LIMITACIONES DE LA BACTERIOSIS VASCULAR DE YUCA ...

avirulencia (Avr) del patógeno (Dangl y Jones, 2001). Dicha interacción es descrita
por el modelo gen por gen. En los últimos diez años se han aislado y caracterizado
molecularmente en diferentes especies vegetales más de 48 genes de resistencia frente
a diversos patógenos (virus, bacterias, hongos, nemátodos). Estos estudios han revelado
que a pesar de conferir resistencia a patógenos tan diferentes, las proteínas de
resistencia poseen dominios conservados (Hammond-Kosack y Parker, 2003). El grupo
de proteínas de resistencia más común presenta un dominio de unión a nucleótidos
(NBS, Nucleotide-Binding Site) y una región de repeticiones ricas en leucinas (LRR,
Leucine Rich Repeat), los cuales pueden estar acompañados de un dominio TIR (Toll
Interleukin protein) en su extremo N-terminal (Dangl y Jones, 2001). Aprovechando la
presencia de dominios conservados en las proteínas de resistencia, ha sido posible diseñar
primers degenerados complementarios a las secuencias de ADN correspondientes
a estos dominios y de esta forma aislar Genes Candidatos de Resistencia (GRC; Meyers
et al., 1999). Esta estrategia ha revelado ser muy útil como un primer paso hacia la
identificación de genes de resistencia. Muchos de estos GRCs se encuentran agrupados
en el genoma tal y como ocurre con los genes de resistencia y colocalizan con loci de
resistencia o con QTLs asociados a la resistencia a diferentes patógenos. Este último
hecho sugiere que los genes de resistencia de tipo cuantitativo y cualitativo pueden
mostrar características estructurales comunes (López et al., 2003a). Una estrategia
similar ha sido empleada en yuca para identificar GRCs en yuca (López et al., 2003b).
Primers degenerados complementarios a los dominios TIR y NBS presentes en varias
proteínas de resistencia fueron diseñados. Dos GRCs de tipo TIR y 10 de tipo NBS
fueron de esta forma identificados. Análisis de secuencia de los 10 GRCs de tipo NBS
permitieron agruparlos en dos clases. Análisis de southern-blot y de screening sobre una
librería BAC (Bacterial Artificial Chromosome) permitieron entender de una forma más
detallada la organización estructural de los GRCs en el genoma de la yuca (López et al.,
2003b). Estos análisis mostraron que todos los GRCs en yuca son genes de baja copia
o de copia única, excepto uno de ellos (RCa6) que representa una familia multigénica
grande y diversa. La secuenciación parcial de un clon BAC (B11E5) obtenido con el
RCa6 y el cual posee cinco copias de NBS, permitió la identificación de dos GRCs
completos (López et al., 2003b). Los análisis de mapeo permitieron ubicar dos BACs
que poseen NBS en el grupo de ligamiento E y cuatro en el grupo de ligamiento J. En
el grupo de ligamiento J se pudo establecer la presencia de una región que posee al
menos 15 secuencias de tipo NBS. Desafortunadamente hasta el momento ningún
QTL asociado a la resistencia ha sido identificado en esta región (López et al., 2003b).
Estos estudios han puesto en evidencia la necesidad de obtener más datos fenotípicos
de resistencia, a otras cepas de Xam o a otros patógenos, para poder establecer asociaciones
entre genes candidatos y regiones genómicas implicadas en resistencia. Si bien
los QTLs detectados por Jorge et al. (2000; 2001), empleando cinco cepas de Xam,
representan un paso importante en la identificación de regiones genómicas implicadas
en la resistencia, dada la gran diversidad observada en las poblaciones de Xam, estas
regiones genómicas detectadas solo cubren una parte parcial del genoma de la yuca
implicado en la resistencia a la bacteriosis. Más recientemente, datos adicionales de
QTLs asociados a dos cepas de Xam, permitieron la identificación de un nuevo QTL
asociado a la resistencia a la cepa CIO151 en el grupo de ligamiento U. El marcador