16.09.2013 Views

AF-21 Rappfotometer - Umeå universitet

AF-21 Rappfotometer - Umeå universitet

AF-21 Rappfotometer - Umeå universitet

SHOW MORE
SHOW LESS

Create successful ePaper yourself

Turn your PDF publications into a flip-book with our unique Google optimized e-Paper software.

<strong>Umeå</strong> Universitet<br />

Biomedicinska analytikerprogrammet<br />

Årskull:<br />

Laborationsrapport<br />

Absorbansmätningar<br />

XXXXXX och YYYYYY<br />

Laborationsdatum: Inlämnad Godkänd<br />

Handledare:


Moment I: Ljusabsorption i kyvetter<br />

1)<br />

Tabell 1. Uppmätta absorbansvärden för en plastkyvett,<br />

glaskyvett och kvartskyvett vid olika våglängder.<br />

Våglängd Abs Abs Abs<br />

(nm) plastkyvett glaskyvett kvartskyvett<br />

200 3,381 3,344 0,696<br />

205 3,584 3,536 0,494<br />

<strong>21</strong>0 3,708 3,489 0,398<br />

<strong>21</strong>5 3,562 3,386 0,315<br />

220 3,615 3,534 0,266<br />

225 3,587 3,653 0,239<br />

230 3,871 3,7 0,<strong>21</strong>2<br />

235 3,671 3,486 0,17<br />

240 3,601 3,488 0,13<br />

245 3,643 3,676 0,105<br />

250 3,913 3,703 0,099<br />

255 3,91 3,645 0,068<br />

260 4,024 3,638 0,066<br />

265 3,913 3,548 0,064<br />

270 3,708 3,578 0,065<br />

275 3,752 3,452 0,064<br />

280 3,537 3,345 0,06<br />

285 3,453 2,79 0,06<br />

290 2,289 1,924 0,057<br />

295 1,532 1,278 0,056<br />

300 0,91 0,86 0,056<br />

305 0,725 0,577 0,057<br />

310 0,633 0,385 0,051<br />

315 0,578 0,264 0,05<br />

320 0,536 0,19 0,048<br />

325 0,501 0,136 0,049<br />

330 0,472 0,102 0,049<br />

335 0,446 0,08 0,048<br />

340 0,4<strong>21</strong> 0,069 0,049<br />

345 0,402 0,06 0,048<br />

350 0,385 0,053 0,048


2)<br />

4,5<br />

4<br />

3,5<br />

3<br />

2,5<br />

2<br />

1,5<br />

1<br />

0,5<br />

0<br />

200 220 240 260 280 300 320 340<br />

Figur 1. Visar absorption som funktion av våglängden för de olika kyvettyperna.<br />

Abs<br />

plastkyvett<br />

Abs<br />

glaskyvett<br />

Abs<br />

kvartskyvett<br />

3)<br />

Kvartskyvetten går att använda i nästan hela våglängdsspektrat som undersöktes. Möjligtvis<br />

att den absorberar lite för mycket i sig själv vid våglängderna mellan 200 och 250 nm.<br />

Plastkyvetten och glaskyvetten däremot, som följdes åt ganska bra, absorberade väldigt<br />

mycket i sig själv från 200 nm till cirka 280 nm. Därefter skedde en kraftig minskning av<br />

absorbansen. Dock var absorbansvärdena nere under 0,5 först vid våglängden 305 nm<br />

(glaskyvett) respektive 330 nm (plastkyvett). Skulle man fortsätta mätningen upp på längre<br />

våglängder ser det ut som att både glas- och plastkyvetten skulle komma ner närmare noll i<br />

absorbansvärde. Alltså lämpar sig plast- och glaskyvetter bäst vid absorbansmätningar över<br />

