P10607119-8 A2 - Questel
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(21)<strong>P10607119</strong>-8 <strong>A2</strong><br />
(22) Data de Depósito: 01/02/2006<br />
(43) Data da Publicação: 11/08/2009<br />
(RPI 2014)<br />
sitio poilA<br />
região rI3-glob Pa<br />
Remanescente ligador misc<br />
HI3Ver,<br />
BspI201 (3694)<br />
pUC19<br />
1, II II II 111,11,11911 A111<br />
(51) Int.CI.:<br />
A61 K 39/245 (2009.01)<br />
A61 K 39/145 (2009.01)<br />
A61 K 39/39 (2009.01)<br />
A61 K 9/16 (2009.01)<br />
C12N 15/85 (2009.01)<br />
C12N 15/44 (2009.01)<br />
C12N 15/38 (2009.01)<br />
C12N 15/31 (2009.01)<br />
C12N 15/36 (2009.01)<br />
(54) Título: CONSTRUÇÃO DE ÁCIDO NUCLEICO, (57) Resumo: CONSTRUÇÃO DE ÁCIDO NUCLEICO, POPULAÇÃO<br />
POPULAÇÃO DE CONSTRUÇÕES DE ÁCIDO<br />
DE CONSTRUÇÕES DE ÁCIDO NIJCLEICO, SEQUENCIA<br />
NUCLEICO, SEQÜÊNCIA PROMOTORA QUIMÉRICA<br />
ISOLADA PURIFICADA, PARTÍCULAS REVESTIDAS,<br />
RECEPTÁCULO DE DOSAGEM PARA UM<br />
PROMOTORA QUIMÉRICA ISOLADA PURIFICADA, PARTÍCULAS<br />
REVESTIDAS, RECEPTÁCULO DE DOSAGEM PARA UM<br />
DISPOSITIVO DE LIBERAÇÃO MEDIADA POR PARTÍCULA,<br />
DISPOSITIVO DE LIBERAÇÃO MEDIADA POR PARTÍCULA,<br />
DISPOSITIVO DE LIBERAÇÃO MEDIADA POR<br />
COMPOSIÇÃO FARMACÊUTICA, COMPOSIÇÃO DE VACINA, E,<br />
PARTÍCULA, DISPOSITIVO DE LIBERAÇÃO MEDIADA<br />
POR PARTÍCULA, COMPOSIÇÃO FARMACÊUTICA,<br />
COMPOSIÇÃO DE VACINA, E, MÉTODO IN VITRO DE<br />
MÉTODO IN VITRO DE OBTER A EXPRESSAO EM CÉLULAS DE<br />
MAMÍFERO DE UM POLIPEPTÍDEO DA INFLUENZA DE INTERESSE.<br />
Uma construção de ácido nucleico que compreende uma seqüência<br />
promotora quimérica e um sítio de clonagem para a inserção de uma<br />
OBTER A EXPRESSÃO EM CÉLULAS DE MAMÍFERO seqüência codificadora em ligação operável com o promotor quimérico,<br />
DE UM POLIPEPTÍDEO DA INFLUENZA DE<br />
INTERESSE<br />
em que a seqUência promotora quimérica compreende: (a) uma<br />
seqUência promotora inicial imediata de hCMV; (b) exon 1 e pelo menos<br />
uma parte do exon 2 do gene inicial imediato maior de hCMV; e (c) um<br />
íntron heterólogo fornecido no lugar da região de íntron A do gene inicial<br />
(30) Prioridade Union ista: 20/04/2005 GB 0507997.5, 01/02/2005<br />
US 60/648,382, 19/04/2005 US 60/672,497<br />
imediato maior de hCMV.<br />
(73) Titular(es): Powderject Vaccines, Inc.<br />
(72) Inventor(es): James Fuller<br />
(74) Procurador(es): Momsen, Leonardos & CIA.<br />
(86) Pedido Internacional: PCT GB2006000344 de 01/02/2006<br />
(87) Publicação Internacional: WO 2006/082398de 10/08/2006<br />
H3 HA CDS<br />
1,903. remanescentes de caLICCK<br />
KenR (Tn9031<br />
,903, remanescentes de pUr.41(<br />
Remanescente Pucl9 MCS<br />
CMV Pra<br />
GMV Exonla<br />
Fusão Etam/Bgl<br />
íntron A de Insulina de rato<br />
5'-UTR de FIFIV pré S2<br />
ATG-Nhe<br />
fiel (1989)
1<br />
Pr. o 6 o }1 19-'g<br />
"CONSTRUÇÃO DE ÁCIDO NUCLEICO, PARTÍCULAS<br />
CARREADORAS, RECEPTÁCULO DE DOSAGEM PARA UM<br />
DISPOSITIVO DE LIBERAÇÃO MEDIADA POR PARTÍCULA,<br />
DISPOSITIVO DE LIBERAÇÃO MEDIADA POR PARTÍCULA,<br />
5 POPULAÇÃO DE CONSTRUÇÕES DE ÁCIDO NUCLEICO,<br />
SEQÜÊNCIA PROMOTORA QUIMÉRICA ISOLADA PURIFICADA,<br />
PARTÍCULAS REVESTIDAS, COMPOSIÇÃO FARMACÊUTICA,<br />
COMPOSIÇÃO DE VACINA, USO DE UMA CONSTRUÇÃO DE ÁCIDO<br />
NUCLEICO, DE UMA POPULAÇÃO DE CONSTRUÇÕES DE ÁCIDO<br />
10 NUCLEICO OU DE PARTÍCULAS REVESTIDAS, E, MÉTODO IN VITRO<br />
DE OBTER A EXPRESSÃO EM CÉLULAS DE MAMÍFERO DE UM<br />
POLIPEPTÍDEO DA INFLUENZA DE INTERESSE"<br />
Campo da Invenção<br />
A invenção diz respeito aos campos da biologia molecular e<br />
15 imunologia e no geral aos reagentes úteis nas técnicas de imunização de ácido<br />
nucleico. Mais especificamente, a invenção diz respeito a. construções de<br />
ácido nucleico para a expressão de polipeptídeos e em particular polipeptídeos<br />
antigênicos, particularmente antígenos da influenza bem como a expressão de<br />
polipeptídeos adjuvantes e às estratégias de imunização com ácido nucleico<br />
20 usando tais reagentes.<br />
Fundamentos da invenção<br />
A terapia de gene e imunização com ácido nucleico são<br />
métodos promissores para o tratamento e prevenção de doenças tanto<br />
adquiridas quanto herdadas. Estas técnicas fornecem a transferência de um<br />
25 ácido nucleico desejado em um indivíduo com a expressão in vivo<br />
subseqüente. A transferência pode ser realizada pela transfecção das células<br />
ou tecidos do indivíduo ex vivo e reintroduzir o material transformado no<br />
hospedeiro. Alternativamente, o ácido nucleico pode ser administrado in vivo<br />
diretamente ao receptor.
2<br />
Cada uma destas técnicas requer a expressão eficiente do ácido<br />
nucleico na célula transfectada, para fornecer uma quantidade suficiente do<br />
produto de gene terapêutico ou antigênico. Diversos fatores são conhecidos<br />
afetar os níveis de expressão obtidos, incluindo a eficiência de transcrição, e a<br />
5 eficiência com que o gene ou a seqüência de interesse é transcrita e o mRNA<br />
traduzido.<br />
Vários sistemas de expressão foram descritos na técnica, cada<br />
um dos quais tipicamente consiste de um vetor contendo um gene ou<br />
seqüência de nucleotídeo de interesse operavelmente ligada às seqüências de<br />
10 controle de expressão. Estas seqüências de controle incluem seqüências<br />
promotoras transcricionais e seqüências início e terminação transcricionais.<br />
Os promotores habitualmente usado para sistemas de expressão de célula de<br />
mamífero incluem o promotor inicial SV40, um promotor de citomegalovírus<br />
(CMV) tal como o promotor inicial imediato de CMV (Chapman et al (1991)<br />
15 Nucl. Acids Res. 19: 3979-3986), o promotor de repetição de terminal longo<br />
(LTR) do vírus do tumor mamário de camundongo, o promotor tardio maior<br />
de adenovírus (Ad MLP) e o promotor do vírus simples do herpes (HSV),<br />
entre outros. Os promotores não virais, tais como um promotor derivado do<br />
gene da metalotioneína de murino também são habitualmente usados.<br />
20 Os sistemas de expressão freqüentemente incluem elementos<br />
moduladores transcricionais, aludidos como "realçadores". Os realçadores são<br />
amplamente definidos como um agente que atua em cis, que quando<br />
operavelmente ligado a uma seqüência de promotor/ gene, aumentará a<br />
transcrição desta seqüência de gene. Os realçadores podem funcionar a partir<br />
25 de posições que estão muito mais longe de uma seqüência de interesse do que<br />
outros elementos de controle de expressão (por exemplo, promotores), e<br />
podem operar quando posicionados em cada orientação relativa à seqüência<br />
de interesse (Banerji et al. (1981) Cell 27: 299-308, deVilleirs et al. (1981)<br />
Nucl. Acids Res 9: 6251-6264). Os realçadores foram identificados a partir de
3<br />
várias fontes virais, incluindo o vírus do polioma, vírus BK, citomegalovírus<br />
(CMV), adenovírus, vírus símio 40 (SV40), vírus do sarcoma -de Moloney,<br />
vírus do papiloma bovino e vírus do sarcoma de Rous (deVilleirs et al supra,<br />
Rosenthal et al. (1983) Science 222: 749-755, Hearing et al. (1983) Cell 33:<br />
5 695-703, Weeks et al. (1983) Mol. Cell. Biol. 3: 1222-1234, Levinson et al.<br />
(1982) Nature 295: 568-572, e Luciw et al. (1983) Cell 33: 705-716).<br />
Vários sistemas de expressão para a imunização com ácido<br />
nucleico e terapia de gene fazem uso do promotor inicial imediato do hCMV.<br />
Ver por exemplo, as Patentes US 5168062 e 5385839 concedidas a<br />
10 Stinski, e Relatório Descritivo de Patente EP 0323997 B 1. Os vetores de<br />
expressão usando o promotor inicial imediato do hCMV incluem por<br />
exemplo, pWRG7128 (Roy et al, Vaccine 19, 764-778, 2001), e pBC12/CMV<br />
e pJW4303 que são mencionados na WO 95/20660. Chapman et al (1991)<br />
supra relatam níveis reduzidos de expressão do promotor inicial imediato do<br />
15 hCMV na ausência de hCMV Intron A.<br />
Sumário da invenção<br />
Uma construção de ácido nucleico foi desenvolvido usando<br />
seqüências de promotor/expressão viral manipulados que fornece expressão<br />
realçada de seqüências codificadoras heterólogas em células hospedeiras. A<br />
20 construção é adequada para a expressão eficiente de genes e em particular<br />
genes que codificam antígeno, e portanto podem ser usados na imunização<br />
com ácido nucleico. A construção também pode ser usada para expressar<br />
polipeptídeos adjuvantes. A construção pode ser fornecida em partículas<br />
carreadoras, para o uso na imunização mediada por partícula com ácido<br />
25 nucleico. Em uma forma de realização especialmente preferida da invenção a<br />
construção codifica um antígeno da influenza, fragmento imunogênico deste<br />
ou uma variante imunogênica de cada um. Em uma outra forma de realização<br />
especialmente preferida a construção codifica um polipeptídeo adjuvante.<br />
Conseqüentemente, presente invenção fornece uma
4<br />
construção de ácido nucleico adequada para a liberação a um indivíduo para<br />
induzir uma resposta imune contra o antígeno de hemaglutinina (HA) do vírus<br />
da influenza, construção esta que compreende:<br />
(i) um seqüência promotora quimérica que compreende:<br />
5 (a) uma seqüência promotora inicial imediata de hCMV;<br />
imediato maior de hCMV; e<br />
(b) exon 1 e pelo menos uma parte do exon 2 do gene inicial<br />
(c) um intron heterólogo fornecido no lugar da região de intron<br />
A do gene inicial imediato maior de hCMV;<br />
10 (ii) uma seqüência codificadora em ligação operável com o<br />
promotor quimérico, onde a seqüência codificadora codifica um antígeno de<br />
hemaglutinina (HA) do vírus da influenza, um fragmento imunogênico deste<br />
ou uma variante imunogênica do dito antígeno ou fragmento tendo pelo<br />
menos 80% de homologia de aminoácido ao dito antígeno ou fragmento;<br />
15 (iii) uma seqüência líder não traduzida que é derivada da<br />
seqüência de antígeno HBVpreS2, seqüência de antígeno e de HBV ou<br />
seqüência de antígeno tipo 2gD de HSV e que está em ligação operável com o<br />
promotor quimérico; e<br />
(iv) uma seqüência realçadora que é derivada de uma região 3'<br />
20 não traduzida (UTR) de uma seqüência do HBsAg ou de uma seqüência de<br />
gene inicial imediata de CMV símio, que está em ligação operável com o<br />
promotor quimérico e que está a jusante da seqüência codificadora.<br />
A presente invenção também fornece uma construção de ácido<br />
nucleico adequada para a liberação a um indivíduo para induzir uma resposta<br />
25 imune contra antígeno de hemaglutinina (HA) do vírus da influenza,<br />
construção esta que compreende:<br />
(i) uma seqüência promotora quimérica que compreende:<br />
(a) uma seqüência promotora inicial imediata de hCMV;<br />
(b) exon 1 e pelo menos uma parte do exon 2 do gene inicial
imediato maior de hCMV; e<br />
5<br />
(c) um intron heterólogo fornecido no lugar da região de intron<br />
A do gene inicial imediato maior de hCMV; e<br />
(ii) uma seqüência codificadora em ligação operável com o<br />
5 promotor quimérico, onde a seqüência codificadora codifica um antígeno de<br />
hemaglutinina (HA) do vírus da influenza, um fragmento imunogênico deste<br />
ou uma variante imunogênica do dito antígeno ou fragmento tendo pelo<br />
menos 80% de homologia de aminoácido ao dito antígeno ou fragmento.<br />
Além disso, a presente invenção fornece uma construção de<br />
10 ácido nucleico que compreende uma seqüência promotora quimérica e um<br />
15<br />
sítio de clonagem para a inserção de uma seqüência codificadora em ligação<br />
operável com o promotor quimérico, em que a seqüência promotora<br />
quimérica compreende:<br />
imediato maior de hCMV; e<br />
(a) uma seqüência promotora inicial imediata de hCMV;<br />
(b) exon 1 e pelo menos uma parte do exon 2 do gene inicial<br />
(c) um intron heterólogo fornecido no lugar da região do intron<br />
A do gene inicial imediato maior de hCMV.<br />
Em um exemplo preferido, a construção compreende uma<br />
20 seqüência codificadora inserida no sítio de clonagem. Assim, uma seqüência<br />
codificadora pode ser fornecida no sítio de clonagem.<br />
Em uma outra forma de realização preferida uma construção<br />
da invenção pode compreender ainda:<br />
(a) uma seqüência líder não traduzida que é derivada da<br />
25 seqüência de antígeno HBVpreS2, seqüência de antígeno e de HBV ou<br />
seqüência de antígeno tipo 2 gD do HSV e que está em ligação operável com<br />
o promotor quimérico; e/ou<br />
(b) uma seqüência realçadora que é derivada de uma região<br />
não traduzida 3' (UTR) de uma seqüência do HBsAg, ou uma UTR 3' de uma
6<br />
seqüência de gene inicial imediata de CMV símio e que está em ligação<br />
operável com o promotor quimérico, em que a seqüência realçadora está a<br />
jusante do sítio de clonagem.<br />
A invenção também fornece uma construção de ácido nucleico<br />
5 que compreende uma seqüência promotora e uma seqüência codificadora<br />
operavelmente ligada ao promotor, onde a construção compreende ainda:<br />
(a) uma seqüência líder não traduzida que é derivada da<br />
seqüência de antígeno HBVpreS2, seqüência de antígeno e de HBV ou<br />
seqüência de antígeno tipo 2gD de HSV, que está em ligação operável com a<br />
10 seqüência codificadora e promotor que é heterólogo à seqüência codificadora;<br />
e/ou<br />
(b) uma seqüência realçadora 3' da e operavelmente ligada à<br />
seqüência codificadora, onde a seqüência realçadora é derivada de uma UTR<br />
3' de uma seqüência do HBsAg ou uma UTR 3' de uma seqüência de gene<br />
15 inicial imediata de CMV símio, e a seqüência codificadora é heteróloga à<br />
20<br />
25<br />
seqüência realçadora 3'.<br />
que compreende:<br />
imediato maior de hCMV; e<br />
A invenção também fornece uma construção de ácido nucleico<br />
(i) uma seqüência promotora quimérica que compreende:<br />
(a) uma seqüência promotora inicial imediata de hCMV;<br />
(b) exon 1 e pelo menos uma parte do exon 2 do gene inicial<br />
(c) um intron heterólogo fornecido no lugar da região de intron<br />
A do gene inicial imediato maior de hCMV; e<br />
(ii) um sítio de clonagem para a inserção de uma seqüência<br />
codificadora em ligação operável com o promotor quimérico; e<br />
(iii) (a) uma seqüência líder não traduzida que é<br />
derivada da seqüência de antígeno preS2 de HBV, seqüência de antígeno e de<br />
HBV ou seqüência de antígeno tipo 2gD de HSV e que está em ligação
operável com o promotor quimérico; e/ou<br />
7<br />
(b) uma seqüência realçadora que é derivada de uma região<br />
não traduzida 3' (UTR) de uma seqüência do HBsAg, ou uma UTR 3' de uma<br />
seqüência de gene inicial imediata de CMV símio e que está em ligação<br />
5 operável com o promotor quimérico, em que a seqüência realçadora está a<br />
jusante do sítio de clonagem.<br />
que compreende:<br />
A invenção também fornece uma construção de ácido nucleico<br />
(i) uma seqüência promotora;<br />
10 (ii) uma seqüência líder não traduzida derivada da seqüência<br />
de antígeno preS2 de HBV, seqüência de antígeno e de HBV ou seqüência de<br />
antígeno tipo 2 gD do HSV; e<br />
(ii)<br />
(iii) uma seqüência codificadora operavelmente ligada a (i) e<br />
15 em que a seqüência codificadora é heteróloga à seqüência líder<br />
não traduzida.<br />
que compreende:<br />
A invenção também fornece uma construção de ácido nucleico<br />
(i) uma seqüência promotora;<br />
20 (ii) uma seqüência codificadora operavelmente ligada à<br />
seqüência promotora (i); e<br />
seqüência codificadora (ii);<br />
(iii) uma seqüência realçadora 3' da e operavelmente ligada à<br />
em que a seqüência realçadora (iii) é derivada de uma UTR 3'<br />
25 de uma seqüência do HBsAg ou uma UTR 3' de uma seqüência de gene<br />
inicial imediata de CMV símio, e a seqüência codificadora (ii) é heteróloga à<br />
seqüência realçadora 3'.<br />
A presente invenção também fornece uma construção de ácido<br />
nucleico que compreende uma seqüência promotora e uma seqüência
8<br />
codificadora operavelmente ligada ao promotor, onde a construção<br />
compreende ainda:<br />
(a) uma seqüência líder não traduzida que é derivada da<br />
seqüência de antígeno HBVpreS2, seqüência de antígeno e de HBV ou<br />
5 seqüência de antígeno tipo 2 gD do HSV, que está em ligação operável com a<br />
seqüência codificadora e promotor que é heterólogo à seqüência codificadora;<br />
e/ou<br />
(b) uma seqüência realçadora 3' da e operavelmente ligada à<br />
seqüência codificadora, onde a seqüência realçadora é derivada de uma UTR<br />
10 3' de uma seqüência do HBsAg ou uma UTR 3' de uma seqüência de gene<br />
inicial imediata de CMV símio, e a seqüência codificadora é heteróloga à<br />
seqüência realçadora 3'.<br />
A presente invenção adicionalmente fornece uma população de<br />
construções de ácido nucleico onde a população compreende pelo menos duas<br />
15 construções diferentes da invenção.<br />
em um outro exemplo, a invenção fornece uma seqüência<br />
promotora quimérica isolada purificada que compreende:<br />
20 imediato maior de hCMV; e<br />
(a) uma seqüência promotora inicial imediata de hCMV;<br />
(b) exon 1 e pelo menos uma parte do exon 2 do gene inicial<br />
(c) um intron heterólogo fornecido no lugar da região de intron<br />
A do gene inicial imediato maior de hCMV.<br />
A invenção também fornece<br />
- um método de obter a expressão em células de mamífero<br />
25 de um polipeptídeo de interesse, método este que compreende transferir para<br />
dentro das ditas células uma construção de ácido nucleico, uma população de<br />
construções de ácido nucleico ou partículas revestidas da invenção;<br />
- partículas revestidas, adequadas para a liberação a partir<br />
de um dispositivo de liberação mediada por partícula, partículas estas que
9<br />
compreendem partículas carreadoras revestidas com uma construção de ácido<br />
nucleico da invenção, a construção incluindo uma seqüência codificadora que<br />
codifica o polipeptídeo;<br />
- um receptáculo de dosagem para um dispositivo de<br />
5 liberação mediada por partícula que compreende as partículas revestidas;<br />
- um dispositivo de liberação mediada por partícula<br />
carregado com as partículas revestidas;<br />
- um método de imunização com ácido nucleico que<br />
compreende administrar a um indivíduo uma quantidade eficaz das partículas<br />
10 revestidas da invenção;<br />
- uma composição farmacêutica que compreende uma<br />
construção de ácido nucleico da invenção ou uma população de construções<br />
de ácido nucleico da invenção juntas com um carreador ou excipiente<br />
farmaceuticamente aceitáveis;<br />
15 - uma composição de vacina que compreende uma<br />
construção de ácido nucleico da invenção ou uma população de construções<br />
de ácido nucleico da invenção ou partículas revestidas da invenção.<br />
Também é fornecido o uso de uma construção de ácido<br />
nucleico da invenção, uma população de construções de ácido nucleico da<br />
20 invenção ou partículas revestidas da invenção na fabricação de um<br />
medicamento para a imunização com ácido nucleico.<br />
Estes e outros objetivos, aspectos, formas de realização e<br />
vantagens da presente invenção facilmente ocorrerão àqueles de habilidade<br />
comum na técnica em vista da divulgação aqui.<br />
25 Descrição Resumida dos Desenhos<br />
A Figura 1 ilustra os níveis de expressão do antígeno de<br />
superficie do vírus da hepatite B (1-1BsAg) obtidos usando vários vetores de<br />
expressão de plasmídeo.<br />
A Figura 2 mostra o efeito da inclusão de intron sobre a
10<br />
expressão do HBsAg em células SCC15 e de beta-gal em células B16 (média<br />
de três experimentos).<br />
A Figura 3 mostra o efeito do intron A da insulina de rato e da<br />
UTR 3' do HBV sobre a expressão de beta-gal em células SCC 15 (média de<br />
5 três experimentos).<br />
A Figura 4 mostra o efeito do intron A da insulina de rato e da<br />
UTR 3' do HBV sobre a expressão de HSVgD em células SCC 15 (média de<br />
três experimentos).<br />
A Figura 5 mostra o efeito do intron A da insulina de rato e da<br />
10 UTR 3' do HBV sobre a expressão de SEAP em células SCC15 e B16 (três<br />
repetições por linhagem de célula).<br />
A Figura 6 mostra a capacidade dos peptídeos de sinal<br />
heterólogos para direcionar a secreção de SEAP ou fragmento hFc em células<br />
B16.<br />
15 A Figura 7 ilustra níveis de anticorpos detectados nos soros de<br />
camundongos imunizados com ácidos nucleicos que codificam antígeno<br />
contidos em uma variedade de vetores de expressão de plasmídeo.<br />
expressão pPJV.<br />
A Figura 8 é uma representação diagramática do vetor de<br />
20 A Figura 9 é uma representação diagramática de pPJV7389.<br />
A Figura 10 é uma representação diagramática de pPJV7400.<br />
A Figura 11 é uma representação diagramática de pPJV7468.<br />
A Figura 12 é uma representação diagramática de pPJV7563.<br />
A Figura 13 demonstra a composição base para pPJV7563.<br />
25 A Figura 14 fornece um diagrama de fluxo da derivatização<br />
dos plasmídeos pPJV7563 e pPJV1671.<br />
construção de pPJV 1671.<br />
A Figura 15 fornece mapas dos plasmídeos chave na<br />
A Figura 16 fornece um mapa característico de pPJV1671 e
11<br />
fornece uma comparação de seqüência das seqüências dos terminais N do<br />
antígeno de HA, H3 Panama natural e do antígeno de HA, H3 Panama<br />
codificado pelo pPJV1671.<br />
A Figura 17 mostra os títulos de anticorpo da inibição da<br />
5 hemaglutinação em porcos vacinados com pPJV 1671.<br />
A Figura 18 mostra as reações de pele locais que segue a<br />
liberação epidérmica mediada por partícula de pPJV1671 aos seres humanos.<br />
A Figura 19 mostra os títulos de anticorpo da inibição da<br />
hemaglutinação em porcos imunizados com uma vacina trivalente com base<br />
10 na PMED. Os títulos de HI específicos para os vírus H3, H1 e B são<br />
mostrados para dois dispositivos de PMED.<br />
A Figura 20 é uma representação diagramática de pPML7789.<br />
A Figura 21 mostra a seqüência anotada de pPML7789.<br />
A Figura 22 é uma representação diagramática de pPJV2012.<br />
15 A Figura 23 é um diagrama de fluxo para a construção de<br />
pPJV2012.<br />
pPJV7788.<br />
A Figura 24 fornece a seqüência anotada de pPJV2012.<br />
A Figura 25 é uma representação diagramática do vetor<br />
20 A Figura 26 é uma representação diagramática do vetor<br />
pPJV7788 mostrando sítios de restrição.<br />
A Figura 27 é uma representação diagramática de pICP27.<br />
A Figura 28 é a seqüência de aminoácido (SEQ ID NO: 65) de<br />
ICP27 da cepa MS de HSV-2 com base na seqüência de nucleotídeo de<br />
25 pICP27. A diferença de aminoácido único entre a seqüência publicada de<br />
ICP27 da cepa MS de HSV-2 (asparagina = N) e cepa HG52 (lisina) está em<br />
negrito. A seqüência identificada como o epítopo CD8 putativo na cepa MS<br />
do HSV-2 está sublinhada.<br />
A Figura 29 mostra a identificação de um epítopo ICP27
12<br />
dominante em camundongos Balb/c. A: Células de baço (S) e linfonodo (N)<br />
de camundongos Balb/c infectados com HSV-2 (BS e BN, respectivamente)<br />
ou camundongos C57BL/6 (CS e CN) foram ensaiadas quanto à atividade de<br />
IFN-y ELISPOT usando as várias reuniões de peptídeo (C1-C12, R1-R6)<br />
5 descritas no Exemplo 22. 5 x 10 5 células foram plaqueadas em cada<br />
reservatório e os resultados são tabulados como negativo (quadrados vazios),<br />
fraco (25<br />
ELISPOTs/reservatório, quadrados pretos). B: Seqüências dos dois peptídeos<br />
(SEQ ID NOS: 66 e 67) reconhecidos pelas células de camundongos Balb/c<br />
10 salientando um epítopo Dd do HSV-2 potencial (negrito) e uma região<br />
(sublinhada) que corresponde a um epítopo do HSV-1 previamente<br />
identificado (Banks et al, J. Virol. 67, 613-616, 1993).<br />
A Figura 30 relata a caracterização da resposta de Balb/c a<br />
ICP27 usando um ensaio IFN-y ELISPOT. As células do baço de<br />
15 camundongos Balb/c infectados foram ensaiadas quanto a atividade de IFN-y<br />
ELISPOT usando a reunião de peptídeo feita de todos os peptídeos de ICP27<br />
(Reunião), ou peptídeos HGPSLYRTF individuais (P1, SEQ ID NO: 68) e<br />
LYRTFAANPRA (P2, SEQ ID NO: 69). 5 x 10 5 células foram plaqueadas em<br />
cada reservatório e os resultados são expressados como número de<br />
20 ELISPOTs/reservatório. Além disso, uma aliquota da amostra de célula do<br />
baço foi tratada com pérolas magnéticas para esgotar a amostra de células<br />
CD8+ como descrito no Exemplo 22. A amostra original (+CD8) e amostra<br />
esgotada (-CD8) foram ensaiadas quanto a atividade de IFN-y ELISPOT<br />
usando a reunião de peptídeo feita de todos os peptídeos de ICP27 (Reunião).<br />
25 A Figura 31 mostra a correlação entre a proteção contra a<br />
inoculação de HSV-2 e a produção de citocina específica de ICP27. Grupos<br />
de 16 camundongos receberam imunizações de PMED DNA primárias e de<br />
reforço consistindo da vacina pICP27 DNA com e sem o vetor CT DEI<br />
pPJV2013 (subunidade dual A+B) ou subunidade do vetor LT DEI pPJV2012
13<br />
(dual A+B). O pICP27 para o vetor DEI foi uma razão de 9:1. Painel A: dados<br />
de sobrevivência após a inoculação. Metade dos animais em cada grupo foram<br />
inoculados duas semanas a seguir da segunda imunização com 50 LD 50 de<br />
HSV-2. Painéis B e C: produção de IFN-y específico de ICP27 e TNF-a em<br />
5 cada grupo, respectivamente. Os animais remanescentes foram sacrificados no<br />
mesmo tempo e os esplenócitos foram coletados para a medição da produção<br />
de citocina específica de ICP27 usando um kit de série de pérola citométrica.<br />
A Figura 32 mostra o papel de IFN-y e TNF-a na proteção da<br />
inoculação letal de HSV-2 — avaliação da morbidez. Grupos de 4<br />
10 camundongos receberam imunizações primária e de reforço com a vacina<br />
pICP27 PMED DNA com (4 grupos) ou sem (1 grupo) o vetor pPJV2012<br />
dual A+B LT DEI. O pICP27 para o vetor DEI foi uma razão de 9:1. Os<br />
animais foram intranasalmente inoculados duas semanas mais tarde com 50<br />
LD50 de HSV-2. Para o esgotamento de célula T, os camundongos receberam<br />
15 injeções intraperitoneais contendo 200 jig de anticorpo monoclonal específico<br />
para IFN-y e/ou TNF-a nos dias -2, 0, 2, 4, 6, e 8 em relação à inoculação<br />
viral como descrito no Exemplo 22. Os animais foram monitorados quanto a<br />
mortalidade (% de sobrevivência) e morbidez, classificados em uma escala de<br />
O a 4 de acordo com o seguinte programa: 4, saudável; 3, pelo eriçado,<br />
20 espirrando; 2, feridas nos olhos ou nádegas, movimento reduzido; 1,<br />
encurvado, pouco movimento; 0, morto.<br />
A Figura 33 mostra o papel de populações de célula T na<br />
proteção da inoculação letal de HSV-2. Cinco grupos de 4 camundongos<br />
receberam imunizações primária e de reforço com a vacina pICP27 PMED<br />
25 DNA com (+LT, 4 grupos) ou sem (-LT, 1 grupo) o vetor pPJV2012 dual<br />
A+B LT DEI. O pICP27 para vetor DEI foi uma razão de 9:1. Os animais<br />
foram inoculados intranasalmente com 50 LD 50 de HSV-2 duas semanas mais<br />
tarde. Três grupos dos animais imunizados com ICP27+LT DEI foram<br />
tratados com injeções intraperitoneais de 90 lig de anticorpos monoclonais
14<br />
específicos de aCD4 e/ou aCD8, nos dias -2 e O em relação à inoculação<br />
virai. De modo a manter o DNA total no grupo pICP27 sozinho (indicado<br />
como -LT) igual aos grupos pICP27 + LT, vetor vazio foi adicionado ao<br />
grupo pICP27 sozinho.<br />
5 Descrição Resumida das Seqüências<br />
A SEQ ID NO: 1 é a seqüência promotora inicial imediata de<br />
hCMV (GenBank #M60321, X17403)<br />
A SEQ ID NO: 2 é a seqüência dos exons 1 e 2 do gene inicial<br />
imediato maior de hCMV (GenBank #M60321, X17403)<br />
10 A SEQ ID NO: 3 é a seqüência do intron A da insulina de rato<br />
(GenBank #J00748)<br />
A SEQ ID NO: 4 é a seqüência de um promotor quimérico de<br />
acordo com a presente invenção<br />
A SEQ ID NO: 5 é uma seqüência líder da HBV pre S2<br />
15 antígeno seqüência da UTR 5' do antígeno pré S2 do HBV (GenBank<br />
#M54923)<br />
A SEQ ID NO: 6 é uma seqüência líder da seqüência da UTR<br />
5' do tipo 2 gD do HSV (GenBank #Z86099)<br />
A SEQ ID NO: 7 é uma seqüência líder da seqüência da UTR<br />
20 5' do HBV e antígeno (GenBank #M54923)<br />
(GenBank #AF 143308)<br />
A SEQ ID NO: 8 é a seqüência da UTR 3' de HBVenh<br />
A SEQ ID NO: 9 é a seqüência da UTR 3' do gene inicial<br />
imediato símio (GenBank #M16019)<br />
25 A SEQ ID NO: 10 é a seqüência poli A da globina de coelho<br />
(GenBank #K03256)<br />
A SEQ ID NO: 11 é a seqüência poli A do gene inicial<br />
imediato de sCMV símio (GenBank #M16019)<br />
A SEQ ID NO: 12 é a seqüência poli A do gene gB do HSV2
(GenBank #Z86099)<br />
HPV16 (GenBank #K02718)<br />
5 pPJV<br />
15<br />
A SEQ ID NO: 13 é a seqüência poli A do gene inicial do<br />
A SEQ ID NO: 14 é a seqüência do vetor de expressão de<br />
A SEQ ID NO: 15 é o iniciador de PCR de JF93<br />
A SEQ ID NO: 16 é o iniciador de PCR de F110<br />
A SEQ ID NO: 17 é o iniciador de PCR de GW1<br />
A SEQ ID NO: 18 é o iniciador de PCR de JF254<br />
10 A SEQ ID NO: 19 é o iniciador de PCR de GW150<br />
A SEQ ID NO: 20 é o iniciador de PCR de JF255<br />
A SEQ ID NO: 21 é o iniciador de PCR de DS1<br />
A SEQ ID NO: 22 é o iniciador de PCR de DA1<br />
A SEQ ID NO: 23 é o iniciador de PCR de JF301<br />
15 A SEQ ID NO: 24 é o iniciador de PCR de JF302<br />
A SEQ ID NO: 25 é o iniciador de PCR de JF84<br />
A SEQ ID NO: 26 é o iniciador de PCR de JF225<br />
A SEQ ID NO: 27 é o iniciador de PCR de JF335<br />
A SEQ ID NO: 28 é o iniciador de PCR de JF336<br />
20 A SEQ ID NO: 29 é o iniciador de PCR de JF357<br />
A SEQ ID NO: 30 é o iniciador de PCR de JF365<br />
A SEQ ID NO: 31 é o iniciador de PCR de JF393<br />
A SEQ ID NO: 32 é o iniciador de PCR de JF406<br />
A SEQ ID NO: 33 é o iniciador de PCR de JF256<br />
25 A SEQ ID NO: 34 é o iniciador de PCR de JF257<br />
A SEQ ID NO: 35 é o iniciador de PCR de JF320<br />
A SEQ ID NO: 36 é o iniciador de PCR de JF321<br />
A SEQ ID NO: 37 é o iniciador de PCR de JF386<br />
A SEQ ID NO: 38 é o iniciador de PCR de FcAS
16<br />
A SEQ ID NO: 39 é o oligonucleotídeo JF354<br />
A SEQ ID NO: 40 é o iniciador de PCR de JF355<br />
A SEQ ID NO: 41 é o iniciador de PCR de JF356<br />
A SEQ ID NO: 42 é o oligonucleotídeo JF348<br />
5 A SEQ ID NO: 43 é o iniciador de PCR de JF349<br />
A SEQ ID NO: 44 é o iniciador de PCR de JF350<br />
A SEQ ID NO: 45 é o oligonucleotídeo JF351<br />
A SEQ ID NO: 46 é o iniciador de PCR de JF352<br />
A SEQ ID NO: 47 é o iniciador de PCR de JF353<br />
10 A SEQ ID NO: 48 é o iniciador de PCR de JF430<br />
15 Pseudo-raiva (PRV).<br />
sarcoma de Rous (RSV).<br />
A SEQ ID NO: 49 é o iniciador de PCR de JF442<br />
A SEQ ID NO: 50 é o iniciador de PCR de JF421<br />
A SEQ ID NO: 51 é o iniciador de PCR de JF444<br />
A SEQ ID NO: 52 é a seqüência promotora do vírus da<br />
A SEQ ID NO: 53 é a seqüência promotora do vírus do<br />
A SEQ ID NO: 54 fornece a seqüência de nucleotídeo do vetor<br />
pPJV1671 e a seqüência de aminoácido do antígeno H3N2 HA codificado.<br />
20 A SEQ ID NO: 55 fornece a seqüência de aminoácido sozinha<br />
do antígeno H3N2 HA codificado por pPJV1671.<br />
A SEQ ID NO: 56 fornece a seqüência de aminoácido de N<br />
terminal natural do antígeno H3 Panama HA.<br />
A SEQ ID NO: 57 fornece a seqüência de aminoácido de<br />
25 terminal N para o antígeno H3 Pananama HA codificado pelo pPJV 1671.<br />
A SEQ ID NO: 58 fornece a seqüência de consenso das<br />
seqüências das SEQ ID 1■11' 56 e 57.<br />
A SEQ ID NO: 59 fornece a seqüência de nucleotídeo do vetor<br />
pPML7789 e a seqüência de aminoácido do antígeno VN1194H5.
do antígeno VN1194H5.<br />
pPJV2012.<br />
17<br />
A SEQ ID NO: 60 fornece a seqüência de aminoácido sozinha<br />
A SEQ ID NO: 61 fornece a seqüência de nucleotídeo do vetor<br />
5 A SEQ ID NO: 62 fornece a seqüência de nucleotídeo do vetor<br />
PJV7788.<br />
As SEQ ID NOS: 63 e 64 são os iniciadores 5' e 3' usados no<br />
Exemplo 22 para amplificar o DNA da cepa MS do HSV-2.<br />
A SEQ ID NO: 65 é a seqüência de aminoácido de ICP27 da<br />
10 cepa MS do HSV-2 com base na seqüência de nucleotídeo de pICP27,<br />
Exemplo 22.<br />
As SEQ ID NOS: 66 e 67 são os peptídeos 45 e 46<br />
reconhecidos pelas células de camundongos Balb/c no Exemplo 22.<br />
A SEQ ID NO: 68 é uma seqüência de nove aminoácidos<br />
15 homóloga contida nos peptídeos 45 e 46.<br />
As SEQ ID NOS: 69 e 70 são regiões de aminoácido de HSV-<br />
2 ICP27 e HSV-1 ICP27 que diferem em um aminoácido.<br />
Descrição Detalhada da Invenção<br />
Antes de descrever a presente invenção em detalhes, deve ser<br />
20 entendido que esta invenção não é limitada às moléculas ou parâmetros do<br />
processo particularmente exemplificados visto que tais, naturalmente, podem<br />
variar. também deve ser entendido que a terminologia aqui usada é apenas<br />
com o propósito de descrever as formas de realização particulares da<br />
invenção, e não é intencionada a ser limitante. Além disso, a prática da<br />
25 presente invenção utilizará, a menos que de outro modo indicado, métodos<br />
convencionais de virologia, microbiologia, biologia molecular, técnicas de<br />
DNA recombinante e imunologia todas as quais estão dentro da habilidade<br />
comum da técnica. Tais técnicas são explicadas completamente na literatura.<br />
Ver, por exemplo, Sambrook, et al., Molecular Cloning: A Laboratory
18<br />
Manual (2 a Edição, 1989); DNA Cloning: A Practical Approach, vol. I & II<br />
(D. Glover, ed.); Oligonucleotide Synthesis (N. Gait, ed., 1984); A Practical<br />
Guide to Molecular Cloning (1984); e Fundamental Virology, 2 a Edição, vol.<br />
I & II (B. N. Fields e D. M. Knipe, eds.).<br />
5 Todas as publicações, patentes e pedidos de patente aqui<br />
citados, seja acima ou abaixo, são aqui incorporadas por referência em sua<br />
totalidade.<br />
Deve ser mencionado que, como usado neste relatório<br />
descritivo e nas reivindicações anexas, as formas singulares "um," "uma" e<br />
10 "o", "a" incluem referentes plurais a menos que o conteúdo claramente dite de<br />
outro modo.<br />
Em casos onde um agente particular é especificado como<br />
compreendendo unidades particulares, em um exemplo preferido o agente<br />
pode consistir essencialmente de tais unidades. UM.<br />
15 A Definições<br />
A menos que de outro modo definido, todos os termos técnicos<br />
e científicos aqui usados têm o mesmo significado como habitualmente<br />
entendido por uma pessoa de habilidade comum na técnica à qual a invenção<br />
pertence. Embora vários métodos e materiais similares ou equivalentes<br />
20 àqueles aqui descritos podem ser usados na prática da presente invenção, os<br />
materiais e métodos preferidos são aqui descritos.<br />
Na descrição da presente invenção, os seguintes termos serão<br />
utilizados e são intencionados a serem definidos como indicado abaixo.<br />
O termo "imunização com ácido nucleico" é aqui usado para<br />
25 se referir à introdução de uma molécula de ácido nucleico que codifica um ou<br />
mais antígenos ou polipeptídeos selecionados em uma célula hospedeira para<br />
a expressão in vivo do antígeno ou antígenos. a molécula de ácido nucleico<br />
pode ser introduzida diretamente dentro do indivíduo receptor, tal como pela<br />
injeção intramuscular ou intradérmica padrão; liberação de partícula
19<br />
transdérmica; inalação; topicamente, ou pelos modos de administração oral,<br />
intranasal ou mucósico. Em particular, o ácido nucleico pode ser administrado<br />
por intermédio da liberação de partícula transdérmica. A molécula<br />
alternativamente pode ser introduzida ex vivo dentro de células que foram<br />
5 removidas de um indivíduo. Neste último caso, as células contendo a<br />
molécula de ácido nucleico de interesse são re-introduzidas no indivíduo tal<br />
que uma resposta imune pode ser montada contra o antígeno codificado pela<br />
molécula de ácido nucleico. As moléculas de ácido nucleico usadas em tal<br />
imunização são no geral aqui aludidas como "vacinas de ácido nucleico."<br />
10 Qualquer um dos ácidos nucleicos aqui mencionados pode estar presente em<br />
tais vacinas e em particular as construções de ácido nucleico aqui<br />
mencionadas podem estar presentes.<br />
O termo "adjuvante" significa um material ou composição<br />
capaz de alterar específica ou não especificamente alterar, realçar, direcionar,<br />
15 redirecionar, potenciar ou iniciar uma resposta imune específica de antígeno.<br />
Assim, a co-adminisração de um adjuvante com um antígeno pode resultar em<br />
uma dose mais baixa ou menos doses de antígeno que é necessário para se<br />
obter uma resposta imune desejada no indivíduo ao qual o antígeno é<br />
administrado, ou a co-administração pode resultar em uma resposta imune<br />
20 qualitativa e/ou quantitativamente diferente no indivíduo. Em particular, a<br />
administração do adjuvante pode resultar em uma resposta imune realçada tal<br />
como uma de maior magnitude e/ou duração. A eficácia de um adjuvante<br />
pode ser determinada pela administração do adjuvante com uma composição<br />
de vacina em paralelo com uma composição de vacina sozinha aos animais e<br />
25 comparar a imunidade mediada por anticorpo e/ou celular nos dois grupos<br />
usando ensaios padrão tais como radioimunoensaio, ELISAs, e ensaios de<br />
CTL. As construções da invenção podem expressar um ou mais polipeptídeos<br />
adjuvantes.<br />
Por "carreador de núcleo" é intencionado um carreador no qual
20<br />
um ácido nucleico hóspede (por exemplo, DNA, RNA) é revestido de modo a<br />
comunicar um tamanho de partícula definido bem como uma densidade<br />
suficientemente alta para se obter a cinética requerida para a penetração da<br />
membrana celular, tal que a molécula hóspede possa ser liberada usando<br />
5 técnicas mediadas por partícula (ver, por exemplo, a Patente U.S. W-<br />
5.100.792). os carreadores de núcleo tipicamente incluem materiais tais como<br />
tungstênio, ouro, platina, ferrita, poliestireno e látex. Ver por exemplo,<br />
Particle Bombardment Technology for Gene Transfer, (1994) Yang, N. ed.,<br />
Oxford University Press, Nova Iorque, NY páginas 10-11.<br />
10 Por "seringa isenta de agulha" é intencionado um instrumento<br />
que libera uma composição particulada transdermicamente sem a ajuda de<br />
uma agulha convencional para perfurar a pele. As seringas sem agulha para o<br />
uso com a presente invenção são aqui debatidas.<br />
O termo liberação "transdérmica" significa administração<br />
15 intradérmica (por exemplo, dentro da derme ou epiderme), transdérmica (por<br />
exemplo, "percutânea") e administração transmucósica, isto é, liberação pela<br />
passagem de um agente dentro ou através da pele ou tecido mucósico. Ver,<br />
por exemplo, Transdermic Drug Delivery: Developmental Issues and<br />
Research Initiatives, Hadgraft e Guy (eds.), Marcel Dekker, Inc., (1989);<br />
20 Controlled Drug Delivery: Fundamentais and Applications, Robinson e Lee<br />
(eds.), Marcel Dekker Inc., (1987); e Transdermic Delivery of Drugs, Vols. 1-<br />
3, Kydonieus e Berner (eds.), CRC Press, (1987). Assim, o termo abrange a<br />
liberação a partir de uma seringa isenta de agulha como descrito na Patente<br />
U.S. N" 5.630.796, bem como a liberação mediada por partícula como<br />
25 descrito na Patente U.S. N° 5.865.796.<br />
Um "polipeptídeo" é usado no seu sentido mais amplo para se<br />
referir a um composto de dois ou mais aminoácidos de subunidades, análogos<br />
de aminoácido, ou outros peptidomiméticos. As subunidades podem ser<br />
ligadas pelas ligações de peptídeo ou por outras ligações, por exemplo éster,
21<br />
éter, etc. Como aqui usado, o termo "aminoácido" refere-se a aminoácidos<br />
naturais e/ou não naturais ou sintéticos, incluindo glicina e ambos os isômeros<br />
óticos D ou L, e análogos de aminoácido e peptidomiméticos. Um peptídeo de<br />
três ou mais aminoácidos é habitualmente chamado um oligopeptídeo se a<br />
5 cadeia de peptídeo é curta. Se a cadeia de peptídeo é longa, o peptídeo é<br />
tipicamente chamado um polipeptídeo ou uma proteína.<br />
Um "antígeno" refere-se a qualquer um agente, no geral uma<br />
macromolécula, que possa evocar uma resposta imunológica em um<br />
indivíduo. O termo pode ser usado para se referir a uma macromolécula<br />
10 individual ou a uma população homogênea ou heterogênea de<br />
macromoléculas antigênicas. Como aqui usado, "antígeno" é no geral usado<br />
para se referir a uma molécula de proteína ou porção desta que contenha um<br />
ou mais epítopos. Um "antígeno" pode compreender, por exemplo, um<br />
polipeptídeo que ocorre naturalmente, um fragmento de um tal polipeptídeo<br />
15 que seja imunogênico ou uma forma variante de cada um que retenha a<br />
imunogenicidade. Em um exemplo preferido, onde um fragmento ou variante<br />
é aludido, a resposta imune gerada pode ser preferivelmente capaz de<br />
reconhecer o polipeptídeo original a partir do qual o fragmento ou variante é<br />
derivado.<br />
20 Para os propósitos da presente invenção, os antígenos podem<br />
ser obtidos ou derivados de qualquer fonte apropriada. Para os propósitos da<br />
presente invenção, um "antígeno" inclui uma proteína tendo modificações,<br />
tais como deleções, adições e substituições (no geral conservativas por<br />
natureza) à seqüência nativa, contanto que a proteína mantenha<br />
25 imunogenicidade suficiente. Estas modificações podem ser deliberadas, por<br />
exemplo através da mutagênese direcionada ao sítio, ou pode ser acidental, tal<br />
Como através de mutações de hospedeiros que produzem os antígenos. Em<br />
uma forma de realização particularmente preferida da invenção o antígeno<br />
utilizado ou codificado pode ser um antígeno da influenza, um fragmento
22<br />
imunogênico de um antígeno da influenza ou uma variante imunogênica de<br />
cada um.<br />
Uma "resposta imune" contra um antígeno de interesse é o<br />
desenvolvimento em um individual de uma resposta imune humoral e/ou um<br />
5 celular para aquele antígeno. Para os propósitos da presente invenção, uma<br />
"resposta imune humoral" refere-se a uma resposta imune mediada por<br />
moléculas de anticorpo, enquanto que uma "resposta imune celular" é uma<br />
mediada pelos linfócitos T e/ou outras células sanguíneas brancas.<br />
Os termos "molécula de ácido nucleico" e "polinucleotídeo"<br />
10 são usados aqui intercambiavelmente e referem-se a uma forma polimérica de<br />
nucleotídeos de qualquer comprimento, desoxinibonucleotídeos ou<br />
ribonucleotídeos, ou análogos destes. Os polinucleotídeos podem ter qualquer<br />
estrutura tri-dimensional, e pode realizar qualquer função, conhecida ou<br />
desconhecida. Os exemplos não limitantes de polinucleotídeos incluem um<br />
15 gene, um fragmento de gene, exons, introns, RNA mensageiro (mRNA), RNA<br />
de transferência, RNA ribossômico, ribozimas, cDNA, polinucleotídeos<br />
recombinantes, polinucleotídeos ramificados, plasmídeos, vetores, DNA<br />
isolado de qualquer seqüência, RNA isolado de qualquer seqüência, sondas de<br />
ácido nucleico e iniciadores.<br />
20 Um polinucleotídeo é tipicamente composto de uma seqüência<br />
específica de quatro bases de nucleotídeo: adenina (A); citosina (C); guanina<br />
(G); e timina (T) (uracila (U) no lugar de timina (T) quando o polinucleotídeo<br />
é RNA). Assim, o termo seqüência de ácido nucleico é a representação<br />
alfabética de uma molécula de polinucleotídeo. Esta representação alfabética<br />
25 pode ser introduzida em bases de dados em um computador tendo uma<br />
unidade de processamento central e usada para aplicações de bioinformáticas<br />
tais como genômicas funcionais e pesquisa de homologia.<br />
Um "vetor" é capaz de transferir seqüências de ácido nucleico<br />
para alvejar células (por exemplo, vetores virais, vetores não virais,
23<br />
carreadores particulados, e lipossomas). As células alvo podem ser<br />
procarióticas ou eucarióticas. Tipicamente, "construção de vetor," "vetor de<br />
expressão," e "vetor de transferência de gene," significam qualquer<br />
construção de ácido nucleico capaz de direcionar a expressão de um gene de<br />
5 interesse e que pode transferir seqüências de gene para alvejar células. Assim,<br />
o termo inclui veículos de clonagem e expressão, bem como vetores virais.<br />
Um "plasmídeo" é um vetor na forma de um elemento genético<br />
extracromossômico.<br />
Uma seqüência de ácido nucleico que "codifica" um antígeno<br />
10 selecionado é uma molécula de ácido nucleico que é transcrita (no caso de<br />
DNA) e traduzida (no caso de mRNA) em um polipeptídeo in vivo ou in vitro<br />
quando colocado sob o controle de seqüências reguladoras apropriadas. Os<br />
limites da seqüência codificadora são determinados por um códon de partida<br />
no terminal 5' (amino) e um códon de parada de tradução no terminal 3'<br />
15 (carbóxi). Para os propósitos da invenção, tais seqüências de ácido nucleico<br />
podem incluir, mas não são limitados a, cDNA a partir de mRNA viral,<br />
procariótico ou eucariótico, seqüências genômicas de DNA ou RNA virais ou<br />
procarióticos, e ainda seqüências de DNA sintéticas. Uma seqüência de<br />
terminação de transcrição pode estar localizada 3' em relação à seqüência<br />
20 codificadora.<br />
Em alguns casos uma seqüência transcrita pode dar origem a<br />
polipeptídeos múltiplos, por exemplo um transcrito pode conter matrizes de<br />
leitura aberta múltiplas (ORFs) e também um ou mais Sítios de Entrada de<br />
Ribossoma Interno (IRES) para possibilitar a tradução de ORFs depois da<br />
25 primeira ORF. Um transcrito pode ser traduzido para dar um polipeptídeo que<br />
é subseqüentemente clivado para dar uma pluralidade de polipeptídeos. Em<br />
alguns casos uma construção de ácido nucleico pode dar origem a transcritos<br />
múltiplos e por este motivo uma pluralidade de polipeptídeos.<br />
Um "promotor" é uma seqüência de nucleotídeo que inicia e
24<br />
regula a transcrição de um polinucleotídeo que codifica polipeptídeo. Os<br />
promotores podem incluir promotores indutíveis (onde a expressão de uma<br />
seqüência de polinucleotídeo operavelmente ligada ao promotor é induzida<br />
por um análito, co-fator, proteína reguladora, etc.), promotores repressíveis<br />
5 (onde a expressão de uma seqüência de polinucleotídeo operavelmente ligada<br />
ao promotor é reprimida por um análito, co-fator, proteína regulatória, etc.), e<br />
promotores constitutivos. É intencionado que o termo "promotor" ou<br />
"elemento de controle" inclui regiões promotoras e segmentos funcionais de<br />
tamanho natural (por exemplo, transcrição ou tradução de controle) destas<br />
10 regiões.<br />
"Operavelmente ligada" refere-se a um arranjo de elementos<br />
em que os componentes assim descritos são configurados de modo a realizar a<br />
sua função usual. Assim, um dado promotor operavelmente ligado a uma<br />
seqüência de ácido nucleico é capaz de efetuar a expressão daquela seqüência<br />
15 quando as enzimas apropriadas estão presentes. O promotor não precisa ser<br />
contíguo com a seqüência, contanto que o mesmo funcione para direcionar a<br />
sua expressão. Assim, por exemplo, seqüências interventoras não traduzidas<br />
embora transcritas podem estar presentes entre a seqüência promotora e a<br />
seqüência de ácido nucleico e a seqüência promotora pode ser ainda<br />
20 considerada "operavelmente ligada" à seqüência codificadora.<br />
"Recombinante" é aqui usado para descrever uma molécula de<br />
ácido nucleico (polinucleotídeo) de origem genômica, cDNA, semissintética<br />
ou sintética que, em virtude da sua origem ou manipulação não está associada<br />
com toda ou uma porção do polinucleotídeo com que a mesma está associada<br />
25 na natureza e/ou está ligada a um polinucleotídeo outro que não aquele ao<br />
qual a mesma está ligada na natureza. Duas seqüências de ácido nucleico que<br />
estão contidas dentro de uma molécula de ácido nucleico recombinante única<br />
são "heterólogas" em relação uma à outra quando as mesmas não estão<br />
normalmente associadas uma com a outra na natureza.
25<br />
Os homólogos de polinucleotídeos são aqui aludidos.<br />
Tipicamente um polinucleotídeo que é homólogo a um outro polinucleotídeo<br />
é pelo menos 70% homólogo ao polinucleotídeo, preferivelmente pelo menos<br />
75, 80 ou 90% e mais preferivelmente pelo menos 95%, 97% ou 99%<br />
5 homólogo a este. Os métodos de medir a homologia são bem conhecidos na<br />
técnica e será entendido por aqueles de habilidade na técnica que no presente<br />
contexto, homologia é calculada com base na identidade de ácido nucleico.<br />
Tal homologia, por exemplo, pode existir em uma região de pelo menos 15,<br />
preferivelmente pelo menos 30, por exemplo pelo menos 40, 60 ou 100 ou<br />
10 mais nucleotídeos contíguos. A região de homologia pode ser acima de pelo<br />
menos 150, preferivelmente pelo menos 200 e ainda mais preferivelmente<br />
acima de pelo menos 300 nucleotídeos. A região de homologia pode dizer<br />
respeito a qualquer um dos elementos aqui aludidos em relação às construções<br />
de ácido nucleico da invenção. Em alguns casos, a região de homologia pode<br />
15 ser acima da região inteira em questão, tal como, por exemplo, acima da<br />
região inteira de qualquer um dos elementos aqui especificados.<br />
Níveis equivalentes de homologia de aminoácido àqueles<br />
aludidos em relação à homologia de nucleotídeo acima pode estar presente.<br />
Assim, qualquer um dos níveis mencionados acima de homologia podem se<br />
20 aplicar ao nível de aminoácido. Homologia ao nível de aminoácido, por<br />
exemplo, pode ser acima de pelo menos 15, preferivelmente pelo menos 25,<br />
mais preferivelmente acima de pelo menos 50, ainda mais preferivelmente<br />
pelo menos 75 e ainda mais preferivelmente acima de pelo menos 100<br />
aminoácidos. A região de homologia pode estar acima do comprimento<br />
25 inteiro do elemento em questão.<br />
Métodos de medir a homologia ou identidade de<br />
polinucleotídeo são conhecidos na técnica. Por exemplo o Pacote UWGCG<br />
fornece o programa BESTFIT que pode ser usado para calcular a homologia<br />
(por exemplo, usado nos seus ajustes de valor padrão) (Devereux et al (1984)
26<br />
Nucleic Acids Research 12, p387-395).<br />
Os algoritmos de PILEUP e BLAST também podem ser<br />
usados para calcular a homologia ou seqüências arranjadas (tipicamente nos<br />
seus ajustes de valor padrão), por exemplo como descrito em Altschul S. F.<br />
5 (1993) J Mol Evol 36: 290-300; Altschul, S, F et al (1990) J Mol Biol 215:<br />
403-10.<br />
O software para realizar a análise BLAST está publicamente<br />
disponível através da National Centre for Biotechnology Information<br />
(http://www.ncbi.nlm.nih.gov/) . Este algoritmo envolve primeiro identificar<br />
10 pares de seqüência de alta classificação (HSPs) pela identificação de palavras<br />
curtas de comprimento W na seqüência dúvida que se iguala ou satisfaz<br />
algumas contagens de patamar de valor positivo T quando alinhada com uma<br />
palavra do mesmo comprimento em uma seqüência da base de dados. T é<br />
aludido como o patamar de contagem de palavra da vizinhança (Altschul et<br />
15 al, supra). Este acerto de palavra da vizinhança inicial atua como sementes<br />
para iniciar pesquisas para encontrar HSPs que as contenham. Os acertos de<br />
palavra são estendidos em ambas as direções junto de cada seqüência de<br />
modo que a contagem de alinhamento acumulativo possa ser aumentado. As<br />
extensões para os acertos de palavra em cada direção são paradas quando: a<br />
20 contagem de alinhamento acumulativo vai a zero ou abaixo, devido ao<br />
acúmulo de um ou mais alinhamentos de resíduo de contagem negativa; ou o<br />
final de cada seqüência é atingido. Os parâmetros de algoritmo BLAST W, T<br />
e X determina a sensibilidade e velocidade do alinhamento. O programa<br />
BLAST usa como valores padrão um comprimento de palavra (W) de 11, os<br />
25 alinhamentos de matriz de contagem BLOSUM62 (ver Henikoff e Henikoff<br />
(1992) Proc. Natl. Acad. Sci. USA 89: 10915-10919) (B) de 50, expectação<br />
(E) de 10, M = 5, N = 4, e uma comparação de ambos os filamentos.<br />
O algoritmo BLAST realiza uma análise estatística da<br />
similaridade entre duas seqüências; ver por exemplo, Karlin e Altschul (1993)
27<br />
Proc. Natl, Acad. Sci. USA 90: 5873-5787. Uma medida de similaridade<br />
fornecida pelo algoritmo BLAST é a menor probabilidade de soma (P(N)),<br />
que fornece uma indicação da probabilidade pela qual um emparelhamento<br />
entre duas seqüências de nucleotídeo ou aminoácido ocorreriam ao acaso. Por<br />
5 exemplo, uma seqüência é considerada similar a uma outra seqüência se a<br />
menor probabilidade de soma em comparação da primeira seqüência para a<br />
segunda seqüência for menor do que cerca de 1, preferivelmente menor do<br />
que cerca de 0,1, mais preferivelmente menor do que cerca de 0,01, e o mais<br />
preferivelmente menor do que cerca de 0,001.<br />
10 Os homólogos tipicamente hibridizam com o polinucleotídeo<br />
relevante em um nível significantemente acima do fundo. O nível de sinal<br />
gerado pela interação entre o homólogo e o polinucleotídeo é tipicamente pelo<br />
menos 10 vezes, preferivelmente pelo menos 100 vezes, tão intenso quanto a<br />
"hibridização de fundo". A intensidade de interação pode ser medida, por<br />
15 exemplo, pela radiorrotulação da sonda, por exemplo, com 32P. A hibridização<br />
seletiva é tipicamente obtida usando condições de severidade média a alta,<br />
(por exemplo, 0,03 M de cloreto de sódio e 0,003 M de citrato de sódio de<br />
cerca de 50° C a cerca de 60° C.<br />
As condições de hibridização severas podem incluir 50% de<br />
20 formamida, 5x de Solução de Denhardt, 5x SSC, 0,1% de SDS e 100 µg/ml<br />
de DNA de esperma de salmão desnaturado e as condições de lavagem podem<br />
incluir 2x SSC, 0,1% de SDS a 37° C seguido por 1 x SSC, 0,1% de SDS a 68°<br />
C. Definir as condições de hibridização apropriadas está dentro da habilidade<br />
da técnica. Ver, por exemplo, Sambrook et al., supra.<br />
25 O homólogo pode diferir de uma seqüência no polinucleotídeo<br />
relevante em menos do que 3, 5, 10, 15, 20 ou mais mutações (cada uma das<br />
quais pode ser uma substituição, duplicação, deleção ou inserção). Estas<br />
mutações podem ser medidas em uma região de pelo menos 30, por exemplo<br />
pelo menos 40, 60 ou 100 ou mais nucleotídeos contíguos do homólogo. Em
28<br />
alguns casos as mutações podem ser medidas na região inteira do homólogo.<br />
Onde um polinucleotídeo codifica um polipeptídeo, as substituições<br />
preferivelmente criam mudanças "conservativas" no aminoácido codificado.<br />
Estes são definidos de acordo com a Tabela 1 abaixo. Os aminoácidos no<br />
5 mesmo bloco na segunda coluna e preferivelmente na mesma linha na terceira<br />
coluna podem ser substituídos no lugar de um outro nas mudanças<br />
conservativas.<br />
Tabela 1<br />
ALIFÁTICO Não Polar G A P<br />
I L V<br />
Polar não carregado C S T M<br />
N Q<br />
Polar carregado D E<br />
KR<br />
AROMÁTICO H F W Y<br />
O termo "fragmento" indica uma parte menor de uma entidade<br />
10 maior. Fragmentos de elementos específicos aqui aludidos podem ser<br />
utilizados na invenção. Em particular, tais fragmentos reterão algumas ou<br />
todas as funcionalidades do elemento original e em particular qualquer uma<br />
das funções aqui mencionadas. Em exemplos preferidos um fragmento de um<br />
antígeno pode reter imunogenicidade e um fragmento de um adjuvante a<br />
15 capacidade para atuar como um adjuvante. Em alguns exemplos, um<br />
fragmento pode ser pelo menos 50%, preferivelmente pelo menos 60%, mais<br />
preferivelmente pelo menos 70%, ainda mais preferivelmente pelo menos<br />
80%, ainda mais preferivelmente pelo menos 90% e ainda mais<br />
preferivelmente pelo menos 95% do comprimento do original. Um fragmento<br />
20 pode ser igual a ou menor do que tais porcentagens do comprimento do<br />
original.<br />
Os termos "indivíduo" e "indivíduo" são usados<br />
intercambialvelmente aqui para se referir a qualquer membro do subfilo
29<br />
cordata, incluindo, sem limitação, seres humanos e outros primatas, incluindo<br />
primatas não humanos tais como chimpanzés e outras espécies de símios e<br />
macacos; animais criação tais como gado, ovelha, porcos, cabras e cavalos;<br />
mamíferos domésticos tais como cães e gatos; animais de laboratório<br />
5 incluindo roedores tais como camundongos, ratos e porquinhos da Índia bem<br />
como porcos; pássaros, incluindo aves domésticas, selvagens e de caça tais<br />
como galinhas, perus e outras aves galináceas, patos, gansos, e outros. Os<br />
termos não denotam uma idade particular. Assim, indivíduos tanto adultos<br />
como recém-nascidos são intencionados a serem abrangidos. Os métodos aqui<br />
10 descritos são intencionados para o uso em qualquer uma das espécies<br />
vertebradas acima, desde que os sistemas imune de todos estes vertebrados<br />
operem similarmente.<br />
Em alguns exemplos, a invenção pode ser usada para imunizar<br />
qualquer indivíduo adequado e em particular qualquer indivíduo adequado de<br />
15 uma dada espécie. Em um exemplo preferido, qualquer indivíduo humano<br />
adequado pode ser imunizado. Assim, tantos indivíduos quanto possível, por<br />
exemplo, podem ser imunizados sem ênfase em qualquer grupo particular de<br />
indivíduos. Por exemplo, uma população de indivíduos como um todo, ou<br />
tantos quanto possível, podem ser imunizados. Em particular, onde a invenção<br />
20 está sendo usada para tratar influenza, e especialmente para imunizar contra<br />
uma cepa pandêmica de influenza, as construções da invenção podem ser<br />
usadas para imunizar qualquer indivíduo e preferivelmente tantos indivíduos<br />
quanto possível.<br />
Em outros casos, o indivíduo ou indivíduo podem ser um em<br />
25 risco de infecção ou para quem a infecção seria particularmente prejudicial. A<br />
infecção, em um exemplo preferido, pode ser uma infecção respiratória. Em<br />
particular, onde a invenção está sendo usada para prevenir ou tratar uma<br />
infecção respiratória e em particular contra influenza, o indivíduo pode ser um<br />
ser humano. Em alguns casos, as construções de ácido nucleico da invenção
30<br />
podem ser administradas de preferência, ou primeiro, em particular em grupos<br />
de risco. Isto, por exemplo, pode ser o caso para a administração de<br />
construções para imunizar contra cepas não pandêmicas de influenza. Em<br />
alguns casos os indivíduos, por exemplo, podem cair em uma ou mais das<br />
5 seguintes categorias:<br />
um indivíduo com um distúrbio respiratório e/ou<br />
problemas cardíacos e em particular que tenha asma, enfisema, bronquite e/ou<br />
doença pulmonar obstrutiva crônica (COPD);<br />
- um indivíduo com uma condição médica crônica tal como<br />
10 diabete, supressão imune, deficiência imune, doença de célula falciforme e/ou<br />
uma doença renal;<br />
- um indivíduo com idade de pelo menos 50 anos,<br />
preferivelmente pelo menos 60 anos, mais preferivelmente pelo menos 65<br />
anos, ainda mais preferivelmente pelo menos 75 anos de idade e ainda mais<br />
15 preferivelmente pelo menos 80 anos de idade;<br />
- uma criança com 2 anos de idade ou menos, em particular<br />
de 6 a 23 meses, por exemplo 18 meses ou menos;<br />
- um indivíduo em uma terapia com aspirina crônica e em<br />
particular um com idade de 6 meses a 18 anos;<br />
20 - uma mulher grávida e em particular uma que estará no seu<br />
segundo ou terceiro trimestre de gravidez durante a época da influenza;<br />
- um residente de uma casa de saúde ou instalação de<br />
cuidados de longa duração; e/ou<br />
- um enfermeiro para qualquer um dos acima ou alguém que<br />
25 é provável de entrar em contato regular com eles.<br />
B. Resumo Geral<br />
A invenção diz respeito a construções de ácido nucleico que<br />
possibilitem a expressão eficiente de seqüências codificadoras heterólogas, e<br />
em particular genes que codifiquem antígeno, em células hospedeiras. As
31<br />
construções, em alguns exemplos, podem expressar um ou mais polipeptídeos<br />
adjuvantes. Mais especificamente, a invenção fornece construções de ácido<br />
nucleico que compreendem, ou em algumas formas de realização, consistem<br />
essencialmente de uma seqüência promotora quimérica e um sítio de<br />
5 clonagem, tal que quando uma seqüência codificadora é inserida no sítio de<br />
clonagem, a seqüência codificadora está em ligação operável com o promotor<br />
quimérico. A invenção também fornece construções com seqüências<br />
codificadoras inseridas no sítio ou sítios de clonagem. As seqüências<br />
codificadoras podem codificar qualquer um dos polipeptídeos aqui aludidos e<br />
10 em particular um antígeno e especialmente qualquer um dos antígenos e<br />
polipeptídeos adjuvantes aqui mencionados.<br />
Em uma forma de realização especialmente preferida as<br />
construções compreendem uma seqüência codificadora e em particular uma<br />
seqüência codificadora que codifica um antígeno, um fragmento imunogênico<br />
15 deste ou uma variante imunogênica de cada um. Em uma forma de realização<br />
especialmente preferida as seqüências codificadoras codificam um antígeno<br />
da influenza, um fragmento imunogênico deste ou uma variante imunogênica<br />
de cada um. Em uma outra forma de realização preferida a seqüência<br />
codificadora pode codificar um polipeptídeo adjuvante e em particular uma<br />
20 subunidade de toxina bacteriana que ribosile ADP, um fragmento desta com<br />
atividade de adjuvante ou uma variante de cada um com atividade de<br />
adjuvante.<br />
O promotor quimérico compreende, ou em algumas formas de<br />
realização consiste essencialmente de:<br />
25 (a) uma seqüência promotora inicial imediata de hCMV;<br />
imediato maior de hCMV; e<br />
(b) exon 1 e pelo menos uma parte do exon 2 do gene inicial<br />
(c) um intron heterólogo fornecido no lugar da região de intron<br />
A do gene inicial imediato maior de hCMV.
