24.04.2013 Views

1 TEMA 1: LA CÈL!LULA COM A UNITAT ESTRUCTURAL I ...

1 TEMA 1: LA CÈL!LULA COM A UNITAT ESTRUCTURAL I ...

1 TEMA 1: LA CÈL!LULA COM A UNITAT ESTRUCTURAL I ...

SHOW MORE
SHOW LESS

You also want an ePaper? Increase the reach of your titles

YUMPU automatically turns print PDFs into web optimized ePapers that Google loves.

<strong>TEMA</strong> 1: <strong>LA</strong> <strong>CÈL</strong>!LU<strong>LA</strong> <strong>COM</strong> A <strong>UNITAT</strong> <strong>ESTRUCTURAL</strong> I FUNCIONAL<br />

DELS SISTEMES VIUS<br />

Un ésser viu diem que és un organisme que reuneix tres<br />

característiques bàsiques:<br />

- És un sistema obert. Sempre hi ha intercanvi d’informació (entrada,<br />

sortida o transport) amb l’entorn. Capta energia i matèria del medi per tal<br />

de mantenir una estructura organitzada.<br />

- És un sistema d’alta complexitat molecular. Està format per un nombre<br />

elevat de molècules diferents i que a més són d’un alt pes molecular (ex.<br />

proteïnes, àcids nucleïcs...)<br />

- És un sistema amb capacitat de reproducció autònoma. Poden generar<br />

còpies idèntiques d’ells mateixos. Tot i que s’han de tenir en compte les<br />

mutacions que fan que existeixi la variabilitat entre individus.<br />

La biologia és la ciència que estudia als éssers vius.<br />

Els sistemes vius són cèl!lules o agrupacions de cèl·lules. Aquestes<br />

cèl·lules tenen unes característiques concretes:<br />

- Guarden la informació hereditària en el mateix codi químic (el DNA)<br />

- Repliquen la informació hereditària mitjançant una polimerització sobre<br />

un motlle.<br />

- Transcriuen part de la informació present en el DNA en un mateix tipus<br />

de molècula (RNA)<br />

- Utilitzen proteïnes com a catalitzadors<br />

- Tradueixen el RNA a proteïna.<br />

- Funcionen com factories bioquímiques que utilitzen els mateixos blocs<br />

moleculars bàsics.<br />

- Estan envoltades d’una membrana plasmàtica per la qual han de passar<br />

els nutrients i els residus.<br />

Hi ha dos grans grups de cèl·lules:<br />

PROCARIOTES EUCARIOTES<br />

Senzilles Complexes<br />

Unicel·lulars o colonials Unicel·lulars o pluricel·lulars<br />

Entre 0.1 – 1 µm Entre 1µm – 1mm<br />

Formes poc variades Formes variades<br />

Genoma (DNA) amb menys<br />

informació, un únic cromosoma<br />

circular sense histones que es<br />

codifica per poques proteïnes i<br />

sense separació de la resta del<br />

citoplasma.<br />

Genoma (ADN) amb més informació, ADN<br />

lineal organitzat en cromosomes que<br />

modulen el grau de condensació de la<br />

cromatina i que contenen gens fragmentats<br />

(exons i introns). Es troba envoltat per la<br />

membrana nuclear.<br />

Pocs orgànuls Nucli, cloroplast, mitocondri, etc.<br />

Sense comparimentació<br />

intracel·lular, és a dir, sense<br />

orgànuls membranosos.<br />

Compartimentació intracel·lular: tenen nucli<br />

diferenciat que emmagatzema la<br />

informació i complexos com el reticle<br />

endoplasmàtic, l’aparell de Golgi...Això els<br />

permet realitzar el transport vesicular a<br />

través dels diferents compartiments.<br />

1


Tenen microtúbuls de flagel·lina Els cilis i flàgels estan formats per<br />

microtúbuls de tubulina.<br />

Presenten citoesquelet: filaments que<br />

No fan l’endocitosi ni cap digestió<br />

intracel·lular. No existeixen els<br />

corrents citoplàsmatics.<br />

donen mobilitat i la forma a la cèl·lula.<br />

La membrana plasmàtica els permet<br />

realitzar l’endocitosi i l’exocitosi. Tenen<br />

corrents citoplasmàtics i realitzen una<br />

digestió intracel·lular.<br />

Reproducció sexual o asexual, existeix la<br />

Reproducció asexual (mitosi) per<br />

bipartició simple o per espores. mitosi i la meiosi (formació de gàmetes)<br />

Organització cel·lular: principalment Organització cel·lular: principalment<br />

unicel·lular<br />

pluricel·lular amb diferenciació de les<br />

cèl·lules (també hi ha de unicel·lulars).<br />

Bacteris, cianofícies, micoplasmes. Protistes, fongs, plantes i animals<br />

Existeix una determinada classificació dels éssers vius, que ha anat<br />

evolucionant al llarg del temps fins a la classificació d’avui en dia. Des de la<br />

primera classificació només dels organismes microscòpics en vegetals i<br />

animals fins l’actual. Al llarg dels anys han sorgit diversos problemes com quan<br />

es va descubrir que els fongs, inicialment classificats com a vegetals, no ho<br />

eren perquè no tenen cloroplasts, les seves parets són de quitina enlloc de<br />

cel·lulosa i són organismes colonials, no pluricel·lulars.<br />

2


I més actual ha estat el debat sobre la classificació dels virus que han<br />

quedat exclosos de la classificació ja que són “éssers vius” que no tenen<br />

complexitat estructural ni tampoc tenen funcions de nutrició ni de relació,<br />

només de reproducció.<br />

Així, finalment la classificació actual dels 5 regnes és la següent:<br />

3


<strong>TEMA</strong> 2: EVOLUCIÓ PREBIÒTICA<br />

Hi ha moltes teories sobre l’origen de la vida, però cap deu ser<br />

considerada com totalment certa ja que cap aporta proves definitives i totes<br />

posseeixen defectes i llacunes<br />

Fins al segle XVII hi havia una acceptació general de les teories<br />

creacionistes: els éssers vius van ser creats en un moment determinat per un<br />

ser superior, però encara es poden anar creant a partir de la matèria inanimada<br />

per la intervenció d’aquest ser superior (generació espontània). Es creia que<br />

els éssers vius venien d’altres éssers vius sense canvi morfogenètic. Un<br />

experiment clàssic que demostrava aquesta teoria.<br />

L’any 1862 el concepte de generació espontània queda totalment<br />

descartat pels experiments de Louis Pasteur. Pasteur va demostrar que en un<br />

recipient que contenia nutrients no apareixien microbis si es mantenia estéril.<br />

L’esterilitat es podia aconseguir simplement allargant la boca del recipient, de<br />

manera que els microbis de l’aire no poguessin arribar als nutrients, o també es<br />

podien eliminar els microorganismes bullint les substàncies.<br />

A partir d’aquest moment, els científics de l’època es van començar a<br />

qüestionar com devia ser el inici de la terra. Amb el descobriment d’Amèrica es<br />

va trobar una gran diversitat d’espècies i amb el posterior descobriment i estudi<br />

de fòssils es comença a parlar de història i evolució dels éssers vius.<br />

En aquell instant, s’enfronten les teories creacionistes amb les<br />

anomenades materialistes:<br />

- Creacionistes: els éssers vius van ser creats per un ser superior<br />

- Materialistes: els éssers vius apareixen a partir de la síntesi abiòtica de<br />

molècules orgàniques a partir de molècules inorgàniques existents a la<br />

terra primitiva.<br />

La comunitat científica es decanta per les teories materialistes.<br />

1. TEORIA D’OPARIN<br />

L’any 1922 el científic rus A.I.Oparin va postular que la vida havia<br />

aparegut com a conseqüència d’un procés d’evolució química, l’anomenada<br />

evolució prebiòtica (de matèria inorgànica a matèria orgànica).<br />

Postulava que la radiació ultraviolada del Sol o les descàrregues<br />

lluminoses que es produïen a la Terra primitiva provocaren que les molècules<br />

de l’atmosfera reductora existent reaccionessin per a formar compostos<br />

orgànics senzills, tals com els aminoàcids, les bases nitrogenades i els sucres.<br />

Oparin va realitzar un experiment que corroborà aquesta teoria i que va<br />

permetre demostrar com es varen poder sintetitzar les primeres substàncies<br />

orgàniques a partir de substàncies inorgàniques.<br />

4


2. SÍNTESI ABIÒTICA DE <strong>COM</strong>POSTOS ORGÀNICS A <strong>LA</strong> TERRA<br />

PRIMITIVA. ORIGEN DE <strong>LA</strong> PRIMERA <strong>CÈL</strong>!LU<strong>LA</strong><br />

