Memoria COMPUTAEX 2019

CénitS - COMPUTAEX
Álvaro Rodríguez San Pedro
Estudiante del Grado en Ingeniería Informática en Ingeniería de Software en la Escuela Politécnica
de Cáceres. Durante el período de beca en la Fundación colaboró en el proyecto HeritaGen. Durante
el período de la beca en la Fundación, colaboró en el desarrollo del proyecto HeritaGen, formándose
en el ámbito de la supercomputación, el Big Data y técnicas de HPC (High Performance Computing)
para el procesado de datos de secuencias genéticas.
Su trabajo se centró en la implantación de una infraestructura de apoyo a la investigación genética
con el objetivo de unificar y relacionar la información base del estudio para facilitar su análisis
y tratamiento, incluyendo información genealógica, personal, genética y genómica. Asimismo, la
infraestructura mejoró la gestión de los datos facilitando su acceso y análisis. Para ello, mejoró el
backend del sistema previo existente, añadiendo múltiples operaciones y separándolo efectivamente
del frontend. Éste consta de tres APIs (Application Programming Interface) que ofrecen operaciones
para la gestión de datos de participantes, datos genéticos y de variantes.
Trabajó también en el sistema de almacenamiento, aumentando su rendimiento para favorecer
la gestión del gran volumen de datos a manejar. Además, dado que la información a almacenar
es de carácter sensible y de especial protección, diseñó e implementó un plan de seguridad para
cumplir con las pautas marcadas por el Reglamento General de Protección de Datos. Éste incluye el
establecimiento de medidas de seguridad concretas, el cumplimiento con la licitud del tratamiento
y la posibilidad del ejercicio de los derechos ARCO (Acceso, Rectificación, Cancelación y
Oposición) sobre los datos personales almacenados. Por último, desarrolló además una herramienta
de elaboración de pedigríes que aúna un editor gráfico junto con utilidades para la generación de
árboles genealógicos, integrando dicha herramienta en la plataforma web desarrollada previamente
y permitiendo la generación y elaboración de pedigríes, así como su carga y modificación.
Respecto a su colaboración con la Unidad Funcional de Proyectos y Comunicación de CénitS,
participó en la organización y desarrollo de la Noche Europea de los Investigadores y en otras
jornadas de difusión organizadas por el centro.
En el ámbito académico, desarrolló su Trabajo Fin de Grado para la finalización de sus estudios en
Ingeniería Informática en Ingeniería de Software, titulado “Sistema bioinformático de apoyo a la
investigación en la unificación del patrimonio genealógico y genético”, como parte del proyecto
HeritaGen, desarrollado por CénitS.
Entre los objetivos marcardos para esta beca, se encontraban los siguientes: unificación de
información genealógica, genética y de variantes, así como su relación para facilitar su análisis;
estudio del rendimiento del almacenamiento de grandes volúmenes de datos; desarrollo de técnicas
que faciliten el acceso y análisis de información; automatización de extracción de información a
partir de datos; aplicación de técnicas que garanticen la seguridad de los datos almacenados.
Entre los objetivos alcanzados destacan principalmente los siguientes:
• Participación en el desarrollo software de un proyecto de gran tamaño, frente a los proyectos
aislados realizados durante la formación universitaria.
• Ampliación de conocimientos en el uso de bases de datos NoSQL y programación en Python,
incluyendo el uso de librerías y frameworks.
• Ampliación de conocimientos en HPC y Big Data.
• Desarrollo de documentación técnica sobre software.
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