compreender:<br />
nativa;<br />
32<br />
A seqüência do promotor inicial imediato do hCMV (a) pode<br />
(i) uma seqüência do promotor inicial imediato de hCMV<br />
5 (ii) um função homólogo variante do mesmo; ou<br />
(iii) uma função de fragmento de (i) ou (ii).<br />
No geral a seqüência (a) compreende cerca de 100 a 600,<br />
preferivelmente 200 a 600, por exemplo 400 a 600 nucleotídeos. Tipicamente<br />
a seqüência (a) compreende as seqüências presentes em (i) que ligam fatores<br />
10 de transcrição ou a RNA polimerase, ou ao invés de qualquer uma destas<br />
seqüências, homólogos destas seqüências capazes de ligar os mesmos fatores<br />
de transcrição e RNA polimerase. Tipicamente tais seqüências ou seus<br />
homólogos estão presentes na seqüência promotora (a) na mesma ordem e/ou<br />
substancialmente no mesmo espaçamento relativo como em (i).<br />
15 No geral, (i) compreende pelo menos de nucleotídeos -100 a -<br />
1, tipicamente -150 a -1, por exemplo -500 a -1 ou -600 a -1 do gene inicial<br />
imediato maior de hCMV. A seqüência (i) tipicamente compreende a<br />
seqüência promotora de núcleo do hCMV e também pode incluir um ou mais<br />
elementos realçadores presentes no promotor inicial imediato do hCMV. Por<br />
20 exemplo, (i) pode compreender dos nucleotídeos -118 a -1, ou -524 a -1 como<br />
na US 6218140, ou dos nucleotídeos -62 a 1 ou -465 a -1 como na US 538<br />
5839.<br />
No geral (i) inclui um TATA box ou CAAT box habitualmente<br />
encontrados nas seqüências promotoras. Preferivelmente a seqüência inclui<br />
25 uma ou mais das seqüências de repetição no promotor inicial imediato do<br />
hCMV.<br />
Em uma forma de realização preferida, (i) compreende a SEQ<br />
ID NO: 1. Em uma outra forma de realização preferida, (i) compreende os<br />
nucleotídeos 903 a 1587 da SEQ ID NO: 54. Em uma outra forma de
33<br />
realização (i) pode compreender os nucleotídeos de 903 a 1587 da SEQ ID<br />
NO: 14. Em uma outra forma de realização preferida (i) pode compreender os<br />
nucleotídeos de 1002 a 1686 ou de 2624 a 3308 da SEQ ID 1\1 2 57. Em uma<br />
outra forma de realização preferida (i) pode compreender os nucleotídeos de<br />
5 1815 a 1935 e/ou de 1948 a 2632 da SEQ ID 1\l' 61 e em particular os<br />
nucleotídeos de 1948 a 2632 da SEQ ID 61. Em uma outra forma de<br />
realização preferida os nucleotídeos de 1815 a 1935 podem ser usados.<br />
Em uma forma de realização particularmente preferida da<br />
invenção a seqüência do promotor inicial imediato de hCMV (a) compreende:<br />
10 (i) a seqüência de nucleotídeo da SEQ ID No. 1, nucleotídeos<br />
de 903 a 1587 da SEQ ID No. 54, nucleotídeos de 1815 a 1935 da SEQ ID<br />
No: 61, nucleotídeos de 1948 a 2632 da SEQ ID No: 61, nucleotídeos de 1002<br />
a 1686 da SEQ ID No: 62 e/ou nucleotídeos de 2624 a 3308 da SEQ ID No:<br />
62;<br />
15 (ii) uma variante funcional de (i) que tem pelo menos 80% de<br />
homologia de seqüência de nucleotídeo a uma ou mais das seqüências de (i);<br />
e/ou<br />
(iii) um fragmento funcional de (i) ou (ii).<br />
Em alguns exemplos, um fragmento pode compreender pelo<br />
20 menos 300 nucleotídeos, preferivelmente pelo menos 400 nucleotídeos, mais<br />
preferivelmente pelo menos 500 nucleotídeos e ainda mais preferivelmente<br />
pelo menos 600 nucleotídeos de tais seqüências. O fragmento pode<br />
compreender até 800, até 600 ou até 400 nucleotídeos<br />
Uma seqüência promotora inicial imediata de hCMV pode ser<br />
25 obtida usando métodos conhecidos. Um promotor inicial imediato do hCMV<br />
nativo pode ser isolado diretamente de uma amostra do vírus, usando técnicas<br />
padrão. A US 5385839, por exemplo, descreve a clonagem de uma região<br />
promotora de hCMV. A seqüência de um promotor inicial imediato do hCMV<br />
está disponível no Genbank #M60321 (cepa Towne do hCMV) e X17403
34<br />
(cepa Ad169 do hCMV). Uma seqüência nativa portanto pôde ser isolada pela<br />
PCR usando iniciadores de PCR com base na seqüência conhecida. Ver por<br />
exemplo, Sambrook et al, supra, quanto a uma descrição de técnicas usadas<br />
para obter e isolar DNA. Uma seqüência promotora do hCMV adequada<br />
5 também pôde ser isolada a partir de um vetor plasmídico existente. As<br />
seqüências promotoras também podem ser sinteticamente produzidas.<br />
Uma variante funcional (ii) ou fragmento (iii) é no geral um<br />
que retenha e/ou complemente a atividade do promotor nativo (i).<br />
Tipicamente a sua atividade é a capacidade para causar (incluindo iniciar e<br />
10 regular) a transcrição de um polinucleotídeo operavelmente ligado, em<br />
particular do gene inicial imediato maior de hCMV. Em uma forma de<br />
realização, a variante ou fragmento seriam capazes de complementar a<br />
atividade do promotor nativo em um vírus hCMV, por exemplo possibilitando<br />
que o vírus retenha a capacidade para infectar e/ou replicar em células.<br />
15 Uma variante homóloga (ii) ou fragmento (iii) podem ser<br />
ensaiados quanto a capacidade para reter e/ou complementar a atividade de<br />
(i). Por exemplo, uma variante ou fragmento podem ser ensaiados quanto a<br />
capacidade para restaurar a funcionalidade (tal como a capacidade de infecção<br />
e/ou replicação) ao hCMV mutante em que o promotor inicial imediato do<br />
20 hCMV nativo é defeituoso.<br />
Uma variante homóloga (ii) ou fragmento (iii) podem ser<br />
testados quanto a utilidade usando o ensaio de Expressão Comparativa<br />
abaixo. A seqüência promotora de teste é trocada no vetor base no lugar do<br />
promotor inicial imediato do hCMV nativo. Tipicamente, uma variante<br />
25 funcional ou fragmento possibilita pelo menos 50%, por exemplo, 60, 70, 80,<br />
90% ou mais da expressão fornecida usando o vetor base. Uma variante<br />
funcional ou fragmento podem fornecer qualquer um dos níveis de expressão<br />
aqui aludidos. Em alguns exemplos, a variante ou fragmento podem fornecer<br />
um nível mais alto de expressão tal como pelo menos 50%, 100%, 150%,
35<br />
200%, 300% ou mais de aumento na atividade. No geral a expressão é<br />
fornecida em pelo menos um, mas preferivelmente dois, tipos de célula de<br />
referência. Tipicamente, as células de referência são células HEK, 293T,<br />
CHO, HeLa, BHK, 3T3 ou COS de mamífero. As células de referência podem<br />
5 ser células hospedeiras SSC-15 ou B16 em alguns exemplos.<br />
Adicional ou alternativamente, a seqüência promotora pode ser<br />
testada no Ensaio de Imunogenicidade Comparativa abaixo. A seqüência<br />
promotora de teste é trocada no vetor base no lugar do promotor inicial<br />
imediato do hCMV nativo. Uma seqüência promotora funcional tipicamente<br />
10 fornece títulos de anticorpo que são pelo menos tão altos quanto aqueles<br />
obtidos pelo vetor base com pelo menos um, preferivelmente dois antígenos.<br />
Preferivelmente os títulos de anticorpo são pelo menos 5%, 10%, 20%, 30%<br />
ou 40% mais altos do que com o vetor base. Em alguns casos, o nível de<br />
títulos de antígeno pode ser qualquer um daqueles aqui aludidos. Os antígenos<br />
15 adequados são os antígenos HBsAg, HSV 2gD e flu-M2. Os antígenos<br />
particularmente preferidos são antígenos da influenza. Os antígenos da<br />
influenza incluem os antígenos HA, NA, M2, NP, M1, PB1, PB2, PA, NS1 e<br />
NS2 e em particular os antígenos HA, NA e M2. Em uma forma de realização<br />
especialmente preferida o antígeno é HA ou um fragmento deste ou uma<br />
20 variante de cada um. De acordo com o ensaio, uma variante homóloga<br />
funcional (ii) ou fragmento funcional (iii) de seqüência promotora nativa (i) é<br />
tipicamente uma que possibilite os títulos de anticorpo mais altos obtidos pela<br />
seqüência nativa. Em alguns exemplos, o título de anticorpo pode ser<br />
levemente mais baixo incluindo qualquer um dos níveis aqui mencionados.<br />
25 Em exemplos onde uma construção da invenção codifica um<br />
polipeptídeo adjuvante, o teste da imunogenicidade comparativa pode ser<br />
utilizado com um antígeno padrão e comparando um vetor de teste que<br />
codifica um polipeptídeo de atividade adjuvante desconhecida com um vetor<br />
adjuvante padrão. Por exemplo, um vetor adjuvante de teste pode codificar
36<br />
um fragmento ou variante de um polipeptídeo adjuvante conhecido e ser<br />
comparado contra um vetor padrão que expressa o polipeptídeo adjuvante<br />
conhecido na sua capacidade para promover uma resposta imune quando<br />
administrado com um antígeno. Um fragmento ou variante pode ter qualquer<br />
5 um dos níveis de atividade aqui mencionados e em particular fornecerá pelo<br />
menos 50%, preferivelmente pelo menos 75%, mais preferivelmente pelo<br />
menos 85% e ainda mais preferivelmente pelo menos 100% da atividade<br />
adjuvante do adjuvante padrão. Preferivelmente o vetor de teste e o vetor<br />
padrão será idêntico, ou pelo menos substancialmente idêntico, à parte das<br />
10 seqüências que codificam o adjuvante/polipeptídeo sob teste.<br />
Como mencionado acima, a construção pode compreender a<br />
seqüência de exon (b) que compreende a seqüência derivada do exon 1 e exon<br />
2 do gene inicial imediato maior de hCMV. Os exons são seqüências<br />
codificadoras, que na natureza são no geral separados pelos introns. No gene<br />
15 inicial imediato maior do hCMV nativo, os exons 1 e 2 são usualmente<br />
separados pelo intron A nativo. Na presente construção quimérica a seqüência<br />
do exon 2 é no geral posicionada 3' da seqüência do exon 1, sem a seqüência<br />
de intron intercalada, de modo que as seqüências do exon 1 e exon 2 são<br />
contíguas.<br />
20 A seqüência do exon (b) pode compreender:<br />
(integral ou parcial);<br />
(i) a seqüência de exon nativa, tipicamente exon 1 e exon 2<br />
(ii) uma variante homóloga de (i) que é funcional; ou<br />
(iii) um fragmento funcional de (i) ou (ii).<br />
25 A seqüência (i) pode compreender de cerca de 50 a 100% da<br />
seqüência de exon 1 do gene inicial imediato maior do hCMV nativo, por<br />
exemplo, 60 a 90% ou 70 a 80%. Tipicamente pelo menos 50% da seqüência<br />
do exon 1 natural está presente, tal como 60%, 70%, 80%, 90% ou mais. A<br />
seqüência de exon (b) também compreende pelo menos uma parte da
37<br />
seqüência do exon 2. Na seqüência (i), tipicamente 2 ou mais bases de exon 2<br />
nativo, por exemplo 2 a 9, 2 a 7 ou 3 a 5 bases estão presentes. Até e<br />
incluindo 100% da seqüência de exon 2 natural, por exemplo de 5 a 95%, 20 a<br />
80% ou 40 a 60% da seqüência de exon 2 natural pode estar presente.<br />
5 Tipicamente a variante homóloga tem qualquer um dos comprimentos acima<br />
mencionados para a seqüência nativa.<br />
Preferivelmente (i) compreende a SEQ ID No. 2. Em uma<br />
outra forma de realização preferida (i) compreende os nucleotídeos de 1588 a<br />
1718 da SEQ ID NO: 54. Em uma outra forma de realização preferida (i)<br />
10 compreende os nucleotídeos de 1588 a 1718 da SEQ ID No. 14. Em um outro<br />
exemplo preferido (i) compreende os nucleotídeos de 1684 a 1814 e/ou de<br />
2633 a 2763 da SEQ ID No. 51. Em uma outra forma de realização preferida,<br />
(i) pode compreender os nucleotídeos de 1687 a 1817 e/ou de 3309 a 3439 da<br />
SEQ ID No: 62.<br />
15 Assim, em uma forma de realização particularmente preferida<br />
a seqüência de exon (b) do promotor quimérico compreende:<br />
(i) a seqüência de nucleotídeo da SEQ ID No.2, a seqüência de<br />
nucleotídeo dos nucleotídeos de 1588 a 1718 da SEQ ID No. 54, nucleotídeos<br />
de 1684 a 1814 da SEQ ID No: 61, nucleotídeos de 2633 a 2763 da SEQ ID<br />
20 No: 61, nucleotídeos de 1687 a 1817 da SEQ ID No: 62 e/ou nucleotídeos de<br />
3309 a 3439 da SEQ ID No: 62;<br />
(ii) uma variante funcional de (i) que tem pelo menos 80% de<br />
homologia de seqüência de nucleotídeo a uma ou mais das seqüências de (i);<br />
e/ou<br />
25 (iii) um fragmento funcional de (i) ou (ii).<br />
A seqüência de exon adequada (b) pode ser obtida usando<br />
métodos conhecidos. Ver por exemplo, Sambrook et al., supra, para uma<br />
descrição de técnicas usadas para obter e isolar o DNA. A seqüência de gene<br />
inicial imediata maior do hCMV nativo pode ser isolada diretamente de uma
38<br />
amostra do vírus, usando técnicas padrão (ver por exemplo, MacLean, A<br />
(1998) "Preparation of HSV-DNA and Production of Infectious Virus" em<br />
Herpes Simplex Virus Protocols S. Brown, A Maclean, editores, Humana<br />
Press, Totowa, NJ, pp. 19-26). A seqüência de um gene inicial imediato maior<br />
5 hCMV, incluindo a localização do exon 1 e exon 2, é disponível no Genbank<br />
#M60321, X17403. As seqüências de exon 1 e 2 nativas portanto podem ser<br />
isoladas cortando-se a seqüência de gene maior nativa nos sítios de restrição<br />
apropriados ou pela PCR usando iniciadores de PCR com base na seqüência<br />
conhecida. As seqüências de exon adequadas alternativamente podem ser<br />
10 isoladas a partir de um vetor plasmídeo existente, tal como pWRG7128. As<br />
seqüências de exon também podem ser produzidas sinteticamente, ao invés de<br />
clonadas. As seqüências variantes podem ser facilmente construídas pelas<br />
metodologias de rotina tais como a mutagênese direcionada ao sítio.<br />
No geral a seqüência de exon, quando presente na construção<br />
15 da invenção, realçará a expressão, tipicamente causando realce comparável<br />
para as seqüências de exon 1 e exon 2 nativas (i) mencionadas acima.<br />
A seqüência de exon pode ser ensaiada quanto a<br />
funcionalidade usando o Ensaio de Expressão Comparativa abaixo. A<br />
seqüência de exon de teste é trocada no vetor base no lugar da seqüência de<br />
20 exon já presente. No geral a seqüência de exon é funcional se a seqüência não<br />
anula a expressão, mas preferivelmente aumenta a expressão em pelo menos<br />
um, preferivelmente dois tipos de célula de referência quando comparado com<br />
o vetor base. Tipicamente as células de referência são células HEK293T,<br />
CHO, HeLa, BHK, 3T3 ou COS de mamífero. As células SSC15 ou B16<br />
25 podem ser usadas. Preferivelmente a expressão aumenta em pelo menos 5%,<br />
10%, 20%, 30% ou 40%. A expressão pode aumentar em qualquer um dos<br />
níveis aqui mencionados. De acordo com este ensaio, uma variante homóloga<br />
funcional (ii) ou fragmento funcional (iii) de seqüência de exon natural (i) é<br />
uma que tipicamente possibilita pelo menos 50% da melhora da expressão
39<br />
fornecida pela seqüência natural. Em alguns exemplos, onde o nível de<br />
expressão é mais baixo do que aquele dado pelo nível base, a diminuição pode<br />
ser qualquer um dos níveis aqui mencionados.<br />
Adicional ou alternativamente, a seqüência de exon pode ser<br />
5 testada no Ensaio de Imunogenicidade Comparativa abaixo. A seqüência de<br />
exon de teste é trocada no vetor base no lugar da seqüência de exon já<br />
presente. A seqüência de exon funcional fornece títulos de anticorpo que são<br />
tipicamente pelo menos tão altos quanto ou mais altos do que aqueles obtidos<br />
pelo vetor base com pelo menos um, preferivelmente dois antígenos.<br />
10 Preferivelmente os títulos de anticorpo são pelo menos 5%, 10%, 20%, 30%<br />
ou 40% mais altos do que com o vetor base. O aumento pode ser qualquer um<br />
dos níveis aqui mencionados. Os antígenos preferidos são os antígenos<br />
HBsAg, HSV 2gD e flu-M2. Os antígenos especialmente preferidos são os<br />
antígenos da influenza, incluindo qualquer um daqueles aqui mencionados e<br />
15 em particular os antígenos HA, NA e M2. O uso de antígeno HA, um<br />
fragmento imunogênico deste ou uma variante imunogênica de cada um é<br />
especialmente preferido. De acordo com este ensaio, uma variante homóloga<br />
funcional (ii) ou fragmento funcional (iii) da seqüência de exon natural (i) é<br />
uma que tipicamente possibilita os títulos de anticorpo mais altos obtidos pela<br />
20 seqüência natural. Em exemplos onde o nível do título de anticorpo é<br />
levemente mais baixo, a diminuição pode ser qualquer uma dos níveis aqui<br />
mencionados. Os vetores adjuvantes podem ser avaliados em uma maneira<br />
equivalente como debatido acima.<br />
A construção de promotor quimérico compreende o intron<br />
25 heterólogo (c) no lugar da região A do intron nativo do gene inicial imediato<br />
maior de hCMV. Um intron é uma seqüência não codificadora que é unida a<br />
partir do hnRNA transcrito de um gene. Um intron heterólogo é um que não<br />
está presente na seqüência codificadora na natureza.<br />
O intron heterólogo (c) substitui total ou parcialmente, o intron
40<br />
A nativo do gene inicial imediato maior de hCMV. Tipicamente o intron A<br />
nativo é ausente.<br />
No geral o intron heterólogo (c) é 3' da seqüência de exon (b).<br />
Tipicamente o intron heterólogo (c) compreende:<br />
5 (i) um intron natural;<br />
(ii) uma variante homóloga funcional de (i); ou<br />
(iii) um fragmento funcional de (i) ou (ii).<br />
O intron heterólogo (c) é no geral um intron viral ou<br />
eucariótico. Preferivelmente o intron é um intron de mamífero, em particular<br />
10 um intron não humano, por exemplo um intron de rato pode ser utilizado. Em<br />
alguns exemplos, um intron de galinha pode ser utilizado. Preferivelmente o<br />
intron é um intron A, por exemplo, intron A da insulina de rato, intron A da<br />
queratina de galinha ou intron A da actina cardíaca de galinha. Em uma forma<br />
de realização especialmente preferida o intron é intron A da insulina de rato.<br />
15 Em uma forma de realização preferida o intron heterólogo (c)<br />
compreende uma seqüência selecionada da seqüência de intron A do gene da<br />
insulina de rato, seqüência de intron A do gene da queratina de galinha,<br />
seqüência de intron A do gene da actina cardíaca de galinha, um fragmento<br />
funcional de qualquer um destes ou uma variante funcional de qualquer um<br />
20 dos precedentes.<br />
Tipicamente o intron (c) tem um comprimento de cerca de 50<br />
nucleotídeos a cerca de 1000 nucleotídeos, por exemplo de cerca de 100 a<br />
cerca de 500 nucleotídeos. O intron (c) pode por exemplo, compreender de 50<br />
a 500 nucleotídeos, tal como até 100, 200, 300 ou 400 nucleotídeos.<br />
25 Preferivelmente o intron compreende a seqüência encontrada em torno dos<br />
nucleotídeos de 50 a 133 do intron A da insulina de rato nativa, ou um<br />
homólogo desta seqüência.<br />
Preferivelmente o intron heterólogo (c) é capaz de ser unido a<br />
partir de um RNA transcrito em uma célula hospedeira eucariótica. No geral o
41<br />
intron compreende uma ou mais de uma seqüência doadora (tal como GT),<br />
uma seqüência aceitadora (tal como AG), uma região rica em pirimidina 3' e<br />
uma seqüência em ponto de ramificação. A região rica em pirimidina, se<br />
presente, pode incluir, por exemplo pelo menos 5, 8, 10 ou mais pirimidinas.<br />
5 Preferivelmente o intron compreende pelo menos uma seqüência doadora,<br />
seqüência aceitadora e uma seqüência em ponto de ramificação. Tipicamente<br />
na construção quimérica, o intron (c) compreende seqüências flanqueadoras<br />
que não intron que são derivadas de seqüências de exon encontradas nos<br />
limites intron/exon do intron natural (i). A seqüência de exon flanqueadora<br />
10 pode ser a seqüência de exon nativa ou um homólogo desta seqüência que<br />
retenha substancialmente a mesma atividade como a seqüência nativa, por<br />
exemplo retenha a função de união. Tipicamente de 5 a 10, preferivelmente de<br />
7 a 10 bases de seqüência de exon são incluídas em cada extremidade do<br />
intron.<br />
15 O intron (c) pode ser um intron artificial, contanto que o intron<br />
seja funcional. Por exemplo, um intron recombinante ou quimérico pode ser<br />
usado. Um tal intron pode compreender a seqüência de mais do que um intron<br />
natural.<br />
Tipicamente o intron (c) compreende as seqüências presentes<br />
20 no intron A de hCMV que liga fatores de transcrição ou proteínas reguladoras<br />
ou ao invés de qualquer uma destas seqüências, homólogos destas seqüências<br />
capazes de ligar os mesmos fatores ou proteínas. Tipicamente tais seqüências<br />
ou seus homólogos estão presentes no intron (c) na mesma ordem e/ou<br />
substancialmente no mesmo espaçamento relativo como no intron A de<br />
25 hCMV.<br />
O intron (c) pode compreender uma variante homóloga (ii) em<br />
que a seqüência do intron natural (i) foi modificada para remover um sítio de<br />
restrição interno. Por exemplo, uma variante homóloga de intron A da<br />
insulina de rato pode ser usada em que um sítio Nhel interno foi destruído.
5<br />
42<br />
Preferivelmente, o intron (c) compreende:<br />
(i) A SEQ ID No. 3;<br />
(ii) uma variante homóloga funcional de (i); ou<br />
(iii) um fragmento funcional de (i) ou (ii).<br />
Em um outro exemplo preferido, (i) pode compreender os<br />
nucleotídeos de 1725 a 1857 da SEQ ID NO: 54 ou os mesmos nucleotídeos<br />
da SEQ ID No. 14. Em uma outra forma de realização preferida (i) pode<br />
compreender os nucleotídeos de 1545 a 1677 e/ou de 2770 a 2902 da SEQ ID<br />
No: 61. Em um outro exemplo preferido, (i) pode compreender os<br />
10 nucleotídeos de 1824 a 1956 e/ou de 3446 a 3578 da SEQ ID No: 62.<br />
insulina de rato compreende:<br />
Em um exemplo preferido, a seqüência de intron A do gene da<br />
(i) a seqüência de nucleotídeo da SEQ ID No. 3, a seqüência<br />
de nucleotídeo dos nucleotídeos de 1725 a 1857 da SEQ ID No. 54, os<br />
15 nucleotídeos de 1545 a 1677 da SEQ ID No: 61, os nucleotídeos de 2770 a<br />
20 e/ou<br />
2902 da SEQ ID No: 61, os nucleotídeos de 1824 a 1956 da SEQ ID No: 62<br />
e/ou os nucleotídeos de 3446 a 3578 da SEQ ID No: 62;<br />
(ii) uma variante funcional de (i) que tenha pelo menos 80% de<br />
homologia de seqüência de nucleotídeo a uma ou mais das seqüências de (i);<br />
(iii) um fragmento funcional de (i) ou (ii).<br />
A seqüência de intron (c) pode ser obtida usando técnicas de<br />
clonagem padrão. Por exemplo, a seqüência de intron A da insulina de rato<br />
está disponível no GenBank J00748, a seqüência de intron A da queratina de<br />
25 galinha no GenBank J00847 e a seqüência de intron A cardíaco de galinha no<br />
GenBank X02212. A seqüência de intron pode ser isolada a partir de fontes<br />
naturais usando iniciadores com base na seqüência conhecida. A seqüência<br />
pode ser preparada sinteticamente. As seqüências variantes podem ser obtidas<br />
pela mutagênese.
43<br />
Tipicamente uma seqüência de intron funcional, por exemplo<br />
uma variante funcional (ii) ou um fragmento funcional (iii) é uma que tenha<br />
substancialmente a mesma atividade como, e/ou complemente a atividade de<br />
um intron natural (i). Em uma forma de realização a atividade é a atividade de<br />
união.<br />
As seqüências de intron (c) podem ser testadas quanto a<br />
atividade de união usando um ensaio de união de rotina. No geral um<br />
homólogo funcional (ii) ou fragmento funcional (iii) mostrarão pelo menos<br />
50%, por exemplo 60%, 70%, 80%, 90% e até 100% ou mais da eficiência de<br />
10 união do intron natural (i) no ensaio.<br />
No geral a seqüência heteróloga do intron, quando presente na<br />
construção da invenção, realçará a expressão. Tipicamente, uma intron<br />
variante (ii) ou fragmento (iii) causará realce comparável a um intron natural<br />
(i). Em alguns casos, uma diminuição na expressão seria observada incluindo<br />
15 qualquer um dos níveis aqui mencionados.<br />
A funcionalidade da seqüência de intron potencial (c) pode ser<br />
testada usando o Ensaio de Expressão Comparativa abaixo. O intron<br />
heterólogo é trocado no vetor base. No geral a seqüência heteróloga de intron<br />
é funcional se a adição da seqüência aumenta a expressão em pelo menos um,<br />
20 mas preferivelmente dois tipos de célula de referência em 25% ou mais,<br />
comparado com o vetor base. Tipicamente as células de referência são células<br />
HEK293T, CHO, HeLa, BHK, 3T3 ou COS de mamífero. As células SSC15<br />
ou B16 podem ser usadas. O aumento na expressão pode ser de pelo menos<br />
35%, 45%, 55% ou mais. O aumento pode ser qualquer um dos níveis aqui<br />
25 mencionados. De acordo com este ensaio, uma variante funcional (i) ou<br />
fragmento funcional (ii) de uma seqüência de intron natural (i) é tipicamente<br />
uma que possibilite mais do que 50% da melhora na expressão obtidos pela<br />
seqüência natural. Em casos onde uma diminuição na expressão é observada a<br />
diminuição, por exemplo, pode ser qualquer um dos níveis aqui mencionados.
44<br />
Uma seqüência de intron heterólogo (c), adicional ou<br />
alternativamente pode ser testada quanto a funcionalidade usando o Ensaio de<br />
Imunogenicidade Comparativa abaixo. A seqüência de intron (c) é adicionada<br />
ao vetor base. Uma seqüência de intron (c) funcional fornece títulos de<br />
5 anticorpo que são mais altos do que aqueles obtidos pelo vetor base com pelo<br />
menos um, preferivelmente dois antígenos. Preferivelmente, os títulos de<br />
anticorpo são pelo menos 5 ou 10%, por exemplo 20%, 30% ou 40% mais<br />
altos do que com o vetor base. Os antígenos preferidos são os antígenos<br />
HSV2gD e Flu-M2. Os antígenos especialmente preferidos são os<br />
10 antígenos da influenza, incluindo qualquer um daqueles aqui mencionados e<br />
em particular os antígenos HA, NA e M2. Em particular, o antígeno HA, um<br />
fragmento imunogênico deste ou uma variante imunogênica de cada um pode<br />
ser utilizado. De acordo com este ensaio, uma variante funcional (ii) ou<br />
fragmento funcional (iii) de uma seqüência de intron natural (i) é tipicamente<br />
15 uma que possibilite os títulos de anticorpo mais altos obtidos pela seqüência<br />
natural. Em alguns casos uma diminuição pode ser observada, os níveis, por<br />
exemplo, podem ser qualquer um daqueles aqui mencionados. Os vetores<br />
adjuvantes podem ser avaliados em uma maneira equivalente como aqui<br />
debatido em outra parte.<br />
20 A seqüência de intron heteróloga adequada pode ser obtida<br />
usando técnicas de clonagem padrão. Por exemplo, a seqüência de intron A da<br />
insulina de rato está disponível no GenBank J00748, o intron A de queratina<br />
de galinha no GenBank J00847, e intron A da actina cardíaca de galinha em<br />
X02212. A seqüência de intron pode ser isolada a partir de fontes nativas<br />
25 usando iniciadores com base nos dados de seqüência conhecidos. A seqüência<br />
adequada também pode ser preparada sinteticamente.<br />
As seqüências componentes (a), (b) e (c) podem ser fornecidas<br />
adequadamente ligadas juntas para formar um promotor quimérico usando<br />
técnicas de clonagem ou biologia molecular padrão. Preferivelmente a
45<br />
seqüência de intron (c) é fornecida 3' da seqüência de exon (b). a construção<br />
de promotor quimérica é ligada a um sítio de clonagem, em um tal modo que<br />
o promotor efetuará a expressão de uma seqüência codificadora inserida no<br />
sítio, quando as enzimas apropriadas estão presentes. Os sítios de clonagem<br />
5 adequados, incluindo sítios de clonagem múltipla são conhecidos na técnica,<br />
por exemplo, os sítios de clonagem múltipla pUC19, pBC SK, pBluescript II<br />
KS, cDNA3.1, pSP72, pGEM 7Z. Qualquer sítio de restrição adequado, por<br />
exemplo, pode ser usado como um sítio de clonagem para inserir as<br />
seqüências codificadoras.<br />
10 Em uma forma de realização preferida, o promotor quimérico<br />
utilizado compreende:<br />
(i) a seqüência de nucleotídeo da SEQ ID No. 4 ou a seqüência<br />
de nucleotídeo dos nucleotídeos de 903 a 1857 da SEQ ID No. 54;<br />
(ii) uma variante funcional de (i) que tenha pelo menos 80% de<br />
15 homologia de seqüência de nucleotídeo a (i); e/ou<br />
(iii) um fragmento funcional de (i) ou (ii).<br />
Em um outro exemplo preferido, o promotor quimérico<br />
utilizado pode ser um que compreende a seqüência da SEQ ID No: 14.<br />
Tipicamente, um ácido nucleico para a inserção (ou inserida)<br />
20 no sítio de clonagem codifica um polipeptídeo terapeuticamente relevante. É<br />
preferido que a seqüência codificadora seja adequada para o uso na<br />
imunização com ácido nucleico ou terapia de gene. O inserto de ácido<br />
nucleico pode assim compreender uma seqüência capaz de fornecer<br />
imunidade, por exemplo uma seqüência imunogênica que evoque uma<br />
25 resposta imune humoral e/ou celular quando liberada a um indivíduo.<br />
Alternativamente, o ácido nucleico pode compreender um ou mais genes que<br />
codifiquem um polipeptídeo terapêutico por exemplo, uma proteína<br />
defeituosa ou que falte de um genoma da célula alvo ou uma proteína não<br />
nativa tendo um efeito biológico ou terapêutico desejado (por exemplo, uma
46<br />
função antiviral). A construção pode codificar um polipeptídeo adjuvante.<br />
Para o tratamento de distúrbios genéticos, os genes funcionais que<br />
correspondem aos genes conhecidos como sendo deficientes no distúrbio<br />
particular podem ser administrados a um indivíduo. Preferivelmente o ácido<br />
5 nucleico é DNA. O ácido nucleico em alguns exemplos pode ser RNA ou<br />
PNA.<br />
Em alguns exemplos um RNA não codificador pode ser<br />
expressado por uma construção da invenção. Assim o vetor pode ter inserido<br />
no sítio de clonagem uma região que pode dar origem a um tal RNA, por<br />
10 exemplo um RNA anti-sentido ou SiRNA. O RNA anti-sentido ou SiRNA,<br />
por exemplo, pode inibir a expressão de qualquer um dos genes aqui<br />
mencionados ou um gene de qualquer um dos patógenos aqui mencionados.<br />
Entretanto, na maioria das formas de realização preferidas, um polipeptídeo é<br />
codificado.<br />
15 Os ácido nucleicos adequados para a inserção incluem aqueles<br />
usados para o tratamento de doenças inflamatórias, autoimune, doenças<br />
crônicas e infecciosas, incluindo distúrbios tais como AIDS, câncer, doenças<br />
neurológicas, doença cardiovascular, hipercolestemia; vários distúrbios<br />
sangüíneos incluindo várias anemias, talassemia e hemofilia; defeitos<br />
20 genéticos tais como fibrose cística, Doença de Gaucher, deficiência na<br />
adenosina desaminase (ADA), enfisema, etc.<br />
As construções na invenção podem ser usadas para tratar ou<br />
prevenir uma condição. As construções podem ser usadas para melhorar uma<br />
condição e/ou eliminar ou reduzir um sintoma particular, ou todos, de um<br />
25 distúrbio. Em um exemplo particularmente preferido as construções podem<br />
ser usadas para vacinar um indivíduo contra um patógeno.<br />
Por exemplo, em métodos para o tratamento de tumores<br />
sólidos, genes que codificam peptídeos tóxicos (isto é, agentes<br />
quimioterapêuticos tais como ricina, toxina da difteria e fator de veneno de
47<br />
cobra), genes supressores de tumor tais como p53, genes que codificam<br />
seqüências de mRNA que são anti-sentido para transformar oncogenes,<br />
peptídeos antineoplásticos tais como fator de necrose de tumor (TNF) e outras<br />
citocinas, ou mutantes transdominantes negativos de oncogenes<br />
5 transformadores, podem ser inseridos para a expressão no local do tumor ou<br />
próximo a este.<br />
Em uma forma de realização preferida uma construção da<br />
invenção pode codificar um polipeptídeo para tratar ou prevenir um câncer.<br />
Em uma forma de realização particularmente preferida uma construção da<br />
10 invenção pode codificar um antígeno de tumor. Os exemplos de antígenos<br />
associados a tumor incluem, mas não são limitados a, antígenos de testículos<br />
cancerosos tais como membros da família MAGE (MAGE 1, 2, 3 etc), NY-<br />
ESO-1 e SSX-2, antígenos de diferenciação tais como tirosinase, gp100, PSA,<br />
Her-2 e CEA, auto antígenos mutados e antígenos de tumor viral tais como E6<br />
15 e/ou E7 de tipos HPV oncogênicos. Outros exemplos de antígenos de tumor<br />
particulares incluem MART-1, Melan-A, p97, beta-HCG, Ga1NAc, MAGE-1,<br />
MAGE-2, MAGE-4, MAGE-12, MUC1, MUC2, MUC3, MUC4, MUC18,<br />
CEA, DDC, P1A, EpCam, antígeno de melanoma gp75, Hker 8, antígeno de<br />
melanoma de peso molecular alto, K19, Tyrl, Tyr2, membros da família de<br />
20 gene pMel 17, c-Met, PSM (antígeno de mucina da próstata), PSMA<br />
(antígeno de membrana específico da próstata), proteína secretora da próstata,<br />
alfa-fetoproteína, antígenos CAl25, CA19.9, TAG-72, BRCA-1 e BRCA-2.<br />
Os exemplos de cânceres particulares que o antígeno pode ser<br />
derivado incluem aqueles de cânceres do pulmão, próstata, mama, cólon,<br />
25 ovário, testículo, intestino, melanoma, um linfoma e uma leucemia. As<br />
construções da invenção também podem ser usadas para tratar ou prevenir tais<br />
cânceres.<br />
Similarmente, os ácido nucleicos que codificam polipeptídeos<br />
conhecidos para demonstrar a atividade antiviral e/ou antibacteriana, ou
48<br />
estimular o sistema imune do hospedeiro, também podem ser incluídos. O<br />
ácido nucleico pode codificar uma das várias citocinas (ou fragmentos<br />
funcionais destas), tais como as interleucinas, interferons e fatores<br />
estimuladores de colônia.<br />
5 Em um exemplo preferido, as seqüências codificadoras podem<br />
codificar um antígeno, fragmento imunogênico deste ou variante imunogênica<br />
de cada um. O antígeno em particular pode ser um antígeno de patógeno viral,<br />
bacteriano, parasítico ou fúngico ou um antígeno de tumor. Em um exemplo<br />
preferido, o antígeno é um antígeno viral, um fragmento imunogênico deste<br />
10 ou uma variante imunogênica de cada um.<br />
O ácido nucleico pode codificar um antígeno para o tratamento<br />
ou prevenção de vários condições incluindo mas não limitadas ao câncer,<br />
alergias, toxicidade e infecção por um patógeno tal como, mas não limitado a,<br />
fungo, vírus incluindo os Vírus do Papiloma Humano (1-IPV), HIV,<br />
15 HSV2/HSV1, vírus da influenza (tipos A, B e C), vírus da poliomielite, vírus<br />
RSV, Rinovírus, Rotavírus, vírus da Hepatite A, Grupo do Vírus Norwalk,<br />
Enterovírus, Astrovírus, vírus do sarampo, vírus da Para Influenza, vírus da<br />
caxumba, vírus Varicela-Zoster, Citomegalovírus, vírus Epstein-Barr,<br />
Adenovírus, vírus da Rubéola, vírus tipo I do Linfoma de célula T Humano<br />
20 (HTLV-I), vírus da Hepatite B (HBV), vírus da Hepatite C (HCV), vírus da<br />
Hepatite D, vírus Pox, Marburg e Ebola; bactérias incluindo M tuberculosis,<br />
Chlamydia, N. gonorrhoeae, Shigella, Salmonella, Vibrio Cholera,<br />
Treponema pallidua, Pseudomonas, Bordetella pertussis, Brucella,<br />
Franciscella tulorensis, Helicobacter pylori, Leptospria interrogaus,<br />
25 Legionella pnumophila, Yersinia pestis, Streptococcus (tipos A e B),<br />
Pneumococcus, Meningococcus, Hemophilus influenza (tipo b), Toxoplama<br />
gondii, Complybacteriosis, Moraxella catarrhalis, Donovanosis, e<br />
Actinomycosis; patógenos fúngicos incluindo Candidíase e Aspergilose;<br />
patógenos parasíticos incluindo Tênia, Trematóides, nematelmintos,
49<br />
Amebíase, Giardíase, Cryptosporidium, Schitosoma, Pneumocystis carinii,<br />
Trichomoniasis e Trichinosis. O ácido nucleico também pode ser usado para<br />
fornecer uma resposta imune adequada contra numerosas doenças<br />
veterinárias, tais como doenças do Pé e da Boca, Coronavírus, Pasteurella<br />
5 multocida, Helicobacter, Forteylus vulgaris, Actinobacillus<br />
pleuropneumonia, vírus da diarréia viral bovina (BVDV), Klebsiella<br />
pneumoniae, E. coli, Bordetella pertussis, Bordetella parapertussis e<br />
Bordetella brochiseptica. Assim em um aspecto, as construções de ácido<br />
nucleico da presente invenção podem encontrar uso em uma vacina. As<br />
10 vacinas da invenção podem ser usadas para vacinar contra qualquer um dos<br />
patógenos e condições aqui mencionados. Assim, a invenção fornece uma<br />
composição de vacina que compreende uma construção de ácido nucleico da<br />
invenção ou uma população de construções de ácido nucleico da invenção ou<br />
partículas revestidas da invenção.<br />
15 Em um exemplo preferido uma construção de ácido nucleico<br />
da invenção pode codificar um antígeno de um membro da adenoviridae<br />
(incluindo por exemplo um adenovírus humano), herpesviridae (incluindo por<br />
exemplo HSV-1, HSV-2, EBV, CMV e VZV), papovaviridae (incluindo por<br />
exemplo HPV), poxviridae (incluindo por exemplo varíola e vacínia),<br />
20 parvoviridae (incluindo por exemplo parvovírus B 19), reoviridae (incluindo<br />
por exemplo um rotavírus), coronaviridae (incluindo por exemplo SARS),<br />
flaviviridae (incluindo por exemplo febre amarela, vírus do Nilo Ocidental,<br />
dengue, hepatite C e encefalite transportada por carrapato), picornaviridae<br />
(incluindo pólio, rinovírus, e hepatite A), togaviridae (incluindo por exemplo<br />
25 o vírus da rubéola), filoviridae (incluindo por exemplo Marburg e Ebola),<br />
paramyxoviridae (incluindo por exemplo um vírus da parainfluenza, vírus<br />
sincial respiratrório, cachumba e sarampo), rhabdoviridae (incluindo por<br />
exemplo vírus da raiva), bunyaviridae (incluindo por exemplo vírus Hantaan),<br />
orthomyxoviridae (incluindo por exemplo os vírus da influenza A, B e C),
50<br />
retroviridae (incluindo por exemplo HIV e HTLV) e hepadnaviridae<br />
(incluindo por exemplo hepatite B). Em um outro exemplo preferido o<br />
antígeno pode ser de um patógeno responsável por uma doença veterinária e<br />
em particular pode ser de um patógeno virai, incluindo, por exemplo, um<br />
5 Reovírus (tal como doença do cavalo africano ou vírus da língua azul) e vírus<br />
do Herpes (incluindo herpes eqüino). O antígeno pode ser um do vírus da<br />
Doença do Pé e Boca. Em um outro exemplo preferido o antígeno pode ser de<br />
um vírus da encefalite transportada por carrapato, vírus do dengue, SARS,<br />
vírus do Nilo Ocidental e vírus Hantaan.<br />
10 Em um outro caso preferido o antígeno pode ser de um<br />
retroviradae (e.g. HTLV-I; HTLV-II; ou HIV-I (também conhecido como<br />
HTLV-III, LAV, ARV, hTLR, etc.)). Em particular do HIV e em particular os<br />
isolados HIVIIIb, HIVSF2, HTVLAV, HIVLAI, HIVMN; HIV-1CM235,<br />
HIV-1; ou HIV-2. Em uma forma de realização particularmente preferida, o<br />
15 antígeno pode ser um antígeno do vírus da imunodeficiência humana (HW).<br />
Os exemplos de-antígenos -do- MV preferidos incluem, por exemplo, os<br />
antígenos gp120, gp 160 gp41, gag tais como p24gag e p55gag, bem como<br />
proteínas derivadas das regiões pol, env, tat, vif, rev, nef, vpr, vpu ou LTR do<br />
HIV. Em um caso particularmente preferido o antígeno pode ser HIV gp120<br />
20 ou uma porção de HIV gp120. O antígeno pode ser de um vírus da<br />
imunodeficiência, e, por exemplo, pode ser de SIV ou um vírus da<br />
imunodeficiência felina.<br />
Assim, o polipeptídeo codificado pode ser um antígeno, um<br />
fragmento imunogênico deste ou uma variante imunogênica deste. O<br />
25 fragmento ou variante, por exemplo, pode ter qualquer um dos níveis de<br />
homologia, proporção do comprimento do antígeno original, e funcionalidade<br />
aqui especificados e em particular a capacidade para dar origem a uma<br />
resposta imune. Em alguns exemplos, a seqüência codificadora da construção<br />
de ácido nucleico pode ter sido modificada para otimizar a expressão. Por
51<br />
exemplo, o uso de códon pode ser modificado para aquele típico do indivíduo.<br />
Uma seqüência Kozak de consenso para o indivíduo também pode ser<br />
substituído para a seqüência que ocorre naturalmente em torno do códon de<br />
partida.<br />
5 Em uma forma de realização especialmente preferida a<br />
construção de ácido nucleico da invenção compreende uma seqüência<br />
codificadora que codifica um antígeno da influenza, um fragmento<br />
imunogênico deste ou uma variante imunogênica de cada um. O fragmento<br />
e/ou variante podem ter qualquer um dos níveis de homologia de seqüência,<br />
10 comprimentos de fragmento e/ou níveis de funcionalidade aqui especificados.<br />
Em particular, preferivelmente uma seqüência codificadora da construção<br />
codifica um antígeno do vírus da influenza, um fragmento imunogênico de<br />
um antígeno do vírus da influenza ou uma variante imunogênica com 80% de<br />
homologia de aminoácido para qualquer um dos precedentes.<br />
15 Por exemplo o antígeno da influenza pode ser um antígeno NP<br />
(nucleoproteína/ proteína nucleocapsídica), HA (hemaglutinina), NA<br />
(neuraminidase), M1, M2, PB1, PB2, PA, NS1 e/ou NS2 da influenza ou<br />
pode ser um fragmento ou variante de tais antígenos. Em uma forma de<br />
realização preferida o antígeno codificado pode ser o antígeno HA, NA e/ou<br />
20 M2 da influenza ou um fragmento ou uma variante de tais antígenos. Em um<br />
exemplo especialmente preferido, o antígeno codificado pode ser um antígeno<br />
HA ou um NA ou um fragmento ou variante de tais antígenos e em particular<br />
um antígeno HA ou um fragmento ou variante de um tal antígeno.<br />
Assim, em uma construção especialmente preferida da<br />
25 invenção o antígeno codificado é a hemaglutinina da influenza (HA), um<br />
fragmento imunogênico deste ou uma variante imunogênica com 80% de<br />
homologia de seqüência de aminoácido a cada um. Em um outro exemplo<br />
preferido o antígeno codificado é a Neuraminidase (NA) da influenza, M2,<br />
um fragmento imunogênico de cada um ou uma variante imunogênica com
52<br />
80% de homologia de seqüência de aminoácido a qualquer um dos<br />
precedentes.<br />
Em um exemplo preferido, uma construção da invenção pode<br />
codificar mais do que um polipeptídeo e em particular mais do que um<br />
5 antígeno da influenza, fragmento imunogênico ou variante imunogênica de<br />
cada um. Em exemplos onde mais do que um antígeno deva ser utilizado em<br />
um exemplo preferido os antígenos HA e NA podem ser utilizados juntos ou<br />
um fragmento ou uma variante de tais antígenos.<br />
Em exemplos onde uma construção da invenção expressa mais<br />
10 do que um antígeno da influenza, fragmento imunogênico, ou variante<br />
imunogênica de cada um, pelo menos dois dos antígenos diferentes,<br />
fragmentos ou variantes codificados são do mesmo polipeptídeo da influenza<br />
de cepas diferentes do vírus da influenza.<br />
Em uma forma de realização preferida o antígeno pode ser da<br />
15 cepa H5N1 da influenza e fragmentos imunogênicos deste e variantes de cada<br />
um que retenham a imunogenicidade podem ser utilizados. Em particular, o<br />
antígeno pode ser um da cepa H5N1 ou um fragmento de um tal antígeno.<br />
Em alguns exemplos, o antígeno pode ser um fragmento ou<br />
variante de um polipeptídeo da influenza que ocorra naturalmente. Por<br />
20 exemplo, o antígeno pode corresponder a uma sub-região de um polipeptídeo<br />
da influenza que ocorra naturalmente incluindo qualquer um dos vários<br />
comprimentos de fragmento aqui aludidos. O antígeno pode ser uma variante<br />
de um antígeno da influenza que ocorre naturalmente ou de um fragmento de<br />
um tal antígeno. Preferivelmente tais variantes e/ou fragmentos serão capazes<br />
25 de dar origem a uma resposta imune capaz de reconhecer o antígeno e em<br />
particular o vírus da influenza do qual o fragmento ou variante é derivado.<br />
O antígeno da influenza pode ser de qualquer vírus da<br />
influenza. O antígeno pode ser do vírus da influenza A, B ou C, em particular<br />
da influenza A e/ou B. O antígeno pode ser de uma cepa da influenza variante
53<br />
e em particular uma cepa variante associada com infectividade ou<br />
patogenicidade aumentadas da cepa da influenza. O antígeno, por exemplo,<br />
pode ser de uma das cepas identificadas anualmente pela World Health<br />
Organization para serem usadas em vacinas contra a influenza e em particular<br />
5 pode ser um antígeno identificado pela WHO para tal uso. Em um exemplo<br />
preferido, uma construção de ácido nucleico, população de ácidos nucleicos, a<br />
composição farmacêutica ou vacina da invenção pode codificar um antígeno<br />
de cada uma das três cepas da influenza e em particular as três cepas<br />
identificadas pela WHO ou outras autoridades equivalentes em um ano<br />
10 particular.<br />
Em um exemplo preferido, um ou mais dos antígenos da<br />
influenza codificados podem originar de uma cepa da influenza pandêmica.<br />
Assim, o antígeno da influenza, fragmento ou variante imunogênicos de cada<br />
um podem ser de uma cepa da influenza pandêmica. Uma construção que<br />
15 codifica o antígeno da cepa pandêmica, por exemplo, pode ser administrada,<br />
ou estar presente, por si só. Em outros, a construção também pode codificar,<br />
ou ser administrada com outras construções que codificam, outros antígenos.<br />
Em um caso preferido, um antígeno de uma cepa da influenza pandêmica e<br />
um antígeno de uma cepa da influenza não pandêmica podem ser codificados<br />
20 na mesma ou em construções separadas. Em particular, um antígeno flu<br />
pandêmico e um antígeno de 1, 2, 3, 4, 5, 6 ou mais cepas da influenza não<br />
pandêmicas podem ser administrados, preferivelmente um antígeno de cada<br />
uma de 3, 4 ou 5 cepas da influenza não pandêmicas pode ser administrado e<br />
ainda mais preferivelmente um antígeno de cada uma de 3 ou 4 cepas da<br />
25 influenza não pandêmicas pode ser administrado.<br />
Em alguns exemplos, a construção pode codificar mais do que<br />
um polipeptídeo. Em particular, uma construção pode codificar mais do que<br />
um antígeno e especialmente mais do que um antígeno da influenza. Por<br />
exemplo, a construção pode expressar dois, três, quatro, cinco, seis ou mais
54<br />
polipeptídeos e em particular antígenos. Em um caso preferido, a construção<br />
pode codificar três, quatro, cinco ou mais polipeptídeos diferentes e em<br />
particular antígenos. Em um caso ainda mais preferido a construção pode<br />
codificar três, quatro ou cinco polipeptídeos diferentes e em particular<br />
5 antígenos. Em um caso ainda mais preferido a construção pode codificar três<br />
ou quatro polipeptídeos diferentes, em particular antígenos e especialmente<br />
antígenos da influenza. Pelo menos um dos antígenos será expressado usando<br />
o promotor quimérico da invenção e preferivelmente todos os antígenos serão<br />
assim expressados. Tipicamente, cada antígeno pode ser expressado a partir<br />
10 de um promotor quimérico da invenção separado. Em alguns casos, um único<br />
promotor pode ser usado para gerar um transcrito que dê origem a um<br />
pluralidade de polipeptídeos. Em alguns exemplos, diversos antígenos podem<br />
ser expressados como uma proteína de fusão.<br />
Em um exemplo preferido, uma construção da invenção<br />
15 codifica um antígeno da influenza pandêmico, fragmento imunogênico deste,<br />
ou variante imunogênica de cada um e um ou mais antígenos da influenza não<br />
pandêmicos, fragmentos imunogênicos destes ou variantes imunogênicas de<br />
cada um.<br />
As construções de ácido nucleico da invenção podem ser<br />
20 utilizadas em uma vacina. Assim, a invenção fornece uma composição de<br />
vacina que compreende uma construção de ácido nucleico, uma população de<br />
construções de ácido nucleico ou partículas carreadoras da invenção<br />
revestidas. A vacina pode compreender um carreador ou excipiente<br />
farmacêuticos adequados. A vacina pode compreender um adjuvante e em<br />
25 particular uma construção adjuvante da invenção. Alternativamente, a vacina<br />
pode ser administrada separada, seqüencial ou simultaneamente com um tal<br />
adjuvante.<br />
Em um exemplo preferido, a invenção fornece uma vacina<br />
multivalente que compreende pelo menos duas construções diferentes da
55<br />
invenção que codificam antígenos diferentes, fragmentos imunogênicos<br />
destes, ou variantes imunogênicas de cada um. O antígeno pode ser qualquer<br />
um daqueles aqui mencionados. Em um exemplo preferido, a invenção<br />
fornece uma vacina multivalente que compreende pelo menos duas<br />
5 construções diferentes da invenção que codificam antígenos diferentes da<br />
influenza, fragmentos imunogênicos destes ou variantes imunogênicas de<br />
cada um. Em exemplos alternativos, uma pluralidade de antígenos pode ser<br />
expressada da mesma construção para fornecer uma vacina multivalente ou<br />
combinações de construções que codificam antígenos isolados e plurais pode<br />
10 ser usada.<br />
Em um outro exemplo preferido, uma vacina multivalente da<br />
invenção pode ser uma que seja uma vacina trivalente, tetravalente ou<br />
pentavalente que codifique três, quatro ou cinco antígenos diferentes,<br />
fragmentos imunogênicos ou variantes imunogênicas e em particular<br />
15 antígenos da influenza, fragmentos ou variantes de cada um.<br />
Em um outro exemplo preferido uma vacina da invenção,<br />
incluindo as vacinas multivalentes, pode compreender uma construção que<br />
codifique um antígeno da influenza pandêmico, fragmento imunogênico deste<br />
ou variante imunogênica de cada um. Uma vacina multivalente pode codificar<br />
20 um antígeno da influenza pandêmico, fragmento imunogênico, ou variante<br />
imunogênica de cada um e também, por exemplo, um antígeno de cada um de<br />
três, quatro ou cinco cepas da influenza diferentes, fragmentos imunogênicos<br />
destas ou variantes imunogênicas de cada uma.<br />
Um adjuvante pode estar presente em uma vacina da invenção<br />
25 ou administrado simultânea, separada ou seqüencialmente com uma vacina da<br />
invenção. Em particular, a invenção fornece uma vacina que compreende pelo<br />
menos uma construção da invenção que codifica uma subunidade de toxina<br />
bacteriana que ribosile ADP, fragmento desta com atividade adjuvante ou<br />
variante desta com atividade adjuvante.
56<br />
As construções de ácido nucleico que expressam mais do que<br />
um antígeno podem ser usadas para gerar vacinas multivalentes, isto é, uma<br />
vacina intencionada a imunizar contra uma pluralidade de antígenos<br />
diferentes e em particular contra antígenos da influenza. Em alguns exemplos,<br />
5 um antígeno da influenza ou antígenos e um antígeno ou antígenos de um<br />
patógeno diferente serão fornecidos. Assim, qualquer uma das construções,<br />
populações de construções de ácido nucleico, vacinas, composições<br />
farmacêuticas e partículas carreadoras revestidas aqui mencionadas podem<br />
compreender uma construção que codifique um antígeno da influenza e a<br />
10 mesma construção, ou construções diferentes, podem codificar antígenos de<br />
patógenos diferentes. As várias construções, populações e vacinas da<br />
influenza multivalentes aqui mencionadas também podem codificar um<br />
antígeno ou antígenos de um patógeno diferente.<br />
Em alguns casos, os antígenos codificados serão do mesmo<br />
15 patógeno. Em alguns exemplos, os antígenos diferentes todos serão do mesmo<br />
vírus. Assim, em um exemplo preferido, todos os antígenos serão antígenos<br />
da influenza. A pluralidade de antígenos pode vir da mesma cepa de vírus da<br />
influenza e conseqüentemente pode ser de polipeptídeos diversos diferentes<br />
do vírus da influenza. Alternativamente, a pluralidade de antígenos pode ser<br />
20 de cepas diferentes de vírus e em particular do vírus da influenza. No caso de<br />
construções e/ou vacinas multivalentes, os antígenos de pelo menos duas e<br />
preferivelmente pelo menos três, quatro ou cinco cepas da influenza<br />
diferentes podem ser escolhidos. Os antígenos, por exemplo, podem ser de 2,<br />
3, 4, 5, 6 ou mais cepas diferentes, em particular antígenos de três, quatro ou<br />
25 cinco cepas podem ser utilizados, e ainda mais preferivelmente de três ou<br />
quatro cepas diferentes.<br />
As vacinas multivalentes podem alternativa ou adicionalmente<br />
compreender uma pluralidade de construções diferentes da invenção com as<br />
construções diferentes que codificam antígenos diferentes. Por exemplo, pelo
57<br />
menos 2, 3, 4, 5, ou 6 construções diferentes podem ser utilizadas. Em um<br />
exemplo particularmente preferido 2, 3, 4 ou 5 construções diferentes e<br />
especialmente três ou quatro construções podem ser utilizadas. Em um<br />
exemplo, onde mais do que uma construção está presente, cada construção<br />
5 codifica um antígeno singular. Em um outro exemplo, as construções podem<br />
codificar 2, 3, 4, 5 ou mais antígenos diferentes, particularmente 3 ou 4<br />
antígenos diferentes.<br />
A invenção também fornece uma população de construções de<br />
ácido nucleico onde a população compreende uma pluralidade de construções<br />
10 da invenção e em particular qualquer uma das combinações mencionadas<br />
acima. Assim, a invenção fornece uma população de construções de ácido<br />
nucleico onde a população compreende pelo menos duas construções<br />
diferentes da invenção. As construções de ácido nucleico podem estar<br />
presentes em qualquer quantidade adequada em relação a cada uma.<br />
15 Tipicamente, cada construção de ácido nucleico está presente em uma relação<br />
em peso de aproximadamente 1:10 entre si.<br />
As populações de construções de ácido nucleico podem ser<br />
usadas para gerar vacinas multivalentes e nos vários métodos da invenção. As<br />
vacinas multivalentes também podem ser multivalentes porque elas<br />
20 compreendem qualquer uma das construções da invenção que codificam mais<br />
do que um antígeno.<br />
Em um exemplo preferido uma população de ácidos nucleicos<br />
é fornecida onde a população compreende pelo menos duas construções<br />
diferentes que codificam antígenos diferentes. Em particular, a invenção<br />
25 fornece uma população que compreende pelo menos duas construções<br />
diferentes que codificam antígenos da influenza, fragmentos imunogênicos<br />
destes ou variantes imunogênicas de cada um. Em uma tal população de<br />
construções de ácido nucleico preferivelmente pelo menos dois dos antígenos<br />
diferentes podem ser do mesmo polipeptídeo da influenza, tal como HA, de
58<br />
cepas da influenza diferentes. Em populações com pelo menos duas<br />
construções diferentes que codificam antígenos da influenza estão presentes,<br />
preferivelmente pelo menos dois dos antígenos, fragmentos ou variantes<br />
diferentes são de polipeptídeos da influenza diferentes podem ser da mesma<br />
5 cepa da influenza ou de uma diferente. Outras populações preferidas incluem<br />
uma população de construções de ácido nucleico onde a população<br />
compreende pelo menos três construções diferentes de modo que cada uma<br />
codifique um antígeno de uma cepa da influenza diferente ou um fragmento<br />
imunogênico ou variante imunogênica.<br />
10 Em um outro exemplo preferido, a invenção fornece uma<br />
população de construções de ácido nucleico que compreende pelo menos uma<br />
construção que codifique um antígeno, fragmento imunogênico deste, ou uma<br />
variante imunogênica de cada um e pelo menos uma construção que codifique<br />
uma subunidade de toxina bacteriana que ribosile ADP, fragmento desta com<br />
15 atividade adjuvante ou variante desta com atividade adjuvante. A ou cada<br />
construção que codifica um antígeno, fragmento imunogênico ou variante<br />
imunogênica está tipicamente presente em uma relação em peso de cerca de<br />
10:1 a 1:10 com respeito à ou cada construção que codifique a subunidade de<br />
toxina bacteriana que ribosila ADP, fragmento deste com atividade adjuvante<br />
20 ou variante desta com atividade adjuvante. A relação em peso pode ser de<br />
cerca de 10:1 a cerca de 1:1, por exemplo de cerca de 9:1.<br />
Nos exemplos onde uma pluralidade de polipeptídeos deva ser<br />
codificada, qualquer combinação de construções que codifique um ou mais<br />
polipeptídeos e uma pluralidade de construções podem ser utilizadas. Por<br />
25 exemplo, onde três antígenos devam ser codificados, uma construção pode<br />
codificar todos os três, uma construção pode codificar dois e uma outra<br />
construção um antígeno, ou três construções cada uma codificando um<br />
antígeno, por exemplo, podem ser utilizadas. Em exemplos onde quatro<br />
antígenos devam ser codificados, estes podem ser codificados por intermédio
59<br />
de quatro, três, duas ou uma construção, com cada construção codificando<br />
um, dois, três, ou quatro antígenos diferentes. Em um exemplo, tão poucas<br />
construções quanto possível podem ser utilizadas, por exemplo apenas uma<br />
ou duas construções podem ser utilizadas. A invenção também fornece<br />
5 populações de ácidos nucleicos e vacinas que compreendem tais combinações<br />
de construções de ácido nucleico.<br />
Em um exemplo preferido, a invenção fornece uma vacina<br />
multivalente ou população de ácidos nucleicos que compreendem uma<br />
construção que codifique um antígeno de um vírus da influenza pandêmico e<br />
10 que também codifique 3, 4 ou 5 e em particular 3 ou 4 antígenos da influenza<br />
não pandêmicos. Os antígenos da influenza não pandêmicos podem ser<br />
codificados na mesma construção como o antígeno da influenza pandêmico<br />
ou em construções diferentes. Em um exemplo preferido os 3, 4 ou 5 outros<br />
antígenos da influenza não pandêmicos podem ser codificados em uma<br />
15 construção ou construções separadas e em particular em uma única construção<br />
separada. em um outro exemplo, a construção que codifica o antígeno<br />
pandêmico também pode codificar um ou mais dos outros antígenos.<br />
Em algumas formas de realização, a construção de ácido<br />
nucleico codificará um adjuvante ou uma construção separada pode assim<br />
20 fazê-lo. Qualquer uma das populações, composições e vacinas da invenção<br />
pode compreender, ou pode ser administrada simultânea, seqüencial ou<br />
separadamente com uma tal construção adjuvante. Assim, as seqüências<br />
inseridas no sítio de clonagem para a inserção de uma seqüência codificadora<br />
pode codificar um polipeptídeo que pode atuar como um adjuvante.<br />
25 Assim, em um exemplo a invenção compreende uma<br />
construção de ácido nucleico em que a seqüência codificadora codifica uma<br />
subunidade de toxina bacteriana que ribosila ADP, um fragmento desta com<br />
atividade adjuvante ou uma variante de cada um com atividade adjuvante que<br />
também tenha 80% de homologia de aminoácido a qualquer um dos
60<br />
precedentes. Em um exemplo preferido, a construção de ácido nucleico<br />
compreende duas seqüências codificadoras que compreendem uma<br />
subunidade de toxina bacteriana que ribosile ADP, fragmento desta com<br />
atividade adjuvante ou variante de cada um com atividade adjuvante, onde<br />
5 cada uma é ligada a um tal promotor quimérico.<br />
As duas seqüências codificadoras que codificam uma<br />
subunidade de toxina bacteriana que ribosila ADP, fragmento deste com<br />
atividade adjuvante ou variante de cada um com atividade adjuvante pode<br />
estar, em um exemplo, na orientação inversa. em um outro exemplo as duas<br />
10 seqüências codificadoras que codificam uma subunidade de toxina bacteriana<br />
que ribosile ADP, fragmento deste com atividade adjuvante ou variante de<br />
cada um com atividade adjuvante podem estar na mesma orientação. Em<br />
qualquer uma das construções da invenção que compreendem mais do que<br />
uma seqüência codificadora ligada a um promotor quimérico, os promotores<br />
15 podem estar na mesma orientação, em orientações diferentes ou uma mistura<br />
dos dois onde existem três ou mais de tais promotores.<br />
Em um exemplo preferido, o adjuvante codificado em<br />
qualquer uma das construções adjuvantes pode ser uma toxina bacteriana que<br />
ribosile ADP. Estes incluem a toxina da difteria (DT), toxina da coqueluche<br />
20 (PT), toxina do cólera (CT), as toxinas instáveis ao calor da E. coli (LT1 e<br />
LT2), endotoxina A de Pseudomonas, exotoxina S de Pseudomonas,<br />
exoenzima de B. cereus, toxina B. sphaericus, toxinas C2 e C3 de C.<br />
botulinum, exoenzima de C. limosum, bem como as toxinas de C. perfringens,<br />
C. spiriforma e C. difficile e EDIN de Staphylococcus aureus. A maior parte<br />
25 das toxinas bacterianas que ribosilam ADP contêm subunidades A B. e A<br />
construção pode expressar a subunidade A, a subunidade B e/ou ambas as<br />
subunidades.<br />
Em um exemplo preferido, a construção de ácido nucleico<br />
pode codificar a Toxina instável ao calor de E. coli e/ou toxina do cólera e em
61<br />
particular pode expressar a toxina instável ao calor de E. coli. Uma entrada no<br />
GenBank para as seqüências completas dos genes A e B da subunidade CT<br />
podem ser encontrada no Local VIBCTXABB (Acesso No. D30053),<br />
enquanto uma entrada no GenBank para as seqüências completas dos genes A<br />
5 e B da subunidade LT pode ser encontrada no local AB0116677 (Acesso 1\1 12-<br />
invenção pode codificar as subunidades LT A e/ou LT B codificadas pelos<br />
vetores pPJV2012 e/ou pPJV7788 ou um fragmento de uma tal subunidade<br />
que retenha a atividade adjuvante ou uma variante de cada um que retenha a<br />
10 atividade adjuvante. Uma construção da invenção pode compreender as<br />
seqüências codificadoras para as subunidades LT A e/ou LT B dos vetores<br />
pPJV2012 e/ou pPJV7788, um fragmento deste que codifique um<br />
polipeptídeo que tenha atividade adjuvante ou uma variante de cada um que<br />
tenha atividade adjuvante. Em um exemplo preferido uma construção da<br />
15 invenção tem ambas as seqüências codificadoras LT A e LT B.<br />
Em um outro exemplo preferido, a construção pode<br />
compreender a seqüência do vetor PJV2012 fornecida pela SEQ ID No: 61 ou<br />
uma seqüência com 60% de identidade de seqüência a esta. Em um outro<br />
exemplo, a construção pode compreender a seqüência do vetor PJV7788<br />
20 fornecida pela SEQ ID No: 62 ou uma seqüência com 60% de identidade de<br />
seqüência a esta.<br />
A construção pode expressar uma variante ou fragmento ativos<br />
de um adjuvante particular. A variante ou fragmento serão ditos ser ativos se<br />
eles retêm pelo menos alguma da atividade adjuvante do polipeptídeo a partir<br />
25 do qual são derivados. Assim, a variante e/ou fragmento ainda serão capazes<br />
de realçar uma resposta imune contra um antígeno particular em comparação<br />
com a resposta imune observada quando nenhum adjuvante é administrado<br />
com o antígeno. A seqüência codificada pode ser fragmentos ou variantes<br />
ativos das subunidades CT A e/ou B e em particular podem ser fragmentos<br />
AB011677). Em um exemplo particularmente preferido, uma construção da
62<br />
ativos das subunidades LT A e/ou B. As variantes e fragmentos que podem<br />
ser utilizados, por exemplo, podem ter qualquer um dos comprimentos, níveis<br />
de homologia de seqüência ou outras características aqui mencionadas para<br />
variantes e fragmentos. Estes, por exemplo, podem ser avaliados usando o<br />
5 Ensaio de Imunogenicidade Comparativa usando um antígeno particular e<br />
depois comparando os resultados observados com um vetor base adjuvante e<br />
um vetor variante que codifique um adjuvante. Em uma forma de realização<br />
particularmente preferida a construção pode codificar as subunidades LTA<br />
e/ou LTB e em particular ambas. A construção, em um exemplo<br />
10 particularmente preferido pode ser pPJV2012 ou pPJV7788 as seqüências<br />
para os quais são aqui fornecidas.<br />
Qualquer uma das construções adjuvantes da invenção podem<br />
ser administradas simultânea, seqüencial ou separadamente com um antígeno<br />
ou um ácido nucleico que codifique um antígeno. Em um exemplo preferido<br />
15 uma construção adjuvante da invenção pode ser administrada simultânea,<br />
seqüencial ou separadamente com uma construção da invenção que codifique<br />
um antígeno. As composições e vacinas que compreendem uma construção<br />
adjuvante e uma construção que codifique um antígeno são fornecidas, como<br />
o são carreadores de núcleo revestidos com ambos os tipos de construção<br />
20 fornecidas sobre eles ou misturas de carreadores de núcleo revestidos com<br />
uma construção adjuvante e outros carreadores de núcleo revestidos com uma<br />
construção que codifique um antígeno.<br />
A subunidade de toxina pode ter tido a sua seqüência de sinal<br />
que ocorre naturalmente deletada. As seqüências de sinal naturais das<br />
25 exotoxinas podem ser substituídas por uma seqüência de sinal eucariótica e<br />
em particular pelo peptídeo de sinal de lisozima de galinha. Uma subunidade<br />
de exotoxina que ocorre naturalmente pode ter sido modificada para<br />
destoxificar a toxina. A subunidade A pode ter sido modificada para romper<br />
ou inativar a atividade de ADP-ribosil transferase. Em alguns casos as
63<br />
subunidades de exotoxina podem reter a toxicidade. Assim, em alguns<br />
exemplos as subunidades de exotoxina podem não ter sido destoxificadas.<br />
Assim, as construções adjuvantes da invenção podem ser<br />
usadas para realçar uma resposta imune contra um antígeno particular. A<br />
5 resposta imune realçada pode envolver uma resposta imune de magnitude ou<br />
duração maiores. Isto pode significar que quando o antígeno é re-encontrado a<br />
resposta imune então é maior do que se nenhum adjuvante fosse administrado.<br />
A resposta imune realçada pode resultar em títulos de anticorpo mais altos.<br />
No caso de algumas construções, e em particular aquelas que expressam<br />
10 subunidades de exotoxina, o adjuvante pode resultar em uma resposta celular<br />
aumentada e uma resposta imune equivalente ao auxiliar T 1 contra o<br />
antígeno em questão.<br />
As construções de adjuvante podem ser administradas com,<br />
estar presente em uma vacina com, ou estar presente em uma população de<br />
15 ácidos nucleicos com qualquer uma das outras construções aqui mencionadas.<br />
As construções adjuvantes também podem codificar, ou serem administradas<br />
com uma construção que codifique, um antígeno ou antígeno, incluindo<br />
qualquer um destes aqui mencionados e em particular aqueles que codifiquem<br />
a influenza.<br />
20 Em uma forma de realização, uma construção da invenção<br />
pode codificar um imunoestimulador e/ou um imunossupressor. Em um<br />
exemplo preferido uma construção pode codificar um ou mais de interferon<br />
alfa, beta e/ou gama, interleucina-1, -2, -4, -5, -7, -10, -12, -13, -18, -23 e —24,<br />
GM-CSF, G-CSF, TGF-beta, B7.1, B7.2, CTLA-4, ligando CD40, CD40,<br />
25 OX40, ligando OX40, ligando Flt-3, TRAIL, TRANCE, ligando Fas, TNF<br />
alfa, MCP-1 alfa, PF-4, SLC, MIP-3 alfa, IP-10. Em alguns casos uma tal<br />
construção pode ser administrada simultânea, separada ou seqüencialmente<br />
com qualquer uma de outra construção, em particular uma da invenção e<br />
especialmente uma construção que codifique um antígeno.
64<br />
Uma construção da invenção pode compreender um sinal de<br />
poliadenilação. O ácido nucleico para a inserção no sítio de clonagem pode<br />
compreender uma seqüência de poliadenilação (poliA). Uma tal seqüência<br />
poliA é no geral nativa à seqüência codificadora. Alternativamente, uma<br />
5 seqüência poliA heteróloga pode ser fornecida na construção de ácido<br />
nucleico da invenção. Tipicamente a seqüência poliA será fornecida a jusante<br />
do sítio de clonagem, tal que a mesma esteja operativamente ligada a uma<br />
seqüência codificadora inserida no sítio de clonagem. Qualquer seqüência<br />
poliA adequada pode ser incluída na construção usando técnicas de clonagem<br />
10 padrão. Tais seqüências poliA são conhecidas na técnica.<br />
A seqüência poli A pode ser:<br />
(i) uma seqüência poli A natural;<br />
(ii) uma variante homóloga funcional de (i); ou<br />
(iii) um fragmento funcional de (i) ou (ii).<br />
15 A seqüência poli A natural (i) pode ser, por exemplo um poli<br />
A do gene da beta globina de coelho, poli A do gene inicial ou tardio do Vírus<br />
do Papiloma Humano (HPV), poli A do gene HSV-2gB, uma poli A do gene<br />
inicial imediata de CMV símio ou poli A do gene tardio gD do HSV. A<br />
seqüência de poliadenilação pode ser derivada de uma seqüência de<br />
20 poliadenilação de um gene selecionado daquele do gene beta-globina de<br />
coelho, genes inicial ou tardio do vírus do papiloma humano (HPV), o gene<br />
HSV-2gB, um gene inicial imediato de CMV símio e gene tardio de HSVgD.<br />
Preferivelmente a seqüência natural poli A (i) é selecionada da<br />
grupo que consiste da SEQ ID No. 10 (GenBank K03256), SEQ ID No. 11<br />
25 (GenBank M16019), SEQ ID No. 12 (GenBank Z80699) e SEQ ID No. 13<br />
(GenBank K02718). Uma seqüência poli A particularmente preferida<br />
compreende os nucleotídeos de 4243 a 4373 da SEQ ID NO: 54 ou é uma<br />
variante homóloga funcional ou fragmento desta. Uma seqüência poli A<br />
preferida também é fornecida pelos nucleotídeos de 2556 a 2686 da SEQ ID
65<br />
No. 14 ou um fragmento funcional ou variante de cada um também podem ser<br />
utilizados.<br />
Em um outro exemplo preferido, um sinal de poliadenilação<br />
utilizado em uma construção da invenção pode compreender:<br />
5 (i) a seqüência de nucleotídeo da SEQ ID NO: 10, SEQ ID<br />
NO: 11, SEQ ID NO: 12, SEQ ID NO: 13, nucleotídeos de 4243 a 4373 da<br />
SEQ ID No: 54, nucleotídeos de 906 a 1038 da SEQ ID No: 61, nucleotídeos<br />
de 4375 a 4050 da SEQ ID No: 61, e/ou nucleotídeos de 2463 a 2593 da SEQ<br />
ID No: 62;<br />
10 (ii) uma variante funcional de (i) que tenha pelo menos 80% de<br />
homologia de seqüência de nucleotídeo a uma ou mais das seqüências de (i);<br />
e/ou<br />
15 atividade de poliadenilação.<br />
(iii) um fragmento funcional de (i) ou (ii).<br />
No geral, uma seqüência poliA funcional é uma que retêm a<br />
Uma seqüência poli A pode ser testada quanto a capacidade<br />
para realizar a poliadenilação de um transcrito de RNA usando um ensaio de<br />
expressão de rotina. Uma variante homóloga funcional (ii) ou fragmento<br />
funcional (iii) tipicamente mostram pelo menos 50%, por exemplo 60%, 70%<br />
20 80% ou mais da atividade de poli A da seqüência natural poli A no ensaio.<br />
No geral a seqüência poli A, quando presente na construção da<br />
invenção, realçará a expressão, tipicamente causando realce comparável à<br />
seqüência natural poli A (i) mencionada acima.<br />
Uma seqüência poli A também pode ser ensaiada quanto à<br />
25 funcionalidade usando o Ensaio de Expressão Comparativa abaixo. Uma<br />
região poli A de teste é trocada no vetor base no lugar do RBGpA. Uma poli<br />
A de teste é considerada funcional se a poli A não anula a expressão, mas<br />
preferivelmente aumenta a expressão em pelo menos um mas preferivelmente<br />
dois tipos de célula de referência, comparado com o vetor base.
66<br />
Preferivelmente existe um aumento na expressão de pelo menos 5%, 10%,<br />
20%, 30%, 40% ou 50% ou mais. O aumento pode ser qualquer um dos níveis<br />
aqui mencionados. Em alguns casos uma diminuição pode ocorrer, incluindo<br />
qualquer um dos níveis aqui mencionados. Os tipos de célula preferidos são<br />
5 células HEK293T, CHO, HeLa, BHK, 3T3 ou COS de mamífero. As células<br />
SSC15 ou B16 também podem ser utilizadas. De acordo com o ensaio,<br />
tipicamente uma variante homóloga (ii) ou fragmento (iii) são funcionais se<br />
os mesmos possibilitem mais do que 50% da melhora na expressão obtidos<br />
pela seqüência poli A natural (i).<br />
10 Alternativa ou adicionalmente, as seqüências poli A podem ser<br />
testadas quanto a atividade no Ensaio de Imunogenicidade Comparativa<br />
abaixo. A seqüência poli A é trocada no vetor base no lugar de RBGpA. Uma<br />
seqüência poli A funcional fornece títulos de anticorpo que são pelo menos<br />
tão altos quanto ou mais altos do que aqueles obtidos pelo vetor base com<br />
15 pelo menos um, preferivelmente dois antígenos. Preferivelmente os títulos de<br />
anticorpo são pelo menos 5%, 10%, por exemplo 20%, 30% ou 40% mais<br />
altos do que aqueles obtidos com o vetor base. Em alguns exemplos qualquer<br />
um dos aumentos ou diminuições aqui mencionados podem ser observados.<br />
Os antígenos preferidos são HBsAg, HSV2gD e Flu-M2. Os antígenos<br />
20 especialmente preferidos são os antígenos da influenza, incluindo qualquer<br />
um daqueles aqui mencionados e em particular antígenos HA, NA e M2. Em<br />
particular, antígeno HA, ou um fragmento imunogênico deste ou uma variante<br />
imunogênica de cada um pode ser utilizado. Uma variante homóloga (ii) ou<br />
fragmento (iii) são tipicamente funcionais se os mesmos possibilitem os<br />
25 títulos de anticorpo mais altos obtidos pela seqüência natural poli A (i).<br />
A construção de ácido nucleico pode compreender seqüências<br />
de controle adicionais que influenciam a expressão de uma seqüência<br />
codificadora inserida no sítio de clonagem. A construção pode incluir uma<br />
seqüência líder não traduzida. A seqüência é fornecida na construção em
67<br />
ligação operável com o promotor quimérico, e portanto também com uma<br />
seqüência codificadora inserida no sítio de clonagem. O líder fornece um sítio<br />
de início de tradução para a expressão de uma seqüência codificadora inserida<br />
e tipicamente inclui uma seqüência Kozak.<br />
5 Tipicamente a seqüência líder não traduzida compreende:<br />
(i) uma seqüência líder não traduzida natural;<br />
(ii) uma variante homóloga funcional de (i); ou<br />
(iii) um fragmento funcional de (i) ou (ii).<br />
Tipicamente a seqüência líder compreende seqüências<br />
10 presentes em (i) que ligam componentes de transcrição ou proteínas<br />
reguladoras, ou homólogos destas seqüências que são capazes de ligar os<br />
mesmos componentes ou proteínas. Tipicamente tais seqüências ou seus<br />
homólogos estão presentes na seqüência líder na mesma ordem e/ou<br />
substancialmente no mesmo espaçamento relativo como em (i). No geral a<br />
15 seqüência líder compreende um sítio de início de tradução para a expressão de<br />
uma seqüência codificadora inserida. Tipicamente a seqüência líder inclui<br />
uma seqüência Kozak.<br />
No geral a seqüência líder não traduzida tem um comprimento<br />
de cerca de 10 a cerca de 200 nucleotídeos, por exemplo de cerca de 15 a 150<br />
20 nucleotídeos, preferivelmente de 15 a cerca de 130 nucleotídeos. As<br />
seqüências líder que compreendem, por exemplo, 15, 50, 75 ou 100<br />
nucleotídeos podem ser usadas.<br />
No geral uma seqüência líder não traduzida funcional é uma<br />
que é capaz de fornecer um sítio de início traducional para a expressão de<br />
25 uma seqüência codificadora em ligação operável com a seqüência líder.<br />
Tipicamente uma variante funcional (ii) ou fragmento (iii) têm<br />
substancialmente a mesma atividade como e/ou complementa a atividade da<br />
seqüência natural (i), usualmente na facilitação ou realce da expressão de uma<br />
seqüência codificadora em ligação operável com a seqüência.
68<br />
Uma variante (ii) ou fragmento (iii) podem ser testados quanto<br />
a atividade como uma seqüência líder não traduzida em relação à seqüência<br />
líder natural usando protocolos padrão. Por exemplo, vetores de expressão<br />
podem ser preparados de modo que compreendam uma seqüência líder natural<br />
5 (i) operavelmente ligada à sua seqüência codificadora nativa, e a expressão<br />
monitorada em células hospedeiras adequadas por exemplo, células HEK<br />
293T, CHO, HeLa, BHK, 3T3 ou COS de mamífero. As construções de teste<br />
podem ser preparadas em que a seqüência líder natural é substituída por uma<br />
variante ou fragmento homólogos e a expressão é monitorada mais uma vez<br />
10 nas mesmas células hospedeiras. No geral, uma variante (ii) ou fragmento (iii)<br />
fornecem pelo menos 50%, tal como 60%, 70%, 80%, 90% ou 100% ou mais<br />
da expressão fornecida pela seqüência natural. Em alguns casos qualquer um<br />
dos aumentos ou diminuições na expressão aqui mencionados podem ser<br />
observados.<br />
15 Uma seqüência líder potencial também pode ser testada quanto<br />
a utilidade no Ensaio de Expressão Comparativa abaixo. Uma seqüência líder<br />
de teste é trocada no vetor base no lugar do HBV pre S2 5' UTR. Uma<br />
seqüência líder funcional não anula a expressão mas preferivelmente aumenta<br />
a expressão em pelo menos um mas preferivelmente dois tipos de célula de<br />
20 referência, comparada com o vetor base. No geral a expressão é aumentada<br />
em pelo menos 5%, 10%, 20%, 30%, 40% ou 50%. Os tipos de célula<br />
preferidos são células HEK293T, CHO, HeLa, BHK, 3T3 ou COS de<br />
mamífero. De acordo com o ensaio, uma variante homóloga (ii) ou fragmento<br />
(iii) são tipicamente funcionais se os mesmos possibilitem mais do que 50%<br />
25 da melhora na expressão obtida pela seqüência líder natural.<br />
Alternativa ou adicionalmente, uma seqüência líder pode ser<br />
testada quanto a atividade no Ensaio de Imunogenicidade Comparativa<br />
abaixo. Uma seqüência líder é trocada no vetor base no lugar do HBV pre S2<br />
UTR 5'. Uma seqüência líder funcional fornece títulos de anticorpo que são
69<br />
pelo menos tão altos quanto ou mais altos do que aqueles obtidos pelo vetor<br />
base, com pelo menos um preferivelmente dois antígenos. Preferivelmente os<br />
títulos de anticorpo são pelo menos 5%, 10%, 20%, 30% ou 40% mais altos<br />
do que com o vetor base. Os antígenos preferidos são os antígenos HBsAg,<br />
5 HSV 2gD e Flu-M2. Os antígenos especialmente preferidos são antígenos da<br />
influenza, incluindo qualquer um daqueles aqui mencionados e em particular<br />
antígenos HA, NA e M2. Em particular, o antígeno HA, ou um fragmento ou<br />
variante deste podem ser utilizados. Uma variante homóloga (ii) ou fragmento<br />
(iii) é tipicamente funcional se os mesmos possibilitem os títulos de anticorpo<br />
10 mais altos possibilitados pela seqüência líder natural (i). Entretanto, em<br />
alguns exemplos um dos níveis diminuídos de expressão aqui mencionados<br />
podem ser observados.<br />
A seqüência líder adequada pode ser obtida usando protocolos<br />
padrão. Por exemplo, a seqüência de antígeno preS2 de HBV, a seqüência de<br />
15 antígeno e de HBV e a seqüência de antígeno tipo 2 gD do HSV estão<br />
disponíveis no GenBank M54923, M54923 e Z86099 respectivamente. Os<br />
iniciadores podem ser planejados com base nesta seqüência conhecida e<br />
usados para isolar seqüências homólogas. As seqüências líder podem ser<br />
sintetizadas com base nas seqüências conhecidas.<br />
20 No geral a seqüência natural (i) é uma seqüência eucariótica<br />
ou uma seqüência viral, em particular, de um vírus que infecte um eucariota.<br />
Preferivelmente a seqüência natural (i) é a seqüência de HBV ou HSV, por<br />
exemplo a seqüência de antígeno preS2 de HBV, a seqüência de antígeno e de<br />
HBV, ou a seqüência de antígeno tipo 2 gD do HSV. De modo<br />
25 particularmente preferivelmente, (i) é selecionada do grupo que consiste da<br />
SEQ ID No. 5, SEQ ID No. 6 e SEQ ID No. 7. Em um outro exemplo<br />
preferido, a seqüência líder não traduzida compreende os nucleotídeos de<br />
1864 a 1984 da SEQ ID NO: 54 ou SEQ ID No. 14. Os fragmentos funcionais<br />
ou variantes de qualquer uma destas seqüências também podem ser utilizados.