DATA ESDEVENIMENT<br />

20.000 ma S’origina l’Univers.<br />

15.000 ma Big Bang<br />

4.500 ma Formació de la Terra<br />

4.300 ma Aparició de l’atmosfera primitiva<br />

3.800 ma Va aparèixer la primera cèl·lula, els primers microfòssils<br />

(procariotes molt senzills) trobats a la Terra.<br />

1.900 ma Primera cèl·lula eucariota<br />

700-600 ma Primers vertebrats<br />

570 ma Període càmbric (període actiu en la proliferació d’espècies)<br />

4,5 ma Primer homínid.<br />

Fa 4.500 milions d’anys es formà la Terra a partir de la condensació de<br />

núvols de gasos estel·lars. Entre els 4.000 i els 3.800 milions d’anys. La Terra<br />

s’ha refredat i és una massa coberta d’aigua i envoltada d’una atmosfera que<br />

probablement contenia:<br />

CH4, H2, N2, SH2, NH3, CO2 i vapor d’H2O (no hi ha oxigen lliure)<br />

Per a la evolució química de la vida a la Terra primitiva es necessitaven<br />

quatre requeriments:<br />

- Absència total d’oxigen lliure, ja que al ser molt reactiu hagués oxidat<br />

les molècules orgàniques que són essencials per a la vida.<br />

- Una font d’energia, la Terra primitiva era un lloc caracteritzat per la<br />

presència de vulcanisme generalitzat, tempestes elèctriques,<br />

bombardeig de meteorits i intensa radiació, especialment ultraviolada<br />

(degut a la manca de capa d’ozó).<br />

- Substàncies químiques, que funcionessin com “blocs de construcció<br />

químics”: aigua, minerals inorgànics i gasos (els anomenats<br />

anteriorment, CH4, H2, N2, SH2, NH3, CO2 i vapor d’H2O)<br />

- Temps: l’edat de la Terra es calcula en 4.500 milions d’anys i els<br />

vestigis de vida més antics daten de 3.800 milions d’anys de manera que<br />

la “vida” va trigar uns 700 milions d’anys en formar-se.<br />

Fins a finals del segle XVIII es pensava que els compostos orgànics<br />

només podien formar-se per l’acció dels éssers vius, la síntesi en el laboratori<br />

de la urea (un compost orgànic), va acabar amb aquesta creença.<br />

En 1952, Stanley Miller i Urey (també el va realitzar Joan Oró) van<br />

dissenyar un experiment destinat a corroborar la hipòtesi d’Oparin, que<br />

considerava com condicions de partida la presència en l’atmosfera primitiva<br />

dels següents gasos: H2, N2, CO2, H2O, NH3, CH4.<br />

5


Miller va fer passar descàrregues<br />

elèctriques a través de la barreja de<br />

gasos que simularia la atmosfera<br />

primordial. En un recipient d’aigua<br />

que representava l’oceà primitiu,<br />

Miller va recupera aminoàcids.<br />

Posteriors modificacions a<br />

l’atmosfera produïren precursors de<br />

les 4 classes de macromolècules<br />

orgàniques (aminoàcids, sucres,<br />

lípids i àcids nucleics).<br />

Varen demostrar, doncs, amb aquest<br />

experiment que les descàrregues<br />

elèctriques sobre una mescla de<br />

gasos com la que devia ésser a<br />

l’atmosfera primitiva originava<br />

molècules com àcid nítric,<br />

formaldehid, àcid acètic, glicina, àcid<br />

làctic, alanina urea, àcid<br />

aspàrtic...indispensables per a<br />

qualsevol organisme viu.<br />

Les molècules obtingudes en els primers experiments de Miller són:<br />

6


El pas següent va ser la formació de macromolècules per polimerització<br />

de les petites, la polimerització. La interacció entre les molècules així<br />

generades es va incrementar a mesura que la seva concentració augmentava.<br />

Aquesta acumulació seria el que actualment anomenem “sopa d cultiu<br />

primitiu”. A partir d’aquesta sopa podria haver sorgit la primera forma de vida,<br />

ja que la polimerització va donar lloc a molècules més complexes com<br />

polipèptids (proteïnes) o polinucleòtids (RNA) essencials per a l’aparició de la<br />

primera cèl·lula. El polinucleòtids actuen com a patrons de polimerització,<br />

aquest fet és possible gràcies a que es produeix un enllaç preferencial entre<br />

parells de nucleòtids, mitjançant enllaços relativament febles. Malgrat tot, calien<br />

catalitzadors per a que tinguessin lloc aquestes polimeritzacions. S’han trobat<br />

diversos elements i minerals que hi havia que podien haver realitzar aquesta<br />

funció, per exemple, ions, minerals, el mateix RNA i, fins i tot, argila.<br />

No obstant, per tal de poder construir una cèl·lula o sistema biològic,<br />

aquest ha de tenir les següents propietats:<br />

- Un material de partida informatiu capaç d’autoreplicar-se que permeti ser<br />

construït i transmetre la informació a la generació següent<br />

- Un cert nivell de metabolisme que permeti captar matèria i energia del<br />

medi per al seu manteniment i per a la transmissió de la vida.<br />

- Possibilitat de mutacions o canvis que permeti al sistema progressar cap<br />

a la complexitat.<br />

A les cèl·lules vives actuals la informació genètica s’emmagatzema en el<br />

DNA, el qual transcriu el missatge al RNA finalment pot traduir aquesta<br />

informació en proteïnes que actualment són les encarregades de la gran<br />

majoria de les funcions cel·lulars.<br />

En canvi, les primeres cèl·lules no tenien DNA com a magatzem de la<br />

informació genètica, sinó que tenien RNA. El RNA era capaç d’emmagatzemar<br />

la informació genètica i catalitzar les reaccions químiques en les cèl·lules<br />

primitives. D’aquesta etapa d’autoreplicació molecular, s’anomena el món<br />

del RNA. Posteriorment, el DNA es va convertir en el material genètic i les<br />

proteïnes en els principals components catalítics i estructurals de les cèl·lules.<br />

Com es produïa aquesta autoreplicació del RNA?<br />

El mateix RNA pot actuar com a catalitzador (Ribozima).<br />

S’han identificat ribozimes amb acitivitats catalítiques molt diferents, inclosa la<br />

polimerització del RNA.<br />

Els RNAs tenien, doncs, capacitat informativa i capacitat catalítica. Dels RNAs<br />

amb activitat replicativa, s’haurien anat seleccionant aquells més estables<br />

(l’estabilitat depèn de l’estructura tridimensional del RNA).<br />

7


A la primera i segona imatge veiem el procés de replicació del RNA catalitzat per les<br />

ribozimes. Mentre que el esquema de la dreta representa com aglunes ribozimes<br />

podien catalitzar no només la replicació d’altres RNAs, sinó també la seva pròpia.<br />

El pas de món de RNA a DNA va<br />

seguir diferents passos. Les cèl·lules<br />

més primitives amb pre-RNA, que<br />

combinaven funcions genètiques,<br />

catalítiques i estructurals van ser<br />

reemplaçades gradualment pel RNA,<br />

que van evolucionar per poder dur a<br />

terme la síntesi de proteïnes. La<br />

aparició de molècules de DNA i<br />

l’evolució posterior d’algunes proteïnes<br />

(enzims) que podien replicar el DNA i<br />

fer copies de RNA a partir d’ell van<br />

reemplaçar definitivament el RNA per<br />

DNA. El DNA és més estable que el<br />

RNA i va resultar essencial quan les<br />

cèl·lules varen ser més complexes i<br />

necessitaven més informació.<br />

Però perquè tots aquests processos<br />

(autoreplicació, etc.) es produeixin<br />

necessitaven una alta concentració de RNA.<br />

Això es va aconseguir quan es van formar<br />

bicapes lipídiques quan els lípids entraven en<br />

contacte amb l’aigua. La primera cèl·lula,<br />

doncs, apareix quan una bicapa (miscel·la) és<br />

capaç d’incorporar en el seu interior molècules<br />

de RNA<br />

8


Ànnex: TEORIES EVOLUCIONISTES<br />

A partir de la refutació de la teoria de la generació espontània i del<br />

descobriment dels fòssils, es va començar a parla per primera vegada de la<br />

història i l’evolució del éssers vius. Les primeres teories evolucionistes<br />

intentaven demostrar que els éssers vius havien anat evolucionant amb el<br />

temps.<br />

Lammark, al 1801, va ser el primer en enuncià una teoria sobre<br />

l’evolució anomenada: teoria de l’evolució, o també coneguda com a teoria<br />

de l’herència dels caràcters adquirits que postulava que totes les espècies<br />

provenen d’altres menys desenvolupades; totes tenen un ancestre comú. Les<br />

idees bàsiques de la seva teoria eren:<br />

- La funció crea a l’òrgan, és a dir, l’adaptació es fa per necessitat<br />

(actualment s’està totalment en contra d’aquest punt).<br />

- Els òrgans o caràcters adquirits durant la vida s’hereten. Postulava que<br />

s’heretaven aquelles estructures que eren útils per a l’espècie, ja que<br />

duien a terme una funció important (també considerada com a falsa ja<br />

que els caràcters adquirits durant la vida no es poden heretar).<br />

Entre 20 i 30 anys després, Darwin va desenvolupar els seus estudis.<br />

Va estar 5 anys viatjant i estudiant les petites diferències entre espècies.<br />

Finalment, va realitzar una altra teoria, més completa, que es basava també en<br />

què les espècies ancestral, però que es recolzava en tres punts bàsics.<br />

- L’existència de variabilitat és el motor de l’evolució.<br />

- Les diferències entre els individus d’una mateixa espècie són degudes a<br />

mutacions, produïdes a l’atzar.<br />

- L’entorn s’encarrega de seleccionar als individus millor dotats: selecció<br />

natural.<br />

9


<strong>TEMA</strong> 3: EVOLUCIÓ CEL!LU<strong>LA</strong>R<br />

Les primeres cèl·lules es daten, segons el registre fòssil, fa 3.800 milions<br />

d’anys. Aquestes cèl·lules eren procariotes (no tenien nucli diferenciat),<br />

heteròtrofes (s’alimentaven de la sopa primitiva) i anaeròbies (no hi ha oxigen<br />

lliure, per tant, tenien un metabolisme poc eficient).<br />

Aquesta cèl·lula tenia un cicle cel·lular molt curt, que li permetia una<br />

reproducció constant i molt ràpida (per bipartició). Al anar-se’n reproduint tant<br />

ràpidament, es va anar incrementant en nombre considerablement, produint<br />

així una crisi d’aliments, ja que s’esgotava la matèria orgànica (crisi dels<br />

aliments).<br />

Degut a aquesta situació extrema i l’acumulació de mutacions en el<br />

material genètic es van seleccionar cèl·lules capaces d’obtenir energia de la<br />

llum solar i d’utilitzar el poc diòxid de carboni atmosfèric per a realitzar un<br />

procés fotosintètic. Apareix, per tant, la FOTOSÍNTESI. Les cèl·lules<br />

fotosintetitzadores podien convertir l’aigua i el diòxid de carboni en compostos<br />

orgànics i alliberaven oxigen a l’atmosfera.<br />

Simultàniament, també es seleccionaren cèl·lules amb capacitat de<br />

fagocitar i que, per tant, s’alimentaven d’altres cèl·lules. Gràcies a la fagocitosi<br />

es van anar incorporant uns organismes dins d’uns altres establint relacions de<br />

simbiosi.<br />

Tal com apareix a l’esquema, l’aparició de cèl·lules fotosintetitzadores<br />

que alliberaven oxigen al medi va provocar una segona crisi, la crisi aeròbica.<br />

