Biologia Celular e Molecular - Universidade de Coimbra

cnc.cj.uc.pt

Biologia Celular e Molecular - Universidade de Coimbra

LabRot_10_11

03/12/2010 12:46

Mestrado em

Biologia Celular e Molecular

Organizado pelo Departamento de Ciências da Vida da FCTUC

com a colaboração do Centro de Neurociências e Biologia Celular (CNC)

Rotações Laboratoriais 2010/11 e Projectos

Nas rotações laboratoriais, os estudantes acompanham e participam em projectos de investigação a decorrer em laboratórios do Centro de Neurociências e

Biologia Celular (CNC), do Instituto Biomédico de Investigação em Luz e Imagem (IBILI), da Faculdade de Medicina da Universidade de Coimbra

(FMUC) e da Faculdade de Farmácia da Universidade de Coimbra (FFUC). Os alunos podem sugerir outros laboratórios para fazer rotações (sujeito a

aprovação).

As rotações laboratoriais permitem a aprendizagem das tecnologias, estratégias experimentais e questões científicas em diferentes áreas das Ciências da Vida e da

Saúde. As rotações laboratoriais poderão ser usadas para a escolha do laboratório para desenvolver o projecto de Mestrado.

No final da rotação laboratorial (3 semanas), os estudantes escrevem um relatório e/ou apresentam o trabalho em que participaram.

Candidaturas por mail para Emília Duarte

As candidaturas podem ser feitas directamente para o investigador responsável/investigador principal (PI) do projecto quando é indicado o seu contacto de e-mail.

Neste caso, deve ser dado conhecimento à coordenadora do mestrado da aceitação na rotação e do período em que vai decorrer.

Nota: Os artigos referidos encontram-se no Material de Apoio da Rotação Laboratorial I

Laboratórios/Projectos

Molecular mechanisms of neuronal plasticity

New project

Mechanisms of neuronal death in brain ischemia

Interacção patológica entre a diabetes e a doença de Alzheimer

Retinal Dysfunction Group (IBILI)

Laboratório de Neurogenética e Genética da Visão

Ocular and Brain Pharmacology - Endothelial cell dysfunction - IBILI/FMUC

Laboratório de Neuroquímica, Serviço de Neurologia, HUC

Alterações da alfa-sinucleína induzidas por drogas de abuso

Impact of methamphetamine on the CNS

Laboratório de Farmacologia e Terapêutica Experimental (IBILI/FMUC)

Mitochondrial Toxicology and Disease Group (CNC)

Metabolism, Insulin Resistance and Complications - Molecular and Translational Medicine (CNC)

Infection and Pathogens Group (CNC)

Chronic Inflammation Group (CNC)

Imunologia Celular e Oncobiologia (CNC e FFUC)

Microbiology of Extreme Environments Group (CNC)

Laboratório de Microbiologia da Faculdade de Farmácia

Laboratório de Microbiologia e Parasitologia da Faculdade de Farmácia

Laboratório de Patologia Molecular do IPO de Coimbra

Vectors and Gene Therapy Group (CNC)

Biomaterials and Stem Cell-Based Therapies (BIOCANT)

Laboratório de Citometria de Fluxo e Cell Sorting (Centro de Histocompatibilidade)

Laboratório de Biologia Molecular Aplicada e Hematologia (FMUC/IBILI)

Groups "Neuronal Cell Death and Neuroprotection" and "Glutamatergic Synapses" (CNC)

Projecto - Molecular mechanisms of neuronal plasticity

PI - Carlos Duarte @ e Ana Luísa Carvalho @

Projecto - Mechanisms of neuronal cell death in brain ischemia

PI - Armanda Santos @ e Carlos Duarte @

Mais Info - Group Neuronal Cell Death and Neuroprotection web page

file:///Users/ED/Work/MBCM/MBCM_2010_12/WebMBCM/LabRot_10_11.html#Laborat%F3rio_de_Neurogen%E9tica_e_Gen%E9tica

Page 1 of 8


LabRot_10_11

03/12/2010 12:46

Group Glutamatergic Synapses web page

Projecto - Hippocampal neurons’ plasma membrane dynamics upon neurotrophin treatment: role of cytoskeleton and membrane composition in axonal outgrowth.

