
Credits 6.0<br />
Voertaal Nederlands<br />
Faculteit Faculteit der Exacte Wetenschappen<br />
Coördinator dr. J.N.M. Commandeur<br />
Doel vak<br />
Vertrouwd raken met modellen en methoden die gebruikt worden in<br />
computersimulaties aan eiwitten.<br />
Inhoud vak<br />
Biomoleculaire modeling en simulatie is een belangrijke 'tool' om<br />
biochemische, farmaceutische en moleculair-toxicologische processen<br />
zoals (mis)vouwing van eiwitten en de interactie van medicijnen met<br />
eiwitten/enzymen te kunnen begrijpen en voorspellen. In de afgelopen<br />
jaren zijn biomoleculaire modellen (krachtvelden, interaction finger<br />
print methoden) steeds nauwkeuriger geworden, en zijn er steeds<br />
efficientere in silico methoden (virtual screening, free-energy<br />
<strong>Vrije</strong> <strong>Universiteit</strong> <strong>Amsterdam</strong> - Faculteit der Exacte Wetenschappen - B <strong>Farmaceutische</strong> Wetenschappen - 2010-2011 8-6-2012 - Pagina 49 van 76
methoden) ontwikkeld om bindingsaffiniteiten te berekenen.<br />
Onderwijsvorm<br />
Tijdens de cursus zullen, aan de hand van door de docent aangereikte<br />
literatuur, belangrijke recente ontwikkelingen op het gebied van<br />
bindingsaffiniteits-berekeningen en/of krachtveld-ontwikkeling in kaart<br />
worden gebracht.<br />
Toetsvorm<br />
Toetsing vindt mondeling of schriftelijk plaats.<br />
Literatuur<br />
Wordt beschikbaar gesteld door de docent.<br />
Aanbevolen voorkennis<br />
Dit vak bouwt verder op theorie die is behandeld in vakken als<br />
Moleculaire Modeling voor Farmacochemici (2F), en Computational<br />
(Pharmaco)Chemistry (3F en 3S).<br />
Doelgroep<br />
3F<br />
Keuzevak Mol. Tox., Drug, Disp. and Saf. Assessm.<br />
Vakcode X_430548 (430548)<br />
Periode Ac. Jaar (september)<br />
Credits 3.0<br />
Voertaal Nederlands<br />
Faculteit Faculteit der Exacte Wetenschappen<br />
Coördinator dr. J.N.M. Commandeur<br />
Inhoud vak<br />
Biotransformatie, ook wel metabolisme genoemd, speelt een zeer<br />
belangrijke rol in de verwerking van geneesmiddelen door het lichaam.<br />
Aan de ene kant is biotransformatie vaak bepalend voor de<br />
halfwaardetijd waarmee een geneesmiddel wordt geëlimineerd vanuit het<br />
plasma. Aan de andere kant kunnen bij metabolisme reactieve<br />
metabolieten ontstaan die met cellulair materiaal reageren, zoals<br />
eiwitten, DNA of membranen. Het menselijke genoom codeert voor enkele<br />
honderden enzymen die in meer of mindere mate bij het metabolisme van<br />
geneesmiddelen betrokken kunnen zijn. Om de rol van de enzymen beter<br />
te kunnen bestuderen, zijn voor de belangrijkste<br />
biotransformatie-enzymen expressiesystemen ontwikkeld in verschillende<br />
organismes, zoals Escherichia coli, gist, insectcellen, Salmonella<br />
typhimurium, zoogdiercellen, etc. De keuze van het organisme hangt af<br />
van het doel wat wordt beoogd, bijv. grote schaal expressie (mg-gram)<br />
voor biocatalyse of kristallisatie, lage schaal expressie voor in vitro<br />
(geno)toxiciteit experimenten.<br />
Overige informatie<br />
Dit keuzevak bestaat in twee varianten. De basisvariant van 3<br />
studiepunten (vakcode 430548) kan in overleg met de coordinator worden<br />
uitgebreid naar 6 studiepunten (vakcode 430549).<br />
Keuzevak Multidimensionale scheidingstechnieken<br />
<strong>Vrije</strong> <strong>Universiteit</strong> <strong>Amsterdam</strong> - Faculteit der Exacte Wetenschappen - B <strong>Farmaceutische</strong> Wetenschappen - 2010-2011 8-6-2012 - Pagina 50 van 76
Vakcode X_435037 (435037)<br />
Periode Ac. Jaar (september)<br />
Credits 3.0<br />
Voertaal Nederlands<br />
Faculteit Faculteit der Exacte Wetenschappen<br />
Coördinator dr. H. Lingeman<br />
Doel vak<br />
Het doel is het verwerven van theoretisch en/of praktisch inzicht aan<br />
de hand van een goed gedefinieerd complex analytisch probleem.<br />
Inhoud vak<br />
Het primaire doel is het introduceren van complexe analytische systemen<br />
waarmee zowel de selectiviteit als de gevoeligheid verbeterd kan<br />
worden. Met name de ontwikkeling en optimalisering van geautomatiseerde<br />
multidimensionale systemen en 'high-throughput' systemen zullen aan de<br />
orde komen. Het gaat hierbij om de koppeling van gaschromatografische<br />
of vloeistofchromatografische systemen met elkaar en met verschillende<br />
detectiesystemen (bijv. massaspectrometrie).<br />
Onderwijsvorm<br />
Het studieonderdeel bestaat uit twee onderdelen waarvan het theoretisch<br />
deel (hoorcollege, werkcollege) voorafgaande aan het praktisch deel<br />
gevolgd moet worden. Het theoretisch deel (3 studiepunten) kan ook<br />
afzonderlijk worden gevolgd.<br />
Literatuur<br />
Basisliteratuur en informatie van het internet.<br />
Aanbevolen voorkennis<br />
Basiskennis analytische chemie.<br />
Keuzevak Spectroscopische detectie- en identificatietechniek<br />
Vakcode X_430568 ()<br />
Credits 6.0<br />
Voertaal Nederlands<br />
Faculteit Faculteit der Exacte Wetenschappen<br />
Coördinator dr. F. Ariese<br />
Overige informatie<br />
Dit vak wordt op individuele basis aangeboden in overleg met de docent.<br />
Keuzevak Spectroscopische detectie- en identificatietechniek<br />
Vakcode X_435039 (435039)<br />
Periode Ac. Jaar (september)<br />
Credits 3.0<br />
Voertaal Nederlands<br />
Faculteit Faculteit der Exacte Wetenschappen<br />
Coördinator prof. dr. C. Gooijer<br />
<strong>Vrije</strong> <strong>Universiteit</strong> <strong>Amsterdam</strong> - Faculteit der Exacte Wetenschappen - B <strong>Farmaceutische</strong> Wetenschappen - 2010-2011 8-6-2012 - Pagina 51 van 76
Doel vak<br />
Het doel is het verwerven van praktisch en theoretisch inzicht omtrent<br />
een bepaald thema uit het grote aanbod van spectroscopische detectie-<br />
en identificatietechnieken.<br />
Inhoud vak<br />
Het ontwikkelen en testen van nieuwe spectroscopische technieken die<br />
voor analytische toepassingen kunnen worden gebruikt. Het gaat hier met<br />
name om laser detectiesystemen voor chromatografie of electroforese en<br />
om Raman spectroscopische en hoge-resolutie spectroscopie sytemen voor<br />
de specifieke en gevoelige detectie van organische verbindingen.<br />
Onderwijsvorm<br />
Het studieonderdeel bestaat uit een theoretisch en een praktisch<br />
gedeelte. Het theoretisch deel (3 studiepunten) kan ook afzonderlijk<br />
worden gevolgd. Het volgen van zowel het theoretisch deel als het<br />
praktisch deel levert 3 extra studiepunten op voor een totaal van 6<br />
studiepunten.<br />
Aanbevolen voorkennis<br />
Basiskennis analytische en fysische chemie.<br />
Doelgroep<br />
3F, 3MNW, 3S<br />
Keuzevak Theoretische Chemie<br />
Vakcode X_430538 (430538)<br />
Periode Ac. Jaar (september)<br />
Credits 3.0<br />
Voertaal Nederlands<br />
Faculteit Faculteit der Exacte Wetenschappen<br />
Coördinator prof. dr. L. Visscher<br />
Inhoud vak<br />
De inhoud van het keuzevak wordt in overleg met de docent bepaald. Dit<br />
geldt ook voor het aantal contacturen en te gebruiken studiemateriaal.<br />
Neem tijdig contact op met de docent.<br />
Keuzevak Theoretische Chemie<br />
Vakcode X_430539 (430539)<br />
Periode Ac. Jaar (september)<br />
Credits 6.0<br />
Voertaal Nederlands<br />
Faculteit Faculteit der Exacte Wetenschappen<br />
Coördinator prof. dr. L. Visscher<br />
Inhoud vak<br />
De inhoud van het keuzevak wordt in overleg met de docent bepaald. Dit<br />
geldt ook voor het aantal contacturen en te gebruiken studiemateriaal.<br />
Neem tijdig contact op met de docent.<br />
<strong>Vrije</strong> <strong>Universiteit</strong> <strong>Amsterdam</strong> - Faculteit der Exacte Wetenschappen - B <strong>Farmaceutische</strong> Wetenschappen - 2010-2011 8-6-2012 - Pagina 52 van 76
Levende chemie<br />
Vakcode X_430569 ()<br />