Fa uns 2.000 milions d’anys, les cèl·lules fotosintetitzadores havien produït<br />

suficient oxigen per a modificar l’atmosfera terrestre substancialment.<br />

Molt pocs organismes eren capaços d’aprofitar l’oxigen alliberat al medi<br />

i, de fet, per la gran majoria aquest oxigen resultava tòxic. Aquests anaeròbics<br />

obligats varen desaparèixer o van quedar restringits a àrees sense contacte<br />

amb l’oxigen. No obstant, els pocs que podien aprofitar-lo van evolucionar<br />

desenvolupant una via respiratòria que utilitzava l’O2 per obtenir més energia<br />

dels aliments i transformar-la en ATP. La respiració aeròbia s’incorpora, així, al<br />

procés anaerobi ja existent de la glucòlisi.<br />

10


A més a més, gràcies a aquest oxigen alliberat es va formar la capa<br />

d’ozó (O3) que envolta la Terra impedint l’arribada de les radiacions<br />

ultraviolades a la Terra.<br />

L’ORIGEN DE LES <strong>CÈL</strong>!LULES EUCARIOTES.<br />

Per tal d’evolucionar de cèl·lules procariotes a cèl·lules eucariotes, les cèl·lules<br />

han hagut d’adquirir al menys dos propietats bàsiques.<br />

- Estructures especialitzades en la respiració (mitocondri). A més els<br />

autotròfics requerien sistemes fotosintetitzadors (cloroplasts).<br />

- Un sistema intracel·lular de membranes (generarien nucli cel·lular)<br />

1.1. L’origen del nucli<br />

Les cèl·lules fagocitaries tenien una membrana molt flexible, fet que va<br />

afavorir al desenvolupament d’un sistema intracel·lular de membranes que<br />

finalment va donar lloc als orgànuls típics de les cèl·lules eucariotes, entre ells<br />

el nucli (coberta nuclear té dos membranes).<br />

11


1.2. L’origen dels mitocondris i els cloroplasts<br />

L’origen dels mitocondris i cloroplasts es data entre 1.500 i 700 milions<br />

d’anys. L’any 1980 Lynn Margulis va proposar la teoria de la endosimbiosi<br />

(teoria endosimbiòtica) per tal d’explicar l’origen dels mitocondris i dels<br />

cloroplasts. D’acord amb aquesta idea, un procariota fagocitari va envoltar un<br />

procariota aerobi (considerat el mitocondri) o a un procariota fotosintetitzador<br />

(considerat el cloroplast).<br />

Això explica perquè tant els mitocondris com els cloroplasts tenen dos<br />

membranes i DNA propi.<br />

Podem dir que els mitocondris eren originàriament bacteris aeròbics.<br />

Tenen una mida i una forma semblant i tenen DNA circular sense associar-se a<br />

histones, sintetitzen proteïnes, es reprodueixen per bipartició, tenen ribosomes<br />

de 70s i posseeixen a la seva membrana enzims per a realitzar la respiració,<br />

sent els responsables de la respiració cel·lular.<br />

Pel que fa als cloroplasts, eren originàriament cianobacteris, ja que<br />

capten la llum solar en la clorofil·la, unida a les membranes, tenen una mida i<br />

una forma semblant, es reprodueixen per bipartició i tenen un DNA amb una<br />

seqüència de nucleòtids pràcticament idèntica a la de fragments del<br />

cromosoma bacterià.<br />

12


Així, la simbiosi entre espècies va donar lloc a nous organismes:<br />

EVOLUCIÓ DELS UNICEL!LU<strong>LA</strong>RS ALS PLURICEL!LU<strong>LA</strong>RS<br />

Requisits bàsics per a l’evolució:<br />

- Un medi intern que aporti nutrients a totes les cèl·lules i un sistema de<br />

transport per a aquest medi. (Això ocasiona la sortida de la vida de<br />

l’aigua per trobar aliment)<br />

- Una especialització funcional de les cèl·lules del organisme<br />

(diferenciació cel·lular: totes les cèl·lules tenen la mateixa informació<br />

genètica, però cadascuna expressa una informació concreta).<br />

13


Evolució d’organismes unicel·lulars a organismes pluricel·lulars.<br />

Totes les cèl·lules precursores són protistes que formen un grup molt heterogeni<br />

Així, després del pas de unicel·lulars a pluricel·lulars la distribució dels<br />

organismes va quedar tal i com la coneixem avui en dia.<br />

14


<strong>TEMA</strong> 4: MÈTODES PER A L’ESTUDI DE LES <strong>CÈL</strong>!LULES<br />

1. TÈCNIQUES MICROSCÒPIQUES<br />

La cèl·lula no té color i, per tant, no té contrast. Sota el microscopi no es<br />

veu res. Per poder estudiar a fons la cèl·lula hem de processar-la mitjançant<br />

diferents tècniques.<br />

Hem de saber quines són les mides que volem estudiar i escolir la millor.<br />

Per això, ens cal saber el límit de resolució que es calcula de la següent<br />

manera:<br />

LR = (0,61*") / (n*pen#) = (0,61*") / AN<br />

n = índex de refracció = 1-1,4. Indica el material que hi ha entre l’objectiu i<br />

l’objecte (aire, aigua, oli...)<br />

pen! = el dóna el fabricant (mesura entre l’objectiu i l’objecte)<br />

AN= apertura numérica<br />

" = longitud d’ona de la llum emprada. (és aprox. 500nm)<br />

El límit de resolució d’un microscopi òptic és de 0,2µm = 200nm. Dos punts<br />

situats més a prop de 200nm, no els podriem distingir com dues estructures<br />

separades.<br />

Per augmentar la " podem canviar el tipus de llum. Això fa augmentar la<br />

resolució. La llum ultraviolada (UV) té una " de 260nm. En aquest cas, el límit<br />

de resolució d’un microscopi òptic és de 0,25µm = 250nm.<br />

La " en el microscopi electrònia és extremadament més baixa. Fa servir<br />

electrons accelerats a 100.000V ! "= 0.004nm.<br />

15


El límit de resolució d’un microscopi electrònic amb els electrons accelerats a<br />

100.000V és d’entre 0,1 i 0,2 nm. Podem veure molècules o àtoms. Tamé<br />

podem veure detalls de la cèl·lula (mitocondris, etc.)<br />

Un altre concepte relacionat és el contrast. Hem de preparar adequadament<br />

les mostres per poder-les visualitzar a través del microscopi.<br />

1.1. Preparació de mostres<br />

Té quatre punts molt importants:<br />

- Fixació: aturar de cop els processos metabòlics i bioquímics de la<br />

cèl·lula. Hem de garantir, però, que la cèl·lula morta sigui el més<br />

semblant possible a la viva. Pot ser:<br />

" Fixació química: mitjançant fixadors (formol, alcohol...). Moltes<br />

vegades aquest procés és massa llarg i no ens interessa<br />

" Fixació física: Congelació amb nitrogen o heli. És immediat<br />

- Inclusió del teixit fixat (en fixacions químiques). Quan congelem el<br />

teixit està dur i el podem tallar, però si hem fet una fixació química cal<br />

que l’endurim per tallar-lo. S’inclou el teixit en un altre material (plàstic,<br />

parafina...). El material impregna el teixit i el podem tallar.<br />

- Tallar seccions. Per al microscopi òptic els talls han de ser d’entre 6-<br />

10µm. Amb aquest gruix la llum pot traspassar la mostra. Els talls es fan<br />

amb el micròtom. Per al microscòpi electrònic els talls han de ser<br />

ultrafins perquè els electrons tenen un poder de traspàs molt baix. Talls<br />

entre 50-100µm.<br />

Actualment, els microscopis òptics porten càmeres digitals i pots capturar la<br />

imatge.<br />

Fa 10-15 anys van aparèixer una sèrie de tècniques que empraven filtres o<br />

llum UV i que van revolucionar l’ús dels mircroscopi. Aquestes tècniqeues<br />

milloraven la visió i són principalment:<br />

- Microscòpia de contrast de fase: És el que dóna millor informació<br />

sobre les cèl·lules vives. Permeten obtenir un contrast més elevat. Hi ha<br />

una sèrie de filtras que fan que la llum incideixi sobre un altre angle i no<br />

directament sobre la mostra<br />

- Filtres diferencials<br />

- Tècniques de camp fos<br />

1.1.1. Microscòpia confocal i de fluorescència<br />

S’ha emprat des dels anys 80-85. Ha permès obtenir informació que mai<br />

no es podria haver captat per mètodes tradcionals. Podem analitzar estructures<br />

i veure com estan composades a la cèl·lula.<br />

16


Aquestes molècules fluorescents estan associades als anticossos i als<br />

antígens. Un anticòs només concorda amb un antígen. Podem veure el que<br />

marquen anticossos i antígens.<br />

La microscòpia confocal mostra imatges molt nítides perquè enfoquem<br />

un pla.<br />

Utilitzarem llum UV per estudiar molècules fluorescents de la cèl·lula. Si<br />

això li sumem la tècnica confocal tenim imatge més nítides.<br />

Idea bàsica de la microscòpia confocal i de fluorescència.<br />

Excitar una molècula fluorescent dins la cèl·lula amb llum Uv. Si hi ha<br />

cèl·lules que tenen estructures fluorescents dins de la seva estructura les<br />

podem excitar amb llum UV. Si la cèl·lula no té molècules fluorescents n’hem<br />

d’induir. Un dels sistemes és induir anticossos. Els marquem fluorescentment i<br />