70<br />
Em um exemplo, a seqüência líder não traduzida compreende:<br />
(i) a seqüência de nucleotídeo da SEQ ID No 5, Seq ID No: 6,<br />
Seq ID No: 7 ou nucleotídeos de 1864 a 1984 da SEQ ID No. 54.<br />
(ii) uma variante funcional de (i) que tenha pelo menos 80% de<br />
5 homologia de seqüência de nucleotídeo com (i); e/ou<br />
(iii) um fragmento funcional de (i) ou (ii).<br />
Uma tal seqüência líder não traduzida pode ser utilizada em<br />
qualquer uma das construções da invenção.<br />
A construção de ácido nucleico pode compreender uma<br />
10 seqüência realçadora. Uma seqüência realçadora é tipicamente fornecida 3' do<br />
sítio de clonagem, em ligação operável tanto com o promotor quimérico e<br />
uma seqüência codificadora inserida, e atua para aumentar a transcrição da<br />
seqüência inserida.<br />
No geral o realçador compreende:<br />
15 (i) um realçador natural;<br />
(ii) uma variante homóloga funcional de (i); ou<br />
(iii) um fragmento funcional de (i) ou (ii).<br />
A seqüência realçadora no geral compreende de cerca de 50 a<br />
cerca de 850 nucleotídeos, por exemplo de cerca de 75 a cerca de 500<br />
20 nucleotídeos. Os realçadores de cerca de 100, 200, 300 ou 400 nucleotídeos<br />
podem ser usados.<br />
Tipicamente (i) é um realçador eucariótico ou viral, em<br />
particular, de um vírus que infecta eucariotas. Usualmente tais realçadores<br />
ocorrem na região não traduzida 3' (UTR 3') de um gene. Preferivelmente (i)<br />
25 é um realçador de HBV ou um de CMV, por exemplo um HBs Ag UTR 3' ou<br />
um gene UTR 3' inicial imediato de CMV símio. Preferivelmente (i)<br />
compreende a SEQ ID No. 8 ou SEQ ID No. 9. Preferivelmente (i) pode<br />
compreender os nucleotídeos de 3699 a 4231 da SEQ ID NO: 54. Em um<br />
outro exemplo preferido (i) pode compreender os nucleotídeos de 2012 a
71<br />
2544 da SEQ ID No. 14. Os fragmentos funcionais ou variantes de qualquer<br />
uma destas seqüências podem ser utilizados.<br />
No geral, o realçador na construção compreende seqüências<br />
encontradas em (i) que ligam os componentes de transcrição ou proteínas<br />
5 reguladoras, por exemplo fatores de transcrição, ou homólogos destas<br />
seqüências que ligam os mesmos componentes ou proteínas. Preferivelmente<br />
estas seqüências estão presentes no realçadores na mesma ordem e/ou<br />
substancialmente o mesmo espaçamento relativo como em (i).<br />
No geral um realçador funcional é um que realça ou aumenta a<br />
10 expressão de um polinucleotídeo, por exemplo, uma seqüência codificadora,<br />
que é operavelmente ligada à seqüência realçadora. Tipicamente uma variante<br />
homóloga funcional (ii) ou fragmento (iii) tem substancialmente a mesma<br />
atividade (por exemplo, realce de expressão) como e/ou complementa a<br />
atividade do realçador natural (i).<br />
15 A atividade realçadora pode ser ensaiada usando um ensaio de<br />
aprisionamento de realçador. Os protocolos são conhecidos na técnica. Uma<br />
variante homóloga funcional (ii) ou fragmento (iii) preferivelmente fornece<br />
pelo menos 50% da atividade realçadora mostrada pelo realçador natural em<br />
tal ensaio. Tipicamente a atividade é pelo menos 60%, 70%, 80%, 90, 100%<br />
20 ou mais da atividade do realçador natural. No geral, uma variante funcional<br />
(ii) ou fragmento (iii) é capaz de complementar a atividade do realçador<br />
natural (i) no ensaio. Qualquer um dos aumentos ou diminuições aqui<br />
aludidos, por exemplo, podem ser observados.<br />
25 compreende:<br />
Em um exemplo preferido, a seqüência realçadora<br />
(i) a seqüência de nucleotídeo da SEQ ID No: 8, SEQ ID No:<br />
9, nucleotídeos de 3699 a 4231 da SEQ ID No. 54, nucleotídeos de 3831 a<br />
4363 da SEQ ID No: 61 e/ou de 4507 a 5038 da SEQ ID No: 62.<br />
(ii) uma variante funcional de (i) que tenha pelo menos 80% de
72<br />
homologia de seqüência de nucleotídeo a uma ou mais das seqüências de (i);<br />
e/ou<br />
(iii) um fragmento funcional de (i) ou (ii).<br />
A utilidade de realçador também pode ser testada usando o<br />
5 Ensaio de Expressão Comparativa apresentada abaixo. Uma seqüência de<br />
teste da UTR 3' é trocada no vetor base. Uma UTR 3' tem utilidade se não<br />
anula a expressão, mas preferivelmente aumenta a expressão em pelo menos<br />
um mais preferivelmente dois tipos de célula de referência comparada com os<br />
vetores base no ensaio. Preferivelmente a expressão é aumentada em pelo<br />
10 menos 5%, 10%, 20%, 30%, 40% ou 50%. Os tipos de célula preferidos são<br />
as células HEK293T, CHO, HeLa, BHK, 3T3 ou COS de mamífero. De<br />
acordo com este ensaio, uma variante homóloga (ii) ou fragmento (iii) são<br />
tipicamente funcionais se os mesmos possibilitem mais do que 50% de<br />
melhora na expressão obtida pela seqüência natural realçadora (i).<br />
15 Adicional ou alternativamente, as seqüências realçadoras<br />
podem ser testadas quanto a atividade no Ensaio de Imunogenicidade<br />
Comparativa abaixo. Uma UTR 3' é trocada no vetor base. Uma seqüência<br />
realçadora funcional fornece títulos de anticorpo que são pelo menos tão altos<br />
quanto ou mais altos do que aqueles obtidos pelo vetor base com pelo menos<br />
20 um, preferivelmente dois antígenos. Preferivelmente os títulos de anticorpo<br />
são pelo menos 5%, 10%, 20%, 30% ou 40% mais altos do que com o vetor<br />
base. Os antígenos preferidos são os antígenos HBsAg, HSV2gD e Flu-M2.<br />
Os antígenos especialmente preferidos são os antígenos da influenza,<br />
incluindo qualquer um daqueles aqui mencionados e em particular os<br />
25 antígenos HA, NA e M2. Em particular, HA pode ser utilizado ou um<br />
fragmento ou variante deste. Uma variante homóloga (ii) ou fragmento (iii)<br />
são funcionais se os mesmos possibilitem o título de anticorpo mais alto<br />
permitido pela seqüência natural realçadora (i).<br />
A seqüência realçadora adequada pode ser obtida usando
73<br />
métodos de clonagem padrão. Por exemplo, a seqüência HBsAg da UTR 3',<br />
ou a seqüência de gene inicial imediata de CMV símio da UTR 3' podem ser<br />
acessadas no GenBank AF143308 e M16019. Os iniciadores podem ser<br />
planejados com base nesta seqüência conhecida e usados para isolar<br />
5 seqüências homólogas.<br />
Em alguns exemplos, onde uma pluralidade de polipeptídeos é<br />
codificada por uma única construção, pode ser desejável omitir seqüências<br />
particulares para reduzir o tamanho da construção. Em particular, uma<br />
construção pode carecer de um realçador e/ou região que codifique uma<br />
10 seqüência líder não traduzida operavelmente ligada à seqüência ou seqüências<br />
que codifiquem o polipeptídeo a ser expressado. Este, por exemplo, pode ser<br />
o caso onde três, quatro, cinco ou mais polipeptídeos são expressados a partir<br />
da mesma construção e particularmente três, quatro ou cinco polipeptídeos<br />
são expressados a partir da mesma construção.<br />
15 Em uma forma de realização preferida, a construção de ácido<br />
nucleico compreende uma seqüência poliA heteróloga, uma seqüência líder<br />
heteróloga e um realçador heterólogo, todos em ligação operável com o<br />
promotor quimérico, para a expressão eficiente de uma seqüência<br />
codificadora inserida.<br />
20 Em um outro aspecto, a presente invenção também fornece<br />
uma construção de ácido nucleico que compreende, ou algumas vezes<br />
consiste essencialmente de:<br />
(i) uma seqüência promotora<br />
(ii) uma seqüência líder não traduzida derivada da seqüência<br />
25 de antígeno preS2 de HBV, seqüência de antígeno e de HBV ou seqüência de<br />
antígeno tipo 2 gD do HSV; e<br />
(iii) uma seqüência codificadora operavelmente ligada a (i) e<br />
em que a seqüência codificadora é heteróloga à seqüência líder
não traduzida.<br />
74<br />
Tipicamente a seqüência promotora (i) é derivada de uma<br />
seqüência promotora virai ou eucariótica. A seqüência promotora pode ser<br />
uma seqüência natural promotora, um homólogo funcional da seqüência<br />
5 natural ou um fragmento funcional de cada um. Os promotores naturais<br />
adequados incluem, por exemplo, o promotor inicial imediato do hCMV, o<br />
promotor do vírus da Pseudo-raiva (PRV) ou promotor do vírus do sarcoma<br />
de Rous (RSV). Preferivelmente o promotor natural compreende a SEQ ID<br />
NO: 52 ou SEQ ID NO: 53.<br />
10 Uma construção promotora artificial, tal como o promotor<br />
quimérico descrito acima, pode ser usado, contanto que o promotor seja<br />
funcional.<br />
Uma seqüência promotora funcional é no geral uma que é<br />
capaz de causar (incluindo iniciar e regular) a transcrição de uma seqüência<br />
15 codificadora operavelmente ligada em uma célula hospedeira adequada.<br />
Uma seqüência promotora pode ser testada quanto a atividade<br />
promotora usando um ensaio de expressão de rotina. Um homólogo ou<br />
fragmento funcionais de uma seqüência natural promotora tipicamente<br />
fornece pelo menos 50%, por exemplo, ou no mínimo 60, 70, 80 ou 90% da<br />
20 expressão fornecida pela seqüência natural em um tal ensaio.<br />
A seqüência líder não traduzida (ii) é como descrita acima. As<br />
seqüências codificadoras (iii) adequadas incluem aquelas já descritas em<br />
relação à construção promotora quimérica. Entretanto, no presente aspecto da<br />
invenção, a seqüência codificadora é heteróloga à seqüência líder não<br />
25 traduzida. A presente construção tipicamente inclui uma seqüência poli A,<br />
que como já descrito, pode ser nativa à seqüência codificadora, ou fornecida<br />
como uma seqüência poli A heteróloga na construção. As seqüências poli A<br />
adequadas já foram descritas. A construção pode adicionalmente incluir uma<br />
seqüência realçadora 3' da seqüência codificadora. As seqüências realçadoras
75<br />
adequadas são descritas acima em relação à construção promotora quimérica.<br />
Em um outro aspecto, a invenção fornece uma construção de<br />
ácido nucleico que compreende, ou em algumas formas de realização consiste<br />
essencialmente de:<br />
5 (i) uma seqüência promotora;<br />
seqüência promotora (i) e;<br />
seqüência codificadora (ii);<br />
(ii) uma seqüência codificadora operavelmente ligada à<br />
(iii) uma seqüência realçadora 3' de e operavelmente ligada à<br />
10 em que a seqüência realçadora (iii) é derivada de uma UTR 3'<br />
de uma seqüência do HBsAg ou uma UTR 3' de uma seqüência de gene<br />
inicial imediata de CMV símio, e a seqüência codificadora (ii) é heteróloga à<br />
seqüência realçadora.<br />
A construção pode incluir uma seqüência líder não traduzida<br />
15 tal como aquela já descrita em relação à construção promotora quimérica.<br />
Tipicamente a seqüência promotora (i) é derivada de uma<br />
seqüência promotora viral ou eucariótica. A seqüência promotora pode ser<br />
uma seqüência promotora natural, um homólogo funcional da seqüência<br />
natural ou um fragmento funcional de cada uma. Os promotores naturais<br />
20 adequados incluem, por exemplo, o promotor inicial imediato do hCMV, o<br />
promotor do vírus da pseudo-raiva (PRV) ou o promotor do vírus do sarcoma<br />
de Rous (RSV). Preferivelmente o promotor natural compreende as SEQ ID<br />
NO: 52 ou SEQ ID NO: 53.<br />
Uma construção promotora artificial, tal como o promotor<br />
25 quimérico descrito acima, pode ser usada, contanto que o promotor seja<br />
funcional.<br />
Uma seqüência promotora funcional é no geral uma que é<br />
capaz de causar (incluindo iniciar e regular) a transcrição de uma seqüência<br />
codificadora operavelmente ligada em uma célula hospedeira adequada.
76<br />
Uma seqüência promotora pode ser testada quanto a atividade<br />
promotora usando um ensaio de expressão de rotina. Os homólogos ou<br />
fragmentos funcionais de uma seqüência promotora natural tipicamente<br />
fornecer pelo menos 50%, por exemplo, ou no mínimo 60, 70, 80 ou 90% ou<br />
5 a expressão fornecida pela seqüência natural em um tal ensaio.<br />
As seqüências codificadoras (ii) adequadas incluem aquelas já<br />
mencionadas em relação à construção promotora quimérica. Entretanto, no<br />
presente aspecto, a seqüência codificadora é heteróloga à seqüência<br />
realçadora 3'. A seqüência realçadora (iii) da construção é descrita acima. A<br />
10 presente construção também tipicamente inclui uma seqüência poli A. Como<br />
no caso da construção promotora quimérica, esta região poli A pode ser nativa<br />
à seqüência codificadora (ii) ou pode ser fornecida como um componente poli<br />
A heterólogo na construção.<br />
Uma construção de acordo com qualquer aspecto da presente<br />
15 invenção pode compreender uma seqüência de peptídeo de sinal. Assim, uma<br />
construção de ácido nucleico pode compreender uma seqüência de<br />
nucleotídeo que codifique um peptídeo de sinal que seja operavelmente ligado<br />
à seqüência codificadora. A seqüência de peptídeo de sinal é inserida em<br />
ligação operável com o promotor tal que o peptídeo de sinal seja expressado e<br />
20 facilite a secreção de um polipeptídeo codificado pelo seqüência codificadora<br />
também em ligação operável com o promotor.<br />
Tipicamente uma seqüência de peptídeo de sinal codifica um<br />
peptídeo de 10 a 30 aminoácidos por exemplo de 15 a 20 aminoácidos.<br />
Freqüentemente, os aminoácidos são predominantemente hidrofóbicos. Em<br />
25 uma situação típica, um peptídeo de sinal alveja uma cadeia de polipeptídeo<br />
em crescimento que porta o peptídeo de sinal para o retículo endoplasmático<br />
da célula sob expressão. O peptídeo de sinal é separado por clivagem no<br />
retículo endoplasmático, possibilita a secreção do polipeptídeo por intermédio<br />
do complexo de Golgi.
compreender:<br />
5 peptídeo de sinal; ou<br />
peptídeo de sinal.<br />
77<br />
Um peptídeo de sinal para o uso na invenção pode<br />
(i) uma seqüência de peptídeo de sinal natural;<br />
(ii) uma variante homóloga de (i) que retenha a atividade do<br />
(iii) um fragmento de (i) ou (ii) que retenha a atividade do<br />
A seqüência (i) pode ser por exemplo o peptídeo de sinal<br />
ativador de plasminogênio de tecido humano (hTPAsp) (GenBank L00141), o<br />
10 peptídeo de sinal da aprotinina (GenBank AAD13685), peptídeo de sinal da<br />
extensina do tabaco (GenBank JU0465), ou peptídeo de sinal da lisozima de<br />
galinha (GenBank AF410481).<br />
Um peptídeo de sinal, adequado para o uso na presente<br />
invenção, é um que possibilitará a secreção de proteínas heterólogas. Um<br />
15 peptídeo de sinal funcional pode ser identificado em um ensaio que compare o<br />
efeito de um peptídeo de sinal de teste com o efeito de um peptídeo de sinal<br />
conhecido - por exemplo, peptídeo de sinal ativador de plasminogênio de<br />
tecido humano (hTPAsP) - e com o efeito de não ter nenhum peptídeo de<br />
sinal. O Ensaio de Expressão Comparativa apresentado abaixo pode ser usado<br />
20 mas com as seguintes modificações. Os vetores de expressão de secreção são<br />
construídos contendo o vetor base com o peptídeo de sinal de teste, hTPAsp<br />
ou nenhum peptídeo de sinal. As seqüências codificadoras para polipeptídeos<br />
destituídos de seus peptídeos de sinal que ocorrem naturalmente são inseridos<br />
nos vetores e os vetores transformados nas células hospedeiras de referência.<br />
25 Preferivelmente as células são células HEK293T, CHO, HeLa, BHK, 3T3 ou<br />
COS de mamífero. O meio de célula é analisado quanto aos níveis de<br />
expressão de polipeptídeo. Um peptídeo de sinal funcional possibilita a<br />
secreção do polipeptídeo em um nível mais alto do que um vetor que carece<br />
de um peptídeo de sinal com pelo menos um, preferivelmente dois
78<br />
polipeptídeos. Tipicamente, a secreção é 5% mais alta, ou mais<br />
preferivelmente 10% mais alta ou mais, por exemplo 20 ou 50% mais alta ou<br />
mais. Tipicamente, os níveis de secreção são comparáveis àqueles obtidos<br />
usando hTPAsp. Em alguns casos, qualquer um de aumento ou diminuição<br />
5 aqui aludido pode ser observado.<br />
Em um exemplo preferido, o peptídeo de sinal é selecionado<br />
de peptídeo de sinal de ativador de plasminogênio de tecido humano<br />
(hTPAsp), peptídeo de sinal de aprotinina, peptídeo de sinal de extensina do<br />
tabaco e peptídeo de sinal de lisozima de galinha.<br />
10 Possibilitar a secreção de proteína codificada fora de uma<br />
célula em expressão pode ter várias vantagens, em particular onde a proteína é<br />
um antígeno. Por exemplo, a secreção de antígeno aumentada possibilitaria<br />
maior captação de antígeno e resposta pelas células imunes (macrófagos,<br />
células de Langerhan, células B, células T, etc), possibilitaria a capacidade do<br />
15 antígeno para atingir a corrente sangüínea e as células de sinal (citocinas),<br />
possibilitaria que um antígeno encontrasse ligandos celulares e efetuasse uma<br />
função (anticorpos, toxinas tais como a toxina do cólera, LT de E. coli) e<br />
participariam em processos bioquímicos celulares normais (receptores<br />
celulares).<br />
20 Uma construção da invenção pode estar na forma de um<br />
plasmídeo. Uma construção de ácido nucleico da invenção pode estar na<br />
forma de um vetor de expressão plasmídico. Em um exemplo preferido, uma<br />
construção da invenção pode ser uma construção de DNA. Em exemplos<br />
alternativos, a construção pode ser uma construção de RNA ou PNA.<br />
25 O vetor pode depois incluir elementos adicionais, tais como<br />
uma origem de replicação, ou genes seletores. Tais elementos são conhecidos<br />
na técnica e podem ser incluídos usando técnicas padrão. Em uma forma de<br />
realização, o vetor plasmídico tem a seqüência na SEQ ID NO: 14.<br />
Alternativamente, a construção pode ser incluída em uma construção de vetor
viral.<br />
79<br />
Em algumas formas de realização, a construção de ácido<br />
nucleico da invenção pode compreender dois ou mais dos promotores<br />
quiméricos aqui definidos. Assim, a construção pode compreender uma<br />
5 pluralidade de promotores quiméricos e em particular a construção pode ter<br />
dois, três, quatro, cinco ou mais promotores quiméricos. Os promotores<br />
quiméricos preferivelmente serão cada um de modo separadamente operável<br />
ligados a um sítio de clonagem para a inserção de uma seqüência<br />
codificadora. Assim, a construção pode expressar duas, três, quatro, cinco ou<br />
10 mais seqüências codificadoras. As seqüências codificadoras expressadas<br />
podem ser qualquer uma daquelas aqui especificadas. Em um exemplo<br />
preferido, a construção tem dois promotores quiméricos com cada um tendo<br />
uma seqüência codificadora operavelmente ligada a eles. Em particular, os<br />
dois promotores podem ser transcritos separadamente um do outro. Em outras<br />
15 formas de realização, os promotores podem ser transcritos próximos um do<br />
outro. Assim, os promotores podem estar na orientação invertida ou em<br />
alguns casos na mesma orientação.<br />
Em particular, as construções com dois promotores podem<br />
expressar as subunidades A e B de uma toxina bacteriana que ribosila ADP,<br />
20 incluindo qualquer uma daquelas aqui mencionadas e preferivelmente uma<br />
subunidade A e B de LT. Entretanto, as construções com promotores<br />
múltiplos podem expressar qualquer combinação das seqüências<br />
codificadoras aqui mencionadas. Em um outro aspecto preferido, as<br />
construções com promotores múltiplos podem expressar uma pluralidade de<br />
25 antígenos da influenza, incluindo combinações de qualquer um dos antígenos<br />
da influenza aqui mencionados. Em um outro aspecto preferido, uma<br />
construção pode expressar um antígeno da influenza pandêmico, um<br />
fragmento imunogênico deste ou uma variante imunogênica de cada um e<br />
uma ou mais de qualquer uma das seqüências codificadoras aqui
mencionadas.<br />
80<br />
Em casos onde a construção tem promotores quiméricos<br />
múltiplos cada um pode compreender, ou ser operavelmente ligado a,<br />
qualquer uma das seqüências aqui mencionadas. Em um exemplo<br />
5 particularmente preferido, o intron heterólogo de um ou mais dos promotores<br />
pode ser a seqüência de intron A do gene da insulina de rato. Um ou mais dos<br />
promotores quiméricos também podem preferivelmente compreender a UTR<br />
5' de HBVpre-S2. Um ou mais dos promotores podem compreender a<br />
seqüência de poli adenilação do gene da beta globina de coelho.<br />
10 Em um caso preferido, a construção de ácido nucleico da<br />
invenção pode compreender duas seqüência promotoras quiméricas, com cada<br />
seqüência promotora sendo operavelmente ligada a um sítio de clonagem que<br />
tenha uma seqüência codificadora inserida nele, onde cada promotor<br />
quimérico compreende:<br />
15 (a) uma seqüência promotora inicial imediata de hCMV;<br />
imediato maior de hCMV; e<br />
(b) exon 1 e pelo menos uma parte do exon 2 do gene inicial<br />
(c) um intron heterólogo fornecido no lugar da região de intron<br />
A do gene inicial imediato maior de hCMV.<br />
20 Com a seqüência codificadora operavelmente ligada a um<br />
promotor quimérico que codifique uma subunidade LTA e a seqüência<br />
codificadora ligada ao outro que codifica uma subunidade LTB. A construção<br />
portanto pode expressar ambas as subunidades. Preferivelmente:<br />
25 intron A do gene da insulina de rato;<br />
- o intron heterólogo de cada promotor é a seqüência de<br />
- a seqüência que codifica cada subunidade LT é<br />
operavelmente ligada à UTR 5' de HBV pre-S2; e/ou<br />
- uma seqüência codificadora de LT é operavelmente ligada<br />
à seqüência de poliadenilação do gene da beta globina de coelho.
81<br />
Em um exemplo especialmente preferido, um ou mais dos<br />
elementos dos vetores pPJV7563 e/ou pPJV1671 podem ser utilizados em<br />
uma construção de ácido nucleico da invenção. Fragmentos funcionais ou<br />
variantes de tais elementos podem ser utilizados. Em particular, qualquer um<br />
5 dos elementos de pPJV1671 especificados na Tabela 3, variantes funcionais<br />
de tais elementos ou fragmentos funcionais de cada um podem ser utilizados.<br />
Similarmente, qualquer um dos elementos de pPJV7563 especificados no<br />
Exemplo 5, variantes funcionais de tais elementos ou fragmentos funcionais<br />
de cada um pode ser utilizado. Preferivelmente, as seqüências de um ou mais<br />
10 daqueles elementos dos próprios pPJV7563 e/ou pPJV1671 podem ser<br />
utilizadas. Em uma outra forma de realização preferida os elementos<br />
correspondentes da construção pPML7789 podem ser utilizados e a<br />
localização destes é indicada em particular na Figura 21 e na listagem de<br />
seqüência aqui fornecida. Em outros exemplos preferidos, os elementos<br />
15 correspondentes dos vetores pPJV2012 e pPJV7788 podem ser utilizados e<br />
em particular aqueles elementos indicados nas Tabelas 6 e 8 podem ser<br />
utilizados. Os Fragmentos funcionais e variantes dos elementos dos vetores<br />
pPML7789, pPJV2012 e pPJV7788 também podem ser utilizados nas<br />
construções da invenção.<br />
20 Em um exemplo preferido, uma construção da invenção<br />
compreende:<br />
No: 14;<br />
25 seqüência de (i),<br />
(i) a seqüência do vetor pPJV7563 fornecida como SEQ ID<br />
(ii) uma seqüência com 60% de identidade de seqüência com a<br />
à parte da inserção da seqüência que codifica o antígeno da influenza, um<br />
fragmento imunogênico ou variante imunogênica na seqüência de (i) ou (ii)<br />
de modo que a mesma seja operavelmente ligada ao promotor quimérico. Em<br />
um exemplo preferido, uma seqüência codificadora de uma tal construção
82<br />
codifica um antígeno HA, uma variante imunogênica deste ou um fragmento<br />
imunogênico de cada um.<br />
Em outros exemplos preferidos da invenção uma construção é<br />
fornecida onde o vetor compreende a seqüência do vetor pPJV1671 fornecido<br />
5 como a SEQ ID No: 54 ou uma seqüência com 60% de identidade de<br />
seqüência a esta. Em um outro exemplo preferido, o vetor compreende a<br />
seqüência do vetor pPML7789 fornecida como a SEQ ID No: 59 ou uma<br />
seqüência com 60% de identidade de seqüência a esta.<br />
Em um exemplo preferido, o promotor de CMV, a seqüência<br />
10 líder não traduzida, o intron A da insulina de rato, a seqüência líder não<br />
traduzida, o realçador de HBV e/ou a seqüência poli A de coelho de<br />
pPJV7563 e/ou pPJV1671 são utilizados ou uma variante funcional ou<br />
fragmento de tais seqüências. Em um exemplo especialmente preferido o<br />
intron A da insulina de rato e/ou o realçador de HBV de pPJV7563 e/ou<br />
15 pPJV1671 são utilizados ou um fragmento funcional ou variante de tais<br />
seqüências. Em particular, tanto o intron A da insulina de rato quanto o<br />
realçador de HBV são utilizados ou um fragmento funcional ou variante de<br />
tais seqüências são utilizados. Em um outro exemplo preferido as seqüências<br />
correspondentes de pPML7789, pPJV2012, pPJV7788, fragmentos funcionais<br />
20 de tais seqüências ou variantes de tais seqüências podem ser utilizados.<br />
Em exemplos onde a construção codifica diversos<br />
polipeptídeos e em particular antígenos, seqüências particulares podem ser<br />
omitidas para reduzir o tamanho da construção. Por exemplo, as construções<br />
pode carecer de um realçador e/ou uma seqüência líder não traduzida,<br />
25 particularmente onde três, quatro, cinco ou mais antígenos são codificados.<br />
Em outras construções que codificam o mesmo número de antígenos estas<br />
seqüências ainda podem estar presentes.<br />
Em um exemplo particularmente preferido, o vetor pPJV7563<br />
é usado para clonar as seqüências codificadoras desejadas e em particular as
83<br />
seqüências codificadoras para um antígeno tais como, por exemplo, qualquer<br />
um dos antígenos aqui mencionados. Em um exemplo preferido um antígeno<br />
da influenza desejado, fragmento ou variante deste é clonado no vetor. As<br />
modificações em alguns casos podem ser feitas a pPJV7563. Por exemplo, o<br />
5 gene da resistência à canamicina pode ser trocado por um gene alternativo e<br />
em particular um marcador selecionável ou triável alternativo. Qualquer uma<br />
das construções de ácido nucleico da invenção pode compreender marcadores<br />
selecionáveis. A cadeia principal do plasmídeo pUC19 de pPJV7563 pode ser<br />
modificada ou substituída com uma cadeia principal de plasmídeo diferente.<br />
10 Os elementos específicos de pPJV7563, por exemplo, podem ser trocados<br />
com qualquer um dos elementos que satisfazem a mesma função e em<br />
particular variantes funcionais ou fragmentos das seqüências em pPJV7563.<br />
Em alguns exemplos pPJV7563 pode ser modificado pela substituição de um<br />
elemento particular com qualquer um dos elementos aqui aludidos que têm a<br />
15 mesma função como o elemento a ser substituído. As modificações similares<br />
podem ser para pPJV1671 quando este está sendo utilizado. Modificações<br />
similares também podem ser feitas a qualquer um dos vetores aqui<br />
mencionados e em particular pPML7789, pPJV2012 e pPJV7788. As<br />
seqüências codificadoras de pPML7789, pPJV2012 e pPJV7788 podem ser<br />
20 trocadas por qualquer uma das seqüências codificadoras aqui mencionadas.<br />
No caso de pPJV2012 e pPJV7788 uma ou ambas as seqüências codificadoras<br />
do vetor podem ser trocadas.<br />
Em uma forma de realização preferida uma construção de<br />
ácido nucleico da invenção compreende:<br />
25 (i) a seqüência do vetor pPJV7563 fornecida como a SEQ ID<br />
No: 14;<br />
seqüência de (i),<br />
(ii) uma seqüência com 60% de identidade de seqüência à<br />
à parte da inserção das seqüências codificadoras desejadas de modo que elas
84<br />
sejam operavelmente ligadas ao promotor quimérico. Em um exemplo<br />
preferido, as seqüências codificadoras codificam um antígeno. Em particular,<br />
uma seqüência codificadora que codifique um antígeno da influenza, um<br />
fragmento imunogênico ou variante imunogênica é inserido na seqüência de<br />
5 (i) ou (ii) de modo que este esteja operavelmente ligado ao promotor<br />
quimérico.<br />
A construção pode ter 60% de identidade de seqüência à<br />
seqüência de (i) levando-se em conta as seqüências codificadoras inseridas ou<br />
desconsiderando-as. A construção pode ter qualquer um dos valores da<br />
10 identidade de seqüência aqui especificados e em particular, pelo menos 70%,<br />
preferivelmente pelo menos 80%, mais preferivelmente pelo menos 90% e<br />
ainda mais preferivelmente pelo menos 95%. Em uma forma de realização<br />
preferida a construção é pPJV7563 à parte da inserção das seqüências<br />
codificadoras.<br />
15 As seqüências adicionais podem ser adicionadas à seqüência<br />
de pPJV7563 para gerar outras construções da invenção. Por exemplo, um ou<br />
mais promotores quiméricos da invenção podem ser adicionados juntos com<br />
qualquer uma das seqüências aqui mencionadas que podem estar em ligação<br />
operável a um tal promotor. O sítio de clonagem de pPJV7563 pode ser<br />
20 modificado para possibilitar a clonagem de fragmentos de restrição diferentes<br />
e em particular a clonagem das seqüências codificadoras como fragmentos<br />
diferentes. Modificações similares podem ser feitas a qualquer um dos vetores<br />
aqui mencionados e em particular ao pPML7789, pPJV2012 e pPJV7788.<br />
Em um outro exemplo preferido, uma construção da invenção<br />
25 pode ser fabricada substituindo-se alguma ou todas das seqüências<br />
codificadoras de pPJV1671 que codifique um antígeno com seqüências que<br />
codifiquem um antígeno diferente. Mais uma vez, qualquer uma das<br />
modificações debatidas acima em relação a pPJV7563 também podem ser<br />
feitas para modificar pPJV 1671. Tais modificações também podem ser feitas
85<br />
ao pPML7789. As seqüências codificadoras de pPJV2012 e pPJV7788<br />
também podem ser substituídas com outras seqüências codificadoras<br />
desejadas e em particular aquelas que codifiquem um antígeno.<br />
5 compreende a:<br />
10<br />
Em outros exemplos preferidos, a construção da invenção<br />
- seqüência do vetor pPJV1671 fornecida como a SEQ ID<br />
No: 54 ou uma seqüência com 60% de identidade de seqüência a esta;<br />
- seqüência do vetor pPML7789 fornecida como a SEQ ID<br />
No: 59 ou uma seqüência com 60% de identidade de seqüência a esta;<br />
- seqüência do vetor pPJV2012 fornecida pela SEQ ID No:<br />
61 ou uma seqüência com 60% de identidade de seqüência a esta;<br />
seqüência do vetor pPJV7788 fornecida pela SEQ ID No:<br />
62 ou uma seqüência com 60% de identidade de seqüência a esta.<br />
Em tais exemplos, a construção pode ter qualquer uma das<br />
15 identidades de seqüência percentual aqui especificadas e em particular<br />
aquelas especificadas acima em relação a pPJV7563.<br />
Uma construção da invenção pode compreender qualquer um<br />
dos elementos especificados nas Tabelas aqui e em particular aquelas<br />
especificadas nas Tabelas 3, 6 e 8. Os fragmentos funcionais de tais<br />
20 seqüências e variantes de tais seqüências e seus fragmentos também podem<br />
ser utilizados. Em um exemplo preferido, onde o vetor é um vetor adjuvante<br />
um ou mais dos elementos especificados pelas Tabelas 6 e/ou 8 podem estar<br />
presentes ou um fragmento ou variante de uma tal seqüência.<br />
A invenção também fornece um método para gerar uma<br />
25 construção da invenção que compreende inserir seqüências codificadoras para<br />
um polipeptídeo e em particular um antígeno em um vetor da invenção que<br />
careça de tais seqüências. As seqüências codificadoras podem codificar<br />
qualquer um dos antígenos aqui mencionados. Em um exemplo preferido, a<br />
invenção fornece um tal método que compreende inserir as seqüências
86<br />
codificadoras escolhidas em pPJV7563, pPJV1671 ou uma das versões<br />
modificadas dos vetores aqui debatidos. Estes podem ser inseridos no<br />
pPML7789, pPJV2012 e/ou pPJV7788 e em particular pPML7789. Em<br />
alguns casos uma seqüência codificadora adicional pode ser inserida e/ou uma<br />
5 seqüência codificadora já presente pode ser substituída com uma seqüência<br />
10<br />
15<br />
codificadora diferente.<br />
A invenção também fornece uma seqüência promotora e uma<br />
seqüência codificadora operavelmente ligada ao promotor, onde a construção<br />
compreende ainda:<br />
(a) uma seqüência líder não traduzida que é derivada da<br />
seqüência de antígeno HBVpreS2, seqüência de antígeno e de HBV ou<br />
seqüência de antígeno tipo 2gD de HSV, que está em ligação operável com a<br />
seqüência codificadora e promotor que é heterólogo à seqüência codificadora;<br />
e/ou<br />
(b) uma seqüência realçadora 3' de e operavelmente ligada à<br />
seqüência codificadora, onde a seqüência realçadora é derivada de uma UTR<br />
3' de uma seqüência do HBsAg ou uma UTR 3' de uma seqüência de gene<br />
inicial imediata de CMV símio, e a seqüência codificadora é heteróloga à<br />
seqüência realçadora 3'.<br />
20 Os vários elementos do vetor podem ser qualquer um daqueles<br />
aqui especificados. Em um exemplo, a seqüência promotora (i) é selecionada<br />
da seqüência do promotor inicial imediato do hCMV, seqüência promotora do<br />
vírus da pseudo-raiva e seqüência promotora do vírus do sarcoma de Rous.<br />
Em uma outra, o promotor é um dos promotores quiméricos aqui debatidos.<br />
25 Em um outro exemplo, a invenção fornece um promotor<br />
quimérico purificado, isolado onde o promotor quimérico é qualquer um<br />
daqueles aqui definidos.<br />
Uma construção de polinucleotídeo da invenção pode ser<br />
substancialmente isento de ou associado com células ou com material celular.
87<br />
Esta pode estar na forma substancialmente isolada, ou pode estar na forma<br />
substancialmente purificada, caso este em que no geral compreenderá pelo<br />
menos 90% por exemplo, pelo menos 95%, 98% ou 99% do polinucleotídeo<br />
ou massa seca na preparação.<br />
5 As presentes moléculas de ácido nucleico podem ser liberadas<br />
às células hospedeiras adequadas, para a expressão de um polinucleotídeo em<br />
ligação operável com o promotor. Preferivelmente as célula hospedeiras são<br />
células de mamífero, em particular células humanas. Os métodos adequados<br />
para a liberação de ácidos nucleicos a tais células são conhecidos na técnica e<br />
10 incluem, por exemplo, a transfecção mediada com dextrano, precipitação com<br />
fosfato de cálcio, eletroporação e microinjeção direta nos núcleos. Assim, a<br />
invenção fornece uma transformação de célula com um vetor da invenção.<br />
Como descrito acima, uma seqüência de ácido nucleico<br />
codificadora em uma construção pode codificar um polipeptídeo<br />
15 terapeuticamente relevante. As presentes construções portanto podem ser<br />
usadas para a imunização com ácido nucleico ou terapia de gene usando<br />
protocolos de liberação de gene padrão. Os métodos adequados para a<br />
liberação de, gene são conhecidos na técnica, como debatido abaixo. As<br />
moléculas de ácido nucleico podem ser liberadas diretamente a um indivíduo,<br />
20 ou alternativamente, liberadas ex vivo às células derivadas do indivíduo<br />
depois do que as células são reimplantadas no indivíduo. Em um exemplo<br />
preferido, as construções são liberadas diretamente ao indivíduo onde o<br />
polipeptídeo codificado é um antígeno, particularmente um antígeno da<br />
influenza. Qualquer uma das vias de liberação aqui mencionadas podem ser<br />
25 utilizadas e em particular a liberação transdérmica. As construções adjuvantes<br />
da invenção podem ser administradas para realçar uma resposta imune contra<br />
um antígeno e em particular contra um antígeno expressado a partir de uma<br />
construção da invenção.<br />
A invenção também fornece o uso de uma construção de ácido
88<br />
nucleico da invenção ou uma população de construções de ácido nucleico da<br />
invenção ou partículas revestidas da invenção na fabricação de um<br />
medicamento para a imunização com ácido nucleico. O medicamento pode<br />
ser um que deva ser liberado por injeção, liberação de partícula transdérmica,<br />
5 inalação, tópica, oral, intranasal ou transmucosicamente. Em um exemplo<br />
preferido, o medicamento deve ser liberado pela injeção isenta de agulha.<br />
Para o uso em imunização com ácido nucleico ou terapia de<br />
gene, as construções de ácido nucleico podem ser formuladas como<br />
preparações farmacêuticas convencionais. Isto pode ser feito usando as<br />
10 químicas e metodologias da formulação farmacêutica padrão, que estão<br />
disponíveis àqueles de habilidade na técnica. Por exemplo, composições<br />
contendo uma ou mais seqüência de ácido nucleicos (por exemplo, presentes<br />
em uma forma de vetor adequada tal como um plasmídeo de DNA) pode ser<br />
combinado com um ou mais excipientes ou veículos farmaceuticamente<br />
15 aceitáveis para fornecer uma preparação líquida. Assim também é fornecida<br />
uma composição farmacêutica que compreende uma construção de ácido<br />
nucleico da invenção e um carreador ou excipiente farmaceuticamente<br />
aceitáveis. Em um exemplo preferido uma composição farmacêutica pode<br />
compreender uma pluralidade de construções da invenção ou uma população<br />
20 de construções da invenção incluindo qualquer uma daquelas aqui<br />
mencionadas.<br />
As substâncias auxiliares, tais como agentes umectantes ou<br />
emulsificantes, substâncias tamponantes de pH e outras, podem estar<br />
presentes no excipiente ou veículo. Estes excipientes, veículos e substâncias<br />
25 auxiliares são no geral agentes farmacêuticos que podem ser administrados<br />
sem a toxicidade indevida e que, no caso de composições de vacina não<br />
induzirão uma resposta imune no indivíduos que recebe a composição. Os<br />
excipientes farmaceuticamente aceitáveis incluem, mas não são limitados a,<br />
líquidos tais como água, solução salina, polietileno glicol, ácido hialurônico,
89<br />
glicerol e etanol. Os sais farmaceuticamente aceitáveis também podem ser<br />
incluídos nesse ponto, por exemplo, os sais de ácido mineral tais como<br />
cloridretos, bromidretos, fosfatos, sulfatos, e outros; e os sais de ácidos<br />
orgânicos tais como acetatos, propionatos, malonatos, benzoatos, e outros.<br />
5 Também é preferido, embora não requerido, que a preparação conterá um<br />
excipiente farmaceuticamente aceitável que serve como um estabilizador,<br />
particularmente para peptídeo, proteína ou outras moléculas semelhantes se<br />
estas devam ser incluídas na composição. Os exemplos de carreadores<br />
adequados que também atuam como estabilizadores para os peptídeos<br />
10 incluem, sem limitação, graus farmacêuticos de dextrose, sacarose, lactose,<br />
trealose, manitol, sorbitol, inositol, dextrano e outros. Outros carreadores<br />
adequados incluem, mais uma vez sem limitação, amido, celulose, fosfatos de<br />
sódio ou cálcio, ácido cítrico, ácido tartárico, glicina, polietileno glicóis de<br />
peso molecular alto (PEGs), e combinação destes. Um debate completo de<br />
15 excipientes, veículos e substâncias auxiliares farmaceuticamente aceitáveis<br />
está disponível em REMINGTON'S PHARMACEUTICAL SCIENCES<br />
(Mack Pub. Co., N. J. 1991), aqui incorporado por referência.<br />
Certos facilitadores da captação e/ou expressão de ácido<br />
nucleico ("agentes que facilitam a transfecção") também podem ser incluídos<br />
20 nas composições, por exemplo, facilitadores tais como bupivacaína,<br />
cardiotoxina e sacarose, e veículos que facilitam a transfecção tais como<br />
preparações lipossômicas ou lipídicas que são rotineiramente usados para<br />
liberar moléculas de ácido nucleico. os lipossomas aniônicos e neutros são<br />
amplamente disponíveis e bem conhecidos para a liberação de moléculas de<br />
25 ácido nucleico (ver, por exemplo, Liposomes: A Practical Approach, (1990)<br />
RPC New Ed., IRL Press). As preparações lipídicas catiônicas também são<br />
veículos bem conhecidos para o uso na liberação de moléculas de ácido<br />
nucleico. as preparações lipídicas adequadas incluem DOTMA (cloreto de N-<br />
[1-(2,3-dioleilóxi)propil]-N,N,N-trimetilamônio), disponível sob a marca
90<br />
Lipofectin , e DOTAP (1,2-bis(oleilóxi)-3-(trimetilamônio)propano), ver, por<br />
exemplo, Felgner et al. (1987) Proc. Natl. Acad. Sci. USA 84: 7413-7416;<br />
Malone et al. (1989) Proc. Natl. Acad. Sci. USA 86: 6077-6081; Patente US<br />
1\122 5.283.185 e 5.527.928, e Publicações Internacionais 1\1 2 - WO 90/11092,<br />
5 WO 91/15501 e WO 95/26356. Estes lipídeos catiônicos podem ser<br />
preferivelmente usados em associação com um lipídeo neutro, por exemplo<br />
DOPE (dioleil fosfatidiletanolamina). Além disso, as composições que<br />
facilitam a transfecção que podem ser adicionadas às preparações de lipídeo<br />
ou lipossoma acima incluem derivados de espermina (ver, por exemplo, a<br />
10 Publicação Internacional WO 93/18759) e compostos permeabilizantes de<br />
membrana tais como GALA, Gramicidina S e sais biliares catiônicos (ver, por<br />
exemplo, a Publicação Internacional NP- WO 93/19768).<br />
Alternativamente, as moléculas de ácido nucleico da presente<br />
invenção podem ser encapsuladas, absorvidas ou associadas com carreadores<br />
15 particulados. Os carreadores particulados adequados incluem aqueles<br />
derivados de polímeros de metacrilato de polimetila, bem como<br />
micropartículas de PLG derivados de poli(lactídeos) e poli(lactídeo-co-<br />
glicolídeos). Ver, por exemplo, Jeffery et al. (1993) Pharm. Res. 10: 362-368.<br />
Outros sistemas particulados e polímeros também podem ser usados, por<br />
20 exemplo, polímeros tais como polilisina, poliarginina, poliornitina, espermina,<br />
espermidina, bem como conjugados destas moléculas. Em uma forma de<br />
realização preferida, as construções da invenção são precipitadas em<br />
carreadores na presença de um agente de condensação de ácido nucleico e um<br />
agente quelador de íon metálico. Os agentes de condensação preferidos<br />
25 incluem polímeros catiônicos, em particular poliaminas, e em particular uma<br />
poliarginina ou um polilisina. Em um exemplo preferido a poliamina é (Arg)4<br />
ou (Arg)6. Referência pode ser feita às técnicas debatidas na WO<br />
2004/208560 que podem ser utilizadas para gerar partículas carreadoras<br />
revestidas da invenção.
91<br />
Uma vez formuladas, as composições podem ser liberadas a<br />
um indivíduo in vivo usando uma variedade de vias e técnicas conhecidas. Por<br />
exemplo, as preparações líquidas podem ser fornecidas como uma solução,<br />
suspensão ou emulsão injetáveis e administradas por intermédio da injeção<br />
5 parenteral, subcutânea, intradérmica, intramuscular, intravenosa usando uma<br />
agulha e seringa convencionais, ou usando um sistema de injeção de jato<br />
líquido. As preparações líquidas também podem ser administradas<br />
topicamente à pele ou tecido mucósico, ou fornecidas como uma pulverização<br />
finamente dividida adequada para a administração respiratória ou pulmonar.<br />
10 Outros modos de administração incluem a administração oral, supositórios, e<br />
técnicas de liberação transdérmica ativas ou passivas.<br />
Alternativamente, as composições podem ser administradas ex<br />
vivo, por exemplo a liberação e reimplantação de células transformadas em<br />
um indivíduo são conhecidas (por exemplo, a transfecção mediada por<br />
15 dextrano, precipitação com fosfato de cálcio, eletroporação, e microinjeção<br />
direta nos núcleos).<br />
As composições são administradas a um indivíduo em uma<br />
quantidade que seja compatível com a formulação de dosagem e que será<br />
profilática e/ou terapeuticamente eficaz. Uma quantidade eficaz apropriada<br />
20 cairá em uma faixa relativamente ampla mas pode ser facilmente determinada<br />
por uma pessoa de habilidade na técnica pelos testes de rotina. O "Physicians<br />
Desk Reference" e "Goodman e Gilman's The Pharmacological Basis of<br />
Therapeutics" são úteis para os propósitos de determinar a quantidade<br />
necessária. Por exemplo, é no geral esperado que uma dose eficaz do<br />
25 polinucleotídeo cairá dentro de uma faixa de cerca de 0,001 a 1000 In,<br />
preferivelmente de 0,001 a 100 lig, mais preferivelmente de 0,01 a 10,0 lig.<br />
Em alguns exemplos a dose pode ser de 0,1 a 100 pg, preferivelmente de 0,5<br />
a 25 Em casos onde a dose é administrada por intermédio da injeção<br />
isenta de agulha, a dose em alguns casos pode ser de 0,1 a 25 pg,
92<br />
preferivelmente de 0,5 a 10 pg e mais preferivelmente de 1 a 5 pg. Em<br />
particular, a dose pode ser de 4 pg. Em alguns casos, a dose pode ser dada por<br />
intermédio de uma pluralidade de injeções isentas de agulha tais como, por<br />
exemplo, em uma, duas, três, quatro ou cinco injeções isentas de agulha.<br />
5 Em alguns casos depois de uma administração inicial, uma<br />
administração subseqüente da construção pode ser realizada. Em particular, a<br />
seguir de uma imunização inicial um indivíduo pode ser administrado com<br />
uma imunização de reforço. A imunização de reforço pode ser, por exemplo,<br />
uma dose escolhida de qualquer uma daquelas aqui mencionadas. A<br />
10 administração ao indivíduo, por exemplo, pode ser em pelo menos uma<br />
semana, duas semanas, um mês, dois meses ou seis meses depois da<br />
administração inicial.<br />
Em um exemplo, uma construção de ácido nucleico da<br />
invenção pode ser usada em conjunção com uma outra construção de ácido<br />
15 nucleico. Em um caso, a construção de ácido nucleico pode ser uma daquela<br />
aqui descrita para a expressão de um adjuvante e a outra construção pode ser<br />
uma construção que codifique um ou mais antígenos. Em um caso preferido,<br />
ambas as construções podem utilizar os promotores quiméricos da invenção.<br />
Onde dois ou mais agentes são aqui dados eles podem ser em particular<br />
20 administrados separada, simultânea ou seqüencialmente.<br />
No caso onde uma construção expresse um adjuvante e a outra<br />
um antígeno ou antígenos, os antígenos em particular podem ser de HSV,<br />
HPV, ou do vírus da Hepatite (particularmente do vírus da Hepatite B). Os<br />
antígenos em particular podem ser os antígenos HSV ICPO, ICP4, ICP 22<br />
25 e/ICP 27 e preferivelmente todos os quatro. Em um caso especialmente<br />
preferido, os antígenos podem ser um antígeno da influenza incluindo<br />
qualquer um daqueles aqui mencionados e em particular HA, NA e/ou M2 e<br />
em particular HA e NA e especialmente HA. Em casos onde tais antígenos<br />
são expressados, a construção de adjuvante em particular expressará LTA
93<br />
e/ou LTB e em particular ambos. Qualquer uma das construções de adjuvante<br />
aqui mencionadas pode ser utilizada simultânea, separada ou seqüencialmente<br />
com qualquer uma das construções que codifiquem um antígeno.<br />
Qualquer uma de duas entidades da invenção pode ser<br />
5 administrada separada, seqüencial ou simultaneamente. As duas construções<br />
podem ser administradas separada, simultânea ou seqüencialmente. As duas<br />
podem ser administradas na mesma ou em composições diferentes. Em<br />
particular, onde uma construção tem um efeito adjuvante as duas serão<br />
liberadas de modo que um efeito adjuvante seja observado, isto é a resposta<br />
10 imune gerada será maior e/ou por um período mais longo do que se o<br />
adjuvante não fosse administrado com o antígeno. Em um exemplo preferido,<br />
as duas construções podem ser liberadas na mesma composição,<br />
preferivelmente nas mesmas partículas carreadoras. Em outros casos as<br />
partículas carreadoras que carregam uma construção podem ser misturadas<br />
15 com partículas carreadoras que carregam uma outra construção. Qualquer um<br />
de tais esquemas de administração pode ser utilizado para qualquer uma das<br />
combinações de uma pluralidade de construção aqui debatidas.<br />
Em uma forma de realização preferida, as construções de ácido<br />
nucleico da invenção são liberadas para alvejar as células usando uma técnica<br />
20 de liberação mediada por partícula. Os métodos mediados por partícula para a<br />
liberação de preparações de ácido nucleico são conhecidos na técnica.<br />
Assim, em um exemplo preferido a invenção fornece<br />
partículas revestidas que compreendem partículas carreadoras revestidas com<br />
uma construção de ácido nucleico da invenção ou uma população de<br />
25 construções de ácido nucleico da invenção. Em particular, as partículas<br />
revestidas são adequadas para a liberação a partir de um dispositivo de<br />
liberação mediada por partícula.<br />
As partículas para a liberação mediada por partícula podem ser<br />
formadas revestindo-se as presentes moléculas de ácido nucleico sobre
94<br />
partículas carreadoras (por exemplo, carreadores de núcleo) usando uma<br />
variedade de técnicas conhecidas no ramo. As partículas carreadoras são<br />
selecionadas de materiais que tenham uma densidade adequada na faixa de<br />
tamanhos de partícula tipicamente usados para a liberação intracelular a partir<br />
5 de um dispositivo de liberação mediada por partícula. Tipicamente as<br />
10<br />
partículas carreadoras têm um diâmetro de 0,1 a 5 iam, por exemplo de 0,5 a 3<br />
gm, preferivelmente de 1 a 2 gm. Em alguns casos, as partículas podem ter<br />
um diâmetro de 1 a 3 .trri. O tamanho de partícula do carreador ótimo,<br />
naturalmente, dependerá do diâmetro das células alvo.<br />
Usualmente as partículas carreadoras são selecionadas de<br />
metais inertes. Os metais são inertes em que eles não são fisiologicamente<br />
ativos. Para os propósitos da invenção Ferro, Cobalto, Níquel, Cobre, Prata,<br />
Cádmio, Háfnio, Tantálio, Tungstênio, Platina, Ouro, e Aço Inoxidável, por<br />
exemplo podem ser usados e em particular partículas carreadoras de<br />
15 tungstênio, ouro, platina e irídio podem ser usadas. As partículas de<br />
tungstênio e ouro são preferidas. Assim, em um exemplo preferido, a<br />
invenção fornece partículas carreadoras revestidas que são de ouro ou<br />
tungstênio. As partículas de tungstênio são facilmente disponível em<br />
tamanhos médios de 0,5 a 2,0 pm no diâmetro. Embora tais partículas tenha<br />
20 densidade ótima para o uso em métodos de liberação de aceleração de<br />
partícula, e possibilitam revestimento altamente eficiente com DNA, o<br />
tungstênio pode ser potencialmente tóxico para certos tipos de célula. As<br />
partículas de ouro ou ouro microcristalino (por exemplo, pó de ouro A1570,<br />
disponível da Engelhard Corp., East Newark, NJ) também encontrarão uso<br />
25 com os presentes métodos. As partículas de ouro fornecem uniformidade no<br />
tamanho (disponível da Alfa Chemicals em tamanhos de partícula de 1 a 3<br />
gm, ou disponíveis da Degussa, South Plainfield, NJ em uma faixa de<br />
tamanhos de partícula incluindo 0,95 gm) e toxicidade reduzida. O ouro<br />
microcristalino fornece uma distribuição de tamanho de partícula diversa,
95<br />
tipicamente na faixa de 0,1 a 5 gm. Entretanto, a área de superfície irregular<br />
de ouro microcristalino fornece revestimento altamente eficiente com ácidos<br />
nucleicos.<br />
Vários métodos são conhecidos e foram descritos para revestir<br />
5 ou precipitar DNA ou RNA sobre partículas de ouro ou tungstênio. A maioria<br />
de tais métodos no geral combinam uma quantidade pré determinada de ouro<br />
ou tungstênio com DNA plasmídico, CaC1 2 e espermidina. A solução<br />
resultante é turbilhonada continuamente durante o procedimento de<br />
revestimento para garantir uniformidade da mistura de reação. Depois da<br />
10 precipitação do ácido nucleico, as partículas revestidas podem ser transferidas<br />
para membranas adequadas e deixadas secar antes do uso, revestidas em<br />
superfícies de uma amostra módulo ou cassete, ou carregado em um cassete<br />
de liberação para o uso em particular na liberação mediada por instrumentos<br />
de partícula.<br />
15 Como uma alternativa, os polinucleotídeos da invenção podem<br />
ser formulados como uma composição particulada. A formulação pode ser<br />
realizada usando as químicas da formulação farmacêutica padrão descritas<br />
acima. Por exemplo, os polinucleotídeos podem ser combinados com um ou<br />
mais excipientes ou veículos farmaceuticamente aceitáveis para fornecer uma<br />
20 composição adequada. As composições formuladas são depois preparadas<br />
como partículas usando técnicas padrão tais como pela evaporação simples<br />
(secagem ao ar), secagem a vácuo, secagem por pulverização, secagem por<br />
congelamento (liofilização), secagem por pulverização-congelamento,<br />
revestimento por pulverização, precipitação, formulação de partícula de fluido<br />
25 super crítico e outros. Se desejado, as partículas resultantes podem ser<br />
densificadas usando as técnicas descritas na Publicação Internacional de<br />
propriedade comum N'WO 97/48485, incorporada aqui por referência.<br />
Estes métodos podem ser usados para se obter partículas de<br />
ácido nucleico tendo um tamanho variando de cerca de 0,01 a cerca de 250
5<br />
96<br />
gm, preferivelmente de cerca de 10 a cerca de 150 gm, e o mais<br />
preferivelmente de cerca de 20 a cerca de 60 Jim; e uma densidade de<br />
partícula variando de cerca de 0,1 a cerca de 25 g/cm 3, e uma densidade<br />
volumétrica de cerca de 0,5 a cerca de 3,0 g/cm 3, ou maior.<br />
Uma vez formadas, as partículas que compreendem as<br />
moléculas de ácido nucleico podem ser empacotadas em dosagens unitárias<br />
isoladas ou recipientes de dose múltipla. A invenção portanto também fornece<br />
um receptáculo de dosagem para um dispositivo de liberação mediada por<br />
partícula que compreende partículas revestidas da invenção. Tais recipientes<br />
10 podem compreender um recipiente hermeticamente selado incluindo uma<br />
quantidade adequada das partículas. As partículas podem ser embaladas como<br />
uma formulação estéril, e o recipiente hermeticamente selado pode ser assim<br />
planejado para preservar a esterilidade da formulação até o uso na liberação a<br />
um indivíduo. Os recipientes são preferivelmente adaptados para o uso direto<br />
15 em um dispositivo de liberação mediada por partícula. Tipicamente tais<br />
recipientes tomam a forma de cápsulas, bolsas de folha metálica, sachês,<br />
cassetes e outros. Os dispositivos de liberação de partícula também podem ser<br />
fornecidos em uma condição pré carregada contendo uma dosagem adequada<br />
das partículas. O dispositivo pré carregado também pode ser depois pré<br />
20 empacotado em um recipiente hermeticamente selado.<br />
O recipiente em que as partículas são empacotadas pode ser<br />
ainda rotulado para identificar a composição e fornecer informação de<br />
dosagem relevante. Além disso, o recipiente pode ser rotulado com uma<br />
informação na forma prescrita por uma agência governamental, por exemplo,<br />
25 a Food and Drug Administration, em que a informação indica a aprovação<br />
pela agência sob Lei Federal da fabricação, uso ou venda da preparação de<br />
ácido nucleico aí contida para a administração humana.<br />
A invenção também fornece um dispositivo de liberação<br />
mediada por partícula carregado com partículas revestidas da invenção.
97<br />
Preferivelmente, o dispositivo de liberação é uma seringa isenta de agulha. Os<br />
dispositivos de aceleração de partícula, adequados para a liberação mediada<br />
por partícula são conhecidos na técnica. Por exemplo, os dispositivos de<br />
pistola de gene correntes utilizam um explosivo, descarga elétrica ou gasosa<br />
5 para impelir as partículas carreadoras revestidas na direção das células alvo.<br />
As partículas carreadoras revestidas podem ser liberavelmente ligadas a uma<br />
placa carreadora móvel, ou removivelmente ligadas a uma superfície ao longo<br />
da qual uma corrente de gás passa, levantando as partículas da superfície e<br />
acelerando-as na direção do alvo. Um exemplo de um dispositivo de descarga<br />
10 gasosa está descrito na Patente U.S. -9- N5.204.253.<br />
Um dispositivo tipo<br />
explosivo é descrito na Patente U.S. l\P 4.945.050. Um exemplo de um<br />
aparelho de descarga elétrica adequado para o uso aqui é descrito na Patente<br />
U.S. 1\12 5.120.657. Um outro aparelho de descarga elétrica é descrito na<br />
Patente US 1\1 -' 5.149.655. A divulgação de todas estas patentes é aqui<br />
15 incorporada por referência em suas totalidades.<br />
As partículas também podem ser administradas usando um<br />
dispositivo de seringa isenta de agulha, tal como aquele descrito na Patente<br />
U.S. 5.630.796 concedida a Bellhouse et al ("the PowderJect® needleless<br />
syringe device") e na Publicação Internacional IV WO 94/24263, WO<br />
20 96/04947, WO 96/12513 e WO 96/20022, todas as quais são aqui<br />
incorporadas por referência.<br />
Dispositivos tais como aquele descrito na Patente US 1\1 12<br />
contendo, em ordem linear movendo-se do topo para o fundo, um cilindro de<br />
25 gás, um cassete ou pacote de partículas, e um bocal supersônico com um meio<br />
silenciador associado. As partículas são fornecidas dentro de um recipiente<br />
adequado, por exemplo, um cassete formado por duas membranas poliméricas<br />
rupturáveis que são seladas por calor a um espaçador na forma de lavador<br />
para formar uma unidade selada auto-contida. Os materiais de membrana<br />
5.630.796 podem ser fornecidos como um instrumento na forma de caneta
98<br />
podem ser selecionados para se obter um modo específico de abertura e<br />
pressão de estouro que ditam as condições nas quais o fluxo supersônico é<br />
iniciado.<br />
Em operação, o dispositivo é atuado para liberar o gás<br />
5 comprimido do cilindro em uma câmara de expansão dentro do dispositivo. O<br />
gás de liberação contata o cassete de partícula e, quando pressão suficiente é<br />
desenvolvida, repentinamente rompe as membranas do cassete varrendo as<br />
partículas para dentro do bocal supersônico para a liberação subseqüente. O<br />
bocal é planejado para se obter uma velocidade de gás específica e padrão de<br />
10 fluxo para liberar uma quantidade de partículas a uma superfície alvo de área<br />
pré definida. O silenciador é usado para atenuar o ruído produzido pelo fluxo<br />
de gás supersônico.<br />
O sistema de liberação descrito na Publicação Internacional Ni'<br />
WO 96/20022 também usa a energia de uma fonte de gás comprimido para<br />
15 acelerar e liberar composições em pó. Entretanto, é distinguido do sistema da<br />
Patente US NP- 5.630.796 no seu uso de uma onda de choque ao invés de fluxo<br />
de gás para acelerar as partículas. Mais particularmente, um aumento da<br />
pressão instantânea fornecida por uma onda de choque gerada por detrás de<br />
uma cúpula flexível golpeia a parte de trás da cúpula, causando uma eversão<br />
20 súbita da cúpula flexível na direção de uma superfície alvo. Esta eversão<br />
súbita catapulta uma composição em pó (que está localizada no lado externo<br />
da cúpula) em uma velocidade suficiente, deste modo cinética, para penetrar o<br />
tecido alvo, por exemplo, tecido mucósico oral. A composição em pó é<br />
liberada no ponto da eversão da abóbada completa. A abóbada também serve<br />
25 para conter completamente o fluxo de gás em alta pressão que portanto não<br />
entra em contato com o tecido. Porque o gás não é liberado durante esta<br />
operação de liberação, o sistema é inerentemente imóvel. Este planejamento<br />
pode ser usado em outras aplicações fechadas ou de outro modo sensíveis por<br />
exemplo, para liberar partículas aos sítios cirúrgicos minimamente invasivos.
99<br />
As partículas podem ser liberadas in vivo diretamente a um<br />
indivíduo, ou ex vivo às células tiradas de um indivíduo, as células<br />
transformadas sendo depois reimplantadas no indivíduo. Para a liberação in<br />
vivo, a injeção de partícula é tipicamente subcutânea, epidérmica,<br />
5 intradérmica, intramucósica (por exemplo, nasal, retal e/ou vaginalmente),<br />
intraperitonealmente, intravenosamente, oralmente ou intramuscularmente.<br />
Preferivelmente, a liberação é às células terminalmente diferenciadas;<br />
entretanto, as partículas também podem ser liberadas às células não<br />
diferenciadas, ou parcialmente diferenciadas tais como as células tronco do<br />
10 sangue e fibroblastos da pele. Mais preferivelmente, a liberação é às células<br />
epidérmicas da pele.<br />
As partículas são administradas a um indivíduo em uma<br />
maneira compatível com a formulação de dosagem e em uma quantidade que<br />
será profilática e/ou terapeuticamente eficaz. Uma "quantidade<br />
15 terapeuticamente eficaz" das presentes composições particuladas será<br />
suficiente para realizar tratamento ou prevenção de sintomas de doença ou<br />
condição, e cairá, em uma faixa relativamente ampla que pode ser determinada<br />
pelos testes de rotina. No geral as partículas são liberadas em uma quantidade<br />
de 0,001 a 1000 iig, mais preferivelmente de 0,01 a 10,0 pg de ácido nucleico<br />
20 por dose. Entretanto, a quantidade exata necessária variará dependendo da<br />
idade e condição geral do indivíduo que é tratado e da seqüência de<br />
nucleotídeo particular selecionada, bem como de outros fatores. Uma<br />
quantidade eficaz apropriada pode ser facilmente determinada através de<br />
testes clínicos. O "Physicians Desk Reference" e "Goodman e Gilman's The<br />
25 Pharmacological Basis of Therapeutics" são úteis para os propósitos de<br />
determinar a quantidade necessária.<br />
Ensaios<br />
Ensaio de Expressão Comparativa<br />
Um teste adequado para utilidade do elemento determina o
100<br />
efeito que o elemento tem sobre a expressão de um polipeptídeo. Em um<br />
exemplo preferido o polipeptídeo pode ser um antígeno da influenza, variante<br />
deste ou fragmento de cada um. A base de comparação para testar a utilidade<br />
dos elementos é um 'vetor base', no geral (a menos que de outro modo<br />
5 mencionado) um plasmídeo com um promotor de hCMV, exon 1 de hCMV, 9<br />
bases de exon 2 de hCMV, a UTR 5' de HBV preS2 e a região de<br />
poliadenilação de beta-globina de coelho, posicionado para direcionar a<br />
expressão de uma seqüência codificadora. Tipicamente, o vetor base é<br />
pPJV7384, pRIV7401, pPJV7450 ou pPJV7533. Em alguns exemplos,<br />
10 qualquer um dos vetores aqui mencionados com os elementos acima<br />
mencionados pode ser utilizado como um vetor base. Em um exemplo,<br />
pPJV1671 pode ser utilizado como um vetor base. pPJV2012, pPJV7788 e<br />
pPML7789 também podem ser utilizados como vetores base.<br />
O vetor básico, introns heterólogos e UTRs 3' são adicionados,<br />
15 ou seqüências promotoras, exons, UTRs 5' e sítios poliA são trocados nos<br />
vetores base para criar vetores de expressão de teste. Qualquer um dos<br />
elementos dos vetores aqui debatidos podem ser trocados com uma seqüência<br />
de teste e comparados com uma seqüência de base. Assim, variantes<br />
funcionais ou fragmentos podem ser testados.<br />
20 Os vetores base e vetores de teste são transformados em<br />
células hospedeiras adequadas e as células analisadas quanto aos níveis de<br />
expressão de polipeptídeo. Preferivelmente, as células hospedeiras de<br />
mamífero são usadas. As células adequados incluem as células HEK 293T,<br />
CHO, HeLa, BHK, 3T3 ou COS de mamífero. Em alguns exemplos, células<br />
25 SSC15 ou B16 podem ser utilizadas.<br />
Tipicamente, um elemento funcional causa a expressão que é<br />
comparável ao vetor base, por exemplo pelo menos a mesma como ou maior.<br />
Preferivelmente a expressão é testada em mais do que um tipo de célula e com<br />
mais do que uma seqüência codificadora. Em alguns exemplos, um elemento
101<br />
funcional pode causar a expressão que é levemente menor do que o vetor base<br />
tal como, por exemplo, pelo menos 25%, em particular pelo menos 50%,<br />
preferivelmente pelo menos 60%, mais preferivelmente pelo menos 70%,<br />
ainda mais preferivelmente pelo menos 80%, ainda mais preferivelmente pelo<br />
5 menos 90% e ainda mais preferivelmente pelo menos 90% da expressão do<br />
vetor base. Tipicamente, uma variante ou fragmento de um elemento<br />
particular pode ser ainda considerado representar uma variante funcional ou<br />
fragmento de um elemento particular se este mostra tais níveis de expressão.<br />
Entretanto, preferivelmente variante e fragmentos funcionais darão origem à<br />
10 expressão mais alta do que o vetor base como debatido acima. O aumento<br />
percentual, por exemplo, pode ser qualquer uma das porcentagens<br />
mencionadas acima.<br />
Os protocolos experimentais adequados são fornecidos, por<br />
exemplo, nos Exemplos de 1 a 18 abaixo.<br />
15 Ensaio de Imunogenicidade Comparativa<br />
Onde o polipeptídeo a ser expressado é um antígeno, um outro<br />
teste pode ser realizado para identificar elementos de construção funcional ou<br />
particularmente preferidos. Em particular, um tal teste pode ser realizado onde<br />
o antígeno é, por exemplo, um antígeno da influenza, fragmento deste ou<br />
20 variante de cada um. No ensaio, o efeito de um elemento na resposta imune é<br />
determinado depois da liberação de um vetor de expressão a um organismo de<br />
teste. Os níveis de anticorpo contra o antígeno são o modo mais fácil para<br />
julgar a resposta imune. Grupos de camundongos são vacinados com os<br />
vetores base ou vetores de teste construídos como acima. Os soros são<br />
25 coletados depois de uma quantidade apropriada de tempo e analisados quanto<br />
aos níveis de anticorpo.<br />
Este experimento é realizado duas vezes, e os níveis de<br />
anticorpo de todos os grupos em ambos os experimentos são plotados. Os<br />
elementos funcionais tipicamente darão origem a títulos de anticorpo pelo
102<br />
menos tão altos quanto ou mais altos em ambos os experimentos para um<br />
antígeno particular do que o vetor base. Preferivelmente, o resultado será<br />
observado com mais do que um antígeno para demonstrar a extensão de<br />
utilidade do(s) elemento(s) naquele painel de expressão. Em alguns exemplos,<br />
5 um elemento funcional pode dar origem a um título de anticorpo que é<br />
levemente menor do que aquele observado com o vetor base tal como, por<br />
exemplo, pelo menos 25%, em particular pelo menos 50%, preferivelmente<br />
pelo menos 60%, mais preferivelmente pelo menos 70%, ainda mais<br />
preferivelmente pelo menos 80%, ainda mais preferivelmente pelo menos<br />
10 90% e ainda mais preferivelmente pelo menos 90% do título de anticorpo<br />
observado com o vetor base. Tipicamente, uma variante ou fragmento de um<br />
elemento particular pode ser ainda considerado representar uma variante ou<br />
fragmento funcionais de um elemento particular se estes dão origem a um tal<br />
título de anticorpo. Entretanto, preferivelmente variantes e fragmentos<br />
15 funcionais darão origem a títulos mais altos do que o vetor base como<br />
debatido acima. O aumento percentual, por exemplo, pode ser qualquer uma<br />
das porcentagens mencionadas acima.<br />
Os vetores adjuvantes também podem ser ensaiados pela<br />
comparação de um vetor adjuvante de teste com um padrão adjuvante com<br />
20 ambos sendo administrados com o mesmo antígeno. Uma comparação do<br />
efeito adjuvante de ambos os vetores é feita usando o antígeno administrado<br />
sozinho como um controle. Qualquer um dos vetores adjuvantes aqui<br />
mencionados pode ser utilizado como um padrão. O aumento ou diminuição<br />
percentuais no efeito adjuvante pode ser qualquer um daqueles níveis aqui<br />
25 mencionados.<br />
Os protocolos experimentais adequados são fornecidos por<br />
exemplo, no Exemplo 14 abaixo. Os protocolos adequados também são<br />
descritos nos Exemplos 15 a 18 abaixo.
