29.09.2013 Views

Evolution del 2 - Jessica K. Abbott

Evolution del 2 - Jessica K. Abbott

Evolution del 2 - Jessica K. Abbott

SHOW MORE
SHOW LESS

You also want an ePaper? Increase the reach of your titles

YUMPU automatically turns print PDFs into web optimized ePapers that Google loves.

<strong>Evolution</strong>, <strong>del</strong> 2:<br />

<strong>Evolution</strong>sprocesser och<br />

förändringar i det<br />

genetiska materialet<br />

<strong>Jessica</strong> <strong>Abbott</strong><br />

Forskare<br />

<strong>Evolution</strong>är Ekologi


Naturlig selektion<br />

• Alleler som ger bättre överlevnad och/eller<br />

reproduktionsförmåga ökar i frekvens<br />

Generation 1:<br />

16 individer<br />

•8 blå, 8 grön<br />

Parning Generation 2:<br />

16 individer<br />

•4 blå, 12 grön


Fixering<br />

• All evolution är allelsubstitutioner


Typer av mutationer<br />

• Punktmutation


Typer av mutationer<br />

• Punktmutation: sickle cell anemi


Typer av mutationer<br />

• Frameshift


Typer av mutationer<br />

• Frameshift: Huntingtons sjukdom


Typer av mutationer<br />

• Invertering


Typer av mutationer<br />

• Invertering: In(3R)Payne<br />

mel<br />

sub


Typer av mutationer<br />

• Duplicering


Typer av mutationer<br />

• Duplicering: globiner


Rekombination<br />

• Leder till snabbare evolution


Rekombination<br />

• Utnyttjar den stående genetiska variansen


Rekombination<br />

• Utnyttjar den stående genetiska variansen<br />

• Olika vägar till samma fenotyp


Horisontell genöverföring<br />

• ~17% horisontellt överförda gener hos E.<br />

coli


Horisontell genöverföring<br />

• ~17% horisontellt överförda gener hos E.<br />

coli<br />

• Antibiotikaresistens


Horisontell genöverföring<br />

• ~17% horisontellt överförda gener hos E.<br />

coli<br />

• Antibiotikaresistens<br />

• Biodegradaderingsprocesser


Horisontell genöverföring<br />

• ~17% horisontellt överförda gener hos E.<br />

coli<br />

• Antibiotikaresistens<br />

• Biodegradaderingsprocesser<br />

• Pathogenicitet


Horisontell genöverföring<br />

• ~17% horisontellt överförda gener hos E.<br />

coli<br />

• Antibiotikaresistens<br />

• Biodegradaderingsprocesser<br />

• Pathogenicitet<br />

• Överlevnad i extrema miljöer


Mutationstakten<br />

• Varierar mellan organismer


Mutationstakten<br />

• Substitutionstakt ≠ mutationstakt


Vanliga mutationer<br />

• Melanism eller albinism


Vanliga mutationer<br />

• Melanism eller albinism<br />

• Delade blad


Naturlig selektion<br />

• Överlevnad: undvika predatorer, bättre på<br />

att hitta mat, osv.


Sexuell selektion<br />

• Reproduktionsförmåga: hitta en partner,<br />

befruktningsförmåga, osv.


Fitness<br />

• Fitness = överlevnadsförmåga +<br />

reproduktionsförmåga (gen eller individ)<br />

• Antal avkommor producerad under hela<br />

livstiden


Adaptivt landskap<br />

• Vilka kombinationer av egenskaper ger<br />

högst fitness?


Riktad selektion<br />

• Resulterar i ändrat me<strong>del</strong>värde<br />

Fitness<br />

Egenskap


Riktad selektion


Riktad selektion


Stabiliserande selektion<br />

• Resulterar i minskning av variansen<br />

Fitness<br />

Egenskap


Stabiliserande selektion


Stabiliserande selektion


Divergent selektion<br />

• Resulterar i ökning av variansen<br />

Fitness<br />

Egenskap


Divergent selektion


Divergent selektion


Frekvensberoende selektion<br />

• Fitness är beroende av frekvensen i<br />

populationen<br />

Frequency<br />

1.0<br />

0.8<br />

0.6<br />

0.4<br />

0.2<br />

0.0<br />

0 2 4 6 8 10 12<br />

Time


Frekvensberoende selektion


Frekvensberoende selektion


Korrelerad selektion<br />

• Selektion på kombinationer av egenskaper


Korrelerad selektion


Korrelerad selektion


Neutral evolution<br />

• Genetisk drift


Neutral evolution<br />

• Grundareffekten


Neutral evolution<br />

• Grundareffekten<br />

• Flaskhalsar


Neutral evolution<br />

• Selektivt neutrala mutationer


Principer: neutral evolution<br />

• Motoo Kimura<br />

• Substitutionsfrekvensen är konstant (0.5-<br />

1% / miljon år i däggdjurens mtDNA)


Principer: neutral evolution<br />

• Neutrala mutationer fixeras oftare än<br />

skadliga mutationer


Principer: neutral evolution<br />

• Genduplicering går före evolution av nya<br />

funktioner


Principer: neutral evolution<br />

• Positiv selektion leder sällan till fixering<br />

jämfört med neutral evolution


Principer: neutral evolution<br />

• ”Viktiga” sekvenser förändras<br />

långsammare än ”oviktiga”


Fylogenetisk information<br />

• Den molekylära klockan


Fylogenetisk information<br />

• Homologa gener<br />

• Paraloger = inom<br />

samma art<br />

• Ortologer = hos<br />

olika arter


Metoder<br />

• Cytogenetiska analyser


Metoder<br />

• Immunologiska metoder


Metoder<br />

• Sekvenser av aminosyror


Metoder<br />

• DNA-hybridisering


Metoder<br />

• Restriktionskartor


Metoder<br />

• DNA-sekvensering


Sammanfattning<br />

• All evolution = allelsubstitutioner<br />

• Naturlig selektion = skillnader i överlevnad<br />

• Sexuell selektion = skillnader i reproduktion<br />

• Neutral evolution = fixering drivs av slumpen

Hooray! Your file is uploaded and ready to be published.

Saved successfully!

Ooh no, something went wrong!