PI - Bruno Manadas @ e Carlos Duarte

Mais Info - Web page (Biocant e CNC)

Vagas - 2-3 alunos

Datas - A partir de Janeiro, a combinar

Molecular Mechanisms of Disease Group (CNC)

Projecto - A interacção patológica entre a diabetes e a doença de Alzheimer: Papel da vias de sinalização mediadas pela mitocôndria e insulina

PI - Paula I. Moreira

Mais Info - Web page

Estudos prévios do nosso laboratório mostram que as mitocôndrias são um elo funcional entre a doença de Alzheimer e a diabetes. Actualmente, estamos interessados

em explorar o papel das vias de sinalização mediadas pela mitocôndria na disfunção neuronal e endotelial que ocorre nestas doenças. Estamos a dar particular atenção à

“conversa cruzada” entre as vias de sinalização mediadas pela mitocôndria e a insulina. Por outro lado, a interacção entre a diabetes e o envelhecimento

cerebral/neurodegenerescência parece envolver a resistência à insulina, stresse oxidativo, inflamação e alterações metabólicas, resultando em alterações cognitivas e

aumentando o risco para a doença de Alzheimer. Assim, pretendemos analisar o envolvimento de vários mecanismos bioquímicos no potencial efeito protector da terapia

insulínica contra alterações comportamentais e neurodegenerescência associadas ao género e envelhecimento, em modelos animais de diabetes. Também pretendemos

clarificar o potencial papel protector do pré-condicionamento induzido por hipoxia na doença de Alzheimer. Em última análise, o nosso objectivo é o de encontrar novos

alvos para intervenção terapêutica.

Vagas - 1 rotação/semestre com 1-2 alunos

Datas - A combinar

Retinal Dysfunction Group (IBILI)

Centro de Oftalmologia e Ciências da Visão, IBILI, Faculdade de Medicina (Pólo III)

Projecto - Life and death of retinal ganglion cells: unmasking the neuromodulatory and neuroprotective roles of neuropeptide Y

PI - António Francisco Ambrósio @

O neuropeptídeo Y (NPY) encontra-se amplamente distribuído no Sistema Nervoso Central, e os seus efeitos são mediados pela activação de vários

receptores: NPY Y1, Y2, Y3, Y4, Y5 e y6. Na retina, a imunorreactividade para o NPY está localizada principalmente nas células amácrinas, mas

também nas células ganglionares (CGs).

O NPY é um forte neuroprotector no cérebro. Verificámos que o NPY pode também proteger as células da retina (Álvaro et al., 2008a), e que inibe a

libertação de [3H]D-aspartato e o aumento da [Ca2+]i em neurónios da retina, o que pode contribuir para aquele efeito. Apesar de as CGs serem

praticamente inexistentes nestas culturas, colocamos a hipótese de que o NPY pode exercer um efeito protector nestas células. O glaucoma é uma

doença degenerativa da retina, sem cura, caracterizada pela morte das CGs. A pressão intraocular (PIO) elevada é considerada o maior factor de

risco para o desenvolvimento da doença, no entanto, como a redução da PIO não previne a morte das CGs, o uso de estratégias neuroprotectoras

para o tratamento de glaucoma tem vindo a ser enfatizado. Tendo em conta os efeitos protectores do NPY, este poderá ser visto como um potencial

agente neuroprotector em glaucoma.

O objectivo principal deste projecto é avaliar o potencial efeito protector do NPY na degeneração das CGs.

Demonstrámos que vários receptores do NPY são expressos na retina (Álvaro et al., 2007), mas não sabemos quais são expressos nas CGs. Para

esclarecer este ponto, na tarefa 1 iremos usar RT-PCR quantitativo em culturas purificadas de CGs. Na tarefa 2 iremos avaliar o efeito protector do

NPY, e os receptores envolvidos, em culturas purificadas de CGs e explantes da retina expostos a condições hiperbáricas ou NMDA, visto que a PIO

elevada e a excitotoxicidade desempenham papéis importantes no glaucoma. As culturas de células e os explantes da retina serão incubados com

agonistas e antagonistas selectivos para os receptores do NPY. A morte celular será avaliada com ensaios de TUNEL, imunohistoquímica e Western

blotting. Para analisar a morte das CGs faremos marcação retrógrada com fluorogold e utilizaremos também as técnicas referidas acima. Serão

realizados electrorretinogramas para avaliar a resposta da retina a estímulos luminosos.

Vagas - Apenas 1 aluno em rotação laboratorial. Possibilidade de acolher vários alunos.

Datas - A combinar

Projecto - Crosstalk between retinal ganglion cells and microglia: neuroprotection by adenosine receptors in glaucoma

PI - Ana Raquel Santiago @

Glaucoma is the second cause of blindness, affecting approximately 67 million people in the world (Resnikoff et al. 2004). It is characterized by

progressive loss of retinal ganglion cells (RGCs) which leads to visual field loss. Elevated intraocular pressure (IOP) is implicated as the primary insult

and lowering IOP is the only clinical therapy available for treatment. Unfortunately, some patients continue to lose vision despite successful IOP

control. Development of novel neuroprotective therapeutic strategies targeting damaged RGCs is the major challenge in glaucoma research

nowadays. The mechanisms of RGC loss are still unclear. Neuroinflammation plays a role in glaucoma and microglial cells become activated and

release inflammatory mediators.

Adenosine is a neuromodulator in central nervous system. It activates inhibitory (A1 and A3) and facilitatory (A2A and A2B) adenosine receptors

(ARs). All ARs are present in the retina, namely A1R and A3R are expressed by RGCs and A2AR is expressed by microglia. ARs have been reported

to be involved in protection of the retina against several insults (Li et al. 1999, Ferreira & Paes-de-Carvalho 2001, Oku et al. 2004, Zhang et al.