els introduïm a la cèl·lula. Ex. anticossos d’antiactina! marcaran les molècules<br />

d’actina.<br />

Problema de la microscòpia de fluorescència.<br />

Hi ha soroll de fons que embruta la imatge (distorsió). El pla focal és pla<br />

hi ha moltes molècules fluorescents a diferents nivell que no les sabríem<br />

col·locar. Això provocar distorsió.<br />

Si enlloc de fer servir llum UV fem servir un làser, el pla focal és d’un<br />

punt. Així, desapareix el soroll. Això és una tècnica confocal. El problema del<br />

pla confocal és que perdem informació de l’estructura que estem observant.<br />

Els microscopis confocals, però, incorporen sistemes d’escaneig que capten<br />

diferents imatges de l’estructura de la cèl·lula per no perdre informació. Totes<br />

les imatges que escaneja el microscopi les reconstrueix i ens mostra tota la<br />

imatge de la cèl·lula.<br />

1.1.2. Microscòpia electrònica<br />

Hi ha dos tipus:<br />

- Microscòpia electrònica de transmissió (TEM):<br />

La llum travessa la mostra. Hi h electrons en un camp elèctri i les lents<br />

són camps electromagnètics. La imatge final serà el resultat d’una sèrie<br />

de contrastos. També podem digitalitzar la imatge.<br />

En el microscopi electrònic de transmissió els talls de la mostra han de<br />

ser molt petits perquè els electrons pugui traspassar.<br />

Ens trobem amb el mateix problema que amb la microscòpia confocal.<br />

Per solucionar el problema podem fer talls seriats i reconstruir la imatge.<br />

Això és complicat tècnicament. Una altra solució per estructures<br />

senzilles (ex Mitocondris) és fa servir el TEM d’alt voltatge (TEM normal:<br />

100.000V / TEM alt voltatge: 1.000.000V). Amb això aconseguim que<br />

augmenti el nivell de penetració. Només hi ha dos TEM d’alt voltatge.<br />

La microscòpia de transmissió és en B/N i requereix treballar amb els<br />

50/100nm.<br />

17


- Microscòpia electrònica de rastreig (SEM): la trajectòria de la llum és<br />

diferent. Hi ha un filament d’electrons que passen a través d’una lent<br />

electromagnètica. Els electrons no travessen la mostra, sinó que reboten<br />

i van a parar a una pantalla que reprodueix la imatge. Perquè això<br />

funcioni, cal que pintem la superfície de la mostra amb sals de metalls<br />

pesats.<br />

Ens dóna una imatge només de la superfície de la mostra (ex. una<br />

cèl·lula sencera, un teixit, un insecte). La resolució és més baixa que el<br />

TEM.<br />

TEM = 0,1 nm<br />

SEM= 10nm<br />

MO=200nm<br />

Ens mostra imatges que ens ajuden a entendre la morfologia a nivell de<br />

les cèl·lules d’un teixit.<br />

1.1.3. Criofactura.<br />

Tècnica emprada en la visualització de mostres biològiques mitjançant el<br />

microscopi electrònic, especialment en estudis de la membrana cel·lular,<br />

consistent a congelar l’espècimen amb nitrogen líquid i fracturar-lo amb un<br />

micròtom<br />

1.2. Tècniques de fraccionament i cultius cel!lulars<br />

A pràctiques.<br />

Temes 7 i 9<br />

1.3. Tècniques de localització i quantificació de molècules<br />

A pràctiques.<br />

18


<strong>TEMA</strong> 5: PROTEÒMICA<br />

Hem passat de l’època del genoma a l’època post-genòmica: època<br />

proteòmica ! l’expressió dels gens. Per entendre les funcions dels gens hem<br />

d’entendre els seus productes.<br />

Fins ara es creia:<br />

GEN (DNA) ! RNA ! proteïnes<br />

Ara se sap que un GEN té més d’un RNA que pot donar lloc a<br />

estructures diferents.<br />

Ens interessa doncs, saber què fan les proteïnes. Quan falla quelcom al<br />

cos hem de saber quina molècula ha fallat i, per tant, necessitem saber quines<br />

funcions desenvolupen les proteïnes.<br />

A una proteïna no se li pot assignar una sola funció, sinó que la<br />

funció d’una proteïna depèn del lloc i del temps on estigui.<br />

La proteïna està dins d’un compartiment i al llarg del temps va passant<br />

d’un compartiment a un altre. A cada compartiment interacciona amb altres<br />

molècules i aquestes interaccions determinen les seves funcions. Això fa que<br />

una proteïna tingui diferents funcions (poden no ser molt diferents,però ho són).<br />

Proteoma: conjunt de proteïnes d’una espècie.<br />

Hi ha diferents tècniques per estudiar el proteoma:<br />

- Electroforesi bidimensional. Separar les proteïnes segons el seu pes<br />

molecular (en un pes elèctric). A la llarga les proteïnes es van barrejant<br />

19


Pot passar que més d’una proteïna tingui el mateix pes molecular, per<br />

tant, aquest sistema no serveix. Ens cal un segon criteri que ens permeti<br />

spearar totalment les proteïens<br />

Criteri 1: separa les proteïnes pel seu punt isoelèctric (característica<br />

única de cada proteïna que està relacionat amb la càrrega elèctica. La<br />

càrrega depèn dels aminoàcids que són diferents per cada proteïna).<br />

Criteri 2: el pes molecular.<br />

- Espectromètria de masses. Retallem cada proteïna en condicions<br />

estèrils (perquè no es contamini la mostra). L’espectòmetre ens donarà<br />

la seva massa i ens seqüènciara la proteïna o part de la proteïna<br />

(desxifra els aminoàcids). Els espectòmetres estan connectats a una<br />

base de dades online que et permet veure si aquella proteïna està<br />

identificada o no.<br />

20


<strong>TEMA</strong> 6: <strong>COM</strong>PARTIMENTALITZACIÓ<br />

La cèl·lula eucariota està subdividida en compartiments envoltats per una<br />

membrana i que mantenen la seva pròpia estructura i funció. Cada<br />

compartiment o orgànul té:<br />

- Enzims propis.<br />

- Molècules especialitzades.<br />

- Sistema de distribució que transporta els compostos d’un orgànul a<br />

l’altre.<br />

Les proteïnes tenen un paper molt important a la compartimentalització, ja que:<br />

- Catalitzen les reaccions de cada orgànul<br />

- Són marcadors específics en la superfície que marquen el destí de<br />

proteïnes i lípids a l’orgànul adequat.<br />

- Són sintetitzades al citosol i són transportades allà on són necessitades.<br />

- S’encarreguen del transport selectiu de dins i fora del compartiment. La<br />

bicapa lipídica dels orgànuls de membrana és impermeable a la majoria<br />

de les molècules hidrofíliques; així, cada membrana ha de tenir<br />

proteïnes transportadores que s’encarreguin de l’entrada i sortida de<br />

metabòlits.<br />

1. <strong>COM</strong>PARTIMENTS MÉS IMPORTANTS <strong>COM</strong>UNS A TOTES LES<br />

<strong>CÈL</strong>!LULES EUCARIOTES<br />

- Nucli: conté el genoma principal i es produeix la síntesi d’ADN i ARN.<br />

- Citoplasma: format pel citosol i els orgànuls suspesos en ell.<br />

- Citosol: es produeix la síntesi de proteïnes i és on es desenvolupen la<br />

majoria de reaccions del metabolisme cel·lular (síntesi i degradació de<br />

molècules).<br />

- Reticle endoplasmàtic (ER) (llis i rugós): (fàbrica de la cèl·lula)<br />

presenta molts ribosomes units a la seva superfície citoplasmàtica, els<br />

quals sintetitzen proteïnes integrals de membrana i proteïnes solubles<br />

destinades a ser segregades o a ser transportades a altres orgànuls.<br />

Produeix també lípids i emmagatzema Ca 2+ .<br />

21


- Aparell de Golgi: conjunt de compartiments organitzats en forma de<br />

sacs discoïdals (forma de disc) anomenats cisternes de Golgi. Rep<br />

proteïnes i lípids del RE i les distribueix cap a diferents destins<br />

intracel·lulars, generalment modificant-les (maduren aquí) també.<br />

- Mitocondris: respiració cel·lular i generació d’ATP.<br />

- Lisosomes: tenen enzims digestius que degraden orgànuls morts i<br />

molècules captades per endocitosi.<br />

- Endosomes: compartiments per on passen les partícules endocitades<br />

abans d’entrar als lisosomes.<br />

- Peroxisomes: petits compartiments vesicualrs que contenen enzims de<br />

diverses reaccions.<br />

En la majoria de les cèl·lules,<br />

l’aparell de Golgi és pròxim al nucli<br />

mentre que el ER s’exten a partir<br />

del nucli per tot el citosol. L’interior<br />

dels orgànuls es comuniquen entre<br />

si i amb l’exterior de la cèl·lula<br />

mitjançant la via de vesícules de<br />

transport que apareixen per<br />

gemmació d’un orgànul i es<br />

fusionen amb un altre.<br />

Els orgànuls limitats per membrana no estan distribuïts a l’atzar, sinó que<br />

adopten unes posicions estratègiques i específiques.<br />

Quan la cèl·lula es reprodueix per divisió, ha de duplicar els seus<br />

compartiments intracel·lulars. Generalment, les cèl·lules duen a terme aquest<br />

procediment augmentant la mida dels seus orgànuls ja existents i incorporant<br />

noves molècules en ells; els orgànuls ja augmentats es divideixen i es<br />

distribueixen entre les dues cèl·lules filles. Cada cèl·lula filla hereta de la cèl·lula<br />

