AF-21 Rappfotometer - Umeå universitet
AF-21 Rappfotometer - Umeå universitet
AF-21 Rappfotometer - Umeå universitet
Create successful ePaper yourself
Turn your PDF publications into a flip-book with our unique Google optimized e-Paper software.
<strong>Umeå</strong> Universitet<br />
Biomedicinska analytikerprogrammet<br />
Årskull:<br />
Laborationsrapport<br />
Absorbansmätningar<br />
XXXXXX och YYYYYY<br />
Laborationsdatum: Inlämnad Godkänd<br />
Handledare:
Moment I: Ljusabsorption i kyvetter<br />
1)<br />
Tabell 1. Uppmätta absorbansvärden för en plastkyvett,<br />
glaskyvett och kvartskyvett vid olika våglängder.<br />
Våglängd Abs Abs Abs<br />
(nm) plastkyvett glaskyvett kvartskyvett<br />
200 3,381 3,344 0,696<br />
205 3,584 3,536 0,494<br />
<strong>21</strong>0 3,708 3,489 0,398<br />
<strong>21</strong>5 3,562 3,386 0,315<br />
220 3,615 3,534 0,266<br />
225 3,587 3,653 0,239<br />
230 3,871 3,7 0,<strong>21</strong>2<br />
235 3,671 3,486 0,17<br />
240 3,601 3,488 0,13<br />
245 3,643 3,676 0,105<br />
250 3,913 3,703 0,099<br />
255 3,91 3,645 0,068<br />
260 4,024 3,638 0,066<br />
265 3,913 3,548 0,064<br />
270 3,708 3,578 0,065<br />
275 3,752 3,452 0,064<br />
280 3,537 3,345 0,06<br />
285 3,453 2,79 0,06<br />
290 2,289 1,924 0,057<br />
295 1,532 1,278 0,056<br />
300 0,91 0,86 0,056<br />
305 0,725 0,577 0,057<br />
310 0,633 0,385 0,051<br />
315 0,578 0,264 0,05<br />
320 0,536 0,19 0,048<br />
325 0,501 0,136 0,049<br />
330 0,472 0,102 0,049<br />
335 0,446 0,08 0,048<br />
340 0,4<strong>21</strong> 0,069 0,049<br />
345 0,402 0,06 0,048<br />
350 0,385 0,053 0,048
2)<br />
4,5<br />
4<br />
3,5<br />
3<br />
2,5<br />
2<br />
1,5<br />
1<br />
0,5<br />
0<br />
200 220 240 260 280 300 320 340<br />
Figur 1. Visar absorption som funktion av våglängden för de olika kyvettyperna.<br />
Abs<br />
plastkyvett<br />
Abs<br />
glaskyvett<br />
Abs<br />
kvartskyvett<br />
3)<br />
Kvartskyvetten går att använda i nästan hela våglängdsspektrat som undersöktes. Möjligtvis<br />
att den absorberar lite för mycket i sig själv vid våglängderna mellan 200 och 250 nm.<br />
Plastkyvetten och glaskyvetten däremot, som följdes åt ganska bra, absorberade väldigt<br />
mycket i sig själv från 200 nm till cirka 280 nm. Därefter skedde en kraftig minskning av<br />
absorbansen. Dock var absorbansvärdena nere under 0,5 först vid våglängden 305 nm<br />
(glaskyvett) respektive 330 nm (plastkyvett). Skulle man fortsätta mätningen upp på längre<br />
våglängder ser det ut som att både glas- och plastkyvetten skulle komma ner närmare noll i<br />
absorbansvärde. Alltså lämpar sig plast- och glaskyvetter bäst vid absorbansmätningar över<br />
cirka 300 nm.<br />
Moment II: Våglängdsscanning med U1100<br />
1)<br />
Tabell 2. Uppmätta absorbansvärden för proteinlösning vid olika<br />
