Nye Kemiske Horisonter - Danmarks Tekniske Universitet: Kemisk ...
Nye Kemiske Horisonter - Danmarks Tekniske Universitet: Kemisk ...
Nye Kemiske Horisonter - Danmarks Tekniske Universitet: Kemisk ...
You also want an ePaper? Increase the reach of your titles
YUMPU automatically turns print PDFs into web optimized ePapers that Google loves.
82<br />
Molekylstørrelse<br />
600<br />
500<br />
400<br />
300<br />
200<br />
100<br />
0<br />
For at vise hvordan beregningstiden øges<br />
med molekylstørrelsen, har vi gennemført<br />
en række beregninger med varierende antal<br />
alanin-enheder. Når den hurtige molekylmekanik<br />
benyttes, er alle beregninger med under<br />
10 alanin-enheder gennemført på mindre end<br />
Beregningstid<br />
10ala 15ala 20ala 25ala 30ala 40 ala 50ala 75ala 100ala 150ala 200ala 2<br />
100ala<br />
Tid (sekunder)<br />
Figur 12. Illustration af beregningstider i forhold til molekylstørrelse.<br />
Tid (sekunder)<br />
5000<br />
4500<br />
4000<br />
3500<br />
3000<br />
2500<br />
2000<br />
1500<br />
1000<br />
500<br />
0<br />
Beregningstider<br />
3<br />
100ala<br />
4<br />
100ala<br />
5<br />
100ala<br />
10<br />
100ala<br />
Molekyl-mekanik<br />
1 sekund. Efterhånden som molekylet øges i<br />
størrelse begynder tiderne at være målbare. På<br />
fi gur 12 er dette vist for en række polyalaninmolekyler,<br />
hvor den største beregning er foretaget<br />
på 10 kæder med hver 100 alanin-enheder<br />
som tager ca. 500 sekunder.<br />
1ala 2ala<br />
Molekylstørrelse<br />
3ala<br />
Figur 13. Tider for beregning af små alanin-molekyler med enten ab initio eller DFT-metoden.<br />
Computerkemi – en opdagelsesrejse in silico<br />
Ab Initio<br />
DFT
Change language