Credits 3.0<br />
Voertaal Nederlands<br />
Faculteit Faculteit der Exacte Wetenschappen<br />
Coördinator dr. M.H. Siderius<br />
Doel vak<br />
Het hoorcollege dient om inzicht te geven in de basisprincipes van de<br />
bouw van levende cellen, de chemische structuur van de bestanddelen van deze ce<br />
gebruiken voor groei en deling, als ook basisprincipes van de<br />
moleculaire biologie van de levende cel, de manier waarop genetische informatie<br />
belangrijkste aspecten van recombinant DNA technologie worden behandeld.<br />
Inhoud vak<br />
Er wordt begonnen met het bespreken van de structurele en functionele<br />
opbouw van de levende cel, waarna de verschillende soorten<br />
(macro)moleculen die in de cel aanwezig zijn worden behandeld.<br />
Aandacht voor eiwitstructuur en functie, met name in het metabolisme<br />
(Enzym activiteit, Michaelis-Menten kinetiek, Allostere effecten). De<br />
afbraakroutes van de belangrijkste voedingsstoffen<br />
(koolhydraten en vetten) worden rudimentair besproken. Tevens de<br />
behandeling van de<br />
structuur en functie van DNA en de manier waarop DNA in de celkern is<br />
opgevouwen tot chromosomen en de aspecten van DNA replicatie en herstel.<br />
Onderwijsvorm<br />
Hoorcollege. Op de de Blackboard site behorend bij dit vak worden<br />
vragen aangeboden aan de hand waarvan de studenten zichzelf kunnen<br />
Toetsvorm<br />
Biochemie zal worden getoetst aan de hand van twee deeltentamens, Het<br />
eerste deel zal gaan over de hoofdstukken waarin cellen, celbouw,<br />
bouwstenen van biochemisch belangrijke macromoleculen, DNA, eiwit<br />
alsmede enzymfunctie wordt behandeld. Het tweede deeltentamen zal de<br />
hoofdstukken toetsen waarin DNA repair, transcriptie en translatie,<br />
genomes, moleculair biologische technieken en cellulair metabolisme en<br />
energiehuishouding aan de orde komen.<br />
Literatuur<br />
Alberts, B. e.a., Essential Cell Biology 3rd ed, 2009. Hoofdstukken 1<br />
t/m 6, aangevuld met delen zoals aangegeven in de studiehandleiding<br />
Doelgroep<br />
1F, 1MNW, 1S, 1-SBI, 1W-B, mBio<br />
Maatschappelijke aspecten van de natuur<strong>wetenschappen</strong><br />
Vakcode X_420153 (420153)<br />
Periode Periode 4<br />
Credits 3.0<br />
Voertaal Nederlands<br />
<strong>Vrije</strong> <strong>Universiteit</strong> <strong>Amsterdam</strong> - Faculteit der Exacte Wetenschappen - B <strong>Farmaceutische</strong> Wetenschappen - 2010-2011 8-6-2012 - Pagina 53 van 76
Faculteit Faculteit der Exacte Wetenschappen<br />
Coördinator prof. dr. J.G.F. Bunders-Aelen<br />
Docent(en) prof. dr. J.G.F. Bunders-Aelen<br />
Lesmethode(n) Hoorcollege<br />
Doel vak<br />
De student beschikt over kennis en inzicht in de interacties tussen<br />
wetenschap en maatschappij.<br />
De student beschikt over kennis en inzicht in de dynamiek van<br />
wetenschap- en technologie ontwikkeling en de rol van sociale processen<br />
daarbij.<br />
De student beschikt over kennis en inzicht in moderne instrumenten<br />
zoals, technology assessment en interactief beleid etc om wetenschap in<br />
maatschappelijk gewenste richtingen te sturen.<br />
De student is in staat om een gefundeerd oordeel geven over<br />
maatschappelijke en ethische aspecten van wetenschap.<br />
De student is instaat om kritisch te reflecteren op zijn<br />
maatschappelijke verantwoordelijkheid als wetenschapper.<br />
Inhoud vak<br />
De cursus gaat in op de wisselwerking tussen wetenschap, technologie en<br />
samenleving. Aan de hand van concrete, actuele vraagstukken wordt eerst<br />
ingegaan op recente knelpunten, dilemma's en controverses in de relatie<br />
wetenschap-maatschappij. Daarna gaat de cursus in op diverse inzichten<br />
en instrumenten (`Technology Assessment'), ethische aspecten,<br />
interactief beleid en maatschappelijk verantwoord ondernemen, die van<br />
belang zijn bij het tot stand brengen van een pro-actieve oordeels en<br />
besluitvorming over W&S ontwikkelingen. Na het theoretische gedeelte van<br />
de cursus, schrijf je samen met een groepje studenten een essay. In dit<br />
essay reflecteer je op een actuele natuurwetenschappelijke ontwikkeling<br />
die belangrijke maatschappelijke consequenties met zich meebrengt.<br />
Onderwijsvorm<br />
Hoorcollege<br />
Toetsvorm<br />
Toets en schriftelijke rapportage met mondelinge presentatie.Voor beide<br />
onderdelen moet minimaal een voldoende gehaald worden.<br />
Literatuur<br />
Syllabus.<br />
Doelgroep<br />
2F, 2MNW, 2N, 2S<br />
Overige informatie<br />
Alle studenten N, S, F en MNW moeten kiezen tussen Geschiedenis van de<br />
natuur<strong>wetenschappen</strong> en Maatschappelijke aspecten van de<br />
natuur<strong>wetenschappen</strong>.<br />
Inlichtingen bij Joske Bunders kamer U-552 de Boelelaan 1081, tel. (020)<br />
598 7030.<br />
Inschrijven in TIS, https://tis.vu.nl/tis/menu is voor dit vak<br />
verplicht! Inschrijven is mogelijk tot 14 dagen voor aanvang van de<br />
cursus.<br />
Macromoleculen en katalyse<br />
<strong>Vrije</strong> <strong>Universiteit</strong> <strong>Amsterdam</strong> - Faculteit der Exacte Wetenschappen - B <strong>Farmaceutische</strong> Wetenschappen - 2010-2011 8-6-2012 - Pagina 54 van 76
Vakcode X_435450 (435450)<br />
Periode Ac. Jaar (september)<br />
Credits 6.0<br />
Voertaal Nederlands<br />
Faculteit Faculteit der Exacte Wetenschappen<br />
Coördinator dr. J.C. Slootweg<br />
Doel vak<br />
Het kennisnemen van en inzicht verkrijgen in enkele belangrijke<br />
aspecten (synthese, eigenschappen, toepassingen) van synthetische<br />
macromoleculen.<br />
Inhoud vak<br />
In deze cursus wordt kort stilgestaan bij natuurlijk voorkomende<br />
macromoleculen, maar de nadruk ligt op synthetische polymeren. Er wordt<br />
een overzicht gegeven van de syntheseroutes, eigenschappen, en<br />
toepassingen van verschillende klassen polymeren. Aan de orde komen<br />
begrippen als: additie-polymeren, condensatie-polymeren, radicaal<br />
polymerisaties, ionische polymerisaties, gekatalyseerde polymerisaties<br />
(Ziegler-Natta), cross-linking, thermoplastics, fibers, elastomeren,<br />
thermohardende harsen, kunststof recycling.<br />
Onderwijsvorm<br />
Na een beperkte introductie waarbij ook twee experimenten zullen worden<br />
uitgevoerd (polymerisatie en depolymerisatie) zullen de studenten zich<br />
de stof vooral eigen maken door een speciale studie te maken van een<br />
industrieel belangrijk polymeer, daarover een korte scriptie te<br />
schrijven en de inhoud hiervan te presenteren.<br />
Literatuur<br />
Clayden e.a., Organic Chemistry. Oxford: Oxford University Press, 2001.<br />
hoofdstuk 52 en aanvullend materiaal.<br />
Aanbevolen voorkennis<br />
Organische chemie I en II<br />
Doelgroep<br />
3S, 3F<br />
Mathematische methoden<br />
Vakcode X_401022 (401022)<br />
Periode Periode 4<br />
Credits 6.0<br />
Voertaal Nederlands<br />
Faculteit Faculteit der Exacte Wetenschappen<br />
Coördinator dr. F. Heinloth<br />
Docent(en) dr. F. Heinloth<br />
Lesmethode(n) Hoorcollege, Werkcollege<br />
Doelgroep<br />
2F<br />
<strong>Vrije</strong> <strong>Universiteit</strong> <strong>Amsterdam</strong> - Faculteit der Exacte Wetenschappen - B <strong>Farmaceutische</strong> Wetenschappen - 2010-2011 8-6-2012 - Pagina 55 van 76
Medische (patho)fysiologie 2<br />
Vakcode X_436503 (436503)<br />
Periode Periode 2<br />
Credits 6.0<br />
Voertaal Nederlands<br />
Faculteit Faculteit der Exacte Wetenschappen<br />
Coördinator prof. dr. G.J.M. Stienen<br />
Lesmethode(n) Hoorcollege, Practicum<br />
Doel vak<br />
Het doel van de cursus is het verwerven van kennis van en inzicht in de<br />
endocriene functies in het menselijk lichaam: hormonale controle, de<br />
nierfunctie, voeding en spijsvertering, de voortplanting, groei en<br />