våglängder efter blank med H20 respektive Bio-Rad<br />
Abs prov med Abs prov med<br />
Våglängd H2O som Bio-Rad som<br />
(nm)<br />
blank<br />
blank<br />
400 0,561 -0,096<br />
410 0,605 -0,113<br />
420 0,681 -0,137<br />
430 0,766 -0,167<br />
440 0,84 -0,193<br />
450 0,89 -0,<strong>21</strong>3<br />
460 0,915 -0,224<br />
470 0,918 -0,227<br />
480 0,899 -0,2<strong>21</strong><br />
490 0,866 -0,208<br />
500 0,823 -0,182<br />
510 0,785 -0,146
2)<br />
absorbans<br />
1,2<br />
1<br />
0,8<br />
0,6<br />
0,4<br />
0,2<br />
0<br />
-0,4<br />
520 0,758 -0,091<br />
530 0,755 -0,012<br />
540 0,783 -0,095<br />
550 0,834 0,<strong>21</strong>4<br />
560 0,884 0,32<br />
570 0,919 0,396<br />
580 0,938 0,44<br />
590 0,947 0,459<br />
600 0,956 0,457<br />
610 0,967 0,442<br />
620 0,985 0,417<br />
630 1,001 0,384<br />
640 1,003 0,349<br />
650 0,982 0,314<br />
660 0,931 0,281<br />
670 0,853 0,252<br />
680 0,751 0,226<br />
690 0,641 0,205<br />
700 0,527 0,184<br />
710 0,422 0,164<br />
720 0,33 0,144<br />
730 0,255 0,125<br />
740 0,194 0,105<br />
750 0,15 0,091<br />
-0,2400<br />
500 600 700<br />
våglängd (nm)<br />
Abs prov med H2O<br />
som blank<br />
Abs prov med Bio-Rad<br />
som blank<br />
Figur 2. Visar absorptionen som funktion av våglängden för mätningarna av provet<br />
med H2O resp. Bio-Rad som blank.<br />
3)<br />
Absorbansmätning av proteinlösningar blandade med Bio-Rad bör mätas vid cirka 600 nm<br />
eftersom båda graferna uppvisar höga absorbansvärden där. Anledningen till att grafen som är<br />
blankad med H2O uppvisar så mycket högre absorbansvärden än den andra grafen är att den<br />
även visar Bio-Rads absorbans i provlösningen. Därför är den övre grafen ej användbar när<br />
man vill räkna ut proteinkoncentrationen i provet. Grafen som är blankad med Bio-Rad visar<br />
däremot endast proteinets absorbans och kan därför användas vid beräkning av proteinets<br />
koncentration i provet. Vid våglängder mellan 400 nm och 540 nm absorberar provlösningen
lankad med Bio-Rad mindre ljus än blanklösningen vilket ger negativa absorbansvärden.<br />
Därav grafens utseende.<br />
Metod III : Val av våglängdsfilter<br />
1)<br />
Tabell 3. De färgade lösningarnas absorbansvärde<br />
vid 405 nm.<br />
Absorbans vad 405 nm<br />
grön blå röd gul<br />
prov lösning lösning lösning lösning<br />
1 0,225 0,17 0,064 0,157<br />
2 0,222 0,172 0,063 0,161<br />
3 0,226 0,169 0,06 0,156<br />
4 0,228 0,171 0,066 0,157<br />
5 0,23 0,173 0,065 0,169<br />
6 0,225 0,17 0,062 0,155<br />
7 0,226 0,173 0,066 0,156<br />
8 0,226 0,173 0,062 0,158<br />
9 0,229 0,175 0,064 0,157<br />
10 0,229 0,171 0,063 0,156<br />
medel 0,227 0,172 0,064 0,158<br />
median 0,226 0,172 0,064 0,157<br />
std 0,0024 0,0018 0,0019 0,0041<br />
Tabell 4. De färgade lösningarnas absorbansvärde<br />
vid 450 nm.<br />
Absorbans vad 450 nm<br />