mare un joc complet de membranes cel·lulars. Aquesta herència és essencial<br />

perquè la cèl·lula no pot formar les membranes de nou.<br />

2. LES PROTEÏNES PODEN DESP<strong>LA</strong>ÇAR-SE ENTRE<br />

<strong>COM</strong>PARTIMENTS DE DIVERSES MANERES<br />

Totes les proteïnes comencen a ser<br />

sintetitzades als ribosomes en el citosol. El<br />

seu destí següent depèn de la seva<br />

seqüència d’aminoàcids, que pot presentar<br />

senyals de classificació que proporcionen<br />

diferents destins específics per a les<br />

proteïnes, fora del citosol. Moltes proteïnes<br />

no tenen aquests senyals, així que han de<br />

restar al citosol. Altres tenen senyals de<br />

“sorting” que les dirigeixen en el seu<br />

repartiment al nucli, al RE, al mitocondri, als<br />

cloroplasts o als peroxisomes.<br />

22


Hi ha 3 sistemes fonamentals diferents mitjançant els quals les proteïnes es<br />

desplacen des d’un compartiment a l’altre.<br />

1) Transport regulat o de comporta (gated transport): es dóna entre el<br />

citolsol i el nucli a través dels porus nuclears que funcionen com a<br />

comportes selectives que permeten activar el transport específic de<br />

macromolècules, encara que també està permesa la difusió de petites<br />

molècules.<br />

2) Transport transmembrana: Les proteïnes que estan al citosol per<br />

entrar als compartiments hauran de traspassar les seves membranes,<br />

per això necessiten mecanismes específics (translocadors proteïcs units<br />

a la membrana) que dirigeixen el transport específic de proteïnes.<br />

3) Transport vesicular: les vesícules de<br />

transport carreguen proteïnes des d’un<br />

compartiment a l’altre. A mesura que la<br />

membrana d’un compartiment produeix<br />

vesícules per gemmació, aquestes<br />

vesícules capten molècules del lumen del<br />

compartiment. Després del transport i la<br />

fusió amb la membrana de l’altre<br />

compartiment, aquestes vesícules<br />

descarreguen el seu carregament en<br />

l’interior d’aquest altre compartiment.<br />

Cada un d’aquests mecanismes de transport és dirigit per senyals de<br />

sorting continguts a les seqüències aminoàcides de les proteïnes, que són<br />

reconeguts per receptors complementaris de la proteïna al orgànul.<br />

El viatge de les proteïnes comença amb la seva síntesi als ribosomes i<br />

finalitza quan s’ha arribat al destí final. A cada estació intermitja (boxes) es<br />

decideix si la proteïna és retinguda o transporta.<br />

Hi ha dos tipus de senyals de sorting a les proteïnes:<br />

A- Seqüències senyal. És un tram continuu de la seqüència<br />

d’aminoàcids que normalment trobem a un dels extrems, generalment a<br />

l’amino. Aquest senyal acostuma a ser eliminat per una proteïna peptidasa<br />

especialitzada un cop el procés de sorting ha finalitzat.<br />

23


B- Dominis senyal: Es pot formar una regió senyal mitjançant la<br />

juxtaposició d’aminoàcids procedents de regions que es trobaven físicament<br />

separades abans que aquesta es plegués. Són una col·locació específica i<br />

tridimensional dels àtoms al llarg de la superfície de la proteïna. Els residus<br />

d’aminoàcids que comprenen aquest domini senyal poden estar separats els<br />

uns dels altres a la seqüència aminoàcida i resten a l’extrem final de la<br />

proteïna. Aquests dominis només es poden observar quan la proteïna adopta<br />

una configuració tridimensional que pot ser reconeguda per altres molècules.<br />

(ex. manosa-6-fosfat)<br />

Per entrar als orgànuls, les vesícules necessiten ser molt hidrofòbiques.<br />

Aquesta és la raó per què la majoria de seqüències senyal són molt<br />

hidrofòbiques (ex. Leucina i lisina són aminoàcids molt comuns i molt<br />

hidrofòbics).<br />

En el citosol quan es comença a sintetitza la proteïna es fan dues coses:<br />

- si té seqüència senyal anirà al reticle endoplasmàtic<br />

- si no té seqüència senyal no podrà entrar al reticle endoplasmàtic.<br />

24


<strong>TEMA</strong> 7: ESTRUCTURES DE LES MEMBRANES<br />

Les membranes cel·lulars són essencials per a la vida cel·lular. La<br />

membrana plasmàtica envolta la cèl·lula definint la seva extensió i mantenint<br />

les diferències entre el contingut de la cèl·lula i el seu entorn. Les membranes<br />

del ER, aparell de Golgi, mitocondris i altres orgànuls delimitats per membrana<br />

mantenen les diferències característiques entre els continguts de cada orgànul i<br />

el citosol. La membrana conté també proteïnes que actuen com sensors de<br />

senyals externs.<br />

Les bicapes lípidiques són altament<br />

impermeables a la majoria de molècules<br />

polars. No obstant, qualsevol molècula<br />

acabarà penetrant la bicapa lipídica lliure de<br />

proteïna amb temps suficient. La velocitat amb<br />

què es produeix la difusió depén del tamany<br />

de la molècula i de la solubilitat en lípids. Com<br />

més petita i més hidrofòbica o apolar, millor i<br />

més ràpidament es difon en la bicapa. Les<br />

bicapes lipídiques són altament impermeables<br />

a ions malgrat el seu tamany ja que la seva<br />

càrrega i el grau d’hidratació eviten la<br />

penetració. Algunes molècules entraran,<br />

doncs, per transport passiu o difusió facilitada a favor de gradient electroquímic<br />

sense despesa d’ATP, mentre que d’altres entraran per transport actiu amb<br />

consum d’ATP gràcies a les anomenades bombes.<br />

Les membranes estan formades per lípids, proteïnes i carbohidrats i són<br />

estructures dinàmiques, ja que la majoria de les seves molècules són capaces<br />

de desplaçar-se en el pla de la membrana. A més a més, la bicapa és<br />

asimètrica, diferenciant-se una cara externa i una cara citosòlica o<br />

protoplasmàtica. Cada cara té una composició i una càrrega diferent i, per tant,<br />

cada una tindrà unes funcions específiques. L’any 1972, Singer i Nicolson van<br />

proposar el model del mosaic fluid, basant-se en aquest dinamisme.<br />

1. <strong>LA</strong> MEMBRANA P<strong>LA</strong>SMÀTICA<br />

La membrana plasmàtica és la membrana que envolta totes les cèl·lules,<br />

definit la seva extensió i mantenint les diferències essencials entre el contingut<br />

de la cèl·lula i el seu entorn.<br />

No és una membrana uniforme, de tant en tant es veuen uns dominis<br />

d’uns 70nm de diàmetre anomenats Rafts, que tenen una composició i unes<br />

funcions diferents a les de la resta de la membrana. Aquests rafts són més<br />

amples degut a que la seva composició lipídica és diferent. Tenen més<br />

colesterol i una concentració d’esfingolípids més elevada. Són rígids i no<br />

permeten els moviments de les molècules fàcilment. A més hi ha una<br />

disminució de la permeabilitat. La seva existència és molt important perquè són<br />

regions que concentren moltes proteïnes receptores de senyals externes.<br />

25


També s’hi troben molècules com el Ras (oncogènica, regulada per<br />

caveolina que fa que estigui inactiva, en estat actiu es troba en molts càncers) i<br />

proteïnes que s’han de transportar a altres membranes cel·lulars. Restringeixen<br />

també les interaccions de les proteïnes de la membrana amb molècules<br />

extracel·lulars i, en canvi, potencien les interaccions amb el citoesquelet. El<br />

microdominis (Rafts) es classifiquen per si tenen caveolina o no, en caveolars o<br />

no caveolars.<br />

Els caveolars formen part d’una invaginació recorberta de caveolina, en<br />

canvi els no caveolars tenen la superfície plana. Els rafts tenen molta<br />

importància degut a que s’ha descobert que són els anclatges per l’entrada del<br />

virus de la SIDA o de la toxina del Còlera.<br />

La claveolina té dominis transmembrana amb molta afinitat pel<br />

colesterol. S’encarrega de la regulació del transport de colesterol, té la<br />

capacitat d’unir moltes proteïnes i intervé en la relaxació arterial.<br />

2. ELS LÍPIDS DE <strong>LA</strong> MEMBRANA<br />

Els lípids de membrana són molècules<br />

amfipàtiques (tenen un extrem hidrofílic i un<br />

extrem hidrofòbic) que formen bicapes. Les<br />

molècules lipídiques són insolubles en aigua però<br />

es dissolen fàcilment en dissolvents orgànics.<br />

2.1. Fosfolípids<br />

Els lípids més abundants de les<br />

membranes són els fosfolípids. Els<br />

fosfolípids tenen un cap polar i dues<br />

cadenes hidrofòbiques (àcids grassos).<br />

Normalment una de les dues cues presenta<br />

un o més dobles enllaços (cadena<br />

insaturada) i l’altra normalment no té dobles<br />

enllaços (cadena saturada).<br />

26<br />

LÍPIDS DE<br />

MEMBRANA<br />

FOSFOLÍPIDS COLESTEROL GLUCOLÍPIDS


La membrana plasmàtica no és homogènia, hi ha subdominis. Els<br />

dominis ordenats (fosfolípids sense insaturacions en ela seus àcids grassos) i<br />

dominis desordenats (àcids grassos amb insaturacions).<br />

Els fosfolípids es mouen en la membrana plasmàtica. Hi distingim la<br />

difusió lateral, la difusió translocacional i la difusio rotacional, que són<br />

espontànies, i la difusió transmembranal (flip-flop), que és molt lenta<br />

TIPUS MOVIMENT LÍPIDS<br />

DIFUSIÓ <strong>LA</strong>TERAL<br />

Els fosfolípids són sintetitzats només en una de els monocapes de la<br />

membrana, normalment en la monocapa citosòlica del ER.<br />

Si cap d’aquestes molècules recentment formades pogués migrar capa l’altra<br />

meitat de la bicapa lípidica no es podria formar més bicapa. Per a solucionar<br />

aquest problema hi ha un enzim translocador de fosfolípids encarregat de<br />

catalitzar un ràpid flip-flop de fosfolípids específics des de la monocapa on han<br />