veroudering, de afweer en het bloed.<br />
Inhoud vak<br />
De cursus is opgebouwd uit de volgende delen met de bijbehorende<br />
onderwerpen:<br />
- hormonale controle<br />
- de nierfunctie<br />
- voeding en spijsvertering<br />
- de voortplanting, groei en veroudering<br />
- bloed(stelping), afweer.<br />
Toetsvorm<br />
Inleveren van de antwoorden op de werkgroepvragen, van de<br />
practicumverslagen en het houden van de presentatie is verplicht. De<br />
cijfers hiervan tellen mee in de eindbeoordeling. De cursus wordt<br />
afgesloten met een tentamen met 40 meerkeuze en 8 open vragen.<br />
Medische fysiologie 1<br />
Vakcode X_430059 (430059)<br />
Periode Periode 1<br />
Credits 3.0<br />
Voertaal Nederlands<br />
Faculteit Faculteit der Exacte Wetenschappen<br />
Lesmethode(n) Hoorcollege, Werkcollege, Practicum<br />
Doel vak<br />
Het verwerven van kennis van en inzicht in het membraantransport, de<br />
bouw en functie van het zenuwstelsel, het hart en de bloedsomloop onder<br />
normale omstandigheden en tijdens ziekte.<br />
Inhoud vak<br />
De volgende onderwerpen komen aan bod:<br />
- Transport van stoffen over het celmembraan.<br />
- Bouw van zenuwvezels, neuronale schakelingen, meten van de<br />
voortplantingsnelheid van de actiepotentiaal.<br />
- Bouw en functie van het hart, ECG, bloeddrukmeting.<br />
- Centrale en perifere zenuwstelsel: neuronale paden en reflexen.<br />
<strong>Vrije</strong> <strong>Universiteit</strong> <strong>Amsterdam</strong> - Faculteit der Exacte Wetenschappen - B <strong>Farmaceutische</strong> Wetenschappen - 2010-2011 8-6-2012 - Pagina 56 van 76
- Sensorische en motorische functie.<br />
- Bewustzijn en gedrag: EEG, evoked potentials.<br />
Onderwijsvorm<br />
Patiëntdemonstraties, hoorcolleges, werkgroepen met casussen, practica<br />
en presentaties. Onderwerpen patiëntdemonstraties: rugklachten, het<br />
carpaal tunnel syndroom en dwarslaesie. In de hoorcolleges zullen de<br />
klinische problemen in verband gebracht worden met bovengenoemde<br />
cursusonderwerpen. Hierbij zal een relatie gelegd worden tussen de<br />
ziektebeelden, de bouw, functie en werking van het zenuwstelsel, de<br />
zintuigen, het hart en de bloedsomloop. Een belangrijke plaats wordt<br />
ingenomen door het elektromyogram (EMG), de mechanische eigenschappen<br />
van botten en spieren, het elektrocardiogram (ECG) en het<br />
elektro-encefalogram (EEG). De werkgroepen en practica zijn erop<br />
gericht de zelfwerkzaamheid van de studenten te stimuleren. In de<br />
werkgroepen zullen bovengenoemde onderwerpen uitgediept worden aan de<br />
hand van concrete klinisch georiënteerde vragen en opdrachten. De<br />
practica vormen een illustratie en demonstratie van behandelde<br />
principes. Hierbij komen de volgende onderwerpen aan bod:<br />
- Zenuwgeleiding en Rugklachten<br />
- Elektrische activiteit van het hart<br />
- Bloeddruk meting<br />
- Bewustzijn en Gedrag.<br />
Toetsvorm<br />
Inleveren van de antwoorden op de werkgroepvragen en van de<br />
practicumverslagen is verplicht. De cijfers hiervan tellen mee in de<br />
eindbeoordeling. De periode wordt afgesloten met een tentamen bestaande<br />
uit 30 meerkeuze en 8 open vragen.<br />
Literatuur<br />
Vander, Sherman, and Luciano, Human Physiology 11th ed. MacGrawHill.<br />
Daarnaast wordt een syllabus beschikbaar gesteld met daarin opgenomen<br />
de werkgroep vragen/opdrachten en de practicumhandleiding.<br />
Doelgroep<br />
1F, 1LI-HA<br />
Medische fysiologie II<br />
Vakcode X_430102 (430102)<br />
Credits 6.0<br />
Voertaal Nederlands<br />
Faculteit Faculteit der Exacte Wetenschappen<br />
Mentoraat / Tutoraat<br />
Vakcode X_000008 ()<br />
Periode Periode 1<br />
Credits 0.0<br />
Voertaal Nederlands<br />
Faculteit Faculteit der Exacte Wetenschappen<br />
Lesmethode(n) Hoorcollege<br />
<strong>Vrije</strong> <strong>Universiteit</strong> <strong>Amsterdam</strong> - Faculteit der Exacte Wetenschappen - B <strong>Farmaceutische</strong> Wetenschappen - 2010-2011 8-6-2012 - Pagina 57 van 76
Overige informatie<br />
Iedere eerstejaars student Business Analytics is verplicht deel te nemen<br />
aan het Eerstejaars mentoraat in periodes 1 en 2. Het met een voldoende<br />
afronden van het vak Wiskunde wereldwijd is alleen mogelijk indien is<br />
deelgenomen aan het Eerstejaars mentoraat.<br />
Modern Developments in Pharmacochemistry<br />
Vakcode X_430515 (430515)<br />
Periode Periode 2<br />
Credits 3.0<br />
Voertaal Nederlands<br />
Faculteit Faculteit der Exacte Wetenschappen<br />
Coördinator prof. dr. N.P.E. Vermeulen<br />
Docent(en) prof. dr. N.P.E. Vermeulen<br />
Lesmethode(n) Hoorcollege<br />
Doel vak<br />
Het doel van dit college is de student kennis van en inzicht te laten<br />
verwerven in het onderzoek naar de ontdekking (discovery) en de<br />
ontwikkeling (development) van nieuwe geneesmiddelen, met name in de<br />
nieuwste ontwikkelingen daarin. Ook zal kennis verworven worden in het<br />
succes/falen van deze processen.<br />
Inhoud vak<br />
In dit studieonderdeel zullen diverse moderne ontwikkelingen in het<br />
'discovery' en 'development' proces van de ontwikkeling van nieuwe<br />
geneesmiddelen. De nadruk ligt op verdieping van eerder in de <strong>BSc</strong>-FAR<br />
behandelde stof, dit aan de hand van recente onderzoeksartikelen.<br />
Onderwerpen die aan de orde komen zijn: drug design en synthese,<br />
moleculaire farmacologie ('target finding and validation'), cellulaire<br />
'stress and signaling', moleculaire toxicologie ('ADME and drug<br />
safety'), 'computational medicinal chemistry and toxicology' en<br />
bioanalyse van geneesmiddelen. Ook zullen systeem en netwerk analysie<br />
en biomarkers aan de orde komen.<br />
Onderwijsvorm<br />
Er wordt gebruik gemaakt van Blackboard, en de stof wordt behandeld in<br />
de vorm van 'journal clubs' over recente onderzoeksartikelen,<br />
discussie-sessies en mondelinge presentaties door de studenten in<br />
aanwezigheid van deskundige onderzoekers/docenten.<br />
Literatuur<br />
Het studiemateriaal zal bestaan uit recente researchartikelen uit de<br />
verschillende specialisatie-gebieden in MSc-opleiding Drug Discovery<br />
and Safety.<br />
Doelgroep<br />
3F<br />
Moleculaire mechanismen van ziekten<br />
Vakcode X_430104 (430104)<br />
<strong>Vrije</strong> <strong>Universiteit</strong> <strong>Amsterdam</strong> - Faculteit der Exacte Wetenschappen - B <strong>Farmaceutische</strong> Wetenschappen - 2010-2011 8-6-2012 - Pagina 58 van 76
Periode Periode 3<br />
Credits 3.0<br />
Voertaal Nederlands<br />
Faculteit Faculteit der Exacte Wetenschappen<br />
Coördinator dr. J.E. van Muijlwijk-Koezen<br />
Docent(en) dr. J.E. van Muijlwijk-Koezen<br />
Lesmethode(n) Hoorcollege, Werkcollege<br />
Onderwijsvorm<br />
Na een inleiding over een van bovengenoemde ziekten zullen studenten in<br />
groepjes deelopdrachten t.a.v. deze ziekte uitwerken. Hierbij worden<br />
artikelen uit de wetenschappelijke literatuur gebruikt. Op geregelde<br />
tijden zal over de stof worden gediscussieerd met de begeleidende<br />
docent. De resultaten worden aan de overige studenten gepresenteerd,<br />
afwisselend schriftelijk en mondeling.<br />
Moleculaire modeling<br />
Vakcode X_435103 (435103)<br />
Periode Periode 6<br />
Credits 6.0<br />
Voertaal Nederlands<br />
Faculteit Faculteit der Exacte Wetenschappen<br />
Coördinator dr. C. de Graaf<br />
Docent(en) dr. I.J.P. de Esch, dr. C. de Graaf<br />
Lesmethode(n) Hoorcollege, Practicum<br />
Doel vak<br />
Het leren van verschillende rekenkundige benaderingen om de biologische<br />
activiteit van nieuwe medicijnmoleculen te begrijpen en te voorspellen.<br />
Verschillende technieken die worden gebruikt in de moderne<br />