2006b). We hypothesize that ARs can protect RGCs in glaucoma.

The main aims are: to investigate whether the modulation of A2AR activity controls microglia-induced neuroinflammation; to investigate the

neuroprotective effects of A3R activation against RGC death in glaucoma; and to elucidate whether the balance of A1R and A2AR is altered in the

retina in glaucoma.

Our ultimate goal is to protect RGCs against cell death induced by elevated IOP, targeting A2ARs in microglia and A3Rs in RGCs.

In summary, with this project we expect to demonstrate that ARs protect RGCs which might help developing new therapeutic strategies to treat

glaucoma.

Vagas - Apenas 1 aluno em rotação laboratorial. Possibilidade de acolher vários alunos.

Datas - A combinar com os alunos

Laboratório de Neurogenética e Genética da Visão (CNC/IBILI)

Project - Diagnóstico Molecular de Parkinson

Project - Avaliação de mutações no gene da Glucocerebrosidase como factor preditivo de deterioração cognitiva

PI - Maria do Rosário Almeida @

Molecular testing of Neurodegenerative and Vision related genetic diseases are one of the main aims of this group which started its activity at Neuroscience Center and

Cell Biology (CNC), on April 2009. Since then, a wide range of genetic tests have been implemented in the Neuroscience area, in particularly, in Neurodegenerative

disorders such as: Frontotemporal Dementia, Familial Alzheimer Disease and Parkinson Disease. In addition, the molecular diagnosis is also available to some vision

file:///Users/ED/Work/MBCM/MBCM_2010_12/WebMBCM/LabRot_10_11.html#Laborat%F3rio_de_Neurogen%E9tica_e_Gen%E9tica

Page 2 of 8


LabRot_10_11

03/12/2010 12:46

inherited diseases such as: Nanophthalmia and Retinitis pigmentar, towards an early diagnosis when it is still possible to prevent irreversible damages by the use of

successful treatments. Therefore, the molecular diagnosis has playing an important role in clinical practice, improving the patient’s diagnostic, prognosis, and therapeutic

decisions and also it allows the identification of the relatives at high risk to develop the disease, in the context of formal genetic counselling.

At the same time, the group is involved in research activity which is fundamental to establish not only the new research findings that are of relevance in a clinical setting,

but also to find out the best way to move these quickly from a research setting to diagnostic service in a timely and efficient manner. Thus, several Research Projects have

been outline and are eligible to be carried out by Postgraduate students under the supervision of team members. One of these Projects concerns the assessment of the

frequency and clinical characterstics of carriers of the two most common mutations reported, N370S and L444P, in Glucocerebrosidase gene (GBA) with early-onset

Parkinson disease. Mutations in GBA gene have been reported to modify risk for Parkinson disease and Dementia with Lewy bodies and more recently The Consortium on

Risk for Early Onset Parkinson Study has found 6,9% of patients with mutations in this gene. Another Project concerns the molecular diagnosis of Pakinson Disease which

aim to find out whether it is worth to expand the mutation search to all the six pathogenic mutations reported in LRRK2 in a routine basis to our population.

Vagas - 2 alunos

Datas - A combinar com os alunos

Ocular and Brain Pharmacology - Endothelial cell dysfunction (IBILI/FMUC)

Projecto - Estudo da disfunção endotelial na retina em modelos animais de diabetes e efeitos terapêuticos da sitagliptina

Projecto - Avaliação da disfunção das células endoteliais da microvasculatura da retina num modelo animal com a doença de Alzheimer

PI - Rosa Fernandes @

Mais Info - Web page

2 artigos do grupo: Antonio et al_2009_EurJClinPharmacol.pdf; Bento_Fernandes_2010_Exp Physiol.pdf

Vagas - 3 alunos

Datas - A combinar com os alunos

Laboratório de Neuroquímica, Serviço de Neurologia, HUC

PI - Inês Baldeiras @

Projecto - Biological markers in Multiple Sclerosis: relevance for prognosis and therapeutical managment

Multiple Sclerosis (MS) is the most common non-traumatic disorder of the central nervous system (CNS) in young adults. Although the etiology of

MS is still unknown, it is generally believed to be an immune-mediated disorder that occurs in genetically susceptible people, in which myelin or

oligodendrocyte proteins serve as autoantigens. Several pathophysiological processes (including inflammation, demyelination, axonal damage and

repair mechanisms) participate in the disease process and are not uniformly represented across patient populations. The multiplicity in neurological

deficits, the relative admisture of relapses/remissions, with or without overall progression, and the severity of the disease, leads to a marked clinical

heterogeneity in patients with MS. There is therefore an emerging need to observe disease activity by simple and reliable laboratory tests, not only to

describe clinical disease activity at a given time point, but ideally also to predict the progression of this disabling disease.

