Contenido: - Licenciatura en Ciencias Genómicas - UNAM

More documents

Recommendations

Info

Noviembre-2006 4 Un dulce genoma por Claudia Gabriela Gonzaga Jáuregui La carrera por la secuenciación de otros varios organismos continúa en los diferentes centros de secuenciación del mundo y recientemente, la abeja se ha sumado a la ya amplia lista de organismos cuyo genoma ya está publicado. Las abejas pertenecen, al igual que las hormigas y las avispas, al orden Himenoptera de los insectos y divergieron de los dípteros (moscas y mosquitos) y de los lepidópteros (mariposas) hace 300 millones de años, mientras que el último ancestro común con el hombre vivió hace unos 600 millones de años. Las abejas son organismos interesantes ya que viven en sociedades bien organizadas y tienen una división de castas que se caracteriza por cambios morfológicos y de comportamiento bien definidos dados por la expresión diferencial del mismo genoma. El genoma de la abeja mielera, Apis mellifera, se secuenció mediante shotgun a partir de varios zánganos derivados de una misma reina, logrando una cobertura de 7.5x de las 236 Mb que constituyen el genoma clonable (se estima que el tamaño total del genoma es de 262 ± 1 Mb), con una calidad del 98%. Los fragmentos fueron posteriormente ensamblados usando un mapa de ligamiento de microsatélites; lo anterior se facilitó debido a que el genoma de la abeja tiene una alta tasa de recombinación, por lo que el mapa de ligamiento contiene más de 2,000 marcadores. Entre algunas características que se encontraron en el análisis del genoma de Apis mellifera están el hecho de que este genoma es más rico en AT que otros genomas secuenciados. Por otro lado, los genes se encuentran localizados mayormente en regiones ricas en AT; aunque en contraste con los genomas de vertebrados, en el genoma de la abeja se encontró que la longitud de los intrones en los genes aumenta dependiendo del contenido de GC. En cuanto a elementos repetidos, se encontró que este genoma tiene pocos transposones, siendo la mayoría de los pocos existentes miembros de la familia Mariner y contituyendo apenas un 1% del total del genoma, aunque se cree que puede haber más en las regiones que no pudieron ser secuenciadas. En el mismo rubro, se encontraron muy pocos retrotransposones, los cuales al parecer ya ni siquiera están activos, a pesar de que se cree que en algún momento hubo gran cantidad y actividad de retrotransposones debido a que se hallaron varios remanentes de LTRs a lo largo del genoma. Se cree que la poca presencia de todos estos elementos repetidos en la abeja se debe a la fuerte selección al que está sujeto este genoma, sobretodo en los individuos haploides. En cuanto al número y contenido de genes de este genoma, se hizo una lista utilizando varios métodos de predicción y validación; esta lista conformada por 10,157 genes, a su vez se dividió en dos, en una se encuentran todos los genes que cuentan con algún tipo de validación o evidencia experimental, mientras que en la otra están todos los genes predichos ab initio. Además, se hizo un perfil de expresión de diferentes tejidos y estadíos, mediante microarreglos de siete millones de oligonucleótidos que cubrieron la mayor parte del genoma de la abeja; a partir de esto, además de obtener evidencia de expresión de varios genes anotados y predichos, se pudieron identificar señales de varios RNAs no codificantes. Entre estos RNAs no codificantes, se lograron anotar varios genes para miRNAs, los cuales además dieron prueba de expresarse diferencialmente en diferentes tejidos, estadíos y castas. Por lo anterior, se cree que los miRNAs son un mecanismo importante en la regulación del genoma de Apis mellifera; además se encontraron varios genes ortólogos a aquellos de las proteínas involucradas en el mecanismo de RNA de interferencia. Por otro lado, se observó que la abeja tiene ortólogos a genes particulares de vertebrados, como aquellos involucrados en la regulación de los ritmos circadianos y proteínas de la maquinaria de metilación de DNA, entre