C. Experimental<br />
103<br />
Abaixo estão os exemplos de formas de realização específicas<br />
para realizar a presente invenção. Os exemplos são oferecidos apenas com<br />
propósitos ilustrativos, e não são intencionados a limitar o escopo da presente<br />
5 invenção de nenhum modo.<br />
Esforços foram feitos para garantir a precisão com respeito aos<br />
números usados (por exemplo, quantidades, temperaturas, etc.), mas alguns<br />
erros e desvios experimentais, naturalmente, devem ser permitidos.<br />
Métodos<br />
10 Condições de PCR Padrão<br />
As condições de PCR padrão usadas para a construção de<br />
vetores foram como segue: 1 x tampão de núcleo de PCR com 1,5 mM de<br />
MgC12 (Promega Corporation, Madison, WI), 0.400 gM cada de cada<br />
iniciador, 200 gM de cada dNTP (USB, Inc, Cleveland, OH), 2,5 g de Taq<br />
15 polimerase (Promega Corporation, Madison, WI), 1,0 ng de DNA padrão,<br />
água até 100 gl, e uma cobertura de óleo mineral (Aldrich Chemical, Inc,<br />
Milwaukee, WI). O termociclador PTC-200 (MJ Research, Inc, Waltham,<br />
MA) foi programado para funcionar na seguinte rotina: 4' @ 95° C, 30 ciclos<br />
de (1' @ 95° C/ 1'15" @ 55° C/ 1' @ 72° C), 10' @ 72° C, contensão a 4° C).<br />
20 Os produtos de amplificação foram removidos da reação de PCR usando-se o<br />
Kit de Purificação de PCR QlAquick (Qiagen Inc, Valencia, CA) antes de<br />
cortar com enzimas de restrição (New England Biolabs, Beverly, MA).<br />
Todos os produtos de PCR foram seqüenciados depois da<br />
clonagem para garantir a fidelidade da amplificação.<br />
25 Exemplo 1. Construção de painéis vetoriais do antígeno de superfície do vírus<br />
da hepatite B (HBsAg)<br />
para a expressão de HBsAg.<br />
Vários vetores de expressão de plasmídeo foram construídos
Materiais de partida<br />
104<br />
(i) pWRG7128 (Roy, M, et al. Vaccine (2001) 19: 764-778),<br />
que contém a seqüência do promotor inicial imediato do hCMV, o primeiro<br />
exon, primeiro intron, e um segundo exon parcial do gene inicial imediato<br />
5 maior de hCMV, a seqüência codificadora HBsAg com regiões flanqueadoras<br />
(seqüência derivada HBV preS2 UTR 5' e elemento de resposta 3' pós<br />
transcricional) e a região de poliadenilação do hormônio do crescimento<br />
bovino (BGHpA)<br />
(ii) pPJV7284, um derivado de pWRG7128 que troca a região<br />
10 de poliadenilação de globina de coelho (RBGpA) por BGHpA.<br />
RBGpA)<br />
(a) pPJV7384 (CMV (nenhum intron), HBV preS2 UTR 5' e<br />
pWRG7128 foi amplificado pela PCR com JF93 (SEQ ID NO:<br />
15) e F110 (SEQ ID NO: 16) usando condições padrão e cortados com SalI e<br />
15 BamHI para isolar um fragmento de inserto contendo o promotor de CMV,<br />
exon 1 e parte da seqüência do exon 2. pAM6 (ATCC, Marmassas, VA) foi<br />
cortado com BamHl e BstXl para isolar um fragmento de inserto que<br />
contivesse a UTR 5' de HBsAg, e aproximadamente 70% da região<br />
codificadora de HBsAg. pJV7284 foi cortado com Sall e BstXl para gerar<br />
20 um fragmento de vetor no qual os dois fragmentos de inserto foram ligados,<br />
resultando em pJV7293.<br />
pWRG7128 foi amplificado pela PCR com iniciadores GW1<br />
(SEQ ID NO: 17) e JF254 (SEQ ID NO: 18) e cortados com BstXl e Bg12<br />
para isolar um fragmento de inserto que contivesse a extremidade 3' da região<br />
25 codificadora de HBsAg. pPJV7293 foi cortado com BstXl e Bg12 para gerar<br />
um fragmento de vetor no qual o fragmento de inserto foi ligado, resultando<br />
no vetor pPJV7384.<br />
preS2 UTR 5' e RBGpA)<br />
(b) pPJV7382 (CMV (nenhum intron), HBsAg UTR 3', HBV
105<br />
pPJV7293 foi cortado com Xho 1 e Xbal para gerar um<br />
fragmento de inserto contendo o promotor/exons de CMV e a UTR 5' com a<br />
extremidade 5' da seqüência codificadora de HBsAg. pWRG7128 foi cortado<br />
com Xbal e Bcl 1 para gerar um fragmento de inserto contendo a maioria da<br />
5 seqüência codificadora de HBsAg e a UTR 3'. pPJV7284 foi cortado com<br />
Xho 1 e Bg12 para gerar um fragmento de vetor no qual os dois fragmentos de<br />
inserto foram ligados, resultando em pPJV7382.<br />
5' e RBGpA)<br />
(c) pPJV7389 (CMV (RIA), HBsAg UTR 3', HBV preS2 UTR<br />
10 O intron A da insulina de rato (RIA) foi amplificado pela PCR<br />
sem plasmídeo p5'rIns com iniciadores GW150 (SEQ ID NO: 19) e JF255<br />
(SEQ ID NO: 20). O produto de PCR foi cortado com BamHl e inserido no<br />
pPJV7382 linearizado com BamHl, resultando em pPJV7389.<br />
(d) pPJV7387 (CMV( RIA), HBV preS2 UTR 5' e RBGpA)<br />
15 pPJV7384 foi cortado com BstXl e EcoR1 para gerar um<br />
fragmento de inserto contendo a extremidade 3' da região codificadora de<br />
HBsAg e RBGpA. pPJV7389 foi cortado com BstXl e EcoR1 para gerar um<br />
fragmento de vetor no qual o fragmento de inserto foi ligado, resultando no<br />
pPJV7387.<br />
20 Exemplo 2. Construção de painéis vetoriais de antígeno da glicoproteína D do<br />
vírus simples do herpes (HSVgD)<br />
para a expressão de HSVgD.<br />
Materiais de partida<br />
Vários vetores de expressão de plasmídeo foram construídos<br />
25 (a) pPJV7334, um derivado de pWRG7284 (pPJV 7284) que<br />
substitui a seqüência codificadora de HBsAg com um Nhel na matriz<br />
diretamente a jusante do códon de partida ATG, seguido por um fragmento<br />
vedador com um BamHl imediatamente 5' do HBV Enh (Realçador).<br />
(b) pWRG7202, um derivado de pGem3Z (Promega) com um
106<br />
fragmento vedador que possibilite a fusão de uma seqüência codificadora ao<br />
peptídeo de sinal do ativador de plasminogênio de tecido humano (TPA) a<br />
jusante de um sítio Nhel.<br />
5 UTR 5' e RBGpA)<br />
(a) pPJV7392(CMV (intron nativo), HBsAg UTR 3', HBsAg<br />
A região codificadora para HSV2 gD foi amplificada pela PCR<br />
sem um estoque de DNA virai (Advanced Biotech, Inc, Columbia, MD)<br />
usando iniciadores DS1 (SEQ ID NO: 21) e DA1 (SEQ ID NO: 22) e foi<br />
cortado com Nhel e EcoR1 para gerar um fragmento de inserto. pWRG7202<br />
10 foi cortado com Nhel e EcoR1 para gerar um fragmento de vetor no qual o<br />
fragmento de inserto foi ligado, resultando em pPJV7391.<br />
pPJV7391 foi cortado com Nhel e Bg12 para gerar um<br />
fragmento de inserto contendo a seqüência codificadora de HSV2 gD.<br />
pPJV7334 foi cortado com Nhel e BamHl para gerar um fragmento de vetor<br />
15 no qual o fragmento de inserto foi ligado, resultando no pPJV7392. Este vetor<br />
consiste dos seguintes elementos de expressão: a seqüência do promotor<br />
inicial imediato do hCMV, o primeiro exon, primeiro intron, e um segundo<br />
exon parcial do gene inicial imediato maior de hCMV, a UTR 5' de HBsAg, a<br />
seqüência codificadora para o gene HSV2 gD, a UTR 3' de HBsAg, e<br />
20 RBGpA.<br />
UTR 5' e RBGpA)<br />
(b) pPJV7399 (CMV (nenhum intron), HBsAg UTR 3' HBsAg<br />
Uma versão isenta de intron de pPJV7392 foi construída como<br />
segue. pPJV7384 foi cortado com HindIII e Ndel para isolar um fragmento<br />
25 de inserto contendo as extremidades 5' do gene de resistência à canamicina e<br />
o promotor de CMV. pPJV7384 foi cortado com Ndel e Sspl para isolar um<br />
fragmento de inserto contendo a extremidade 3' do promotor de CMV, o<br />
exon1/2 de CMV e a extremidade 5' da UTR 5' de HBsAg. Estes fragmentos<br />
de inserto foram inseridos no pPJV7392 a partir do qual que o fragmento
107<br />
Hind3-Sspl foi removido, resultando no pPJV7399.<br />
RBGpA)<br />
(c) pPJV7400 (CMV(RIA), HBsAg UTR 3', HBsAg UTR 5' e<br />
Uma versão RIA de pPJV7392 foi construída como segue.<br />
5 pPJV7384 foi cortado com HindIII e Nde 1 para isolar um fragmento de<br />
inserto contendo as extremidades 5' do gene de resistência à canamicina e<br />
promotor de CMV. pPJV7387 foi cortado com Nde 1 e Ssp 1 para isolar um<br />
fragmento de inserto contendo a extremidade 3' do promotor de CMV, o<br />
exon1/2(parcial) de CMV, RIA, e a extremidade 5' da UTR 5' de HBsAg.<br />
10 Estes fragmentos de inserto foram inseridos no pPJV7392 a partir do qual o<br />
fragmento Hind3-Sspl foi removido, resultando no pPJV7400.<br />
RBGpA)<br />
(d) pPJV7401 (CMV (nenhum intron), HBsAg UTR 5' e<br />
Uma versão isenta de UTR 3' de pPJV7399 foi construída<br />
15 como segue. pPJV7391 foi cortado com Bsp120I e Bg12 para isolar um<br />
fragmento de inserto contendo a extremidade 3' do gene HSV2 gD.<br />
pPJV7284 foi cortado com Bg12 e EcoR1 para isolar o sinal RBGpA. Estes<br />
fragmentos de inserto foram inseridos no pPJV7399 a partir do qual o<br />
fragmento Bsp120I-EcoR1 foi removido, resultando no pPJV7401.<br />
20 (e) pPJV7402 (CMV(RIA), HBsAg UTR 5' e RBGpA)<br />
Uma versão isenta de UTR 3' de pPJV7400 foi construída<br />
como segue. pPJV7391 foi cortado com Bsp120I e Bg12 para isolar um<br />
fragmento de inserto contendo a extremidade 3' do gene HSV2 gD.<br />
pPJV7284 foi cortado com Bg12 e EcoR1 para isolar o sinal RBGpA. Estes<br />
25 fragmentos de inserto foram ligados no pPJV7400 a partir do qual o<br />
fragmento Bsp120I-EcoR1 foi removido, resultando no pPJV7402.<br />
Exemplo 3. Construção de painéis vetoriais de antígeno Flu M2<br />
(a) pPJV7450 (CMV (nenhum intron), HBsAg UTR 5' e RBGpA)<br />
Uma região codificadora para Flu M2 foi amplificada pela
108<br />
PCR sem plasmídeo pFL-M2 (Joel Haynes, pPJV) usando os iniciadores<br />
JF301 (SEQ ID NO: 23) e JF302 (SEQ ID NO: 24) e foi cortado com Nhel e<br />
Bg12 para gerar um fragmento de inserto. pPJV7401 foi cortado com Nhel e<br />
Bg12 para gerar um fragmento de vetor no qual o fragmento de inserto foi<br />
5 ligado, resultando no pPJV7450.<br />
(b) pPJV7452 (CMV (nenhum intron), HBsAg UTR 3', HBsAg UTR 5' e<br />
RBGpA)<br />
Um fragmento UTR 3' foi amplificado pela PCR sem<br />
pPJV7389 com os iniciadores JF84 (SEQ ID NO: 25) e JF225 (SEQ ID NO:<br />
10 26) foi cortado com Bsp120I, enchido com T4 DNA polimerase, e ligado com<br />
ligadores Bg12 (cat# 1036, New England Biolabs). O fragmento foi depois<br />
cortado com Bg12 e EcoR1 para isolar um fragmento de inserto contendo a<br />
UTR 3' de HBsAg e a região RBGpA. pPJV7450 foi cortado com Bg12 e<br />
EcoR1 para gerar um fragmento de vetor no qual o fragmento de inserto foi<br />
15 ligado, resultando no pPJV7452<br />
(c) pPJV7458 (CMV(RIA) HBsAg UTR 5' e RBGpA)<br />
Uma versão de pPJV7450 contendo o RIA foi construído<br />
como segue: pPJV7389 foi cortado com BamHl para isolar um fragmento de<br />
inserto contendo RIA. pPJV7450 foi cortado com BamHl para gerar um<br />
20 fragmento de vetor no qual o fragmento de inserto foi ligado, resultando no<br />
pPJV7458.<br />
(d) pPJV7468 (CMV(RIA), HBsAg UTR 3',HBsAg UTR 5' e RBGpA)<br />
Uma versão de pPJV7458 contendo a UTR 3' de HBsAg foi<br />
construída como segue: pPJV7452 foi cortado com Bg12 e EcoR1 para<br />
25 produzir um fragmento de inserto contendo a UTR 3' de HBsAg e RBGpA.<br />
pPJV7458 foi cortado com Bg12 e EcoR1 para gerar um fragmento de vetor<br />
no qual o fragmento de inserto foi ligado, resultando no pPJV7468.<br />
Exemplo 4. Construção de painéis vetoriais de Beta-gal<br />
(a) pPJV7488 (CMV (nenhum intron), HBsAg UTR 3', HBsAg UTR 5' e
RBGpA)<br />
109<br />
CMV-beta (Clontech) foi amplificado pela PCR com<br />
iniciadores JF335 (SEQ ID NO: 27) e JF336 (SEQ ID NO: 28) e cortado com<br />
Nhel e Bg12 para isolar um fragmento de inserto que codifique a beta-<br />
5 galactosidase. pPJV7452 foi cortado com Nhe 1 e Bg12 para gerar um<br />
fragmento de vetor no qual o fragmento de inserto foi ligado, resultando no<br />
pPJV7488.<br />
(b) pPJV7533 (CMV (nenhum intron), HBsAg UTR 5' e RBGpA)<br />
pPJV7450 foi cortado com Bg12 e EcoR1 para isolar um<br />
10 fragmento de inserto contendo o RBGpA. pPJV7488 foi cortado com Bg12 e<br />
EcoR1 para gerar um fragmento de vetor no qual o fragmento de inserto foi<br />
ligado, resultando no pPJV7533.<br />
(c) pPJV7551(CMV(RIA/NheI), HBsAg UTR 3', HBsAg UTR 5' e RBGpA)<br />
pPJV7530 (ver o Exemplo 5) foi cortado com Xhol e BamHl<br />
15 para isolar um fragmento de inserto contendo o promotor de CMV até o RIA.<br />
pPJV7488 foi cortado com Xhol e BamHl para gerar um fragmento de vetor<br />
no qual o fragmento de inserto foi ligado, resultando no pPJV7551.<br />
(d) pPJV7552(CMV(RIA/NheI), HBsAg UTR 5' e RBGpA)<br />
pPJV7530 foi cortado com Xhol e BamHl para isolar um<br />
20 fragmento de inserto contendo o promotor de CMV até o RIA. pPJV7533 foi<br />
cortado com Xhol e BamHl para gerar um fragmento de vetor no qual o<br />
fragmento de inserto foi ligado, resultando no pPJV7552.<br />
Exemplo 5. Construção da Expressão de pPJV (pPJV7563)<br />
(a) pPJV7496<br />
25 pPJV7389 foi amplificado pela PCR com os iniciadores JF357<br />
(SEQ ID NO: 29) e JF365 (SEQ ID NO: 30), tratado com T4 DNA<br />
polimerase para tornar as extremidades abruptas, e cortado com Sal 1 para<br />
isolar um fragmento de inserto que codifique a resistência à canamicina.<br />
pPJV7389 foi cortado com Aval, tratado com T4 DNA polimerase para
110<br />
tornar as extremidades abruptas, e cortado com Sal l para isolar um fragmento<br />
de vetor no qual o fragmento de inserto foi ligado, resultando no pPJV7496.<br />
(b) pPJV7530<br />
pPJV7389 foi amplificado pela PCR com iniciadores JF393<br />
5 (SEQ ID NO: 31) e JF406 (SEQ ID NO: 32) e cortado com Bg12 e BamHl<br />
para isolar um fragmento de inserto contendo o RIA destituído de um sítio<br />
Nhel interno. pPJV7496 foi cortado com BamHl para preparar um fragmento<br />
de vetor no qual o fragmento de inserto foi ligado, resultando no pPJV7530.<br />
(c) pPJV7549<br />
10 pPJV7468 foi cortado com BamHl e EcoR5 para isolar um<br />
fragmento de inserto contendo M2 e parte do HBV 3' ENH. pPJV7530 foi<br />
cortado com BamHl e EcoR5 para preparar um fragmento de vetor no qual o<br />
fragmento de inserto foi ligado, resultando no pPJV7549.<br />
(d) pPJV7563<br />
15 Os iniciadores JF256 (SEQ ID NO: 33) e JF257 (SEQ ID NO:<br />
34) foram recozidos para preparar um fragmento de inserto consistindo de um<br />
sítio de clonagem múltiplo. pPJV7549 foi cortado por Nhel e Bg12 para<br />
preparar um fragmento de vetor no qual o fragmento de inserto foi ligado,<br />
resultando no pPJV7563. Um mapa plasmídico de pPJV7563 é fornecido na<br />
20 Figura 12. A composição base para o plasmídeo pPJV7563 é fornecida na<br />
Figura 13. Os componentes e a sua posição no plasmídeo pPJV7563 são como<br />
segue:<br />
1-44 Seqüências de Transposon 903<br />
45-860 Seqüência codificadora da resistência à canamicina do<br />
25 Transposon 903<br />
861-896 Seqüências do Transposon 903<br />
897-902 sítio Sall<br />
903-1587 Promotor CMV<br />
1588-1718 seqüência líder não traduzida do gene imediato inicial de CMV
111<br />
1719-1724 Fusão das enzimas de restrição BamH1 e BglII<br />
1725-1857 Intron A da insulina de rato<br />
1858-1863 sítio BamH1<br />
1864-1984 antígeno de superfície do líder não traduzido 5'<br />
5 1985-1993 Códon de partida sintético/ sítio de clonagem Nhel<br />
1994-2011 Sítios de clonagem sintéticos<br />
2012-2544 Realçador do HBV<br />
2545-2555 Seqüência de vetor velha. Nenhum acerto contra as bases de<br />
dados da NCBI<br />
10 2556-2686 Região de poliadenilação da beta-globina de coelho<br />
2687-3759 Seqüência de vetor pUC19<br />
Exemplo 6. Construção de Painéis de Expressão de Peptídeo de Sinal usando<br />
a Fosfatase Alcalina Secretada Humana (SEAP) e Fragmento Fc de IgG<br />
Humano (hFc) como Antígenos Modelo<br />
15 (i) pPJV7507 (hTPAsp e SEAP)<br />
pSEAP-Basic (Clontech) foi amplificado pela PCR com<br />
iniciadores JF320 (SEQ ID NO: 35) e JF321 (SEQ ID NO: 36) depois cortado<br />
com Nhel e Bg12 para isolar um fragmento de inserto consistindo do<br />
fragmento SEAP humano. pPJV7079 (Macklin, et al.) foi cortado com Nhel e<br />
20 Bg12 para preparar um fragmento de vetor no qual o fragmento de inserto foi<br />
ligado, resultando no pPJV7507.<br />
(ii) pPJV7508 (hTPAsp e hFc)<br />
O DNA humano foi amplificado pela PCR com iniciadores<br />
JF386 (SEQ ID NO: 37) e FcAS (SEQ ID NO: 38) depois cortado com Nhel<br />
25 e Bg12 para isolar um fragmento de inserto consistindo do fragmento Fc de<br />
IgG humana. pPJV7079 foi cortado com Nhel e Bg12 para preparar um<br />
fragmento de vetor no qual o fragmento de inserto foi ligado, resultando no<br />
pPJV7508.<br />
(iii) Preparação da Seqüência Codificadora do Peptídeo de Sinal de
Aprotinina<br />
112<br />
O oligo JF354 sintético (SEQ ID NO: 39) foi amplificado pela<br />
PCR com iniciadores JF355 (SEQ ID NO: 40) e JF356 (SEQ ID NO: 41) para<br />
gerar a seqüência codificadora para o peptídeo de sinal de aprotinina.<br />
5 (iv) Preparação de Seqüência Codificadora do Peptídeo de Sinal da Extensina<br />
do Tabaco<br />
O oligo JF348 sintético (SEQ ID NO: 42) foi amplificado pela<br />
PCR com iniciadores JF349 (SEQ ID NO: 43) e JF350 (SEQ ID NO: 44) para<br />
gerar a seqüência codificadora para o peptídeo de sinal da extensina de<br />
10 tabaco.<br />
(v) Preparação da Seqüência Codificadora do Peptídeo de Sinal da Lisozima<br />
de Galinha<br />
O oligo JF351 sintético (SEQ ID NO: 45) foi amplificado pela<br />
PCR com iniciadores JF352 (SEQ ID NO: 46) e JF353 (SEQ ID NO: 47) para<br />
15 gerar a seqüência codificadora para o peptídeo de sinal da lisozima de<br />
galinha.<br />
(a) Painéis de Peptídeo de Sinal do Antígeno Flu M2<br />
aprotinina s.p.)<br />
pPJV7499 (CMV (nenhum intron), HbsAg UTR 5', RBGpA.<br />
20 pPJV7497 (CMV (nenhum intron), HbsAg UTR 5', RBGpA,<br />
extensina do tabaco s.p.)<br />
lisozima de galinha s.p.)<br />
PPJV7500 (CMV (nenhum intron), HbsAg UTR 5', RBGpA,<br />
As seqüências codificadoras para os peptídeos de sinal foram<br />
25 cortadas com Spel e Nhel para isolar fragmentos de inserto. pPJV7450 foi<br />
cortado com Nhe 1 para preparar um fragmento de vetor no qual os<br />
fragmentos de inserto foram ligados, resultando no pPJV7499 (aprotinina),<br />
pPJV7497 (extensina do tabaco), e pPJV7500 (lisozima de galinha).<br />
(b) Painéis de peptídeo de sinal de SEAP
5<br />
10<br />
aprotinina s.p.)<br />
extensina do tabaco sp.)<br />
lisozima de galinha s.p.)<br />
113<br />
pPJV7513 (CMV (nenhum intron), HbsAg UTR 5', RBGpA,<br />
pPJV7512 (CMV (nenhum intron), HbsAg UTR 5', RBGpA,<br />
pPJV7510 (CMV (nenhum intron), HbsAg UTR 5', RBGpA,<br />
pPJV7499, 7497, e 7500 foram cortados com Xhol e Nhel<br />
para isolar um fragmento de inserto consistindo do promotor de CMV até a<br />
seqüência de peptídeo de sinal codificadora dos plasmídeos. pPJV7507 foi<br />
cortado com Xhol e Nhel para preparar um fragmento de vetor no qual os<br />
fragmentos de inserto foram ligados, resultando no pPJV7513 (aprotinina),<br />
pPJV7512 (extensina do tabaco), e pPJV7510 (lisozima de galinha).<br />
(c) Painéis de peptídeo de sinal de hFc<br />
15 aprotinina s.p.)<br />
extensina do tabaco s.p.)<br />
pPJV7524 (CMV (nenhum intron), HbsAg UTR 5', RBGpA,<br />
pPJV7525 (CMV (nenhum intron), HbsAg UTR 5', RBGpA,<br />
pPJV7526 (CMV (nenhum intron), HbsAg UTR 5', RBGpA,<br />
peptídeo de sinal da lisozima de galinha)<br />
20 pPJV7499, 7497, e 7500 foram cortados com Xho 1 e Nhel<br />
para isolar um fragmento de inserto consistindo do promotor de CMV até a<br />
seqüência de peptídeo de sinal codificadora dos plasmídeos. pPJV7508 foi<br />
cortado com Xhol e Nhel para preparar um fragmento de vetor no qual os<br />
fragmentos de inserto foram ligados, resultando no pPJV7524 (aprotinina),<br />
25 pPJV7525 (extensina do tabaco), e pPJV7526 (lisozima de galinha).<br />
Exemplo 7. Construção de painéis de Fosfatase Alcalina Secretada Humana<br />
(SEAP)<br />
(a) pPJV7531 (CMV (nenhum intron), HbsAg UTR 5', RBGpA, lisozima de<br />
galinha s.p.)
114<br />
pPJV7510 foi cortado com Sal 1 e Bg12 para isolar um<br />
fragmento de inserto contendo o promotor de CMV até o peptídeo de sinal da<br />
lisozima. pPJV7450 foi cortado com Sall e Bg12 para gerar um fragmento de<br />
vetor no qual o fragmento de inserto foi ligado, resultando no pPJV7531.<br />
5 (b) pPJV7554 (CMV(RIA/NheI), HbsAg UTR 5', RBGpA, lisozima de<br />
galinha s.p.)<br />
pPJV7530 foi cortado com Xhol e BamH1 para isolar um<br />
fragmento de inserto contendo o promotor de CMV até RIA. pPJV7531 foi<br />
cortado com Xhol e BamH1 para gerar um fragmento de vetor no qual o<br />
10 fragmento de inserto foi ligado, resultando no pPJV7554.<br />
(c) pPJV7568 (CMV (nenhum intron), HBsAg UTR 3', HbsAg UTR 5',<br />
RBGpA, lisozima de galinha s.p.)<br />
pPJV7563 foi cortado com Bg12 e EcoR1 para isolar um<br />
fragmento de inserto contendo a UTR 3' de HBV e RBGpA. pPJV7531 foi<br />
15 cortado com Bg12 e EcoR1 para gerar um fragmento de vetor no qual o<br />
fragmento de inserto foi ligado, resultando no pPJV7568.<br />
(d) pPJV7572 (CMV(RIA/NheI), HBsAg UTR 3', HbsAg UTR 5', RBGpA,<br />
lisozima de galinha s.p.)<br />
pPJV7563 foi cortado com Bg12 e EcoR1 para isolar um<br />
20 fragmento de inserto contendo the UTR 3' de HBV e RBGpA. pPJV7554 foi<br />
cortado com Bg12 e EcoR1 para gerar um fragmento de vetor no qual o<br />
fragmento de inserto foi ligado, resultando no pPJV7572.<br />
Exemplo 8. Construção de Vetores Beta-gal e HBsAg Usando os Introns da<br />
Queratina de Galinha e da Actina Cardíaca de Galinha<br />
25 (a) pPJV7557 (Beta-gal, CMV(cA intron), HbsAg UTR 3', HbsAg UTR 5' e<br />
RBGpA)<br />
O DNA de galinha foi amplificado pela PCR com iniciadores<br />
JF430 (SEQ ID NO: 48) e JF442 (SEQ ID NO: 49) e cortado com Bg12 e<br />
BamH1 para isolar um fragmento de inserto consistindo do intron e das
115<br />
seqüências de exon flanqueadoras da actina cardíaca de galinha. pPJV7488<br />
foi cortado com BamHl para preparar um fragmento de vetor no qual o<br />
fragmento de inserto foi ligado, resultando no pPJV7557.<br />
(b) pPJV7558 (Beta-gal, CMV(cK intron), HbsAg UTR 3', HbsAg UTR 5' e<br />
5 RBGpA)<br />
O DNA de Galinha foi amplificado pela PCR com iniciadores<br />
JF421 (SEQ ID NO: 50) e JF444 (SEQ ID NO: 51) e cortado com Bg12 e<br />
BamHl para isolar um fragmento de inserto consistindo do intron e<br />
seqüências de exon flanqueadoras do gene da queratina de galinha. pPJV7488<br />
10 foi cortado com BamHl para preparar um fragmento de vetor no qual o<br />
fragmento de inserto foi ligado, resultando no pPJV7558.<br />
(c) pPJV7578 (HBsAg, CMV(cA intron), HbsAg UTR 3', HbsAg UTR 5' e<br />
RBGpA)<br />
pPJV7557 foi cortado com Sall e BamHl para isolar um<br />
15 fragmento de inserto consistindo do promotor de CMV até as regiões de<br />
intron. pPJV7496 foi cortado com Sall e BamHl para preparar um fragmento<br />
de vetor no qual o fragmento de inserto foi ligado, resultando no pPJV7558.<br />
(d) pPJV7579 (HBsAg, CMV(cK intron), HbsAg UTR 3', HbsAg UTR 5' e<br />
RBGpA)<br />
20 pPJV7558 foi cortado com Sall e BamHl para isolar um<br />
fragmento de inserto consistindo do promotor de CMV até as regiões de<br />
intron. pPJV7496 foi cortado com Sall e BamHl para preparar um fragmento<br />
de vetor no qual o fragmento de inserto foi ligado, resultando no pPJV7579.<br />
Exemplo 9. Análise In Vitro da Expressão de Antígeno pelos Painéis<br />
25 Vetoriais de HBsAg<br />
No dia um, as células SCC15 (ATCC) ou B16 (origem<br />
desconhecida, versões disponíveis na ATCC) foram plaqueadas em placas de<br />
cultura de tecido de 6 reservatórios de 20 a 40% de confluência, e deixadas<br />
cultivar durante a noite em uma incubadora. As células hospedeiras foram
116<br />
propagadas em meio recomendado pela ATCC.<br />
No dia dois, a reação de transfecção foi realizada. Para cada<br />
vetor a ser testado, 20 gl de reagente Lipofectin® (Life Technologies Inc,<br />
Grand Island, NY) foram adicionados a 180 gl de meio Optimem® (Life<br />
5 Technologies, Grand Island, NY), e deixados incubar na temperatura<br />
ambiente por 45 minutos. Para cada vetor a ser testado, 2 pg de vetor foram<br />
misturados em 200 gl de Optimem® em 40 minutos. Em 45 minutos, o vetor<br />
e as soluções de Lipofectin® foram misturadas entre si e deixadas repousar na<br />
temperatura ambiente por um adicional de 10 minutos. Durante esta<br />
10 incubação final, as células hospedeiras plaqueadas foram removidas da<br />
incubadora e lavadas duas vezes com meio Optimem®. Em 10 minutos, 1,6<br />
ml de Optimem® foi adicionado à mistura de Lipofectin® / vetor, e 1 ml da<br />
mistura resultante foi adicionado a cada um dos dois reservatórios de célula.<br />
As células hospedeiras foram retornadas para a incubadora e deixadas<br />
15 repousar imperturbáveis por 5 horas, ponto no qual a mistura de<br />
Lipofectin®/vetor foi removida e substituída por meio de manutenção de<br />
célula padrão.<br />
De 18 a 24 horas depois da troca do meio, os 50 a 100 gl de<br />
meio de manutenção de célula foram removidos das placas de cultura de<br />
20 tecido e analisados quanto a expressão de antígeno colocando-se as amostras<br />
em vasos de reação fornecidos no kit de Diagnóstico Monoclonal<br />
AUSZYNIE® (Abbott Laboratories, Abbott Park, IL). O volume das amostras<br />
de teste foi levado a um volume de 200 p1 com PBS, depois 50 vil de<br />
conjugado e uma pérola de reação foram adicionados a cada amostra. O vaso<br />
25 é incubado por 80 minutos a 40° C, depois do que os reservatórios foram<br />
lavados limpos de todos os componentes de reação líquidos. As pérolas foram<br />
transferidas para novos tubos depois que 300 gl de tampão de<br />
desenvolvimento de cor foram adicionados. Em 30 minutos, a reação de<br />
desenvolvimento de cor foi interrompida pela adição de ácido sulfúrico 1 M, e
117<br />
a absorbância da reação foi medida a 490 nm. Os dados mostrados na Figura<br />
1 são as leituras da absorbância média dos reservatórios em duplicata de dois<br />
experimentos.<br />
Como mostrado na Figura 1, a adição de RIA, do UTR 3' de<br />
5 HBV ou ambos elementos a um vetor base (promotor de CMV, exon e região<br />
de poliadenilação) aumentou a expressão do HBsAg em células SCC15.<br />
Como mostrado na Figura 2, a adição de cada um dos introns de queratina de<br />
galinha ou da actina cardíaca de galinha a um vetor base (promotor de CMV,<br />
exon, UTR 3' de HBV e região de poliadenilação) aumentou a expressão de<br />
10 HBsAg em células SCC15.<br />
Exemplo 10. Análise In Vitro da Expressão de Antígeno pelos Painéis<br />
Vetoriais de Beta-gal<br />
como descrito no Exemplo 9.<br />
As células hospedeiras SSC-15 ou B16 foram transfectadas<br />
15 De dezoito a quarenta horas depois da troca do meio, os<br />
sobrenadantes do meio foram removidos e as células foram lavadas com PBS.<br />
Depois da remoção da lavagem, as células foram lisadas incubando-se as<br />
células em 500 1.11 de tampão de lise (50 mM de NaPO 4, 0,1% de Triton X-<br />
100, pH 7) por 5 minutos, seguido pela raspagem física das células fora da<br />
20 placa plástica. Os lisados foram microcentrifugados por dois minutos para<br />
remover os fragmentos de célula, e 10 a 25 jal do lisado clarificado foram<br />
adicionados a 500 gl de tampão de reação (80 µg/ml de o-nitrofenil<br />
galactopiranosida, 50 mM de NaPO 4, pH 7) e incubadas a 37° C por 10 a 20<br />
minutos. A reação foi interrompida pela adição de 500 1.11 de Na 2CO3 1 M e<br />
25 lida a 405 nm. Os dados estão apresentados como a razão da expressão de<br />
vetor (contendo um intron, HBVenh, ou ambos) realçada a um vetor base.<br />
A adição de RIA, a UTR 3' de HBV ou ambos os elementos a<br />
um vetor base (promotor de CMV, exon e região de poliadenilação) aumentou<br />
a expressão de beta-gal em ambas as linhagens de célula. Os resultados para
118<br />
as células SCC15 são mostrados na Figura 3. A adição de cada um dos introns<br />
da queratina de galinha ou da actina cardíaca de galinha a um vetor base<br />
(promotor de CMV, exon, a UTR 3' de HBV e a região de poliadenilação)<br />
aumentou a expressão de beta-gal em ambas as linhagens de célula. Os<br />
5 resultados para as células B 16 são mostradas na Figura 2.<br />
Exemplo 11. Análise In Vitro da Expressão de Antígeno pelo Painel Vetorial<br />
de HSV gD<br />
As células hospedeiras SCC15 ou B16 foram transfectadas<br />
como descrito no Exemplo 9. Dezoito horas após a transfecção, as placas<br />
10 foram colocadas em gelo por 15 minutos. Cada reservatório foi depois lavado<br />
com 2 ml de PBS (Biowhittaker, Walkerville, MD). As células foram fixadas<br />
com 0,05% de glutaraldeído (Polisciences Inc, Warrington, PA) diluídas em<br />
PBS e incubadas por 30 minutos na temperatura ambiente. Todas as<br />
incubações subseqüente duraram 1 hora na temperatura ambiente e as<br />
15 lavagens entre cada incubação foram como estabelecido acima. As placas<br />
foram bloqueadas com 2 ml de leite em pó a 5% (Bio Rad Laboratories,<br />
Melville, NY) em PBS. As incubações com 1 ml de uma diluição 1:1000 de<br />
anti-gD monoclonal (ABI, Columbia, MD) em 2% de leite em pó / PBS /<br />
0,05% de Tween-20® (Sigma, St. Louis, MO) e 1 ml de uma diluição de<br />
20 1:2500 de HRP anti-camundongo de cabra (KPL, Gaithersburg, MD) em PBS<br />
/ 0,1% de Tween-20 ® seguido. A cor foi desenvolvida usando 1 ml de<br />
substrato de micro-reservatório TMB (BioFX, Owings Mills, MD). As<br />
reações foram interrompidas com H 2SO4 1 M, o líquido foi transferido para<br />
cubetas plásticas e a densidade ótica lifa a 450 nm. Os dados estão<br />
25 apresentados como a razão da expressão de vetor (contendo um intron,<br />
HBVenh, ou ambos) realçada a um vetor base.<br />
A adição de RIA com ou sem a UTR 3' de HBV a um vetor<br />
base (promotor de CMV, exon e região de poliadenilação) aumentou a<br />
expressão de HSV gD em ambas as linhagens de célula. Os resultados para as
119<br />
células SC15 são mostrados na Figura 4.<br />
Exemplo 12. Análise In Vitro da Expressão de Antígeno pelos Painéis<br />
Vetoriais de SEAP<br />
As células hospedeiras SCC 15 ou B 16 foram transfectadas<br />
5 como descrito no Exemplo 9. em dezoito a quarenta horas depois da troca de<br />
meio, os sobrenadantes do meio foram removidos e aquecidos a 70° C por 30<br />
minutos. 10 a 25 gl dos sobrenadantes inativados por calor foram incubados<br />
por 5 minutos com 1/10 ° do volume de 1-homoarginina 100 mM. 500 gl de<br />
tampão de reação de fosfatase alcalina (cat # 172-1063, Bio-Rad, preparado<br />
10 de acordo com as instruções) foram adicionados aos lisados e incubados a 37°<br />
C por 10 a 20 minutos. A reação foi interrompida pela adição de 500 gl de<br />
NaOH 1 M e lida a 405 nm. Os dados estão apresentados como a razão da<br />
expressão de vetor (contendo um intron, HBVenh, ou ambos) realçada a um<br />
vetor base, ou a razão da expressão dos peptídeos de sinal experimental para o<br />
15 vetor de peptídeo de sinal de TPA humano.<br />
Como mostrado na Figura 5, a adição de RIA, da UTR 3' de<br />
HBV ou de ambos os elementos a um vetor base (promotor de CMV, exon e<br />
região de poliadenilação) aumentou a expressão de SEAP em células B16.<br />
Inesperadamente, apenas a adição da UTR 3' de HBV a um vetor base<br />
20 (promotor de CMV, exon e região de poliadenilação) aumento a expressão de<br />
SEAP em células SCC15.<br />
A adição de peptídeos de sinal da aprotinina bovina, lisozima<br />
de galinha, ou extensina do tabaco ao terminal N de SEAP madura<br />
possibilitou a secreção eficiente de SEAP nos sobrenadantes de meio de<br />
25 célula de ambas as linhagens de célula. Os resultados para as células B 16 são<br />
mostradas na Figura 6.<br />
Exemplo 13. Análise In Vitro da Expressão de Antígeno pelo Painel de<br />
Peptídeo de Sinal de Fragmento Fc da IgG Humana<br />
As células hospedeiras SCC15 ou B16 foram transfectadas
120<br />
como descrito no Exemplo 9. Os sobrenadantes do meio foram removidos de<br />
dezoito to quarenta horas depois da troca de meio.<br />
As placas de ELISA (Costar) foram incubadas durante a noite<br />
a 4° C com 100 µ1 de IgG anti-humano de cabra (Sigma #I3382, diluição<br />
5 1/1000 em tampão de revestimento de carbonato) por reservatório. Todas as<br />
incubações subseqüentes duraram 1 hora na temperatura ambiente com<br />
lavagens (10 mM de Tris, 150 mM de NaC1, 0,1% de Brij-35, pH 8,0) entre<br />
cada incubação. Os reservatórios foram depois bloqueados com 100 gl de 5%<br />
de seco em PBS, seguido por incubação com sobrenadantes de meio diluído<br />
10 em série em tampão de diluição (2% de leite em pó, PBS, 0,05% de Tween-<br />
20®). Isto foi seguido pela incubação com 100 gl de IgG anti-humano de<br />
cabra/HRP (Sigma #A6029, diluição 1/5000 em tampão de diluição) por<br />
reservatório, seguido pelo desenvolvimento de cor usando 100 gl de substrato<br />
de micro-reservatório TMB. As reações foram interrompidas com 100 gl de<br />
15 2SO4 H1<br />
M, e lidas a 450 nm. Os dados estão apresentados como a razão da<br />
expressão dos peptídeos de sinal experimentais para o vetor de peptídeo de<br />
sinal de TPA humano.<br />
A adição de peptídeos de sinal de aprotinina bovina, lisozima<br />
de galinha, ou extensina do tabaco ao terminal N do fragmento Fc humano<br />
20 possibilitou a secreção eficiente de hFc em sobrenadantes de meio de célula<br />
de ambas as linhagens de célula. Os resultados para as células B 16 são<br />
mostrados na Figura 6.<br />
Exemplo 14. Uso dos vetores de expressão de plasmídeo HBsAg, HSVgD e<br />
Flu-M2 para a imunização de camundongos<br />
25 (a) Preparação de cartuchos de imunização<br />
Para cada plasmídeo a ser testado, 25 mg de pó de ouro de 2<br />
mícrons foram pesados em um tubo de microcentrífuga. Depois da adição de<br />
uma alíquota de 250 gl de espermidina 50 mM (Aldrich Chemical, Inc,<br />
Milwaukee, WI), o tubo foi turbilhonado e ligeiramente sonificado. O ouro foi
121<br />
separado por microcentrifugação, e a espermidina substituída por uma<br />
alíquota de 100 µl fresca. O ouro foi recolocado em suspensão por<br />
turbilhonamento, depois que 25 In de DNA foram adicionados ao tubo e<br />
misturado. Enquanto que o tubo foi levemente turbilhonado, 100 µl de CaCl 2<br />
5 a 10% (Fujisawa USA, Inc, Deerfield, IL) foi adicionado para precipitar o<br />
DNA sobre as pérolas de ouro. A reação de precipitação foi deixada processar<br />
por 10 minutos na bancada, depois que o ouro foi coletado por um breve giro<br />
de microcentrífuga e lavado três times com etanol absoluto (Spectrum Quality<br />
Products, Inc, Gardena, CA) para remover os reagentes de precipitação em<br />
10 excesso. O complexo de ouro/DNA lavado foi depois recolocado em<br />
suspensão em 3.6 ml de 0,05 mg/ml de polivinilpirrolidona (360KD,<br />
Spectrum Quality Products, Inc, Gardena, CA) em etanol absoluto. Esta pasta<br />
fluida foi depois injetada em um tubo Tefzelâ (McMaster-Carr, Chicago, IL)<br />
localizado em um torno de tubo (PowderJect Vaccines) que reveste o interior<br />
15 do tubo Tefzelâ com o complexo de ouro/DNA. Depois que o procedimento<br />
de girar o tubo foi completado, o tube foi cortado em "projéteis" de 0,5" (1,27<br />
cm) de vacina que foram carregados no dispositivo XR1 (PowderJect<br />
Vaccines) para a liberação aos camundongos.<br />
(b) Procedimento de Vacinação<br />
20 Camundongos de quatro a seis semanas de idade foram<br />
anestesiados com uma mistura de Ketasetâ (Fort Dodge) e Rompunâ (Bayer).<br />
Os ventres foram raspados com um par de tesouras elétricas para remover o<br />
pelo, e dois "projéteis" não sobrepostos de vacina foram liberados por<br />
intermédio do dispositivo XR1 (450 psi (3105 kPa)) à área raspada. Os<br />
25 animais foram retornados para asa suas gaiolas e sangrados em seis semanas<br />
após a vacinação. Os camundongos Balb/c foram usados para avaliar os<br />
vetores de expressão de HBsAg, e camundongos Swiss Webster foram usados<br />
para avaliar os vetores de expressão HSV-gD e Flu M2.
122<br />
Análise de Soros quanto a Anticorpos Anti-HBsAg<br />
Em seis semanas, as amostras de sangue foram colhidas de<br />
animais vacinados. Um volume de soro isolado destas amostras foi colocado<br />
em reservatórios de um vaso de reação fornecido com o kit AUSAB ® EIA<br />
5 Diagnostic (Abbott Laboratories, Abbott Park, IL). O volume de soros<br />
adicionados dependeu do título de anticorpo da amostra, e a amostra foi<br />
diluída com tampão de diluição de amostra para cair dentro dos valores<br />
obteníveis com um painel de quantificação. 200 pl de cada frasco do Painel<br />
de Quantificação AUSAB ® (Abbott Laboratories, Abbott Park, IL) foram<br />
10 adicionados aos reservatórios do vaso de reação. A cada reservatório uma<br />
pérola foi adicionada, depois que o vaso foi selado e incubado por duas horas<br />
a 40° C. Os reservatórios foram depois lavados de todos os componentes da<br />
reação líquida. A cada reservatório lavado foram adicionados 200 pl de<br />
mistura conjugada, depois que o vaso foi selado e incubado por duas horas a<br />
15 40° C. Os reservatórios foram depois lavados de todos os componentes de<br />
reação líquidos. As pérolas foram transferidas para novos tubos depois que<br />
300 gl de tampão de desenvolvimento de cor foram adicionados. Em 30<br />
minutos, a reação de desenvolvimento de cor foi interrompida pela adição de<br />
ácido sulfúrico 1 M, e a absorbância das reações foi medida a 490 nm em um<br />
20 espectrofotômetro Quantum II ® (Abbott Laboratories, Abbott Park, IL). Este<br />
espectrofotômetro calcula os níveis de anticorpo de uma amostra pela<br />
comparação da absorbância da amostra com uma curva padrão gerada com o<br />
painel de quantificação. Estes níveis de anticorpo foram depois corrigidos<br />
quanto aos fatores de diluição. Os dados mostrados na Figura 7 são os títulos<br />
25 da média geométrica de todos os animais vacinados com um vetor particular.<br />
Análise de Soros quanto aos Anticorpos de Antígeno Anti-Flu M2<br />
Placas de ELISA de ligação de meio Costar de 96<br />
reservatórios (Fisher Scientific, Pittsburgh, PA) foram revestidas com um<br />
peptídeo Flu M2 sintético (QCB/Biosource, Hopkinton, MA) a uma
123<br />
concentração de 1 gg/m1 em PBS (Biowhittaker, Walkerville, MD) e<br />
incubadas durante a noite a 4° C. As placas foram lavadas três vezes com 10<br />
mM de Tris (Sigma, St. Louis, MO)/150 mM de NaC1 (Fisher<br />
Scientific)/0,1% de Brij-35 (Sigma), depois bloqueado com 5% de leite em pó<br />
5 (Bio Rad Laboratories, Melville, NY) em PBS por 1 hora na temperatura<br />
ambiente. Todas as incubações subseqüentes foram na temperatura ambiente<br />
por uma hora e as lavagens entre cada incubação foram como estabelecido<br />
acima. A amostra de soro de camundongo, um controle padrão (título alto,<br />
soros de camundongo anti-M2) e um negativo (soro de camundongo anti-<br />
10 HBsAg) foram diluídos em 2% de leite em pó/PBS/0,05% de Tween-20 ®<br />
IgG anti-camundongo de cabra (H+L) (Southern Biotechnology Associate,<br />
Birmingham, AL) diluído 1:8000 em 2% de leite em pó/ PBS/0,05% de<br />
Tween-20 ® e conjugado de estreptavidina-peroxidase de rábano (Southern<br />
15 Biotechnology) diluído 1:8000 em PBS/0,1% de Tween-20 seguido. A cor foi<br />
desenvolvida usando substrato de TMB (BioFX, Owings Mills, MD). As<br />
reações foram interrompidas com H 2SO4 1 M e as placas lidas a 450 nm com<br />
uma leitora de placa Emax precision (Molecular Devices, Sunnyvale, CA). O<br />
software SoftMax Pro 4.1 (Molecular Devices) foi usado para calcular os<br />
20 títulos no ponto final usando uma análise de quatro parâmetros. Os títulos<br />
foram normalizados ao soro padrão, que teve um título pré determinado, para<br />
minimizar a variação de ensaio para ensaio e de placa para placa. Os<br />
resultados são mostrados na Figura 7.<br />
Análise de Soros quanto aos Anticorpos de Antígeno Anti-gD de HSV<br />
25 Placas de ELISA de ligação de meio Costar de 96<br />
reservatórios (Fisher Scientific, Pittsburgh, PA) foram revestidas com a<br />
proteína gD de HSV (Virai Therapeutics, Ithaca, NY) a uma concentração de<br />
1 gg/m1 em PBS (Biowhittaker, Walkerville, MD) e incubados durante a noite<br />
a 4° C. As placas foram lavadas três vezes com 10 mM de Tris (Sigma, St.<br />
(Sigma) e incubados nas placas de ELISA. Anticorpo conjugado a biotina de
124<br />
Louis, MO)/150 mIVI de NaC1 (Fisher Scientific)/0,1% de Brij-35 (Sigma),<br />
depois bloqueado com 5% de leite em pó (Bio Rad Laboratories, Melville,<br />
NY) em PBS por 1 hora na temperatura ambiente. Todas as incubações<br />
subseqüentes foram na temperatura ambiente por uma hora e as lavagens<br />
5 entre cada incubação foram como estabelecido acima. As amostras de soro de<br />
camundongo, um controle padrão (título alto, soro de camundongo anti-gD) e<br />
um negativo (soro de camundongo anti HiBsAg) foram diluídos em 2% de<br />
leite em pó/PBS/0,05% de Tween-20 (Sigma) e incubados nas placas de<br />
ELISA. o anticorpo conjugado a biotina IgG anti-camundongo de cabra<br />
10 (H+L) (Southern Biotechnology Associate, Birmingham, AL) diluído 1:8000<br />
em 2% de leite em pó/PBS/0,05% de Tween-20 e conjugado de<br />
estreptavidina-peroxidase de rábano (Southern Biotechnology) diluído 1:8000<br />
em PBS/0,1% de Tween-20 seguido. A cor foi desenvolvida usando substrato<br />
TMB (BioFX, Owings Mills, MD). As reações foram interrompidas com<br />
15 H2SO4 1 M e as placas lidas a 450 nm com uma leitora de placa Emax<br />
precision (Molecular Devices, Sunnyvale, CA). O software SoftMax Pro 4.1<br />
(Molecular Devices) foi usado para calcular os títulos de ponto final usando<br />
uma análise de quatro parâmetros. Os títulos foram normalizados ao soro<br />
padrão, que teve um título pré determinado, para minimizar a variação de<br />
20 ensaio para ensaio e de placa para placa. Os resultados são mostrados na<br />
Figura 7.<br />
Exemplo 15. Construção de Plasmídeo pPJV1671, Vetor da Vacina de DNA<br />
contra a Influenza<br />
O plasmídeo pPJV1671 foi construído de modo que codifique<br />
25 e possa expressar o antígeno da Hemaglutinina (HA) da influenza<br />
A/Panama/2007/99 (H3N2).<br />
principais:<br />
A construção de pPJV1671 é melhor descrita em três estágios<br />
(i) Clonar o gene de expressão;
125<br />
(ii) Engendrar a cadeia principal de vetor; e<br />
(iii) Engendrar o plasmídeo final.<br />
Clonagem do Gene de Expressão<br />
A seqüência codificadora para a influenza HA foi obtida por<br />
5 uma técnica de clonagem da transcriptase reversa-reação da cadeia da<br />
polimerase padrão (RT-PCR) usando uma amostra de vírus A/Panama/<br />
2007/99 obtida da Centers for Disease Control and Prevention (Atlanta, GA)<br />
como uma fonte de ácido ribonucleico padrão (RNA).<br />
10 expressão, HA:<br />
As seguintes etapas foram utilizadas na clonagem do gene de<br />
A produção pela RT-PCR de fragmento dsDNA de RNA<br />
segmento 4 de A/Panama/2007/99 (H3N2);<br />
Propagação de clone de DNA do segmento 4 de RNA em<br />
um vetor com base em pUC 19 padrão na E. coli;<br />
15 Análise de seqüência da seqüência codificadora de H3<br />
Panama HA dentro do clone do segmento 4 de RNA; e<br />
uma segunda reação de PCR para gerar um fragmento de<br />
DNA contendo a seqüência codificadora H3 Panama HA (sem o seu códon<br />
ATG) com extremidades compatíveis com o vetor "vazio" de vacina de DNA<br />
20 pPJV7563 (Me I e Bsp 1201).<br />
Engendramento da Cadeia Principal do Vetor, pPJV7563<br />
A cadeia principal de plasmídeo para pPJV1671 é pPJV7563.<br />
A maioria das seqüências de cadeia principal de plasmídeo em pPJV7563<br />
também são encontrados em pWRG7128, um vetor de vacina de DNA que foi<br />
25 avaliado em diversos testes clínicos humanos. Esta seção fornece uma sinopse<br />
30<br />
da construção de pPJV7563. Um diagrama de fluxo detalhado é fornecido na<br />
Figura 14 da construção de pPJV7563 e pPJV1671, e uma comparação tabular<br />
abaixo (Tabela 2) de elementos chave em plasmídeos pWRG7128 e<br />
pPJV1671 é fornecida. O mapa de pPJV1671 é mostrado na Figura 16.
Tabela 2<br />
126<br />
Comparação de Elementos nas cadeias Principais de Vetor:<br />
Plasmídeos WRG7128 (HBsAg) e pPJV1671 (Influenza HA)<br />
Descrição da Mudança Razão ou Propósito para a<br />
Mudança<br />
O fragmento de gene de<br />
resistência à canamicina<br />
em pPJV1671 é 354 bases<br />
menor do que aquele usado<br />
em pWRG7128.<br />
O ligador Sphl-Pstl a<br />
montante do promotor de<br />
CMV em pWRG7128 foi<br />
removido.<br />
O intron A de CMV foi<br />
removido e em pPJV1671,<br />
o CMV exonl foi fundido<br />
às 9 bases remanescentes<br />
do exon2 de CMV.<br />
O intron A do gene da<br />
insulina de rato foi<br />
inserido entre os exons de<br />
CMV fundidos e a UTR 5'<br />
de HBsAg.<br />
A região de poliadenilação<br />
foi trocada do hormônio de<br />
crescimento bovino para<br />
beta-globina de coelho.<br />
Para remover seqüências<br />
estranhas do vetor<br />
Para remover seqüências<br />
estranhas do vetor.<br />
Possibilita que estes sítios<br />
de restrição sejam mais<br />
eficazmente utilizados em<br />
construções de vacinas<br />
futuras.<br />
Os exons de CMV foram<br />
fundidos para recriar UTR<br />
5' de transcrito pWRG7128<br />
unido.<br />
Para substituir a seqüência<br />
do intron A de CMV com<br />
uma alternativa funcional.<br />
Para utilizar um sinal de<br />
poliadenilação alternativo<br />
Engendramento do Plasmídeo Final, pPJV1671<br />
Efeito Biológico ou<br />
Significância ou Efeito<br />
Possível da Mudança<br />
Nenhuma mudança negativa<br />
para a eficácia ou segurança<br />
da vacina prevista<br />
Nenhuma mudança negativa<br />
para a eficácia ou segurança<br />
da vacina prevista<br />
A fusão dos exons de CMV<br />
não devem mudar o perfil<br />
de eficácia ou segurança da<br />
vacina.<br />
A adição do intron A da<br />
insulina de rato nos vetores<br />
de vacina mostrou aumentar<br />
a expressão de antígeno e<br />
subseqüente respostas de<br />
anticorpo.<br />
Nenhuma mudança negativa<br />
para a eficácia ou segurança<br />
da vacina prevista.<br />
5 Duas etapas principais foram envolvidas no engendramento do<br />
plasmídeo final, pPJV1671, a partir da cadeia principal, pPJV7563 (como<br />
ilustrado na Figura 14) estas são:<br />
deleção do sítio Nhel-Bgl II de pPJV7563; e<br />
inserção da seqüência codificadora de H3 Panama HA no<br />
10 pPJV7563 produzindo o vetor de vacina de DNA de pPJV1671 final, H3<br />
Panama HA.
127<br />
Uma análise de seqüência completa de pPJV1671 confirmou<br />
todas as cadeias principais de vetor e as seqüências codificadoras de HA que<br />
são listadas abaixo na Tabela 3.<br />
Comparação de pWRG7 128 e pPJV1671<br />
5 As diferenças principais nas cadeias principais de vetor entre o<br />
pWRG7128 clinicamente testado que codifica HBsAg e o vetor pPJV1671 da<br />
vacina da influenza que codifica H3 Panama HA são mostradas acima na<br />
Tabela 2. Estas incluem o uso do intron A da insulina de rato no lugar do<br />
elemento de intron A de Citomegalovírus humano (hCMV) e o uso da<br />
10 seqüência de poliadenilação da 0-globina de coelho no lugar da seqüência de<br />
poliadenilação do hormônio do crescimento bovino. Estudos em animal<br />
extensivos com pPJV1671 descritos demonstraram bom desempenho da<br />
vacina de DNA contra a influenza tanto em animais pequenos quanto grandes.<br />
O plasmídeo pPJV1671 também desempenha bem em seres humanos<br />
15 seguindo PMED desta vacina de DNA como debatido abaixo no Exemplo 16.<br />
Característica e Mapa Funcional de pPJV1671<br />
O mapa funcional de pPJV1671 é mostrado na Figura 16. As<br />
características deste mapa estão listadas na Tabela 3. O plasmídeo pPJV1671<br />
utiliza o promotor inicial imediato do hCMV e as seqüência não codificadoras<br />
20 5' de exons 1 e 2. Este promotor é ligado ao intron A da insulina de rato e o<br />
gene UTR 5' do HBV pre-S2. A tradução da seqüência codificadora H3<br />
Panama HA começa em um códon ATG que é fixado no vetor no contexto de<br />
uma seqüência de início de tradução Kozak de consenso. A seqüência<br />
codificadora HA é seguida por um realçador transcricional de HBV<br />
25 (HBVenh). Finalmente, a terminação de transcrição é facilitada por um sítio<br />
de poliadenilação de 0-globina de coelho.<br />
Por causa do códon de início de tradução ATG natural do gene<br />
HA de A/Panama/2007/99 (H3N2) não se conforma à seqüência de consenso<br />
Kozak para o início de tradução, foi escolhido usar o elemento ATG
128<br />
fornecido pelo vetor de vacina de DNA pPJV7563 para o início de tradução.<br />
A expressão de antígeno a partir de vetores de vacina de DNA é realçada<br />
usando códons ATG que se conformem com o consenso de Kozak. O uso do<br />
códon ATG fornecido pelo vetor (por intermédio de inserção no sítio Nhe I)<br />
5 resulta em uma inserção de 2-aminoácidos menor no término amino da<br />
seqüência codificadora do gene HA como representado na Figura 16.<br />
Origem da Seqüência de Nucleotídeos em pPJV167 1<br />
A história de construção detalhada e relatos de<br />
seqüenciamento para pPJV1671 possibilita a designação da origem de todas<br />
10 as posições de nucleotídeo dentro deste plasmídeo. Os alinhamentos de<br />
BLAST entre as seqüências componentes do vetor e as bases de dados do<br />
GenBank foram realizados para verificar que designações de componente<br />
corretas de fato foram feitas.<br />
Tabela 3<br />
15 Identificação de Componentes Que Compreendem Plasmídeo pPJV 1671<br />
Números de Base Identificação de Componente<br />
1-896<br />
Gene de resistência à canamicina, flanqueado pelas<br />
seqüências tn903 (Tn903, pUC4K remanescentes 1-44 e<br />
861-896)<br />
897-902 sítio de clonagem Sal 1 /pUC 19 MCS<br />
903-1587 promotor de CMV<br />
1588-1718 Fusão de exon 1/ 2 de CMV<br />
1719-1724 Fusão BamHl/ Bg12<br />
1725-1857 Intron A da insulina de rato<br />
1858-1863 sítio de clonagem de BamHl<br />
1864-1984 Região preS2 não codificadora de HbsAg<br />
1985-1987 Códon de início ATG<br />
1988-1993 sítio de clonagem Nhel<br />
1994-3688 seqüência codificadora H3N2 HA<br />
3689-3691 Códon de parada<br />
3692 nucleotídeo G de H3 Panama UTR 3'<br />
3693-3698 sítio de clonagem Bsp 1201<br />
3699-4231 Realçador HBV<br />
4232-4242 Artefato de clonagem. Origem desconhecida<br />
4243-4373 região de poliadenilação de beta-globina de coelho<br />
4374-4379 sítio de clonagem EcoR1<br />
4380-5446 Vetor PUC19
129<br />
Seqüência de pPJV1671 (Banco de Célula Mestra)<br />
O seqüenciamento foi realizado pela PowderJect Research<br />
Department usando Qiagen Megaprep DNA preparado a partir do plasmídeo<br />
pPJV 1671 recém construído. Os dados de seqüência reais estavam em 100%<br />
5 de acordo com a seqüência teórica prognosticada para pPJV1671. O<br />
seqüenciamento durante o processo de fabricação também mostrou que a<br />
seqüência de plasmídeo também estava em 100% de acordo com as<br />
seqüências teóricas e de pesquisa. Os vários elementos e posições de<br />
plasmídeo na seqüência são fornecidos na Tabela 3 acima.<br />
10 Exemplo 16. Avaliação Não Clinica de pPJV1671: Imunogenicidade da<br />
Vacina de DNA da Influenza Monovalente pPJV1671 em um Modelo de<br />
Animal Grande<br />
O modelo de porco doméstico foi usado para investigar a<br />
imunogenicidade de pPJV1671 a geração do qual é descrita acima no<br />
15 Exemplo 15. Porcos brancos domésticos de oito semanas de idade (porcos<br />
castrados e leitoas) foram utilizados neste estudo. Os títulos de anticorpo da<br />
inibição da hemagluttinação (HI) foram medidos para os animais de estudo<br />
candidatos e foram
130<br />
que a vacina de DNA pPJV1671 induziu títulos de anticorpo HI significantes<br />
em 100% dos animais de teste com reservatórios de títulos de anticorpo HI<br />
médios em excesso de 1:40 do título de anticorpo HI substituto para a<br />
proteção contra a influenza em seres humanos.<br />
5 Exemplo 17. Testes Clínicos que Avaliam o a construção de vacina de DNA<br />
da influenza em seres humanos<br />
Introdução<br />
Um estudo clínico escalar de dose de fase I foi realizado para<br />
avaliar a segurança e imunogenicidade da vacina de DNA pPJV 1671 que é<br />
10 uma vacina de DNA da influenza PMED monovalente contendo o gene de<br />
HA (hemaglutinina) de A/Panama/2007/99 (H3N2). A segurança foi avaliada<br />
monitorando-se eventos adversos locais e sistêmicos da vacinação até a<br />
conclusão do estudo. A imunogenicidade foi avaliada medindo-se os níveis de<br />
anticorpo da hemaglutinação-inibição (HI) séricas.<br />
15 Três grupos de 12 indivíduos adultos saudáveis receberam<br />
uma dose única no dia O de cada 1, 2 ou 4 l.tg de vacina de DNA, liberada<br />
como 1, 2 ou 4 administrações de PMED. A vacina de DNA da influenza<br />
PMED evocou as respostas de anticorpo de hemaglutinação-inibição (Hl)<br />
séricas em todos os 3 níveis de dose, com as respostas mais altas e mais<br />
20 consistentes em indivíduos vacinados com o nível de dose mais alto. As<br />
respostas de anticorpo foram maiores no último ponto do tempo testado, dia<br />
56. A reatogenicidade relacionada com o tratamento foi limitada a reações de<br />
pele de branda a moderada no local da vacina, que foram primariamente auto-<br />
limitantes. Estes resultados fornecem uma indicação da segurança e<br />
25 imunogenicidade da vacina de DNA para a influenza gerada.<br />
Materiais e Métodos<br />
Vacina e sistemas de liberação<br />
Para o plasmídeo clínico, a seqüência codificadora de HA foi<br />
obtida por uma técnica de clonagem pela transcriptase reversa - reação da
131<br />
cadeia da polimerase (RT-PCR) padrão usando uma amostra de vírus<br />
A/Panama/2007/99 como uma fonte de RNA padrão (o vírus foi um presente<br />
de J. Katz, Centers for Disease Control and Prevention). A seqüência<br />
codificadora de H3 Panama HA foi inserida no vetor pPJV7563 como<br />
5 descrito acima no Exemplo 15 produzindo o vetor de vacina de DNA<br />
pPJV1671 H3 Panama HA final. A análise de seqüência completa de<br />
pPJV1671 confirmou todas as cadeias principais de vetor e as seqüências<br />
codificadoras de HA.<br />
O plasmídeo pPJV1671 foi fabricado sob boas práticas de<br />
10 fabricação na Strathman GmbH (Hannover, Alemanha). O DNA plasmídico<br />
foi revestido em partículas de ouro de 1 a 3 gm, e formulado para PMED<br />
usando o dispositivo PowderJect XR-1, usando os métodos anteriormente<br />
descritos (Roy et al., (2001) Vaccine 19: 764-78). Cada dose conteve um<br />
valor nominal de 1 pg de DNA revestido em 0,5 mg de ouro. Os parâmetros<br />
15 de qualidade de vacina analisados incluíram a quantidade de ouro e DNA,<br />
expressão in vitro, imunopotência em camundongos, e ausência de biocarga e<br />
endotoxina.<br />
População e conversão de indivíduo<br />
A fase clínica do estudo foi conduzida na MDS Pharma<br />
20 Services, Lincoln, NE, e foi aprovada pelo Institutional Review Board local.<br />
Trinta e seis (36) voluntários adultos foram alistados (Tabela 4).<br />
Tabela 4: Demográficos da população de estudo<br />
Grupo 1 Grupo 2 Grupo 3<br />
Número por grupo 12 12 12<br />
Idade média (anos) 31 31 32<br />
Faixa de idade (anos) 20-48 20-50 21-49<br />
Homem: Mulher 7: 5 4: 8 5: 7<br />
Pré vacinação<br />
HAI GMT (faixa)<br />
16 (5-40) 17 (5-40) 12 (5-40)<br />
Os indivíduos foram considerado elegíveis se eles foram<br />
saudáveis, de idade de 19 a 50, não grávidos ou lactentes, capazes de fornecer<br />
25 Consentimento Informado por escrito, e com títulos de inibição da
132<br />
hemaglutinação (HI) na pré vacinação à influenza A/Panama de e 40.<br />
As razões para a exclusão incluíram terapia imunossupressiva<br />
nos últimos 6 meses, história de doença de pele, cicatriz, verrugas, cortes ou<br />
tatuagens no local de imunização, alergia a ouro, história de crisoterapia,<br />
5 recebimento de vacina contra a influenza nos últimos 12 meses, sintomas<br />
equivalentes à influenza ou influenza diagnosticada na estação corrente, ou<br />
presença de qualquer condição médica onde a vacinação contra a influenza<br />
não é recomendada.<br />
Todos os indivíduos completaram o estudo e foram avaliados<br />
10 quanto a segurança e imunogenicidade, com a exceção de dois indivíduos.<br />
Um indivíduo foi perdido de seguimento e um outro indivíduo não foi<br />
condescendente. Entretanto, conforme todos os 36 indivíduos forneceram uma<br />
amostra de pré vacinação, receberam a vacinação, e foram avaliados pelo<br />
menos uma vez após a vacinação quanto a segurança e imunogenicidade, os<br />
15 dados foram disponíveis para a avaliação de segurança e imunogenicidade em<br />
todos os indivíduos. Todos os procedimentos de estudo foram de acordo com<br />
a Declaração de Helsinki de 1975, com as últimas emendas Edinburgh,<br />
Scotland (2000) e a International Conference on Harmonization guidelines on<br />
Good Clinical Practice (Etapa 4, 1 de maio de 1996).<br />
20 Planejamento de Estudo Clínico<br />
Os indivíduos foram designados a três grupos de tratamento,<br />
12 por grupo, em uma base seqüencial. Cada administração de vacina de<br />
DNA de PMED liberou 1 In de DNA, plasmídeo pPJV1671 (H3 Panama) em<br />
0,5 mg de ouro. O primeiro grupo receberam uma única administração de<br />
25 vacina no aspecto interno do braço superior no dia 0. Indivíduos no grupo 2<br />
receberam duas imunizações de vacina no dia 0, para um total de 2 pg de<br />
DNA, administrado aos sítios adjacentes no braço superior interno. Os<br />
indivíduos no grupo 3 receberam 4 administrações no dia 4, para um total de<br />
4 lag de DNA. As vacinas foram administradas usando o dispositivo
133<br />
PowderJect XR-1 em uma pressão de hélio de 500 psi (3450 kPa), uma<br />
pressão mostrada ser bem tolerada em estudos mais no princípio (Roy et al.<br />
(2001) Supra, Rottinghaus et al. (2003) Vaccine 21(31): 4604-8 e Tacket et<br />
al. (1999) Vaccines 17(22): 2826-9).<br />
5 Segurança Clínica e Avaliações de Imunogenicidade<br />
A segurança foi avaliada monitorando-se as reações no sítio de<br />
vacinação e registrando a incidência de eventos adversos locais e sistêmicos<br />
durante o estudo. Todos os indivíduos foram avaliados quanto a segurança da<br />
vacina e tolerabilidade local no momento da imunização, 1 hora e 2 horas<br />
10 após a imunização. Os indivíduos foram ainda avaliados quanto a<br />
tolerabilidade local nos dias 3, 7, 14, 21, 28, 56, e 180. Os eventos adversos<br />
sistêmicos foram monitorados pela examinação física, sinais vitais, testes de<br />
segurança de laboratório, e testes de anticorpo anti DNA de filamento duplo.<br />
Estes testes foram conduzidos antes e depois da imunização.<br />
15 A imunogenicidade de cada vacina foi determinada pela coleta<br />
de amostras de sangue no dia O (pré imunização), e nos dias 14, 21, e 56 após<br />
a imunização para a determinação de títulos de HAI contra<br />
A/Panama/2007/99, usando uma modificação de um método previamente<br />
descrito (Kendal, et al (1982) Concepts and procedures for laboratory-based<br />
20 influenza surveillance. US Department of Health and Human Services, Public<br />
Health Service, Centers for Disease Control: B17-35).<br />
Análise de dados clínicos<br />
Os dados de segurança foram tabulados. Cada título de HI foi<br />
reportado como a média geométrica (GMT) de duas determinações<br />
25 independentes, que usualmente produziram os mesmos ou resultados<br />
similares. Um título de 5 foi designado se a amostra teve um título abaixo de<br />
10, o limite de detecção do ensaio. Para cada grupo, a GMT em cada ponto de<br />
tempo e 95% de Intervalo de Confidência (CI) foram calculados usando<br />
títulos logaritmicamente transformados. Para cada ponto de tempo, a razão de
134<br />
GMT da referência para cada grupo de dosagem foi comparada pelos testes de<br />
chi-quadrado usando procedimentos CATMOD em SAS. As diferenças na<br />
GMT entre os três grupos também foram comparadas.<br />
A taxa de soroconversão (porcentagem de indivíduos com >_4-<br />
5 vezes de aumento no título de HAI em relação ao título na pré imunização), e<br />
a taxa de soroproteção (a proporção de indivíduos que alcançam um título na<br />
pós imunização 40) foram calculadas e comparadas entre os grupos pelo<br />
teste de chi-quadrado usando o procedimento CATMOD em SAS para<br />
comparar a% de resta com a função de ligação de resposta logit.<br />
10 Resultados<br />
Segurança e Reatogenicidade<br />
As reações locais foram avaliadas para todos os 84 locais de<br />
administração de vacina (Figura 18). As contagens de reação de pele de todos<br />
os três grupos (84 locais de vacinação totais) foram calculados em média. As<br />
15 reações de pele foram classificadas de acordo com os seguintes critérios:<br />
sol branda; 3 = vermelhão.<br />
- Eritema: O = nenhum; 1 = vermelhidão; 2 = queimadura de<br />
- Edema: O = nenhum; 1 = um pouco mais espesso; 2 =<br />
notavelmente mais espesso; 3 = agrupamento firme grande.<br />
20 - Descoloração: O = nenhum; 1 = pouco observável; 2 =<br />
notavelmente descolorido; 3 = graxa de sapato marrom.<br />
- Floculação: O = nenhuma; 1 = como caspa branca fina; 2 =<br />
descascando como queimadura de sol; 3 = mais espessa, amarela, com crosta.<br />
- Coceira/desconforto: O = nenhuma; 1 = coceira branda ou<br />
25 levemente sensível ao toque; 2 = coceira ou sensibilidade moderadas<br />
Como esperado com base em estudos anteriores (Roy et al.<br />
(2001), Rottinghaus et al. (2003) e Tacket et al. (1999) todos supra), os<br />
indivíduos experienciaram reações dérmicas locais, entretanto nenhuma<br />
reação local na faixa severa (classificação = 3) ocorreu. Não houve registros
135<br />
de hemorragia ou dano à pele. A reação local típica foi caracterizada por<br />
eritema, edema, e descoloração de pele de brandas a moderadas, e<br />
ocasionalmente coceira/desconforto, seguido pela floculação de pele<br />
superficial branda.<br />
5 Reações locais infreqüentes incluíram petéquias (2/84 locais),<br />
contusões menores (2/84 locais) e cicatrizes menores (15/84 locais). Embora<br />
o edema no geral desaparecesse em 14 dias após a vacinação, o eritema e a<br />
descoloração de pele persistiram até 28 dias. Dos 84 locais de vacinação<br />
totais, a descoloração de pele branda estava ainda presente em 30 nos dias 56<br />
10 e 21 nos dias 180 após a vacinação. Um indivíduo também teve contusão<br />
detectável em 2 locais no Dia 180.<br />
Os eventos adversos sistêmicos observados durante o estudo<br />
foram brandos e considerados não relacionados com o tratamento. Os eventos<br />
reportados de 7 a 56 dias após a imunização incluíram dor de cabeça (11<br />
15 eventos em 10 indivíduos), fadiga (4 eventos em 3 indivíduos), mialgia (3<br />
eventos em 1 indivíduo), febre (2 eventos em 2 indivíduos), sensação de frio<br />
nas mãos (2 eventos em 2 indivíduos), dor nas costas (2 eventos em 1<br />
indivíduo) e náusea, artralgia, rigidez muscular, calafrio, hipertensão<br />
intermitente, e hipotensão intermitente (1 evento de cada em 1 indivíduo).<br />
20 Nenhum anticorpo anti-DNA de filamento duplo foi detectado. De ponta a<br />
ponta o perfil de evento adverso local e sistêmico para todos os grupos de<br />
estudo forneceu uma indicação da segurança da vacina de DNA contra a<br />
influenza liberada por PMED.<br />
Respostas de Anticorpo<br />
25 Os indivíduos foram pré triados quanto aos títulos de 1-11 para<br />
Influenza A/Panama de 10 e .40, já alguns indivíduos tiveram títulos de 5_10<br />
no dia da vacinação. Os títulos de HI de referência foram todos
136<br />
A imunização resultou em aumentos significantes nos títulos<br />
médios geométricos (GMT) em todos os pontos de tempo em todos os três<br />
grupos (como mostrado na Tabela 5 abaixo).<br />
Tabela 5:<br />
5 Respostas de anticorpo sérico, taxas de soroconversão e soroproteção<br />
Grupo Dia Soroconversão a<br />
(%)<br />
Soroproteção b<br />
(%)<br />
Aumento de GMT<br />
médio (vezes)<br />
1 0<br />
17 (2/12)<br />
14 8 (1/12)<br />
42 (5/12)<br />
1,4<br />
21 17 (2/12) 33 (4/12)<br />
1,7<br />
56 33 (4/12) 58 (7/12) 2,8`<br />
2 O 33 (4/12) -<br />
14 17 (2/12) 50 (6/12) 1,7<br />
21 8 (1/12) 58 (7/12) 2,1<br />
56 67 (8/12) 92 (11/12) 3,9<br />
3 O 8 (1/12) -<br />
14 17 (2/12) 25 (3/12) 1,8<br />
21 33 (4/12) 67 (8/12) 3,4<br />
56 64 (7/11) 100 (11/11) 8,1<br />
a A soroconversão é definida como um título de pré vacinação negativo<br />
(5_10) a um título pós vacinação ou um aumento significante no título de<br />
anticorpo, isto é, pelo menos um aumento de quatro vezes entre os títulos de<br />
pré e pós vacinação onde o título de pré vacinação é ?..1 O<br />
10 b A taxa de soroproteção é definida como a proporção de indivíduos que<br />
alcançam um título de pós imunização<br />
c Os valores que atingem os critérios CPMP estão negrito<br />
Embora houvesse uma tendência voltada para títulos de HI<br />
mais altos e% de soroconversão mais alta em uma maneira de dose-resposta,<br />
15 não houve nenhuma diferença estatística na GMT,% de soroproteção ou% de<br />
soroconversão entre os três grupos. Para todos os três níveis de dose de<br />
vacina, GMT,% de soroconversão e% de soroproteção aumentaram como<br />
uma função do tempo após a vacinação, com os títulos mais altos no dia 56<br />
(ver a Tabela 5). No grupo 1, 33% dos indivíduos foram soroconvertidos no<br />
20 dia 56, com 58% obtendo títulos HAI soroprotetores, e um aumento de GMP<br />
de 2,8 vezes. No grupo 2, a taxa de soroconversão no dia 56 foi de 67%, com
137<br />
92% dos indivíduos soroprotegidos e um aumento de GMT de 3,9 vezes. Os<br />
títulos mais altos e mais consistentes foram observados para o grupo 3 no dia<br />
56, onde 100% de soroproteção foram observados, e GMT aumentou 8,1<br />
vezes em relação à referência. Neste grupo, a soroconversão foi menor do que<br />
5 100%, porque alguns indivíduos soroprotegidos não mostraram um aumento<br />
de vezes no título, devido aos títulos HAI de referência relativamente<br />
altos.<br />
Debate<br />
O trabalho descrito no presente Exemplo fornece a primeira<br />
10 geração bem sucedida de uma resposta de anticorpo anti-influenza que é<br />
prognosticada ser eficaz para a profilaxia da influenza.<br />
A análise imunológica demonstrou que todas os níveis de dose<br />
produziram respostas de anticorpo anti-influenza. A comparação contra as<br />
diretrizes da CPMP (Committee for Proprietary Medical Products) para o<br />
15 licenciamento anual de vacinas Flu mostrou que o grupo de dose de 1 vig<br />
atingiu os critérios no dia 56 no Título Médio Geométrico (GMT), o grupo de<br />
dose de 2 gg atingiu os critérios no dia 56 em todos os três critérios<br />
(soroconversão, soroproteção e GMT) e o grupo de dose de 4 pg atingiu os<br />
critérios no dia 21 para a GMT e no dia 56 em todos os outros critérios.<br />
20 Um total de 320 eventos adversos emergentes do tratamento<br />
(AEs), incluindo as reações no local da vacina, foram reportados por 34<br />
(94%) dos 36 indivíduos dosados. Houve 1 SAE reportado durante o estudo —<br />
uma fratura de pé — considerada improvável de estar relacionada com a vacina<br />
em estudo. Sete (7) indivíduos experienciaram AEs reportáveis ao FDA que<br />
25 foram todos considerados improváveis de estarem relacionados com a vacina<br />
em estudo. A maioria (71%) dos AEs foram brandos na severidade. O AE<br />
mais comum reportado foi dor de cabeça (53% de todos os indivíduos).<br />
Nenhum indivíduo descontinuou o estudo devido a um AE. Um total de 89<br />
Aes relacionados com o local da vacinação foram reportados por 27 dos 36
138<br />
indivíduos dosados com a dor branda no local da aplicação sendo o AE local<br />
mais comum, reportado por 12 indivíduos (33%). Nenhuma medida de<br />
reatogenicidade local foi avaliada como Grau 3 (severa) e portanto<br />
consideradas eventos adversos. As reações no local da vacinação típicas<br />
5 incluem vermelhidão/eritema, edema, floculação, descoloração e formação de<br />
crosta/cicatriz.<br />
Em conclusão, a administração de pPJV1671 foi bem tolerada<br />
em todos os indivíduos, e evocaram respostas de anticorpo anti-influenza<br />
potentes. A dose de topo de 4 vig atingiu os critérios em 21 dias estabelecido<br />
10 pelo CPMP para o licenciamento de vacinas flu anual.<br />
Exemplo 18. Avaliação não clínica de vacina de DNA trivalente em porcos.<br />
Três vetores de vacina de DNA que codifica as moléculas de<br />
HA das três cepas da vacina da influenza 2001-2002 foram construídos para<br />
avaliar a imunogenicidade de uma vacina de DNA da influenza trivalente<br />
15 humana candidata em um modelo de animal relevante. Historicamente, o<br />
porco doméstico foi usado como um modelo para as vacinas de DNA na<br />
PMED em seres humanos devido às similaridades próximas nas arquiteturas<br />
da pele humana e de porco. A relevância do modelo de porco como um<br />
prognosticador do desempenho de vacina de DNA na PMED em seres<br />
20 humanos foi demonstrado por um teste clínico humano de fase I de uma<br />
vacina de DNA de antígeno de superfície da hepatite B em que o bom<br />
desempenho da vacina em porcos foi espelhado em seres humanos.<br />
As amostras de três cepas de vacina da influenza humana<br />
2001-2002 (A/Panama/2007/99 (H3N2), A/New Caledonia/20/99 (H1N1), e<br />
25 BNictoria/5/00) foram obtidos do Centers for Disease Control (CDC) e<br />
usadas em experimentos da transcriptase reversa/reação da cadeia da<br />
polimerase (RT-PCR) para gerar fragmentos de DNA que codifiquem os<br />
antígenos de HA correspondentes. As seguintes etapas foram utilizadas no<br />
desenvolvimento dos três vetores de vacina de DNA HA finais:
139<br />
A produção pela RT-PCR de fragmentos de dsDNA de<br />
segmento #4 de RNA de A/Panama/2007/99 (H3N2), A/New<br />
Caledonia/20/99 (H1N1), e BNictoria/5/00.<br />
Propagação de clones de DNA do segmento #4 de RNA<br />
5 em um vetor com base em pUC 19 padrão na E. coli.<br />
Análise de seqüência da seqüência codificadora de HA<br />
dentro dos clones do segmento #4 de RNA.<br />
Uma segunda série de reações de PCR (com base nos<br />
dados de seqüência de gene de HA real) para gerar fragmentos de DNA de<br />
10 cada vírus contendo a seqüência codificadora de HA (sem códons de ATG)<br />
com as extremidades compatíveis com o vetor de expressão da vacina de<br />
DNA pPJV7563 (Nhe I e Bsp 1201).<br />
Inserção dos três fragmentos de seqüência codificadora de<br />
HA no vetor de vacina de DNA clínico pPJV7563 produzindo os três vetores<br />
15 de vacina de DNA finais.<br />
Análise de seqüência de seqüências codificadoras HA em<br />
todos os três vetores confirmando que nenhuma mutação ocorreu.<br />
Os vetores resultantes utilizam promotores quiméricos da<br />
invenção. Assim, os vetores utilizam o promotor inicial imediato de<br />
20 citomegalovírus humano (hCMV) e as seqüências não codificadoras 5' de<br />
exons iniciais imediatos 1 e 2. Este promotor está ligado ao intron A da<br />
insulina de rato e a região não traduzida 5' (UTR) do gene pre-S2 do vírus da<br />
hepatitis B (HBV). A tradução da seqüência codificadora HA começa em um<br />
códon ATG que é fixado no vetor no contexto de uma seqüência de início de<br />
25 tradução Kozak de consenso. A seqüência codificadora HA é seguido por um<br />
realçador transcricional de HBV (HBVenh). Finalmente, a terminação da<br />
transcrição é facilitada por um sítio de poliadenilação de 0-globina de coelho.<br />
Como os códons de início de tradução ATG naturais de genes<br />
HA não se conformam à seqüência de consenso de Kozak para o início de
140<br />
tradução, o elemento ATG fornecido pelo vetor de vacina de DNA pPJV7563<br />
foi usado para o início de tradução. A expressão de antígeno a partir de<br />
vetores de vacina de DNA é no geral realçada usando códons ATG que se<br />
conformam com o consenso Kozak. O uso do códon ATG fornecido pelo<br />
5 vetor (por intermédio de inserção no sítio Nhe I) resulta em uma inserção de<br />
dois aminoácidos menores no terminal amino da seqüência codificadora do<br />
antígeno HA.<br />
A imunogenicidade destes vetores foi avaliada em uma<br />
formulação trivalente no modelo de porco doméstico. Os três vetores foram<br />
10 misturados 1:1:1 e formulados em partículas de ouro a uma taxa de 2 gg de<br />
DNA total /mg de ouro, usando 0,5 mg de ouro por administração. Cada<br />
imunização consistiu de duas administrações na PMED em tandem<br />
totalizando 2µg de DNA e 1 mg de ouro. O regime de vacinação envolveu<br />
duas de tais imunizações espaçadas quatro semanas. Os porcos ingênuos em<br />
15 influenza foram divididos em dois grupos de imunização com base no<br />
dispositivo de liberação real utilizado. Um grupo de animais receberam<br />
vacinações de DNA da influenza trivalentes usando o dispositivo PMED de<br />
"pesquisa" reutilizável que foram usados com sucesso para induzir respostas<br />
imunes a numerosos antígenos em uma variedade de animais. O segundo<br />
20 grupo de animais receberam imunizações usando o dispositivo clínico que foi<br />
usado para vacinar com sucesso seres humanos usando uma vacina de DNA<br />
de HBV. Este último dispositivo difere do dispositivo de pesquisa em que o<br />
mesmo utiliza um bocal plástico descartável de "tiro único" no lugar do bocal<br />
reutilizável de 12 tiros associado com o dispositivo de pesquisa.<br />
25 Duas semanas a seguir da segunda imunização, as amostras de<br />
soro foram coletadas e os títulos de anticorpo de inibição da hemaglutinação<br />
(HI) específicos para os vírus homólogos H3, H1 e B foram medidos. Estes<br />
dados são mostrados na Figura 19. 100% de soroconversão foram observados<br />
para os antígenos H3 e B usando ambos os dispositivos com reservatório de
141<br />
títulos de HI médios geométricos em excesso do nível substituto de 1:40<br />
habitualmente acreditado ser requerido para a imunogenicidade para<br />
influenza. Os dados obtidos indicam que esta plataforma de tecnologia será<br />
capaz para evocar respostas significantes em seres humanos.<br />
5 As respostas imunes específicas de H1 foram mais baixas. Isto<br />
foi mais tarde determinado ser devido a um rearranjo no gene HA de H1 que<br />
ocorreu no vetor de vacina de DNA de H1 durante a produção de plasmídeo.<br />
Estes rearranjos não foram detectados na análise inicial do DNA antes da<br />
formulação e vacinação, mas seriam detectados por uma análise mais<br />
10 rigorosa. Com base nos resultados usando os vetores H3 e B, é provável que<br />
as respostas específicas de H1 tenham sido acentuadamente maiores tiveram<br />
um plasmídeo funcional sendo utilizado.<br />
Exemplo 19. Construção de pPJV2012 plasmídico<br />
O pPJV2012 plasmídico foi construído. pPJV2012 expressa as<br />
15 subunidades A B da e toxina instável ao calor (LT) de Escherichia coli<br />
enterotoxigênica. A expressão de toxin LT funcional de pPJV2012 in vivo<br />
pode ser usada para realçar a resposta imune a outras proteínas expressadas a<br />
partir de plasmídeos co-administrados com pPJV2012.<br />
LT é uma proteína multimérica de 84 kD composta de uma<br />
20 única subunidade A e um pentâmero de subunidades B idênticas. LT é<br />
expressado e secretado de E. coli e liga-se a gangliosídeo GM1 nas células<br />
intestinais por intermédio do pentâmero de subunidades B. A toxina é<br />
internalizada e a subunidade A então ativa a produção de cAMP excessivo e o<br />
rompimento do equilíbrio eletrolítico através do lúmen intestinal (Tauschek,<br />
25 et al (2002) Proc Natl Acad Sci, USA 99: 7066-7071). Assim para a atividade<br />
biológica de LT expressado in vivo a produção tanto de subunidade A quanto<br />
B é requerida junto com sinais que medeiem a secreção a partir da qual<br />
células de expressão. Os vetores plasmídicos que codificam as subunidades A<br />
e B de LT mostraram to aumentar a resposta imune induzida a diversos
142<br />
antígenos virais quando co-liberadas usando a liberação epidérmica mediada<br />
particular (Arrington et al (2002) J Virol 76 (9): 4536-46).<br />
Além das seqüências codificadoras para as subunidades A e B<br />
da toxina LT, pPJV2012 também incorpora as seqüências promotoras<br />
5 quiméricas da invenção para garantir a expressão de gene eficaz, um<br />
seqüência poli A de beta globina de coelho, seqüências de sinal para mediar a<br />
secreção a partir da qual células expressam, um gene de resistência à<br />
canamicina e uma origem bacteriana de replicação. O plasmídeo é mostrado<br />
na Figura 22.<br />
10 O plasmídeo pPJV2012 foi construído por intermédio das<br />
seguintes etapas:<br />
Amplificação pela PCR da seqüência codificadora A de<br />
LT de DNA genômico de E. coli e inserção em um plasmídeo intermediário;<br />
Excisão da seqüência codificadora A de LT e inserção em<br />
15 um plasmídeo "Aceitador" sob o controle do promotor de CMV.<br />
A amplificação pela PCR da seqüência codificadora B de<br />
LT a partir do DNA genômico de E. coli e inserção em um plasmídeo<br />
intermediário sob o controle de um promotor truncado de CMV.<br />
Excisão do cassete de expressão A de LT.<br />
20 O plasmídeo resultante, pPJV2012, a expressão de ambas as<br />
subunidades de LT em células de mamífero.<br />
Promotor e seqüências realçadoras em pPJV2012<br />
A subunidade A de LT é expressada a partir de um promotor<br />
Inicial Imediato de CMV (IE). A subunidade B de LT é expressada a partir de<br />
25 um promotor IE de CMV truncado. As seqüências adicionais são incluídos<br />
para ambos os genes para melhorar a expressão, especificamente a HBV pre-<br />
S2 UTR 5' (Moriarty et al (1981) Proc Natl Acad Sci USA 78: 2606-2610),<br />
exon 'A de CMV (consistindo dos dois primeiros exons IE de CMV unidos<br />
juntos pela deleção do intron natural), intron A da insulina de rato (Lomedico
143<br />
et al (1979) Cell 2: 545-558) e poli A de beta globina de rato (rGpA). Para<br />
garantir a secreção das células de expressão o peptídeo de sinal da lisozima de<br />
galinha (CLSP; número de acesso no Genbank CR390743) foi inserido a<br />
ambas as subunidades LT. Além disso, o realçador env do HBV (Vannice e<br />
5 Levinson (1988) J Virol. 62: 1305-1313) foi inserido depois da subunidade A<br />
para melhorar a expressão.<br />
Clonagem das subunidades A e B de LT<br />
A cepa E078 da E. coli: H11 foi obtida da ATCC (catálogo<br />
#35401), e as subunidades A e B foram amplificadas pelas reações de PCR<br />
10 separadas usando iniciadores homólogos para as extremidades 5' e 3',<br />
planejadas pela referência ao arquivo de acesso no GenBank AB011677. As<br />
seqüências codificadoras geradas para ambas as subunidades não incluem as<br />
seqüências que codificam os peptídeos de sinal bacterianos encontrados nos<br />
términos amino. Os fragmentos de subunidade A e B foram separadamente<br />
15 ligados no plasmídeo WRG7054.<br />
Construção de pPJV2012<br />
A seqüência codificadora A de LT foi excisada e ligada com a<br />
cadeia principal de vetor de pPJV7592 e um fragmento derivado de<br />
pPJV7572 que incluiu o promotor de CMV, as regiões não traduzidas 5' e<br />
20 CLSP. O plasmídeo resultante foi designado Al. Al foi cortado e ligado com<br />
um fragmento de pPJV7592 para recriar um sítio de clonagem múltiplo, e o<br />
plasmídeo resultante foi designado Aceitador; isto forneceu o componente A<br />
de LT de pPJV2012.<br />
A seqüência codificadora B de LT foi excisada e ligada com a<br />
25 cadeia principal de vetor de pPJV7591 e a um fragmento derivado de<br />
pPJV7572 que continha a extremidade 3' das regiões não traduzidas e o<br />
CLSP. O plasmídeo resultante foi designado Doador e forneceu o componente<br />
B de LT de pPJV2012.<br />
Para gerar pPJV2012 um fragmento de Doador contendo o
144<br />
cassete de expressão B de LT foi ligado com um fragmento de vetor derivado<br />
de Aceitador. O plasmídeo resultante expressa tanto A quanto B de LT em<br />
células de mamífero.<br />
Origem das seqüências de nucleotídeo em pPJV2012<br />
5 pPJV2012 foi totalmente seqüenciado e alinhado com bases de<br />
dados para designar a origem de cada seqüência. As seqüências derivadas,<br />
mostradas na Tabela 6 abaixo, foram como esperadas.<br />
Tabela 6: Identificação de Componentes Que compreendem Plasmídeo<br />
pPJV2012<br />
Números de base Identificação do Componente<br />
1-905<br />
Seqüências derivadas de pUC4K incluindo o gene de resistência à<br />
canamicina<br />
906-1038 poli A de beta globina de coelho<br />
1039-1351 seqüência codificadora da subunidade B de LT<br />
1352-1357 Seqüência ligadora<br />
1358-1417 seqüência de sinal da lisozima de galinha<br />
1418-1538 UTR 5' de HBV pre-S2<br />
1539-1544 Seqüência ligadora<br />
1545-1677 Intron A de rato<br />
1678-1683 Seqüência ligadora<br />
1684-1814 exon 1 / 2 de CMV<br />
1815-1935 Promotor IE de CMV truncado<br />
1936-1947 Seqüência ligadora<br />
1948-2632 promotor de CMV<br />
2633-2763 CMV exon 1 / 2<br />
2764-2769 Seqüência ligadora<br />
2770-2902 Intron A da insulina de rato<br />
2903-2908 Seqüência ligadora<br />
2909-3029 UTR 5' de HBV pre-S2<br />
3030-3089 Peptídeo de sinal da lisozima de galinha<br />
3090-3095 Seqüência ligadora<br />
3096-3818 seqüência codificadora A de LT
145<br />
Números de base Identificação do Componente<br />
3819-3830 Seqüência ligadora<br />
3831-4363 seqüência realçadora HBV env<br />
4364-4374 Seqüência desconhecida<br />
4375-4050 poli A de beta globina de coelho<br />
4051-5578 Seqüência derivada de pUC19<br />
Além disso, uma pesquisa BLAST foi realizada para<br />
homologias de seqüência para o genoma humano inteiro, procurando<br />
similaridades de seqüência em trechos tão curtos quanto 19 bases. Não foram<br />
"encontradas nenhuma similaridade significante"; o maior grau de homologia<br />
5 foi com uma seqüência de 68 bases de rGpA, embora o trecho mais longo de<br />
seqüência idêntica foi apenas de 18 bases.<br />
Comparação de seqüência de pPJV2012 com pPJV1671<br />
A seqüência de pPJV2012 foi comparada com aquela de<br />
pPJV 1671. Os resultados são mostrados na Tabela 7 abaixo.<br />
10 Tabela 7: Comparação da seqüência de pPJV2012 com pPJV1671<br />
Números de base da seqüência em<br />
pPJV2012<br />
1-896<br />
897-905<br />
906-1038<br />
1039-1351<br />
1352-1357<br />
1358-1417<br />
1418-1538<br />
1539-1544<br />
1545-1677<br />
1678-1683<br />
1684-1814<br />
1815-1935<br />
1936-1947<br />
Seqüência também presente na vacina<br />
de DNA contra a influenza de<br />
pPJV1671?<br />
Sim<br />
Não<br />
Sim<br />
Não<br />
Sim<br />
Não<br />
Sim<br />
Sim<br />
Sim<br />
Sim<br />
Sim<br />
Sim<br />
Sim
Números de base da seqüência em<br />
pPJV2012<br />
1948-2632<br />
2633-2763<br />
2764-2769<br />
2770-2902<br />
2903-2908<br />
2909-3029<br />
3030-3089<br />
3090-3095<br />
3096-3818<br />
3819-3824<br />
3825-3830<br />
3831-4363<br />
4364-4374<br />
4375-4505<br />
4512-5578<br />
146<br />
Seqüência também presente na vacina<br />
de DNA contra a influenza de<br />
pPJV1671?<br />
Sim<br />
Sim<br />
Sim<br />
Sim<br />
Sim<br />
Sim<br />
Não<br />
Sim<br />
Não<br />
Sim<br />
Sim<br />
Sim<br />
Sim<br />
Sim<br />
Sim<br />
A análise demonstra que 4418 dos 5578 pares de base (79%)<br />
em pPJV2012 também estão presentes na vacina de DNA contra a influenza<br />
de pPJV1671. Exclusivo das seqüências codificadoras para as subunidades A<br />
e B de LT, 4418 dos 4544 pares de base (97%) de pPJV2012 também estão<br />
5 presentes em pPJV 1671.<br />
Observe que pPJV1671 tem passado pelos estudos de<br />
biodistribuição/integração e em cada caso nenhuma evidência de integração<br />
foi encontrada.<br />
Exemplo 20 - Construção do plasmídeo pPJV7788 um plasmídeo que<br />
10 expressa as subunidades LT da E. coli em células de mamífero<br />
plasmídeos:<br />
O plasmídeo pPJV7788 foi gerado usando os seguintes<br />
pPJV7563 e pPJV7592 que são plasmídeos derivados de<br />
pPJV7275, pPJV7284, pPJV7389, pPJV7586 e pPJV7293.