The objective of this project is to find markers that will allow for a better biochemical characterization and clinical management of multiple sclerosis

in humans.

A wide range of putative biomarkers will be studied, both in CSF and serum from MS patients, associated with several pathophysiological process:

activation of the immune system, blood-brain barrier disruption, oxidative stress, axonal damage and gliosis. This will aim at finding markers for

disease activity, disease sub-type and prognosis.

We will also investigate possible relations between serum biochemical markers and the patients’ response to specific standard treatments, according

to their clinical history. We expect to find markers that could help predict distinct responses to therapy and offer new insight into drug-induced

changes relevant for therapeutic efficacy.

Projecto - Early diagnosis of Alzheimer´s Disease: identification of biomarkers

Alzheimer´s Disease (AD) is a major concern among ageing disorders. Early and accurate diagnosis of AD is crucial for intervention and treatment as

well as for planning assistance and economical resources. Nonetheless the diagnosis is still uncertain and difficulties remain in its differentiation from

normal aging, depression and other dementias. The clinical interest in establishing an early diagnosis has led to a concept of a transitional state

between normal and dementia widely known as Mild Cognitive Impairment (MCI).

Analysis of various brain-specific proteins in the cerebrospinal fluid (CSF), amyloid beta (1-42) (Aβ42), total tau (t-tau) and phosphorylated tau at

threonine 181 (p-tau181), has already proven to be very sensitive and specific for AD. Research effort now aims at evaluating the performance of

these CSF markers in MCI cases.

In this work we will determine the CSF levels of Aβ42, t-tau and p-tau181 in MCI patients, AD patients and controls (DFT patients and normal

controls). By that we expect to establish cut-off values for these biomarkers in MCI and AD patients and evaluate the accuracy of CSF markers in the

early diagnose of AD. MCI patients will be followed-up and the utility of these markers in identifying MCI cases that latter will progress to AD will be

assesssed.

Additionaly, we propose to explore a new panel of potential markers, namely oxidative stress and mithocondrial dysfuntion markers that could help

predict progression to AD in MCI patients.

Projecto - Molecular Diagnosis of Muscular Dystrophies

Limb-girdle muscular dystrophy (LGMD) is a family of muscular dystrophies affecting voluntary muscles, mainly those around the hips and shoulders.

While LGMD isn't a fatal disease, it may eventually weaken the heart and lung muscles, leading to illness or death due to secondary disorders. The

various forms of limb-girdle dystrophy are very difficult to differentiate on clinical grounds alone and determining the exact subtype of LGMD in a

particular patient is important for genetic counselling and care as they carry different risks of complications.

LGMD is typically an inherited disorder, though it may be inherited as a dominant, recessive, or X-linked genetic defect. There are at least 19 forms

of LGMD that are classified by the genetic flaws that appear to cause them. So far, 15 specific genes that lead to production of several muscle

proteins have been implicated as definite causes of LGMD. The result of the defect is that muscles cannot properly form the proteins needed for

normal muscle function. The mutations identified to date in LGMD patients have been very small and therefore extremely time consuming and

laborious to identify. Furthermore, linkage analysis which would indicate the location of the affected gene, is only rarely informative because it

requires large families with affected members.

The importance of protein screening in the diagnostic process has therefore been emphasized. The aim of this work is to implement and optimize

protein expression analysis for the most common forms of autosomal recessive LGMD: LGMD2A, a calpainopathy; LGMD2B, a dysferlinopathy and

LGMD2C-F, all sarcoglycanopathies. Dystrophic muscle biopsies will be used and protein expression will be assessed by immunocytochemical and/or

immunoblotting techniques. Identification of a protein defect on muscle biopsy will allow the selection of candidate patients for subsequent mutation

detection analysis.

Vagas - 2-3 alunos

Datas - A partir de Janeiro 2011, a combinar com os alunos.

Mitochondrial dysfunction and signaling in neurodegeneration

Projecto - Alterações da alfa-sinucleína induzidas por drogas de abuso

PI - Ana Cristina Rego, Teresa Oliveira @ e Rita Perfeito

file:///Users/ED/Work/MBCM/MBCM_2010_12/WebMBCM/LabRot_10_11.html#Laborat%F3rio_de_Neurogen%E9tica_e_Gen%E9tica

Page 3 of 8


LabRot_10_11

03/12/2010 12:46

Mais Info - Web page

A doença de Parkinson e a toxicodependência partilham alterações na neurotransmissão dopaminérgica. Os níveis de alfa-sinucleína, uma proteína existente nos

terminais dopaminérgicos, encontram-se alterados na doença de Parkinson (a alfa-sinucleína é o principal componente dos corpos de Lewy) e também após consumo de

cocaína (Mash et al, 2003, J Neurosci. 23:2564-71), anfetaminas (Mauceli et al, 2008, Ann N Y Acad Sci.;1074:191) ou heroína (Horvath et al, 2007, J

Neurosci.;27:13371-5). Foi demonstrado que a alfa-sinucleína modula a função do transportador de dopamina (DAT) (ver Eriksen et al, 2010, J Neurochem 113:27-41), o

alvo molecular clássico da cocaína, que bloqueia a sua função. A anfetamina também afecta este transportador, funcionando como substrato, sendo captada através dele

para o interior dos terminais pré-sinápticos. Foi também demonstrado que a ligação da alfa-sinucleína ao DAT acelera a apoptose induzida pela dopamina (Lee et al,

2001, FASEB J 15:916-26), sugerindo uma potencial contribuição para a disfunção dopaminérgica observada em toxicodependentes.