otros. En cuanto al análisis filogenético, se encontró que el genoma de la abeja tiene una identidad promedio mayor con el humano, que al comparar humano y mosca (Drosophila) o humano y mosquito (Anopheles). Lo anterior en conjunto con el resto del análisis filogenético, hace pensar que el genoma de la abeja ha evolucionado más lentamente, mientras que los dípteros han divergido más rápido. En el mismo sentido, se observó que el número de familias de genes expandidas en la abeja es mucho menor que en los dípteros, sin embargo algunos de los ejemplos de expansión más notables están dados por los receptores odoríficos y las proteínas mayores de la jalea real; lo cual es bastante comprensible de acuerdo al ambiente de este insecto. Referencias: The Honeybee Genome Sequencing Consortium, Insights into social insects from the genome of the honeybee Apis mellifera, Nature, Vol. 443, 2006.
Noviembre-2006 5 XLVIII Muestra Internacional de Cine por Rodrigo García López En Noviembre vuelve la Muestra Internacional de Cine, esta vez en su edición 48, para ofrecernos un panorama general del cine actual en el mundo. La muestra, que desde 1998 se presenta dos veces por año, se distingue por ser una selección del mejor material presentado en los festivales mas afamados en el mundo. Mención especial merece Camino a Guantánamo del director Michael Winterbottom y Mat Whitecross (Gran Bretaña), un documental sobre la experiencia de algunos jóvenes británicos de origen pakistaní que son capturados por la Alianza del norte. También es recomendable Grbavica: La revelación de Sara de Jasmila Zbanic (Austria-Bosnia y Herzegovina-Alemania-Croacia), una cinta que se desarrolla en el Sarajevo de la posguerra. Es un drama sobre una niña, su madre y realidad de la muerte de su padre. Del agrado de solo algunos será Pequeña Miss Sunshine de Jonathan Dayton y Valerie Faris (USA), una roadmovie sobre una familia disfuncional viajando al festival Little Miss Sunshine. La vida de los otros de Florian Henckel von Donnersmarck, (Alemania) fue una de las cintas mejor recibidas por la critica alemana (uno de los públicos de mayor exigencia). Trata sobre dos figuras de la escena intelectual en el estado socialista en desacuerdo con algunas de las ideas del mismo. París, yo te amo (Francia-Alemania-Suiza-Liechtenstein), una propuesta, si no buena, al menos interesante, presenta a través de la expresión en corto una visita a la ciudad de la luz. Cada segmento esta a cargo de distintos directores de la talla de Gus van Sant y Alfonso Cuarón. Una cinta de controversia es De mi deseo en tu piel de Pernille Fischer Christensen, (Dinamarca- Suecia),donde se presenta la relación sentimental de una joven mujer con un travesti. México participa con El carnaval de Sodoma, de Arturo Ripstein, (México-España), una historia sobre frustraciones y personajes derrotados con un burdel por escenario. Esta vez participa El topo de Alejandro Jodorowsky (México) como invitada de honor ya que es la versión remasterizada de un western clásico de 1969. Estas son solo algunas propuestas ya que la muestra se presenta con 18 nuevos filmes: ∗ EL TOPO (Alejandro Jodorowsky, México, 1969, 125 mins.) ∗ CAMINO A GUANTÁNAMO (The Road To Guantánamo, Michael Winterbottom y Mat Whitecross, Gran Bretaña, 2006, 95 mins.) ∗ GRBAVICA: LA REVELACIÓN DE SARA (Jasmila Zbanic, Austria-Bosnia y Herzegovina-Alemania-Croacia, 2005, 90 mins.) ∗ PEQUEÑA MISS SUNSHINE (Little Miss Sunshine, Jonathan Dayton y Valerie Faris, Estados Unidos, 2006, 101 mins.) ∗ LAS MANTENIDAS SIN SUEÑOS (Vera Fogwill y Martín de Salvo, Argentina, 2005, 94 mins.) Continúa ...
Page 1 and 2: Noviembre-2006 1 Recuerdos de famil
Page 3: Noviembre-2006 3 Estimadas(os) lect
Page 7 and 8: Noviembre-2006 7 Palomitas y Más
Page 9 and 10: Noviembre-2006 9 En CoNtAcTo ExTeRn
Page 11 and 12: Noviembre-2006 11 Día ía de Muert
Page 13 and 14: Noviembre-2006 13 Después de por e

Contenido: - Licenciatura en Ciencias Genómicas - UNAM

Create successful ePaper yourself

Delete template?

Save as template?