cirka 300 nm.<br />

Moment II: Våglängdsscanning med U1100<br />

1)<br />

Tabell 2. Uppmätta absorbansvärden för proteinlösning vid olika<br />

våglängder efter blank med H20 respektive Bio-Rad<br />

Abs prov med Abs prov med<br />

Våglängd H2O som Bio-Rad som<br />

(nm)<br />

blank<br />

blank<br />

400 0,561 -0,096<br />

410 0,605 -0,113<br />

420 0,681 -0,137<br />

430 0,766 -0,167<br />

440 0,84 -0,193<br />

450 0,89 -0,<strong>21</strong>3<br />

460 0,915 -0,224<br />

470 0,918 -0,227<br />

480 0,899 -0,2<strong>21</strong><br />

490 0,866 -0,208<br />

500 0,823 -0,182<br />

510 0,785 -0,146


2)<br />

absorbans<br />

1,2<br />

1<br />

0,8<br />

0,6<br />

0,4<br />

0,2<br />

0<br />

-0,4<br />

520 0,758 -0,091<br />

530 0,755 -0,012<br />

540 0,783 -0,095<br />

550 0,834 0,<strong>21</strong>4<br />

560 0,884 0,32<br />

570 0,919 0,396<br />

580 0,938 0,44<br />

590 0,947 0,459<br />

600 0,956 0,457<br />

610 0,967 0,442<br />

620 0,985 0,417<br />

630 1,001 0,384<br />

640 1,003 0,349<br />

650 0,982 0,314<br />

660 0,931 0,281<br />

670 0,853 0,252<br />

680 0,751 0,226<br />

690 0,641 0,205<br />

700 0,527 0,184<br />

710 0,422 0,164<br />

720 0,33 0,144<br />

730 0,255 0,125<br />

740 0,194 0,105<br />

750 0,15 0,091<br />

-0,2400<br />

500 600 700<br />

våglängd (nm)<br />

Abs prov med H2O<br />

som blank<br />

Abs prov med Bio-Rad<br />

som blank<br />

Figur 2. Visar absorptionen som funktion av våglängden för mätningarna av provet<br />

med H2O resp. Bio-Rad som blank.<br />

3)<br />

Absorbansmätning av proteinlösningar blandade med Bio-Rad bör mätas vid cirka 600 nm<br />

eftersom båda graferna uppvisar höga absorbansvärden där. Anledningen till att grafen som är<br />

blankad med H2O uppvisar så mycket högre absorbansvärden än den andra grafen är att den<br />

även visar Bio-Rads absorbans i provlösningen. Därför är den övre grafen ej användbar när<br />

man vill räkna ut proteinkoncentrationen i provet. Grafen som är blankad med Bio-Rad visar<br />

däremot endast proteinets absorbans och kan därför användas vid beräkning av proteinets<br />

koncentration i provet. Vid våglängder mellan 400 nm och 540 nm absorberar provlösningen


lankad med Bio-Rad mindre ljus än blanklösningen vilket ger negativa absorbansvärden.<br />