Neste projecto pretendemos avaliar alterações da alfa-sinucleína (e.g. expressão, fosforilação e/ou libertação) numa linha celular dopaminérgica (efeitos pré-sinápticos) e

em culturas primárias de neurónios corticais de embrião de rato (efeitos pós-sinápticos), após exposição aguda a drogas de abuso.

Cunha-Oliveira T, Rego AC, Oliveira CR (2008) Cellular and molecular mechanisms involved in the neurotoxicity of opioid and psychostimulant drugs. Brain Res Rev.

58(1): 192-208. Pdf

Perfeito R, Rego AC (2008) Post-translational modifications of alpha-synuclein and mitochondrial dysfunction in Parkinson´s disease. In: “Protein misfolding in Biology and

Disease” (Outeiro T, Ed.) Transworld Research Network, chapter 7, pages 203-230. Pdf

Vagas - 2 alunos (em sinultâneo)

Datas - A partir de Janeiro de 2011

Ocular and Brain Pharmacology group - subgroup of Drugs of Abuse Research (IBILI)

Projecto - Impact of methamphetamine on the CNS: neuroinflammation, neurogenesis and blood-brain barrier

PI - Ana Paula Silva Martins @

Mais Info - Group web page

Recent paper: Gonçalves et al (2010) Methamphetamine-induced neuroinflammation and neuronal dysfunction in the mice hippocampus: preventive

effect of indomethacin. Eur. J. Neurosci. 31, 315-326.

Vagas - 3 alunos

Datas - A combinar com os alunos

Laboratório de Farmacologia e Terapêutica Experimental (IBILI/FMUC)

Projecto - Assessing the effects of drugs of abuse in the peripheral nervous system through functional studies

Pi - Sónia Silva e Frederico Costa Pereira

Para além da anfetamina ser simpaticomimética de acção indirecta é também um agonista dos trace amine-associated receptors (TAAR1). Os nossos

resultados preliminares mostram que a anfetamina produz contracção do íleo e a aorta de rato. Neste projecto queremos avaliar qual a contribuição

destes receptores para as alterações do sistema nervoso periférico induzidas por este psicoestimulante.

Mais Info - Sónia A. Silva, Francisco B. Marques, Carlos A. Fontes Ribeiro (2007) Characterization of the human basilar artery contractile response to 5-HT

and triptans. Fundamental and Clinical Pharmacology 21: 265-272.

Project - Antidiabetic drugs: neuroprotective strategy in drug addiction

PI - Carlos Fontes Ribeiro e Frederico Costa Pereira

Tem sido atribuído um papel neuroprotector aos receptores "peroxisome proliferator-activated" (PPAR)(factores de transcrição que pertencem à

família dos receptores nucleares hormonais) e à GLP-1 (uma importante hormona incretínica). Pretendemos avaliar se as glitazonas (agonistas

PPAR-gama) e a sitagliptina (facilitador da acção GLP-1), fármacos usados como antidiabéticos orais, podem prevenir a disfunção neuronal

produzida por

doses neurotóxicas de metanfetamina, um derivado da anfetamina.

Mais Info - Pereira FC, Gough B, Macedo TR, Ribeiro CF, Ali SF, Binienda ZK (2009) Buprenorphine Modulates Methamphetamine-Induced Dopamine Dynamics in

the Rat Caudate Nucleus. Neurotox Res.

Vagas - 1 estudante/projecto

Datas - A partir de Janeiro 2011

Mitochondrial Toxicology and Disease Group (CNC)

Projecto - Testing Mito-cans for Anticancer Therapy

PI - Paulo J. Oliveira

The objective of this project is to identify compounds that specifically target mitochondria in tumor cells in order to lead to their death. We are currently working not only

with compounds of natural origin, but also with synthetic compounds of different origins

Projecto - Alterations of Mitochondrial Physiology During Cancer Stem Cell Differentiation

PI - Paulo J. Oliveira/Ignacio Vega-Naredo

The objective of this project is to demonstrate that mitochondria in tumor cancer stem cells have specific properties that increase their ability to escape chemotherapy that

affect their differentiated counterparts

Projecto - Phytoestrogens as a Viable Alternative to Hormonal Therapy - Role of Mitochondrial Toxicity

PI - Vilma Sardão

The objective of the present project is to investigate whether selected phytoestrogens can replace beta-estradiol in post-menopause therapy. We are interested first in

comparing the different phytoestrogens vs. estradiol regarding mitochondrial toxicity aspects.