estat sintetitzats fins a la monocapa oposada.<br />

Hi ha quatre grups bàsics de<br />

fosfolípids: la fosfatidiletanolamina, la<br />

fosfaditil serina (carregada<br />

negativament), la fosfatidilcolina i<br />

l’esfingomielina. També existeixen els<br />

fosfolípids d’inositol que són<br />

funcionalment importants, però es<br />

troben en quantitats petites.<br />

2.2. Colesterol<br />

DIFUSIÓ TRANSLOCACIONAL<br />

DIFUSIÓ ROTACIONAL<br />

DIFUSIÓ TRANSMEMBRANAL<br />

La fluïdesa de les membranes cel·lulars és molt important ja que alguns<br />

processos de transport i algunes activitats enzimàtiques poden aturar-se quan<br />

la viscositat de la bicapa augmenta.<br />

La fluïdesa d’una capa lípidica depèn de:<br />

- La seva composició, més lípids insatutrats més fluïdesa.<br />

- La seva temperatura, a temperatures més baixes més fluïdesa<br />

- La longitud de les cadenes dels fosfolípids: més curtes, més fluïdesa (les<br />

cues hidrocarbonades disminueixen les seves interaccions).<br />

27


28<br />

Però, una bicapa lipídica conté<br />

no només fosfolípids i glucolípids, sinó<br />

també quantitats elevades de<br />

colesterol. Les molècules de<br />

colesterol reforcen el caràcter<br />

permeable de la bicapa lipídica (més<br />

colesterol més fluïdes) i donen més<br />

estabilitat mecànica a la bicapa.<br />

Els seus grups hidroxil s’orienten pròxims als caps polars dels<br />

fosfolípids, els seus anells esteroides interactuen i inmmobilitzen les regions de<br />

les cadenes hidrocarbonades (àcids grassos) més pròxims als caps polars,<br />

deixant la resta de la cadena més flexible. En disminuir la mobilitat dels primers<br />

CH2 dels àcids grassos, el colesterol fa més rígida la bicapa lipídica en aquesta<br />

regió però la resta és més flexible. A més, disminueix la permeabilitat de la<br />

bicapa i facilita els canvis en la forma de la membrana que requereixen que les<br />

dues cares de la bicapa es retreguin o s’estenguin. També impedeix que les<br />

cadenes hidrocarbonades s’ajuntin i cristal·litzin, inhibint possibles canvis<br />

d’estat.<br />

3. PROTEÏNES DE MEMBRANA<br />

L’estructura bàsica de les membranes està determinada per la bicapa<br />

lipídica, però la majoria de les seves funcions específiques estan<br />

desenvolupades per proteïnes.<br />

Les proteïnes de membrana poden estar associades a la bicapa lípidica<br />

de diverses maneres:<br />

• Moltes proteïnes de membrana atravessen la bicapa lipídica, són les<br />

anomenades proteïnes transmembrana. Són amfipàtiques, tenen<br />

regions hidrofòbiques i hidrofíliques. Les regions hidrofòbiques es situen<br />

a l’interior de la membrana i es relacionen amb les molècules lipídiques<br />

de l’interior de la bicapa. Les regions hidrofíliques es troben exposades<br />

al medi aquós d’ambdós costats de la membrana. Una proteïna<br />

transmembrana (hèlix !) travessa la membrana un o més cops, pot<br />

formar canals (hèlix #) o estructures hair pin. (1, 2, 3 i 4)


• Proteïnes integrals d’origen citosòlic. Estan ancorades a la bicapa per<br />

la cara citoplasmàtica a través de la unió covalent amb una cadena<br />

d’àcid gras modificat amb un grup prenyl o a través una hèlix !<br />

amfipàtica exposada en la superfície de la proteïna.<br />

• Proteïnes integrals que posseixen un ancoratge GPI<br />

(glicosilfosfatidilinositol) amb la cara no citoplasmàtica. La proteïna està<br />

unida per unió covalent a la bicapa per una unió covalent via un<br />

oligosàcarid específic. Aquesta modificació GPI és un senyal que indica<br />

a la proteïna on s’ha de dirigir en la cèl·lula, influint en la seva funció.<br />

• Proteïnes perifèriques: estan associades a la membrana sense ocupar<br />

el seu interior hidrofòbic, ja que estan unides a una de les dues cares de<br />

la bicapa (a la citosòlica o a la extracel·lular) mitjançant interaccions no<br />

covalents amb altres proteïnes de membrana.<br />

Les proteïnes no es distribueixen uniformement, hi ha proteïnes amb<br />

afinitat pels dominis ordenats i d’altres pels desordenats, per exemple les<br />

proteïnes GPI tenen afinitat pels dominis ordenats als quals es poden unir tot i<br />

no tenir domini hidrofòbic gràcies al grup GPI al que estan associats. Les<br />

proteïnes transmembrana, en canvi, si que tenen dominis hidrofòbics rics en<br />

leusina. Si en aquests dominis hidrofòbics apareix una prolina es produeix una<br />

torsió que fa que la proteïna torni a entrar en la bicapa i la torni a travesar.<br />

En les imatges següents, la primera representa en verd fosc els dominis<br />

hidrofòbics (valors positius) i en verd clar els dominis hidrofílics (valors<br />

negatius) i la segona imatge és un exemple d’un domini transmembrana.<br />

4. <strong>LA</strong> SUPERFÍCIE CEL!LU<strong>LA</strong>R ESTÀ COBERTA AMB RESIDUS DE<br />

SUCRE<br />

En la superfície de totes les membranes plasmàtiques hi ha glucolípids.<br />

Les proteïnes de membrana tampoc acostumen a sobresortir despullades a<br />

l’exterior cel·lular sinó que són cobertes per carbohidrats. Aquests carbohidrats<br />

es troben en forma d’oligosacàrdids units covalentment a les proteïnes de<br />

membrana (glucoproteïnes) i a lípids (glucolípids).<br />

També hi ha proteoglicans integrals de membrana, que són llargues<br />

cadenes de polisacàrids unides covalentment a un nucli proteïc que s’extén a<br />

través de la la llarga bicapa lipídica mitjançant un glucosilfosfatidilinositol (GPI).<br />

29


Els grups de sucre són afegits a les proteïnes (comença al reticle<br />

endoplasmàtic) o als lípids en l’aparell de Golgi. Els glúcids, independentment<br />

a què estiguin associats, se situen a la cara externa de la membrana<br />

plasmàtica, al lumen, mai capa al citosol.<br />

Els set glúcids que podem trobar formant<br />

part de proteïnes i lípids són: manosa,<br />

galactosa, N-acetilgalactosamina, glucosa, Nacetilglucosamina,<br />

fucosa i àcid siàlic. I no tots<br />

els aminoàcids poden ser glucosilat, només la<br />

serina, la treonina i l’àcid aspàrtic.<br />

30<br />

La coberta cel·lular o<br />

glucocàlix és la zona de la<br />

superfície cel·lular rica en hidrats<br />

de carboni. Aquesta està formada<br />

per cadenes d’oligosacàrids dels<br />

glucolípids i de les glucoproteïnes<br />

integrals de membrana. El<br />

glicocàlix és el responsable de<br />

protegir la cèl·lula de possibles<br />

atacs i d’actuar en processos de<br />

reconeixement cel·lular (ex.<br />

sucres de l’òvul són reconegudes<br />

per l’espermatozou).<br />

Els glucolípids són molècules molt<br />

importants per l’organisme. Un exemple és que<br />

en el cas de la seva pèrdua en resulten greus<br />

malalties, com és el cas de l’Alzheimer que és<br />

degut a la pèrdua dels glucolípids de les<br />

neureones.<br />

Els glucolípids tenen diverses funcions essencials:<br />

- Els que tenen càrrega tenen una importància fonamental gràcies als<br />

seus efectes elèctrics: la seva presència altera el camp elèctric a través<br />

de la membrana i la concentració d’ions en la superfície externa.<br />

- Realitzen un paper important en l’aïllament elèctric, ja que es troben en<br />

gran quantitat en la meitat no citoplasmàtica de la bicapa de la<br />

membrana mielínica, que aïlla elèctricament els axons de les cèl·lules<br />

nervioses.<br />

- Realitzen funcions de reconeixement cel·lular.<br />

Procés de rolling: amb aquest procés les citotoxines avisen a les<br />

cèl·lules endotelials per a que segreguin una proteïna transmembrana<br />

implicada en el reconeixement dels carbohidrats dels neutròfils, els quals<br />

quedaran ancorats a les cèl·lules endotelials i s’aniran desplaçant rodant<br />

cap al lloc de la infecció, on seran capturats per proteïnes integrines i<br />

expulsats cap al lloc infectat.