farmacochemie zullen behandeld worden en de student zal de voor- en<br />
nadelen van de individuele methoden leren inschatten.<br />
Inhoud vak<br />
De computer wordt in toenemende mate gebruikt voor het vinden en<br />
ontwerpen van nieuwe stoffen met gewenste biologische activiteit. Deze<br />
'in silico' methoden stellen de farmacochemicus in staat om efficiënter<br />
nieuwe geneesmiddelen te ontwikkelen. Verder dragen de verschillende<br />
technologieën bij aan een beter begrip van de werking van liganden en<br />
biologische targets. In dit vak zal aandacht worden besteed aan het nut<br />
van moleculaire modeling en hoe moleculen beschreven kunnen worden door<br />
de computer (2D descriptoren, 3D descriptoren, atomair, quantum<br />
chemisch). De eigenschappen van liganden die verantwoordelijk zijn voor<br />
de activiteit worden geïdentificeerd door middel van (3D)QSAR,<br />
farmacofoor modeling, en molecular docking. Het berekenen van de<br />
conformaties van moleculen zal worden behandeld met behulp van<br />
moleculaire mechanica, waarbij ook verschillende sampling methodes<br />
worden behandeld (systematisch, Monte Carlo, moleculaire dynamica). Ook<br />
zal kort worden ingegaan op quantum mechanische manieren om moleculen<br />
te beschrijven. Vervolgens zullen de toepassing van deze methodes in<br />
rationele drug discovery besproken worden zoals virtual screening en<br />
'de novo' design benaderingen.<br />
<strong>Vrije</strong> <strong>Universiteit</strong> <strong>Amsterdam</strong> - Faculteit der Exacte Wetenschappen - B <strong>Farmaceutische</strong> Wetenschappen - 2010-2011 8-6-2012 - Pagina 59 van 76
Onderwijsvorm<br />
Hoorcolleges, werkcollege, practica.<br />
Toetsvorm<br />
De beoordeling zal plaatsvinden op basis van schriftelijke tentamens en<br />
tussentijdse opdrachten.<br />
Literatuur<br />
Collegedictaat.<br />
Doelgroep<br />
2F<br />
Natuurstoffen<br />
Vakcode X_435440 (435440)<br />
Periode Ac. Jaar (september)<br />
Credits 6.0<br />
Voertaal Nederlands<br />
Faculteit Faculteit der Exacte Wetenschappen<br />
Coördinator dr. E. Ruijter<br />
Doel vak<br />
Doel van deze cursus is het verkrijgen van een overzicht over de<br />
structuur, eigenschappen en reacties van de verschillende hoofdklassen<br />
van natuurstoffen.<br />
Inhoud vak<br />
Aansluitend op de basiskennis organische chemie en biochemie worden in<br />
deze cursus een aantal aspecten van de natuurstofchemie behandeld. De<br />
biologische activiteit van vele natuurstoffen hangt nauw samen met hun<br />
unieke en diverse structuren. De structurele kenmerken en<br />
biosynthetische aspecten van o.a. polyketiden, suikers, peptiden,<br />
terpenen en steroïden, alkaloïden en flavonoïden zijn de hoofdthema's<br />
van deze cursus. Hun specifieke rol in de natuur en een aantal<br />
specifieke fysische en chemische eigenschappen zullen worden behandeld.<br />
Onderwijsvorm<br />
Tutorial.<br />
Literatuur<br />
Dewick, P.M., Medicinal Natural Products 3rd ed, Wiley-VCH, 2009.<br />
Aanbevolen voorkennis<br />
Organische Chemie I en II, Biochemie (aangeraden: Organische Chemie III)<br />
Doelgroep<br />
3F, 3S<br />
Open House Analytical Chemistry and applied Spectroscopy<br />
Vakcode X_000009 ()<br />
Periode Periode 1<br />
Credits 0.0<br />
<strong>Vrije</strong> <strong>Universiteit</strong> <strong>Amsterdam</strong> - Faculteit der Exacte Wetenschappen - B <strong>Farmaceutische</strong> Wetenschappen - 2010-2011 8-6-2012 - Pagina 60 van 76
Voertaal Nederlands<br />
Faculteit Faculteit der Exacte Wetenschappen<br />
Coördinator dr. H. Lingeman<br />
Docent(en) dr. H. Lingeman<br />
Lesmethode(n) Bijeenkomst<br />
Open house Chemical Biology<br />
Vakcode X_000010 ()<br />
Periode Periode 1<br />
Credits 0.0<br />
Voertaal Nederlands<br />
Faculteit Faculteit der Exacte Wetenschappen<br />
Coördinator dr. M.H. Siderius<br />
Docent(en) dr. M.H. Siderius<br />
Lesmethode(n) Bijeenkomst<br />
Open House Comp. Med. Chem. & Tox.<br />
Vakcode X_000011 ()<br />
Periode Periode 1<br />
Credits 0.0<br />
Voertaal Nederlands<br />
Faculteit Faculteit der Exacte Wetenschappen<br />
Coördinator dr. B.C. Oostenbrink<br />
Docent(en) dr. B.C. Oostenbrink<br />
Lesmethode(n) Bijeenkomst<br />
Open House DDS<br />
Vakcode X_000012 ()<br />
Periode Periode 1<br />
Credits 0.0<br />
Voertaal Nederlands<br />
Faculteit Faculteit der Exacte Wetenschappen<br />
Coördinator dr. I.J.P. de Esch<br />
Docent(en) dr. I.J.P. de Esch<br />
Lesmethode(n) Bijeenkomst<br />
Open House Drug Discovery & Target Finding<br />
Vakcode X_000013 ()<br />
Periode Periode 1<br />
Credits 0.0<br />
<strong>Vrije</strong> <strong>Universiteit</strong> <strong>Amsterdam</strong> - Faculteit der Exacte Wetenschappen - B <strong>Farmaceutische</strong> Wetenschappen - 2010-2011 8-6-2012 - Pagina 61 van 76
Voertaal Nederlands<br />
Faculteit Faculteit der Exacte Wetenschappen<br />
Coördinator prof. dr. M.J. Smit<br />
Docent(en) prof. dr. M.J. Smit<br />
Lesmethode(n) Bijeenkomst<br />
Open House MolTox<br />
Vakcode X_000014 ()<br />
Periode Periode 1<br />
Credits 0.0<br />
Voertaal Nederlands<br />
Faculteit Faculteit der Exacte Wetenschappen<br />
Coördinator dr. J.N.M. Commandeur<br />
Docent(en) dr. J.N.M. Commandeur<br />
Lesmethode(n) Bijeenkomst<br />
Organische chemie 1<br />
Vakcode X_435091 (435091)<br />
Periode Periode 5<br />
Credits 3.0<br />
Voertaal Nederlands<br />
Faculteit Faculteit der Exacte Wetenschappen<br />
Coördinator prof. dr. K. Lammertsma<br />
Docent(en) prof. dr. K. Lammertsma<br />
Lesmethode(n) Hoorcollege, Werkcollege<br />
Literatuur<br />
Clayden e.a., Organic Chemistry, Oxford: Oxford University Press, 2001<br />
(ISBN 019850346).<br />
Organische chemie 2<br />
Vakcode X_435007 (435007)<br />
Periode Periode 1<br />
Credits 3.0<br />
Voertaal Nederlands<br />
Faculteit Faculteit der Exacte Wetenschappen<br />
Coördinator prof. dr. ir. R.V.A. Orru<br />
Docent(en) prof. dr. ir. R.V.A. Orru<br />
Lesmethode(n) Hoorcollege<br />
Doel vak<br />
Het college beoogt het aanleren van basiskennis organische chemie.<br />
<strong>Vrije</strong> <strong>Universiteit</strong> <strong>Amsterdam</strong> - Faculteit der Exacte Wetenschappen - B <strong>Farmaceutische</strong> Wetenschappen - 2010-2011 8-6-2012 - Pagina 62 van 76
Inhoud vak<br />
Dit college vormt één geheel met het eerstejaarscollege. Het zet voort<br />
met de presentatie van specifieke reactietypen, nu eens niet<br />
georganiseerd naar functionele groepen, maar rondom een<br />
gemeenschappelijk mechanisme: nucleofiele substituties, eliminaties,<br />
addities aan meervoudige koolstof-koolstofbindingen, electrofiele<br />
aromatische substituties, addities en substitutie aan carbonylgroepen,<br />
omleggingen.<br />
Eveneens wordt aandacht besteed aan syntheseplanning.<br />
Onderwijsvorm<br />
Hoorcollege 16 uur; werkcollege 9 uur.<br />
Aanbevolen voorkennis<br />
Organische chemie I<br />
Doelgroep<br />
2S, 2F<br />
Organische chemie 3: moderne organische synthese<br />
Vakcode X_435109 (435109)<br />
Periode Periode 3<br />
Credits 3.0<br />
Voertaal Nederlands<br />
Faculteit Faculteit der Exacte Wetenschappen<br />
Docent(en) prof. dr. ir. R.V.A. Orru, dr. E. Ruijter<br />
Lesmethode(n) Hoorcollege<br />
Doel vak<br />
Uitbreiden van de basiskennis organische chemie en organische synthese.<br />
Inhoud vak<br />
Dit vak bouwt voort op de colleges organische chemie I en II en het<br />
practicum organische synthese. Er zal ruim aandacht worden besteed aan<br />
nieuwe ontwikkelingen in de organische synthese. Zo worden de<br />
basisprincipes van de combinatoriële chemie, solution en solid phase,<br />
diversity oriented benaderingen besproken, maar ook moderne parallelle<br />
synthese technieken, automatische opzuiveringstechnieken en database<br />