Mais Info - Group web page

Pereira et al_2008_Tox Sci_Berberine and ANT.pdf

Serafim et al_2008_J Theor Exp Pharmacol.pdf

Sardao et al_2008_Expert Opinion Drug Safety_Review.pdf

Pereira et al_2009_Curr Drug Safety_Review Mitochondria as a Biosensor.pdf

PereiraG et al_2007_J Ther Exp Pharmacol_ berberine.pdf

file:///Users/ED/Work/MBCM/MBCM_2010_12/WebMBCM/LabRot_10_11.html#Laborat%F3rio_de_Neurogen%E9tica_e_Gen%E9tica

Page 4 of 8


LabRot_10_11

03/12/2010 12:46

Vagas - 3

Datas - A partir de Janeiro de 2011

Laboratory of Metabolism, Insulin Resistance and Complications - Molecular and Translational Medicine (CNC)

PI - Eugenia Carvalho @

Projectos - The role of neuropeptides in wound healing

Molecular mechanisms of heart failure

The adipocyte as an endocrine organ

Mechanisms of imflammation

Mais Info - Group webpage

Vagas - 2-4 alunos

Datas - Fevereiro - Julho 2011

Infection and Pathogens Group (CNC)

PI - Otília Vieira @

Project - Role and Molecular Mechanisms Underlying CD36-Mediated Phagocytosis of Apoptotic Cells: Implications for Atherosclerosis

For further information see this paper by the group: Traffic_Rab10 phagosome maturation.pdf

Project - Surfactants in the Prophylaxis of Sexually Transmitted Infections and in Oral Hygiene

For further information see this paper by the group: Vieira et al_08_PLoS One.pdf

Datas - A partir de Dezembro 2010

Chronic Inflammation Group (CNC)

PI - Margarida Carneiro @

Projecto - Caracterização dos linfócitos B de memória IgD+CD27+ em indivíduos saudáveis e com artrite reumatóide

Os linfócitos B IgD+CD27+ estão definidos como pertencendo ao conjunto dos linfócitos B de memória. Porém, esta classificação contradiz alguns

dos dogmas associados à formação de memória imunológica, que geralmente também implica a mudança de cadeia de imunoglobulina de IgD para

IgG, IgA, IgE ou IgM. Além disso, ainda pouco se sabe sobre as funções destas células, em grande parte devido à “inexistência” desta população nos

modelos animais. Sabe-se, porém, que em indivíduos com artrite reumatóide esta população encontra-se diminuida no sangue periférico.

Eevntualmente, estes linfócitos B terão caracterísitcas semelhantes às células do sistema imunitário inato, fazendo parte de uma primeira linha de

defesa contra patogéneos.

O objectivo deste projecto é caracterizar (fenótipo e função) a população de linfócitos B IgD+CD27+ em dadores saudáveis e comparar com

macrófagos/monócitos e estabelecer as eventuais diferenças existentes nos doentes com artrite reumatóide.

Mais Info - Group web page

Projecto - Role of human Natural Killer cell receptors in the progression of Mycobacterium tuberculosis infection to pulmonary disease

PI - Paulo Rodrigues Santos

Almost of the pulmonary tuberculosis (TB) studies released focus on monocytes/macrophages and dendritic cells action, granuloma formation as well

as T cells’ role in the disease. Recent work demonstrates a role of IFNg signalling in the pathogenesis of TB, which has implications for vaccine and

therapeutic development. It is known that in inflammatory processes, NK cells are the major producer of IFNg. This project aims at clarifying the role

of NK cell receptors and IFNg signalling in the pathogenesis of TB.

Projecto - Impaired peripheral Natural Killer cell differentiation in defective Reactive Oxygen Species production

PI - Paulo Rodrigues Santos

Deficiency in genes of the NADPH oxidase complex - leading to a reduced production of ROS – contribute to development of severe chronic

autoimmune diseases (e.g., rheumatoid arthritis, chronic granulomatous disease - CGD), presenting a solid link between low ROS production and

chronic inflammation. However, the precise mechanisms underlying impaired resolution in the chronic inflammatory process are still ill defined. Since

NK cells are seen as regulators of the inflammatory process, the present work aims at identifying defects in the NK cell compartment caused by the

absence of ROS production in human (CGD patients), rat and mouse experimental models.

Projecto - Cross-talk of Natural Killer cells in chronic renal failure, inflammation and erythropoiesis in resistance to recombinant human

erythropoietin therapy

PI - Paulo Rodrigues Santos

Anaemia is a common complication in haemodialysis patients. This anaemia is due to the inability of the failing kidneys to secrete erythropoietin

(EPO) to stimulate erythropoiesis. The introduction of recombinant human EPO (rhEPO) therapy led to a significant reduction in anaemia and

improved patients’ quality of life. However, there is a marked variability in the sensitivity to rhEPO, with up to 10-fold variability in dose

requirements to achieve correction of anaemia. Our aim is to clarify the cross-talk of Natural Killer cells in the triad chronic renal

failure/inflammation/erythropoiesis, at tissue levels that might contribute to the understanding of the development of resistance to rhEPO therapy in

chronic kidney disease patients.