La membrana plasmàtica és troba unida al citoesquelet. El citoesquelet<br />

és ric en filaments d’actina que s’uneixen a la bicapa lípidica.<br />

5. DOMINIS DE MEMBRANA<br />

Moltes cèl·lules tenen sistemes que els permeten limitar les seves<br />

proteïnes de membrana en dominis específics de la bicapa lipídica. Es creu que<br />

la separació de proteïnes i lípids es manté per les barreres formades per un<br />

tipus d’unions intercel·lulars.<br />

Les proteïnes poden moure’s en el seu domini però no poden entrar en<br />

un altre degut a la unió cel·lular anomenada unió estreta. Així, les molècules<br />

lipídiques de la membrana apical (té proteïnes GPI) no poden anar a la<br />

membrana basal de la cèl·lula.<br />

Però, apart de les unions estretes existeixen més restriccions dels<br />

moviments de proteïnes per la membrana, degudes a:<br />

- La formació d’agregats de proteïnes, adquirint més pes i volum.<br />

- La unió de proteïnes de membrana amb components de la matriu<br />

extracel·lular<br />

- La unió de proteïnes de membrana al citoesquelet.<br />

No obstant, existeixen dos tipus de moviments demostrats de les<br />

proteïnes: la difusió lateral i la rotació, on les proteïnes giren al voltant d’un eix<br />

aproximadament perpendicular al pla de la bicapa.<br />

TEMES 8 I 9: RETICLE ENDOP<strong>LA</strong>SMÀTIC I MAQUINÀRIA BIOSINTÈTICA<br />

RETICLE RUGÓS<br />

31


Els cicles de gemmació i fusió permeten que qualsevol orgànul es<br />

comuniqui amb qualsevol altre i l’exterior cel·lular. Les fletxes blaves indiquen la<br />

direcció de sortida del tràfic de vesícules des del ER fins al complex de Golgi i<br />

la membrana plasmàtica (o lisosomes).<br />

Totes les cèl·lules eucariotes tenen un reticle endoplasmàtic, la<br />

membrana del qual constitueix normalment més de la meitat del total de la<br />

membrana de la cèl·lula. Està organitzat en forma d’una xarxa laberíntica de<br />

túbuls ramificats i de sàculs aplanats interconnectats amb el nuclis i que<br />

s’estenen per tot el citoplasma. El lumen del RE queda amb contacte amb<br />

l’espai perinuclear (espai entre la membrana nuclear externa i la interna).<br />

La membrana del reticle està constituïda bàsicament per una doble capa<br />

de fosfolípids amb proteïnes inserides. A més, hi ha petites quantitats de<br />

colesterol, esfingomielina, glicolípids i glicoproteïnes.<br />

La seva membrana del RE és el lloc de producció de totes les proteïnes<br />

transmembrana, de les proteïnes que han de ser secretades i lípids de la<br />

majoria dels orgànuls cel·lular (el mateix ER, aparell de Golgi, lisosomes,<br />

endosomes...). Totes les proteïnes són inicialment transportades al RE.<br />

Algunes de les proteïnes transmembrana produïdes al RE s’hi queden, però<br />

moltes altres estan destinades a altres orgànuls (hidrosolubles) o a la<br />

membrana plasmàtica. Totes aquestes proteïnes, independentment del seu<br />

destí, són dirigides a la membrana del ER. La cèl·lula tindrà un volum de reticle<br />

endoplasmàtic més o menys grans en funció del seu poder transcripcional (molt<br />

poder transcripcional voldrà dir molta síntesi de proteïnes, per tant, molt RE).<br />

Hi ha dos tipus de reticle endoplasmàtic: el RE llis i el RE rugós, aquest<br />

últim té enganxats a la seva membrana ribosomes.<br />

1. EL RETICLE ENDOP<strong>LA</strong>SMÀTIC LLIS. FUNCIONS.<br />

Les regions del ER que no tenen ribosomes units es denominen reticle<br />

endoplasmàtic llis. Les seves cavitats tenen una estructura més tubular i no<br />

presenten ribosomes enganxats.<br />

Dins d’aquestes cavitats i a nivell de membrana trobem enzims<br />

responsables de la síntesi dels lípids, i els enzims implicats en els processos de<br />

detoxificació de substàncies liposolubles.<br />

32


En una gran majoria de les cèl·lules, L’ER llis és escàs i només existeix<br />

una petita regió del ER que és parcialment llisa i rugosa que s’anomena reticle<br />

endoplasmàtic de transició (o elements transicionals), i representen una<br />

regió especialitzada del reticle endoplasmàtic a partir de la qual es formen les<br />

vesícules portadores de lípids i proteïnes, molècules recentment sintetitzades<br />

que van a l’aparell de Golgi.<br />

Malgrat això, hi ha cèl·lules especialitzades en que aquest tipus de<br />

reticle és molt abundant. En:<br />

- Cèl·lules musculars, on s’anomena reticle sarcoplasmàtic, i<br />

s’encarrega de segrestar Ca 2+ del citosol per afavorir la contracció<br />

muscular.<br />

- Cèl·lules de Leydig, encarregades en la síntesi d’hormones esteroïdees<br />

derivades del colesterol.<br />

- Cèl·lules hepàtiques, ja que l’RE llis conté els enzims responsables de la<br />

detoxificació de drogues, alcohols i altres compostes liposolubles.<br />

Així, doncs, les funcions del reticle endoplasmàtic llis són:<br />

- Metabolisme dels lípids: Els fosfolípids i el colesterol es sintetitzen en<br />

les membranes del reticle endoplasmàtic llis. Excepte els àcids grassos i<br />

dos tipus de fosfolípids mitocondrials, la resta de lípids produïts a la<br />

cèl·lula se sintetitzen aquí. El fosfolípid més important és la<br />

fosfatidilcolina format a partir de dos àcids grassos, un glicerol, un fosfat<br />

i una colina. Al reticle hi ha d’haver algun mecanisme que generi<br />

moviments de les molècules lipídiques, ja que aquestes han d’anar fins<br />

la cara del lumen a la cara citoplasmàtica (flip-flop de fosfolípids)<br />

perquè passi a membranes d’altres orgànuls mitjançant la vesiculació.<br />

Es creu que la responsable és una proteïna específica translocadora de<br />

fosfolípids (flipases).<br />

Formació de la fosfatidilcolina<br />

33


- Síntesi i producció de lipoproteïnes.<br />

- Emmagatzemar intracel!lularment Ca 2+<br />

- Síntesi d’hormones esteroïdees.<br />

- Funció de detoxificació: En la detoxificació, els compostos pateixen<br />

una alteració metabòlica que els fa més hidrosolubles. D’aquesta<br />

manera són més fàcilment excretables pels ronyons o per l’intestí o de<br />

ser degradats pels lisosomes. Això s’aconsegueix mitjançant la<br />

hidroxilació de compostos aromàtics i alifàtics i la conjugació d’aquests<br />

derivats hidroxilats amb àcid glucurònic, sulfat, glicina o taurina. És un<br />

procés que permet transformar substàncies insolubles en aigua i que<br />

d’acumular-se a la membrana ocasionarien greus perjudicis a la cèl·lula.<br />

Gràcies a enzims com el citocrom p450 es catalitzen aquestes reaccions<br />

de detoxificació.<br />

2. RETICLE ENDOP<strong>LA</strong>SMÀTIC RUGÓS<br />

Aquest reticle està organitzat en piles de sacs aplanat, anomenats<br />

sàculs, que pel cantó citoplasmàtic estan recoberts per ribosomes distribuïts<br />

asimètricament. Aquesta diferència en la distribució entre els dos cantons del<br />

reticle (citoplasmàtic i luminar) és imprescindible per a les funcions de<br />

biosíntesi. Com ja hem dit, la membrana d’aquest reticle és una continuació de<br />

la membrana nuclear externa que també està entapissada per ribosomes.<br />

Els ribosomes es mantenen sobre la membrana a través de les cadenes<br />

polipeptídiques en creixement, que travessen la membrana a mesura que són<br />

sintetitzades. A més, hi ha zones d’unió especials entre els ribosomes i la<br />

membrana. El punt d’unió del ribosoma es troba a la subunitat major i s’uneix a<br />

dues glicoproteïnes específiques del reticle, denominades riboforines.<br />

Trobem RE rugós a totes les cèl·lules nucleosades, excepte en els<br />

espermatozous, i és molt abundant a les cèl·lules especialitzades en la secreció<br />

de proteïnes (cèl·lules acinars pancreàtiques, cèl·lules secretores<br />

d’anticossos...).<br />

Les funcions del reticle endoplasmàtic rugós són:<br />

- Síntesi proteica. Es sintetitzen:<br />

" Totes les proteïnes de secreció que seran exportades<br />

" Totes les proteïnes de membrana, incloent-hi les seves pròpies.<br />

" Les proteïnes dels mitocondris i els cloroplasts.<br />

" Algunes proteïnes dels peroxisomes.<br />

- Funcions de transport de les substàncies recentment sintetitzades<br />

- Emmagatzemar substàncies recentment sintetitzades, que en un<br />

primer moment són emmagatzemades i, posteriorment, seran<br />

transportades.<br />

- Control de qualitat. Procés post-traduccional perquè les proteïnes<br />

surtin del reticle.<br />

34


3. <strong>LA</strong> MAQUINÀRIA BIOSINTÈTICA DEL RETICLE ENDOP<strong>LA</strong>SMÀTIC<br />

RUGÓS<br />

Per tal de què comenci la síntesi de proteïnes es necessita que l’RNAm,<br />

sintetitzat al nucli s’associï als ribosomes, començant la traducció, que pot tenir<br />

lloc:<br />

- Al citosol, en els ribosomes lliures que sintetitzen les proteïnes<br />

citosòliques. Quan la proteïna està totalment traduïda és transportada<br />

cap al seu lloc de funcionament. Aquest procés és el que s’anomena<br />

síntesi post-traduccional.<br />

- Al RE rugós, la cara citosòlica hi estan adherits els ribosomes units a la<br />

membrana. Es sintetitzen proteïnes de secreció i de membrana. Les<br />

proteïnes mateix temps que es tradueixen van entrant en el reticle.<br />

Aquest procés s’anomena síntesi contraduccional.<br />

Els ribosomes units a la membrana i els ribosomes liures són estructural<br />

i funcionalment idèntics, només es diferencien en les proteïnes que sintetitzen.<br />