147<br />
pPJV7590 que é um derivado de pPJV7389 que inclui um sítio<br />
de clonagem múltiplo (MCS) imediatamente a montante do promotor de<br />
CMV.<br />
pPJV7572 que é um derivado de pPJV7389 que contêm a<br />
5 seqüência codificadora para o peptídeo de sinal da lisozima de galinha<br />
(CLSP) diretamente a montante do antígeno codificado. Isto possibilita a<br />
secreção extracelular de antígenos fundidos no terminal C.<br />
(i) Construção de pPJV7785 (Plasmídeo Aceitador LTA)<br />
pPJV7563 foi cortado com Sal 1 , com extremidade abrupta e<br />
10 cortado com Nde 1 para criar um fragmento de vetor. pPJV7590 foi cortado<br />
com Sphl, com extremidade abrupta, e cortado com Ndel para criar um<br />
fragmento de inserto contendo um MCS e as cinco extremidades de iniciador<br />
do promotor de CMV. Estes fragmentos foram ligados para gerar pPJV7592.<br />
pPJV7592 foi cortado com Nco 1 e Bg12 para criar um<br />
15 fragmento de vetor. pPJV7572 foi cortado com Ncol e Nhel para criar um<br />
fragmento de inserto contendo a extremidade 3' do promotor de CMV, as<br />
regiões não traduzidas 5', e o CLSP. pPJV2004 foi cortado com Nhe 1 e<br />
BamHl para criar um fragmento de inserto contendo a subunidade LTA.<br />
Estes fragmentos foram ligados para gerar o plasmídeo pPJV7785.<br />
20 (ii) Construção de pPJV7787 (Plasmídeo Doador LTB)<br />
pPJV7389 foi cortado com Ncol e EcoR1 para criar um<br />
fragmento de vetor. pPJV7572 foi cortado com Nco 11 e Nhe 1 para criar um<br />
fragmento de inserto contendo a extremidade 3' do promotor de CMV, a<br />
região não traduzida 5', e o CLSP. pPJV2005 foi cortado com Nhel e BamH1<br />
25 para criar um fragmento de inserto contendo a subunidade LTB. pPJV7586<br />
foi cortado com Bg12 e EcoR1 para criar um fragmento de inserto contendo a<br />
região de poliadenilação de beta-globina de coelho. Estes fragmentos foram<br />
ligados para gerar pPJV7787.<br />
(iii) Construção de pPJV7788
148<br />
pPJV7785 foi cortado com Xho 1 e Mfe 1 para criar um<br />
fragmento de vetor contendo o cassete de expressão LTA. pPJV7787 foi<br />
cortado com Xho 1 e EcoR1 para criar um fragmento de inserto contendo o<br />
cassete de expressão LTB. Estes fragmentos foram ligados para gerar<br />
5 pPJV7788 que expressará as subunidades LTA e LTB quando introduzidas<br />
em células de mamífero.<br />
na construção pPJV7788.<br />
A Tabela 8 abaixo fornece a localização dos vários elementos<br />
Tabela 8: Componente ID para pPJV7788<br />
Números de Base Componente<br />
1-44 Tn903, remanescentes de pUC4K<br />
45-860 KanR (Tn903)<br />
861-983 Tn903, remanescentes de pUC4K<br />
984 —1001 pUC19 MCS<br />
1002 -1686 CMV Pro<br />
1687-1817 Exon 1/2 de CMV<br />
1818-1823 fusão Bam/Bgl<br />
1824-1956 Intron A da insulina de rato<br />
1857-1962 sítio BamHl<br />
1963-2083 UTR 5' de HBV pre-S2<br />
2084-2143 Lisozima SP<br />
2144-2149 Sítio Nhel<br />
2150-2462 LTB<br />
2463-2593 RBGpA<br />
2594-2623 Sítio de Clonagem Múltipla<br />
2624-3308 CMV Pro<br />
3309-3439 Exon 1/2 de CMV<br />
3440-3445 fusão Bam/Bgl<br />
3446-3578 Ins IntA de Rato
3579-3584 BamH1<br />
149<br />
3585-3705 UTR 5' de HBV pre-S2<br />
3706-3765 Lisozima SP<br />
3766-3671 sítio Nhel<br />
3772-4494 LTA<br />
4495-4506 Poliligador<br />
4507-5039 HBVenh<br />
5040-5050 Origem desconhecida.<br />
5051-5181 rGlob pA<br />
5182-5187 sítio EcoR1<br />
5188-6254 pUC19<br />
Exemplo 21 - Construção de pPML7789, um Plasmídeo que Expressa a<br />
Proteína de Hemaglutinina H5/ VN1194 em células de mamífero<br />
Uma outra construção, pPML7789, capaz de expressar a<br />
Proteína de Hemaglutinina H5/ VN1194 utilizando um promotor quimérico<br />
5 da invenção foi gerado.<br />
A construção pPJV7563 descrita no Exemplo 5 foi usada como<br />
a cadeia principal para a construção pPML7789.<br />
Um plasmídeo que abriga a seqüência codificadora para o gene<br />
HA de H5/VN1194 foi usado como o padrão para a PCR. Os iniciadores de<br />
10 PCR foram planejados com sítios nas extremidades cinco e três do iniciador<br />
para permitir a inserção no pPJV7563. O pPJV7563 foi cortado com Nhel e<br />
Bsp120I para gerar um fragmento de vetor. O fragmento de PCR amplificado<br />
a partir do padrão H5/VN1194 foi cortado com as mesmas enzimas para gerar<br />
um fragmento de inserto. Estes dois fragmentos foram ligados para produzir<br />
15 pPML7789. As seqüências codificadoras e flanqueadoras foram verificadas<br />
pelo seqüenciamento.<br />
As posições de nucleotídeo dos vários elementos em<br />
pPML7789 são indicados na Tabela 9 abaixo.
150<br />
Tabela 9: Componentes de construção pPML7789<br />
Posição de Nucleotídeo Elemento<br />
Início: 1 Fim: 44 Tn903, remanescentes de pUC4K<br />
Início: 45 Fim: 860 KanR (Tn903)<br />
Início: 861 Fim: 896 Tn903, remanescentes de pUC4K<br />
Início: 897 Fim: 902 pUC19 MCS<br />
Início: 903 Fim: 1587 CMV Pro<br />
Início: 1588 Fim: 1718 Exon 1/2 de CMV<br />
Início: 1719 Fim: 1724 Fusão Bam/Bgl<br />
Início: 1725 Fim: 1857 Ins IntA de Rato<br />
Início: 1858 Fim: 1863 Sítio BamHl<br />
Início: 1864 Fim: 1984 UTR 5' de HBV pre-S2<br />
Início: 1985 Fim: 1993 ATG-Nhe<br />
Início: 1994 Fim: 3699 VN1194H5<br />
Início: 3700 Fim: 3705 Sítio Bsp120I<br />
Início: 3706 Fim: 4238 HBVenh<br />
Início: 4239 Fim: 4249 Seqüência ligadora desconhecida<br />
Início: 4250 Fim: 4380 rGlob pA<br />
Início: 4341 Fim: 4341 Sítio PoliA<br />
Início: 4381 Fim: 4386 Sítio EcoR1<br />
Início: 4387 Fim: 5453 pUC19<br />
Exemplo 22. Respostas imunes celulares protetoras potentes geradas pela<br />
5 Vírus<br />
imunização de DNA com HSV-2 ICP27 e toxina instável ao calor de E. coli<br />
Materiais e Métodos<br />
Os vírus HSV-2 (cepa MS, ATCC VR-540 e cepa HG52 G<br />
presentes de Nancy Sawtell, University of Cincinnati) foram cultivados em<br />
células VERO (ATCC CCL-81) e purificados em gradientes de sacarose antes<br />
do uso.<br />
10 Vacina de DNA e vetores DEI<br />
O plasmídeo que codifica ICP27 do HSV-2 (Fig. 27) foi<br />
gerado pela inserção de um fragmento de PCR que incorpora o gene ICP27<br />
inteiro (UL54) no pTarget (Promega, Madison WI). O fragmento de PCR foi<br />
amplificado a partir de DNA genômico purificado da cepa MS de HSV-2<br />
15 usando iniciadores 5' (GCCACTCTCTTCCGACAC, SEQ ID NO: 63) e 3'<br />
(CAAGAACATCACACGGAAC, SEQ ID NO: 64). As seqüências<br />
amplificadas correspondem aos nucleotídeos 114,523 a 116,179 da seqüência
151<br />
de genoma publicada do clone HG52 de HSV-2 (número de acesso no<br />
GenBank NC 001798). O pICP27 foi seqüenciado na sua totalidade pela<br />
DNA Sequencing Core Facility na University of Wisconsin, Madison.<br />
O plasmídeo PJV2012 codifica tanto a subunidade A quanto B<br />
5 de LT a partir de um vetor único e é mostrado na Figura 22. A construção de<br />
pPJV2012 é descrita no Exemplo 19. Em pPJV2012, o gene da subunidade A<br />
de LT é expressado a partir de uma unidade de transcrição consistindo dos<br />
seguintes componentes: o promotor inicial imediato de citomegalovírus<br />
humano (hCMV), exons 1 e 2 fundidos de hCMV (não codificador), intron A<br />
10 da insulina de rato, região não codificadora 5' do gene pre-S2 do vírus da<br />
hepatite B (HBV), códon ATG, seqüência de peptídeo de sinal codificadora<br />
de lisozima, seqüência codificadora da subunidade LT A, região realçadora<br />
transcricional do HBV não codificadora 3', e a seqüência de poliadenilação de<br />
beta globina de coelho.<br />
15 pPJV2012 também codifica o produto da subunidade LT B de<br />
uma segunda unidade de transcrição que funciona na direção oposta (Figura<br />
22). A unidade de transcrição LT B é similar àquela que codifica o produto<br />
LT A mas não contém cópias adicionais do hCMV e elementos realçadores<br />
transcricionais de HBV. Os elementos realçadores de hCMV e HBV<br />
20 localizados na unidade de transcrição LT A também serve a unidade de<br />
transcrição LT B.<br />
O plasmídeo PJV2013 (não mostrado) é similar a pPJV2012<br />
mas codifica os produtos tanto da subunidade A quanto da B de toxina do<br />
cólera de um vetor único. O mapa funcional de pPJV2013 é idêntico àquele<br />
25 mostrado para pPJV2012 na Figura 22.<br />
A vacinação de DNA por intermédio da liberação epidérmica mediada por<br />
partícula (PMED)<br />
A vacinação de DNA na PMED de camundongos Balb/c<br />
fêmeas de 6 a 8 semanas de idade foi como anteriormente descrito (Arrington
152<br />
et al, J. Virol. 76, 4536-4546, 2002) exceto que cada imunização consistiu de<br />
uma liberação em PMED única à pele abdominal ventral em que cada<br />
liberação conteve 0,5 mg de ouro revestido com um total de 0,5 gg da vacina<br />
de DNA / formulação de vetor DEI. Duas de tais imunizações de "tiro único"<br />
5 foram administradas 4 semanas separadamente e os animais foram<br />
sacrificados ou inoculados 2 semanas seguintes à segunda imunização ou de<br />
"reforço".<br />
Reuniões de peptídeo e peptídeos<br />
A seqüência de aminoácido derivada para ICP27 do vírus da<br />
10 cepa MS foi usada como um padrão para a biblioteca. A proteína ICP27 é<br />
altamente conservada entre a seqüência HG52 e MS (ver a Figura 28 e a SEQ<br />
ID NO: 65) assim a biblioteca seria capaz de detectar respostas para ambas as<br />
cepas. Uma biblioteca de peptídeo foi sintetizada (Mimotopes, Fisher<br />
Scientific) para transpor a seqüência inteira de ICP27 usando peptídeos de 18<br />
15 aminoácidos no comprimento que tiveram uma sobreposição de 11<br />
aminoácidos com o peptídeo adjacente. Um total de 72 peptídeos foram<br />
fabricados.<br />
Para facilitar a identificação de peptídeos positivos a biblioteca<br />
foi dividida em reuniões de peptídeo usando a estratégia descrita por Tobery<br />
20 et al J. Immunol. Methods 254, 59-66, 2001. As reuniões de peptídeo foram<br />
geradas usando o padrão mostrado na Tabela 10. Houve 12 reuniões<br />
(chamadas C 1-C12) com 6 peptídeos por reunião e 6 reuniões (R1-R6) com<br />
12 peptídeos por reunião. Os peptídeos contendo reuniões #45 e #46 estão em<br />
negrito.<br />
25 Tabela 10: Composições de Reunião de Peptídeo<br />
Cl C2 C3 C4 C5 C6 C7 C8 C9 CIO<br />
RI 1 3 5 7 9 11 13 15 17 19<br />
R2 25 27 29 31 33 35 37 39 41 43<br />
R3 49 51 53 55 57 59 61 63 65 67<br />
R4 4 6 8 10 12 14 16 18 20 22<br />
R5 28 30 32 34 36 38 40 42 44 46<br />
R6 52 54 56 58 60 62 64 66 68 70
C11 C12<br />
R1 21 23<br />
R2 45 47<br />
R3 69 71<br />
R4 24 26<br />
R5 48 50<br />
R6 72 2<br />
Ensaios de ELISPOT<br />
153<br />
Os ensaios de ELISPOT IFN-y foram realizadas em<br />
esplenócitos frescos e as células de linfonodo como anteriormente descrito<br />
exceto os antígenos para a estimulação foram peptídeos únicos ou reuniões de<br />
5 peptídeo como definido para cada experimento na seção resultados. Em<br />
alguns exemplos, antes do ensaio ELISPOT, as populações de célula T foram<br />
esgotadas pelas pérolas magnéticas (Dynal) que seguem as instruções do<br />
fabricante.<br />
Ensaios de série de pérola citométrica (CBA)<br />
10 Esplenócitos frescos foram coletados duas semanas a seguir da<br />
segunda imunização e recolocados em suspensão a 1 x 10 7 células por ml em<br />
SM (meio RPMI + 10% de soro bovino fetal suplementado com MEM<br />
piruvato de sódio, aminoácidos não essenciais e 2-mercaptoetanol (Invitrogen,<br />
Carlsbad, CA)). As amostras de célula foram plaqueadas a 1 x 10 6 células<br />
15 (100 1_11) por reservatório em placas de fundo chato de 96 reservatórios. Os<br />
esplenócitos foram tratados com alíquotas de 100 vil do peptídeo ICP27 em<br />
SM ou apenas meio. A concentração de peptídeo final foi de 10 -8 M. Os<br />
esplenócitos de controle de animais ingênuos foram também plaqueados com<br />
e sem peptídeo e com e sem Con-A (concentração final de 2,5 mg/ml) para<br />
20 servir como controles negativo e positivo, respectivamente.<br />
As placas foram incubadas a 37° C por 48 horas e depois 160<br />
gl de cada amostra foram coletados e armazenados a -20° C até ensaiados<br />
usando o kit BD Cytometric Bead Array (CBA) Mouse Thl/Th2 (BD<br />
Biosciences, San Jose, CA (cat. #551287)). Em resumo, este kit usa 5
154<br />
populações de pérola com intensidades de fluorescência distintas revestidas<br />
com anticorpos de captura específicos para IL-2, IL-4, IL-5, INF-y, e TNF-a<br />
de camundongo. As cinco populações de pérola são misturadas juntas para<br />
formar a série que é resolvida no canal FL3 do citômetro de fluxo BD<br />
5 FACSCalibur. As pérolas de captura de citocina são misturadas com os<br />
anticorpos de detecção conjugados a PE e depois incubados com padrões ou<br />
amostras de teste para formar complexos intercalados. O Software de análise<br />
BD CBA foi usado para gerar os resultados depois da aquisição da amostra. A<br />
intensidade da amostra para cada citocina é comparada com as curvas padrão<br />
10 para facilitar a quantificação de concentrações de citocina. As amostras foram<br />
conduzidas puras ou em uma diluição de 1:10 de acordo com as instruções do<br />
fabricante.<br />
Inoculação de vírus do HSV-2<br />
Os camundongos Balb/c anestesiados foram intranasalmente<br />
15 inoculados com 30 pl de PBS contendo aproximadamente 50LD 50 (2 x 10 6<br />
depois da infecção e classificados quanto a morbidez e mortalidade. A<br />
morbidez foi classificada em uma escala de O a 4 de acordo com o seguinte<br />
programa: 4, saudável; 3, pelo eriçado, espirrando; 2, feridas nos olhos ou<br />
20 anca, movimento reduzido; 1, encurvado, pouco movimento; 0, morto. Os<br />
camundongos que foram tratados com anticorpos monoclonais específicos de<br />
IFN-y (Bioscience, San Diego, CA (cat. # 16-7311) e/ou de TNF-a (cat. # 16-<br />
7332) perto do tempo de inoculação receberam injeções intraperitoneais<br />
contendo 90 lig de anticorpo nos dias -2, 0, 2, 4, 6, e 8 em relação à<br />
25 inoculação viral. Nos experimentos de esgotamento de célula T, os<br />
camundongos receberam injeções intraperitoneais contendo 200 lig de<br />
anticorpo específico para as populações de CD4 ou CD8 nos dias -2 e O em<br />
relação à inoculação viral (Functional Grade purified anti-mouse CD4,<br />
eBioscience Cat#: 16-0041; Functional Grade purified anti-mouse CD8,<br />
PFU) da cepa MS do HSV. Os camundongos foram seguidos por 20 dias
eBioscience; Cat#: 16-0081).<br />
Resultados<br />
155<br />
Identificação de um epítopo CD8 forte em camundongos Balb/c.<br />
Para identificar respostas de célula T contra a proteína ICP27,<br />
5 um ensaio ELISPOT de IFN-y foi realizado nas células recuperadas de<br />
camundongos Balb/c e C57B1/6 infectadas com uma cepa atenuada de HSV-2<br />
(HG52 cepa G). Uma biblioteca de peptídeo composta de peptídeos que<br />
transpõem o comprimento inteiro da seqüência codificadora ICP27 foi usada<br />
para estimular as células T. Os peptídeos foram 18 aminoácidos no<br />
10 comprimento e peptídeos vizinhos sobrepostos por 11 aminoácidos. As<br />
reuniões de peptídeo foram compostas de cada 6 peptídeos (Reuniões C 1-<br />
C12) ou 12 peptídeos (Reuniões R1-R6) como descrito em Materials and<br />
Methods e Tabela 10, uma configuração que facilitou a identificação de<br />
peptídeos positivos dentro da biblioteca. As células de baço e linfonodo<br />
15 recuperadas de camundongos Balb/c 7 dias depois da infecção mostraram<br />
respostas muito fortes aos peptídeos dentro das reuniões C10, C11, R2 e R5<br />
(Figura 29A) com respostas mais fracas em diversas outras reuniões. apenas<br />
respostas fracas foram detectadas nas células recuperadas de camundongos<br />
C57B1/6. O padrão de respostas positivas foi descoberto ser similar nas<br />
20 populações de célula do baço e linfonodo ensaiadas.<br />
Com base nos resultados de ELISPOT de IFN-y, dois<br />
peptídeos adjacentes (#45, #46) foram prognosticados conter o epítopo de<br />
célula T dominante. Isto foi confirmado testando-se cada peptídeo<br />
individualmente (dados não mostrados). Os peptídeos 45 e 46 estimularam<br />
25 secreção de IFN-y forte e contiveram uma seqüência homóloga de nove<br />
aminoácidos HGPSLYRTF (Fig 29B, SEQ ID NO: 68) que é prognosticada<br />
para ligar o alelo Dd. De maneira interessante, o peptídeo 46 também contêm<br />
uma região que corresponde a um epítopo previamente descrito em<br />
camundongos Balb/c para ICP27 de HSV-1 (Banks et al, J. Virol. 67, 613-
156<br />
616, 1993). A comparação de seqüências ICP27 no HSV-1 e HSV-2 mostrou<br />
que a região difere em um único aminoácido; o resíduo de alanina (A) no<br />
ICP27 de HSV-2 (LYRTFAANPRA, SEQ ID NO: 69) é substituído por uma<br />
glicina (G) no HSV-1 (LYRTFAGNPRA, SEQ ID NO: 70). A região,<br />
5 entretanto, não está presente no peptídeo 45 embora este peptídeo estimule<br />
uma resposta extremamente forte.<br />
Para determinar a importância relativa dos dois epítopos<br />
potencial no peptídeo 46 no ensaio de IFN-y ELISPOT, os peptídeos<br />
LYRTFAANPRA e o HGPSLYRTF foram sintetizados e testado. As células<br />
10 de baço isoladas de camundongos infectados responderam fortemente ao<br />
peptídeo HGPSLYRTF, mas nenhuma resposta acima do fundo foi detectada<br />
para a seqüência LYRTFAANPRA. Usando pérolas magnéticas para esgotar<br />
as populações de célula T antes do ensaio de IFN-y ELISPOT, resultou em<br />
uma resposta de CD8+ ICP27 forte. Os dados indicam que uma resposta de<br />
15 CD8 forte é gerada em camundongos Balb/c contra a proteína ICP27 do HSV-<br />
2 que é específica para a seqüência HGPSLYRTF.<br />
Respostas imunes in vitro para a vacina ICP27<br />
Uma vacina de DNA, "pICP27", foi gerada usando seqüências<br />
ICP27 da cepa MS de HSV-2 (Fig. 27). A construção seqüenciada teve apenas<br />
20 duas diferenças de nucleotídeo da seqüência de gene de HG52 ICP27<br />
publicada (Figura 28). Houve uma mudança de G para A no nucleotídeo 57<br />
que pode ser silenciosa, e uma mudança de A para C no 484 pode mudar uma<br />
lisina na cepa HG52 para uma asparagina na versão MS. Assim, a proteína<br />
ICP27 cepa MS expressada da vacina de DNA podem ser quase idênticos à<br />
25 versão da cepa HG52 da proteína sem nenhuma diferença na região do<br />
epítopo CD8 putativo.<br />
A vacina de DNA de pICP27 foi usada para imunizar<br />
camundongos Balb/c e C57B1/6 pela PMED. As células de esplenócitos e<br />
linfonodos foram testadas no ensaio IFN-y ELISPOT contra o painel de
157<br />
reuniões descrito na Figura 29. O padrão de respostas positiva para os<br />
peptídeos ICP27 encontrados nos camundongos imunizados com DNA foram<br />
os mesmos como aqueles encontrados nos camundongos infectados (dados<br />
não mostrados).<br />
5 Respostas in vivo para a vacina ICP27<br />
A atividade in vivo de respostas imunes geradas pela<br />
vacinação de DNA de pICP27 foi estudada em um modelo de infecção<br />
intranasal profilática em camundongos Balb/c. A infecção com várias doses<br />
da cepa MS de HSV-2 em camundongos Balb/c de 12 semanas de idade<br />
10 estabeleceu uma LD 50 de aproximadamente 3 x 10 4 PFU (dados não<br />
mostrados). Em experimentos de proteção de DNA, uma dose de inoculação<br />
virai de 50 LD 50 foi usada porque esta dose consistentemente resultou em<br />
100% de mortalidade em animais ingênuos.<br />
Uma série de experimentos mostrou que a imunização com<br />
15 DNA de pICP27 sozinho (iniciador e reforço) teve capacidade limitada para<br />
proteger camundongos. Portanto, para melhorar a proteção vetores DEI que<br />
codificam a toxina do cólera (CT) ou a toxina instável ao calor de E. coli (LT)<br />
foram co-liberadas com a vacina de DNA ICP27. As subunidades de toxina A<br />
e B foram expressadas a partir do mesmo plasmídeo para cada uma das duas<br />
20 toxinas.<br />
Os camundongos foram imunizados com a vacina de DNA de<br />
ICP27, sozinha, ou suplementada com vetores CT ou LT DEI a uma razão de<br />
9:1 (0,45 gg de DNA antígeno + 0,05 pg de DNA de vetor DEI). Um total de<br />
16 animais por grupo de imunização foram utilizados, metade dos quais foram<br />
25 inoculados com vírus e a outra metade sacrificada no momento da inoculação<br />
para a produção de citocina específica de ICP27.<br />
Os resultados deste estudo são mostrados na Figura 31. Os<br />
resultados mostram que a imunização com as formulações ICP27 + CT e<br />
apenas ICP27 forneceram proteção parcial e nenhuma proteção,
158<br />
respectivamente, ao passo que 100% de proteção foi observada para a<br />
formulação de ICP27 + LT (Figura 31 A). Estes resultados confirmam que a<br />
co-liberação de vetores DEI com o vetor ICP27 realçam a proteção e reforçam<br />
a superioridade de LT em relação a CT como um imunoestimulador na<br />
5 imunização de DNA. A quantificação da produção de citocina que segue a<br />
estimulação in vitro com o peptídeo de epítopo CD8 usando o kit CBA<br />
demonstrou uma boa correlação entre a sobrevivência na inoculação e os<br />
níveis da produção tanto de INF-y (Figura 31 B) quanto de TNF-a (Figura<br />
31C).<br />
10 O papel de citocinas e populações de célula T<br />
O papel da produção específica de ICP27 de IFN-y ou TNF-a<br />
na proteção de animais inoculados foi avaliada. Os animais vacinados com<br />
pICP27 + pPJV2012 (LT) foram tratados com anticorpos monoclonais<br />
específicos para INF-y e/ou TNF-a por diversos dias próximos do momento<br />
15 da inoculação para neutralizar estas citocinas in vivo. Os dados de morbidez<br />
são mostrados na Figura 32. Como antes, os animais que receberam duas<br />
vacinações ICP27 + LT DEI foram completamente protegidos da inoculação e<br />
exibiram apenas uma morbidez transitória branda (eriçamento do pelo em 1<br />
de 4 animais) enquanto 100% de camundongos ingênuos ou camundongos<br />
20 imunizados apenas com o vetor pICP27 sucumbiram à inoculação. Nos<br />
grupos imunizados com a formulação ICP27 + LT DEI e subseqüentemente<br />
tratado com anti-TNF-a, uma morte foi observada imediatamente depois da<br />
inoculação intranasal devido a complicações da anestesia. Importantemente,<br />
os três camundongos remanescentes mostraram apenas eriçamento do pelo<br />
25 transitório e recuperaram completamente indicando que a produção de TNF-a<br />
provavelmente não contribui significantemente para a proteção. Ao contrário,<br />
os dois grupos de camundongos imunizados com ICP27+LT DEI que<br />
receberam anti-IFN-y ou anti-IFN-y + anti-TNF-a no momento da inoculação<br />
tornaram-se intensamente mórbidos e 7 de 8 animais morreram,
159<br />
demonstrando claramente a importância de IFN-y como um mediador<br />
essencial de proteção.<br />
Para examinar o papel das populações CD4 e CD8 na<br />
proteção, anticorpos para CD4 ou CD8 foram usados para esgotar estas<br />
5 populações antes da inoculação infecciosa (Fig. 33). Quando camundongos<br />
foram seguidos quanto a mortalidade em 20 dias um padrão interessante<br />
surgiu. Como esperado, os camundongos administrados com pICP27 com<br />
vetor vazio não foram significantemente protegidos da infecção. A vacinação<br />
com pICP27+LT DEI forneceu 100% de sobrevivência, ao passo que, a<br />
10 remoção das células tanto CD4 quanto CD8 de camundongos similarmente<br />
imunizados anulou os efeitos protetores de vacinação e tornou os<br />
camundongos suscetíveis a cerca do mesmo nível como camundongos<br />
ingênuos. Em camundongos imunizados com a vacina pICP27+LT DEI, o<br />
esgotamento da população CD8 antes da infecção fazendo com que os<br />
15 camundongos sucumbissem à infecção indicando um papel importante destas<br />
células na proteção da infecção ou encefalite. Nos camundongos vacinados<br />
com pICP27+LT DEI, o esgotamento da população CD4 introduziu uma<br />
demora de nove dias (em relação aos camundongos ingênuos) antes que estes<br />
camundongos também se tornassem doentes e morressem, sugerindo um<br />
20 papel para as células T CD4 para a sobrevivência de longa duração.<br />
Exemplo 23: Imunogenicidade da vacina de DNA H5N1 da Influenza em<br />
camundongos<br />
Materiais e Métodos<br />
O DNA plasmídico pPML7789 (Exemplo 21, Figura 20) que<br />
25 codifica o vírus FIA da Influenza A/Vietnam/1194/2004 [H5N1] foi<br />
precipitado sobre partículas de ouro e liberadas a camundongos pela liberação<br />
epidérmica mediada por partícula (PMED) usando a tecnologia de liberação<br />
patenteada da PowderMed. A liberação foi efetuada com ou sem, como um<br />
adjuvante, um plasmídeo pPJV2012 adicional (Exemplo 19, Figura 22) que
160<br />
codifica as subunidades A e B da toxina instável ao calor da E. coli. Quando<br />
pPJV2012 está presente, este plasmídeo adicional e o plasmídeo pPML7789<br />
foram precipitados sobre as mesmas partículas de ouro. Isto foi obtido pré<br />
misturando-se primeiro pPJV2012 e pPML7789 na forma líquida na relação<br />
5 em peso de 1:9 e depois co-precipitando os plasmídeos sobre uma população<br />
de partículas de ouro. Como um controle negativo, as partículas de ouro nas<br />
quais nenhum plasmídeo foi precipitado foram liberadas pelo PMED. Os<br />
camundongos foram como segue:<br />
10 Número: 36<br />
Cepa: camundongos Balb/C<br />
Gênero: Fêmea<br />
Faixa de peso: 15,0 a 19,6 g (no dia do primeiro procedimento)<br />
Idade: 42 a 49 dias (no dia da chegada)<br />
Dieta: RM1 pelotizada<br />
15 Fornecedor: Charles River UK Ltd<br />
Os camundongos foram divididos em seis grupos como<br />
mostrado na Tabela 11 abaixo. Os procedimentos realizados nos<br />
camundongos e os dias em que os procedimentos ocorreram são mostrados na<br />
Tabela 12 abaixo. Um ensaio HAI foi realizado nos soros de acordo com<br />
20 procedimentos padrão.
161<br />
Tabela 11: Designação de Grupo de Tratamento para os Animais<br />
Grupo<br />
#<br />
Via de<br />
administração<br />
# de animais em<br />
cada grupo<br />
1 Epidermicamente 6<br />
2 Epidermicamente 6<br />
3 Epidermicamente 6<br />
4 Epidermicamente 6<br />
5 Epidermicamente 6<br />
6 Epidermicamente 6<br />
Tratamento<br />
Controle Negativo<br />
1 dose<br />
Sangria Dia -1, sangria e separação<br />
Dia 14<br />
Controle Negativo<br />
2 doses<br />
Sangria Dia —1 e 21, sangria e<br />
separação Dia 36<br />
pPML7789<br />
1 dose<br />
Sangria Dia —1, sangria e separação<br />
Dia 14<br />
pPML7789<br />
2 doses<br />
Sangria Dia —1 e 21, sangria e<br />
separação Dia 36<br />
pPML7789 + pPJV2012<br />
1 dose<br />
Sangria Dia —1, sangria e separação<br />
Dia 14<br />
pPML7789 + pPJV2012<br />
2 doses<br />
Sangria Dia —1 e 21, sangria e<br />
separação Dia 36<br />
Tabela 12: Os Seguintes Procedimentos foram Realizados nos Dias<br />
Marcados X<br />
Dia do estudo O 14 21 35<br />
Implante de transponder X<br />
Peso do corpo X X Xb Xb<br />
Vacinação X Xb<br />
Classificação da saúde X X Xb Xb<br />
Soro para anticorpo X X' X" Xb<br />
Coleta de baços Xa Xb<br />
Culling X' X b<br />
a Grupos 1, 3 & 5 apenas<br />
5 b Grupos 2, 4 & 6 apenas<br />
Resultados<br />
Os títulos HAI contra o vírus NIBRG-14 [H5N11 foram determinados<br />
Todos os controles foram observados estar dentro dos limites<br />
aceitáveis. O artigo de controle negativo (vírus NIBRG-14 [H5N1]) foi<br />
10 negativo em todas as placas. O artigo de controle positivo (células sangüíneas<br />
vermelhas de peru) foi positivo em todas as placas. O segundo artigo de
162<br />
controle positive (soro contendo anticorpos para vírus da Influenza<br />
A/Galinha/Scotland/59 [H5N1]) conduzido em todas as placas a uma média<br />
geométrica de 28, 40, 56 ou 80 HAIU (dentro de limites aceitáveis de 40<br />
HAIU +/- 2 vezes).<br />
5 Todas as amostras nos dias 0, 14 e 21 foram
163<br />
Conseqüentemente, novas construções de ácido nucleico,<br />
composições que compreendem várias construções, e técnicas de imunização<br />
com ácido nucleico usando estas construções foram descritos. Embora as<br />
formas de realização preferidas da presente invenção fossem descritas em<br />
5 alguns detalhes, é entendido que variações podem ser feitas sem divergir do<br />
espírito e do escopo da invenção.
1<br />
LISTAGEM DAS SEQÜÊNCIAS<br />
POWDERJECT VACCINES, INC;<br />
POWDERMED LIMITED<br />
CONSTRUÇÕES DE ÁCIDO NUCLEICO<br />
N93730C GCW<br />
UK 0507997.5<br />
2005-04-20<br />
US 60/672,479<br />
2005-04-19<br />
US 60/648,382<br />
2005-02-01<br />
70<br />
Patentln versão 3.1<br />
1<br />
685<br />
DNA<br />
Citomegalovirus humano<br />
1<br />
aatattggct attggccatt gcatacgttg tatctatatc ataatatgta catttatatt 60<br />
ggctcatgtc caatatgacc gccatgttga cattgattat tgactagtta ttaatagtaa 120<br />
tcaattacgg ggtcattagt tcatagccca tatatggagt tccgcgttac ataacttacg 180<br />
gtaaatggcc cgcctggctg accgcccaac gacccccgcc cattgacgtc aataatgacg 240<br />
tatgttccca tagtaacgcc aatagggact ttccattgac gtcaatgggt ggagtattta 300<br />
cggtaaactg cccacttggc agtacatcaa gtgtatcata tgccaagtcc gccccctatt 360<br />
gacgtcaatg acggtaaatg gcccgcctgg cattatgccc agtacatgac cttacgggac 420<br />
tttcctactt ggcagtacat ctacgtatta gtcatcgcta ttaccatggt gatgcggttt 480<br />
tggcagtaca ccaatgggcg tggatagcgg tttgactcac ggggatttcc aagtctccac 540<br />
cccattgacg tcaatgggag tttgttttgg caccaaaatc aacgggactt tccaaaatgt 600<br />
cgtaataacc ccgccccgtt gacgcaaatg ggcggtaggc gtgtacggtg ggaggtctat 660<br />
ataagcagag ctcgtttagt gaacc 685<br />
2<br />
131<br />
DNA<br />
Citomegalovirus humano<br />
2<br />
gtcagatcgc ctggagacgc catccacgct gttttgacct ccatagaaga caccgggacc 60<br />
gatccagcct ccgcggccgg gaacggtgca ttggaacgcg gattccccgt gccaagagtg 120<br />
actcaccgtc c 131<br />
3<br />
135<br />
DNA<br />
Rattus rattus<br />
3<br />
atcagcaagc aggtatgtac tctccagggt gggcctggct tccccagtca agactccagg 60<br />
gatttgaggg acgctgtggg ctcttctctt acatgtacct tttgctagcc tcaaccctga 120<br />
ctatcttcca ggtca 135<br />
4<br />
955<br />
DNA<br />
Seqüência artificial<br />
<br />
Seqüência de promotor quimérica<br />
4<br />
aatattggct attggccatt gcatacgttg tatctatatc ataatatgta catttatatt 60<br />
ggctcatgtc caatatgacc gccatgttga cattgattat tgactagtta ttaatagtaa 120<br />
tcaattacgg ggtcattagt tcatagccca tatatggagt tccgcgttac ataacttacg 180<br />
gtaaatggcc cgcctggctg accgcccaac gacccccgcc cattgacgtc aataatgacg 240<br />
tatgttccca tagtaacgcc aatagggact ttccattgac gtcaatgggt ggagtattta 300<br />
cggtaaactg cccacttggc agtacatcaa gtgtatcata tgccaagtcc gccccctatt 360<br />
gacgtcaatg acggtaaatg gcccgcctgg cattatgccc agtacatgac cttacgggac 420<br />
tttcctactt ggcagtacat ctacgtatta gtcatcgcta ttaccatggt gatgcggttt 480
2<br />
tggcagtaca ccaatgggcg tggatagcgg tttgactcac ggggatttcc aagtctccac 540<br />
cccattgacg tcaatgggag tttgttttgg caccaaaatc aacgggactt tccaaaatgt 600<br />
cgtaataacc ccgccccgtt gacgcaaatg ggcggtaggc gtgtacggtg ggaggtctat 660<br />
ataagcagag ctcgtttagt gaaccgtcag atcgcctgga gacgccatcc acgctgtttt 720<br />
gacctccata gaagacaccg ggaccgatcc agcctccgcg gccgggaacg gtgcattgga 780<br />
acgcggattc cccgtgccaa gagtgactca ccgtccggat ctcagcaagc aggtatgtac 840<br />
tctccagggt gggcctggct tccccagtca agactccagg gatttgaggg acgctgtggg 900<br />
ctcttctctt acatgtacct tttgcttgcc tcaaccctga ctatcttcca ggtca 955<br />
5<br />
121<br />
DNA<br />
Vírus de hepatite B<br />
5<br />
cagagtcagg ggtctgtatt ttcctgctgg tggctccagt tcaggaacag taaaccctgc 60<br />
tccgaatatt gcctctcaca tctcgtcaat ctccgcgagg actggggacc ctgtgacgaa 120<br />
c 121<br />
6<br />
57<br />
DNA<br />
Vírus de herpes simplex<br />
6<br />
ataagctgca ttgcgaacca ctagtcgccg tttttcgtgt gcatcgcgta tcacggc 57<br />
7<br />
48<br />
DNA<br />
Vírus de hepatite B<br />
7<br />
ctttgtacta ggaggctgta ggcataaatt ggtctgttca ccagcacc 48<br />
8<br />
533<br />
DNA<br />
Vírus de hepatite B<br />
8<br />
taacaaaaca aaaagatggg gttattccct aaacttcatg ggttacgtaa ttggaagttg 60<br />
ggggacattg ccacaagatc atattgtaca aaagatcaaa cactgtttta gaaaacttcc 120<br />
tgtaaacagg cctattgatt ggaaagtatg tcaaaggatt gtgggtcttt tgggctttgc 180<br />
tgctccattt acacaatgtg gatatcctgc cttaatgcct ttgtatgcat gtatacaagc 240<br />
taaacaggct ttcactttct cgccaactta caaggccttt ctaagtaaac agtacatgaa 300<br />
cctttacccc gttgctcggc aacggcctgg tctgtgccaa gtgtttgctg acgcaacccc 360<br />
cactggctgg ggcttggcca taggccatca gcgcatgcgt ggaacctttg tggctcctct 420<br />
gccgatccat actgcggaac tcctagccgc ttgttttgct cgcagccggt ctggagcaaa 480<br />
gctcatagga actgacaatt ctgtcgtcct ctcgcggaaa tatacatcgt ttc 533<br />
9<br />
158<br />
DNA<br />
Citomegalovírus de macaco<br />
9<br />
gtcagacaga cagacagtta tatgggctgg tccctataac tctgccattg taaccccata 60<br />
tagccagaca gttagcattg catctattga tgatgtacta atgtattgta acccccccta 120<br />
tgccattgtc taactgtact aatgtatgat attatacc 158<br />
10<br />
131<br />
DNA<br />
Oryctolagus cuniculus<br />
10<br />
gatctttttc cctctgccaa aaattatggg gacatcatga agccccttga gcatctgact 60<br />
tctggctaat aaaggaaatt tattttcatt gcaatagtgt gttggaattt tttgtgtctc 120<br />
tcactcggaa g 131<br />
11<br />
204<br />
DNA<br />
Citomegalovírus de macaco<br />
11
3<br />
atatatactc tatgttatac tctatgatat acaatatata ctcatgaaca ctatgtactt 60<br />
ggtgtatgac tcattattgt ctgggacttg gttgggactt ggttggttgg gaagaatgtt 120<br />
gtgcctgtac ttgtgctgtg ctgtggatct caataaatgt gactatgttc aaaacactaa 180<br />
gtgcccccgt gtcttcttta acta 204<br />
12<br />
163<br />
DNA<br />
Vírus de herpes simplex 2<br />
12<br />
gaagacgagc tctaagggag gggaggggag ctgggcttgt gtataaataa aaagacaccg 60<br />
atgttcaaaa atacacatga cttctggtat tgttttgcct tggtttttat ttgggggggg 120<br />
gggggcgtgt gactagaaaa acaaatgcag acatgtgcta acg 163<br />
13<br />
191<br />
DNA<br />
Papilomavírus tipo 16 humano<br />
13<br />
aattgttaca tataattgtt gtataccata acttactatt ttttcttttt tattttcata 60<br />
tataattttt ttttttgttt gtttgtttgt tttttaataa actgttatta cttaacaatg 12<br />
cgacacaaac gttctgcaaa acgcacaaaa cgtgcatcgg ctacccaact ttataaaaca 180<br />
tgcaaacagg c 191<br />
14<br />
3759<br />
DNA<br />
Seqüência artificial<br />
<br />
Vetor de expressão pJV<br />
<br />
Intron<br />
(1725)..(1857)<br />
Rat Ins IntA<br />
<br />
misc aspecto<br />
(1).(44)<br />
Tn903, pUC4K Restantes<br />
<br />
< .221> misc aspecto<br />
(861T.(896)<br />
Tn903, pUC4K Restantes<br />
<br />
misc aspecto<br />
(897T.(902)<br />
pUC19 MCS<br />
<br />
Sinal polyA<br />
(2556T.(2686)<br />
rGLOB pA<br />
<br />
Sitio polyA<br />
(2647T.(2647)<br />
Sitio_polyA_1<br />
<br />
promotor<br />
(903)..(1587)<br />
CMV Pro<br />
<br />
3'UTR<br />
(2012)..(2544)<br />
HBVenh<br />
<br />
5'UTR<br />
(1864)..(1984)<br />
5'-UTR of HBV pre-S2
4<br />
<br />
misc aspecto<br />
(1719)..(1724)<br />
Fusão Bam/Bgl<br />
<br />
misc aspecto<br />
(198)..(1987)<br />
ATG-Nhe<br />
<br />
misc aspecto<br />
(198)..(2011)<br />
CDS insertion site<br />
<br />
misc aspecto<br />
(254 -5-)..(2555)<br />
unknown<br />
<br />
exon<br />
(1588)..(1718)<br />
CMV Exon 1/2<br />
<br />
misc aspecto<br />
(2695)..(3759) -<br />
pUCl9<br />
<br />
misc_aspecto<br />
(45)..(860)<br />
Complemento KanR (Tn903)<br />
14<br />
ggcgtaatgc tctgccagtg ttacaaccaa ttaaccaatt ctgattagaa aaactcatcg 60<br />
agcatcaaat gaaactgcaa tttattcata tcaggattat caataccata tttttgaaaa 120<br />
agccgtttct gtaatgaagg agaaaactca ccgaggcagt tccataggat ggcaagatcc 180<br />
tggtatcggt ctgcgattcc gactcgtcca acatcaatac aacctattaa tttcccctcg 240<br />
tcaaaaataa ggttatcaag tgagaaatca ccatgagtga cgactgaatc cggtgagaat 300<br />
ggcaaaagct tatgcatttc tttccagact tgttcaacag gccagccatt acgctcgtca 360<br />
tcaaaatcac tcgcatcaac caaaccgtta ttcattcgtg attgcgcctg agcgagacga 420<br />
aatacgcgat cgctgttaaa aggacaatta caaacaggaa tcgaatgcaa ccggcgcagg 480<br />
aacactgcca gcgcatcaac aatattttca cctgaatcag gatattcttc taatacctgg 540<br />
aatgctgttt tcccggggat cgcagtggtg agtaaccatg catcatcagg agtacggata 600<br />
aaatgcttga tggtcggaag aggcataaat tccgtcagcc agtttagtct gaccatctca 660<br />
tctgtaacat cattggcaac gctacctttg ccatgtttca gaaacaactc tggcgcatcg 720<br />
ggcttcccat acaatcgata gattgtcgca cctgattgcc cgacattatc gcgagcccat 780<br />
ttatacccat ataaatcagc atccatgttg gaatttaatc gcggcctcga gcaagacgtt 840<br />
tcccgttgaa tatggctcat aacacccctt gtattactgt ttatgtaagc agacaggtcg 900<br />
acaatattgg ctattggcca ttgcatacgt tgtatctata tcataatatg tacatttata 960<br />
ttggctcatg tccaatatga ccgccatgtt gacattgatt attgactagt tattaatagt 1020<br />
aatcaattac ggggtcatta gttcatagcc catatatgga gttccgcgtt acataactta 1080<br />
cggtaaatgg cccgcctggc tgaccgccca acgacccccg cccattgacg tcaataatga 1140<br />
cgtatgttcc catagtaacg ccaataggga ctttccattg acgtcaatgg gtggagtatt 1200<br />
tacggtaaac tgcccacttg gcagtacatc aagtgtatca tatgccaagt ccgcccccta 1260<br />
ttgacgtcaa tgacggtaaa tggcccgcct ggcattatgc ccagtacatg accttacggg 1320<br />
actttcctac ttggcagtac atctacgtat tagtcatcgc tattaccatg gtgatgcggt 1380<br />
tttggcagta caccaatggg cgtggatagc ggtttgactc acggggattt ccaagtctcc 1440<br />
accccattga cgtcaatggg agtttgtttt ggcaccaaaa tcaacgggac tttccaaaat 1500<br />
gtcgtaataa ccccgccccg ttgacgcaaa tgggcggtag gcgtgtacgg tgggaggtct 1560<br />
atataagcag agctcgttta gtgaacc gtc aga tcg cct gga gac gcc atc cac<br />
Val Arg Ser Pro Gly Asp Ala Ile His<br />
1614<br />
1 5<br />
gct gtt ttg acc tcc ata gaa gac acc ggg acc gat cca gcc tcc gcg<br />
Ala Val Leu Thr Ser Ile Glu Asp Thr Gly Thr Asp Pro Ala Ser Ala<br />
1662<br />
10 15 20 25<br />
gcc ggg aac ggt gca ttg gaa cgc gga ttc ccc gtg cca aga gtg act<br />
Ala Gly Asn Gly Ala Leu Glu Arg Gly Phe Pro Val Pro Arg Val Thr<br />
1710
5<br />
30 35 40<br />
cac cgt cc ggatctcagc aagcaggtat gtactctcca gggtgggcct ggcttcccca 1768<br />
His Arg<br />
gtcaagactc cagggatttg agggacgctg tgggctcttc tcttacatgt accttttgct 1828<br />
tgcctcaacc ctgactatct tccaggtcag gatcccagag tcaggggtct gtattttcct 1888<br />
gctggtggct ccagttcagg aacagtaaac cctgctccga atattgcctc tcacatctcg 1948<br />
tcaatctccg cgaggactgg ggaccctgtg acgaacatgg ctagcgggcc cagatctggg 2008<br />
ccctaacaaa acaaaaagat ggggttattc cctaaacttc atgggttacg taattggaag 2068<br />
ttgggggaca ttgccacaag atcatattgt acaaaagatc aaacactgtt ttagaaaact 2128<br />
tcctgtaaac aggcctattg attggaaagt atgtcaaagg attgtgggtc ttttgggctt 2188<br />
tgctgctcca tttacacaat gtggatatcc tgccttaatg cctttgtatg catgtataca 2248<br />
agctaaacag gctttcactt tctcgccaac ttacaaggcc tttctaagta aacagtacat 2308<br />
gaacctttac cccgttgctc ggcaacggcc tggtctgtgc caagtgtttg ctgacgcaac 2368<br />
ccccactggc tggggcttgg ccataggcca tcagcgcatg cgtggaacct ttgtggctcc 2428<br />
tctgccgatc catactgcgg aactcctagc cgcttgtttt gctcgcagcc ggtctggagc 2488<br />
aaagctcata ggaactgaca attctgtcgt cctctcgcgg aaatatacat cgtttcgatc 2548<br />
tacgtatgat ctttttccct ctgccaaaaa ttatggggac atcatgaagc cccttgagca 2608<br />
tctgacttct ggctaataaa ggaaatttat tttcattgca atagtgtgtt ggaatttttt 2668<br />
gtgtctctca ctcggaagga attctgcatt aatgaatcgg ccaacgcgcg gggagaggcg 2728<br />
gtttgcgtat tgggcgctct tccgcttcct cgctcactga ctcgctgcgc tcggtcgttc 2788<br />
ggctgcggcg agcggtatca gctcactcaa aggcggtaat acggttatcc acagaatcag 2848<br />
gggataacgc aggaaagaac atgtgagcaa aaggccagca aaaggccagg aaccgtaaaa 2908<br />
aggccgcgtt gctggcgttt ttccataggc tccgcccccc tgacgagcat cacaaaaatc 2968<br />
gacgctcaag tcagaggtgg cgaaacccga caggactata aagataccag gcgtttcccc 3028<br />
ctggaagctc cctcgtgcgc tctcctgttc cgaccctgcc gcttaccgga tacctgtccg 3088<br />
cctttctccc ttcgggaagc gtggcgcttt ctcatagctc acgctgtagg tatctcagtt 3148<br />
cggtgtaggt cgttcgctcc aagctgggct gtgtgcacga accccccgtt cagcccgacc 3208<br />
gctgcgcctt atccggtaac tatcgtcttg agtccaaccc ggtaagacac gacttatcgc 3268<br />
cactggcagc agccactggt aacaggatta gcagagcgag gtatgtaggc ggtgctacag 3328<br />
agttcttgaa gtggtggcct aactacggct acactagaag aacagtattt ggtatctgcg 3388<br />
ctctgctgaa gccagttacc ttcggaaaaa gagttggtag ctcttgatcc ggcaaacaaa 3448<br />
ccaccgctgg tagcggtggt ttttttgttt gcaagcagca gattacgcgc agaaaaaaag 3508<br />
gatctcaaga agatcctttg atcttttcta cggggtctga cgctcagtgg aacgaaaact 3568<br />
cacgttaagg gattttggtc atgagattat caaaaaggat cttcacctag atccttttaa 3628<br />
attaaaaatg aagttttaaa tcaatctaaa gtatatatga gtaaacttgg tctgacagtt 3688<br />
accaatgctt aatcagtgag gcacctatct cagcgatctg tctatttcgt tcatccatag 3748<br />
ttgcctgact c 3759<br />
15<br />
42<br />
DNA<br />
Seqüência artificial<br />
<br />
Iniciador<br />
15<br />
ggaggatccg gacggtgagt cactcttggc acggggaatc cg 42<br />
16<br />
21<br />
DNA<br />
Seqüência artificial<br />
<br />
Iniciador<br />
16<br />
ggtgaatatg gctcataaca c . 21<br />
17<br />
23<br />
DNA<br />
Seqüência artificial<br />
<br />
Iniciador<br />
17<br />
ccgccgaaca tggagaacat cgc 23<br />
18
6<br />
33<br />
DNA<br />
Seqüência artificial<br />
<br />
Iniciador<br />
18<br />
cacagatctt ttgttagggt ttaaatgtat acc 33<br />
19<br />
29<br />
DNA<br />
Seqüência artificial<br />
<br />
Iniciador<br />
19<br />
ggaggatcct gacctggaag atagtcacc 29<br />
20<br />
26<br />
DNA<br />
Seqüência artificial<br />
<br />
Iniciador<br />
20<br />
ggaggatcca tcagcaagca ggtatg 26<br />
21<br />
33<br />
DNA<br />
Seqüência artificial<br />
<br />
Iniciador<br />
21<br />
ggagctagcg ggcgtttgac ctccggcgtc ggg 33<br />
22<br />
37<br />
DNA<br />
Seqüência artificial<br />
<br />
Iniciador<br />
22<br />
ggagaattca gatctcctct agtaaaacaa tggctgg 37<br />
23<br />
25<br />
DNA<br />
Seqüência artificial<br />
<br />
Iniciador<br />
23<br />
ggagctagcc ttctaaccga ggtcg 25<br />
24<br />
30<br />
DNA<br />
Seqüência artificial<br />
<br />
Iniciador<br />
24<br />
ggaagatctc cttactccag ctctatgctg 30<br />
25<br />
27<br />
DNA<br />
Seqüência artificial<br />
<br />
Iniciador<br />
25<br />
ggcgaattcc ttccgagtga gagacac 27
26<br />
43<br />
DNA<br />
Seqüência artificial<br />
<br />
Iniciador<br />
26<br />
ggagtataca tttaaagggc cctaacaaaa caaaaagatg ggg<br />
27<br />
31<br />
DNA<br />
Seqüência artificial<br />
<br />
Iniciador<br />
27<br />
ggagctagct cgtttacttt gaccaagaac g<br />
28<br />
36<br />
DNA<br />
Seqüência artificial<br />
<br />
Iniciador<br />
28<br />
ggaagatctc cttatttttg acaccagacc aactgg<br />
29<br />
29<br />
DNA<br />
Seqüência artificial<br />
<br />
Iniciador<br />
29<br />
ggagtcgacc tgtctgctta cataaacag<br />
30<br />
26<br />
DNA<br />
Seqüência artificial<br />
<br />
Iniciador<br />
30<br />
cgtaatgctc tgccagtgtt acaacc<br />
31<br />
20<br />
DNA<br />
Seqüência artificial<br />
<br />
Iniciador<br />
31<br />
gaaagatctc agcaagcagg<br />
32<br />
47<br />
DNA<br />
Seqüência artificial<br />
<br />
Iniciador<br />
32<br />
ggaggatcct gacctggaag atagtcaggg ttgaggcaag caaaagg<br />
33<br />
12<br />
DNA<br />
Seqüência artificial<br />
<br />
Iniciador<br />
33
ctagcgggcc ca 12<br />
34<br />
12<br />
DNA<br />
Seqüência artificial<br />
<br />
Iniciador<br />
34<br />
gatctgggcc cg 12<br />
35<br />
28<br />
DNA<br />
Seqüência artificial<br />
<br />
Iniciador<br />
35<br />
ggagctagca tcatcccagt tgaggagg 28<br />
36<br />
28<br />
DNA<br />
Seqüência artificial<br />
<br />
Iniciador<br />
36<br />
ggtagatctc ctcatgtctg ctcgaagc 28<br />
37<br />
29<br />
DNA<br />
Seqüência artificial<br />
<br />
Iniciador<br />
37<br />
ccaagctagc gacaaaactc acacatgcc 29<br />
38<br />
45<br />
DNA<br />
Seqüência artificial<br />
<br />
Iniciador<br />
38<br />
ggaagatctc gtttacccct gtcatttacc cggagacagg gagag 45<br />
39<br />
57<br />
DNA<br />
Seqüência artificial<br />
<br />
Oligonucleotídeo<br />
39<br />
aagatgtcca gactctgtct ctccgtggcc ctcctcgtgc tcctcgggac actcgcc 57<br />
40<br />
24<br />
DNA<br />
Seqüência artificial<br />
<br />
Iniciador<br />
40<br />
ggaactagta agatgtccag actc 24<br />
41<br />
25<br />
DNA<br />
Seqüência artificial<br />
<br />
Iniciador
9<br />
41<br />
ggaagctagc ggcgagtgtc ccgag 25<br />
42<br />
75<br />
DNA<br />
Seqüência artificial<br />
<br />
Oligonucleotídeo<br />
42<br />
ggaaagatgg ccagcctctt tgccacattt ctcgtggtgc tcgtgagcct cagcctcgcc 60<br />
agcgaaagca gcgcc 75<br />
43<br />
24<br />
DNA<br />
Seqüência artificial<br />
<br />
Iniciador<br />
43<br />
ggaactagtg gaaagatggc cagc 24<br />
44<br />
26<br />
DNA<br />
Seqüência artificial<br />
<br />
Iniciador<br />
44<br />
ggaagctagc ggcgctgctt tcgctg 26<br />
45<br />
51<br />
DNA<br />
Seqüência artificial<br />
<br />
Oligonucleotídeo<br />
45<br />
aggtctttgc taatcttggt gctttgcttc ctgcccctgg ctgctctggg g 51<br />
46<br />
24<br />
DNA<br />
Seqüência artificial<br />
<br />
Iniciador<br />
46<br />
ggaactagta ggtctttgct aatc 24<br />
47<br />
25<br />
DNA<br />
Seqüência artificial<br />
<br />
Iniciador<br />
47<br />
ggaagctagc ccccagagca gccag 25<br />
48<br />
31<br />
DNA<br />
Seqüência artificial<br />
<br />
Iniciador<br />
48<br />
ggagctagct cgtttacttt gaccaagaac g 31<br />
49<br />
25<br />
DNA<br />
Seqüência artificial
1 0<br />
<br />
Iniciador<br />
49<br />
ggaagatctc cggtgagtgg tgctg<br />
25<br />
50<br />
32<br />
DNA<br />
Seqüência artificial<br />
<br />
Iniciador<br />
50<br />
gcaggatcca gtagacctgg agagaggaca ag 32<br />
51<br />
29<br />
DNA<br />
Seqüência artificial<br />
<br />
Iniciador<br />
51<br />
ggaagatcta caaggtgagc tgctgtggc 29<br />
52<br />
490<br />
DNA<br />
Vírus de pseudo raiva<br />
52<br />
tggccgcaga gcgggccggg catgcaaatc agaggcgcgc gggagacgcc tccgcgcgcc 60<br />
cattggcccg ggcgagccga gatggccgcc gcgggggccg gacatgcaaa gtagacgcga 120<br />
gaggaagtag ggagagaaat cccattggcc gtcgaggggc caagatggcg ccctcggggc 180<br />
cggacatgca aagtagacgc gagaggaagt gggcgagaga aatcccattg gccgtcgatg 240<br />
gggcaagatg gccgccgcgg gggccgggca tgcaaatggt cctcgcgagg aagttcctcg 300<br />
cgaaatccca ttggccggcg gccgccatct tgggccgggc atgcaaagca gacggcagag 360<br />
gaagcgggcg agaaaaatcc cattggccgg ccgtcgggga agtccgcggc gaaaatcggc 420<br />
cattggtccg cttacctggg ggcgggctct cctcggggcg cttataagcg cggtctccat 480<br />
cgtagcactt 490<br />
53<br />
495<br />
DNA<br />
Vírus de sarcoma Rous<br />
53<br />
ctgctccctg cttgtgtgtt ggaggtcgct gagtagtgcg cgagcaaaat ttaagctaca 60<br />
acaaggcaag gcttgaccga caattgcatg aagaatctgc ttagggttag gcgttttgcg 120<br />
ctgcttcgcg atgtacgggc cagatatacg cgtatctgag gggactaggg tgtgtttagg 180<br />
cgaaaagcgg ggcttcggtt gtacgcggtt aggagttccc tcaggatata gtagtttcgc 240<br />
ttttgcatag ggagggggaa atgtagtctt atgcaataca cttgtagtct tgcaacatgg 300<br />
taacgatgag ttagcaacat gccttacaag gagagaaaaa gcaccgtgca tgccgattgg 360<br />
tggaagtaag gtggtacgat cgtgccttat taggaaggca acagacaggt ctgacatgga 420<br />
ttggacgaac cactgaattc cgcattgcag agataattgt atttaagtgc ctagctcgat 480<br />
acaataaacg ccatt 495<br />
54<br />
5446<br />
DNA<br />
Seqüência artificial<br />
<br />
Gene de reistência a canamicina flanqueado por seqüências Tn903<br />
(1)..(896)<br />
<br />
Sítio de clonagem Sal I<br />
(897)..(902)<br />
<br />
Promotor CMV<br />
(903)..(1587)<br />
11<br />
Fusão 1/2 de exon CMV<br />
(1588)..(1718)<br />
<br />
Fusão Bam Hl/Bgl 2<br />
(1719)..(1724)<br />
<br />
Intron A de insulina de rato<br />
(1725)..(1857)<br />
<br />
Sítio de clonagem Bam Hl<br />
(1858)..(1863)<br />
<br />
Região pre S2 de não codificação de HBsAg<br />
(1864)..(1984)<br />
<br />
CDS<br />
(1985)..(3691)<br />
<br />
Nucleotídeo G de H3 Panama 3" UTR<br />
(3692)..(3692)<br />
<br />
Sítio de clonagem Bsp1201<br />
(3693)..(3698)<br />
<br />
Melhorador HBV<br />
(3699)..(4231)<br />
<br />
Região de poliadenilação de beta globina de coelho<br />
(4243)..(4373)<br />
<br />
Sítio de clonagem Eco RI<br />
(4374)..(4379)<br />
<br />
Seqüências da estrutura dorsal do vetor PUC 19<br />
(4380)..(5446)<br />
54<br />
ggcgtaatgc tctgccagtg ttacaaccaa ttaaccaatt ctgattagaa aaactcatcg 60<br />
agcatcaaat gaaactgcaa tttattcata tcaggattat caataccata tttttgaaaa 120<br />
agccgtttct gtaatgaagg agaaaactca ccgaggcagt tccataggat ggcaagatcc 180<br />
tggtatcggt ctgcgattcc gactcgtcca acatcaatac aacctattaa tttcccctcg 240<br />
tcaaaaataa ggttatcaag tgagaaatca ccatgagtga cgactgaatc cggtgagaat 300<br />
ggcaaaagct tatgcatttc tttccagact tgttcaacag gccagccatt acgctcgtca 360<br />
tcaaaatcac tcgcatcaac caaaccgtta ttcattcgtg attgcgcctg agcgagacga 420<br />
aatacgcgat cgctgttaaa aggacaatta caaacaggaa tcaaatgcaa ccggcgcagg 480<br />
aacactgcca gcgcatcaac aatattttca cctgaatcag gatattcttc taatacctgg 540<br />
aatgctgttt tcccggggat cgcagtggtg agtaaccatg catcatcagg agtacggata 600<br />
aaatgcttga tggtcggaag aggcataaat tccgtcagcc agtttagtct gaccatctca 660<br />
tctgtaacat cattggcaac gctacctttg ccatgtttca gaaacaactc tggcgcatcg 720<br />
ggcttcccat acaatcgata gattgtcgca cctgattgcc cgacattatc gcgagcccat 780<br />
ttatacccat ataaatcagc atccatgttg gaatttaatc gcggcctcga gcaagacgtt 840<br />
tcccgttgaa tatggctcat aacacccctt gtattactgt ttatgtaagc agacaggtcg 900<br />
acaatattgg ctattggcca ttgcatacgt tgtatctata tcataatatg tacatttata 960<br />
ttggctcatg tccaatatga ccgccatgtt gacattgatt attgactagt tattaatagt 1020<br />
aatcaattac ggggtcatta gttcatagcc catatatgga gttccgcgtt acataactta - 1080<br />
cggtaaatgg cccgcctggc tgaccgccca acgacccccg cccattgacg tcaataatga 1140<br />
cgtatgttcc catagtaacg ccaataggga ctttccattg acgtcaatgg gtggagtatt 1200<br />
tacggtaaac tgcccacttg gcagtacatc aagtgtatca tatgccaagt ccgcccccta 1260<br />
ttgacgtcaa tgacggtaaa tggcccgcct ggcattatgc ccagtacatg accttacggg 1320<br />
actttcctac ttggcagtac atctacgtat tagtcatcgc tattaccatg gtgatgcggt 1380<br />
tttggcagta caccaatggg cgtggatagc ggtttgactc acggggattt ccaagtctcc 1440<br />
accccattga cgtcaatggg agtttgtttt ggcaccaaaa tcaacgggac tttccaaaat 1500<br />
gtcgtaataa ccccgccccg ttgacgcaaa tgggcggtag gcgtgtacgg tgggaggtct 1560<br />
atataagcag agctcgttta gtgaaccgtc agatcgcctg gagacgccat ccacgctgtt 1620
12<br />
ttgacctcca tagaagacac cgggaccgat ccagcctccg cggccgggaa cggtgcattg 1680<br />
gaacgcggat tccccgtgcc aagagtgact caccgtccgg atctcagcaa gcaggtatgt 1740<br />
actctccagg gtgggcctgg cttccccagt caagactcca gggatttgag ggacgctgtg 1800<br />
ggctcttctc ttacatgtac cttttgcttg cctcaaccct gactatcttc caggtcagga 1860<br />
tcccagagtc aggggtctgt attttcctgc tggtggctcc agttcaggaa cagtaaaccc 1920<br />
tgctccgaat attgcctctc acatctcgtc aatctccgcg aggactgggg accctgtgac 1980<br />
gaac atg gct agc aag act atc att gct ttg agc tac att tta tgt ctg 2029<br />
Met Ala Ser Lys Thr Ile Ile Ala Leu Ser Tyr Ile Leu Cys Leu<br />
1 5 10 15<br />
gtt ttc gct caa aaa ctt ccc gga aat gac aac agc acg gca acg ctg 2077<br />
Val Phe Ala Gln Lys Leu Pro Gly Asn Asp Asn Ser Thr Ala Thr Leu<br />
20 25 30<br />
tgc ctg ggg cac cat gca gtg tca aac gga acg cta gtg aaa aca atc 2125<br />
Cys Leu Gly His His Ala Val Ser Asn Gly Thr Leu Val Lys Thr Ile<br />
35 40 45<br />
acg aat gac caa att gaa gtg act aat gct act gag ctg gtt cag agt 2173<br />
Thr Asn Asp Gln Ile Glu Val Thr Asn Ala Thr Glu Leu Val Gln Ser<br />
50 55 60<br />
tcc tca aca ggt aga ata tgc gac agt cct cac caa atc ctt gat gga 2221<br />
Ser Ser Thr Gly Arg Ile Cys Asp Ser Pro His Gln Ile Leu Asp Gly<br />
65 70 75<br />
gaa aac tgc aca cta ata gat gct cta ttg gga gac cct cat tgt gat 2269<br />
Glu Asn Cys Thr Leu Ile Asp Ala Leu Leu Gly Asp Pro His Cys Asp<br />
80 85 90 95<br />
ggc ttc caa aat aag gaa tgg gac ctt ttt gtt gaa cgc agc aaa gcc 2317<br />
Gly Phe Gln Asn Lys Glu Trp Asp Leu Phe Val Glu Arg Ser Lys Ala<br />
100 105 110<br />
tac agc aac tgt tac cct tat gat gtg ccg gat tat gcc tcc ctt agg 2365<br />
Tyr Ser Asn Cys Tyr Pro Tyr Asp Val Pro Asp Tyr Ala Ser Leu Arg<br />
115 120 125<br />
tca cta gtt gcc tca tcc ggc aca ctg gag ttt aac aat gaa agc ttc 2413<br />
Ser Leu Val Ala Ser Ser Gly Thr Leu Glu Phe Asn Asn Glu Ser Phe<br />
130 135 140<br />
aat tgg act gga gtc gct cag aat gga aca agc tct gct tgc aaa agg 2461<br />
Asn Trp Thr Gly Val Ala Gln Asn Gly Thr Ser Ser Ala Cys Lys Arg<br />
145 150 155<br />
aga tct aat aaa agt ttc ttt agt aga ttg aat tgg ttg cac caa tta 2509<br />
Arg Ser Asn Lys Ser Phe Phe Ser Arg Leu Asn Trp Leu His Gln Leu<br />
160 165 170 175<br />
aaa tac aaa tat cca gca ctg aac gtg act atg cca aac aat gaa aaa 2557<br />
Lys Tyr Lys Tyr Pro Ala Leu Asn Val Thr Met Pro Asn Asn Glu Lys<br />
180 185 190<br />
ttt gac aaa ttg tac att tgg ggg gtt ctc cac ccg agt acg gac agt 2605<br />
Phe Asp Lys Leu Tyr Ile Trp Gly Val Leu His Pro Ser Thr Asp Ser<br />
195 200 205<br />
gac caa atc agc cta tat gct caa gca tca ggg aga gtc aca gtc tct 2653<br />
Asp Gln Ile Ser Leu Tyr Ala Gln Ala Ser Gly Arg Val Thr Val Ser<br />
210 215 220<br />
acc aaa aga agc caa caa act gta atc ccg aat atc gga tct aga ccc 2701<br />
Thr Lys Arg Ser Gln Gln Thr Val Ile Pro Asn Ile Gly Ser Arg Pro<br />
225 230 235<br />
tgg gta agg ggt gtc tcc agc aga ata agc atc tat tgg aca ata gta 2749<br />
Trp Val Arg Gly Val Ser Ser Arg Ile Ser Ile Tyr Trp Thr Ile Val<br />
240 245 250 255<br />
aaa ccg gga gac ata ctt ttg att aac agc aca ggg aat cta att gct 2797<br />
Lys Pro Gly Asp Ile Leu Leu Ile Asn Ser Thr Gly Asn Leu Ile Ala<br />
260 265 270<br />
cct cgg ggt tac ttc aaa ata cga agt ggg aaa agc tca ata atg agg 2845<br />
Pro Arg Gly Tyr Phe Lys Ile Arg Ser Gly Lys Ser Ser Ile Met Arg<br />
275 280 285<br />
tca gat gca ccc att ggc aaa tgc aat tct gaa tgc atc act cca aat 2893<br />
Ser Asp Ala Pro Ile Gly Lys Cys Asn Ser Glu Cys Ile Thr Pro Asn<br />
290 295 300
13<br />
gga agc att ccc aat gac aaa cca ttt caa aat gta aac agg atc aca 2941<br />