Cellular Immunology and Oncobiology Group (CNC)

em colaboração com o Serviço de Ortopedia e Banco de Ossos dos Hospitais da Universidade de Coimbra

Projecto - Identificação de compostos com actividade anti-inflamatória em óleos essenciais.

PI - Alexandrina Ferreira Mendes

Este projecto está a ser desenvolvido em colaboração com o Laboratório de Farmacognosia da Faculdade de Farmácia/Centro de Estudos

Farmacêuticos da Universidade de Coimbra, onde são preparados e fraccionados os óleos essenciais e identificados os seus componentes. A

actividade farmacológica desses compostos está a ser avaliada para determinar a sua capacidade para inibir a activação de factores de transcrição e

a expressão de genes envolvidos nas respostas inflamatória e catabólica responsáveis pela degradação da cartilagem que caracteriza as patologias

artríticas e a destruição da mucosa intestinal na doença inflamatória crónica. Como modelos, estão a ser utilizadas, no primeiro caso, culturas de

primárias de condrócitos humanos e linhas celulares condrocíticas humanas e, no segundo, linhas de células do cólon humanas. Artigo 1

Mais Info - Artigo do grupo: Planta Medica_2010_screening essential oils.pdf

file:///Users/ED/Work/MBCM/MBCM_2010_12/WebMBCM/LabRot_10_11.html#Laborat%F3rio_de_Neurogen%E9tica_e_Gen%E9tica

Page 5 of 8


LabRot_10_11

03/12/2010 12:46

Projecto - Papel dos canais K(ATP) na regulação do transporte de glucose em condrócitos humanos normais e osteoartríticos (OA).

PI - Alexandrina Ferreira Mendes

A regulação do transporte de glucose pelo condrócito é essencial para a produção de energia e para a síntese de proteoglicanos e manutenção da

matriz da cartilagem. Os mecanismos através dos quais os condrócitos normais/jovens ajustam o transporte de glucose em função da sua

concentração extracelular são desconhecidos. Por outro lado, desconhecem-se também as causas da incapacidade dos condrócitos osteoartríticos

para se adaptarem a alterações na concentração extracelular de glucose. O objectivo deste projecto é elucidar o papel dos canais de K+ dependentes

de ATP [K(ATP)] como sensores de glucose em condrócitos normais e OA. Artigo 2

Mais Info - Artigo do grupo: Arthritis Research & Therapy_2009.pdf

Datas - A partir de Janeiro de 2011

Microbiology of Extreme Environments Group (CNC)

Pojecto - Functional analysis of maltokinases from saprophytic and pathogenic bacteria

PI - Nuno Empadinhas @

The genus Mycobacterium is composed by over 100 species and while many are free-living organisms from distinct environments, others are

intracellular pathogens in animals ranging from marine sponges to humans. The gene mak coding for the enzyme maltokinase (Mak), which catalyzes

the synthesis of maltose-1-phosphate, is present in most mycobacterial genomes available and in those of unrelated bacteria. Moreover, Mak was

considered essential for the growth of Mycobacterium tuberculosis, hence an attractive target for the development of new drugs for tuberculosis.

However, this enzyme’s function is still poorly understood. Although mak seems to be constitutively expressed in this organism, increasing levels of

maltose-1-phosphate were found to be toxic to this human pathogen. We will probe Mak expression and function in selected free-living bacteria and

intracellular pathogens to understand the fine-tuned regulation of its function and integration into bacterial metabolism.

Mais Info - Group web page

Mendes et al (2010) Biochemical characterization of the maltokinase from Mycobacterium bovis.

Vagas - 2 alunos

Datas - A partir de Janeiro de 2011

Laboratório de Microbiologia da Faculdade de Farmácia da Universidade de Coimbra (Pólo III)

Projectos - Estudo de factores de virulência em Salmonella e Escherichia coli isoladas de alimentos de origem animal

Virulência associada a resistência aos antibióticos em Enterobactérias de origem clínica

Virulência e resistência em estirpes de Escherichia coli isoladas em doentes com colite ulcerosa

Patogenicidade de Acinetobacter baumannii: resistência versus virulência

PI - Gabriela Jorge da Silva

Vagas - 3 alunos

Datas - A partir de Janeiro de 2011

Laboratório de Microbiologia e Parasitologia da Faculdade de Farmácia da Universidade de Coimbra (Pólo III)

Projecto 1 - Estudos de actividade anti-Leishmania de novas moléculas: caracterização da acção farmacológica e toxicológica

Ver Projecto 1_MCSousa.pdf

Projecto 2 - Caracterização genética de Giardia lamblia de origem humana e animal: impacto nos ciclos de transmissão

Ver Projecto 2_MCSousa.pdf

Projecto 3 - Caracterização genética de estirpes de Leishmania de origem humana e animal.