gestuurde synthese planning komen aan bod. Verder wordt het rationeel<br />
(computer ondersteund) ontwerpen van complexe syntheses besproken. Ook<br />
komen onderwerpen als asymmetrische katalyse, omleggings-,<br />
cycloadditie- en radicaalreacties aan bod.<br />
Onderwijsvorm<br />
Werkcolleges/opdrachten<br />
Toetsvorm<br />
Opdracht<br />
Literatuur<br />
Clayden e.a., Organic Chemistry, Oxford: Oxford University Press, 2001<br />
(ISBN 019850346).<br />
<strong>Vrije</strong> <strong>Universiteit</strong> <strong>Amsterdam</strong> - Faculteit der Exacte Wetenschappen - B <strong>Farmaceutische</strong> Wetenschappen - 2010-2011 8-6-2012 - Pagina 63 van 76
Aanbevolen voorkennis<br />
Organische chemie I en II.<br />
Doelgroep<br />
3F, 3S, mi-MC, mi-AMC<br />
Organometaalchemie<br />
Vakcode X_435018 (435018)<br />
Periode Ac. Jaar (september)<br />
Credits 3.0<br />
Voertaal Nederlands<br />
Faculteit Faculteit der Exacte Wetenschappen<br />
Coördinator dr. A.W. Ehlers<br />
Doel vak<br />
Het doel van dit college is het verdiepen van de basiskennis op het<br />
gebied van coordinatiechemie en de organometaalchemie.<br />
Inhoud vak<br />
Er wordt aandacht besteed aan de volgende onderwerpen:<br />
- organometaalchemie van overgangsmetalen<br />
- organometaalcomplexen en organische synthese<br />
- homogene katalyse<br />
- bio-anorganische chemie (metallo-enzymen, biomimetica).<br />
Onderwijsvorm<br />
Zelfstudie.<br />
Literatuur<br />
Elschenbroich, C., Organometallics 3rd ed. Weinheim: Wiley-VCH. of in<br />
overleg met de docent.<br />
Doelgroep<br />
3S, 3F<br />
Oriëntatie op de M-variant<br />
Vakcode X_400375 (400375)<br />
Periode Periode 4<br />
Credits 6.0<br />
Voertaal Nederlands<br />
Faculteit Faculteit der Exacte Wetenschappen<br />
Docent(en) A. van Luijn MSc<br />
Lesmethode(n) Hoorcollege<br />
Doel vak<br />
- Het verwerven van kennis en inzicht in de met name in<br />
beleidsprocessen, beleidstheorie en beleidsanalyse;<br />
- Het verwerven van kennis en inzicht in de structuur en het beleid van<br />
de Nederlandse overheid met name op het gebied van wetenschap;<br />
- Het verwerven van kennis en inzicht in managementprocessen en<br />
-theorieën, met specifieke aandacht voor kennismanagement en<br />
<strong>Vrije</strong> <strong>Universiteit</strong> <strong>Amsterdam</strong> - Faculteit der Exacte Wetenschappen - B <strong>Farmaceutische</strong> Wetenschappen - 2010-2011 8-6-2012 - Pagina 64 van 76
projectmanagement;<br />
- De student is instaat om beleid te analyseren en beleidsopties te<br />
identificeren;<br />
- De student is instaat tot projectmatig werken in teamverband;<br />
- De student beschikt over vaardigheden, zoals onderzoeksopzet maken,<br />
literatuurstudie, kritisch analyseren, argumenteren, en schriftelijk en<br />
mondeling presenteren;<br />
- Oriëntatie op de M-variant, dan wel de masters Management,<br />
Policy-Analysis and Entrepreneurship.<br />
Inhoud vak<br />
Beleid speelt op vele manieren en niveaus een rol in onze samenleving.<br />
Ook binnen de wetenschap heb je eigenlijk altijd met beleid te maken.<br />
Enerzijds speelt beleid een rol bij het stimuleren en/of reguleren van<br />
wetenschappelijk onderzoek. Anderzijds wordt wetenschap ingezet om<br />
beleid rondom een maatschappelijk probleem te ondersteunen of te<br />
adviseren.<br />
Ook management speelt in allerlei situaties en op allerlei niveaus een<br />
rol. Zo wordt wetenschappelijk onderzoek altijd intern aangestuurd door<br />
het management of direct door het hoofd van de afdeling, maar ook meer<br />
indirect door het faculteitsbestuur en College van Bestuur.<br />
Ook al lijken beleid en management veelal ad hoc vorm gegeven te<br />
worden, toch zijn er structurele processen en ordenende principes aan<br />
te wijzen. Inzicht in deze processen en principes maakt dat je begrijpt<br />
waarom bepaalde keuzes gemaakt worden en bijvoorbeeld waarom beleid er<br />
uitziet zoals het in een beleidsnota geformuleerd wordt.<br />
In het eerste deel van deze cursus krijg je colleges over diverse<br />
beleids- en managementaspecten geïllustreerd aan de hand van praktische<br />
casussen. Dit deel wordt afgesloten met een tentamen.<br />
Het tweede deel van de cursus bestaat uit een projectopdracht waarin de<br />
analyse van een actueel, maatschappelijk en natuurwetenschappelijk<br />
vraagstuk in relatie tot (overheids)beleid centraal staat. Voorbeelden<br />
zijn nanotechnologie, Q- koorts, orgaandonatie of biobrandstof. De<br />
nadruk ligt hierbij op zelfwerkzaamheid, eigen initiatief en<br />
oordeelsvorming en op het werken in teamverband. Wij willen daarmee een<br />
leersituatie creëren die nauw aansluit bij de praktijk van beleidsmatig<br />
onderzoek en projectmatig werken. De problematiek en de verschillende<br />
beleidsopties rond dit vraagstuk worden kritisch geanalyseerd. De<br />
resultaten, conclusies en aanbevelingen worden weergegeven in een<br />
beleidsadviesrapport dat aan het eind van de cursus mondeling<br />
gepresenteerd wordt.<br />
Onderwijsvorm<br />
De eerste helft van de cursus zal bestaan uit werkcolleges, de tweede<br />
helft uit het uitvoeren van een projectopdracht in teamverband.<br />
Literatuur<br />
Informatie over literatuur wordt via Blackboard verstrekt.<br />
Doelgroep<br />
Derdejaars FEW-studenten.<br />
Overige informatie<br />
Onderdeel van de M-oriëntatie.<br />
Oriëntatie science educatie<br />
<strong>Vrije</strong> <strong>Universiteit</strong> <strong>Amsterdam</strong> - Faculteit der Exacte Wetenschappen - B <strong>Farmaceutische</strong> Wetenschappen - 2010-2011 8-6-2012 - Pagina 65 van 76
Vakcode O_ORIBETA (991010)<br />
Periode Periode 4<br />
Credits 6.0<br />
Voertaal Nederlands<br />
Coördinator ir. J.G. Schoonhoven<br />
Doel vak<br />
Voor een student die deze cursus heeft doorlopen geldt:<br />
de student is bereid en in staat te reflecteren op zijn/haar<br />
functioneren,<br />
de student is in staat om aan te geven wat het betekent om een goede<br />
docent in de bovenbouw te zijn,<br />
de student is in staat om zijn eigen geschiktheid voor het beroep van<br />
docent te beoordelen,<br />
de student kan aangeven of het beroep van docent iets voor hem/haar is,<br />
de student verwerft een aantal communicatieve en didactische<br />
vaardigheden.<br />
Inhoud vak<br />
De cursus bestaat de eerste week uit diverse werkcolleges, de volgende<br />
drie weken uit een stage op een school voor voortgezet onderwijs. elke<br />
week is er een praktijkbespreking en verdieping op de VU. De stage is<br />
het belangrijkste onderdeel van de cursus, deze voer je uit samen met<br />
een medestudent. In totaal zal de stage ongeveer twaalf dagen in beslag<br />
nemen.<br />
Tijdens de werkcolleges komen de volgende onderwerpen aan de orde:<br />
Hoe bouw je een presentatie op, hoe kom je over.<br />
Hoe vertaal je (wetenschappelijke) informatie naar het niveau van je<br />
doelgroep.<br />
Wat doet een (goede) leraar allemaal.<br />
Wat is het verschil tussen presenteren en onderwijzen.<br />
Welke kenmerken heeft de doelgroep en hoe kun je daar rekening mee<br />
houden.<br />
Hoe ontwerp je een (activerende) les.<br />
Hoe krijg je je doelgroep actief.<br />
Met welke communicatieve aspecten in de klas moet je rekening houden.<br />
Tijdens de stage onderneem je de volgende activiteiten:<br />
observeren van lessen;<br />
zelf minimaal vier lessen geven, in zowel onderbouw als bovenbouw;<br />
uitvoeren van een klein onderzoek;<br />
zo veel mogelijk deelnemen aan alle activiteiten op school en zo<br />
(hernieuwd) kennis maken met het voortgezet onderwijs vanuit het<br />
docenten perspectief.<br />
Onderwijsvorm<br />
Je levert aan het eind van de cursus een verslag in. Het verslag is een<br />
samenhangend verhaal dat een beeld geeft van jouw leerproces tijdens de<br />