grön blå röd gul<br />
prov lösning lösning lösning lösning<br />
1 0,198 0,067 0,188 0,14<br />
2 0,198 0,068 0,188 0,142<br />
3 0,202 0,068 0,188 0,147<br />
4 0,203 0,068 0,186 0,142<br />
5 0,203 0,068 0,187 0,142<br />
6 0,202 0,068 0,187 0,14<br />
7 0,202 0,068 0,188 0,14<br />
8 0,203 0,068 0,187 0,14<br />
9 0,203 0,068 0,188 0,14<br />
10 0,204 0,068 0,188 0,138<br />
medel 0,202 0,068 0,188 0,141<br />
median 0,203 0,068 0,188 0,140<br />
std 0,00<strong>21</strong> 0,0003 0,188 0,138
Tabell 5. De färgade lösningarnas absorbansvärde<br />
vid 492 nm.<br />
Absorbans vad 492 nm<br />
grön blå röd gul<br />
prov lösning lösning lösning lösning<br />
1 0,104 0,19 0,561 0,058<br />
2 0,105 0,193 0,563 0,058<br />
3 0,106 0,194 0,561 0,058<br />
4 0,107 0,193 0,564 0,058<br />
5 0,107 0,196 0,56 0,058<br />
6 0,107 0,195 0,56 0,058<br />
7 0,106 0,194 0,562 0,058<br />
8 0,107 0,194 0,559 0,058<br />
9 0,107 0,194 0,561 0,057<br />
10 0,107 0,194 0,561 0,057<br />
medel 0,106 0,194 0,561 0,058<br />
median 0,107 0,194 0,561 0,058<br />
std 0,0011 0,0016 0,0015 0,0004<br />
Tabell 6. De färgade lösningarnas absorbansvärde<br />
vid 540 nm.<br />
Absorbans vad 540 nm<br />
grön blå röd gul<br />
prov lösning lösning lösning lösning<br />
1 0,061 0,519 0,59 0,008<br />
2 0,061 0,524 0,593 0,007<br />
3 0,062 0,52 0,59 0,007<br />
4 0,064 0,519 0,595 0,007<br />
5 0,063 0,527 0,589 0,007<br />
6 0,063 0,524 0,59 0,007<br />
7 0,063 0,522 0,592 0,007<br />
8 0,063 0,523 0,59 0,007<br />
9 0,063 0,522 0,59 0,007<br />
10 0,063 0,523 0,592 0,007<br />
medel 0,063 0,522 0,591 0,007<br />
median 0,063 0,522 0,590 0,007<br />
std 0,0009 0,0025 0,0019 0,0003<br />
2) Se under respektive tabell<br />
3) Vi bedömer att vi inte har några extremvärden som behöver testas med Q-test.
4)<br />
absorbans<br />
0,7<br />
0,6<br />
0,5<br />
0,4<br />
0,3<br />
0,2<br />
0,1<br />
0<br />
Medelvärde<br />
vid 405 nm<br />
Medelvärde<br />
vid 450 nm<br />
Medelvärde<br />
vid 492 nm<br />
Medelvärde<br />
vid 540 nm<br />
grön lösning<br />
blå lösning<br />
röd lösning<br />
gul lösning<br />
Figur 3. Diagrammet visar medelvärdet av de olika färglösningarnas absorbans vid de<br />
olika våglängderna.<br />
Den gröna lösningen bör mätas vid 405 nm eftersom den uppvisar högst absorbans då. Dess<br />
absorbans minskar sedan med ökande våglängd. Den blå lösningen skall mätas vid 540 nm.<br />
Absorbansen där är betydligt högre än vid de andra våglängderna. Absorbansen vid de olika<br />
våglängderna följer inget tydligt mönster. Den röda lösningen kan mätas vid 492 nm eller<br />
540 nm, men har lite högre absorbans vid 540 nm. Absorbansen vid de här våglängderna är<br />
betydligt högre än vid 405 nm och 450 nm. Den gula lösningen bör mätas vid 405 nm men har<br />
relativt låga absorbansvärden vid alla fyra våglängderna.