Ver Projecto 3_MCSousa.pdf

PI - Maria do Céu Rodrigues de Sousa @

Datas - A partir de Janeiro de 2011

Laboratório de Patologia Molecular do IPO de Coimbra

PI - Teresa Martins

Lab Info - O Laboratório de Patologia Molecular do IPO de Coimbra é um serviço de vertente dupla, que se dedica tanto à realização de exames de rotina, como

à

investigação.

A Unidade de Diagnóstico Molecular tem como objectivo apoiar, de forma transversal, os serviços clínicos na informação da patologia molecular,

nomeadamente através da realização de testes genéticos para síndromas hereditários de cancro, caracterização molecular de tumores e estudos de

farmacogenómica. A Unidade de Investigação tem por objectivo a realização de projectos de investigação na área das Ciências Biomédicas,

nomeadamente em genética e biologia do cancro e imunologia. Tem vindo a desenvolver trabalhos de investigação em carcinogénese da tiróide,

factores de susceptibilidade para cancro da mama e para cancro do colo do útero associado a infecções pelo papilomavirus humano (HPV), e em

autoimunidade e

infecção.

Vagas - 2 alunos por rotação

Datas - A combinar com os alunos.

file:///Users/ED/Work/MBCM/MBCM_2010_12/WebMBCM/LabRot_10_11.html#Laborat%F3rio_de_Neurogen%E9tica_e_Gen%E9tica

Page 6 of 8


LabRot_10_11

03/12/2010 12:46

Vectors and Gene Therapy Group (CNC)

Project - Targeted combined chemoterapy

PI - João Nuno Moreira

Mais Info - Paper by the group: Pinto et al (2010) Liposomal Imatinib-Mitoxantrone Combination: Formulation Development and Therapeutic Evaluation in an

Animal Model of Prostate Cancer

Vagas - 1 aluno de cada vez

Datas - A combinar

Projecto - Development of a novel antitumoral strategy involving a concerted action of gene therapy and chemotherapeutic agents

PI - Henique Faneca

Vagas - 1 aluno

Gene therapy constitutes a promising strategy to the treatment of cancer, due to the discovery of new molecular targets associated to this disease,

and consequently to the opportunity to generate novel therapeutic approaches. For pancreatic cancer, recent studies indicate that the overexpression

of some microRNAs (miRNAs) is associated to the development of this disease. On the other hand, we have recently shown that the gene delivery

efficiency of lipoplexes is highly enhanced by the presence of very low amounts of some chemotherapeutic agents. In this context, the main goal of

this project is to generate a novel strategy for treatment of pancreatic cancer, consisting of a combination of gene therapy (involving anti-microRNA

oligonucleotides) and chemotherapy (using low amounts of chemotherapeutic agents) in order to achieve an effective and synergistic antitumoral

activity, without causing significant side effects.

Datas - A partir de Janeiro

Projecto - Viral gene therapy for Central Nervous System

PI - Luís Pereira de Almeida

Vagas - 2 alunos (1 de cada vez)

Datas - A combinar

Biomaterials and Stem Cell-Based Therapies (BIOCANT)

Projecto - Biomaterials to modulate cellular activity

PI - Lino Ferreira

Mais Info - Group web page

Vagas - 1-2 alunos

Datas - Em 2011, a combinar

Laboratório de Citometria de Fluxo e Cell Sorting (Centro de Histocompatibilidade de Coimbra)

Projectos - Papel das Células Dendríticas do sangue periférico na infecção por HCV (Hepatitis C virus)

Papel das Células T expecíficas para antigénios do HCV do sangue periférico na infecção por HCV

PI - Artur Paiva

Vagas - 2 alunos

Datas - A combinar

Laboratório de Biologia Molecular Aplicada e Hematologia (FMUC/IBILI)

PI - Ana Bela Sarmento Ribeiro @

Projecto - Avaliação de mecanismos celulares e moleculares envolvidos no cancro e na sensibilidade e resistência a fármacos anti-cancerígenos;

Estudo de novas abordagens terapêuticas dirigidas a alvos moleculares em neoplasias sólidas e hematológicas

Vagas - 1-2 alunos

Datas - Janeiro, Maio ou Junho (a combinar)

file:///Users/ED/Work/MBCM/MBCM_2010_12/WebMBCM/LabRot_10_11.html#Laborat%F3rio_de_Neurogen%E9tica_e_Gen%E9tica

Page 7 of 8


LabRot_10_11

03/12/2010 12:46

file:///Users/ED/Work/MBCM/MBCM_2010_12/WebMBCM/LabRot_10_11.html#Laborat%F3rio_de_Neurogen%E9tica_e_Gen%E9tica

Page 8 of 8

More magazines by this user
Similar magazines