cursus. Met je verslag laat je zien waar je staat als mogelijk<br />
toekomstig docent. Het gaat primair om het zichtbaar maken van je<br />
ontwikkeling, niet noodzakelijk om te bewijzen dat je een goede docent<br />
bent. Werkcolleges en stage vormen samen een voltijds programma, het<br />
is niet mogelijk gelijktijdig andere colleges te volgen.<br />
Doelgroep<br />
<strong>Vrije</strong> <strong>Universiteit</strong> <strong>Amsterdam</strong> - Faculteit der Exacte Wetenschappen - B <strong>Farmaceutische</strong> Wetenschappen - 2010-2011 8-6-2012 - Pagina 66 van 76
Deelname aan de cursus staat open voor derdejaars bachelorstudenten van<br />
de faculteiten Exacte Wetenschappen en Aard- en Levens<strong>wetenschappen</strong>. De<br />
cursus wordt aangeraden voor studenten die overwegen de<br />
lerarenopleiding te gaan volgen binnen de masteropleiding (E- variant)<br />
of aansluitend op hun masteropleiding. Ook voor studenten die<br />
vaardigheden op willen doen in het verzorgen van wetenschappelijke<br />
presentaties is de cursus interessant.<br />
Overige informatie<br />
Meer informatie is te verkrijgbaar bij Arjan Schooonhoven:<br />
a.schoonhoven@ond. vu. nl, of te vinden op www.onderwijscentrum.vu.nl<br />
Practicum Bio-analytische chemie<br />
Vakcode X_435085 (435085)<br />
Periode Periode 6<br />
Credits 3.0<br />
Voertaal Nederlands<br />
Faculteit Faculteit der Exacte Wetenschappen<br />
Coördinator dr. J. Kool<br />
Doel vak<br />
Het doel is het aanleren van de basisprincipes van de bio-analytische<br />
chemie en het leren opzetten en uitvoeren van bio-analytisch-chemische<br />
experimenten.<br />
Inhoud vak<br />
Dit betekent dat allereerst de, uit analytisch oogpunt belangrijke,<br />
fysich-chemische eigenschappen van de te onderzoeken verbindingen<br />
bestudeerd zullen worden. Vervolgens worden de bio-analytisch-chemische<br />
technieken opgezocht waarmee deze verbindingen bepaald kunnen worden,<br />
waarna een analysevoorschrift wordt opgesteld. Hierna worden de<br />
bepalingen uitgevoerd en worden de resultaten in een verslag<br />
weergegeven. De noodzakelijke theoretische achtergrond wordt gegeven in<br />
de vorm van werk- en instructiecolleges.<br />
Onderwijsvorm<br />
Het practicum wordt wordt uitgevoerd als projectmatig onderwijs,<br />
waarbij de student aan de hand van opdrachten zelf alle noodzakelijke<br />
gegevens, de theoretische achtergrond en de voorschriften moet opzoeken<br />
en het experiment zelf vormgeven.<br />
Literatuur<br />
Tijdens het practicum zal voldoende literatuur aanwezig zijn om de<br />
opdrachten te kunnen uitvoeren.<br />
Doelgroep<br />
1F<br />
Practicum Moderne synthetische methoden<br />
Vakcode X_435016 (435016)<br />
Periode Ac. Jaar (september)<br />
Credits 9.0<br />
<strong>Vrije</strong> <strong>Universiteit</strong> <strong>Amsterdam</strong> - Faculteit der Exacte Wetenschappen - B <strong>Farmaceutische</strong> Wetenschappen - 2010-2011 8-6-2012 - Pagina 67 van 76
Voertaal Nederlands<br />
Faculteit Faculteit der Exacte Wetenschappen<br />
Coördinator dr. E. Ruijter<br />
Doel vak<br />
Kennismaken met nieuwste experimentele ontwikkelingen in de organische<br />
synthese.<br />
Inhoud vak<br />
In dit vak maak je kennis met de nieuwste experimentele technieken in<br />
de organische synthese. Je gaat werken aan een project dat direct met<br />
lopend onderzoek verknoopt is. Parallelle synthese methodiek met behulp<br />
van semi-automatische apparatuur wordt toegepast in combinatie met<br />
parallelle opwerkingstechnieken m.b.v. indampmodules en automatische<br />
kolomchromatografie. Ook leer je syntheses en zuiveringen absoluut<br />
water- en zuurstofvrij uitvoeren d.m.v. Schlenk-technieken en het<br />
werken met een glovebox.<br />
Onderwijsvorm<br />
Practicumproject<br />
Literatuur<br />
Clayden e.a., Organic Chemistry, Oxford: Oxford University Press (ISBN<br />
019850346).<br />
Aanbevolen voorkennis<br />
Organische chemie I & II, practicum organische synthese,<br />
kernspinresonantie (NMR).<br />
Doelgroep<br />
3S, 3F<br />
Project Bio-analytische chemie<br />
Vakcode X_430577 ()<br />
Credits 6.0<br />
Voertaal Nederlands<br />
Faculteit Faculteit der Exacte Wetenschappen<br />
Coördinator dr. H. Lingeman<br />
Doel vak<br />
Het verwerven van kennis en het opzetten en uitvoeren van analytische<br />
technieken die gebruikt kunnen worden bij de (kwantitatieve) bepaling<br />
van geneesmiddelen en endogene componenten in biologische systemen.<br />
Inhoud vak<br />
In een geïntegreerd hoor-/werkcollege en practicum komen de technieken<br />
aan de orde die gebruikt kunnen worden voor zowel de kwalitatieve als<br />
kwantitatieve bepaling van geneesmiddelen, met de hierbij horende<br />
metabolieten en/of ontledingsproducten in een biologische matrix. Dit<br />
betekent dat aan de hand van de fysisch-chemische eigenschappen van de<br />
te onderzoeken verbinding een protocol wordt opgesteld, waarmee deze<br />
verbinding bepaald kan worden. Vervolgens wordt de bepaling uitgevoerd<br />
en worden de resultaten in een verslag weergegeven.<br />
<strong>Vrije</strong> <strong>Universiteit</strong> <strong>Amsterdam</strong> - Faculteit der Exacte Wetenschappen - B <strong>Farmaceutische</strong> Wetenschappen - 2010-2011 8-6-2012 - Pagina 68 van 76
Onderwijsvorm<br />
Geïntegreerd hoor- /werkcollege en projectmatig onderwijs, waarbij de<br />
student aan de hand van opdrachten zelf alle noodzakelijke gegevens,<br />
theoretische achtergrond en de voorschriften moet opzoeken en het<br />
experiment zelf vorm moet geven.<br />
Toetsvorm<br />
Schriftelijk tentamen en beoordeling van de praktische activiteiten<br />
(inclusief voorbereiding, experimentele vaardigheden, schriftelijke<br />
verslaglegging). Beide onderdelen tellen gelijkwaardig mee in<br />
eindbeoordeling en geen van beide onderdelen mag lager dan een 5 zijn.<br />
Literatuur<br />
Materiaal beschikbaar gesteld door de docenten. Uitgebreide informatie<br />
over de behandelde stof kan worden gevonden in D.C. Harris, Quantitative<br />
Chemical Analysis, Eighth Edition, W.H. Freeman and Company, New York,<br />
2010.<br />
Doelgroep<br />
1F (periode 6), 1MNW (periode 5)<br />
Voor studenten MNW begonnen in 2011/2012: Project Bio-analytische chemie<br />
(6 ec) vervangt Bio-analytische chemie (X_430094)+ Practicum bioanalyse<br />
(X_430511)<br />
Overige informatie<br />
Slagingseis 1F:<br />
Het met een voldoende afronden van het vak Bio-Analytische Chemie is<br />
alleen dan mogelijk, indien de onderdelen van tutoraat FAR 1B naar<br />
behoren zijn afgerond.<br />
Radiofarmacochemie<br />
Vakcode X_436502 (436502)<br />
Periode Periode 1<br />
Credits 3.0<br />
Voertaal Nederlands<br />
Faculteit Faculteit der Exacte Wetenschappen<br />
Coördinator dr. A.D. Windhorst<br />
Lesmethode(n) Hoorcollege<br />
Doel vak<br />
Het college heeft tot doel studenten inzicht te geven op welke wijze<br />
radiofarmaca gemaakt worden en wat de toepassing is in de nucleaire<br />
geneeskunde.<br />
Toetsvorm<br />
De beoordeling zal plaatsvinden op basis van een schriftelijke tentamen<br />
met open vragen.<br />
Literatuur<br />
Voor deze cursus is een syllabus beschikbaar. Deze wordt overhandigd op<br />
het eerste college. Via Blackboard zal extra cursus materiaal ter<br />
beschikking komen.<br />
<strong>Vrije</strong> <strong>Universiteit</strong> <strong>Amsterdam</strong> - Faculteit der Exacte Wetenschappen - B <strong>Farmaceutische</strong> Wetenschappen - 2010-2011 8-6-2012 - Pagina 69 van 76
Aanbevolen voorkennis<br />
Deelnemers aan dit college dienen bij voorkeur organische chemie te<br />
hebben gevolgd.<br />
Statistiek<br />
Vakcode X_420223 (420223)<br />
Periode Periode 1+2<br />
Credits 6.0<br />