Gly Ser Ile Pro Asn Asp Lys Pro Phe Gln Asn Val Asn Arg Ile Thr<br />
305 310 315<br />
tat ggg gcc tgt ccc aga tat gtt aag caa aac act ctg aaa ttg gca 2989<br />
Tyr Gly Ala Cys Pro Arg Tyr Val Lys Gln Asn Thr Leu Lys Leu Ala<br />
320 325 330 335<br />
aca ggg atg cgg aat gta cca gag aaa caa act aga ggc ata ttc ggc 3037<br />
Thr Gly Met Arg Asn Val Pro Glu Lys Gln Thr Arg Gly Ile Phe Gly<br />
340 345 350<br />
gca atc gcg ggt ttc ata gaa aat ggt tgg gag gga atg gtg gac ggt 3085<br />
Ala Ile Ala Gly Phe Ile Glu Asn Gly Trp Glu Gly Met Val Asp Gly<br />
355 360 365<br />
tgg tac ggt ttc agg cat caa aat tct gag ggc aca gga caa gca gca 3133<br />
Trp Tyr Gly Phe Arg His Gln Asn Ser Glu Gly Thr Gly Gln Ala Ala<br />
370 375 380<br />
gat ctt aaa agc act caa gca gca atc aac caa atc aac ggg aaa ctg 3181<br />
Asp Leu Lys Ser Thr Gln Ala Ala Ile Asn Gln Ile Asn Gly Lys Leu<br />
385 390 395<br />
aat agg tta atc gag aaa acg aac gag aaa ttc cat caa att gaa aaa 3229<br />
Asn Arg Leu Ile Glu Lys Thr Asn Glu Lys Phe His Gln Ile Glu Lys<br />
400 405 410 415<br />
gaa ttc tca gaa gta gaa ggg aga att cag gac ctc gag aaa tat gtt 3277<br />
Glu Phe Ser Glu Val Glu Gly Arg Ile Gln Asp Leu Glu Lys Tyr Val<br />
420 425 430<br />
gag gac act aaa ata gat ctc tgg tcg tac aac gcg gag ctt ctt gtt 3325<br />
Glu Asp Thr Lys Ile Asp Leu Trp Ser Tyr Asn Ala Glu Leu Leu Val<br />
435 440 445<br />
gcc ctg gag aac caa cat aca att gat cta act gac tca gaa atg aac 3373<br />
Ala Leu Glu Asn Gln His Thr Ile Asp Leu Thr Asp Ser Glu Met Asn<br />
450 455 460<br />
aaa ctg ttt gaa aga aca aag aag caa ctg agg gaa aat gct gag gat 3421<br />
Lys Leu Phe Glu Arg Thr Lys Lys Gln Leu Arg Glu Asn Ala Glu Asp<br />
465 470 475<br />
atg ggc aat ggt tgt ttc aaa ata tac cac aaa tgt gac aat gcc tgc 3469<br />
Met Gly Asn Gly Cys Phe Lys Ile Tyr His Lys Cys Asp Asn Ala Cys<br />
480 485 490 495<br />
ata ggg tca atc aga aat gga act tat gac cat gat gta tac aga gac 3517<br />
Ile Gly Ser Ile Arg Asn Gly Thr Tyr Asp His Asp Val Tyr Arg Asp<br />
500 505 510<br />
gaa gca tta aac aac cgg ttc cag atc aaa ggt gtt gag ctg aag tca 3565<br />
Glu Ala Leu Asn Asn Arg Phe Gln Ile Lys Gly Val Glu Leu Lys Ser<br />
515 520 525<br />
gga tac aaa gat tgg atc cta tgg att tcc ttt gcc ata tca tgc ttt 3613<br />
Gly Tyr Lys Asp Trp Ile Leu Trp Ile Ser Phe Ala Ile Ser Cys Phe<br />
530 535 540<br />
ttg ctt tgt gtt gtt ttg ctg ggg ttc atc atg tgg gcc tgc caa aaa 3661<br />
Leu Leu Cys Val Val Leu Leu Gly Phe Ile Met Trp Ala Cys Gln Lys<br />
545 550 555<br />
ggc aac att agg tgc aac att tgc att tga ggggccctaa caaaacaaaa 3711<br />
Gly Asn Ile Arg Cys Asn Ile Cys Ile<br />
560 565<br />
agatggggtt attccctaaa cttcatgggt tacgtaattg gaagttgggg gacattgcca 3771<br />
caagatcata ttgtacaaaa gatcaaacac tgttttagaa aacttcctgt aaacaggcct 3831<br />
attgattgga aagtatgtca aaggattgtg ggtcttttgg gctttgctgc tccatttaca 3891<br />
caatgtggat atcctgcctt aatgcctttg tatgcatgta tacaagctaa acaggctttc 3951<br />
actttctcgc caacttacaa ggcctttcta agtaaacagt acatgaacct ttaccccgtt 4011<br />
gctcggcaac ggcctggtct gtgccaagtg tttgctgacg caacccccac tggctggggc 4071<br />
ttggccatag gccatcagcg catgcgtgga acctttgtgg ctcctctgcc gatccatact 4131<br />
gcggaactcc tagccgcttg ttttgctcgc agccggtctg gagcaaagct cataggaact 4191<br />
gacaattctg tcgtcctctc gcggaaatat acatcgtttc gatctacgta tgatcttttt 4251<br />
ccctctgcca aaaattatgg ggacatcatg aagccccttg agcatctgac ttctggctaa 4311<br />
taaaggaaat ttattttcat tgcaatagtg tgttggaatt ttttgtgtct ctcactcgga 4371<br />
aggaattctg cattaatgaa tcggccaacg cgcggggaga ggcggtttgc gtattgggcg 4431
14<br />
ctcttccgct tcctcgctca ctgactcgct gcgctcggtc gttcggctgc ggcgagcggt 4491<br />
atcagctcac tcaaaggcgg taatacggtt atccacagaa tcaggggata acgcaggaaa 4551<br />
gaacatgtga gcaaaaggcc agcaaaaggc caggaaccgt aaaaaggccg cgttgctggc 4611<br />
gtttttccat aggctccgcc cccctgacga gcatcacaaa aatcgacgct caagtcagag 4671<br />
gtggcgaaac ccgacaggac tataaagata ccaggcgttt ccccctggaa gctccctcgt 4731<br />
gcgctctcct gttccgaccc tgccgcttac cggatacctg tccgcctttc tcccttcggg 4791<br />
aagcgtggcg ctttctcata gctcacgctg taggtatctc agttcggtgt aggtcgttcg 4851<br />
ctccaagctg ggctgtgtgc acgaaccccc cgttcagccc gaccgctgcg ccttatccgg 4911<br />
taactatcgt cttgagtcca acccggtaag acacgactta tcgccactgg cagcagccac 4971<br />
tggtaacagg attagcagag cgaggtatgt aggcggtgct acagagttct tgaagtggtg 5031<br />
gcctaactac ggctacacta gaagaacagt atttggtatc tgcgctctgc tgaagccagt 5091<br />
taccttcgga aaaagagttg gtagctcttg atccggcaaa caaaccaccg ctggtagcgg 5151<br />
tggttttttt gtttgcaagc agcagattac gcgcagaaaa aaaggatctc aagaagatcc 5211<br />
tttgatcttt tctacggggt ctgacgctca gtggaacgaa aactcacgtt aagggatttt 5271<br />
ggtcatgaga ttatcaaaaa ggatcttcac ctagatcctt ttaaattaaa aatgaagttt 5331<br />
taaatcaatc taaagtatat atgagtaaac ttggtctgac agttaccaat gcttaatcag 5391<br />
tgaggcacct atctcagcga tctgtctatt tcgttcatcc atagttgcct gactc 5446<br />
55<br />
568<br />
PRT<br />
Seqüência artificial<br />
55<br />
Met Ala Ser Lys Thr Ile Ile Ala Leu Ser Tyr Ile Leu Cys Leu Val<br />
1 5 10 15<br />
Phe Ala Gln Lys Leu Pro Gly Asn Asp Asn Ser Thr Ala Thr Leu Cys<br />
20 25 30<br />
Leu Gly His His Ala Val Ser Asn Gly Thr Leu Val Lys Thr Ile Thr<br />
35 40 45<br />
Asn Asp Gln Ile Glu Val Thr Asn Ala Thr Glu Leu Val Gln Ser Ser<br />
50 55 60<br />
Ser Thr Gly Arg Ile Cys Asp Ser Pro His Gln Ile Leu Asp Gly Glu<br />
65 70 75 80<br />
Asn Cys Thr Leu Ile Asp Ala Leu Leu Gly Asp Pro His Cys Asp Gly<br />
85 90 95<br />
Phe Gln Asn Lys Glu Trp Asp Leu Phe Val Glu Arg Ser Lys Ala Tyr<br />
100 105 110<br />
Ser Asn Cys Tyr Pro Tyr Asp Val Pro Asp Tyr Ala Ser Leu Arg Ser<br />
115 120 125<br />
Leu Val Ala Ser Ser Gly Thr Leu Glu Phe Asn Asn Glu Ser Phe Asn<br />
130 135 140<br />
Trp Thr Gly Val Ala Gln Asn Gly Thr Ser Ser Ala Cys Lys Arg Arg<br />
145 150 155 160<br />
Ser Asn Lys Ser Phe Phe Ser Arg Leu Asn Trp Leu His Gln Leu Lys<br />
165 170 175<br />
Tyr Lys Tyr Pro Ala Leu Asn Val Thr Met Pro Asn Asn Glu Lys Phe<br />
180 185 190<br />
Asp Lys Leu Tyr Ile Trp Gly Val Leu His Pro Ser Thr Asp Ser Asp<br />
195 200 205<br />
Gln Ile Ser Leu Tyr Ala Gln Ala Ser Gly Arg Val Thr Val Ser Thr<br />
210 215 220<br />
Lys Arg Ser Gln Gln Thr Val Ile Pro Asn Ile Gly Ser Arg Pro Trp<br />
225 230 235 240<br />
Val Arg Gly Val Ser Ser Arg Ile Ser Ile Tyr Trp Thr Ile Val Lys<br />
. 245 250 255<br />
Pro Gly Asp Ile Leu Leu Ile Asn Ser Thr Gly Asn Leu Ile Ala Pro<br />
260 265 270<br />
Arg Gly Tyr Phe Lys Ile Arg Ser Gly Lys Ser Ser Ile Met Arg Ser<br />
275 280 285<br />
Asp Ala Pro Ile Gly Lys Cys Asn Ser Glu Cys Ile Thr Pro Asn Gly<br />
290 295 300<br />
Ser Ile Pro Asn Asp Lys Pro Phe Gln Asn Val Asn Arg Ile Thr Tyr<br />
305 310 315 320<br />
Gly Ala Cys Pro Arg Tyr Val Lys Gln Asn Thr Leu Lys Leu Ala Thr
325 330 335<br />
Gly Met Arg Asn Val Pro Glu Lys Gln Thr Arg Gly Ile Phe Gly Ala<br />
340 345 350<br />
Ile Ala Gly Phe Ile Glu Asn Gly Trp Glu Gly Met Val Asp Gly Trp<br />
355 360 365<br />
Tyr Gly Phe Arg His Gln Asn Ser Glu Gly Thr Gly Gln Ala Ala Asp<br />
370 375 380<br />
Leu Lys Ser Thr Gln Ala Ala Ile Asn Gln Ile Asn Gly Lys Leu Asn<br />
385 390 395 400<br />
Arg Leu Ile Glu Lys Thr Asn Glu Lys Phe His Gln Ile Glu Lys Glu<br />
405 410 415<br />
Phe Ser Glu Val Glu Gly Arg Ile Gln Asp Leu Glu Lys Tyr Val Glu<br />
420 425 430<br />
Asp Thr Lys Ile Asp Leu Trp Ser Tyr Asn Ala Glu Leu Leu Val Ala<br />
435 440 445<br />
Leu Glu Asn Gln His Thr Ile Asp Leu Thr Asp Ser Glu Met Asn Lys<br />
450 455 460<br />
Leu Phe Glu Arg Thr Lys Lys Gln Leu Arg Glu Asn Ala Glu Asp Met<br />
465 470 475 480<br />
Gly Asn Gly Cys Phe Lys Ile Tyr His Lys Cys Asp Asn Ala Cys Ile<br />
485 490 495<br />
Gly Ser Ile Arg Asn Gly Thr Tyr Asp His Asp Val Tyr Arg Asp Glu<br />
500 505 510<br />
Ala Leu Asn Asn Arg Phe Gln Ile Lys Gly Val Glu Leu Lys Ser Gly<br />
515 520 525<br />
Tyr Lys Asp Trp Ile Leu Trp Ile Ser Phe Ala Ile Ser Cys Phe Leu<br />
530 535 540<br />
Leu Cys Val Val Leu Leu Gly Phe Ile Met Trp Ala Cys Gln Lys Gly<br />
545 550 555 560<br />
Asn Ile Arg Cys Asn Ile Cys Ile<br />
565<br />
56<br />
63<br />
PRT<br />
Seqüência artificial<br />
<br />
N terminal peptide of H3 Panama HA influenza antigen<br />
56<br />
Met Lys Thr Ile Ile Ala Leu Ser Tyr Ile Leu Cys Leu Val Phe Ala<br />
1 5 10 15<br />
Gln Lys Leu Pro Gly Asn Asp Asn Ser Thr Ala Thr Leu Cys Leu Gly<br />
20 25 30<br />
His His Ala Val Ser Asn Gly Thr Leu Val Lys Thr Ile Thr Asn Asp<br />
35 40 45<br />
Gln Ile Glu Val Thr Asn Ala Thr Glu Leu Val Gln Ser Ser Ser<br />
50 55 60<br />
57<br />
65<br />
PRT<br />
Seqüência artificial<br />
<br />
Seqüência N terminal do antígeno H3 Panama HA codificado por<br />
pPJV1671<br />
57<br />
Met Ala Ser Lys Thr Ile Ile Ala Leu Ser Tyr Ile Leu Cys Leu Val<br />
1 5 10 15<br />
Phe Ala Gln Lys Leu Pro Gly Asn Asp Asn Ser Thr Ala Thr Leu Cys<br />
20 25 30<br />
Leu Gly His His Ala Val Ser Asn Gly Thr Leu Val Lys Thr Ile Thr<br />
35 40 45<br />
Asn Asp Gln Ile Glu Val Thr Asn Ala Thr Glu Leu Val Gln Ser Ser<br />
50 55 60<br />
Ser<br />
15
16<br />
65<br />
58<br />
62<br />
PRT<br />
Seqüência artificial<br />
<br />
Consenso of antígenos naturais and pPJV1671 N terminal H3 Panama HÁ<br />
58<br />
Lys Thr Ile Ile Ala Leu Ser Tyr Ile Leu Cys Leu Val Phe Ala Gln<br />
1 5 10 15<br />
Lys Leu Pro Gly Asn Asp Asn Ser Thr Ala Thr Leu Cys Leu Gly His<br />
20 25 30<br />
His Ala Val Ser Asn Gly Thr Leu Val Lys Thr Ile Thr Asn Asp Gln<br />
35 40 45<br />
Ile Glu Val Thr Asn Ala Thr Glu Leu Val Gln Ser Ser Ser<br />
50 55 60<br />
59<br />
5453<br />
DNA<br />
Seqüência artificial<br />
<br />
Gene de reistência a canamicina flanqueado por seqüências Tn903<br />
(1)..(896)<br />
<br />
Sítio de clonagem Sal I<br />
(897)..(902)<br />
<br />
Promotor CMV<br />
(903)..(1587)<br />
<br />
Fusão 1/2 de exon CMV<br />
(1588)..(1718)<br />
<br />
Fusão Bam Hl/Bgl 2<br />
(1719)..(1724)<br />
<br />
Intron A de insulina de rato<br />
(1725)..(1857)<br />
<br />
Sítio de clonagem Bam H1<br />
(1858)..(1863)<br />
<br />
Região pre S2 de não codificação de HBsAg<br />
(1864)..(1984)<br />
<br />
CDS<br />
(1985)..(3697)<br />
<br />
Sítio de clonagem Bsp1201<br />
(3700)..(3705)<br />
<br />
Melhorador HBV<br />
(3706)..(4238)<br />
<br />
Região de poliadenilação de beta globina de coelho<br />
(4250)..(4380)<br />
<br />
Sítio de clonagem Eco RI<br />
(4381)..(4386)<br />
<br />
Seqüências da estrutura dorsal do vetor PUC 19<br />
(4387)..(5453)<br />
59
17<br />
ggcgtaatgc tctgccagtg ttacaaccaa ttaaccaatt ctgattagaa aaactcatcg 60<br />
agcatcaaat gaaactgcaa tttattcata tcaggattat caataccata tttttgaaaa 120<br />
agccgtttct gtaatgaagg agaaaactca ccgaggcagt tccataggat ggcaagatcc 180<br />
tggtatcggt ctgcgattcc gactcgtcca acatcaatac aacctattaa tttcccctcg 240<br />
tcaaaaataa ggttatcaag tgagaaatca ccatgagtga cgactgaatc cggtgagaat 300<br />
ggcaaaagct tatgcatttc tttccagact tgttcaacag gccagccatt acgctcgtca 360<br />
tcaaaatcac tcgcatcaac caaaccgtta ttcattcgtg attgcgcctg agcgagacga 420<br />
aatacgcgat cgctgttaaa aggacaatta caaacaggaa tcgaatgcaa ccggcgcagg 480<br />
aacactgcca gcgcatcaac aatattttca cctgaatcag gatattcttc taatacctgg 540<br />
aatgctgttt tcccggggat cgcagtggtg agtaaccatg catcatcagg agtacggata 600<br />
aaatgcttga tggtcggaag aggcataaat tccgtcagcc agtttagtct gaccatctca 660<br />
tctgtaacat cattggcaac gctacctttg ccatgtttca gaaacaactc tggcgcatcg 720<br />
ggcttcccat acaatcgata gattgtcgca cctgattgcc cgacattatc gcgagcccat 780<br />
ttatacccat ataaatcagc atccatgttg gaatttaatc gcggcctcga gcaagacgtt 840<br />
tcccgttgaa tatggctcat aacacccctt gtattactgt ttatgtaagc agacaggtcg 900<br />
acaatattgg ctattggcca ttgcatacgt tgtatctata tcataatatg tacatttata 960<br />
ttggctcatg tccaatatga ccgccatgtt gacattgatt attgactagt tattaatagt 1020<br />
aatcaattac ggggtcatta gttcatagcc catatatgga gttccgcgtt acataactta 1080<br />
cggtaaatgg cccgcctggc tgaccgccca acgacccccg cccattgacg tcaataatga 1140<br />
cgtatgttcc catagtaacg ccaataggga ctttccattg acgtcaatgg gtggagtatt 1200<br />
tacggtaaac tgcccacttg gcagtacatc aagtgtatca tatgccaagt ccgcccccta 1260<br />
ttgacgtcaa tgacggtaaa tggcccgcct ggcattatgc ccagtacatg accttacggg 1320<br />
actttcctac ttggcagtac atctacgtat tagtcatcgc tattaccatg gtgatgcggt 1380<br />
tttggcagta caccaatggg cgtggatagc ggtttgactc acggggattt ccaagtctcc 1440<br />
accccattga cgtcaatggg agtttgtttt ggcaccaaaa tcaacgggac tttccaaaat 1500<br />
gtcgtaataa ccccgccccg ttgacgcaaa tgggcggtag gcgtgtacgg tgggaggtct 1560<br />
atataagcag agctcgttta gtgaaccgtc agatcgcctg gagacgccat ccacgctgtt 1620<br />
ttgacctcca tagaagacac cgggaccgat ccagcctccg cggccgggaa cggtgcattg 1680<br />
gaacgcggat tccccgtgcc aagagtgact caccgtccgg atctcagcaa gcaggtatgt 1740<br />
actctccagg gtgggcctgg cttccccagt caagactcca gggatttgag ggacgctgtg 1800<br />
ggctcttctc ttacatgtac cttttgcttg cctcaaccct gactatcttc caggtcagga 1860<br />
tcccagagtc aggggtctgt attttcctgc tggtggctcc agttcaggaa cagtaaaccc 1920<br />
tgctccgaat attgcctctc acatctcgtc aatctccgcg aggactgggg accctgtgac 1980<br />
gaac atg gct agc gag aaa ata gtg ctt ctt ttt gca ata gtc agt ctt<br />
Met Ala Ser Glu Lys Ile Val Leu Leu Phe Ala Ile Val Ser Leu<br />
2029<br />
1 5 10 15<br />
gtt aaa agt gat cag att tgc att ggt tac cat gca aac aac tcg aca<br />
Val Lys Ser Asp Gln Ile Cys Ile Gly Tyr His Ala Asn Asn Ser Thr<br />
2077<br />
20 25 30<br />
gag cag gtt gac aca ata atg gaa aag aac gtt act gtt aca cat gcc<br />
Glu Gln Val Asp Thr Ile Met Glu Lys Asn Val Thr Val Thr His Ala<br />
2125<br />
35 40 45<br />
caa gac ata ctg gaa aag aca cac aat ggg aag ctc tgc gat cta gat<br />
Gln Asp Ile Leu Glu Lys Thr His Asn Gly Lys Leu Cys Asp Leu Asp<br />
2173<br />
50 55 60<br />
gga gtg aag cct cta att ttg aga gat tgt agt gta gct gga tgg ctc<br />
Gly Val Lys Pro Leu Ile Leu Arg Asp Cys Ser Val Ala Gly Trp Leu<br />
2221<br />
65 70 75<br />
ctc gga aac cca atg tgt gac gaa ttc atc aat gtg ccg gaa tgg tct<br />
Leu Gly Asn Pro Met Cys Asp Glu Phe Ile Asn Val Pro Glu Trp Ser<br />
2269<br />
80 85 90 95<br />
tac ata gtg gag aag gcc aat cca gtc aat gac ctc tgt tac cca ggg<br />
Tyr Ile Val Glu Lys Ala Asn Pro Val Asn Asp Leu Cys Tyr Pro Gly<br />
2317<br />
100 105 110<br />
gat ttc aat gac tat gaa gaa ttg aaa cac cta ttg agc aga ata aac<br />
Asp Phe Asn Asp Tyr Glu Glu Leu Lys His Leu Leu Ser Arg Ile Asn<br />
2365<br />
115 120 125<br />
cat ttt gag aaa att cag atc atc ccc aaa agt tct tgg tcc agt cat<br />
His Phe Glu Lys Ile Gln Ile Ile Pro Lys Ser Ser Trp Ser Ser His<br />
2413<br />
130 135 140<br />
gaa gcc tca ttg ggg gtg agc tca gca tgt cca tac cag gga aag tcc<br />
Glu Ala Ser Leu Gly Val Ser Ser Ala Cys Pro Tyr Gln Gly Lys Ser<br />
2461<br />
145 150 155
18<br />
tcc ttt ttc aga aat gtg gta tgg ctt atc aaa aag aac agt aca tac<br />
Ser Phe Phe Arg Asn Val Val Trp Leu Ile Lys Lys Asn Ser Thr Tyr<br />
2509<br />
160 165 170 175<br />
cca aca ata aag agg agc tac aat aat acc aac caa gaa gat ctt ttg<br />
Pro Thr Ile Lys Arg Ser Tyr Asn Asn Thr Asn Gln Glu Asp Leu Leu<br />
2557<br />
180 185 190<br />
gta ctg tgg ggg att cac cat cct aat gat gcg gca gag cag aca aag<br />
2605<br />
Val Leu Trp Gly Ile His His Pro Asn Asp Ala Ala Glu Gln Thr Lys<br />
195 200 205<br />
ctc tat caa aac cca acc acc tat att tcc gtt ggg aca tca aca cta<br />
Leu Tyr Gln Asn Pro Thr Thr Tyr Ile Ser Val Gly Thr Ser Thr Leu<br />
2653<br />
210 215 220<br />
aac cag aga ttg gta cca aga ata gct act aga tcc aaa gta aac ggg<br />
Asn Gln Arg Leu Val Pro Arg Ile Ala Thr Arg Ser Lys Val Asn Gly<br />
225 230 235<br />
caa agt gga agg atg gag ttc ttc tgg aca att tta aaa ccg aat gat<br />
Gln Ser Gly Arg Met Glu Phe Phe Trp Thr Ile Leu Lys Pro Asn Asp<br />
240 245 250 255<br />
gca atc aac ttc gag agt aat gga aat ttc att gct cca gaa tat gca<br />
Ala Ile Asn Phe Glu Ser Asn Gly Asn Phe Ile Ala Pro Glu Tyr Ala<br />
260 265 270<br />
tac aaa att gtc aag aaa ggg gac tca aca att atg aaa agt gaa ttg<br />
Tyr Lys Ile Val Lys Lys Gly Asp Ser Thr Ile Met Lys Ser Glu Leu<br />
275 280 285<br />
gaa tat ggt aac tgc aac acc aag tgt caa act cca atg ggg gcg ata<br />
Glu Tyr Gly Asn Cys Asn Thr Lys Cys Gln Thr Pro Met Gly Ala Ile<br />
290 295 300<br />
aac tct agc atg cca ttc cac aat ata cac cct ctc acc atc ggg gaa<br />
2701<br />
2749<br />
2797<br />
2845<br />
2893<br />
Asn Ser Ser Met Pro Phe His Asn Ile His Pro Leu Thr Ile Gly Glu<br />
305 310 315<br />
tgc ccc aaa tat gtg aaa tca aac aga tta gtc ctt gcg act ggg ctc<br />
Cys Pro Lys Tyr Val Lys Ser Asn Arg Leu Val Leu Ala Thr Gly Leu<br />
2989<br />
320 325 330 335<br />
aga aat agc cct caa aga gag aga aga aga aaa aag aga gga tta ttt<br />
Arg Asn Ser Pro Gln Arg Glu Arg Arg Arg Lys Lys Arg Gly Leu Phe<br />
3037<br />
340 345 350<br />
gga gct ata gca ggt ttt ata gag gga gga tgg cag gga atg gta gat<br />
Gly Ala Ile Ala Gly Phe Ile Glu Gly Gly Trp Gln Gly Met Val Asp<br />
3085<br />
355 360 365<br />
ggt tgg tat ggg tac cac cat agc aac gag cag ggg agt ggg tac gct<br />
Gly Trp Tyr Gly Tyr His His Ser Asn Glu Gln Gly Ser Gly Tyr Ala<br />
3133<br />
370 375 380<br />
gca gac aaa gaa tcc act caa aag gca ata gat gga gtc acc aat aag<br />
Ala Asp Lys Glu Ser Thr Gln Lys Ala Ile Asp Gly Val Thr Asn Lys<br />
3181<br />
385 390 395<br />
gtc aac tcg att att gac aaa atg aac act cag ttt gag gcc gtt gga<br />
Val Asn Ser Ile Ile Asp Lys Met Asn Thr Gln Phe Glu Ala Val Gly<br />
3229<br />
400 405 410 415<br />
agg gaa ttt aac aac tta gaa agg aga ata gag aat tta aac aag aag<br />
2941<br />
3277<br />
Arg Glu Phe Asn Asn Leu Glu Arg Arg Ile Glu Asn Leu Asn Lys Lys<br />
420 425 430<br />
atg gaa gac ggg ttc cta gat gtc tgg act tat aat gct gaa ctt cta 3325<br />
Met Glu Asp Gly Phe Leu Asp Val Trp Thr Tyr Asn Ala Glu Leu Leu<br />
435 440 445<br />
gtt ctc atg gaa aac gag aga act cta gac ttt cat gac tca aat gtc 3373<br />
Val Leu Met Glu Asn Glu Arg Thr Leu Asp Phe His Asp Ser Asn Val<br />
450 455 460<br />
aag aac ctt tac gac aag gtc cga cta cag ctt agg gat aat gca aag 3421<br />
Lys Asn Leu Tyr Asp Lys Val Arg Leu Gln Leu Arg Asp Asn Ala Lys<br />
465 470 475<br />
gag ctg ggt aac ggt tgt ttc gag ttc tat cat aaa tgt gat aat gaa 3469<br />
Glu Leu Gly Asn Gly Cys Phe Glu Phe Tyr His Lys Cys Asp Asn Glu<br />
480 485 490 495
19<br />
tgt atg gaa agt gta aga aac gga acg tat gac tac ccg cag tat tca<br />
Cys Met Glu Ser Val Arg Asn Gly Thr Tyr Asp Tyr Pro Gln Tyr Ser<br />
3517<br />
500 505 510<br />
gaa gaa gca aga cta aaa aga gag gaa ata agt gga gta aaa ttg gaa<br />
Glu Glu Ala Arg Leu Lys Arg Glu Glu Ile Ser Gly Val Lys Leu Glu<br />
3565<br />
515 520 525<br />
tca ata gga att tac caa ata ttg tca att tat tct aca gtg gcg agc<br />
Ser Ile Gly Ile Tyr Gln Ile Leu Ser Ile Tyr Ser Thr Val Ala Ser<br />
3613<br />
530 535 540<br />
tcc cta gca ctg gca atc atg gta gct ggt cta tcc tta tgg atg tgc<br />
Ser Leu Ala Leu Ala Ile Met Val Ala Gly Leu Ser Leu Trp Met Cys<br />
3661<br />
545 550 555<br />
tcc aat ggg tcg tta caa tgc aga att tgc att taa atgggcccta<br />
Ser Asn Gly Ser Leu Gln Cys Arg Ile Cys Ile<br />
3707<br />
560 565 570<br />
acaaaacaaa aagatggggt tattccctaa acttcatggg ttacgtaatt ggaagttggg 3767<br />
ggacattgcc acaagatcat attgtacaaa agatcaaaca ctgttttaga aaacttcctg 3827<br />
taaacaggcc tattgattgg aaagtatgtc aaaggattgt gggtcttttg ggctttgctg 3887<br />
ctccatttac acaatgtgga tatcctgcct taatgccttt gtatgcatgt atacaagcta 3947<br />
aacaggcttt cactttctcg ccaacttaca aggcctttct aagtaaacag tacatgaacc 4007<br />
tttaccccgt tgctcggcaa cggcctggtc tgtgccaagt gtttgctgac gcaaccccca 4067<br />
ctggctgggg cttggccata ggccatcagc gcatgcgtgg aacctttgtg gctcctctgc 4127<br />
cgatccatac tgcggaactc ctagccgctt gttttgctcg cagccggtct ggagcaaagc 4187<br />
tcataggaac tgacaattct gtcgtcctct cgcggaaata tacatcgttt cgatctacgt 4247<br />
atgatctttt tccctctgcc aaaaattatg gggacatcat gaagcccctt gagcatctga 4307<br />
cttctggcta ataaaggaaa tttattttca ttgcaatagt gtgttggaat tttttgtgtc 4367<br />
tctcactcgg aaggaattct gcattaatga atcggccaac gcgcggggag aggcggtttg 4427<br />
cgtattgggc gctcttccgc ttcctcgctc actgactcgc tgcgctcggt cgttcggctg 4487<br />
cggcgagcgg tatcagctca ctcaaaggcg gtaatacggt tatccacaga atcaggggat 4547<br />
aacgcaggaa agaacatgtg agcaaaaggc cagcaaaagg ccaggaaccg taaaaaggcc 4607<br />
gcgttgctgg cgtttttcca taggctccgc ccccctgacg agcatcacaa aaatcgacgc 4667<br />
tcaagtcaga ggtggcgaaa cccgacagga ctataaagat accaggcgtt tccccctgga 4727<br />
agctccctcg tgcgctctcc tgttccgacc ctgccgctta ccggatacct gtccgccttt 4787<br />
ctcccttcgg gaagcgtggc gctttctcat agctcacgct gtaggtatct cagttcggtg 4847<br />
taggtcgttc gctccaagct gggctgtgtg cacgaacccc ccgttcagcc cgaccgctgc 4907<br />
gccttatccg gtaactatcg tcttgagtcc aacccggtaa gacacgactt atcgccactg 4967<br />
gcagcagcca ctggtaacag gattagcaga gcgaggtatg taggcggtgc tacagagttc 5027<br />
ttgaagtggt ggcctaacta cggctacact agaagaacag tatttggtat ctgcgctctg 5087<br />
ctgaagccag ttaccttcgg aaaaagagtt ggtagctctt gatccggcaa acaaaccacc 5147<br />
gctggtagcg gtggtttttt tgtttgcaag cagcagatta cgcgcagaaa aaaaggatct 5207<br />
caagaagatc ctttgatctt ttctacgggg tctgacgctc agtggaacga aaactcacgt 5267<br />
taagggattt tggtcatgag attatcaaaa aggatcttca cctagatcct tttaaattaa 5327<br />
aaatgaagtt ttaaatcaat ctaaagtata tatgagtaaa cttggtctga cagttaccaa 5387<br />
tgcttaatca gtgaggcacc tatctcagcg atctgtctat ttcgttcatc catagttgcc 5447<br />
tgactc<br />
60<br />
570<br />
PRT<br />
Seqüência artificial<br />
<br />
Construção sintética<br />
60<br />
Met Ala Ser Glu Lys Ile Val Leu Leu Phe Ala Ile Val Ser Leu Val<br />
5453<br />
1 5 10 15<br />
Lys Ser Asp Gln Ile Cys Ile Gly Tyr His Ala Asn Asn Ser Thr Glu<br />
20 25 30<br />
Gln Val Asp Thr Ile Met Glu Lys Asn Val Thr Val Thr His Ala Gln<br />
35 40 45<br />
Asp Ile Leu Glu Lys Thr His Asn Gly Lys Leu Cys Asp Leu Asp Gly<br />
50 55 60<br />
Val Lys Pro Leu Ile Leu Arg Asp Cys Ser Val Ala Gly Trp Leu Leu<br />
65 70 75 80<br />
Gly Asn Pro Met Cys Asp Glu Phe Ile Asn Val Pro Glu Trp Ser Tyr
85 90 95<br />
Ile Val Glu Lys Ala Asn Pro Val Asn Asp Leu Cys Tyr Pro Gly Asp<br />
100 105 110<br />
Phe Asn Asp Tyr Glu Glu Leu Lys His Leu Leu Ser Arg Ile Asn His<br />
115 120 125<br />
Phe Glu Lys Ile Gln Ile Ile Pro Lys Ser Ser Trp Ser Ser His Glu<br />
130 135 140<br />
Ala Ser Leu Gly Val Ser Ser Ala Cys Pro Tyr Gln Gly Lys Ser Ser<br />
145 150 155 160<br />
Phe Phe Arg Asn Val Val Trp Leu Ile Lys Lys Asn Ser Thr Tyr Pro<br />
165 170 175<br />
Thr Ile Lys Arg Ser Tyr Asn Asn Thr Asn Gln Glu Asp Leu Leu Val<br />
180 185 190<br />
Leu Trp Gly Ile His His Pro Asn Asp Ala Ala Glu Gln Thr Lys Leu<br />
195 200 205<br />
Tyr Gln Asn Pro Thr Thr Tyr Ile Ser Val Gly Thr Ser Thr Leu Asn<br />
210 215 220<br />
Gln Arg Leu Val Pro Arg Ile Ala Thr Arg Ser Lys Val Asn Gly Gln<br />
225 230 235 240<br />
Ser Gly Arg Met Glu Phe Phe Trp Thr Ile Leu Lys Pro Asn Asp Ala<br />
245 250 255<br />
Ile Asn Phe Glu Ser Asn Gly Asn Phe Ile Ala Pro Glu Tyr Ala Tyr<br />
260 265 270<br />
Lys Ile Val Lys Lys Gly Asp Ser Thr Ile Met Lys Ser Glu Leu Glu<br />
275 280 285<br />
Tyr Gly Asn Cys Asn Thr Lys Cys Gln Thr Pro Met Gly Ala Ile Asn<br />
290 295 300<br />
Ser Ser Met Pro Phe His Asn Ile His Pro Leu Thr Ile Gly Glu Cys<br />
305 310 315 320<br />
Pro Lys Tyr Val Lys Ser Asn Arg Leu Val Leu Ala Thr Gly Leu Arg<br />
325 330 335<br />
Asn Ser Pro Gln Arg Glu Arg Arg Arg Lys Lys Arg Gly Leu Phe Gly<br />
340 345 350<br />
Ala Ile Ala Gly Phe Ile Glu Gly Gly Trp Gln Gly Met Val Asp Gly<br />
355 360 365<br />
Trp Tyr Gly Tyr His His Ser Asn Glu Gln Gly Ser Gly Tyr Ala Ala<br />
370 375 380<br />
Asp Lys Glu Ser Thr Gln Lys Ala Ile Asp Gly Val Thr Asn Lys Val<br />
385 390 395 400<br />
Asn Ser Ile Ile Asp Lys Met Asn Thr Gln Phe Glu Ala Val Gly Arg<br />
405 410 415<br />
Glu Phe Asn Asn Leu Glu Arg Arg Ile Glu Asn Leu Asn Lys Lys Met<br />
420 425 430<br />
Glu Asp Gly Phe Leu Asp Val Trp Thr Tyr Asn Ala Glu Leu Leu Val<br />
435 440 445<br />
Leu Met Glu Asn Glu Arg Thr Leu Asp Phe His Asp Ser Asn Val Lys<br />
450 455 460<br />
Asn Leu Tyr Asp Lys Val Arg Leu Gln Leu Arg Asp Asn Ala Lys Glu<br />
465 470 475 480<br />
Leu Gly Asn Gly Cys Phe Glu Phe Tyr His Lys Cys Asp Asn Glu Cys<br />
485 490 495<br />
Met Glu Ser Val Arg Asn Gly Thr Tyr Asp Tyr Pro Gln Tyr Ser Glu<br />
500 505 510<br />
Glu Ala Arg Leu Lys Arg Glu Glu Ile Ser Gly Val Lys Leu Glu Ser<br />
515 520 525<br />
Ile Gly Ile Tyr Gln Ile Leu Ser Ile Tyr Ser Thr Vai Ala Ser Ser<br />
530 535 540<br />
Leu Ala Leu Ala Ile Met Val Ala Gly Leu Ser Leu Trp Met Cys Ser<br />
545 550 555 560<br />
Asn Gly Ser Leu Gln Cys Arg Ile Cys Ile<br />
565 570<br />
61<br />
5578<br />
20
21<br />
DNA<br />
Construção artificial<br />
<br />
Construção PJV2012 contendo seqüência de codificação de LTA e TLB<br />
61<br />
ggcgtaatgc tctgccagtg ttacaaccaa ttaaccaatt ctgattagaa aaactcatcg 60<br />
agcatcaaat gaaactgcaa tttattcata tcaggattat caataccata tttttgaaaa 120<br />
agccgtttct gtaatgaagg agaaaactca ccgaggcagt tccataggat ggcaagatcc 180<br />
tggtatcggt ctgcgattcc gactcgtcca acatcaatac aacctattaa tttcccctcg 240<br />
tcaaaaataa ggttatcaag tgagaaatca ccatgagtga cgactgaatc cggtgagaat 300<br />
ggcaaaagct tatgcatttc tttccagact tgttcaacag gccagccatt acgctcgtca 360<br />
tcaaaatcac tcgcatcaac caaaccgtta ttcattcgtg attgcgcctg agcgagacga 420<br />
aatacgcgat cgctgttaaa aggacaatta caaacaggaa tcaaatgcaa ccggcgcagg 480<br />
aacactgcca gcgcatcaac aatattttca cctgaatcag gatattcttc taatacctgg 540<br />
aatgctgttt tcccggggat cgcagtggtg agtaaccatg catcatcagg agtacggata 600<br />
aaatgcttga tggtcggaag aggcataaat tccgtcagcc agtttagtct gaccatctca 660<br />
tctgtaacat cattggcaac gctacctttg ccatgtttca gaaacaactc tggcgcatcg 720<br />
ggcttcccat acaatcgata gattgtcgca cctgattgcc cgacattatc gcgagcccat 780<br />
ttatacccat ataaatcagc atccatgttg gaatttaatc gcggcctcga gcaagacgtt 840<br />
tcccgttgaa tatggctcat aacacccctt gtattactgt ttatgtaagc agacaggtcg 900<br />
acaattcctt ccgagtgaga gacacaaaaa attccaacac actattgcaa tgaaaataaa 960<br />
tttcctttat tagccagaag tcagatgctc aaggggcttc atgatgtccc cataattttt 1020<br />
ggcagaggga aaaagatccc tagttttcca tactgattgc cgcaattgaa ttgggggttt 1080<br />
tattattcca tacacataat ttatcaattt tggtctcggt cagatatgtg attcttaatg 1140<br />
tgtccttcat cctttcaatg gctttttttt gggagtctat atgttgactg cccgggactt 1200<br />
cgacctgaaa tgttgcgccg ctcttaaatg taatgataac catttctctt ttgcctgcca 1260<br />
tcgattccgt atatgatagt atcttgtcat ttatcgtata tatttgtgtg ttgcgatatt 1320<br />
ccgaacatag ttctgtaata gactggggag cgctagcccc cagagcagcc aggggcagga 1380<br />
agcaaagcac caagattagc aaagacctac tagccatgtt cgtcacaggg tccccagtcc 1440<br />
tcgcggagat tgacgagatg tgagaggcaa tattcggagc agggtttact gttcctgaac 1500<br />
tggagccacc agcaggaaaa tacagacccc tgactctggg atcctgacct ggaagatagt 1560<br />
cagggttgag gcaagcaaaa ggtacatgta agagaagagc ccacagcgtc cctcaaatcc 1620<br />
ctggagtctt gactggggaa gccaggccca ccctggagag tacatacctg cttgctgaga 1680<br />
tccggacggt gagtcactct tggcacgggg aatccgcgtt ccaatgcacc gttcccggcc 1740<br />
gcggaggctg gatcggtccc ggtgtcttct atggaggtca aaacagcgtg gatggcgtct 1800<br />
ccaggcgatc tgacggttca ctaaacgagc tctgcttata tagacctccc accgtacacg 1860<br />
cctaccgccc atttgcgtca acggggcggg gttattacga cattttggaa agtcccgttg 1920<br />
attttggtgc tcgacctgca ggtcgacaat attggctatt ggccattgca tacgttgtat 1980<br />
ctatatcata atatgtacat ttatattggc tcatgtccaa tatgaccgcc atgttgacat 2040<br />
tgattattga ctagttatta atagtaatca attacggggt cattagttca tagcccatat 2100<br />
atggagttcc gcgttacata acttacggta aatggcccgc ctggctgacc gcccaacgac 2160<br />
ccccgcccat tgacgtcaat aatgacgtat gttcccatag taacgccaat agggactttc 2220<br />
cattgacgtc aatgggtgga gtatttacgg taaactgccc acttggcagt acatcaagtg 2280<br />
tatcatatgc caagtccgcc ccctattgac gtcaatgacg gtaaatggcc cgcctggcat 2340<br />
tatgcccagt acatgacctt acgggacttt cctacttggc agtacatcta cgtattagtc 2400<br />
atcgctatta ccatggtgat gcggttttgg cagtacacca atgggcgtgg atagcggttt 2460<br />
gactcacggg gatttccaag tctccacccc attgacgtca atgggagttt gttttggcac 2520<br />
caaaatcaac gggactttcc aaaatgtcgt aataaccccg ccccgttgac gcaaatgggc 2580<br />
ggtaggcgtg tacggtggga ggtctatata agcagagctc gtttagtgaa ccgtcagatc 2640<br />
gcctggagac gccatccacg ctgttttgac ctccatagaa gacaccggga ccgatccagc 2700<br />
ctccgcggcc gggaacggtg cattggaacg cggattcccc gtgccaagag tgactcaccg 2760<br />
tccggatctc agcaagcagg tatgtactct ccagggtggg cctggcttcc ccagtcaaga 2820<br />
ctccagggat ttgagggacg ctgtgggctc ttctcttaca tgtacctttt gcttgcctca 2880<br />
accctgacta tcttccaggt caggatccca gagtcagggg tctgtatttt cctgctggtg 2940<br />
gctccagttc aggaacagta aaccctgctc cgaatattgc ctctcacatc tcgtcaatct 3000<br />
ccgcgaggac tggggaccct gtgacgaaca tggctagtag gtctttgcta atcttggtgc 3060<br />
tttgcttcct gcccctggct gctctggggg ctagcaatgg cgacaaatta taccgtgctg 3120<br />
actctagacc cccagatgaa ataaaacgtt ccggaggtct tatgcccaga gggcataatg 3180<br />
agtacttcga tagaggaact caaatgaata ttaatcttta tgatcacgcg agaggaacac 3240<br />
aaaccggctt tgtcagatat gatgacggat atgtttccac ttctcttagt ttgagaagtg 3300<br />
ctcacttagc aggacagtct atattatcag gatattccac ttactatata tatgttatag 3360<br />
cgacagcacc aaatatgttt aatgttaatg atgtattagg cgtatacagc cctcacccat 3420<br />
atgaacagga ggtttctgcg ttaggtggaa taccatattc tcagatatat ggatggtatc 3480
22<br />
gtgttaattt tggtgtgatt gatgaacgat tacatcgtaa cagggaatat agagaccggt 3540<br />
attacagaaa tctgaatata gctccggcag aggatggtta cagattagca ggtttcccac 3600<br />
cggatcacca agcttggaga gaagaaccct ggattcatca tgcaccacaa ggttgtggaa 3660<br />
attcatcaag aacaattaca ggtgatactt gtaatgagga gacccagaat ctgagcacaa 3720<br />
tatatctcag gaaatatcaa tcaaaagtta agaggcagat attttcagac tatcagtcag 3780<br />
aggttgacat atataacaga attcgggatg aattatgagg atctgggccc taacaaaaca 3840<br />
aaaagatggg gttattccct aaacttcatg ggttacgtaa ttggaagttg ggggacattg 3900<br />
ccacaagatc atattgtaca aaagatcaaa cactgtttta gaaaacttcc tgtaaacagg 3960<br />
cctattgatt ggaaagtatg tcaaaggatt gtgggtcttt tgggctttgc tgctccattt 4020<br />
acacaatgtg gatatcctgc cttaatgcct ttgtatgcat gtatacaagc taaacaggct 4080<br />
ttcactttct cgccaactta caaggccttt ctaagtaaac agtacatgaa cctttacccc 4140<br />
gttgctcggc aacggcctgg tctgtgccaa gtgtttgctg acgcaacccc cactggctgg 4200<br />
ggcttggcca taggccatca gcgcatgcgt ggaacctttg tggctcctct gccgatccat 4260<br />
actgcggaac tcctagccgc ttgttttgct cgcagccggt ctggagcaaa, gctcatagga 4320<br />
actgacaatt ctgtcgtcct ctcgcggaaa tatacatcgt ttcgatctac gtatgatctt 4380<br />
tttccctctg ccaaaaatta tggggacatc atgaagcccc ttgagcatct gacttctggc 4440<br />
taataaagga aatttatttt cattgcaata gtgtgttgga attttttgtg tctctcactc 4500<br />
ggaaggaatt ctgcattaat gaatcggcca acgcgcgggg agaggcggtt tgcgtattgg 4560<br />
gcgctcttcc gcttcctcgc tcactgactc gctgcgctcg gtcgttcggc tgcggcgagc 4620<br />
ggtatcagct cactcaaagg cggtaatacg gttatccaca gaatcagggg ataacgcagg 4680<br />
aaagaacatg tgagcaaaag gccagcaaaa ggccaggaac cgtaaaaagg ccgcgttgct 4740<br />
ggcgtttttc cataggctcc gcccccctga cgagcatcac aaaaatcgac gctcaagtca 4800<br />
gaggtggcga aacccgacag gactataaag ataccaggcg tttccccctg gaagctccct 4860<br />
cgtgcgctct cctgttccga ccctgccgct taccggatac ctgtccgcct ttctcccttc 4920<br />
gggaagcgtg gcgctttctc atagctcacg ctgtaggtat ctcagttcgg tgtaggtcgt 4980<br />
tcgctccaag ctgggctgtg tgcacgaacc ccccgttcag cccgaccgct gcgccttatc 5040<br />
cggtaactat cgtcttgagt ccaacccggt aagacacgac ttatcgccac tggcagcagc 5100<br />
cactggtaac aggattagca gagcgaggta tgtaggcggt gctacagagt tcttgaagtg 5160<br />
gtggcctaac tacggctaca ctagaagaac agtatttggt atctgcgctc tgctgaagcc 5220<br />
agttaccttc ggaaaaagag ttggtagctc ttgatccggc aaacaaacca ccgctggtag 5280<br />
cggtggtttt tttgtttgca agcagcagat tacgcgcaga aaaaaaggat ctcaagaaga 5340<br />
tcctttgatc ttttctacgg ggtctgacgc tcagtggaac gaaaactcac gttaagggat 5400<br />
tttggtcatg agattatcaa aaaggatctt cacctagatc cttttaaatt aaaaatgaag 5460<br />
ttttaaatca atctaaagta tatatgagta aacttggtct gacagttacc aatgcttaat 5520<br />
cagtgaggca cctatctcag cgatctgtct atttcgttca tccatagttg cctgactc<br />
62<br />
6254<br />
DNA<br />
Seqüência artificial<br />
<br />
Construção PJV7788<br />
62<br />
5578<br />
ggcgtaatgc tctgccagtg ttacaaccaa ttaaccaatt ctgattagaa aaactcatcg 60<br />
agcatcaaat gaaactgcaa tttattcata tcaggattat caataccata tttttgaaaa 120<br />
agccgtttct gtaatgaagg agaaaactca ccgaggcagt tccataggat ggcaagatcc 180<br />
tggtatcggt ctgcgattcc gactcgtcca acatcaatac aacctattaa tttcccctcg 240<br />
tcaaaaataa ggttatcaag tgagaaatca ccatgagtga cgactgaatc cggtgagaat 300<br />
ggcaaaagct tatgcatttc tttccagact tgttcaacag gccagccatt acgctcgtca 360<br />
tcaaaatcac tcgcatcaac caaaccgtta ttcattcgtg attgcgcctg agcgagacga 420<br />
aatacgcgat cgctgttaaa aggacaatta caaacaggaa tcgaatgcaa ccggcgcagg 480<br />
aacactgcca gcgcatcaac aatattttca cctgaatcag gatattcttc taatacctgg 540<br />
aatgctgttt tcccggggat cgcagtggtg agtaaccatg catcatcagg agtacggata 600<br />
aaatgcttga tggtcggaag aggcataaat tccgtcagcc agtttagtct gaccatctca 660<br />
tctgtaacat cattggcaac gctacctttg ccatgtttca gaaacaactc tggcgcatcg 720<br />
ggcttcccat acaatcgata gattgtcgca cctgattgcc cgacattatc gcgagcccat 780<br />
ttatacccat ataaatcagc atccatgttg gaatttaatc gcggcctcga gcaagacgtt 840<br />
tcccgttgaa tatggctcat aacacccctt gtattactgt ttatgtaagc agacagtttt 900<br />
attgttcatg atgatatatt tttatcttgt gcaatgtaac atcagagatt ttgagacaca 960<br />
acgtggcttt cccccccccc ccggcatgcc tgcaggtcga caatattggc tattggccat 1020<br />
tgcatacgtt gtatctatat cataatatgt acatttatat tggctcatgt ccaatatgac 1080<br />
cgccatgttg acattgatta ttgactagtt attaatagta atcaattacg gggtcattag 1140<br />
ttcatagccc atatatggag ttccgcgtta cataacttac ggtaaatggc ccgcctggct 1200<br />
gaccgcccaa cgacccccgc ccattgacgt caataatgac gtatgttccc atagtaacgc 1260
23<br />
caatagggac tttccattga cgtcaatggg tggagtattt acggtaaact gcccacttgg 1320<br />
cagtacatca agtgtatcat atgccaagtc cgccccctat tgacgtcaat gacggtaaat 1380<br />
ggcccgcctg gcattatgcc cagtacatga ccttacggga ctttcctact tggcagtaca 1440<br />
tctacgtatt agtcatcgct attaccatgg tgatgcggtt ttggcagtac accaatgggc 1500<br />
gtggatagcg gtttgactca cggggatttc caagtctcca ccccattgac gtcaatggga 1560<br />
gtttgttttg gcaccaaaat caacgggact ttccaaaatg tcgtaataac cccgccccgt 1620<br />
tgacgcaaat gggcggtagg cgtgtacggt gggaggtcta tataagcaga gctcgtttag 1680<br />
tgaaccgtca gatcgcctgg agacgccatc cacgctgttt tgacctccat agaagacacc 1740<br />
gggaccgatc cagcctccgc ggccgggaac ggtgcattgg aacgcggatt ccccgtgcca 1800<br />
agagtgactc accgtccgga tctcagcaag caggtatgta ctctccaggg tgggcctggc 1860<br />
ttccccagtc aagactccag ggatttgagg gacgctgtgg gctcttctct tacatgtacc 1920<br />
ttttgcttgc ctcaaccctg actatcttcc aggtcaggat cccagagtca ggggtctgta 1980<br />
ttttcctgct ggtggctcca gttcaggaac agtaaaccct gctccgaata ttgcctctca 2040<br />
catctcgtca atctccgcga ggactgggga ccctgtgacg aacatggcta gtaggtcttt 2100<br />
gctaatcttg gtgctttgct tcctgcccct ggctgctctg ggggctagcg ctccccagtc 2160<br />
tattacagaa ctatgttcgg aatatcgcaa cacacaaata tatacgataa atgacaagat 2220<br />
actatcatat acggaatcga tggcaggcaa aagagaaatg gttatcatta catttaagag 2280<br />
cggcgcaaca tttcaggtcg aagtcccggg cagtcaacat atagactccc aaaaaaaagc 2340<br />
cattgaaagg atgaaggaca cattaagaat cacatatctg accgagacca aaattgataa 2400<br />
attatgtgta tggaataata aaacccccaa ttcaattgcg gcaatcagta tggaaaacta 2460<br />
gggatctttt tccctctgcc aaaaattatg gggacatcat gaagcccctt gagcatctga 2520<br />
cttctggcta ataaaggaaa tttattttca ttgcaatagt gtgttggaat tttttgtgtc 2580<br />
tctcactcgg aaggaattga gggccggccc tctgcaggtc gacaatattg gctattggcc 2640<br />
attgcatacg ttgtatctat atcataatat gtacatttat attggctcat gtccaatatg 2700<br />
accgccatgt tgacattgat tattgactag ttattaatag taatcaatta cggggtcatt 2760<br />
agttcatagc ccatatatgg agttccgcgt tacataactt acggtaaatg gcccgcctgg 2820<br />
ctgaccgccc aacgaccccc gcccattgac gtcaataatg acgtatgttc ccatagtaac 2880<br />
gccaataggg actttccatt gacgtcaatg ggtggagtat ttacggtaaa ctgcccactt 2940<br />
ggcagtacat caagtgtatc atatgccaag tccgccccct attgacgtca atgacggtaa 3000<br />
atggcccgcc tggcattatg cccagtacat gaccttacgg gactttccta cttggcagta 3060<br />
catctacgta ttagtcatcg ctattaccat ggtgatgcgg ttttggcagt acaccaatgg 3120<br />
gcgtggatag cggtttgact cacggggatt tccaagtctc caccccattg acgtcaatgg 3180<br />
gagtttgttt tggcaccaaa atcaacggga ctttccaaaa tgtcgtaata accccgcccc 3240<br />
gttgacgcaa atgggcggta ggcgtgtacg gtgggaggtc tatataagca gagctcgttt 3300<br />
agtgaaccgt cagatcgcct ggagacgcca tccacgctgt tttgacctcc atagaagaca 3360<br />
ccgggaccga tccagcctcc gcggccggga acggtgcatt ggaacgcgga ttccccgtgc 3420<br />
caagagtgac tcaccgtccg gatctcagca agcaggtatg tactctccag ggtgggcctg 3480<br />
gcttccccag tcaagactcc agggatttga gggacgctgt gggctcttct cttacatgta 3540<br />
ccttttgctt gcctcaaccc tgactatctt ccaggtcagg atcccagagt caggggtctg 3600<br />
tattttcctg ctggtggctc cagttcagga acagtaaacc ctgctccgaa tattgcctct 3660<br />
cacatctcgt caatctccgc gaggactggg gaccctgtga cgaacatggc tagtaggtct 3720<br />
ttgctaatct tggtgctttg cttcctgccc ctggctgctc tgggggctag caatggcgac 3780<br />
aaattatacc gtgctgactc tagaccccca gatgaaataa aacgttccgg aggtcttatg 3840<br />
cccagagggc ataatgagta cttcgataga ggaactcaaa tgaatattaa tctttatgat 3900<br />
cacgcgagag gaacacaaac cggctttgtc agatatgatg acggatatgt ttccacttct 3960<br />
cttagtttga gaagtgctca cttagcagga cagtctatat tatcaggata ttccacttac 4020<br />
tatatatatg ttatagcgac agcaccaaat atgtttaatg ttaatgatgt attaggcgta 4080<br />
tacagccctc acccatatga acaggaggtt tctgcgttag gtggaatacc atattctcag 4140<br />
atatatggat ggtatcgtgt taattttggt gtgattgatg aacgattaca tcgtaacagg 4200<br />
gaatatagag accggtatta cagaaatctg aatatagctc cggcagagga tggttacaga 4260<br />
ttagcaggtt tcccaccgga tcaccaagct tggagagaag aaccctggat tcatcatgca 4320<br />
ccacaaggtt gtggaaattc atcaagaaca attacaggtg atacttgtaa tgaggagacc 4380<br />
cagaatctga gcacaatata tctcaggaaa tatcaatcaa aagttaagag gcagatattt 4440<br />
tcagactatc agtcagaggt tgacatatat aacagaattc gggatgaatt atgaggatct 4500<br />
gggccctaac aaaacaaaaa gatggggtta ttccctaaac ttcatgggtt acgtaattgg 4560<br />
aagttggggg acattgccac aagatcatat tgtacaaaag atcaaacact gttttagaaa 4620<br />
acttcctgta aacaggccta ttgattggaa agtatgtcaa aggattgtgg gtcttttggg 4680<br />
ctttgctgct ccatttacac aatgtggata tcctgcctta atgcctttgt atgcatgtat 4740<br />
acaagctaaa caggctttca ctttctcgcc aacttacaag gcctttctaa gtaaacagta 4800<br />
catgaacctt taccccgttg ctcggcaacg gcctggtctg tgccaagtgt ttgctgacgc 4860<br />
aacccccact ggctggggct tggccatagg ccatcagcgc atgcgtggaa cctttgtggc 4920<br />
tcctctgccg atccatactg cggaactcct agccgcttgt tttgctcgca gccggtctgg 4980<br />
agcaaagctc ataggaactg acaattctgt cgtcctctcg cggaaatata catcgtttcg 5040
24<br />
atctacgtat gatctttttc cctctgccaa aaattatggg gacatcatga agccccttga 5100<br />
gcatctgact tctggctaat aaaggaaatt tattttcatt gcaatagtgt gttggaattt 5160<br />
tttgtgtctc tcactcggaa ggaattctgc attaatgaat cggccaacgc gcggggagag 5220<br />
gcggtttgcg tattgggcgc tcttccgctt cctcgctcac tgactcgctg cgctcggtcg 5280<br />
ttcggctgcg gcgagcggta tcagctcact caaaggcggt aatacggtta tccacagaat 5340<br />
caggggataa cgcaggaaag aacatgtgag caaaaggcca gcaaaaggcc aggaaccgta 5400<br />
aaaaggccgc gttgctggcg tttttccata ggctccgccc ccctgacgag catcacaaaa 5460<br />
atcgacgctc aagtcagagg tggcgaaacc cgacaggact ataaagatac caggcgtttc 5520<br />
cccctggaag ctccctcgtg cgctctcctg ttccgaccct gccgcttacc ggatacctgt 5580<br />
ccgcctttct cccttcggga agcgtggcgc tttctcatag ctcacgctgt aggtatctca 5640<br />
gttcggtgta ggtcgttcgc tccaagctgg gctgtgtgca cgaacccccc gttcagcccg 5700<br />
accgctgcgc cttatccggt aactatcgtc ttgagtccaa cccggtaaga cacgacttat 5760<br />
cgccactggc agcagccact ggtaacagga ttagcagagc gaggtatgta ggcggtgcta 5820<br />
cagagttctt gaagtggtgg cctaactacg gctacactag aagaacagta tttggtatct 5880<br />
gcgctctgct gaagccagtt accttcggaa aaagagttgg tagctcttga tccggcaaac 5940<br />
aaaccaccgc tggtagcggt ggtttttttg tttgcaagca gcagattacg cgcagaaaaa 6000<br />
aaggatctca agaagatcct ttgatctttt ctacggggtc tgacgctcag tggaacgaaa 6060<br />
actcacgtta agggattttg gtcatgagat tatcaaaaag gatcttcacc tagatccttt 6120<br />
taaattaaaa atgaagtttt aaatcaatct aaagtatata tgagtaaact tggtctgaca 6180<br />
gttaccaatg cttaatcagt gaggcaccta tctcagcgat ctgtctattt cgttcatcca 6240<br />
tagttgcctg actc 6254<br />
63<br />
18<br />
DNA<br />
Seqüência artificial<br />
63<br />
gccactctct tccgacac 18<br />
64<br />
19<br />
DNA<br />
Seqüência artificial<br />
64<br />
caagaacatc acacggaac 19<br />
65<br />
512<br />
PRT<br />
Vírus de herpes simplex 2<br />
65<br />
Met Ala Thr Asp Ile Asp Met Leu Ile Asp Leu Gly Leu Asp Leu Ser<br />
1 5 10 15<br />
Asp Ser Glu Leu Glu Glu Asp Ala Leu Glu Arg Asp Glu Glu Gly Arg<br />
20 25 30<br />
Arg Asp Asp Pro Glu Ser Asp Ser Ser Gly Glu Cys Ser Ser Ser Asp<br />
35 40 45<br />
Glu Asp Met Glu Asp Pro Cys Gly Asp Gly Gly Ala Glu Ala Ile Asp<br />
50 55 60<br />
Ala Ala Ile Pro Lys Gly Pro Pro Ala Arg Pro Glu Asp Ala Gly Thr<br />
65 70 75 80<br />
Pro Glu Ala Ser Thr Pro Arg Pro Ala Ala Arg Arg Gly Ala Asp Asp<br />
85 90 95<br />
Pro Pro Pro Ala Thr Thr Gly Val Trp Ser Arg Leu Gly Thr Arg Arg<br />
100 105 110<br />
Ser Ala Ser Pro Arg Glu Pro His Gly Gly Lys Val Ala Arg Ile Gln<br />
115 120 125<br />
Pro Pro Ser Thr Lys Ala Pro His Pro Arg Gly Gly Arg Arg Gly Arg<br />
130 135 140<br />
Arg Arg Gly Arg Gly Arg Tyr Gly Pro Gly Gly Ala Asp Ser Thr Pro<br />
145 150 155 160<br />
Asn Pro Arg Arg Arg Val Ser Arg Asn Ala His Asn Gln Gly Gly Arg<br />
165 170 175<br />
His Pro Ala Ser Ala Arg Thr Asp Gly Pro Gly Ala Thr His Gly Glu<br />
180 185 190
Ala Arg Arg Gly Gly Glu Gln Leu Asp Val Ser Gly Gly Pro Arg Pro<br />
195 200 205<br />
Arg Gly Thr Arg Gln Ala Pro Pro Pro Leu Met Ala Leu Ser Leu Thr<br />
210 215 220<br />
Pro Pro His Ala Asp Gly Arg Ala Pro Val Pro Glu Arg Lys Ala Pro<br />
225 230 235 240<br />
Ser Ala Asp Thr Ile Asp Pro Ala Val Arg Ala Val Leu Arg Ser Ile<br />
245 250 255<br />
Ser Glu Arg Ala Ala Val Glu Arg Ile Ser Glu Ser Phe Gly Arg Ser<br />
260 265 270<br />
Ala Leu Val Met Gln Asp Pro Phe Gly Gly Met Pro Phe Pro Ala Ala<br />
275 280 285<br />
Asn Ser Pro Trp Ala Pro Val Leu Ala Thr Gln Ala Gly Gly Phe Asp<br />
290 295 300<br />
Ala Glu Thr Arg Arg Val Ser Trp Glu Thr Leu Val Ala His Gly Pro<br />
305 310 315 320<br />
Ser Leu Tyr Arg Thr Phe Ala Ala Asn Pro Arg Ala Ala Ser Thr Ala<br />
325 330 335<br />
Lys Ala Met Arg Asp Cys Val Leu Arg Gln Glu Asn Leu Ile Glu Ala<br />
340 345 350<br />
Leu Ala Ser Ala Asp Glu Thr Leu Ala Trp Cys Lys Met Cys Ile His<br />
355 360 365<br />
His Asn Leu Pro Leu Arg Pro Gln Asp Pro Ile Ile Gly Thr Ala Ala<br />
370 375 380<br />
Ala Val Leu Glu Asn Leu Ala Thr Arg Leu Arg Pro Phe Leu Gln Cys<br />
385 390 395 400<br />
Tyr Leu Lys Ala Arg Gly Leu Cys Gly Leu Asp Asp Leu Cys Ser Arg<br />
405 410 415<br />
Arg Arg Leu Ser Asp Ile Lys Asp Ile Ala Ser Phe Val Leu Val Ile<br />
420 425 430<br />
Leu Ala Arg Leu Ala Asn Arg Val Glu Arg Gly Val Ser Glu Ile Asp<br />
435 440 445<br />
Tyr Thr Thr Val Gly Val Gly Ala Gly Glu Thr Met His Phe Tyr Ile<br />
450 455 460<br />
Pro Gly Ala Cys Met Ala Gly Leu Ile Glu Ile Leu Asp Thr His Arg<br />
465 470 475 480<br />
Gln Glu Cys Ser Ser Arg Val Cys Glu Leu Thr Ala Ser His Thr Ile<br />
485 490 495<br />
Ala Pro Leu Tyr Val His Gly Lys Tyr Phe Tyr Cys Asn Ser Leu Phe<br />
500 505 510<br />
66<br />
18<br />
PRT<br />
Vírus de herpes simplex 2<br />
66<br />
Arg Val Ser Trp Glu Thr Leu Val Ala His Gly Pro Ser Leu Tyr Arg<br />
1 5 10 15<br />
Thr Phe<br />
67<br />
18<br />
PRT<br />
Vírus de herpes simplex 2<br />
67<br />
Val Ala His Gly Pro Ser Leu Tyr Arg Thr Phe Ala Ala Asn Pro Arg<br />
1 5 10 15<br />
Ala Ala<br />
68<br />
9<br />
PRT<br />
Seqüência artificial<br />
68<br />
His Gly Pro Ser Leu Tyr Arg Thr Phe<br />
1 5<br />
25
26<br />
69<br />
11<br />
PRT<br />
Vírus de herpes simplex 2<br />
69<br />
Leu Tyr Arg Thr Phe Ala Ala Asn Pro Arg Ala<br />
1 5 10<br />
70<br />
11<br />
PRT<br />
Vírus de herpes simplex 1<br />
70<br />
Leu Tyr Arg Thr Phe Ala Gly Asn Pro Arg Ala<br />
1 5 10
1<br />
REIVINDICAÇÕES<br />
1. Construção de ácido nucleico adequada para a liberação a<br />
um indivíduo para induzir uma resposta imune contra antígeno de<br />
hemaglutinina (HA) do vírus da influenza, caracterizada pelo fato de que<br />
5 compreende:<br />
imediato maior de hCMV; e<br />
(i) uma seqüência promotora quimérica que compreende:<br />
(a) uma seqüência promotora inicial imediata de hCMV;<br />
(b) exon 1 e pelo menos uma parte do exon 2 do gene inicial<br />
10 (c) um intron heterólogo fornecido no lugar da região de intron<br />
A do gene inicial imediato maior de hCMV;<br />
(ii) uma seqüência codificadora em ligação operável com o<br />
promotor quimérico, onde a seqüência codificadora codifica um antígeno de<br />
hemaglutinina (HA) do vírus da influenza, um fragmento imunogênico deste<br />
15 ou uma variante imunogênica do dito antígeno ou fragmento tendo pelo<br />
menos 80% de homologia de aminoácido ao dito antígeno ou fragmento;<br />
(iii) uma seqüência líder não traduzida que é derivada da<br />
seqüência de antígeno HBVpreS2, seqüência de antígeno e de HBV ou<br />
seqüência de antígeno tipo 2gD de HSV e que está em ligação operável com o<br />
20 promotor quimérico; e<br />
(iv) uma seqüência realçadora que é derivada de uma região<br />
não traduzida 3' (UTR) de uma seqüência do HBsAg ou de uma seqüência de<br />
gene inicial imediata de CMV símio, que está em ligação operável com o<br />
promotor quimérico e que está a jusante da seqüência codificadora.<br />
25 2. Construção de ácido nucleico de acordo com a reivindicação<br />
1, caracterizada pelo fato de que a seqüência codificadora codifica mais do<br />
que um dito HA, fragmento ou variante imunogênica.<br />
3. Construção de ácido nucleico de acordo com a reivindicação<br />
2, caracterizada pelo fato de que a seqüência codificadora codifica um dito
2<br />
HA, fragmento ou variante de cada uma de três a cinco cepas da influenza<br />
diferentes.<br />
4. Construção de ácido nucleico de acordo com a reivindicação<br />
3, caracterizada pelo fato de que a seqüência codificadora codifica um dito<br />
5 HA, fragmento ou variante de cada um de três ou quatro cepas da influenza<br />
não pandêmicas.<br />
5. Construção de ácido nucleico de acordo com qualquer uma<br />
das reivindicações precedentes, caracterizada pelo fato de que a seqüência<br />
codificadora codifica um dito HA, fragmento ou variante de uma cepa da<br />
10 influenza pandêmica.<br />
6. Partículas carreadoras, caracterizadas pelo fato de que são<br />
revestidas com uma construção de ácido nucleico como definida em qualquer<br />
uma das reivindicações precedentes.<br />
7. Partículas carreadoras, caracterizadas pelo fato de serem<br />
15 revestidas com pelo menos duas construções diferentes de ácido nucleico<br />
como definida na reivindicação 1, em que cada dita construção codifica um<br />
dito HA, fragmento ou variante de uma cepa da influenza diferente.<br />
8. Partículas carreadoras de acordo com a reivindicação 7,<br />
caracterizadas pelo fato de que são revestidas com três a cinco das ditas<br />
20 construções diferentes.<br />
9. Partículas carreadoras de acordo com a reivindicação 8,<br />
caracterizadas pelo fato de que três ou quatro das ditas construções codificam<br />
um dito HA, fragmento ou variante de cepas diferentes da influenza não<br />
pandêmicas.<br />
25 10. Partículas carreadoras de acordo com qualquer uma das<br />
reivindicações de 7 a 9, caracterizadas pelo fato de que são revestidas com<br />
uma dita construção que codifica um dito HA, fragmento ou variante de uma<br />
cepa da influenza pandêmica.<br />
11. Partículas carreadoras de acordo com qualquer uma das
3<br />
reivindicações de 6 a 10, caracterizadas pelo fato de que também são<br />
revestidas com uma construção de ácido nucleico que compreende uma<br />
seqüência promotora e uma seqüência codificadora em ligação operável com<br />
o promotor, onde a seqüência codificadora codifica uma subunidade de toxina<br />
5 bacteriana que ribosile ADP, um fragmento desta com atividade adjuvante ou<br />
uma variante de cada uma destas tendo atividade adjuvante e tendo pelo<br />
menos 80% de homologia de aminoácido com a dita subunidade ou<br />
fragmento.<br />
12. Partículas carreadoras de acordo com a reivindicação 11,<br />
10 caracterizadas pelo fato de que a seqüência promotora é uma seqüência<br />
promotora quimérica que compreende:<br />
imediato maior de hCMV; e<br />
(a) uma seqüência promotora inicial imediata de hCMV;<br />
(b) exon 1 e pelo menos uma parte do exon 2 do gene inicial<br />
15 (c) um intron heterólogo fornecido no lugar da região de intron<br />
A do gene inicial imediato maior de hCMV.<br />
13. Partículas carreadoras de acordo com as reivindicações 11<br />
ou 12, caracterizadas pelo fato de que a subunidade de toxina bacteriana que<br />
ribosila ADP é selecionada da subunidade A da toxina do cólera, subunidade<br />
20 B da toxina do cólera, subunidade A da toxina instável ao calor da E. coli e<br />
subunidade B instável ao calor da E. coli.<br />
14. Partículas carreadoras de acordo com qualquer uma das<br />
reivindicações de 11 a 13, caracterizadas pelo fato de que a construção de<br />
ácido nucleico compreende duas seqüência codificadoras cada uma<br />
25 compreendendo uma dita subunidade, fragmento ou variante diferentes.<br />
15. Partículas carreadoras de acordo com a reivindicação 14,<br />
caracterizada pelo fato de que as duas seqüência codificadoras que codificam<br />
a subunidade A da toxina do cólera e a subunidade B da toxina do cólera<br />
respectivamente ou a subunidade A da toxina instável ao calor da E. coli e a
subunidade B instável ao calor da E. coli respectivamente.<br />
4<br />
16. Partículas carreadoras de acordo com qualquer uma das<br />
reivindicações de 11 a 15, caracterizadas pelo fato de que a construção de<br />
ácido nucleico compreende ainda:<br />
5 (a) uma seqüência líder não traduzida que é derivada da<br />
seqüência de antígeno HBVpreS2, seqüência de antígeno e de HBV ou<br />
seqüência de antígeno tipo 2gD de HSV e que está em ligação operável com o<br />
promotor quimérico; e<br />
(b) uma seqüência realçadora que é derivada de uma região<br />
10 não traduzida 3' (UTR) de uma seqüência do HBsAg ou de uma seqüência de<br />
15 ouro.<br />
gene inicial imediata de CMV símio, que está em ligação operável com o<br />
promotor quimérico e que está a jusante da seqüência codificadora.<br />
17. Partículas carreadoras de acordo com qualquer uma das<br />
reivindicações de 6 a 16, caracterizadas pelo fato de que são partículas de<br />
18. Receptáculo de dosagem para um dispositivo de liberação<br />
mediada por partícula, caracterizado pelo fato de que compreende partículas<br />
revestidas como definidas em qualquer uma das reivindicações de 6 a 17.<br />
19. Dispositivo de liberação mediada por partícula,<br />
20 caracterizado pelo fato de que é carregado com partículas revestidas como<br />
definidas em qualquer uma das reivindicações de 6 a 17.<br />
20. Dispositivo de liberação mediada por partícula de acordo<br />
com a reivindicação 19, caracterizado pelo fato de que é uma seringa isenta de<br />
agulha.<br />
25 21. Construção de ácido nucleico adequada para a liberação a<br />
um indivíduo para induzir uma resposta imune contra antígeno de<br />
hemaglutinina (HA) do vírus da influenza, caracterizada pelo fato de que<br />
compreende:<br />
(i) uma seqüência promotora quimérica que compreende:
imediato maior de hCMV; e<br />
5<br />
(a) uma seqüência promotora inicial imediata de hCMV;<br />
(b) exon 1 e pelo menos uma parte do exon 2 do gene inicial<br />
(c) um intron heterólogo fornecido no lugar da região de intron<br />
5 A do gene inicial imediato maior de hCMV; e<br />
promotor quimérico,<br />
(ii) uma seqüência codificadora em ligação operável com o<br />
onde a seqüência codificadora codifica um antígeno de<br />
hemaglutinina (HA) do vírus da influenza, um fragmento imunogênico deste<br />
10 ou uma variante imunogênica do dito antígeno ou fragmento tendo pelo<br />
menos 80% de homologia de aminoácido ao dito antígeno ou fragmento.<br />
22. Construção de ácido nucleico de acordo com a<br />
reivindicação 21, caracterizada pelo fato de que compreende ainda:<br />
(iii) uma seqüência líder não traduzida que é derivada da<br />
15 seqüência de antígeno HBVpreS2, seqüência de antígeno e de HBV ou<br />
seqüência de antígeno tipo 2gD de HSV e que está em ligação operável com o<br />
promotor quimérico; ou<br />
(iv) uma seqüência realçadora que é derivada de uma região<br />
não traduzida 3' (UTR) de uma seqüência do HBsAg ou de uma seqüência de<br />
20 gene inicial imediato de CMV símio, que está em ligação operável com o<br />
promotor quimérico e que está a jusante da seqüência codificadora.<br />
23. Construção de ácido nucleico de acordo com as<br />
reivindicações 21 ou 22, caracterizada pelo fato de que a seqüência<br />
codificadora codifica mais do que um do dito HA, fragmento ou variante<br />
25 imunogênica.<br />
24. Construção de ácido nucleico de acordo com a<br />
reivindicação 23, caracterizada pelo fato de que a seqüência codificadora<br />
codifica um dito HA, fragmento ou variante de cada um de três a cinco cepas<br />
da influenza diferentes.