Därav grafens utseende.<br />

Metod III : Val av våglängdsfilter<br />

1)<br />

Tabell 3. De färgade lösningarnas absorbansvärde<br />

vid 405 nm.<br />

Absorbans vad 405 nm<br />

grön blå röd gul<br />

prov lösning lösning lösning lösning<br />

1 0,225 0,17 0,064 0,157<br />

2 0,222 0,172 0,063 0,161<br />

3 0,226 0,169 0,06 0,156<br />

4 0,228 0,171 0,066 0,157<br />

5 0,23 0,173 0,065 0,169<br />

6 0,225 0,17 0,062 0,155<br />

7 0,226 0,173 0,066 0,156<br />

8 0,226 0,173 0,062 0,158<br />

9 0,229 0,175 0,064 0,157<br />

10 0,229 0,171 0,063 0,156<br />

medel 0,227 0,172 0,064 0,158<br />

median 0,226 0,172 0,064 0,157<br />

std 0,0024 0,0018 0,0019 0,0041<br />

Tabell 4. De färgade lösningarnas absorbansvärde<br />

vid 450 nm.<br />

Absorbans vad 450 nm<br />

grön blå röd gul<br />

prov lösning lösning lösning lösning<br />

1 0,198 0,067 0,188 0,14<br />

2 0,198 0,068 0,188 0,142<br />

3 0,202 0,068 0,188 0,147<br />

4 0,203 0,068 0,186 0,142<br />

5 0,203 0,068 0,187 0,142<br />

6 0,202 0,068 0,187 0,14<br />

7 0,202 0,068 0,188 0,14<br />

8 0,203 0,068 0,187 0,14<br />

9 0,203 0,068 0,188 0,14<br />

10 0,204 0,068 0,188 0,138<br />

medel 0,202 0,068 0,188 0,141<br />

median 0,203 0,068 0,188 0,140<br />

std 0,00<strong>21</strong> 0,0003 0,188 0,138


Tabell 5. De färgade lösningarnas absorbansvärde<br />

vid 492 nm.<br />

Absorbans vad 492 nm<br />

grön blå röd gul<br />

prov lösning lösning lösning lösning<br />

1 0,104 0,19 0,561 0,058<br />

2 0,105 0,193 0,563 0,058<br />

3 0,106 0,194 0,561 0,058<br />

4 0,107 0,193 0,564 0,058<br />

5 0,107 0,196 0,56 0,058<br />

6 0,107 0,195 0,56 0,058<br />

7 0,106 0,194 0,562 0,058<br />

8 0,107 0,194 0,559 0,058<br />

9 0,107 0,194 0,561 0,057<br />

10 0,107 0,194 0,561 0,057<br />

medel 0,106 0,194 0,561 0,058<br />

median 0,107 0,194 0,561 0,058<br />

std 0,0011 0,0016 0,0015 0,0004<br />

Tabell 6. De färgade lösningarnas absorbansvärde<br />

vid 540 nm.<br />

Absorbans vad 540 nm<br />

grön blå röd gul<br />

prov lösning lösning lösning lösning<br />

1 0,061 0,519 0,59 0,008<br />

2 0,061 0,524 0,593 0,007<br />

3 0,062 0,52 0,59 0,007<br />

4 0,064 0,519 0,595 0,007<br />

5 0,063 0,527 0,589 0,007<br />

6 0,063 0,524 0,59 0,007<br />

7 0,063 0,522 0,592 0,007<br />

8 0,063 0,523 0,59 0,007<br />

9 0,063 0,522 0,59 0,007<br />

10 0,063 0,523 0,592 0,007<br />

medel 0,063 0,522 0,591 0,007<br />

median 0,063 0,522 0,590 0,007<br />

std 0,0009 0,0025 0,0019 0,0003<br />

2) Se under respektive tabell<br />

3) Vi bedömer att vi inte har några extremvärden som behöver testas med Q-test.


4)<br />

absorbans<br />

0,7<br />

0,6<br />

0,5<br />

0,4<br />

0,3<br />

0,2<br />

0,1<br />

0<br />

Medelvärde<br />

vid 405 nm<br />

Medelvärde<br />

vid 450 nm<br />

Medelvärde<br />

vid 492 nm<br />

Medelvärde<br />

vid 540 nm<br />

grön lösning<br />

blå lösning<br />

röd lösning<br />

gul lösning<br />

Figur 3. Diagrammet visar medelvärdet av de olika färglösningarnas absorbans vid de<br />

olika våglängderna.<br />

Den gröna lösningen bör mätas vid 405 nm eftersom den uppvisar högst absorbans då. Dess<br />

absorbans minskar sedan med ökande våglängd. Den blå lösningen skall mätas vid 540 nm.<br />

Absorbansen där är betydligt högre än vid de andra våglängderna. Absorbansen vid de olika<br />

våglängderna följer inget tydligt mönster. Den röda lösningen kan mätas vid 492 nm eller<br />

540 nm, men har lite högre absorbans vid 540 nm. Absorbansen vid de här våglängderna är<br />

betydligt högre än vid 405 nm och 450 nm. Den gula lösningen bör mätas vid 405 nm men har<br />

relativt låga absorbansvärden vid alla fyra våglängderna.

Hooray! Your file is uploaded and ready to be published.

Saved successfully!

Ooh no, something went wrong!