Voertaal Nederlands<br />
Faculteit Faculteit der Exacte Wetenschappen<br />
Coördinator dr. C.M. Quant<br />
Docent(en) dr. C.M. Quant<br />
Lesmethode(n) Hoorcollege, Werkcollege<br />
Onderwijsvorm<br />
Hoorcollege, werkcollege en computerpracticum.<br />
Doelgroep<br />
2SBI en 2F<br />
Structuurbiologie<br />
Vakcode X_430080 (430080)<br />
Periode Periode 1<br />
Credits 6.0<br />
Voertaal Nederlands<br />
Faculteit Faculteit der Exacte Wetenschappen<br />
Coördinator dr. D.P. Geerke<br />
Docent(en) dr. D.P. Geerke<br />
Lesmethode(n) Hoorcollege<br />
Doel vak<br />
Het verkrijgen van inzicht in de moleculaire elementen die de basis<br />
vormen van de structuur en functie van biomoleculen. Tevens, het opdoen<br />
van kennis over de methoden die gebruikt worden om de structuur en<br />
functie van eiwitten te analyseren.<br />
Onderwijsvorm<br />
Hoorcolleges, zelfstudie, opdrachten.<br />
Literatuur<br />
Branden, C., and Tooze, J., Introduction to Protein Structure, Garland,<br />
1999.<br />
Studie en loopbaan<br />
Vakcode X_000018 ()<br />
Periode Periode 1, Periode 5<br />
Credits 0.0<br />
Voertaal Nederlands<br />
<strong>Vrije</strong> <strong>Universiteit</strong> <strong>Amsterdam</strong> - Faculteit der Exacte Wetenschappen - B <strong>Farmaceutische</strong> Wetenschappen - 2010-2011 8-6-2012 - Pagina 70 van 76
Faculteit Faculteit der Exacte Wetenschappen<br />
Coördinator drs. M. Touwen<br />
Lesmethode(n) Hoorcollege<br />
Overige informatie<br />
In periode 1 voor 3F en 3S, in periode 5 voor 2F en 2S.<br />
Synthese practicum<br />
Vakcode X_435192 (435192)<br />
Periode Periode 2, Periode 3<br />
Credits 6.0<br />
Voertaal Nederlands<br />
Faculteit Faculteit der Exacte Wetenschappen<br />
Coördinator dr. J.C. Slootweg<br />
Docent(en) dr. J.C. Slootweg<br />
Lesmethode(n) Hoorcollege, Practicum<br />
Doel vak<br />
Het doel van het practicum is de student vaardigheid bij te brengen in<br />
de preparatieve organische en (in mindere mate) anorganische chemie,<br />
alsook een beeld te geven hoe de (an)organisch chemicus zijn<br />
experimentele resultaten verkrijgt.<br />
Inhoud vak<br />
Tijdens dit practicum ligt aanvankelijk het accent op het aanleren van<br />
een aantal basale isolatie- en zuiveringstechnieken zoals<br />
kristalliseren, destilleren, sublimeren, extraheren, chromatografie<br />
(GLC, kolomchromatografie). Deze technieken worden geleerd tijdens een<br />
aantal eenstapssyntheses, die tevens de collegestof illustreren. De<br />
syntheses worden deels op macroschaal (2-10 g) en deels op microschaal<br />
(50-100 mg) uitgevoerd. In de eerste periode wordt tevens het<br />
werkcollege spectroscopische technieken gegeven, ten behoeve van de<br />
interpretatie van de in de loop van het practicum op te nemen IR, UV,<br />
NMR, en ook massaspectra. Later worden enkele meerstapssyntheses<br />
uitgevoerd, waarbij het van belang is elk tussenproduct goed te<br />
zuiveren en te karakteriseren. De meeste experimenten kennen een<br />
'probleem-oplossende' aanpak, waarbij aandacht wordt besteed aan<br />
onderzoeksmethodiek.<br />
Onderwijsvorm<br />
De student werkt individueel binnen een groep o.l.v. een assistent.<br />
Literatuur<br />
Lehman, J.W., Multiscale Operational Organic Chemistry 2nd ed, New<br />
Jersey: Prentice Hall, 2009.<br />
Aanbevolen voorkennis<br />
Organische chemie 1 en 2.<br />
Doelgroep<br />
2S, 2F<br />
Thermodynamics<br />
<strong>Vrije</strong> <strong>Universiteit</strong> <strong>Amsterdam</strong> - Faculteit der Exacte Wetenschappen - B <strong>Farmaceutische</strong> Wetenschappen - 2010-2011 8-6-2012 - Pagina 71 van 76
Vakcode X_430513 (430513)<br />
Periode Periode 2<br />
Credits 3.0<br />
Voertaal Nederlands<br />
Faculteit Faculteit der Exacte Wetenschappen<br />
Coördinator dr. G. van der Zwan<br />
Docent(en) dr. G. van der Zwan<br />
Lesmethode(n) Hoorcollege, Werkcollege<br />
Doel vak<br />
Leren toepassen van thermodynamica op chemische processen.<br />
Inhoud vak<br />
Het eerste deel van het college zal bestaan uit het bestuderen van<br />
warmte en arbeid, de afleiding van de grootheid entropie en het bepalen<br />
van de richting van spontane processen. Nieuwe grootheden als enthalpie<br />
en vrije energie zullen worden ingevoerd, en de toepassing van de twee<br />
hoofdwetten van de thermodynamica (je kan geen energie uit niets maken,<br />
en warmte stroomt spontaan van warm naar koud) op chemische processen<br />
zal vervolgens aan de orde komen.<br />
Chemisch evenwicht, en effecten van druk en temperatuur daarop kunnen<br />
dan effectief worden bestudeerd. Toepassing van de thermodynamica op<br />
redox reacties, de wet van Nernst en de electrochemische cel vormen het<br />
laatste onderdeel van dit college.<br />
Onderwijsvorm<br />
Hoor- en werkcolleges.<br />
Literatuur<br />
Wordt nader bekendgemaakt.<br />
Van atoom tot (bio)molecuul<br />
Vakcode X_430580 ()<br />
Credits 6.0<br />
Voertaal Nederlands<br />
Faculteit Faculteit der Exacte Wetenschappen<br />
Coördinator prof. dr. F. Bickelhaupt<br />
Doel vak<br />
Dit vak beoogt de bouwstenen aan te dragen waarop alle chemische<br />
disciplines rusten en zodoende een solide fundament voor de gehele<br />
hierop volgende studie te leggen. Tegelijkertijd wordt ernaar gestreefd<br />
de scheikunde in de context van andere natuur<strong>wetenschappen</strong> te plaatsen<br />
(thema "Van Atoom tot Biomolecuul") alsmede haar relevantie voor het<br />
verschijnsel leven duidelijk te maken (thema "Levende Chemie").<br />
Inhoud vak<br />
Chemie is de wetenschap van stoffen, hun structuur en eigenschappen, en<br />
met name hun omzetting via chemische reacties. Binnen de<br />
natuur<strong>wetenschappen</strong> neemt de chemie een centrale plaats in en heeft vele<br />
raakvlakken met de andere disciplines, van de fysica tot en met de<br />
biologie.<br />
<strong>Vrije</strong> <strong>Universiteit</strong> <strong>Amsterdam</strong> - Faculteit der Exacte Wetenschappen - B <strong>Farmaceutische</strong> Wetenschappen - 2010-2011 8-6-2012 - Pagina 72 van 76
Binnen het thema "Van Atoom tot Biomolecuul" (periode 1) wordt het<br />
multidisciplinaire karakter geaccentueerd door het behandelen van<br />
fundamentele scheikundige begrippen die relevant zijn in de context van<br />
de verschillende natuur<strong>wetenschappen</strong>. In dit kader zullen o.a. aan bod<br />
komen: “evenwichten”, “pH berekeningen”, “oplosbaarheid”,<br />
“oxidatietoestand” en “redoxchemie”.<br />
Bij de overgang naar het thema "Levende Chemie" (periode 2) verschuift<br />
het zwaartepunt van het vak "Van Atoom tot Biomolecuul" naar complexere<br />
aspecten van de scheikunde, beginnend bij de fysische en anorganische<br />
chemie via de (metaal)organische chemie tot aan de biologische chemie.<br />
De volgende onderwerpen worden in dit kader behandeld: "alles is<br />
chemie", "atomen en het periodieke systeem", "moleculaire structuur",<br />
"electronische structuur en chemische binding", "chemische reacties",<br />
"thermodynamica", "kinetiek", "inleiding organische chemie", "inleiding<br />
biochemie", "zelf gegevens opzoeken in de chemische literatuur".<br />
Onderwijsvorm<br />
De cursus bestaat uit een hoorcollege en een werkcollege.<br />
Toetsvorm<br />
tentamen<br />
Literatuur<br />
Steven S. Zumdahl, Chemical Principles, 6th Ed., Houghton Mifflin<br />
Company: Boston, New York, 2009<br />
Doelgroep<br />
1F, 1S, 3-SBI, mi-Sc, mi-BI<br />
Overige informatie<br />
Voor studenten 1S: Het met een voldoende afronden van het vak Van atoom<br />
tot (bio)molecuul is alleen dan mogelijk, indien de onderdelen van<br />
Tutoraat SK 1A naar behoren zijn afgerond.<br />
Deze slagingseis geldt alleen voor 1S, niet voorde andere doelgroepen.<br />
Van molecuul tot medicijn<br />
Vakcode X_430581 ()<br />