6<br />
25. Construção de ácido nucleico de acordo com a<br />
reivindicação 24, caracterizada pelo fato de que a seqüência codificadora<br />
codifica um dito HA, fragmento ou variante de cada um de três ou quatro<br />
cepas da influenza não pandêmicas.<br />
5 26. Construção de ácido nucleico de acordo com qualquer uma<br />
das reivindicações de 21 a 25, caracterizada pelo fato de que a seqüência<br />
codificadora codifica um dito HA, fragmento ou variante de uma cepa da<br />
influenza pandêmica.<br />
27. Partículas carreadoras, caracterizadas pelo fato de que são<br />
10 revestidas com uma construção de ácido nucleico como definida em qualquer<br />
uma das reivindicações de 21 a 26.<br />
28. Partículas carreadoras, caracterizadas pelo fato de serem<br />
revestidas com pelo menos duas construções diferentes de ácido nucleico de<br />
acordo com a reivindicação 21, em que cada dita construção codifica um dito<br />
15 HA, fragmento ou variante de uma cepa da influenza diferente.<br />
29. Partículas carreadoras de acordo com a reivindicação 28,<br />
caracterizadas pelo fato de que são revestidas com três a cinco das ditas<br />
construções diferentes.<br />
30. Partículas carreadoras de acordo com a reivindicação 29,<br />
20 caracterizadas pelo fato de que três ou quatro das ditas construções codificam<br />
um dito HA, fragmento ou variante de cepas diferentes da influenza não<br />
pandêmicas.<br />
31. Partículas carreadoras de acordo com qualquer uma das<br />
reivindicações de 28 a 30, caracterizadas pelo fato de que são revestidas com<br />
25 uma dita construção que codifica um dito HA, fragmento ou variante de uma<br />
cepa da influenza pandêmica.<br />
32. Partículas carreadoras de acordo com qualquer uma das<br />
reivindicações de 27 a 31, caracterizadas pelo fato de que também são<br />
revestidas com uma construção de ácido nucleico que compreende uma
7<br />
seqüência promotora e uma seqüência codificadora em ligação operável com<br />
o promotor, onde a seqüência codificadora codifica uma subunidade de toxina<br />
bacteriana que ribosila ADP, um fragmento desta com atividade adjuvante ou<br />
uma variante de cada um destes tendo atividade adjuvante e tendo pelo menos<br />
5 80% de homologia de aminoácido com a dita subunidade ou fragmento.<br />
33. Partículas carreadoras de acordo com a reivindicação 32,<br />
caracterizadas pelo fato de que a seqüência promotora é uma seqüência<br />
promotora quimérica que compreende:<br />
(a) uma seqüência promotora inicial imediata de hCMV;<br />
10 (b) exon 1 e pelo menos uma parte do exon 2 do gene inicial<br />
imediato maior de hCMV; e<br />
(c) um intron heterólogo fornecido no lugar da região de intron<br />
A do gene inicial imediato maior de hCMV.<br />
34. Partículas carreadoras de acordo com as reivindicações 32<br />
15 ou 33, caracterizadas pelo fato de que a subunidade de toxina bacteriana que<br />
ribosila ADP é selecionada da subunidade A da toxina do cólera, subunidade<br />
B da toxina do cólera, subunidade A da toxina instável ao calor da E. coli e<br />
subunidade B instável ao calor da E. coli.<br />
35. Partículas carreadoras de acordo com qualquer uma das<br />
20 reivindicações de 32 a 34, caracterizadas pelo fato de que a construção de<br />
ácido nucleico compreende duas seqüência codificadoras cada uma<br />
compreendendo uma dita subunidade, fragmento ou variante diferentes.<br />
36. Partículas carreadoras de acordo com a reivindicação 35,<br />
caracterizadas pelo fato de que as duas seqüências codificadoras codificam a<br />
25 subunidade A da toxina do cólera e a subunidade B da toxina do cólera<br />
respectivamente ou a subunidade A da toxina instável ao calor da E. coli e a<br />
subunidade B instável ao calor da E. coli respectivamente.<br />
37. Partículas carreadoras de acordo com qualquer uma das<br />
reivindicações de 32 a 36, caracterizadas pelo fato de que a construção de
ácido nucleico compreende ainda:<br />
8<br />
(a) uma seqüência líder não traduzida que é derivada da<br />
seqüência de antígeno HBVpreS2, seqüência de antígeno e de HBV ou<br />
seqüência de antígeno tipo 2gD de HSV e que está em ligação operável com o<br />
5 promotor quimérico; e/ou<br />
(b) uma seqüência realçadora que é derivada de uma região<br />
não traduzida 3' (UTR) de uma seqüência do HBsAg ou de uma seqüência de<br />
gene inicial imediata de CMV símio, que está em ligação operável com o<br />
promotor quimérico e que está a jusante da seqüência codificadora.<br />
10 38. Partículas carreadoras de acordo com qualquer uma das<br />
reivindicações de 27 a 37, caracterizadas pelo fato de que são partículas de<br />
ouro.<br />
39. Receptáculo de dosagem para um dispositivo de liberação<br />
mediada por partícula, caracterizado pelo fato de que compreende partículas<br />
15 revestidas como definidas em qualquer uma das reivindicações de 27 a 38.<br />
40. Dispositivo de liberação mediada por partícula,<br />
caracterizado pelo fato de que é carregado com partículas revestidas como<br />
definidas em qualquer uma das reivindicações de 27 a 38.<br />
41. Dispositivo de liberação mediada por partícula de acordo<br />
20 com a reivindicação 40, caracterizado pelo fato de que é uma seringa isenta de<br />
agulha.<br />
42. Construção de ácido nucleico, caracterizada pelo fato de<br />
que compreende uma seqüência promotora quimérica e uma seqüência<br />
codificadora em ligação operável com o promotor quimérico, onde a<br />
25 seqüência codificadora codifica um antígeno do vírus da influenza, um<br />
fragmento imunogênico deste ou uma variante imunogênica do dito antígeno<br />
ou fragmento tendo pelo menos 80% de homologia de aminoácido ao dito<br />
antígeno ou fragmento e a seqüência promotora quimérica compreende:<br />
(a) uma seqüência promotora inicial imediata de hCMV;
imediato maior de hCMV; e<br />
9<br />
(b) exon 1 e pelo menos uma parte do exon 2 do gene inicial<br />
(c) um intron heterólogo fornecido no lugar da região de intron<br />
A do gene inicial imediato maior de hCMV.<br />
5 43. Construção de ácido nucleico de acordo com a<br />
reivindicação 42, caracterizada pelo fato de que o antígeno codificado é a<br />
hemaglutinina da influenza (HA), um fragmento imunogênico deste ou uma<br />
variante imunogênica com pelo menos 80% de homologia de seqüência de<br />
aminoácido a cada um.<br />
10 44. Construção de ácido nucleico de acordo com a<br />
reivindicação 42, caracterizada pelo fato de que o antígeno codificado é a<br />
neuraminidase da influenza (NA), M2, um fragmento imunogênico de cada<br />
um ou uma variante imunogênica tendo pelo menos 80% homologia de<br />
seqüência de aminoácido a qualquer um dos ditos NA, M2 ou fragmento.<br />
15 45. Construção de ácido nucleico de acordo com qualquer uma<br />
das reivindicações de 42 a 44, caracterizada pelo fato de que o antígeno da<br />
influenza, fragmento imunogênico ou variante é de uma cepa da influenza<br />
pandêmica.<br />
46. Construção de ácido nucleico de acordo com qualquer uma<br />
20 das reivindicações de 42 a 45, caracterizada pelo fato de que a construção<br />
codifica mais do que um antígeno da influenza, fragmento imunogênico ou<br />
variante imunogênica.<br />
47. Construção de ácido nucleico de acordo com a<br />
reivindicação 46, caracterizada pelo fato de que a construção codifica um<br />
25 antígeno da influenza pandêmico, fragmento imunogênico deste ou variante<br />
imunogênica do dito antígeno ou fragmento e um ou mais antígenos da<br />
influenza não pandêmicos, fragmento(s) imunogênico(s) deste ou variante(s)<br />
imunogênica(s) do(s) dito(s) antígeno(s) ou fragmento(s).<br />
48. Construção de ácido nucleico de acordo com as
10<br />
reivindicações 46 ou 47, caracterizada pelo fato de que pelo menos dois dos<br />
antígenos, fragmentos ou variantes diferentes codificados são do mesmo<br />
polipeptídeo da influenza de cepas diferentes de vírus da influenza.<br />
49. Construção de ácido nucleico, caracterizada pelo fato de<br />
5 que compreende uma seqüência promotora quimérica e uma seqüência<br />
codificadora em ligação operável com o promotor quimérico, onde a<br />
seqüência codificadora codifica uma subunidade de toxina bacteriana que<br />
ribosile ADP, um fragmento deste com atividade adjuvante ou uma variante<br />
de cada um destes tendo atividade adjuvante e tendo pelo menos 80% de<br />
10 homologia de aminoácido com a dita subunidade ou fragmento e a seqüência<br />
promotora quimérica compreende:<br />
imediato maior de hCMV; e<br />
(a) uma seqüência promotora inicial imediata de hCMV;<br />
(b) exon 1 e pelo menos uma parte do exon 2 do gene inicial<br />
15 (c) um intron heterólogo fornecido no lugar da região de intron<br />
A do gene inicial imediato maior de hCMV.<br />
50. Construção de ácido nucleico de acordo com a<br />
reivindicação 49, caracterizada pelo fato de que a subunidade de toxina<br />
bacteriana que ribosila ADP é selecionada da subunidade A da toxina do<br />
20 cólera, subunidade B da toxina do cólera, subunidade A da toxina instável ao<br />
calor da E. coli e subunidade B instável ao calor da E. coli.<br />
51. Construção de ácido nucleico de acordo com as<br />
reivindicações 49 ou 50, caracterizada pelo fato de que a construção de ácido<br />
nucleico compreende duas seqüência codificadoras cada uma compreendendo<br />
25 uma dita subunidade, fragmento ou variante diferentes e cada uma das quais<br />
está operavelmente ligada a um dito promotor quimérico.<br />
52. Construção de ácido nucleico de acordo com a<br />
reivindicação 51, caracterizada pelo fato de que as duas seqüências<br />
codificadoras codificam a subunidade A da toxina do cólera e a subunidade B
11<br />
da toxina do cólera respectivamente ou a subunidade A da toxina instável ao<br />
calor da E. coli e a subunidade B instável ao calor da E. coli respectivamente.<br />
53. Construção de ácido nucleico de acordo com as<br />
reivindicações 51 ou 52, caracterizada pelo fato de que as ditas duas<br />
5 seqüências codificadoras estão na orientação inversa.<br />
54. Construção de ácido nucleico de acordo com as<br />
reivindicações 51 ou 52, caracterizada pelo fato de que as ditas duas<br />
seqüências codificadoras estão na mesma orientação.<br />
55. Construção de ácido nucleico de acordo com qualquer uma<br />
10 das reivindicações de 42 a 54, caracterizada pelo fato de que a seqüência do<br />
promotor inicial imediato do hCMV (a) compreende:<br />
(i) a seqüência de nucleotídeo da SEQ ID NO: 1, nucleotídeos<br />
de 903 a 1587 da SEQ ID NO: 54, nucleotídeos de 1815 a 1935 da SEQ ID<br />
NO: 61, nucleotídeos de 1948 a 2632 da SEQ ID No: 61, nucleotídeos de<br />
15 1002 a 1686 da SEQ ID No: 62 e/ou nucleotídeos de 2624 a 3308 da SEQ ID<br />
No: 62;<br />
(ii) uma variante funcional de (i) que tenha pelo menos 80% de<br />
homologia de seqüência de nucleotídeo a uma ou mais das seqüências de (i);<br />
ou<br />
20 (iii) um fragmento funcional de (i) ou (ii).<br />
56. Construção de ácido nucleico de acordo com qualquer uma<br />
das reivindicações de 42 a 55, caracterizada pelo fato de que a seqüência de<br />
exon (b) compreende:<br />
(i) a seqüência de nucleotídeo da SEQ ID No.2, a seqüência de<br />
25 nucleotídeo dos nucleotídeos de 1588 a 1718 da SEQ ID No. 54, nucleotídeos<br />
de 1684 a 1814 da SEQ ID No: 61, nucleotídeos de 2633 a 2763 da SEQ ID<br />
NO: 61, nucleotídeos de 1687 a 1817 da SEQ ID No: 62 e/ou nucleotídeos de<br />
3309 a 3439 da SEQ ID No: 62;<br />
(ii) uma variante funcional de (i) que tenha pelo menos 80% de
12<br />
homologia de seqüência de nucleotídeo a uma ou mais das seqüências de (i);<br />
OU<br />
(iii) um fragmento funcional de (i) ou (ii).<br />
57. Construção de ácido nucleico de acordo com qualquer uma<br />
5 das reivindicações de 42 a 56, caracterizada pelo fato de que o intron<br />
heterólogo (c) compreende uma seqüência selecionada da seqüência de intron<br />
A do gene da insulina de rato, seqüência de intron A do gene da queratina de<br />
galinha, seqüência de intron A do gene da actina cardíaca de galinha, um<br />
fragmento funcional de qualquer um destes ou uma variante funcional de<br />
10 qualquer um dos precedentes.<br />
58. Construção de ácido nucleico de acordo com a<br />
reivindicação 57, caracterizada pelo fato de que a seqüência de intron A do<br />
gene da insulina de rato compreende:<br />
(i) a seqüência de nucleotídeo da SEQ ID NO: 3, a seqüência<br />
15 de nucleotídeo dos nucleotídeos de 1725 a 1857 da SEQ ID No. 54,<br />
nucleotídeos de 1545 a 1677 da SEQ ID No: 61, os nucleotídeos de 2770 a<br />
2902 da SEQ ID No: 61, os nucleotídeos de 1824 a 1956 da SEQ ID No: 62<br />
e/ou os nucleotídeos de 3446 a 3578 da SEQ ID No: 62;<br />
(ii) uma variante funcional de (i) que tem pelo menos 80% de<br />
20 homologia de seqüência de nucleotídeo a uma ou mais das seqüências de (i);<br />
OU<br />
(iii) um fragmento funcional de (i) ou (ii).<br />
59. Construção de ácido nucleico de acordo com qualquer uma<br />
das reivindicações de 42 a 58, caracterizada pelo fato de que a seqüência<br />
25 promotora quimérica compreende:<br />
(i) a seqüência de nucleotídeo da SEQ ID No. 4 ou a seqüência<br />
de nucleotídeo dos nucleotídeos de 903 a 1857 da SEQ ID No. 54;<br />
(ii) uma variante funcional de (i) que tem pelo menos 80% de<br />
homologia de seqüência de nucleotídeo a (i); ou
13<br />
(iii) um fragmento funcional de (i) ou (ii).<br />
60. Construção de ácido nucleico de acordo com qualquer uma<br />
das reivindicações de 42 a 59, caracterizada pelo fato de que compreende<br />
ainda:<br />
5 (a) uma seqüência líder não traduzida que é derivada da<br />
seqüência de antígeno HBVpreS2, seqüência de antígeno e de HBV ou<br />
seqüência de antígeno tipo 2gD de HSV e que está em ligação operável com o<br />
promotor quimérico; e/ou<br />
(b) uma seqüência realçadora que é derivada de uma região<br />
10 não traduzida 3' (UTR) de uma seqüência do HBsAg ou de uma seqüência de<br />
gene inicial imediata de CMV símio e que está em ligação operável com o<br />
promotor quimérico, em que a seqüência realçadora está a jusante do sítio de<br />
clonagem.<br />
61. Construção de ácido nucleico de acordo com a<br />
15 reivindicação 42, caracterizada pelo fato de que compreende:<br />
No: 14, ou<br />
seqüência à seqüência de (i);<br />
(i) a seqüência do vetor pPJV7563 fornecida como SEQ ID<br />
(ii) uma seqüência com pelo menos 60% de identidade de<br />
20 e a seqüência que codifica o dito antígeno, fragmento ou<br />
variante é fornecida nas ditas seqüências (i) ou (ii) de modo que a mesma<br />
esteja operavelmente ligada ao promotor quimérico.<br />
62. Construção de ácido nucleico de acordo com a<br />
reivindicação 61, caracterizada pelo fato de que a seqüência codificadora<br />
25 codifica um antígeno de HA, uma variante imunogênica deste ou um<br />
fragmento imunogênico de cada um.<br />
63. Construção de ácido nucleico de acordo com a<br />
reivindicação 42, caracterizada pelo fato de que compreende a seqüência do<br />
vetor pPJV1671 fornecida como a SEQ ID No: 54 ou uma seqüência com
14<br />
pelo menos 60% de identidade de seqüência a esta.<br />
64. Construção de ácido nucleico de acordo com a<br />
reivindicação 42, caracterizada pelo fato de que compreende a seqüência do<br />
vetor pPML7789 fornecida como a SEQ ID No: 59 ou uma seqüência com<br />
5 pelo menos 60% de identidade de seqüência a esta.<br />
65. Construção de ácido nucleico de acordo com a<br />
reivindicação 49, caracterizada pelo fato de que compreende a seqüência do<br />
vetor pPJV2012 fornecida pela SEQ ID No: 61 ou uma seqüência com pelo<br />
menos 60% de identidade de seqüência a esta.<br />
10 66. Construção de ácido nucleico de acordo com a<br />
reivindicação 49, caracterizada pelo fato de que compreende a seqüência do<br />
vetor pPJV7788 fornecida pela SEQ ID NO: 62 ou uma seqüência com pelo<br />
menos 60% de identidade de seqüência a esta.<br />
67. Construção de ácido nucleico, caracterizada pelo fato de<br />
15 que compreende uma seqüência promotora e uma seqüência codificadora<br />
operavelmente ligadas ao promotor, onde a seqüência codificadora codifica<br />
um antígeno do vírus da influenza, um fragmento imunogênico deste ou uma<br />
variante imunogênica do dito antígeno ou fragmento tendo pelo menos 80%<br />
de homologia de aminoácido ao dito antígeno ou fragmento e a construção<br />
20 compreende ainda:<br />
25 e/ou<br />
(a) uma seqüência líder não traduzida que é derivada da<br />
seqüência de antígeno HBVpreS2, seqüência de antígeno e de HBV ou<br />
seqüência de antígeno tipo 2gD de HSV, que está em ligação operável com a<br />
seqüência codificadora e promotor que é heterólogo à seqüência codificadora;<br />
(b) uma seqüência realçadora 3' da e operavelmente ligada à<br />
seqüência codificadora, onde a seqüência realçadora é derivada de uma UTR<br />
3' de uma seqüência do HBsAg ou de uma seqüência de gene inicial imediata<br />
de CMV símio, e a seqüência codificadora é heteróloga à seqüência
ealçadora 3'.<br />
15<br />
68. Construção de ácido nucleico de acordo com a<br />
reivindicação 67, caracterizada pelo fato de que o antígeno codificado é a<br />
hemaglutinina da influenza (HA), um fragmento imunogênico deste ou uma<br />
5 variante imunogênica com pelo menos 80% de homologia de seqüência de<br />
aminoácido a cada uma.<br />
69. Construção de ácido nucleico de acordo com a<br />
reivindicação 67, caracterizada pelo fato de que o antígeno codificado é a<br />
neuraminidase da influenza (NA) ou M2, um fragmento imunogênico de cada<br />
10 um ou uma variante imunogênica com pelo menos 80% de homologia de<br />
seqüência de aminoácido à dita NA, M2 ou fragmento.<br />
70. Construção de ácido nucleico de acordo com qualquer uma<br />
das reivindicações de 67 a 69, caracterizado pelo fato de que o antígeno da<br />
influenza codificado, fragmento imunogênico deste, ou variante imunogênica<br />
15 de cada um é de uma cepa da influenza pandêmica.<br />
71. Construção de ácido nucleico de acordo com qualquer uma<br />
das reivindicações de 67 a 70, caracterizada pelo fato de que a construção<br />
codifica mais do que um antígeno da influenza, fragmento imunogênico ou<br />
variante imunogênica.<br />
20 72. Construção de ácido nucleico de acordo com a<br />
reivindicação 71, caracterizada pelo fato de que a construção codifica um<br />
antígeno de uma cepa da influenza pandêmica, um fragmento imunogênico<br />
deste ou uma variante imunogênica do dito antígeno ou fragmento e um ou<br />
mais antígenos de uma cepa da influenza não pandêmica, fragmento(s)<br />
25 imunogênico(s) destes ou variante(s) imunogênica(s) do dito antígeno(s) ou<br />
fragmento(s).<br />
73. Construção de ácido nucleico de acordo com as<br />
reivindicações 71 ou 72, caracterizada pelo fato de que pelo menos dois dos<br />
antígenos diferentes, fragmentos ou variantes são do mesmo polipeptídeo da
16<br />
influenza de cepas diferentes do vírus da influenza.<br />
74. Construção de ácido nucleico, caracterizada pelo fato de<br />
que compreende uma seqüência promotora e uma seqüência codificadora<br />
operavelmente ligadas ao promotor, onde a seqüência codificadora codifica<br />
5 uma subunidade de toxina bacteriana que ribosila ADP, um fragmento desta<br />
com atividade adjuvante ou uma variante de cada um destes tendo atividade<br />
adjuvante e tendo pelo menos 80% de homologia de aminoácido com a dita<br />
subunidade ou fragmento e a construção compreende ainda:<br />
(a) uma seqüência líder não traduzida que é derivada da<br />
10 seqüência de antígeno HBVpreS2, seqüência de antígeno e de HBV ou<br />
seqüência de antígeno tipo 2gD de HSV, que está em ligação operável com a<br />
seqüência codificadora e promotor que é heterólogo à seqüência codificadora;<br />
e/ou<br />
(b) uma seqüência realçadora 3' da e operavelmente ligada à<br />
15 seqüência codificadora, onde a seqüência realçadora é derivada de uma UTR<br />
3' de uma seqüência do HBsAg ou de uma seqüência de gene inicial imediata<br />
de CMV símio, e a seqüência codificadora é heteróloga à seqüência<br />
realçadora 3'.<br />
75. Construção de ácido nucleico de acordo com a<br />
20 reivindicação 74, caracterizada pelo fato de que a subunidade de toxina<br />
bacteriana que ribosila ADP é selecionada da subunidade A da toxina do<br />
cólera, subunidade B da toxina do cólera, subunidade A da toxina instável ao<br />
calor da E. coli e subunidade B instável ao calor da E. coli.<br />
76. Construção de ácido nucleico de acordo com as<br />
25 reivindicações 74 ou 75, caracterizada pelo fato de que a construção de ácido<br />
nucleico compreende duas seqüência codificadoras cada uma compreendendo<br />
uma dita subunidade, fragmento ou variante diferentes e cada uma das quais<br />
está ligada ao dito promotor quimérico.<br />
77. Construção de ácido nucleico de acordo com a
17<br />
reivindicação 76, caracterizada pelo fato de que as duas seqüências<br />
codificadoras codificam a subunidade A da toxina do cólera e a subunidade B<br />
da toxina do cólera respectivamente ou a subunidade A da toxina instável ao<br />
calor da E. coli e a subunidade B instável ao calor da E. coli respectivamente.<br />
5 78. Construção de ácido nucleico de acordo com as<br />
reivindicações 76 ou 77, caracterizada pelo fato de que as ditas duas<br />
seqüências codificadoras estão na orientação inversa.<br />
79. Construção de ácido nucleico de acordo com as<br />
reivindicações 76 ou 77, caracterizada pelo fato de que as ditas duas<br />
10 seqüências codificadoras estão na mesma orientação.<br />
80. Construção de ácido nucleico de acordo com qualquer uma<br />
das reivindicações de 67 a 79, caracterizada pelo fato de que o promotor é<br />
selecionado da seqüência do promotor inicial imediato do hCMV, seqüência<br />
promotora do vírus da pseudo-raiva e seqüência promotora do vírus do<br />
15 sarcoma de Rous.<br />
81. Construção de ácido nucleico de acordo com qualquer uma<br />
das reivindicações de 67 a 80, caracterizada pelo fato de que a seqüência líder<br />
não traduzida compreende:<br />
(i) a seqüência de nucleotídeo da SEQ ID NO: 5, SEQ ID NO:<br />
20 6, SEQ ID NO: 7 ou nucleotídeos de 1864 a 1984 da SEQ ID NO: 54;<br />
(ii) uma variante funcional de (i) que tenha pelo menos 80% de<br />
homologia de seqüência de nucleotídeo a (i); ou<br />
(iii) um fragmento funcional de (i) ou (ii).<br />
82. Construção de ácido nucleico de acordo com qualquer uma<br />
25 das reivindicações de 67 a 81, caracterizada pelo fato de que a seqüência<br />
realçadora compreende:<br />
(i) a seqüência de nucleotídeo da SEQ ID NO: 8, SEQ ID NO:<br />
9, nucleotídeos de 3699 a 4231 da SEQ ID NO: 54, nucleotídeos de 3831 a<br />
4363 da SEQ ID NO: 61 e/ou de 4507 a 5038 da SEQ ID NO: 62;
18<br />
(ii) uma variante funcional de (i) que tenha pelo menos 80% de<br />
homologia de seqüência de nucleotídeo a uma dita seqüência (i); ou<br />
(iii) um fragmento funcional de (i) ou (ii).<br />
83. Construção de ácido nucleico de acordo com qualquer uma<br />
5 das reivindicações de 42 a 82, caracterizada pelo fato de que compreende<br />
ainda uma seqüência de poliadenilação.<br />
84. Construção de ácido nucleico de acordo com a<br />
reivindicação 83, caracterizada pelo fato de que a seqüência de poliadenilação<br />
é uma seqüência de poliadenilação de um gene selecionado do gene da beta-<br />
10 globina de coelho, genes inicial e tardio do vírus do papiloma humano (HPV),<br />
o gene HSV-2gB, um gene inicial imediato de CMV símio e o gene tardio<br />
HSVgD.<br />
85. Construção de ácido nucleico de acordo com a<br />
reivindicação 83, caracterizada pelo fato de que a seqüência de poliadenilação<br />
15 é selecionada da:<br />
(i) seqüência de nucleotídeo da SEQ ID NO: 10, SEQ ID NO:<br />
11, SEQ ID NO: 12, SEQ ID NO: 13, nucleotídeos de 4243 a 4373 da SEQ<br />
ID No: 54, nucleotídeos de 906 a 1038 da SEQ ID No: 61, nucleotídeos de<br />
4375 a 4050 da SEQ ID NO: 61, ou nucleotídeos de 2463 a 2593 da SEQ ID<br />
20 NO: 62;<br />
(ii) uma variante funcional de (i) que tenha pelo menos 80% de<br />
homologia de seqüência de nucleotídeo a uma dita seqüência (i); ou<br />
(iii) um fragmento funcional de (i) ou (ii).<br />
86. Construção de ácido nucleico de acordo com a<br />
25 reivindicação 42, caracterizada pelo fato de que compreende a seqüência da<br />
SEQ ID NO: 14.<br />
87. Construção de ácido nucleico de acordo com qualquer uma<br />
das reivindicações de 42 a 86, caracterizada pelo fato de que compreende<br />
ainda uma seqüência de nucleotídeo que codifique um peptídeo de sinal que é
19<br />
operavelmente ligado à seqüência que codifica o antígeno, subunidade de<br />
exotoxina, fragmento ou variante.<br />
88. Construção de ácido nucleico de acordo com a<br />
reivindicação 87, caracterizada pelo fato de que o peptídeo de sinal é<br />
5 selecionado do peptídeo de sinal de ativador de plasminogênio de tecido<br />
humano (hTPAsp), peptídeo de sinal da aprotinina, peptídeo de sinal da<br />
extensina do tabaco e peptídeo de sinal da lisosima de galinha.<br />
89. Construção de ácido nucleico de acordo com qualquer uma<br />
das reivindicações de 42 a 88, caracterizada pelo fato de que é um plasmídeo.<br />
10 90. População de construções de ácido nucleico, caracterizada<br />
pelo fato de que compreende pelo menos duas construções diferentes como<br />
definidas em qualquer uma das reivindicações de 42 a 89.<br />
91. População de construções de ácido nucleico, caracterizada<br />
pelo fato de que compreende pelo menos duas construções diferentes como<br />
15 definidas em qualquer uma das reivindicações de 42 a 48, 61 a 64 e 67 a 73<br />
que codifique antígenos da influenza diferentes, fragmentos imunogênicos<br />
destes ou variantes imunogênicas dos ditos antígenos ou fragmentos.<br />
92. População de construções de ácido nucleico de acordo com<br />
a reivindicação 91, caracterizada pelo fato de que compreende pelo menos<br />
20 três construções diferentes cada uma codificando um antígeno da influenza<br />
diferente, fragmento imunogênico ou variante imunogênica.<br />
93. População de construções de ácido nucleico de acordo com<br />
as reivindicações 91 ou 92, caracterizada pelo fato de que pelo menos dois<br />
dos antígenos diferentes são do mesmo polipeptídeo da influenza de cepas da<br />
25 influenza diferentes.<br />
94. População de construções de ácido nucleico de acordo com<br />
qualquer uma das reivindicações de 91 a 93, caracterizada pelo fato de que<br />
pelo menos dois dos antígenos, fragmentos ou variantes diferentes são de<br />
polipeptídeos da influenza diferentes da mesma ou de uma cepa da influenza
diferente.<br />
20<br />
95. População de construções de ácido nucleico de acordo com<br />
qualquer uma das reivindicações de 90 a 94, caracterizada pelo fato de que<br />
compreende pelo menos uma construção de acordo com qualquer uma das<br />
5 reivindicações de 49 a 54, 65, 66 e 74 a 79 que codifique uma dita subunidade<br />
de toxina bacteriana que ribosile ADP, fragmento desta ou variante desta.<br />
pelo fato de que:<br />
96. População de construções de ácido nucleico, caracterizada<br />
(i) pelo menos uma construção codifica uma subunidade de<br />
10 toxina bacteriana que ribosile ADP, um fragmento desta com atividade<br />
adjuvante ou uma variante de cada uma destas tendo atividade adjuvante e<br />
tendo pelo menos 80% de homologia de aminoácido à dita subunidade ou<br />
fragmento; e<br />
15 simples do herpes (HSV);<br />
(ii) pelo menos uma construção codifica um antígeno do vírus<br />
onde a seqüência que codifica a dita subunidade, fragmento ou<br />
variante e/ou o antígeno do HSV estão operavelmente ligados a um promotor<br />
quimérico que compreende:<br />
(a) uma seqüência promotora inicial imediata de hCMV;<br />
20 (b) exon 1 e pelo menos uma parte do exon 2 do gene inicial<br />
imediato maior de hCMV; e<br />
(c) um intron heterólogo fornecido no lugar da região de intron<br />
A do gene inicial imediato maior de hCMV.<br />
25 pelo fato de que:<br />
97. População de construções de ácido nucleico, caracterizada<br />
(i) pelo menos uma construção codifica uma subunidade de<br />
toxina bacteriana que ribosile ADP, um fragmento desta com atividade<br />
adjuvante ou uma variante de cada uma desta tendo atividade adjuvante e<br />
tendo pelo menos 80% de homologia de aminoácido à dita subunidade ou
fragmento; e<br />
21<br />
(ii) pelo menos uma construção codifica um antígeno de HSV,<br />
onde pelo menos uma das ditas construções compreende ainda:<br />
(a) uma seqüência líder não traduzida que seja derivada da<br />
5 seqüência de antígeno preS2 de HBV, seqüência de antígeno e de HBV ou<br />
seqüência de antígeno tipo 2 gD do HSV, que esteja em ligação operável com<br />
a seqüência codificadora da dita construção e um promotor que seja<br />
heterólogo à seqüência codificadora; e/ou<br />
(b) uma seqüência realçadora 3' da e operavelmente ligada à<br />
10 seqüência codificadora da dita construção, onde a seqüência realçadora é<br />
derivada de uma UTR 3' de uma seqüência do HBsAg ou de uma seqüência<br />
de gene inicial imediata de CMV símio, e a seqüência codificadora é<br />
heteróloga à seqüência realçadora 3'.<br />
15 pelo fato de que compreende:<br />
98. População de construções de ácido nucleico, caracterizada<br />
(i) uma primeira construção de ácido nucleico que compreenda<br />
uma seqüência promotora quimérica e uma seqüência codificadora em ligação<br />
operável com o promotor quimérico, onde a seqüência codificadora codifica<br />
uma subunidade de toxina bacteriana que ribosile ADP, um fragmento desta<br />
20 com atividade adjuvante ou uma variante de cada uma desta tendo atividade<br />
adjuvante e tendo pelo menos 80% de homologia de aminoácido à dita<br />
subunidade ou fragmento e a seqüência promotora quimérica compreende:<br />
25 imediato maior de hCMV; e<br />
(a) uma seqüência promotora inicial imediata de hCMV;<br />
(b) exon 1 e pelo menos uma parte do exon 2 do gene inicial<br />
(c) um intron heterólogo fornecido no lugar da região de intron<br />
A do gene inicial imediato maior de hCMV; e<br />
(ii) uma segunda construção de ácido nucleico que codifique<br />
pelo menos um antígeno do HSV.
pelo fato de que compreende:<br />
22<br />
99. População de construções de ácido nucleico, caracterizada<br />
(i) uma primeira construção de ácido nucleico que compreende<br />
uma seqüência promotora e uma seqüência codificadora operavelmente<br />
5 ligadas ao promotor, onde a seqüência codificadora codifica uma subunidade<br />
de toxina bacteriana que ribosile ADP, um fragmento desta com atividade<br />
adjuvante ou uma variante de cada uma destas tendo atividade adjuvante e<br />
tendo pelo menos 80% de homologia de aminoácido à dita subunidade ou<br />
fragmento e a construção compreende ainda:<br />
10 (a) uma seqüência líder não traduzida que seja derivada da<br />
seqüência de antígeno preS2 de HBV, seqüência de antígeno e de HBV ou<br />
seqüência de antígeno tipo 2 gD do HSV, que está em ligação operável com a<br />
seqüência codificadora e promotor que é heterólogo à seqüência codificadora;<br />
e/ou<br />
15 (b) uma seqüência realçadora 3' de e operavelmente ligada à<br />
seqüência codificadora, onde o realçador é derivado de uma UTR 3' de uma<br />
seqüência do HBsAg ou de uma seqüência de gene inicial imediata de CMV<br />
símio, e a seqüência codificadora é heteróloga à seqüência realçadora 3'.<br />
20 pelo menos um antígeno do HSV.<br />
(ii) uma segunda construção de ácido nucleico que codifique<br />
100. População de construções de ácido nucleico de acordo<br />
com a reivindicação 99, caracterizada pelo fato de que compreende:<br />
(i) uma primeira construção de ácido nucleico que compreenda<br />
a seqüência do vetor pPJV2012 fornecida pela SEQ ID NO: 61 ou uma<br />
25 seqüência com pelo menos 60% de identidade de seqüência a esta; e<br />
um antígeno de HSV.<br />
(ii) uma segunda construção de ácido nucleico que codifique<br />
101. Seqüência promotora quimérica isolada purificada,<br />
caracterizada pelo fato de que a seqüência promotora quimérica está de
acordo com qualquer uma das reivindicações de 42 e 55 a 57.<br />
23<br />
102. Partículas revestidas, caracterizadas pelo fato de que<br />
compreendem partículas carreadoras revestidas com uma construção de ácido<br />
nucleico como definida em qualquer uma das reivindicações de 42 a 89 ou<br />
5 uma população de construções de ácido nucleico como definidas em qualquer<br />
uma das reivindicações de 90 a 100.<br />
103. Partículas revestidas de acordo com a reivindicação 102,<br />
caracterizadas pelo fato de que as partículas carreadoras são partículas de<br />
ouro.<br />
10 104. Receptáculo de dosagem para um dispositivo de liberação<br />
mediada por partícula, caracterizado pelo fato de que compreende partículas<br />
revestidas como definidas nas reivindicações 102 ou 103.<br />
105. Dispositivo de liberação mediada por partícula,<br />
caracterizado pelo fato de que é carregado com partículas revestidas como<br />
15 definidas nas reivindicações 102 ou 103.<br />
106. Dispositivo de liberação mediada por partícula de acordo<br />
com a reivindicação 105, caracterizado pelo fato de que é uma seringa isenta<br />
de agulha.<br />
107. Composição farmacêutica, caracterizada pelo fato de que<br />
20 compreende uma construção de ácido nucleico como definida em qualquer<br />
uma das reivindicações de 42 a 89 ou uma população de construções de ácido<br />
nucleico como definidas em qualquer uma das reivindicações de 90 a 100<br />
juntas com um carreador ou excipiente farmaceuticamente aceitáveis.<br />
108. Composição de vacina, caracterizada pelo fato de que<br />
25 compreende uma construção de ácido nucleico como definida em qualquer<br />
uma das reivindicações de 42 a 89 ou uma população de construções de ácido<br />
nucleico como definida em qualquer uma das reivindicações de 90 a 100.<br />
109. Composição de vacina de acordo com a reivindicação<br />
108, caracterizada pelo fato de que é um vacina multivalente que compreende
24<br />
pelo menos duas construções diferentes como definidas em qualquer uma das<br />
reivindicações de 42 a 48, 61 a 64, e 67 a 73 que codifique antígenos da<br />
influenza diferentes, fragmentos imunogênicos destes ou variantes<br />
imunogênicas de cada um destes.<br />
5 110. Composição de vacina de acordo com a reivindicação<br />
109, caracterizada pelo fato de que é uma vacina da influenza trivalente,<br />
tetravalente ou pentavalente.<br />
111. Uso de uma construção de ácido nucleico como definida<br />
nas qualquer uma das reivindicações de 42 a 89, de uma população de<br />
10 construções de ácido nucleico como definidas em qualquer uma das<br />
reivindicações de 90 a 95 ou de partículas revestidas como definidas nas<br />
reivindicações 102 ou 103, caracterizado pelo fato de ser empregado na<br />
fabricação de um medicamento para a prevenção da influenza.<br />
112. Uso de acordo com a reivindicação 111, caracterizado<br />
15 pelo fato de que o medicamento deve ser liberado pela injeção, liberação de<br />
partícula transdérmica, inalação, tópica, oral, intranasal ou<br />
transmucosicamente.<br />
113. Uso de acordo com as reivindicações 111 ou 112,<br />
caracterizado pelo fato de que o medicamento deve ser liberado pela injeção<br />
20 isenta de agulha.<br />
114. Método in vitro de obter a expressão em células de<br />
mamífero de um polipeptídeo da influenza de interesse, caracterizado pelo<br />
fato de que compreende transferir para dentro das ditas células uma<br />
construção de ácido nucleico como definida em qualquer uma das<br />
25 reivindicações de 42 a 89, de uma população de construções de ácido nucleico<br />
como definida em qualquer uma das reivindicações de 90 a 95 ou partículas<br />
revestidas como definidas nas reivindicações 102 ou 103.
a expressão de HBsAg<br />
ron e/ou HBV3'- UTR par<br />
Co ntribu ição de i<br />
....à.: ...;.::::,-,,,,;,.:;;:.::;.:;; ,. ....:,:.... ,,, ::,..;:.„,,..-.;:.;iã .;.,::::::::.;:.-R-...:!:,i, ,.;:-.1-..:,-....,:: :::<br />
Eleme ntos prese ntes
0.2<br />
o<br />
RIA<br />
parou<br />
ül<br />
2/51<br />
Efeito da inclusão de intron na expressão de antígeno<br />
(média de três experimentos)<br />
Figura 2<br />
BetaGalIB15)<br />
Hessi (ssc
3/51<br />
Efeito de RIA, ENH sobre a expressão de beta-gal<br />
(média de três experimentos)<br />
Base RIA ENH RIAIEHH<br />
Vetor<br />
Figura 3<br />
!rimos'
4/51<br />
Efeito de intron RIA e inclusão de Enh do HBV na expressão<br />
de gD do HSV (média de 3 experimentos)<br />
Base Enh RIA R.Les/Ee<br />
Elemento adicionado ao vetor base<br />
Figura 4
MA<br />
Enh<br />
5/51<br />
- Efeito de RIA, ENH sobre a expressão<br />
(duas linhas, três reps por linha)<br />
Elementos de vetor<br />
R1A/Enh<br />
Figura 5<br />
t2SSC 1 II B16<br />
í<br />
Razão para vetor base
6/51<br />
Capacidades dos peptideos de sinal heterólogos para<br />
secretar SEAP ou fragmento hFc<br />
Peptideo de sinal<br />
Figura 6
w<br />
5<br />
i<br />
g<br />
-a<br />
o<br />
o o<br />
.<br />
'Mu/mi ou título de ponto final<br />
1 ID +<br />
0 0 0 0 0<br />
M<br />
.<br />
. .<br />
'' .".;,...<br />
. Á .<br />
i, . ..<br />
I. ''.<br />
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''''?': .<br />
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......S<br />
I .. .... ..<br />
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1.<br />
I .:"Ii"... 5 r<br />
... . .<br />
'' .1 '..5 ;'..1'<br />
.. 4; `4,,,<br />
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5<br />
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...<br />
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■<br />
' . ' .. . :1, ,,, .'- ,
pUC19<br />
rGlab pA<br />
desconhecido;<br />
HBVenh<br />
sítios de inserção CDS<br />
ATG-Nhe<br />
UTR 5' de HBV pré S2<br />
8/51<br />
Tn903, remanescentes de pUC4K<br />
Figura 8<br />
Tn903, remanescentes de pUC4K<br />
pUC19 MCS<br />
CMV Pro<br />
CMV Exonl/2<br />
Fusão Bam/BgI<br />
Rat Ins IntA
pUC19<br />
Origem Rep 1<br />
sítio EcoR1<br />
RBGpA<br />
Origem desconhecida<br />
HBsAg<br />
Figura 9<br />
9/51<br />
Tn903, remanescentes de pUC4K<br />
Tn903, remanescentes de pUC4K<br />
pUC19 MCS<br />
CMV Pro<br />
CMV Exon1/2<br />
Intron da insulina de rato<br />
UTR 5' de HBV pré S2
RBGpA<br />
HBVenh<br />
FISVgD<br />
PJV7400<br />
5299 pb<br />
Figura 10<br />
10/51<br />
Tn903, remanescentes de pUC4K<br />
KanR (Tn903)<br />
Tn903, remanescentes de pUC4K<br />
pUCI9 MCS<br />
CMVpro<br />
Exon1/2<br />
intron da insulina de rato<br />
HBV pre-S2
Glob pA<br />
pUC19<br />
pUC OR<br />
HB Venh<br />
11/51<br />
Tn903, remanescentes de pUC4K<br />
KanR (Tn903)<br />
Tn903, remanescentes de pUC4K<br />
pUC19 MCS<br />
CMV Pro<br />
M2<br />
UTR 5' de HBV pré S2 CMV Exonl /2<br />
intron da insulina de rato<br />
Figura 11
Glob pA<br />
HBVenh<br />
Bsp 1201 (200<br />
Bg11.1 (2001<br />
Bsp 1201 (1995<br />
Mrel (19852<br />
sítios de inserção de CDS<br />
ATG-Nhe<br />
UTR 5' de HBV pré S2<br />
12/51<br />
Tn903, remanescentes de pUC4K<br />
/<br />
CMV Exon1/2<br />
intron da insulina de rato<br />
Figura 12<br />
Tn903, remanescentes de pUC4K
opu2loo042-elnooren2p4M312<br />
plu2oReolomopuo22224.2rolmoZjnoonSeve2401224ortm2u2TeTeltnStmeloweoyezeppan21<br />
ungulTetrempop2upouonow..22treenomr2-602poffil4p222nen2mopureu2aruf)ffluolo2n2<br />
1.342222oelonnoTe4loo4r2regeuolopneettnre9coSo2otilugro2toOtreo24422~21.2232 -0?:).4<br />
o2oorantnrouuronool-e21.4op2u12249r2trenuenolpo -412-no2ue2lApp2o21.olgi2241<strong>A2</strong>-ezre.2<br />
regrproup22otiounoo24524Ste2poli.ReStorp2OontY42m22'22021eSuoRenuneorn22peo<br />
Arageonproo2ompdoromSur3223werool.2 -821.pAomorn'122oompo2o513233v2000Sto.423<br />
owootreSoco0454.2.agto2utoolo2o423122B).2 .452an2tolovel.52-e-4.2p2onopOrwap4p2o22'4202<br />
ranon000puloADo4.2loonunoot;p2poSpoor2oonSpoloo21.2opoolo2runp0000lliZo22<br />
toorve2eutitnountarOpoortn2o22;22r2 -eol5nolo2m2olrentainpoStOonSp0000aoopffffel<br />
roo4.3423224o22.32oZoonnmerAomunnoongureAmonntno2u2 .421notarrunuoSonr.21<br />
02,rolergeorooTep22~3122onetreoptop -com22oRdono2p22311.23122oio2o2p2oprSpn<br />
31.32opo4o2oonolo2o2224 ,0324.3.22ongEn2222agannao22o~o2ppuu2Sernopeo<br />
lopi.2124.4.mtn52112;212ulreoZgeoummtntnentnerpnlown2pi.roSe214.opoo2rESInoTem222<br />
Simeneroo2pl000mpop2m2orpTam2nIenumgreno2oploo;2012plyeenSlotnnnuop2<br />
ErroSr221N.82ooffro2o~p2ooEnoop -eunoSiouroor2oo2lopop22;0141.00re221232woff<br />
oSeojnoontwoonno2222p22pr00000rno2m2p2145;2tnao212}o1221.0022o -er322oloM000n<br />
uppore2reon2rann2nnamooneuaenonw2olanprollionnueep2 -egotmilwo2TeiOnpoffTe<br />
rgon2pome2Muuarogmeooldio2;43322241p4222;211E2SereoiSplaweenur2unoon -entrel.<br />
24334orrre~loromeoluRentozi2unto;r2 -enotookirae2222242n221.TerlEon422ffTeol.ion<br />
repooge14222,92rantmeognueorepooMp;r2 -n0322232t1.322Teon2or21.92oom22224.an22E2o<br />
SoNoireol2NoTraeoploo93.mtg2oopZi000terlanon22E349noni.o22120pOpoupOp;2222col<br />
r2roapp2SuoinnoopomouSloontmopo2no214parpgreounoionop22212p0ou222 -e2nre222uo<br />
NorRevorp000no22p32221.222 -cooppti2m.22-eareanoppnoni2oueopu24.2t2reool.2000<br />
opm22o2aeffinuo2Oon222ooffioSooloo2roareSoonSnooenr2reantooloae2314.191ootoowo<br />
o2ou2rfOloo2ol-egeol2pour2".1.32oTo2n2roOrtin-op422-E222422otn.212o25-6122off292retofi'au2<br />
42oopo20000merl2pAwvernoupB222ouninntreomo22442m2t222pro;03224 -eomonooplge<br />
toowe2222molor21422o2m222123222wepaeorAvo221.4322o2p2Opoounmoffowo;ailm3ffon<br />
plrogiffronporpomor222an,not2NorjeopapirogSpo2aoo22;grelnon24. -Brol2onOpul000<br />
oa2polgurooOppow-4.2 -~2orwei2u224222moi.93eanunoupe222<br />
necoo2our42-emoo122m2orSItre/nagbeku0002oopoodotnaoo2oorEionloog000nTern2So<br />
no-ce4e3ungoZoopRenTe;rpopoStyengeuro2292orp.nope42n -etwan2-epuSueue2wor.2112;<br />
roo2oorãworooi2juoloWnumggor421.tivewomnoje -424.12ucoo2p.roonnnoSSpeNtor2a43ffro<br />
ESeaungpm243 -e4-601.p000totm.231022~24_12opoingogEtnoffE2oloo223234~224gpoo<br />
'co2rolreeTeTeono~aoa&232owgeong000514uSpouo2o;2nrOup2oinori:e0004o2S2oTeo2o<br />
022olotn~uop324-coo2pposloZorronweoporm2ppopleo9B2p}22 -ffigtooge9120~4e32<br />
Se2runni221-e24021remenoti2-enuol-eoreaSTeopeAM1224aeo2222000m424oSire221.00<br />
weE434.1.01.~22-eowu2pouonunitnaceopo2o2roo2prrenrAnnooreoSpEgoweSagoccezeu<br />
rro-enrunp..2p2op2o2orwerOot2 -e232t2po2o2gE242ouromilboveroospopo2opeojtionolz<br />
oi2op2orproo2noon -evenon2no-e2gooppppo2TegoS-ereepSZTen2r2125733.4rtãlve2m2.2v2;r0-3<br />
BoltnE22212replennunurertal2op000m-ernuposrenirroTeageool2oloapone2o2pfflow4"<br />
ooTarro221E2RevepopSuonr2oaeopreedu22re2~42332 -euere2AnupoouyenoTeuv23<br />
meogenpro2prer2lrecopoWompuretn2r4n2plwepaup.rroonon242 -epoOploSlen9322<br />
19/£1<br />
£1, ein6u
WRG7284<br />
Fusão<br />
Deleta<br />
Promotor<br />
Introns, HBsAg<br />
3'UTR<br />
PJV7382<br />
deleta 5'UTR<br />
HBsAg e 5'<br />
de 3'UTR<br />
WRG7074<br />
deleta *----"}WR Ár RBGpA<br />
BGHpA<br />
deleta longo ArV<br />
gene KanR<br />
P 7530<br />
G7128 3'HBsAg/ 3'UTR<br />
promotor WRG7293/exons/5'HBsAg<br />
PJV7389 PCR gene KanR curto de pPJV7389<br />
P3V7496<br />
deleta Nhel PCR destituída de RA de Nhel de pPJB7389<br />
contendo<br />
RIA<br />
deleta gene M2<br />
deleta Ár"<br />
Nhel-Bg12<br />
PJV7549<br />
PJV7563<br />
PJV1671<br />
gene M2, 5' de 3'UTR de pPJV7468<br />
oligos para poliligador<br />
PCR seqüência codificadora de DNA H3 Panama HA<br />
Figura 14
Eco RJ (468L<br />
região BGHpA<br />
BOI (43<br />
HBV, Nef Seq<br />
HBVenh<br />
HBsAg<br />
5' -UTR de HBV pré S2<br />
CMV Exon2<br />
F.mIL1145.10<br />
rGlob pA<br />
llsal (438<br />
HBV, Nef Seq<br />
HBVenh<br />
pLIC19<br />
5590 Pb<br />
15/51<br />
Tn903, remanescentes de pUC4K<br />
Tn903, remanescentes de pUC4K<br />
CMV Pro<br />
Ikin(24 rGlob 1:04 6.4e1 dm)<br />
HBsAg<br />
5'-UTR de HBV pré S2<br />
CMV Exon2<br />
intob pp<br />
136 bp<br />
Figura 15a<br />
,,, CMV Exonl<br />
Infron A<br />
Tn903, remanescentes de pUC4K<br />
intron<br />
KanR (Tn903)<br />
Tn903, remanescentes de pUC4K<br />
CMV Pro<br />
CMV Exonl
pUC19<br />
rGlob pA<br />
HBV, Nef Seq PJV72134<br />
5590 pb<br />
HBVenh<br />
HBsAg<br />
5'-UTR de HBV pré S2<br />
iH1(2904, 904,<br />
CMV Exon2<br />
Tn903, remanescentes de pUC4K<br />
nor (losl<br />
rGlob pA<br />
HBV, Nef Seq<br />
pUC19<br />
HBVenh<br />
HBsAg<br />
PJV7293<br />
4759 pb<br />
16/51<br />
Tn903, remanescentes de pUC4K<br />
KanR (Tn903)<br />
intron A<br />
Xhol (1011)<br />
Tn903, remanescentes de pUC4K<br />
CMV Pro<br />
CMV Exonl<br />
fragmento de WRG7128<br />
1050 pares de base (molécula 4759 pares de base)<br />
Figura 15b<br />
Tn903, remanescentes de pUC4K<br />
KanR (Tn903)<br />
CMV Pro<br />
CMV Exon1<br />
C Exon2<br />
Bornal (2073)<br />
5'-UTR de HBV pré S2<br />
CMV Exonl<br />
CMV Exon2<br />
Baor Hl (2073)<br />
noi (0001)<br />
Tn903, remanescentes de pUC4K
Glob pA<br />
sgm(43 ,37)<br />
1-18V, Nef Seq<br />
HBVenh<br />
HBsAg<br />
5'-UTR de HBV pré S2<br />
CMV Exon2<br />
Tn903, remanescentes de pUC4K CMV Pro<br />
A7.7~<br />
rGlob pA<br />
pUC19<br />
HBVenh<br />
HBsAg<br />
17/51<br />
Tn903, remanescentes de pUC4K<br />
KanR (Tn903)<br />
Intron A<br />
27,01(Imn)<br />
Tn903, remanescentes de pUC4K<br />
CMV Pro<br />
CMV Exonl<br />
CMV Exonl<br />
CMV Exon2<br />
Tn903, remanescentes de pUC4K<br />
Xba 1 (2292)<br />
KanR (Tn903)<br />
)3zal (1081)<br />
5'-(1TR of HBV pre-S2<br />
.17.1am)<br />
fragmento de WRG7293<br />
1050 pares de base (molécula 4759 pares de base)<br />
HBVenh<br />
xm 1 01221 HBsAg 8d1 (423BI<br />
fragmento de WRG7128<br />
1050 pares de base (molécula 4759 pares de base)<br />
Figura 15c<br />
Tn903, remanescentes de pUC4K<br />
CMV Pro<br />
CMV Exon1/2<br />
5'-UTR de HBV pré S2
HBVenh<br />
HBVenh<br />
Scalt)1 (2873)<br />
HBsAg<br />
18/51<br />
Tn903, remanescentes de pUC4K<br />
KanR (Tn903)<br />
Tn903, remanescentes de pUC4K<br />
CMV Pro<br />
CfINV Exon1/2<br />
&mu (1720)<br />
intron de insulina de rato<br />
Mirei (1829)<br />
Eacial (1861)<br />
RIA Olhe BgllBam<br />
145 bp<br />
Figura 15e<br />
5'-UTR de HBV pré S2<br />
Tn903, remanescentes de pUC4K<br />
/<br />
KanR (Tn903)<br />
Tn903, remanescentes de pUC4K<br />
MV Pro<br />
CMV Exon 1/2<br />
Bam/Bgl fusion<br />
intron de insulina de rato<br />
.9.+131 (1359)<br />
5'-UTR de HBV pré S2
GIob pA<br />
pUC19<br />
HBVenh<br />
B^HI R)<br />
RBGpA<br />
HBVenh<br />
pUC19<br />
HBsAg<br />
HBsAg<br />
Tn903, remanescentes de pUC4K<br />
19/51<br />
KanR (Tn903)<br />
Tn903, remanescentes de pUC4K<br />
KanR (Tn903)<br />
Tn903, remanescentes de pUC4K<br />
CMV Pro<br />
CMV Exon1/2<br />
ast}11 Mrril<br />
5'-UTR de HBV pré S2<br />
RIA<br />
Rins hdron A<br />
147 bp<br />
KanR (Tn903)<br />
Dam Hl 0 431<br />
.4.01 ern Tn903, remanescentes de pUC4K<br />
maio<br />
Tn903, rernanéscentes de pUC4K<br />
&mus»<br />
CMV Pro<br />
CMV Exon1/2<br />
non<br />
intron de insulina de rato<br />
0.1 RIM<br />
Dm Hl C1214)<br />
5'-UTR de HBV pré S2<br />
P.)/73119<br />
875 bp<br />
Tn903, remanescentes de pUC4K<br />
Figura 15d<br />
10.<br />
Tn903, remanescentes de pUC4K<br />
KanR (Tn903)<br />
kal (553)<br />
Mal caro<br />
Tn903, remanescentes de pUC4K<br />
San MC)<br />
CMV Pro<br />
CMV Exon1/2<br />
intron de insulina de rato<br />
Nhd oco<br />
5'-UTR de HBV pré S2
Giob pA<br />
pUC19<br />
HBV Enh<br />
EcoRV (2499)<br />
rGlob pA<br />
HBVenh<br />
Bsp 1201 (200<br />
BOI (2001<br />
Bgi II (2285)<br />
M2<br />
PJV7549<br />
4043 pb<br />
20/51<br />
Tn903, remanescentes de pUC4K<br />
KanR (Tn903)<br />
Tn903, remanescentes de pUC4K<br />
CMV Pro<br />
CMV Exon1/2<br />
intron de insulina de rato<br />
BamHl (1859)<br />
5'-UTR de HBV pré S2<br />
ATG-Nhe<br />
Miei (1789)<br />
Tn903, remanescentes de pUC4K<br />
Bsp1201 (199 CMV Exon112<br />
Nliel (1989 ' intron de insulina de rato<br />
sítios de inserção de CDA<br />
ATG-Nhe<br />
5'-UTR de HBV pré S2<br />
Tn903, remanescentes de pUC4K<br />
NU (2) H3N2 Ru, 1201 (2060)<br />
H3N2<br />
2064 pb<br />
Figura 15f
sítio poliA<br />
região rB-glob Pa<br />
21/51<br />
Tn903, remanescentes de pUC4K<br />
KanR (Tn903)<br />
Remanescente ligador misc. CMV Pro<br />
Bsp1201 (3694)<br />
H3 HA CDS<br />
Tn903, remanescentes de pUC4K<br />
Remanescente Pucl9 MCS<br />
CMV Exon1/2<br />
Fusão Bam/BgI<br />
intron A de insulina de rato<br />
5'-UTR de HBV pré S2<br />
ATG-Nhe<br />
NheI (1939)<br />
(1) 1 10 20 30 ,40 ,50 65<br />
H3 PanarrB HA Natural Sequence (1) ,-1„c1,V.F.'NICLPG1,1bPS,T.471.4.0.111AVSPGTINKTI irN EiQIEVTNATELVOSSS<br />
H3 Panam) HA Enccded by pRIV1671 (1) MAS Wftiã.s^ãiÉIM:nia",~4±..AT-Lei.47álAçisitt...vriabumawsTELNQsss<br />
Consensos (1) KTIIALSYILCPFAMPGNENSTATLCIGHHAVSNGÉNkTiTNI±QtEVTNATELVQSSS
pPJV1671 XR-1<br />
pesquisa de pPJB1671<br />
22/51<br />
0 50 100<br />
Título de Hl<br />
Figura 17<br />
150 200
23/51<br />
—0— Vermelhidão<br />
_ Inchaço<br />
Descoloração<br />
Floculação<br />
X Coceira/desconforto<br />
Dia o 20<br />
40<br />
60<br />
Figura 18
Clínico<br />
Pesquisa<br />
Clinico<br />
Pesquisa<br />
Clinico<br />
-;13/11:1-4<br />
24/51<br />
H3<br />
o 100 200 300 400 500<br />
B<br />
o 60 100 160 200<br />
". -Yr.-<br />
Pesquisa .s'<br />
-; 4 ;<br />
H1<br />
5 10 15 25<br />
Título de Hl<br />
Figura 19
VN1194H5<br />
25/51<br />
25/51<br />
Figura 20<br />
KanR (Tn903)<br />
CMV Pro<br />
CMV Exon1/2<br />
Intron A de insulina de rato<br />
5'-UTR de HBV pré S2
Tn903, Remanescentes de pUC4K<br />
26/51<br />
1 GGCGTAATGC TCTGCCAGTG TTACAACCAA TTAACCAATT CTGATTAGAA<br />
CCGCATTACG AGACGGTCAC AATGTTGGTT AATTGGTTAA GACTAATCTT<br />
KanR (Tn903)<br />
51 AAACTCATCG AGCATCAAAT GAAACTGCAA TTTATTCATA TCAGGATTAT<br />
TTTGAGTAGC TCGTAGTTTA CTTTGACGTT AAATAAGTAT AGTCCTAATA<br />
KanR (Tn903)<br />
101 CAATACCATA TTTTTGAAAA AGCCGTTTCT GTAATGAAGG AGAAAACTCA<br />
GTTATGGTAT AAAAACTTTT TCGGCAAAGA CATTACTTCC TCTTTTGAGT<br />
KanR (Tn903)<br />
151 CCGAGGCAGT TCCATAGGAT GGCAAGATCC TGGTATCGGT CTGCGATTCC<br />
GGCTCCGTCA AGGTATCCTA CCGTTCTAGG ACCATAGCCA GACGCTAAGG<br />
KanR (Tn903)<br />
201 GACTCGTCCA ACATCAATAC AACCTATTAA TTTCCCCTCG TCAAAAATAA<br />
CTGAGCAGGT TGTAGTTATG TTGGATAATT AAAGGGGAGC AGTTTTTATT<br />
KanR (Tn903)<br />
251 GGTTATCAAG TGASAAATCA CCATGAGTGA CGACTGAATC CGGTGAGAAT<br />
CCAATAGTTC ACTCTTTAGT GGTACTCACT GCTGACTTAG GCCACTCTTA<br />
HindIII<br />
Nsil<br />
KanR (Tn903)<br />
301 GGCAAAAGCT TATGCATTTC TTTCCAGACT TGTTCAACAG GCCAGCCATT<br />
CCGTTTTCGA ATACGTAAAG AAAGGTCTGA ACAAGTTGTC CGGTCGGTAA<br />
KanR (Tn903)<br />
351 ACGCTCGTCA TCAAAATCAC TCGCATCAAC CAAACCGTTA TTCATTCGTG<br />
TGCGAGCAGT AGTTTTAGTG AGCGTAGTTG GTTTGGCAAT AAGTAAGCAC<br />
KanR (Tn903)<br />
401 ATTGCGCCTG AGCGAGACGA AATACGCGAT CGCTGTTAAA AGGACAATTA<br />
TAACGCGGAC TCGCTCTGCT TTATGCGCTA GCGACAATTT TCCTGTTAAT<br />
KanR (Tn903)<br />
451 CAAACAGGAA TCGAATGCAA CCGGCGCAGG AACACTGCCA GCGCATCAAC<br />
GTTTGTCCTT AGCTTACGTT GGCCGCGTCC TTGTGACGGT CGCGTAGTTG<br />
KanR (Tn903)<br />
501 AATATTTTCA CCTGAATCAG GATATTCTTC TAATACCTGG AATGCTGTTT<br />
TTATAAAAGT GGACTTAGTC CTATAAGAAG ATTATGGACC TTACGACAAA<br />
XmaI<br />
KanR (Tn903)<br />
SmaI NsiI<br />
551 TCCCGGGGAT CGCAGTGGTG AGTAACCATG CATCATCAGG AGTACGGATA<br />
AGGGCCCCTA GCGTCACCAC TCATTGGTAC GTAGTAGTCC TCATGCCTAT<br />
Figura 21a<br />
■
27/51<br />
KanR (Tn903)<br />
601 AAATGCTTGA TGGTCGGAAG AGGCATAAAT TCCGTCAGCC AGTTTAGTCT<br />
TTTACGAACT ACCAGCCTTC TCCGTATTTA AGGCAGTCGG TCAAATCAGA<br />
KanR (Tn903)<br />
651 GACCATCTCA TCTGTAACAT CATTGGCAAC GCTACCTTTG CCATGTTTCA<br />
CTGGTAGAGT AGACATTGTA GTAACCGTTG CGATGGAAAC GGTACAAAGT<br />
KanR (Tn903)<br />
701 GAAACAACTC TGGCGCATCG GGCTTCCCAT ACAATCGATA GATTGTCGCA<br />
CTTTGTTGAG ACCGCGTAGC CCGAAGGGTA TGTTAGCTAT CTAACAGCGT<br />
KanR (Tn903)<br />
751 CCTGATTGCC CGACATTATC GCGAGCCCAT TTATACCCAT ATAAATCAGC<br />
GGACTAACGG GCTGTAATAG CGCTCGGGTA AATATGGGTA TATTTAGTCG<br />
KanR (Tn903)<br />
XhoI<br />
801 ATCCATGTTG GAATTTAATC GCGGCCTCGA GCAAGACGTT TCCCGTTGAA<br />
TAGGTACAAC CTTAAATTAG CGCCGGAGCT CGTTCTGCAA AGGGCAACTT<br />
KanR (Tn903)<br />
Tn9 O 3 , Remanescentes de pUC4K<br />
pUC19 MCS<br />
SalI<br />
AccI<br />
851 TATGGCTCAT AACACCCCTT GTATTACTGT TTATGTAAGC AGACAGGTCG<br />
ATACCGAGTA TTGTGGGGAA CATAATGACA AATACATTCG TCTGTCCAGC<br />
pUC19 MCS<br />
SalI<br />
AccI<br />
CMV Pro<br />
901 ACAATATTGG CTATTGGCCA TTGCATACGT TGTATCTATA TCATAATATG<br />
TGTTATAACC GATAACCGGT AACGTATGCA ACATAGATAT AGTATTATAC<br />
CMV Pro<br />
951 TACATTTATA TTGGCTCATG TCCAATATGA CCGCCATGTT GACATTGATT<br />
ATGTAAATAT AACCGAGTAC AGGTTATACT GGCGGTACAA CTGTAACTAA<br />
CMV Pro<br />
SpeI<br />
1001 ATTGACTAGT TATTAATAGT AATCAATTAC GGGGTCATTA GTTCATAGCC<br />
TAACTGATCA ATAATTATCA TTAGTTAATG CCCCAGTAAT CAAGTATCGG<br />
Figura 21b
28/51<br />
CMV Pro<br />
1051 CATATATGGA GTTCCGCGTT ACATAACTTA CGGTAAATGG CCCGCCTGGC<br />
GTATATACCT CAAGGCGCAA TGTATTGAAT GCCATTTACC GGGCGGACCG<br />
CMV Pro<br />
1101 TGACCGCCCA ACGXCCCCCG CCCATTGACG TCAATAATGA CGTATGTTCC<br />
ACTGGCGGGT TGCTGGGGGC GGGTAACTGC AGTTATTACT GCATACAAGG<br />
CMV Pro<br />
1151 CATAGTAACG CCAATAGGGA CTTTCCATTG ACGTCAATGG GTGGAGTATT<br />
GTATCATTGC GGTTATCCCT GAAAGGTAAC TGCAGTTACC CACCTCATAA<br />
CMV Pro<br />
NdeI<br />
1201 TACGGTAAAC TGCCCACTTG GCAGTACATC AAGTGTATCA TATGCCAAGT<br />
ATGCCATTTG ACGGGTGAAC CGTCATGTAG TTCACATAGT ATACGGTTCA<br />
CMV Pro<br />
1251 CCGCCCCCTA TTGACGTCAA TGACGGTAAA TGGCCCGCCT GGCATTATGC<br />
GGCGGGGGAT AACTGCAGTT ACTGCCATTT ACCGGGCGGA CCGTAATACG<br />
CMV Pro<br />
1301 CCAGTACATG ACCTTACGGG ACTTTCCTAC TTGGCAGTAC ATCTACGTAT<br />
GGTCATGTAC TGGAATGCCC TGAAAGGATG AACCGTCATG TAGATGCATA<br />
CMV Pro<br />
NcoI<br />
1351 TAGTCATCGC TATTACCATG GTGATGCGGT TTTGGCAGTA CACCAATGGG<br />
ATCAGTAGCG ATAATGGTAC CACTACGCCA AAACCGTCAT GTGGTTACCC<br />
CMV Pro<br />
1401 CGTGGATAGC GGTTTGACTC ACGGGGATTT CCAAGTCTCC ACCCCATTGA<br />
GCACCTATCG CCAAACTGAG TGCCCCTAAA GGTTCAGAGG TGGGGTAACT<br />
CMV Pro<br />
1451 CGTCAATGGG AGTTTGTTTT GGCACCAAAA TCAACGGGAC TTTCCAAAAT<br />
GCAGTTACCC TCAAACAAAA CCGTGGTTTT AGTTGCCCTG AAAGGTTTTA<br />
CMV Pro<br />
1501 GTCGTAATAA CCCCGCCCCG TTGACGCAAA TGGGCGGTAG GCGTGTACGG<br />
CAGCATTATT GGGGCGGGGC AACTGCGTTT ACCCGCCATC CGCACATGCC<br />
Exon 1/2 de CMV<br />
CMV Pro<br />
Saci<br />
1551 TGGGAGGTCT ATATAAGCAG AGCTCGTTTA GTGAACCGTC AGATCGCCTG<br />
ACCCTCCAGA TATATTCGTC ICGAGCAAAT CACTTGGCAG TCTASCGGAC<br />
CMV Exon1/2<br />
1601 GAGACGCCAT CCACGCTGTT TTGACCTCCA TAGAAGACAC CGGGACCGAT<br />
CTCTGCGGTA GGTGCGACAA AACTGGAGGT ATCTTCTGTG GCCCTGGCTA<br />
Figura 21c
Eagl<br />
29/51<br />
Exon 1/2 de CMV<br />
1651 CCAGCCTCCG CGGCCGGGAA CGGTGCATTG GAACGCGGAT TCCCCGTGCC<br />
GGTCGGAGGC GCCGGCCCTT GCCACGTAAC CTTGCGCCTA AGGGGCACGG<br />
Bam/Bgl fusion<br />
Exon 1/2 de CMV Intron A da insulina de rato<br />
1701 AAGAGTGACT CACCGTCCGG ATCTCAGCAA GCAGGTATGT ACTCTCCAGG<br />
TTCTCACTGA GTGGCAGGCC TAGAGTCGTT CGTCCATACA TGAGAGGTCC<br />
Intron A da insulina de rato<br />
1751 GTGGGCCTGG CTTCCCCAGT CAAGACTCCA GGGATTTGAG GGACGCTGTG<br />
CACCCGGACC GAAGGGGTCA GTTCTGAGGT CCCTAAACTC CCTGCGACAC<br />
Intron A da insulina de rato<br />
1801 GGCTCTTCTC TTACATGTAC CTTTTGCTTG CCTCAACCCT GACTATCTTC<br />
CCGAGAAGAG AATGTACATG GAAAACGAAC GGAGTTGGGA CTGATAGAAG<br />
Rat Ins IntA 5'-UTRdeHBVpré-S2<br />
BaraH I<br />
1851 CAGGTCAGGA TCCCAGAGTC AGGGGTCTGT ATTTTCCTGC TGGTGGCTCC<br />
GTCCAGTCCT AGGGTCTCAG TCCCCAGACA TAAAAGGACG ACCACCGAGG<br />
5'-UTR de HBV pré-S2<br />
1901 AGTTCAGGAA CAGTAAACCC TGCTCCGAAT ATTGCCTCTC ACATCTCGTC<br />
TCAAGTCCTT GTCATTTGGG ACGAGGCTTA TAACGGAGAG TGTAGAGCAG<br />
ATG—Nhe<br />
5'-UTR de HBV pré-S2 VN1194H5<br />
NheI<br />
E K I<br />
1951 AATCTCCGCG AGGACTGGGG ACCCTGTGAC GAACATGGCT AGCGAGAAAA<br />
TTAGAGGCGC TCCTGACCCC TGGGACACTG CTTGTACCGA TCGCTCTTTT<br />
VN1194115<br />
. VLL FAI VSLV K S D Q I C<br />
2001 TAGTGCTTCT TTTTGCAATA GTCAGTCTTG TTAAAAGTGA TCAGATTTGC<br />
ATCACGAAGA AAAACGTTAT CAGTCAGAAC AATTTTCACT AGTCTAAACG<br />
VN1194H5<br />
IGYH ANN STE QVDT IME.<br />
2051 ATTGGTTACC ATGCAAACAA CTCGACAGAG CAGGTTGACA CAATAATGGA<br />
TAACCAATGG TACGTTTGTT GAGCTGTCTC GTCCAACTGT GTTATTACCT<br />
VN1194H5<br />
KNV TVTH A Q D I L E KTHN<br />
2101 AAAGAACGTT ACTGTTACAC ATGCCCAAGA CATACTGGAA AAGACACACA<br />
TTTCTTGCAA TGACAATGTG TACGGGTTCT GTATGACCTT TTCTGTGTGT<br />
Figura 21d
XbaI<br />
30/51<br />
VN1194H5<br />
G K L CDL D G V K PLI L R D<br />
2151 ATGGGAAGCT CTGCGATCTA GATGGAGTGA AGCCTCTAAT TTTGAGAGAT<br />
TACCCTTCGA GACGCTAGAT CTACCTCACT TCGGAGATTA AAACTCTCTA<br />
VN1194H5<br />
EcoRI<br />
C S V A GWL LGN PMCD E F I<br />
2201 TGTAGTGTAG CTGGATGGCT CCTCGGAAAC CCAATGTGTG ACGAATTCAT<br />
ACATCACATC GACCTACCGA GGAGCCTTTG GGTTACACAC TGCTTAAGTA<br />
VN1194H5<br />
NVP E W S Y IVE KAN PVND.<br />
2251 CAATGTGCCG GAATGGTCTT ACATAGTGGA GAAGGCCAAT CCAGTCAATG<br />
GTTACACGGC CTTACCAGAA TGTATCACCT CTTCCGGTTA GGTCAGTTAC<br />
VN1194H5<br />
LCY P G D FNDY EEL KHL<br />
2301 ACCTCTGTTA CCCAGGGGAT TTCAATGACT ATGAAGAATT GAAACACCTA<br />
TGGAGACAAT GGGTCCCCTA AAGTTACTGA TACTTCTTAA CTTTGTGGAT<br />
VN1194H5<br />
LSRI N H F E K I QIIP K S S<br />
2351 TTGAGCAGAA TAAACCATTT TGAGAAAATT CAGATCATCC CCAAAAGTTC<br />
AACTCGTCTT ATTTGGTAAA ACTCTTTTAA GTCTAGTAGG GGTTTTCAAG<br />
VN1194H5<br />
Saci<br />
WSS HEAS L G V S S A C P Y Q<br />
2401 TTGGTCCAGT CATGAAGCCT CATTGGGGGT GAGCTCAGCA TGTCCATACC<br />
AACCAGGTCA GTACTTCGGA GTAACCCCCA CTCGAGTCGT ACAGGTATGG<br />
VN1194H5<br />
G. K S S . FF R N V V W L I K K N<br />
2451 AGGGAAAGTC CTCCTTTTTC AGAAATGTGG TATGGCTTAT CAAAAAGAAC<br />
TCCCTTTCAG GAGGAAAAAG TCTTTACACC ATACCGAATA GTTTTTCTTG<br />
VN1194H5<br />
BglII<br />
---<br />
S T Y P TIKRSY NNTN Q E D<br />
2501 AGTACATACC CAACAATAAA GAGGAGCTAC AATAATACCA ACCAAGAAGA<br />
TCATGTATGG GTTGTTATTT CTCCTCGATG TTATTATGGT TGGTTCTTCT<br />
VN1194H5<br />
Figura 21e
BglII<br />
31/51<br />
LLV L W G I HHP NDA AEQT<br />
2551 TCTTTTGGTA CTGTGGGGGA TTCACCATCC TAATGATGCG GCAGAGCAGA<br />
AGAAAACCAT GACACCCCCT AAGTGGTAGG ATTACTACGC CGTCTCGTCT<br />
VN1194H5<br />
KLY Q N P T T Y I S V G T S T<br />
2601 CAAAGCTCTA TCAAAACCCA ACCACCTATA TTTCCGTTGG GACATCAACA<br />
GTTTCGAGAT AGTTTTGGGT TGGTGGATAT AAAGGCAACC CTGTAGTTGT<br />
VN1194H5<br />
L N Q R LVP RIA T R S K V N G<br />
2651 CTAAACCAGA GATTGGTACC AAGAATAGCT ACTAGATCCA AAGTAAACGG<br />
GATTTGGTCT CTAACCATGG TTCTTATCGA TGATCTAGGT TTCATTTGCC<br />
VN1194H5<br />
QSG RMEF F W T I L K P N D A<br />
2701 GCAAAGTGGA AGGATGGAGT TCTTCTGGAC AATTTTAAAA CCGAATGATG<br />
CGTTTCACCT TCCTACCTCA AGAAGACCTG TTAAAATTTT GGCTTACTAC<br />
VN1194H5<br />
NsiI<br />
INF ESN G N F I APE YAY<br />
2751 CAATCAACTT CGAGAGTAAN GGAAATTTCA TTGCTCCAGA ATATGCATAC<br />
GTTAGTTGAA GCTCTCATTA CCTTTAAAGT AACGAGGTCT TATACGTATG<br />
VN1194H5<br />
KIVK K G D STI MKSE LEY<br />
2801 AAAATTGTCA AGAAAGGGGA CTCAACAATT ATGAAAAGTG AATTGGAATA<br />
TTTTAACAGT TCTTTCCCCT GAGTTGTTAA TACTTTTCAC TTAACCTTAT<br />
VN1194H5<br />
GNC N T K C QTP M G A INSS.<br />
2851 TGGTAACTGC AACACCAAGT GTCAAACTCC AATGGGGGCG ATAAACTCTA<br />
ACCATTGACG TTGTGGTTCA CAGTTTGAGG TTACCCCCGC TATTTGAGAT<br />
VN1194H5<br />
SphI<br />
