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Formation Perl - Inra

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Expressions régulières - Exercice 2<br />

But : à partir d'un fichier multi-FASTA rev_nucl.fasta contenant<br />

des séquences sur le brin + et sur le brin -, créer un programme<br />

<strong>Perl</strong> nommé « rev_comp » sous Eclipse qui permet de reverse<br />

complémenter les séquences sur le brin - uniquement de ce fichier<br />

et de les écrire dans un nouveau fichier multi-FASTA<br />

rev_comp_nucl.fasta :<br />

ouverture en lecture du fichier multi-FASTA de départ.<br />

ouverture en écriture du fichier multi-FASTA de résultat.<br />

lecture du fichier multi-FASTA de départ.<br />

reverse complétion des séquences sur le brin -.<br />

écriture dans le fichier multi-FASTA de résultat.

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