Credits 3.0<br />
Voertaal Nederlands<br />
Faculteit Faculteit der Exacte Wetenschappen<br />
Coördinator dr. I.J.P. de Esch<br />
Doel vak<br />
Dit vak geeft inzicht in de manieren waarop biologisch actieve moleculen<br />
gevonden worden en hoe ze ontwikkeld worden tot medicijnen.<br />
Inhoud vak<br />
Er wordt aandacht besteed aan strategieën om de activiteit van<br />
biologische targets (receptor, enzym of transporteiwit) te beïnvloeden<br />
met geneesmiddelmoleculen. Daarbij zullen moleculaire herkenning, het<br />
screenen van grote stoffenbibliotheken en rationele ontwerpmethodiek,<br />
alsmede de relatie tussen de chemische structuur en de biologische<br />
activiteit (SAR) aan de orde komen. Ook wordt aandacht besteed aan<br />
diagnostiek en therapie, bijvoorbeeld door moleculen te binden aan een<br />
specifiek biologisch target waardoor de werking van het biomolecuul<br />
<strong>Vrije</strong> <strong>Universiteit</strong> <strong>Amsterdam</strong> - Faculteit der Exacte Wetenschappen - B <strong>Farmaceutische</strong> Wetenschappen - 2010-2011 8-6-2012 - Pagina 73 van 76
estudeerd kan worden. Verschillende imaging technieken die gebruikt<br />
worden om targets zichtbaar te maken, zullen worden besproken aan de<br />
hand van cases uit de praktijk. Er zal een bezoek gebracht worden aan de<br />
betrokken centra van het VU Medisch Centrum. Bij de kostbare<br />
ontwikkeling van deze medicijnen en diagnostica is het essentieel om het<br />
intellectueel eigendom (IP) te beschermen teneinde de enorme research<br />
investeringen te kunnen terugverdienen. We zullen dan ook nadrukkelijk<br />
aandacht besteden aan de rol en aanpak van patenten. Tot slot moeten de<br />
medicijnen voor klinische testen en marktintroductie op grote schaal<br />
worden gesynthetiseerd met behulp van proceschemie. De hiermee gepaard<br />
gaande uitdagingen, bekende hordes in de race van molecuul tot medicijn,<br />
zullen worden behandeld.<br />
Onderwijsvorm<br />
Hoorcolleges, werkcollege (gebruik CD Roms, opdrachten), bezoek aan<br />
centra op de VU voor Diagnostiek & Therapie en zelfstudie.<br />
Toetsvorm<br />
Web-tussentoetsen<br />
Schriftelijk tentamen<br />
Literatuur<br />
Patrick, G., An Introduction to Medicinal Chemistry 4th ed.<br />
Oxford: Oxford University Press. 2009, ISBN: 0199234477<br />
Handouts<br />
Aanbevolen voorkennis<br />
Van Atoom tot Biomolecuul<br />
Van Gen tot Geneesmiddel<br />
Innovatieproject Geneesmiddelen<br />
Doelgroep<br />
1F, 2-SBI<br />
Veiligheidsinstructie S, F, MNW en SBI 30min<br />
Vakcode X_000019 ()<br />
Periode Periode 1<br />
Credits 0.0<br />
Voertaal Nederlands<br />
Faculteit Faculteit der Exacte Wetenschappen<br />
Voorlichting door studentendecanen en CSL<br />
Vakcode X_000007 ()<br />
Credits 0.0<br />
Voertaal Nederlands<br />
Faculteit Faculteit der Exacte Wetenschappen<br />
Wetenschapscommunicatie voor Bèta-onderzoekers<br />
Vakcode AB_470185 (450003)<br />
Periode Periode 4<br />
<strong>Vrije</strong> <strong>Universiteit</strong> <strong>Amsterdam</strong> - Faculteit der Exacte Wetenschappen - B <strong>Farmaceutische</strong> Wetenschappen - 2010-2011 8-6-2012 - Pagina 74 van 76
Credits 6.0<br />
Voertaal Engels<br />
Faculteit Fac. der Aard- en Levens<strong>wetenschappen</strong><br />
Coördinator R.C. van Koten MSc<br />
Docent(en) prof. dr. J.E.W. Broerse, R.C. van Koten MSc, dr. M.J.W.<br />
Bos<br />
Lesmethode(n) Hoorcollege, Werkgroep<br />
Doel vak<br />
Verwerven van kennis en inzicht in de verschillende modellen van<br />
wetenschapscommunicatie (deficiet, context, interactie en<br />
participatie), haar parameters en gebruikelijke applicatiedomeinen.<br />
Verwerven van kennis en inzicht van de beperkingen en mogelijkheden<br />
van de verschillende media waarin de modellen tot uitdrukking kunnen<br />
komen (journalistiek, TV en film, het Internet, musea en science<br />
centra).<br />
Verkrijgen van vaardigheid in het ontwerpen van een doelgroepgerichte<br />
communicatie<br />
Het opdoen van leerervaring met het werken in een multidisciplinaire<br />
groep<br />
Inhoud vak<br />
Wetenschap heeft verstrekkende gevolgen voor de maatschappij (bv. ICT,<br />
biotechnologie, nanotechnologie, farmacie). Maar hoe kijkt de<br />
maatschappij eigenlijk naar wetenschappelijke ontwikkelingen? Wat vindt<br />
de industrie van wat we uitgevonden hebben en wat denken andere<br />
wetenschappers van onze kennis? De visie van deze mensen over ons en<br />
ons werk is van groot belang voor de richting die het onderzoek in de<br />
nabije toekomst gaat nemen.<br />
Daarom is communicatie over wetenschap van cruciaal belang. In deze<br />
cursus raak je vertrouwt met een aantal modellen van<br />
wetenschapscommunicatie, het herkennen van hun toepassingen in de<br />
praktijk en de verschillende soorten publiek die men ermee kan<br />
aanspreken (populariseren voor leken, informatieoverdracht voor de<br />
industrie, faciliteren van interdisciplinair onderzoek in de<br />
wetenschap). Door middel van opdrachten raak je bekend met de<br />
praktische kant van wetenschapscommunicatie, bijvoorbeeld<br />
wetenschapsjournalistiek, voorlichting, etc. De opdrachten worden deels<br />
individueel uitgevoerd en deels in een multidisciplinaire groep.<br />
Onderwijsvorm<br />
Colleges, opdracht, zelfstudie<br />
Literatuur<br />
(Online) syllabus<br />
Doelgroep<br />
Keuzecursus voor derdejaars <strong>BSc</strong> Biomedische Wetenschappen en Biologie.<br />
Speciaal aanbevolen voor studenten die overwegen de C- variant<br />
(wetenschapscommunicatie) in hun masterprogramma op te nemen.<br />
Overige informatie<br />
Voor meer informatie: reinout.van.koten@falw.vu.nl<br />
Why Chemical Reactions Happen<br />
<strong>Vrije</strong> <strong>Universiteit</strong> <strong>Amsterdam</strong> - Faculteit der Exacte Wetenschappen - B <strong>Farmaceutische</strong> Wetenschappen - 2010-2011 8-6-2012 - Pagina 75 van 76
Vakcode X_435088 (435088)<br />
Periode Periode 4<br />
Credits 3.0<br />
Voertaal Nederlands<br />
Faculteit Faculteit der Exacte Wetenschappen<br />
Coördinator prof. dr. C. Gooijer<br />
Docent(en) prof. dr. C. Gooijer, prof. dr. K. Lammertsma<br />
Lesmethode(n) Hoorcollege<br />
Doel vak<br />
Het doel van het college is - in nauwe aansluiting met het voorafgaande<br />
college Chemische Binding - nader in te gaan op de quantummechanische<br />
beschrijving van moleculen en de basis te leggen voor de beantwoording<br />
van de vraag waarom en wanneer chemische reacties plaatsvinden. Veel<br />
aandacht wordt besteed aan evenwichtsconstanten in relatie tot de<br />
tweede hoofdwet van de thermodynamice.<br />
Inhoud vak<br />
Molecular orbitals voor homo- en hetero-tweeatomige moleculen;<br />
elektronenverdeling in grotere moleculen; een aantal basale chemische<br />
reacties; chemische evenwichten; reactiesnelheden; binding in<br />
geconjugeerde systemen.<br />
Onderwijsvorm<br />
Gecombineerd hoorcollege en werkcollege<br />
Literatuur<br />
Keeler, J., and Wothers, P., Why Chemical Reactions Happen, New York:<br />
Oxford University Press, 2003 (ISBN 0-19-924-9733).<br />
Doelgroep<br />
1S, 1F<br />
Wijsgerige vorming: natuur<strong>wetenschappen</strong>, filosofie en ethiek<br />
Vakcode X_435340 (435340)<br />
Periode Periode 1<br />
Credits 3.0<br />
Voertaal Nederlands<br />
Faculteit Faculteit der Exacte Wetenschappen<br />
Coördinator dr. G.C. Eigner<br />
Lesmethode(n) Hoorcollege, Werkcollege<br />
Literatuur<br />
Horsten, L. Douven, I. en Weber, E., Wetenschapsfilosofie. Assen: Van<br />
Gorcum, 2007.<br />
<strong>Vrije</strong> <strong>Universiteit</strong> <strong>Amsterdam</strong> - Faculteit der Exacte Wetenschappen - B <strong>Farmaceutische</strong> Wetenschappen - 2010-2011 8-6-2012 - Pagina 76 van 76