MPF H N I HPLT I G E C P K<br />
2901 GCATGCCATT CCACAATATA CACCCTCTCA CCATCGGGGA ATGCCCCAAA<br />
CGTACGGTAA GGTGTTATAT GTGGGAGAGT GGTAGCCCCT TACGGGGTTT<br />
VN1194H5<br />
YVKS NRL VLA T G L R N S P<br />
2951 TATGTGAAAT CAAACAGATT AGTCCTTGCG ACTGGGCTCA GAAATAGCCC<br />
ATACACTTTA GTTTGTCTAA TCAGGAACGC TGACCCGAGT CTTTATCGGG<br />
VN1194H5<br />
QRE RRRK KRG L F G AIAG<br />
3001 TCAAAGAGAG AGAAGAAGAA AAAAGAGAGG ATTATTTGGA GCTATAGCAG<br />
AGTTTCTCTC TCTTCTTCTT TTTTCTCTCC TAATAAACCT CGATATCGTC<br />
VN1194H5<br />
Figura 21f
32/51<br />
FIE GGW QGMV DGW Y G Y<br />
3051 GTTTTATAGA GGGAGGATGG CAGGGAATGG TAGATGGTTG GTATGGGTAC<br />
CAAAATATCT CCCTCCTACC GTCCCTTACC ATCTACCAAC CATACCCATG<br />
VN1194H5<br />
PstI<br />
HMSN E Q G S G Y AADK EST<br />
3101 CACCATAGCA ACGAGCAGGG GAGTGGGTAC GCTGCAGACA AAGAATCCAC<br />
GTGGTATCGT-TGCTCGTCCC CTCACCCATG CGACGTCTGT TTCTTAGGTG<br />
VN119455<br />
QKA IDGV T N K V N S IIDK<br />
3151 TCAAAAGGCA ATAGATGGAG TCACCAATAA GGTCAACTCG ATTATTGACA<br />
AGTTTTCCGT TATCTACCTC AGTGGTTATT CCAGTTGAGC TAATAAGTGT<br />
VN1194H5<br />
MNT Q F E A V G R E F N N L E<br />
3201 AAATGAACAC TCAGTTTGAG GCCGTTGGAA GGGAATTTAA CAACTTAGAA<br />
TTTACTTGTG AGTCAAACTC CGGCAACCTT CCCTTAAATT GTTGAATCTT<br />
VN1194H5<br />
RR,IE N L N KKMEDGF LDV<br />
3251 AGGAGAATAG AGAATTTAAA CAAGAAGATG GAAGACGGGT TCCTAGATGT<br />
TCCTCTTATC TCTTAAATTT GTTCTTCTAC CTTCTGCCCA AGGATCTACA<br />
VN1194145<br />
WTY NAEL LVL MEN E R T L<br />
3301 CTGGACTTAT AATGCTGAAC TTCTAGTTCT CATGGAAAAC GAGAGAACTC<br />
GACCTGAATA TTACGACTTG AAGATCAAGA GTACCTTTTG CTCTCTTGAG<br />
VN1194H5<br />
XbaI<br />
DFH D S N V K N L Y D K V R L<br />
3351 TAGACTTTCA TGACTCAAAT GTCAAGAACC TTTACGACAA GGTCCGACTA<br />
ATCTGAAAGT ACTGAGTTTA CAGTTCTTGG AAATGCTGTT CCAGGCTGAT<br />
VN1194H5<br />
QLRD NAK ELG N G C F EFY<br />
3401 CAGCTTAGGG ATAATGCAAA GGAGCTGGGT AACGGTTGTT TCGAGTTCTA<br />
GTCGAATCCC TATTACGTTT CCTCGACCCA TTGCCAACAA AGCTCAAGAT<br />
VN119455<br />
HKC DNEC MES VRN G T Y D<br />
3451 TCATAAATGT GATAATGAAT GTATGGAAAG TGTAAGAAAC GGAACGTATG<br />
AGTATTTACA CTATTACTTA CATACCTTTC ACATTCTTTG CCTTGCATAC<br />
VN1194H5<br />
YPQ YSE EARL KRE EIS<br />
3501 ACTACCCGCA GTATTCAGAA GAAGCAAGAC TAAAAAGAGA GGAAATAAGT<br />
TGATGGGCGT CATAAGTCTT CTTCGTTCTG ATTTTTCTCT CCTTTATTCA<br />
VN119455<br />
Figura 21g<br />
XbaI
33/51<br />
G V K L ESI G I Y Q I L S I Y S<br />
3551 GGAGTAAAAT TGGAATCAAT AGGAATTTAC CAAATATTGT CAATTTATTC<br />
CCTCATTTTA ACCTTAGTTA TCCTTAAATG GTTTATAACA GTTAAATAAG<br />
VN1194H5<br />
SacI<br />
TVA SSLA LAI MVA G L S L<br />
3601 TACAGTGGCG AGCTCCCTAG CACTGGCAAT CATGGTAGCT GGTCTATCCT<br />
ATGTCACCGC TCGAGGGATC GTGACCGTTA GTACCATCGA CCAGATAGGA<br />
VN1194H5<br />
WMC S N G S L Q C RICI<br />
3651 TATGGATGTG CTCCAATGGG TCGTTACAAT GCAGAATTTG CATTTAAATG<br />
ATACCTACAC GAGGTTACCC AGCAATGTTA CGTCTTAAAC GTAAATTTAC<br />
HBVenh<br />
Bsp120I<br />
3701 GGCCCTAACA AAACAAAAAG ATGGGGTTAT TCCCTAAACT TCATGGGTTA<br />
CCGGGATTGT TTTGTTTTTC TACCCCAATA AGGGATTTGA AGTACCCAAT<br />
HBVenh<br />
3751 CGTAATTGGA AGTTGGGGGA CATTGCCACA AGATCATATT GTACAAAAGA<br />
GCATTAACCT TCAACCCCCT GTAACGGTGT TCTAGTATAA CATGTTTTCT<br />
HBVenh<br />
3801 TCAAACACTG TTTTAGAAAA CTTCCTGTAA ACAGGCCTAT TGATTGGAAA<br />
AGTTTGTGAC AAAATCTTTT GAAGGACATT TGTCCGGATA ACTAACCTTT<br />
HBVenh<br />
3851 GTATGTCAAA GGATTGTGGG TCTTTTGGGC TTTGCTGCTC CATTTACACA<br />
CATACAGTTT CCTAACACCC AGAAAACCCG AAACGACGAG GTAAATGTGT<br />
HBVenh<br />
NsiI<br />
EcoRV AccI<br />
3901 ATGTGGATAT CCTGCCTTAA TGCCTTTGTA TGCATGTATA CAAGCTAAAC<br />
TACACCTATA GGACGGAATT ACGGAAACAT ACGTACATAT GTTCGATTTG<br />
HBVenh<br />
3951 AGGCTTTCAC TTTCTCGCCA ACTTACAAGG CCTTTCTAAG TAAACAGTAC<br />
TCCGAAAGTG AAAGAGCGGT TGAATGTTCC GGAAAGATTC ATTTGTCATG<br />
HBVenh<br />
4001 ATGAACCTTT ACCCCGTTGC TCGGCAACGG CCTGGTCTGT GCCAAGTGTT<br />
TACTTGGAAA TGGGGCAACG AGCCGTTGCC GGACCAGACA CGGTTCACAA<br />
Figura 21h<br />
Bsp120I
34/51<br />
HBVenh<br />
SphI<br />
4051 TGCTGACGCA ACCCCCACTG GCTGGGGCTT GGCCATAGGC CATCAGCGCA<br />
ACGACTGCGT TGGGGGTGAC CGACCCCGAA CCGGTATCCG GTAGTCGCGT<br />
HBVenh<br />
SphI<br />
4101 TGCGTGGAAC CTTTGTGGCT CCTCTGCCGA TCCATACTGC GGAACTCCTA<br />
ACGCACCTTG GAAACACCGA GGAGACGGCT AGGTATGACG CCTTGAGGAT<br />
HBVenh<br />
4151 GCCGCTTGTT TTGCTCGCAG CCGGTCTGGA GCAAAGCTCA TAGGAACTGA<br />
CGGCGAACAA AACGAGCGTC GGCCAGACCT CGTTTCGAGT ATCCTTGACT<br />
Unknown<br />
HBVenh rGlob pA<br />
4201 CAATTCTGTC GTCCTCTCGC GGAAATATAC ATCGTTTCGA TCTACGTATG<br />
GTTAAGACAG CAGGAGAGCG CCTTTATATG TAGCAAAGCT AGATGCATAC<br />
rGlob pA<br />
4251 ATCTTTTTCC CTCTGCCAAA AATTATGGGG ACATCATGAA GCCCCTTGAG<br />
TAGAAAAAGG GAGACGGTTT TTAATACCCC TGTAGTACTT CGGGGAACTC<br />
PolyA Site_l<br />
rGlob pA<br />
4301 CATCTGACTT CTGGCTAATA AAGGAAATTT ATTTTCATTG CAATAGTGTG<br />
GTAGACTGAA GACCGATTAT TTCCTTTAAA TAAAAGTAAC GTTATCACAC<br />
rGlob pA pUC19<br />
EcoRI<br />
4351 TTGGAATTTT TTGTGTCTCT CACTCGGAAG GAATTCTGCA TTAATGAATC<br />
AACCTTAAAA AACACAGAGA GTGAGCCTTC CTTAAGACGT AATTACTTAG<br />
pUC19<br />
4401 GGCCAACGCG CGGGGAGAGG CGGTTTGCGT ATTGGGCGCT CTTCCGCTTC<br />
CCGGTTGCGC GCCCCTCTCC GCCAAACGCA TAACCCGCGA GAAGGCGAAG<br />
pUC19<br />
4451 CTCGCTCACT GACTCGCTGC GCTCGGTCGT TCGGCTGCGG CGAGCGGTAT<br />
GAGCGAGTGA CTGAGCGACG CGAGCCAGCA AGCCGACGCC GCTCGCCATA<br />
pUC19<br />
4501 CAGCTCACTC AAAGGCGGTA ATACGGTTAT CCACAGAATC AGGGGATAAC<br />
GTCGAGTGAG TTTCCGCCAT TATGCCAATA GGTGTCTTAG TCCCCTATTG<br />
pUC19<br />
4551 GCAGGAAAGA ACATGTGAGC AAAAGGCCAG CAAAAGGCCA GGAACCGTAA<br />
CGTCCTTTCT TGTACACTCG TTTTCCGGTC GTTTTCCGGT CCTTGGCATT<br />
pUC19<br />
Figura 21i
35/51<br />
4601 AAAGGCCGCG TTGCTGGCGT TTTTCCATAG GCTCCGCCCC CCTGACGAGC<br />
TTTCCGGCGC AACGACCGCA AAAAGGTATC CGAGGCGGGG GGACTGCTCG<br />
pUC19<br />
4651 ATCACAAAAA TCGACGCTCA AGTCAGAGGT GGCGAAACCC GACAGGACTA<br />
TAGTGTTTTT AGCTGCGAGT TCAGTCTCCA CCGCTTTGGG CTGTCCTGAT<br />
pUC19<br />
4701 TAAAGATACC AGGCGTTTCC CCCTGGAAGC TCCCTCGTGC GCTCTCCTGT<br />
ATTTCTATGG TCCGCAAAGG GGGACCTTCG AGGGAGCACG CGAGAGGACA<br />
pUC19<br />
4751 TCCGACCCTG CCGCTTACCG GATACCTGTC CGCCTTTCTC CCTTCGGGAA<br />
AGGCTGGGAC GGCGAATGGC CTATGGACAG GCGGAAAGAG GGAASCCCTT<br />
pUC19<br />
4801 GCGTGGCGCT TTCTCATAGC TCACGCTGTA GGTATCTCAG TTCGGTGTAG<br />
CGCACCGCGA AAGAGTATCG AGTGCGACAT CCATAGAGTC AAGCCACATC<br />
1=19<br />
4851 GTCGTTCGCT CCAAGCTGGG CTGTGTGCAC GAACCCCCCG TTCAGCCCGA<br />
CAGCAAGCGA GGTTCGACCC GACACACGTG CTTGGGGGGC AAGTCGGGCT<br />
pUC19<br />
4901 CCGCTGCGCC TTATCCGGTA ACTATCGTCT TGAGTCCAAC CCGGTAAGAC<br />
GGCGACGCGG AATAGGCCAT TGATAGCAGA ACTCAGGTTG GGCCATTCTG<br />
pUC19<br />
4951 ACGACTTATC GCCACTGGCA GCAGCCACTG GTAACAGGAT TAGCAGAGCG<br />
TGCTGAATAG CGGTGACCGT CGTCGGTGAC CATTGTCCTA ATCGTCTCGC<br />
pUC19<br />
5001 AGGTATGTAG GCGGTGCTAC AGAGTTCTTG AAGTGGTGGC CTAACTACGG<br />
TCCATACATC CGCCACGATG TCTCAAGAAC TTCACCACCG GATTGATGCC<br />
pUC19<br />
5051 CTACACTAGA AGAACAGTAT TTGGTATCTG CGCTCTGCTG AAGCCAGTTA<br />
GATGTGATCT TCTTGTCATA AACCATAGAC GCGAGACGAC TTCGGTCAAT<br />
pUC19<br />
5101 CCTTCGGAAA AAGAGTTGGT AGCTCTTGAT CCGGCAAACA AACCACCGCT<br />
GGAAGCCTTT TTCTCAACCA TCGAGAACTA GGCCGTTTGT TTGGTGGCGA<br />
pUC19<br />
5151 GGTAGCGGTG GTTTTTTTGT TTGCAAGCAG CAGATTACGC GCAGAAAAAA<br />
CCATCGCCAC CAAAAAAACA AACGTTCGTC GTCTAATGCG CGTCTTTTTT<br />
pUC19<br />
5201 AGGATCTCAA GAAGATCCTT TGATCTTTTC TACGGGGTCT GACGCTCAGT<br />
TCCTAGAGTT CTTCTAGGAA ACTAGAAAAG ATGCCCCAGA CTGCGAGTCA<br />
Figura 21j
36/51<br />
pUC19<br />
5251 GGAACGAAAA CTCACGTTAA GGGATTTTGG TCATGAGATT ATCAAAAAGG<br />
CCTTGCTTTT GAGTGCAATT CCCTAAAACC AGTACTCTAA TAGTTTTTCC<br />
pUC19<br />
5301 ATCTTCACCT AGATCCTTTT AAATTAAAAA TGAAGTTTTA AATCAATCTA<br />
TAGAAGTGGA TCTAGGAAAA TTTAATTTTT ACTTCAAAAT TTAGTTAGAT<br />
pUC19<br />
5351 AAGTATATAT GAGTAAACTT GGTCTGACAG TTACCAATGC TTAATCAGTG<br />
TTCATATATA CTCATTTGAA CCAGACTGTC AATGGTTACG AATTAGTCAC<br />
pUC19<br />
5401 AGGCACCTAT CTCAGCGATC TGTCTATTTC GTTCATCCAT AGTTGCCTGA<br />
TCCGTGGATA GAGTCGCTAG ACAGATAAAG CAAGTAGGTA TCAACGGACT<br />
pUC19<br />
5451 CTC<br />
GAG<br />
Figura 21k
Sítio poliAl<br />
rGlob pA<br />
Desconhecido<br />
HBVenh<br />
pUC19<br />
37/51<br />
LTA CDS 4\1111111% -_,... .~-7-<br />
Lysozyme SP<br />
Tn903, remanescentes de pUC4K<br />
KanR (Tn903)<br />
49"INN<br />
W3.11/2012<br />
5578 pb<br />
N<br />
Tn903, remanescentes de pUC4K<br />
LTB CDS<br />
,Lisozima SP<br />
5'-UTR de HBV p ré-S<br />
Intron A da insulina de rato<br />
'P,' Fusão oBame 1n d CMV v<br />
.4'-<br />
-_--- ,.--g) Exon<br />
mCMVpro<br />
CMV Pro<br />
5'-UTR de HBV pré-S Exon 1/2 de CMV<br />
Intron A da insulina de rato Fusão Bam/BgI<br />
Figura 22<br />
RBGpA
inserto LT A<br />
inserto CMV pro<br />
regiões não traduzidas, CLSP<br />
recriar MCS<br />
recriar MCS<br />
PJV7592<br />
Al<br />
aceitador<br />
PJV2012<br />
38/51<br />
v<br />
Figura 23<br />
PJV7591<br />
doador<br />
inserto LT B<br />
inserto 3' de regiões não<br />
traduzidas, CLSP<br />
ligar o cassete de expressão LT B e<br />
fragmento de vetor aceitador
1 GGCGTAATGC TCTGCCASTG TTACAACCAA TTAACCAATT CTGATTAGAA AAACTCATCG AGCATCAAAT GAAACTGCAA TTTATTCATA TCAGGATTAT<br />
CCGCATTACG AGACGGTCAC AATGTTGGTT AATTGGTTAA GACTAATCTT TTTGAGTAGC TCGTAGTTTA CTTTGACGTT AAATAAGTAT AGTCCTAATA<br />
KanR (Tn903)<br />
101 CAATACCATA TTTTTGAAAA AGCCGTTTCT GTAATGAAGG AGAAAACTCA CCGAGGCAGT TCCATAGGAT GGCAAGATCC TGGTATCGGT CTGCGATTCC<br />
GTTATGGTAT AAAAACTTTT TCGGCAAAGA CATTACTTCC TCTTTTGAGT GGCTCCGTCA AGGTATCCTA CCGTTCTAGG ACCATAGCCA GACGCTAAGG<br />
KanR (Tn903)<br />
201 GACTCGTCCA ACATCAATAC AACCTATTAA TTTCCCCTCG TCAAAAATAA GGTTATCAAG TGAGAAATCA CCATGAGTGA CGACTGAATC CGGTGAGAAT<br />
CTGAGCAGGT TGTAGTTATG TTGGATAATT AAAGGGGAGC AGTTTTTATT CCAATAGTTC ACTCTTTAGT GGTACTCACT GCTGACTTAG GCCACTCTTA<br />
HindIII<br />
KanR (Tn903)<br />
301 GGCAAAAGCT TATGCATTTC TTTCCAGACT TGTTCAACAG GCCAGCCATT ACGCTCGTCA TCAAAATCAC TCGCATCAAC CAAACCGTTA TTCATTCGTG<br />
CCGTTTTCGA ATACGTAAAG AAAGGTCTGA ACAAGTTGTC CGGTCGGTAA TGCGAGCAGT AGTTTTAGTG AGCGTAGTTG GTTTGGCAAT AAGTAAGCAC<br />
KanR (Tn903)<br />
401 ATTGCGCCTG AGCGAGACGA AATACGCGAT CGCTGTTAAA AGGACAATTA CAAACAGGAA TCAAATGCAA CCGGCGCAGG AACACTGCCA GCGCATCAAC<br />
TAACGCGGAC TCGCTCTGCT TTATGCGCTA GCGACAATTT TCCTGTTAAT GTTTGTCCTT AGTTTACGTT GGCCGCGTCC TTGTGACGGT CGCGTAGTTG<br />
KanR (Tn903)<br />
501 AATATTTTCA CCTGAATCAG GATATTCTTC TAATACCTGG AATGCTGTTT TCCCGGGGAT CGCAGTGGTG AGTAACCATG CATCATCAGG AGTACGGATA<br />
TTATAAAAGT GGACTTAGTC CTATAAGAAG ATTATGGACC TTACGACAAA AGGGCCCCTA GCGTCACCAC TCATTGGTAC GTAGTAGTCC TCATGCCTAT<br />
KanR (Tn903)<br />
601 AAATGCTTGA TGGTCGGAAG AGGCATAAAT TCCGTCAGCC AGTTTAGTCT GACCATCTCA TCTGTAACAT CATTGGCAAC GCTACCTTTG CCATGTTTCA<br />
TTTACGAACT ACCAGCCTTC TCCGTATTTA AGGCAGTCGG TCAAATCAGA CTGGTAGAGT AGACATTGTA GTAACCGTTG CGATGGAAAC GGTACAAAGT<br />
KanR (Tn903)<br />
701 GAAACAACTC TGGCGCATCG GGCTTCCCAT ACAATCGATA GATTGTCGCA CCTGATTGCC CGACATTATC GCGAGCCCAT TTATACCCAT ATAAATCAGC<br />
CTTTGTTGAG ACCGCGTAGC CCGAAGGGTA TGTTAGCTAT CTAACAGCGT GGACTAACGG GCTGTAATAG CGCTCGGGTA AATATGGGTA TATTTAGTCG<br />
KanR (Tn903)<br />
801 ATCCATGTTG GAATTTAATC GCGGCCTCGA GCAAGACGTT TCCCGTTGAA TATGGCTCAT AACACCCCTT GTATTACTGT TTATGTAAGC AGACAGGTCG<br />
TAGGTACAAC CTTAAATTAG CGCCGGAGCT CGTTCTGCAA AGGGCAACTT ATACCGAGTA TTGTGGGGAA CATAATGACA AATACATTCG TCTGTCCAGC<br />
KanR (Tn903)<br />
901 ACAATTCCTT CCGAGTGAGA GACACAAAAA ATTCCAACAC ACTATTGCAA TGAAAATAAA TTTCCTTTAT TAGCCAGAAG TCAGATGCTC AAGGGGCTTC<br />
TGTTAAGGAA GGCTCACTCT CTGTGTTTTT TAAGGTTGTG TGATAACGTT ACTTTTATTT AAAGGAAATA ATCGGTCTTC AGTCTACGAG TTCCCCGAAG<br />
Figura 24a
1001 ATGATGTCCC CATAATTTTT GGCAGAGGGA AAAAGATCCC TAGTTTTCCA TACTGATTGC CGCAATTGAA TTGGGGGTTT TATTATTCCA TACACATAAT<br />
TACTACAGGG GTATTAAAAA CCGTCTCCCT TTTTCTAGGG ATCAAAAGGT ATGACTAACG GCGTTAACTT AACCCCCAAA ATAATAAGGT ATGTGTATTA<br />
LTB CDS<br />
1101 TTATCAATTT TGGTCTCGGT CAGATATGTG ATTCTTAATG TGTCCTTCAT CCTTTCAATG GCTTTTTTTT GGGAGTCTAT ATGTTGACTG CCCGGGACTT<br />
AATASTTAAA ACCAGAGCCA GTCTATACAC TAAGAATTAC ACAGGAAGTA GGAAAGTTAC CGAAAAAAAA CCCTCAGATA TACAACTGAC GGGCCCTGAA<br />
LTB CDS<br />
1201 CGACCTGAAA TGTTGCGCCG CTCTTAAATG TAATGATAAC CATTTCTCTT TTGCCTGCCA TCGATTCCGT ATATGATAGT ATCTTGTCAT TTATCGTATA<br />
GCTGGACTTT ACAACGCGGC GAGAATTTAC ATTACTATTG GTAAAGAGAA AACGGACGGT AGCTAAGGCA TATACTATCA TAGAACAGTA AATAGCATAT<br />
LTB CDS<br />
1301 TATTTGTGTG TTGCGATATT CCGAACATAG TTCTGTAATA GACTGGGGAG CGCTAGCCCC CAGAGCAGCC AGGGGCAGGA AGCAAAGCAC CAAGATTAGC<br />
ATAAACACAC AACGCTATAA GGCTTGTATC AAGACATTAT CTGACCCCTC GCGATCGGGG GTCTCGTCGG TCCCCGTCCT TCGTTTCGTG GTTCTAATCG<br />
LTB CDS<br />
1401 AAAGACCTAC TAGCCATGTT CGTCACAGGG TCCCCAGTCC TCGCGGAGAT TGACGAGATG TGAGAGGCAA TATTCGGAGC AGGGTTTACT GTTCCTGAAC<br />
TTTCTGGATG ATCGGTACAA GCAGTGTCCC AGGGGTCAGG AGCGCCTCTA ACTGCTCTAC ACTCTCCGTT ATAAGCCTCG TCCCAAATGA CAAGGACTTG<br />
BamHI<br />
NheI<br />
5'-UTR de HBV pré-S2<br />
1501 TGGAGCCACC AGCAGGAAAA TACAGACCCC TGACTCTGGG ATCCTGACCT GGAAGATAGT CAGGGTTGAG GCAAGCAAAA GGTACATGTA AGAGAAGAGC<br />
ACCTCGGTGG TCGTCCTTTT ATGTCTGGGG ACTGAGACCC TAGGACTGGA CCTTCTATCA GTCCCAACTC CGTTCGTTTT CCATGTACAT TCTCTTCTCG<br />
5'-UTR of HBV pre-S2<br />
1601 CCACAGCGTC CCTCAAATCC CTGGAGTCTT GACTGGGGAA GCCAGGCCCA CCCTGGAGAG TACATACCTG CTTGCTGAGA TCCGGACGGT GAGTCACTCT<br />
GGTGTCGCAG GGAGTTTAGG GACCTCAGAA CTGACCCCTT CGGTCCGGGT GGGACCTCTC ATGTATGGAC GAACGACTCT AGGCCTGCCA CTCAGTGAGA<br />
1701 TGGCACGGGG AATCCGCGTT CCAATGCACC GTTCCCGGCC GCGGAGGCTG GATCGGTCCC GGTGTCTTCT ATGGAGGTCA AAACAGCGTG GATGGCGTCT<br />
ACCGTGCCCC TTAGGCGCAA GGTTACGTGG CAAGGGCCGG CGCCTCCGAC CTAGCCAGGG CCACAGAAGA TACCTCCAGT TTTGTCGCAC CTACCGCAGA<br />
1801 CCAGGCGATC TGACGGTTCA CTAAACGAGC TCTGCTTATA TAGACCTCCC ACCGTACACG CCTACCGCCC ATTTGCGTCA ACGGGGCGGG GTTATTACGA<br />
GGTCCGCTAG ACTGCCAAGT GATTTGCTCG AGACGAATAT ATCTGGAGGG TGGCATGTGC GGATGGCGGG TAAACGCAGT TGCCCCGCCC CAATAATGCT<br />
PstI<br />
1901 CATTTTGGAA AGTCCCGTTG ATTTTGGTGC TCGACCTGCA GGTCGACAAT ATTGGCTATT GGCCATTGCA TACGTTGTAT CTATATCATA ATATGTACAT<br />
GTAAAACCTT TCAGGGCAAC TAAAACCACG AGCTGGACGT CCAGCTGTTA TAACCGATAA CCGGTAACGT ATGCAACATA GATATAGTAT TATACATGTA<br />
2001 TTATATTGGC TCATGTCCAA TATGACCGCC ATGTTGACAT TGATTATTGA CTAGTTATTA ATAGTAATCA ATTACGGGGT CATTAGTTCA TAGCCCATAT<br />
AATATAACCG AGTACAGGTT ATACTGGCGG TACAACTGTA ACTAATAACT GATCAATAAT TATCATTAGT TAATGCCCCA GTAATCAAGT ATCGGGTATA<br />
Figura 24b
2101 ATGGAGTTCC GCGTTACATA ACTTACGGTA AATGGCCCGC CTGGCTGACC GCCCAACGAC CCCCGCCCAT TGACGTCAAT AATGACGTAT GTTCCCATAG<br />
TACCTCAAGG CGCAATGTAT TGAATGCCAT TTACCGGGCG GACCGACTGG CGGGTTGCTG GGGGCGGGTA ACTGCAGTTA TTACTGCATA CAAGGGTATC<br />
2201 TAACGCCAAT AGGGACTTTC CATTGACGTC AATGGGTGGA GTATTTACGG TAAACTGCCC ACTTGGCAGT ACATCAAGTG TATCATATGC CAAGTCCGCC<br />
ATTGCGGTTA TCCCTGAAAG GTAACTGCAG TTACCCACCT CATAAATGCC ATTTGACGGG TGAACCGTCA TGTAGTTCAC ATAGTATACG GTTCAGGCGG<br />
2301 CCCTATTGAC GTCAATGACG GTAAATGGCC CGCCTGGCAT TATGCCCAGT ACATGACCTT ACGGGACTTT CCTACTTGGC AGTACATCTA CGTATTAGTC<br />
GGGATAAcTG CAGTTACTGC CATTTACCGG GCGGACCGTA ATACGGGTCA TGTACTGGAA TGCCCTGAAA GGATGAACCG TCATGTAGAT GCATAATCAG<br />
2401 ATCGCTATTA CCATGGTGAT GCGGTTTTGG CAGTACACCA ATGGGCGTGG ATAGCGGTTT GACTCACGGG GATTTCCAAG TCTCCACCCC ATTGACGTCA<br />
TAGCGATAAT GGTACCACTA CGCCAAAACC GTCATGTGGT TACCCGCACC TATCGCCAAA CTGAGTGCCC CTAAAGGTTC AGAGGTGGGG TAACTGCAGT<br />
2501 ATGGGAGTTT GTTTTGGCAC CAAAATCAAC GGGACTTTCC AAAATGTCGT AATAACCCCG CCCCGTTGAC GCAAATGGGC GGTAGGCGTG TACGGTGGGA<br />
TACCCTCAAA CAAAACéGTG GTTTTAGTTG CCCTGAAAGG TTTTACAGCA TTATTGGGGC GGGGCAACTG CGTTTACCCG CCATCCGCAC ATGCCACCCT<br />
2601 GGTCTATATA AGCAGAGCTC GTTTAGTGAA CCGTCAGATC GCCTGGAGAC GCCATCCACG CTGTTTTGAC CTCCATAGAA GACACCGGGA CCGATCCAGC<br />
CCAGATATAT TCGTCTCGAG CAAATCACTT GGCAGTCTAG CGGACCTCTG CGGTAGGTGC GACAAAACTG GAGGTATCTT CTGTGGCCCT GGCTAGGTCG<br />
2701 CTCCGCGGCC GGGAACGGTG CATTGGAACG CGGATTCCCC GTGCCAAGAG TGACTCACCG TCCGGATCTC AGCAAGCAGG TAXGTACTCT.CCAGGGTGGG<br />
GAGGCGCCGG CCCTTGCCAC GTAACCTTGC GCCTAAGGGG CACGGTTCTC ACTGAGTGGC AGGCCTAGAG TCGTTCGTCC ATACATGAGA GGTCCCACCC<br />
2801 CCTGGCTTCC CCAGTCAAGA CTCCAGGGAT TTGAGGGACG CTGTGGGCTC TTCTCTTACA TGTACCTTTT GCTTGCCTCA ACCCTGACTA TCTTCCAGGT<br />
GGACCGAAGG GGTCAGTTCT GAGGTCCCTA AACTCCCTGC GACACCCGAG AAGAGAATGT ACATGGAAAA CGAACGGAGT TGGGACTGAT AGAAGGTCCA<br />
5'-UTR of HBV pre-S2<br />
BamHI<br />
2901 CAGGATCCCA GAGTCAGGGG TCTGTATTTT CCTGCTGGTG GCTCCAGTTC AGGAACAGTA AACCCTGCTC CGAATATTGC CTCTCACATC TCGTCAATCT<br />
GTCCTAGGGT CTCAGTCCCC AGACATAAAA GGACGACCAC CGAGGTCAAG TCCTTGTCAT TTGGGACGAG GCTTATAACG GAGAGTGTAG AGCAGTTAGA<br />
5'-UTR de HBV pré-S2<br />
LTA CDS<br />
3001 CCGCGAGGAC TGGGGACCCT GTGACGAACA TGGCTAGTAG GTCTTTGCTA ATCTTGGTGC TTTGCTTCCT GCCCCTGGCT GCTCTGGGGG CTAGCAATGG<br />
GGCGCTCCTG ACCCCTGGGA CACTGCTTGT ACCGATCATC CAGAAACGAT TAGAACCACG AAACGAAGGA CGGGGACCGA CGAGACCCCC GATCGTTACC<br />
LTA CDS<br />
3101 CGACAAATTA TACCGTGCTG ACTCTAGACC CCCAGATGAA ATAAAACGTT CCGGAGGTCT TATGCCCAGA GGGCATAATG AGTACTTCGA TAGAGGAACT<br />
GCTGTTTAAT ATGGCACGAC TGAGATCTGG GGGTCTACTT TATTTTGCAA GGCCTCCAGA ATACGGGTCT CCCGTATTAC TCATGAAGCT ATCTCCTTGA<br />
LTA CDS<br />
3201 CAAATGAATA TTAATCTTTA TGATCACGCG AGAGGAACAC AAACCGGCTT TGTCAGATAT GATGACGGAT ATGTTTCCAC TTCTCTTAGT TTGAGAAGTG<br />
GTTTACTTAT AATTAGAAAT ACTAGTGCGC TCTCCTTGTG TTTGGCCGAA ACAGTCTATA CTACTGCCTA TACAAAGGTG AAGAGAATCA AACTCTTCAC<br />
LTA CDS<br />
Figura 24c<br />
NheI
3301 CTCACTTAGC AGGACAGTCT ATATTATCAG GATATTCCAC TTACTATATA TATGTTATAG CGACAGCACC AAATATGTTT AATGTTAATG ATGTATTAGG<br />
GAGTGAATCG TCCTGTCAGA TATAATAGTC CTATAAGGTG AATGATATAT ATACAATATC GCTGTCGTGG TTTATACAAA TTACAATTAC TACATAATCC<br />
LTA CDS<br />
3401 CGTATACAGC CCTCACCCAT ATGAACAGGA GGTTTCTGCG TTAGGTGGAA TACCATATTC TCAGATATAT GGATGGTATC GTGTTAATTT TGGTGTGATT<br />
GCATATGTCG GGAGTGGGTA TACTTGTCCT CCAAAGACGC AATCCACCTT ATGGTATAAG AGTCTATATA CCTACCATAG CACAATTAAA ACCACACTAA<br />
LTA CDS<br />
3501 GATGAACGAT TACATCGTAA CAGGGAATAT AGAGACCGGT ATTACAGAAA TCTGAATATA GCTCCGGCAG AGGATGGTTA CAGATTAGCA GGTTTCCCAC<br />
CTACTTGCTA ATGTAGCATT GTCCCTTATA TCTCTGGCCA TAATGTCTTT AGACTTATAT CGAGGCCGTC TCCTACCAAT GTCTAATCGT CCAAAGGGTG<br />
LTA CDS<br />
HindIII<br />
3601 CGGATCACCA AGCTTGGAGA GAAGAACCCT GGATTCATCA TGCACCACAA GGTTGTGGAA ATTCATCAAG AACAATTACA GGTGATACTT GTAATGAGGA<br />
GCCTAGTGGT TCGAACCTCT CTTCTTGGGA CCTAAGTAGT ACGTGGTGTT CCAACACCTT TAAGTAGTTC TTGTTAATGT CCACTATGAA CATTACTCCT<br />
LTA CDS<br />
EcoRI<br />
3701 GACCCAGAAT CTGAGCACAA TATATCTCAG GAAATATCAA TCAAAAGTTA AGAGGCAGAT ATTTTCAGAC TATCAGTCAG AGGTTGACAT ATATAACAGA<br />
CTGGGTCTTA GACTCGTGTT ATATAGAGTC CTTTATAGTT AGTTTTCAAT TCTCCGTCTA TAAAAGTCTG ATAGTCAGTC TCCAACTGTA TATATTGTCT<br />
LTA CDS<br />
CJI<br />
s,<br />
EcoRI<br />
3801 ATTCGGGATG AATTATGAGG ATCTGGGCCC TAACAAAACA AAAAGATGGG GTTATTCCCT AAACTTCATG GGTTACGTAA TTGGAAGTTG GGGGACATTG<br />
TAAGCCCTAC TTAATACTCC TAGACCCGGG ATTGTTTTGT TTTTCTACCC CAATAAGGGA TTTGAAGTAC CCAATGCATT AACCTTCAAC CCCCTGTAAC<br />
3901 CCACAAGATC ATATTGTACA AAAGATCAAA CACTGTTTTA GAAAACTTCC TGTAAACAGG CCTATTGATT GGAAAGTATG TCAAAGGATT GTGGGTCTTT<br />
GGTGTTCTAG TATAACATGT TTTCTAGTTT GTGACAAAAT CTTTTGAAGG ACATTTGTCC GGATAACTAA CCTTTCATAC AGTTTCCTAA CACCCAGAAA<br />
4001 TGGGCTTTGC TGCTCCATTT ACACAATGTG GATATCCTGC CTTAATGCCT TTGTATGCAT GTATACAAGC TAAACAGGCT TTCACTTTCT CGCCAACTTA<br />
ACCCGAAACG ACGAGGTAAA TGTGTTACAC CTATAGGACG GAATTACGGA AACATACGTA CATATGTTCG ATTTGTCCGA AAGTGAAAGA GCGGTTGAAT<br />
4101 CAAGGCCTTT CTAAGTAAAC AGTACATGAA CCTTTACCCC GTTGCTCGGC AACGGCCTGG TCTGTGCCAA GTGTTTGCTG ACGCAACCCC CACTGGCTGG<br />
GTTCCGGAAA GATTCATTTG TCATGTACTT GGAAATGGGG CAACGAGCCG TTGCCGGACC AGACACGGTT CACAAACGAC TGCGTTGGGG GTGACCGACC<br />
4201 GGCTTGGCCA TAGGCCATCA GCGCATGCGT GGAACCTTTG TGGCTCCTCT GCCGATCCAT ACTGCGGAAC TCCTAGCCGC TTGTTTTGCT CGCAGCCGGT<br />
CCGAACCGGT ATCCGGTAGT CGCGTACGCA CCTTGGAAAC ACCGAGGAGA CGGCTAGGTA TGACGCCTTG AGGATCGGCG AACAAAACGA GCGTCGGCCA<br />
4301 CTGGAGCAAA GCTCATAGGA ACTGACAATT CTGTCGTCCT CTCGCGGAAA TATACATCGT TTCGATCTAC GTATGATCTT TTTCCCTCTG CCAAAAATTA<br />
GACCTCGTTT CGAGTATCCT TGACTGTTAA GACAGCAGGA GAGCGCCTTT ATATGTAGCA AAGCTAGATG CATACTAGAA AAAGGGAGAC GGTTTTTAAT<br />
Figura 24d
4401 TGGGGACATC ATGAAGCCCC TTGAGCATCT GACTTCTGGC TAATAAAGGA AATTTATTTT CATTGCAATA GTGTGTTGGA ATTTTTTGTG TCTCTCACTC<br />
ACCCCTGTAG TACTTCGGGG AACTCGTAGA CTGAAGACCG ATTATTTCCT TTAAATAAAA GTAACGTTAT CACACAACCT TAAAAAACAC AGAGAGTGAG<br />
EcoRI<br />
4501 GGAAGGAATT CTGCATTAAT GAATCGGCCA ACGCGCGGGG AGAGGCGGTT TGCGTATTGG GCGCTCTTCC GCTTCCTCGC TCACTGACTC GCTGCGCTCG<br />
CCTTCCTTAA GACGTAATTA CTTAGCCGGT TGCGCGCCCC TCTCCGCCAA ACGCATAACC CGCGAGAAGG CGAAGGAGCG AGTGACTGAG CGACGCGAGC<br />
4601 GTCGTTCGGC TGCGGCGAGC GGTATCAGCT CACTCAAAGG CGGTAATACG GTTATCCACA GAATCAGGGG ATAACGCAGG AAAGAACATG TGAGCAAAAG<br />
CAGCAAGCCG ACGCCGCTCG CCATAGTCGA GTGAGTTTCC GCCATTATGC CAATAGGTGT CTTAGTCCCC TATTGCGTCC TTTCTTGTAC ACTCGTTTTC<br />
4701 GCCAGCAAAA GGCCAGGAAC CGTAAAAAGG CCGCGTTGCT GGCGTTTTTC CATAGGCTCC GCCCCCCTGA CGAGCATCAC AAAAATCGAC GCTCAAGTCA<br />
CGGTCGTTTT CCGGTCCTTG GCATTTTTCC GGCGCAACGA CCGCAAAAAG GTATCCGAGG CGGGGGGACT GCTCGTAGTG TTTTTAGCTG CGAGTTCAGT<br />
4801 GAGGTGGCGA AACCCGACAG GACTATAAAG ATACCAGGCG TTTCCCCCTG GAAGCTCCCT CGTGCGCTCT CCTGTTCCGA CCCTGCCGCT TACCGGATAC<br />
CTCCACCGCT TTGGGCTGTC CTGATATTTC TATGGTCCGC AAAGGGGGAC CTTCGAGGGA GCACGCGAGA GGACAAGGCT GGGACGGCGA ATGGCCTATG<br />
4901 CTGTCCGCCT TTCTCCCTTC GGGAAGCGTG GCGCTTTCTC ATAGCTCACG CTGTAGGTAT CTCAGTTCGG TGTAGGTCGT TCGCTCCAAG CTGGGCTGTG<br />
GACAGGCGGA AAGAGGGAAG CCCTTCGCAC CGCGAAAGAG TATCGAGTGC GACATCCATA GAGTCAAGCC ACATCCAGCA AGCGAGGTTCGACCCGACAC<br />
5001 TGCACGAACC CCCCGTTCAG CCCGACCGCT GCGCCTTATC CGGTAACTAT CGTCTTGAGT CCAACCCGGT AAGACACGAC TTATCGCCAC TGGCAGCAGC<br />
ACGTGCTTGG GGGGCAAGTC GGGCTGGCGA CGCGGAATAG GCCATTGATA GCAGAACTCA GGTTGGGCCA TTCTGTGCTG AATAGCGGTG ACCGTCGTCG<br />
5101 CACTGGTAAC AGGATTAGCA GAGCGAGGTA TGTAGGCGGT GCTACAGAGT TCTTGAAGTG GTGGCCTAAC TACGGCTACA CTAGAAGAAC AGTATTTGGT<br />
GTGAcCATTG . TCCTAATCGT CTCGCTCCAT ACATCCGCCA CGATGTCTCA AGAACTTCAC CACCGGATTG ATGCCGATGT GATCTTCTTG TCATAAACCA<br />
5201 ATCTGCGCTC TGCTGAAGCC AGTTACCTTC GGAAAAAGAG TTGGTAGCTC TTGATCCGGC AAACAAACCA CCGCTGGTAG CGGTGGTTTT TTTGTTTGCA<br />
TAGACGCGAG ACGACTTCGG TCAATGGAAG CCTTTTTCTC AACCATCGAG AACTAGGCCG TTTGTTTGGT GGCGACCATC GCCACCAAAA AAACAAACGT<br />
5301 AGCAGCAGAT TACGCGCAGA AAAAAAGGAT CTCAAGAAGA TCCTTTGATC TTTTCTACGG GGTCTGACGC TCAGTGGAAC GAAAACTCAC GTTAAGGGAT (J.)<br />
TCGTCGTCTA ATGCGCGTCT TTTTTTCCTA GAGTTCTTCT AGGAAACTAG AAAAGATGCC CCAGACTGCG AGTCACCTTG CTTTTGAGTG CAATTCCCTA<br />
5401 TTTGGTCATG AGATTATCAA AAAGGATCTT CACCTAGATC CTTTTAAATT AAAAATGAAG TTTTAAATCA ATCTAAAGTA TATATGAGTA AACTTGGTCT<br />
AAACCAGTAC TCTAATAGTT TTTCCTAGAA GTGGATCTAG GAAAATTTAA TTTTTACTTC AAAATTTAGT TAGATTTCAT ATATACTCAT TTGAACCAGA<br />
5501 GACAGTTACC AATGCTTAAT CAGTGAGGCA CCTATCTCAG CGATCTGTCT ATTTCGTTCA TCCATAGTTG CCTGACTC<br />
CTGTCAATGG TTACGAATTA GTCACTCCGT GGATAGAGTC GCTAGACAGA TAAAGCAAGT AGGTATCAAC GGACTGAG<br />
Figura 24e
sítio poliAl<br />
rGlob pA<br />
origem desconhecida<br />
HBVenh<br />
LTA<br />
lisozima SP<br />
5'-UTR de HBV pré-S<br />
intron A da insulina de rato<br />
fusão Bam/Bgl<br />
exon 1/2 de CMV<br />
44/51<br />
Tn903, remanescentes de pUC4K<br />
KanR (Tn903)<br />
Figura 25<br />
remanescentes de pUC4K<br />
pLIC19 MCS<br />
CMV Pro<br />
exon 1/2 de CMV<br />
fusão Bam/Bgl<br />
intron A da insulina de rato<br />
5'-UTR de HBV pré-S<br />
lisozima SP<br />
LTB<br />
origem desconhecida<br />
RBGpA<br />
sítio poliA<br />
CMV Pra
pUC1 9<br />
SapI (5247)<br />
EcaRI (5183<br />
sítio poliAl<br />
rGtob pA<br />
origem desconhecida.<br />
SphI (4904<br />
HBVenh .<br />
Ácc1 (473<br />
Nsil (473<br />
EcoRV (471<br />
Ápal (45<br />
Bsp 1201 (450<br />
EcoRI (447<br />
Eam 11051 (44<br />
ifindll (42<br />
il .<br />
\,. ,----<br />
vat , ,. ,----<br />
\,,,,, , k, , ,<br />
LT<br />
NdeI (4096 "<br />
1\ ,<br />
\<br />
Aca(408. ' .,, i<br />
Se.a) (386D L.<br />
nal (380D) 1<br />
Figura 26<br />
Nhel (3767) 10,<br />
lisozima SP<br />
5'-UTR de HBV pré-S<br />
Bam133 (3580<br />
SapI (3531<br />
intron A da insulina de rato<br />
, fusão Bam/Bgl<br />
Eam11051 (343'4<br />
exon 1/2 de CMV<br />
Bsm131 (3317)<br />
45/51<br />
PJV7788<br />
6254 pb<br />
Tn903, remanescentes de pUC4K<br />
Hin6111 (307)<br />
Nsil (317)<br />
Bsm B1 (409)<br />
KanR (Tn903)<br />
)5na1 (553)<br />
ma (583)<br />
XhoI (827)<br />
Tn903, Remanescentes de pUC4K<br />
UC1 9 MCS<br />
Sph I (989)<br />
PstI (995)<br />
Sal' (997)<br />
/Icei (998)<br />
Spel (1105)<br />
el (1340)<br />
CMV Pro<br />
Ncor (1466)<br />
BunB1 (1695)<br />
exon 1/2 de CMV<br />
Eam11051 (1812)<br />
fusão Bam/Bgl<br />
intron A da insulina de rato<br />
SapI (1909)<br />
Bam13:1 (1958)<br />
5'-UTR de HBV pré-S2<br />
Lisozima SP<br />
miei (2145)<br />
LTB<br />
Xotai (2306)<br />
(cl (2434)<br />
origem desconhecida<br />
RBGpA<br />
sítio poliA<br />
.rt 1 (2617)<br />
atI (2619)<br />
ÁccI (2620)<br />
SpeI (2727)<br />
der (2962)<br />
CMV Pro<br />
NcoI (3088)
AmpR<br />
neomicina<br />
46/51<br />
Figura 27<br />
promotor CMV<br />
ntron<br />
gene ICP27<br />
polIA de SV40
47/51<br />
MATDIDMLID LGLDLSDSEL EEDALERDEE GRRDDPESDS SGECSSSDED<br />
MEDPCGDGGA EAIDAAIPKG PPARPEDAGT PEASTPRPAA RRGADDPPPA<br />
TTGVWSRLGT RRSASPREPH GGKVARIQPP STKAPHPRGG RRGRRRGRGR<br />
YGPGGADSTP NPRRRVSRNA HNQGGRHPAS ARTDGPGATH GEARRGGEQL<br />
DVSGGPRPRG TRQAPPPLMA LSLTPPHADG RAPVPERKAP SADTIDPAVR<br />
AVLRSISERA AVERISESFG RSALVMQDPF GGMPFPAANS PWAPVLATQA<br />
GGFDAETRRV SWETLVAHGP SLYRTFAANP RAASTAKAMR DCVLRQENLI<br />
EALASADETL AWCKMCIHHN LPLRPQDPII GTAAAVLENL ATRLRPFLQC<br />
YLKARGLCGL DDLCSRRRLS DIKDIASFVL VILARLANRV ERGVSEIDYT<br />
TVGVGAGETM HFYIPGACMA GLIEILDTHR QECSSRVCEL TASHTIAPLY<br />
VHGKYFYCNS LF<br />
A<br />
CO Z CO<br />
02 CO C.)<br />
CN<br />
6<br />
Figura 28<br />
Cl C2 C3 C4 C5 C6 C7 C8 C9 C10 C11 C12<br />
i::<br />
CN<br />
U) Z CD<br />
02 CD O<br />
,.....ki.<br />
R1 R2 R3 R4 'F15 R6<br />
#45 RVSWETLVAHGPSLYRTF (SEQ ID NO:66)<br />
#46 VAHGPSLYRTFAANPRAA (SEQ ID NO:67)<br />
Figura 29
48/51<br />
Pool P1 P2 reunião reunião<br />
+CD8 -CD8<br />
Figura 30
C<br />
><br />
—<br />
><br />
8<br />
Ingênuo<br />
ICP27+1-7 (9:1)<br />
ICP27+CT (9:1)<br />
1CP27<br />
2 4 6 8 10 12<br />
Dias após a inoculação<br />
49/51<br />
❑ ❑ ❑<br />
14 16<br />
Figura 31<br />
20000<br />
-"r 16000 -<br />
E<br />
to<br />
D.<br />
—9) 10000<br />
u-<br />
5000<br />
2000<br />
1500<br />
E<br />
-6)<br />
1000<br />
z soo<br />
o<br />
44<br />
'10
50/51<br />
O 2 4 6 8 10 12 14 16<br />
Dias após a inoculação ingênuo<br />
Figura 32<br />
—1CP27 +LT<br />
""-- ICP27 + LT+ aTNF<br />
— ICP27 + LT + alFN<br />
,...- ICP27 + LT + alFN + aTNF
a 80<br />
C<br />
a)<br />
><br />
.> 60 -a)<br />
Is<br />
o<br />
o<br />
a)<br />
,se<br />
40 -<br />
51/51<br />
2 4 6 8 10 12 14 16 18 20<br />
Dias após a inoculação<br />
Figura 33
1<br />
RESUMO<br />
"CONSTRUÇÃO DE ÁCIDO NUCLEICO, PARTÍCULAS<br />
CARREADORAS, RECEPTÁCULO DE DOSAGEM PARA UM<br />
DISPOSITIVO DE LIBERAÇÃO MEDIADA POR PARTÍCULA,<br />
5 DISPOSITIVO DE LIBERAÇÃO MEDIADA POR PARTÍCULA,<br />
POPULAÇÃO DE CONSTRUÇÕES DE ÁCIDO NUCLEICO,<br />
SEQÜÊNCIA PROMOTORA QUIMÉRICA ISOLADA PURIFICADA,<br />
PARTÍCULAS REVESTIDAS, COMPOSIÇÃO FARMACÊUTICA,<br />
COMPOSIÇÃO DE VACINA, USO DE UMA CONSTRUÇÃO DE ÁCIDO<br />
10 NUCLEICO, DE UMA POPULAÇÃO DE CONSTRUÇÕES DE ÁCIDO<br />
NUCLEICO OU DE PARTÍCULAS REVESTIDAS, E, MÉTODO IN VITRO<br />
DE OBTER A EXPRESSÃO EM CÉLULAS DE MAMÍFERO DE UM<br />
POLIPEPTÍDEO DA INFLUENZA DE INTERESSE"<br />
Uma construção de ácido nucleico que compreende uma<br />
15 seqüência promotora quimérica e um sítio de clonagem para a inserção de<br />
uma seqüência codificadora em ligação operável com o promotor quimérico,<br />
em que a seqüência promotora quimérica compreende: (a) uma seqüência<br />
promotora inicial imediata de hCMV; (b) exon 1 e pelo menos uma parte do<br />
exon 2 do gene inicial imediato maior de hCMV; e (c) um intron heterólogo<br />
20 fornecido no lugar da região de intron A do gene inicial imediato maior de<br />
hCMV.
fe,,ijo OafffV,1-<br />
1 PI cio 7r -- .19<br />
"CONSTRUÇÃO DE ÁCIDO NUCLEICO, POPULAÇÃO DE<br />
CONSTRUÇÕES DE ÁCIDO NUCLEICO, SEQÜÊNCIA PROMOTORA<br />
QUIMÉRICA ISOLADA PURIFICADA, PARTÍCULAS REVESTIDAS,<br />
RECEPTÁCULO DE DOSAGEM PARA UM DISPOSITIVO DE<br />
5 LIBERAÇÃO MEDIADA POR PARTÍCULA, DISPOSITIVO DE<br />
LIBERAÇÃO MEDIADA POR PARTÍCULA, COMPOSIÇÃO<br />
FARMACÊUTICA, COMPOSIÇÃO DE VACINA, E, MÉTODO IN VITRO<br />
DE OBTER A EXPRESSÃO EM CÉLULAS DE MAMÍFERO DE UM<br />
POLIPEPTÍDEO DA INFLUENZA DE INTERESSE"<br />
10 Campo da Invenção<br />
A invenção diz respeito aos campos da biologia molecular e<br />
imunologia e no geral aos reagentes úteis nas técnicas de imunização de ácido<br />
nucleico. Mais especificamente, a invenção diz respeito a construções de<br />
ácido nucleico para a expressão de polipeptídeos e em particular polipeptídeos<br />
15 antigênicos, particularmente antígenos da influenza bem como a expressão de<br />
polipeptídeos adjuvantes e às estratégias de imunização com ácido nucleico<br />
usando tais reagentes.<br />
Fundamentos da invenção<br />
A terapia de gene e imunização com ácido nucleico são<br />
20 métodos promissores para o tratamento e prevenção de doenças tanto<br />
adquiridas quanto herdadas. Estas técnicas fornecem a transferência de um<br />
ácido nucleico desejado em um indivíduo com a expressão in vivo<br />
subseqüente. A transferência pode ser realizada pela transfecção das células<br />
ou tecidos do indivíduo ex vivo e reintroduzir o material transformado no<br />
25 hospedeiro. Alternativamente, o ácido nucleico pode ser administrado in vivo<br />
diretamente ao receptor.
1<br />
REIVINDICAÇÕES<br />
1. Construção de ácido nucleico adequada para a liberação a<br />
um indivíduo para induzir uma resposta imune contra antígeno de<br />
hemaglutinina (HA) do vírus da influenza, caracterizada pelo fato de que<br />
5 compreende:<br />
imediato maior de hCMV; e<br />
(i) uma seqüência promotora quimérica que compreende:<br />
(a) uma seqüência promotora inicial imediata de hCMV;<br />
(b) exon 1 e pelo menos uma parte do exon 2 do gene inicial<br />
10 (c) um íntron heterólogo fornecido no lugar da região de íntron<br />
A do gene inicial imediato maior de hCMV;<br />
(ii) uma seqüência codificadora em ligação operável com o<br />
promotor quimérico, onde a seqüência codificadora codifica um antígeno de<br />
hemaglutinina (HA) do vírus da influenza, um fragmento imunogênico deste<br />
15 ou uma variante imunogênica do dito antígeno ou fragmento tendo pelo<br />
menos 80% de homologia de aminoácido ao dito antígeno ou fragmento;<br />
(iii) uma seqüência líder não traduzida que é derivada da<br />
seqüência de antígeno HBVpreS2, seqüência de antígeno e de HBV ou<br />
seqüência de antígeno tipo 2gD de HSV e que está em ligação operável com o<br />
20 promotor quimérico; e<br />
(iv) uma seqüência realçadora que é derivada de uma região<br />
não traduzida 3' (UTR) de uma seqüência do HBsAg ou de uma seqüência de<br />
gene inicial imediata de CMV símio, que está em ligação operável com o<br />
promotor quimérico e que está a jusante da seqüência codificadora.<br />
25 2. Construção de ácido nucleico adequada para a liberação a<br />
um indivíduo para induzir uma resposta imune contra antígeno de<br />
hemaglutinina (HA) do vírus da influenza, caracterizada pelo fato de que<br />
compreende:<br />
(i) uma seqüência promotora quimérica que compreende:
imediato maior de hCMV; e<br />
2<br />
(a) uma seqüência promotora inicial imediata de hCMV;<br />
(b) exon 1 e pelo menos uma parte do exon 2 do gene inicial<br />
(c) um íntron heterólogo fornecido no lugar da região de íntron<br />
5 A do gene inicial imediato maior de hCMV; e<br />
promotor quimérico,<br />
(ii) uma seqüência codificadora em ligação operável com o<br />
onde a seqüência codificadora codifica um antígeno de<br />
hemaglutinina (HA) do vírus da influenza, um fragmento imunogênico deste<br />
10 ou uma variante imunogênica do dito antígeno ou fragmento tendo pelo<br />
menos 80% de homologia de aminoácido ao dito antígeno ou fragmento.<br />
3. Construção de ácido nucleico de acordo com a reivindicação<br />
2, caracterizada pelo fato de que compreende ainda:<br />
(iii) uma seqüência líder não traduzida que é derivada da<br />
15 seqüência de antígeno HBVpreS2, seqüência de antígeno e de HBV ou<br />
seqüência de antígeno tipo 2gD de HSV e que está em ligação operável com o<br />
promotor quimérico; e/ou<br />
(iv) uma seqüência realçadora que é derivada de uma região<br />
não traduzida 3' (UTR) de uma seqüência do HBsAg ou de uma seqüência de<br />
20 gene inicial imediato de CMV símio, que está em ligação operável com o<br />
promotor quimérico e que está a jusante da seqüência codificadora.<br />
4. Construção de ácido nucleico, caracterizada pelo fato de que<br />
compreende uma seqüência promotora e uma seqüência codificadora em<br />
ligação operável com o promotor, onde a seqüência codificadora codifica:<br />
25 - um antígeno do vírus da influenza, um fragmento<br />
imunogênico deste ou uma variante imunogênica do dito antígeno ou<br />
fragmento tendo pelo menos 80% de homologia de aminoácido ao dito<br />
antígeno ou fragmento; e/ou<br />
- uma subunidade de toxina bacteriana que ribosila ADP, um
3<br />
fragmento desta com atividade adjuvante ou uma variante de cada um com<br />
atividade adjuvante e tendo pelo menos 80% de homologia de aminoácido<br />
com dita subunidade ou fragmento,<br />
onde:<br />
5 (A) o promotor é um promotor quimérico, a seqüência<br />
promotora quimérica compreendendo:<br />
imediato maior de hCMV, e<br />
(i) uma seqüência promotora inicial imediata de hCMV;<br />
(ii) exon 1 e pelo menos uma parte do exon 2 do gene inicial<br />
10 (iii) um íntron heterólogo fornecido no lugar da região de<br />
íntron A do gene inicial imediato maior de hCMV; e/ou<br />
(B) a construção compreende:<br />
(i) uma seqüência líder não traduzida que é derivada da<br />
seqüência de antígeno HBVpreS2, seqüência de antígeno e de HBV ou<br />
15 seqüência de antígeno tipo 2gD de HSV, que está em ligação operável com a<br />
seqüência codificadora e promotor que é heterólogo à seqüência codificadora;<br />
e/ou<br />
(ii) uma seqüência realçadora 3' da e operavelmente ligada à<br />
seqüência codificadora, onde a seqüência realçadora é derivada de uma UTR<br />
20 3' de uma seqüência do HBsAg ou de uma seqüência de gene inicial imediata<br />
de CMV símio, e a seqüência codificadora é heteróloga à seqüência<br />
realçadora 3'.<br />
5. Construção de ácido nucleico de acordo com a reivindicação<br />
4, caracterizada pelo fato de que o antígeno influenza codificado é:<br />
25 (a) hemaglutinina da influenza (HA), um fragmento<br />
imunogênico deste ou uma variante imunogênica com pelo menos 80% de<br />
homologia de seqüência de aminoácido a cada um; e/ou<br />
(b) neuraminidase da influenza (NA), M2, um fragmento<br />
imunogênico de cada um ou uma variante imunogênica tendo pelo menos
4<br />
80% homologia de seqüência de aminoácido a qualquer um dos ditos NA, M2<br />
ou fragmento.<br />
6. Construção de ácido nucleico de acordo com qualquer uma<br />
das reivindicações precedentes, caracterizada pelo fato de que a seqüência<br />
5 codificadora codifica um antígeno influenza, fragmento deste ou variante de<br />
uma cepa da influenza pandêmica.<br />
7. Construção de ácido nucleico de acordo com a reivindicação<br />
6, caracterizada pelo fato de que codifica um antígeno da influenza<br />
pandêmico, fragmento imunogênico deste ou variante imunogênica do dito<br />
10 antígeno ou fragmento e um ou mais antígenos da influenza não pandêmicos,<br />
fragmento(s) imunogênico(s) deste ou variante(s) imunogênica(s) do(s)<br />
dito(s) antígeno(s) ou fragmento(s).<br />
8. Construção de ácido nucléico de acordo com qualquer uma<br />
das reivindicações precedentes, caracterizada pelo fato de que:<br />
15 (i) a seqüência codificadora codifica mais do que um antígeno<br />
da influenza, fragmento ou variante imunogênica;<br />
(ii) a seqüência codificadora codifica mais do que um antígeno<br />
da influenza e pelo menos dois dos antígenos, fragmentos ou variantes<br />
diferentes codificados são do mesmo polipeptídeo da influenza de cepas<br />
20 diferentes de vírus da influenza;<br />
(iii) a seqüência codificadora codifica um HA da influenza,<br />
fragmento ou variante de cada um de três a cinco cepas da influenza<br />
diferentes; e/ou<br />
(iv) a seqüência codificadora codifica um HA da influenza,<br />
25 fragmento ou variante de cada um de três ou quatro cepas da influenza não<br />
pandêmicas.<br />
compreender:<br />
9. Construção de ácido nucléico, caracterizada pelo fato de<br />
(i) a seqüência promotora quimérica compreendendo:
imediato maior de hCMV; e<br />
5<br />
(a) uma seqüência promotora inicial imediata de hCMV;<br />
(b) exon 1 e pelo menos uma parte do exon 2 do gene inicial<br />
(c) um íntron heterólogo fornecido no lugar da região de íntron<br />
5 A do gene inicial imediato maior de hCMV;<br />
(ii) uma seqüência codificadora em ligação operável com o<br />
promotor quimérico, onde a seqüência codificadora codifica uma subunidade<br />
de toxina bacteriana que ribosile ADP, um fragmento desta com atividade<br />
adjuvante ou uma variante de cada uma destas tendo pelo menos 80% de<br />
10 homologia de aminoácido com a dita subunidade ou fragmento e tendo<br />
atividade adjuvante;<br />
(iii) uma seqüência líder não traduzida que é derivada da<br />
seqüência de antígeno HBVpreS2, seqüência de antígeno e de HBV ou<br />
seqüência de antígeno tipo 2gD de H SV e que está em ligação operável com<br />
15 um promotor quimérico; e<br />
(iv) uma seqüência realçadora que é derivada de uma região<br />
não traduzida 3' (UTR) de uma seqüência do HBsAg ou de uma seqüência de<br />
gene inicial imediato de CMV símio, que está em ligação operável com o<br />
promotor quimérico e que está a jusante da seqüência codificadora.<br />
20 10. Construção de ácido nucleico de acordo com a<br />
reivindicação 4 ou 9, caracterizada pelo fato de que a subunidade de toxina<br />
bacteriana que ribosile ADP é selecionada da subunidade A da toxina do<br />
cólera, subunidade B da toxina do cólera, subunidade A da toxina instável ao<br />
calor da E. coli e subunidade B instável ao calor da E. coli.<br />
25 11. Construção de ácido nucleico de acordo com a<br />
reivindicação 4, 9 ou 10, caracterizada pelo fato de que compreende duas<br />
seqüências codificadoras cada uma compreendendo uma dita subunidade,<br />
fragmento ou variante diferentes e cada qual se liga a dito promotor<br />
quimérico.
6<br />
12. Construção de ácido nucleico de acordo com a<br />
reivindicação 11, caracterizada pelo fato de que as duas seqüências<br />
codificadoras codificam subunidade A da toxina do cólera e subunidade B da<br />
toxina do cólera ou subunidade A da toxina instável ao calor da E. coli e<br />
5 subunidade B instável ao calor da E. coli, respectivamente.<br />
13. Construção de ácido nucleico de acordo com qualquer uma<br />
das reivindicações 4 e 9 a 12, caracterizada pelo fato de que<br />
inversa; ou<br />
(i) as ditas duas seqüências codificadoras estão na orientação<br />
10 (ii) as ditas duas seqüências codificadoras estão na mesma<br />
orientação.<br />
14. Construção de ácido nucleico de acordo com qualquer uma<br />
das reivindicações precedentes, caracterizada pelo fato de que compreende<br />
um promotor quimérico como definido na reivindicação 1, onde:<br />
15 (A) a seqüência do promotor inicial imediato do hCMV (a)<br />
compreende:<br />
(i) a seqüência de nucleotídeo da SEQ ID NO: 1, nucleotídeos<br />
de 903 a 1587 da SEQ ID NO: 54, nucleotídeos de 1815 a 1935 da SEQ ID<br />
NO: 61, nucleotídeos de 1948 a 2632 da SEQ ID No: 61, nucleotídeos de<br />
20 1002 a 1686 da SEQ ID No: 62 e/ou nucleotídeos de 2624 a 3308 da SEQ ID<br />
No: 62;<br />
(ii) uma variante funcional de (i) que tenha pelo menos 80% de<br />
homologia de seqüência de nucleotídeo a uma ou mais das seqüências de (i);<br />
ou<br />
25 (iii) um fragmento funcional de (i) ou (ii);<br />
(B) a seqüência de exon (b) compreende:<br />
(i) a seqüência de nucleotídeo da SEQ ID No.2, a seqüência de<br />
nucleotídeo dos nucleotídeos de 1588 a 1718 da SEQ ID No. 54, nucleotídeos<br />
de 1684 a 1814 da SEQ ID No: 61, nucleotídeos de 2633 a 2763 da SEQ ID
5 ou<br />
7<br />
NO: 61, nucleotídeos de 1687 a 1817 da SEQ ID No: 62 e/ou nucleotídeos de<br />
3309 a 3439 da SEQ ID No: 62;<br />
(ii) uma variante funcional de (i) que tenha pelo menos 80% de<br />
homologia de seqüência de nucleotídeo a uma ou mais das seqüências de (i);<br />
(iii) um fragmento funcional de (i) ou (ii);<br />
(C) o íntron heterólogo é uma seqüência de íntron A do gene<br />
da insulina de rato e compreende:<br />
(i) a seqüência de nucleotídeo da SEQ ID NO: 3, a seqüência<br />
10 de nucleotídeo dos nucleotídeos de 1725 a 1857 da SEQ ID No. 54,<br />
nucleotídeos de 1545 a 1677 da SEQ ID No: 61, os nucleotídeos de 2770 a<br />
2902 da SEQ ID No: 61, os nucleotídeos de 1824 a 1956 da SEQ ID No: 62<br />
e/ou os nucleotídeos de 3446 a 3578 da SEQ ID No: 62;<br />
(ii) uma variante funcional de (i) que tem pelo menos 80% de<br />
15 homologia de seqüência de nucleotídeo a uma ou mais das seqüências de (i);<br />
OU<br />
(iii) um fragmento funcional de (i) ou (ii);<br />
(D) a seqüência promotora quimérica compreende:<br />
(i) a seqüência de nucleotídeo da SEQ ID No. 4 ou a seqüência<br />
20 de nucleotídeo dos nucleotídeos de 903 a 1857 da SEQ ID No. 54;<br />
(ii) uma variante funcional de (i) que tem pelo menos 80% de<br />
homologia de seqüência de nucleotídeo a (i); ou<br />
(iii) um fragmento funcional de (i) ou (ii); e/ou<br />
(E) o íntron heterólogo (c) compreende uma seqüência<br />
25 selecionada da seqüência de íntron A do gene da insulina de rato, seqüência<br />
de íntron A do gene da queratina de galinha, seqüência de íntron A do gene da<br />
actina cardíaca de galinha, um fragmento funcional de qualquer um destes ou<br />
uma variante funcional de qualquer um dos precedentes.<br />
15. Construção de ácido nucleico de acordo com qualquer uma
das reivindicações precedentes, caracterizada pelo fato de que<br />
(A) a construção compreende uma seqüência realçadora como<br />
definida na reivindicação 1, a seqüência realçadora compreendendo:<br />
(i) a seqüência de nucleotídeo da SEQ ID NO: 8, SEQ ID NO:<br />
5 9, nucleotídeos de 3699 a 4231 da SEQ ID NO: 54, nucleotídeos de 3831 a<br />
4363 da SEQ ID NO: 61 e/ou de 4507 a 5038 da SEQ ID NO: 62;<br />
(ii) uma variante funcional de (i) que tenha pelo menos 80% de<br />
homologia de seqüência de nucleotídeo a uma dita seqüência (i); ou<br />
(iii) um fragmento funcional de (i) ou (ii);<br />
10 (B) a construção compreende uma seqüência líder não<br />
traduzida como definida na reivindicação 1, em que a seqüência líder não<br />
traduzida compreende:<br />
(i) a seqüência de nucleotídeo da SEQ ID NO: 5, SEQ ID NO:<br />
6, SEQ ID NO: 7 ou nucleotídeos de 1864 a 1984 da SEQ ID NO: 54;<br />
15 (ii) uma variante funcional de (i) que tenha pelo menos 80% de<br />
homologia de seqüência de nucleotídeo a (i); ou<br />
(iii) um fragmento funcional de (i) ou (ii);<br />
(C) a construção é um plasmídeo;<br />
(D) a construção compreende um sinal de poliadenilação; e/ou<br />
20 (E) a construção compreende ainda uma seqüência de<br />
nucleotídeo que codifique um peptídeo de sinal que é operavelmente ligado à<br />
seqüência que codifica o antígeno, subunidade de exotoxina, fragmento ou<br />
variante.<br />
16. Construção de ácido nucléico de acordo com a<br />
25 reivindicação 15, caracterizada pelo fato de que:<br />
(A) o peptídeo de sinal é selecionado do peptídeo de sinal de<br />
ativador de plasminogênio de tecido humano (hTPAsp), peptídeo de sinal da<br />
aprotinina, peptídeo de sinal da extensina do tabaco e peptídeo de sinal da<br />
lisosima de galinha;
(B) a seqüência de poliadenilação é uma seqüência de<br />
poliadenilação de um gene selecionado do gene da beta-globina de coelho,<br />
genes inicial e tardio do vírus do papiloma humano (HPV), o gene HSV-2gB,<br />
um gene inicial imediato de CMV símio e o gene tardio HSVgD; e/ou<br />
5 (C) a seqüência de poliadenilação é selecionada da:<br />
(i) seqüência de nucleotídeo da SEQ ID NO: 10, SEQ ID NO:<br />
11, SEQ ID NO: 12, SEQ ID NO: 13, nucleotídeos de 4243 a 4373 da SEQ<br />
ID No: 54, nucleotídeos de 906 a 1038 da SEQ ID No: 61, nucleotídeos de<br />
4375 a 4050 da SEQ ID NO: 61, ou nucleotídeos de 2463 a 2593 da SEQ ID<br />
10 NO: 62;<br />
(ii) uma variante funcional de (i) que tenha pelo menos 80% de<br />
homologia de seqüência de nucleotídeo a uma dita seqüência (i); ou<br />
(iii) um fragmento funcional de (i) ou (ii).<br />
17. Construção de ácido nucléico de acordo com qualquer uma<br />
15 das reivindicações precedentes, caracterizada pelo fato de que compreende:<br />
No: 14, ou<br />
seqüência à seqüência de (i);<br />
(i) a seqüência do vetor pPJV7563 fornecida como SEQ ID<br />
(ii) uma seqüência com pelo menos 60% de identidade de<br />
20 e a seqüência que codifica o dito antígeno, fragmento ou<br />
variante é fornecida nas ditas seqüências (i) ou (ii) de modo que a mesma<br />
esteja operavelmente ligada ao promotor quimérico.<br />
18. Construção de ácido nucleico de acordo com qualquer uma<br />
das reivindicações precedentes, caracterizada pelo fato de que compreende:<br />
25 (a) a seqüência do vetor pPJV1671 fornecida como a SEQ ID<br />
No: 54 ou uma seqüência com pelo menos 60% de identidade de seqüência a<br />
esta;<br />
(b) a seqüência do vetor pPML7789 fornecida como a SEQ ID<br />
No: 59 ou uma seqüência com pelo menos 60% de identidade de seqüência a
esta;<br />
10<br />
(c) a seqüência do vetor pPJV2012 fornecida pela SEQ ID No:<br />
61 ou uma seqüência com pelo menos 60% de identidade de seqüência a esta;<br />
(d) a seqüência do vetor pPJV7788 fornecida pela SEQ ID<br />
5 NO: 62 ou uma seqüência com pelo menos 60% de identidade de seqüência a<br />
esta.<br />
19. Construção de ácido nucleico de acordo com a<br />
reivindicação 4, caracterizada pelo fato de que o promotor é selecionado da<br />
seqüência do promotor inicial imediato do hCMV, seqüência promotora do<br />
10 vírus da pseudo-raiva e seqüência promotora do vírus do sarcoma de Rous.<br />
20. População de construções de ácido nucleico, caracterizada<br />
pelo fato de que compreende pelo menos duas construções diferentes como<br />
definidas em qualquer uma das reivindicações precedentes.<br />
21. População de construções de ácido nucléico de acordo com<br />
15 a reivindicação 20, caracterizada pelo fato de que compreende:<br />
(i) pelo menos duas construções diferentes como definidas em<br />
qualquer uma das reivindicações de 1 a 8 e 14 a 19 que codifique antígenos da<br />
influenza diferentes, fragmentos imunogênicos destes ou variantes<br />
imunogênicas dos ditos antígenos ou fragmentos; e/ou<br />
20 (ii) pelo menos uma construção como definida em qualquer<br />
uma das reivindicações 4 e 9 a 19 codificando uma subunidade de toxina<br />
bacteriana que ribosile ADP, um fragmento desta ou uma variante desta.<br />
22. População de construções de ácido nucleico de acordo com<br />
a reivindicação 21, caracterizada pelo fato de que<br />
25 (a) pelo menos dois dos antígenos diferentes são do mesmo<br />
polipeptídeo da influenza de cepas da influenza diferentes; e/ou<br />
(b) pelo menos dois dos antígenos, fragmentos ou variantes<br />
diferentes são de polipeptídeo de influenza diferentes de uma cepas de<br />
influenza igual ou diferente.
11<br />
23. População de construções de ácido nucleico de acordo com<br />
qualquer uma das reivindicações de 20 a 22, caracterizada pelo fato de que<br />
compreende pelo menos três construções diferentes cada uma codificando um<br />
antígeno da influenza diferente, fragmento imunogênico ou variante<br />
5 imunogênica.<br />
pelo fato de que:<br />
24. População de construções de ácido nucleico, caracterizada<br />
(A) (i) pelo menos uma construção codifica uma subunidade de<br />
toxina bacteriana que ribosile ADP, um fragmento desta com atividade<br />
10 adjuvante ou uma variante de cada uma destas tendo atividade adjuvante e<br />
tendo pelo menos 80% de homologia de aminoácido à dita subunidade ou<br />
fragmento; e<br />
(ii) pelo menos uma construção que codifica um antígeno do<br />
vírus simples do herpes (HSV);<br />
15 onde a seqüência que codifica a dita subunidade, fragmento ou<br />
variante e/ou o antígeno do HSV estão operavelmente ligados a um promotor<br />
quimérico que compreende:<br />
20 imediato maior de hCMV; e<br />
(a) uma seqüência promotora inicial imediata de hCMV;<br />
(b) exon 1 e pelo menos uma parte do exon 2 do gene inicial<br />
(c) um íntron heterólogo fornecido no lugar da região de íntron<br />
A do gene inicial imediato maior de hCMV,<br />
(B) (i) pelo menos uma construção codifica uma subunidade de<br />
toxina bacteriana que ribosile ADP, um fragmento desta com atividade<br />
25 adjuvante ou uma variante de cada uma desta tendo atividade adjuvante e<br />
tendo pelo menos 80% de homologia de aminoácido à dita subunidade ou<br />
fragmento; e<br />
(ii) pelo menos uma construção codifica um antígeno de HSV,<br />
onde pelo menos uma das ditas construções compreende ainda:
12<br />
(a) uma seqüência líder não traduzida que seja derivada da<br />
seqüência de antígeno preS2 de HBV, seqüência de antígeno e de HBV ou<br />
seqüência de antígeno tipo 2 gD do HSV, que esteja em ligação operável com<br />
a seqüência codificadora da dita construção e um promotor que seja<br />
5 heterólogo à seqüência codificadora; e/ou<br />
(b) uma seqüência realçadora 3' da e operavelmente ligada à<br />
seqüência codificadora da dita construção, onde a seqüência realçadora é<br />
derivada de uma UTR 3' de uma seqüência do HBsAg ou de uma seqüência<br />
de gene inicial imediata de CMV símio, e a seqüência codificadora é<br />
10 heteróloga à seqüência realçadora 3',<br />
(C) (i) uma primeira construção de ácido nucleico que compreenda<br />
uma seqüência promotora quimérica e uma seqüência codificadora em ligação<br />
operável com o promotor quimérico, onde a seqüência codificadora codifica<br />
uma subunidade de toxina bacteriana que ribosile ADP, um fragmento desta<br />
15 com atividade adjuvante ou uma variante de cada uma desta tendo atividade<br />
adjuvante e tendo pelo menos 80% de homologia de aminoácido à dita<br />
subunidade ou fragmento e a seqüência promotora quimérica compreende:<br />
20 imediato maior de hCMV; e<br />
(a) uma seqüência promotora inicial imediata de hCMV;<br />
(b) exon 1 e pelo menos uma parte do exon 2 do gene inicial<br />
(c) um íntron heterólogo fornecido no lugar da região de íntron<br />
A do gene inicial imediato maior de hCMV; e<br />
(ii) uma segunda construção de ácido nucleico que codifique<br />
pelo menos um antígeno do HSV, e/ou<br />
25 (D) (i) uma primeira construção de ácido nucleico que compreende<br />
uma seqüência promotora e uma seqüência codificadora operavelmente<br />
ligadas ao promotor, onde a seqüência codificadora codifica uma subunidade<br />
de toxina bacteriana que ribosile ADP, um fragmento desta com atividade<br />
adjuvante ou uma variante de cada uma destas tendo atividade adjuvante e
13<br />
tendo pelo menos 80% de homologia de aminoácido à dita subunidade ou<br />
fragmento e a construção compreende ainda:<br />
(a) uma seqüência líder não traduzida que seja derivada da<br />
seqüência de antígeno preS2 de HBV, seqüência de antígeno e de HBV ou<br />
5 seqüência de antígeno tipo 2 gD do HSV, que está em ligação operável com a<br />
seqüência codificadora e promotor que é heterólogo à seqüência codificadora;<br />
e/ou<br />
(b) uma seqüência realçadora 3' de e operavelmente ligada à<br />
seqüência codificadora, onde o realçador é derivado de uma UTR 3' de uma<br />
10 seqüência do HBsAg ou de uma seqüência de gene inicial imediata de CMV<br />
símio, e a seqüência codificadora é heteróloga à seqüência realçadora 3';<br />
(ii) uma segunda construção de ácido nucleico que codifique<br />
pelo menos um antígeno do HSV.<br />
25. População de construções de ácido nucleico de acordo com<br />
15 qualquer uma das reivindicações 20 a 24, caracterizada pelo fato de que<br />
compreende:<br />
(i) uma primeira construção de ácido nucleico que compreenda<br />
a seqüência do vetor pPJV2012 fornecida pela SEQ ID NO: 61 ou uma<br />
seqüência com pelo menos 60% de identidade de seqüência a esta; e<br />
20 (ii) uma segunda construção de ácido nucleico que codifique<br />
um antígeno de HSV.<br />
26. Seqüência promotora quimérica isolada purificada,<br />
caracterizada pelo fato de que a seqüência promotora quimérica está de<br />
acordo com qualquer uma das reivindicações 14 ou 25.<br />
25 27. Partículas revestidas, caracterizada pelo fato de que<br />
compreendem partículas carreadoras revestidas com uma construção de ácido<br />
nucleico como definida em qualquer uma das reivindicações de 1 a 19 ou uma<br />
população de construções de ácido nucleico como definidas em qualquer uma<br />
das reivindicações de 20 a 25.
caracterizada pelo fato de que<br />
14<br />
28. Partículas revestidas de acordo com a reivindicação 27,<br />
(A) as partículas são revestidas com pelo menos duas<br />
construções diferentes de ácido nucleico como definida na reivindicação 1,<br />
5 em que cada dita construção codifica um dito HA, fragmento ou variante de<br />
uma cepa da influenza diferente;<br />
construções diferentes;<br />
(B) as partículas são revestidas com três a cinco das ditas<br />
(C) três ou quatro das ditas construções codificam um dito HA,<br />
10 fragmento ou variante de cepas diferentes da influenza não pandêmicas;<br />
(D) são revestidas com uma dita construção que codifica um<br />
dito HA, fragmento ou variante de uma cepa da influenza pandêmica;<br />
(E) as partículas também são revestidas com uma construção<br />
de ácido nucleico que compreende uma seqüência promotora e uma seqüência<br />
15 codificadora em ligação operável com o promotor, onde a seqüência<br />
codificadora codifica uma subunidade de toxina bacteriana que ribosile ADP,<br />
um fragmento desta com atividade adjuvante ou uma variante de cada uma<br />
destas tendo atividade adjuvante e tendo pelo menos 80% de homologia de<br />
aminoácido com a dita subunidade ou fragmento;<br />
20 (F) as partículas também são revestidas com uma construção<br />
de ácido nucleico que compreende uma seqüência promotora e uma seqüência<br />
codificadora em ligação operável com o promotor, onde a seqüência<br />
codificadora codifica uma subunidade de toxina bacteriana que ribosile ADP,<br />
um fragmento desta com atividade adjuvante ou uma variante de cada uma<br />
25 destas tendo atividade adjuvante e tendo pelo menos 80% de homologia de<br />
aminoácido com a dita subunidade ou fragmento, onde o promotor é um<br />
promotor quimérico como definido na reivindicação 1, as subunidades são<br />
como definidas em qualquer uma das reivindicações 10 a 12, a construção<br />
compreendendo uma seqüência líder não traduzida como definida na
eivindicação 1 e/ou um realçador como definido na reivindicações 1; e/ou<br />
15<br />
(G) as partículas carreadoras são partículas de ouro.<br />
29. Receptáculo de dosagem para um dispositivo de liberação<br />
mediada por partícula, caracterizado pelo fato de que compreende partículas<br />
5 revestidas como definidas na reivindicação 27 ou 28.<br />
30. Dispositivo de liberação mediada por partícula,<br />
caracterizado pelo fato de que é carregado com partículas revestidas como<br />
definidas na reivindicação 27 ou 28.<br />
31. Dispositivo de liberação mediada por partícula de acordo<br />
10 com a reivindicação 30, caracterizado pelo fato de que é uma seringa isenta de<br />
agulha.<br />
32. Composição farmacêutica, caracterizada pelo fato de que<br />
compreende uma construção de ácido nucleico como definida em qualquer<br />
uma das reivindicações de 1 a 19 ou uma população de construções de ácido<br />
15 nucleico como definidas em qualquer uma das reivindicações de 20 a 25<br />
juntas com um carreador ou excipiente farmaceuticamente aceitáveis.<br />
33. Composição de vacina, caracterizada pelo fato de que<br />
compreende uma construção de ácido nucleico como definida em qualquer<br />
uma das reivindicações de 1 a 19 ou uma população de construções de ácido<br />
20 nucleico como definida em qualquer uma das reivindicações de 20 a 25.<br />
34. Composição de vacina de acordo com a reivindicação 33,<br />
caracterizada pelo fato de que é um vacina multivalente que compreende pelo<br />
menos duas construções diferentes que codificam antígenos da influenza<br />
diferentes, fragmentos imunogênicos destes ou variantes imunogênicas de<br />
25 cada um destes.<br />
35. Composição de vacina de acordo com a reivindicação 34,<br />
caracterizada pelo fato de que é uma vacina da influenza trivalente,<br />
tetravalente ou pentavalente.<br />
36. Construção de ácido nucleico como definida nas qualquer
16<br />
uma das reivindicações de 1 a 19, de uma população de construções de ácido<br />
nucleico como definida em qualquer uma das reivindicações de 20 a 25 ou de<br />
partículas revestidas como definidas nas reivindicações 27 ou 28,<br />
caracterizada pelo fato de ser para uso na prevenção da influenza.<br />
5 37. Construção de ácido nucléico, população ou partículas<br />
revestidas de acordo com a reivindicação 36, caracterizada pelo fato de que a<br />
construção de ácido nucléico, população ou partículas revestidas é/são<br />
liberadas por injeção isenta de agulha.<br />
38. Método in vitro de obter a expressão em células de<br />
10 mamífero de um polipeptídeo da influenza de interesse, caracterizado pelo<br />
fato de que compreende transferir para dentro das ditas células uma<br />
construção de ácido nucleico como definida em qualquer uma das<br />
reivindicações de 1 a 19, uma população de construções de ácido nucleico<br />
como definida em qualquer uma das reivindicações de 20 a 25 ou partículas<br />
15 revestidas como definidas nas reivindicações 27 ou 28.
1<br />
RESUMO<br />
/2/060 /' ,92 - (12<br />
"CONSTRUÇÃO DE ÁCIDO NUCLEICO, POPULAÇÃO DE<br />
CONSTRUÇÕES DE ÁCIDO NUCLEICO, SEQÜÊNCIA PROMOTORA<br />
QUIMÉRICA ISOLADA PURIFICADA, PARTÍCULAS REVESTIDAS,<br />
5 RECEPTÁCULO DE DOSAGEM PARA UM DISPOSITIVO DE<br />
LIBERAÇÃO MEDIADA POR PARTÍCULA, DISPOSITIVO DE<br />
LIBERAÇÃO MEDIADA POR PARTÍCULA, COMPOSIÇÃO<br />
FARMACÊUTICA, COMPOSIÇÃO DE VACINA, E, MÉTODO IN VITRO<br />
DE OBTER A EXPRESSÃO EM CÉLULAS DE MAMÍFERO DE UM<br />
10 POLIPEPTÍDEO DA INFLUENZA DE INTERESSE"<br />
Uma construção de ácido nucleico que compreende uma<br />
seqüência promotora quimérica e um sítio de clonagem para a inserção de<br />
uma seqüência codificadora em ligação operável com o promotor quimérico,<br />
em que a seqüência promotora quimérica compreende: (a) uma seqüência<br />
15 promotora inicial imediata de hCMV; (b) exon 1 e pelo menos uma parte do<br />
exon 2 do gene inicial imediato maior de hCMV; e (c) um íntron heterólogo<br />
fornecido no lugar da região de íntron A do gene inicial imediato maior de<br />
hCMV.