Quan un ribosoma comença a fabricar una proteïna amb un pèptid senyal per<br />

la unió amb la membrana del ER, la mateixa senyal dirigeix el ribosoma a la<br />

membrana del ER. Com molts ribosomes poden unir-se a una mateixa<br />

molècula d’ARNm, es forma un poliribosoma. Si una molècula d’ARNm<br />

codifica una proteïna que no té pèptid senyal per al ER, el poliribosoma roman<br />

al citosol lliure o la proteïna producte és alliberada en el propi citosol. Així,<br />

només s’uneixen a les membranes rugoses del ER els ribosomes units a les<br />

molècules d’ARNm que codifiquen proteïnes que tenen un pèptid senyal.<br />

35


Aquest senyal pèptid no només dirigeix les proteïnes cap al reticle, sinó<br />

que depèn del tipus de senyal la proteïna serà dirigida a altres orgànuls. La<br />

hipòtesi de la senyal diu que la seqüència líder actua de pèptid senyal dirigint<br />

la proteïna de secreció fins la membrana del RE rugós. Un cop a la membrana,<br />

i abans que la cadena polipeptídica estigui completa, el pèptid és hidrolitzat per<br />

una peptidasa de senyal de la membrana de RE rugós. La sequüència senyal,<br />

que només serveix per entrar al reticle endoplasmàtic, acostuma a ser<br />

hidrofòbica.<br />

Una partícula de reconeixement de senyal SRP (Signal Recognition<br />

Particle) dirigeix el pèptid senyal per al RE a un receptor específic de la<br />

membrana del RE. El pèptid senyal és dirigit a la membrana del ER per dos<br />

components com a mínim:<br />

- Una partícula de reconeixement de la senyal (SRP) que s’uneix al<br />

pèptid senyal i al ribosoma, consumint energia GTP mentre viatja entre<br />

la membrana i el citosol.<br />

- Un receptor SRP, una proteïna integral de la membrana del reticle que<br />

es troba a la seva superfície citosòlica.<br />

A mesura que el pèptid va emergent del ribosoma, la SRP es va unint al<br />

pèptid senyal. Això provoca una pausa en la síntesi proteica per poder donar al<br />

ribosoma temps suficient per a unir-se a la membrana del ER abans que es<br />

completi la síntesi de la cadena polipeptídica assegurant així que no és<br />

alliberada al citosol. La SRP és alliberada deixant el ribosoma sobre la<br />

membrana del ER. Llavors, un aparell de translocació (o translocon, gràcies<br />

al qual la proteïna entra al lumen) de la membrana del ER format per diverses<br />

subunitats proteiques inserta la cadena polipeptídica en la membrana i la<br />

transfereix a través de la bicapa lipídica.<br />

Mecanisme cotraduccional (mentre es sintetitza)<br />

36


La proteïna també pot entrar un cop ja formada, no sempre entrarà<br />

mentre s’esta produint la seva síntesi, d’aquest mecanisme se’n diu síntesi<br />

post-traduccional.<br />

37<br />

Sec 62, 63, 71, 73 complex:<br />

ajuden a entrar a la proteïna un<br />

cop ja està formada.<br />

Sec 61 complex: el que<br />

anomenem translocador (porus)<br />

BiP: chaperona que ajuda a<br />

plegar la proteïna, requereix<br />

consum d’ATP<br />

El porus del translocador està tapat amb la cadena polípeptídica que es<br />

troba en trànsit a través de la membrana. Permet el pas d’una cadena<br />

desplegada i es tanca quan el ribosoma és eliminat de la membrana. Així, el<br />

porus sembla ser una estructura dinàmica, obrint-se pas quan un ribosoma<br />

amb una cadena polipeptídica s’uneix a la membrana i tancant-se quan el<br />

ribosoma s’allibera després que la síntesi de la proteïna hagi acabat.<br />

Per les proteïnes de secreció, la seqüencia senyal, situada en l’extrem<br />

amino terminal, té dues funcions:<br />

- Dirigir el pèptid senyal a la membrana del RE<br />

- Actuar com a senyal d’inici de transferència, romanent unint al<br />

translocon, mentre que la resta de la proteïna va travessant la<br />

membrana formant un gran bucle a la llum del RE. Una vegada l’extrem<br />

carboxil hagi travessat la membrana, hi ha un aminoàcid de la proteïna<br />

que reconeix una peptidasa, que hidrolitza el pèptid senyal i allibera la<br />

proteïna de la membrana deixant-la lliure al lumen. Després, la mateixa<br />

peptidasa s’encarrega de degradar el pèptid senyal.


En les proteïnes transmembrana d’un únic pas, un pèptid senyal intern<br />

roman en la bicapa lipídica. El procés de translocació de les proteïnes<br />

destinades a romandre en la membrana és més complex que el de les<br />

proteïnes solubles ja que algunes zones de la cadena polipeptídica són<br />

translocades a través de la bicapa lipídica mentre que les altres no ho són.<br />

Un pèptid senyal amino terminal inicia la translocació igual que per a una<br />

proteïna soluble, però un segment addicional hidrofòbic de la cadena frena el<br />

procés de la transferència abans que tota la cadena polipeptídica s’hagi<br />

translocat. Aquest pèptid de parada de transferència atura la proteïna en la<br />

membrana després que el pèptid senyal del ER s’hagi eliminat. El pèptid d’atur<br />

de transferència forma un únic segment ! helicoïdal que travessa la membrana,<br />

amb l’extrem amino terminal de la proteïna en la cara llum de la membrana i<br />

l’extrem carboxil en la cara citosòlica.<br />

Però, també hi ha proteïnes transmembrana que travessen la membrana<br />

més d’un cop. Aquestes proteïnes, proteïnes multipas, necessiten una<br />

combinació de senyals d’inici i para de transferència determinada.<br />

En les proteïnes transmembrana de multipàs, la cadena polipeptídica<br />

travessa repetidament la bicapa lipídica. Un pèptid senyal intern com a senyal<br />

d’inici de transferència inicia la translocació, la qual continua fins que es troba<br />

un pèptid d’atur de transferència. La SRP busca els segments hidrofòbics de la<br />

cadena polipeptídica desplegada començant pel seu extrem aminoterminal i va<br />

progressant fins l’extrem carboxil terminal, en la mateixa direcció en la que es<br />

sintetitza la proteïna.<br />

La SRP reconeix el primer segment apropiat i per tant fixa la pauta de<br />

lectura: si s’ha iniciat la translocació el pròxim segment hidrofòbic serà<br />

reconegut com un pèptid d’atur de transferència, cosa que originarà que la<br />

regió de la cadena polipeptídica compresa entre ambdós segments hidrofòbics<br />

quedi insertada a través de la membrana i així successivament.<br />

38


Moltes proteïnes presents en la llum del ER estan només de pas, en<br />

ruta cap a altres destins. Altres, les proteïnes residents del ER, presenten en<br />

el sEU extrem carboxil terminal una senyal de retenció del ER que és<br />

responsable que la proteïna quedi retinguda en el ER. Aquesta senyal de<br />

residència està formada per 4 aminoàcids: KDEL (lisina, àcid aspàrtic, àcid<br />

glutàmic i leucina). Algunes d’aquestes proteïnes actuen com a catalitzadors<br />

que ajuden a altres moltes proteïnes que són translocades al ER a plegar-se i<br />

ajuntar-se correctament.<br />

3.1. La majoria de proteïnes sintetitzades en el RE rugós són<br />

glucosilades<br />

L’addició covalent de sucres a les proteïnes és una<br />

de les principals funcions del ER. La majoria de<br />

proteïnes solubles i unides a la membrana que són<br />

fabricades en el llum del ER (incloent les destinades<br />

a ser transportades al Golgi, lisosomes i espai<br />

extracel·lular) són glicoproteïnes.<br />

A la foto veiem l’estructura de l’oligosacàrid unit a<br />

asparagina que és afegit a la majoria de els proteïnes<br />

en la membrana del ER rugós. Els cinc residus de<br />

sucre mostrats en el requadre gris formen la regió<br />

central d’aquest oligosacàrid. En l’aparell de Golgi es<br />

produeix una profunda reordenació i eliminació<br />

d’aquests sucres i en moltes proteïnes només<br />

sobreviuen a aquest procés aquests cinc residus.<br />

39


La glucosilació d’una proteïna en el RE es<br />

produeix gairebé immediatament després que<br />

la cadena peptídica entri en la llum del RE. La<br />

glucosilació és un pas més que ha de fer el RE<br />

com a control de qualitat. Per poder sortir en<br />

condicions i ser funcionals al seu destí final, les<br />

proteïnes han de passar un control de qualitat:<br />

han de passar unes modificacions posttraduccionals<br />

que són:<br />

- Glucosilació<br />

- Plegament terciari, gràcies a la<br />

glucosilació o a chaperones.<br />

- Formació d’enllaços di-sulfur<br />

- Proteolisi. Trencament de la seqüencia<br />

senyal i a vegades d’altres parts.<br />

- Oligamerització. Olígomer: proteïnes<br />

formades per més d’una proteïna.<br />

40<br />

En el cas de glucosilació, a la<br />

proteïna se li afegeixen sucres<br />

perquè pugui interaccionar amb la<br />

calnexina que és una chaperona<br />

que s’engarrega de plegar el<br />

polipèptid per que passi a ser una<br />

proteïna.<br />

Si, finalment, la proteïna surt del RE mal plegada, en el citosol serà<br />

desglucosilada i marcada amb ubiquitina el que indicarà que s’ha de degradar.<br />

Quan s’ubiquitinitzades les proteïnes són enviades als proteosomes que<br />

s’encarreguen de degardar-les.<br />

No obstant, existeix un sistema per controlar cúmuls de proteïnes mal<br />

plegades.<br />

- Les proteïnes mal plegades en el ER envien una senyal que estimula la<br />

producció de més chaperones del ER, activant una quinasa<br />

transmembrana.<br />

- La quinasa activada assoleix activitat ribonucleasa.


- La endoribonucleasa talla molècules de RNAm específiques en dos<br />

llocs, eliminant l’intron<br />

- Els dos exons s’uneixen formant un RNAm actiu.<br />

- El RNAm es tradueix creant una proteïna reguladora de l’expressió<br />

gènica.<br />

- La proteïna regulació d’expressió gènica entra en el nucli i activa els<br />

gens que codifiquen chaperones del ER.<br />

- Les chaperones es sintetitzen en el ER on ajuden a plegar les proteïnes.<br />

Les proteïnes, un cop sintetitzades i ben formades, poden<br />

desplaçar-se d’un compartiment a un altre mitjançant un<br />

transport regulat (vermell), el transport transmembrana<br />

(blau) o el transport vesicular (verd). Els senyals que<br />

dirigeixen el camí d’una proteïna determinada a través del<br />

sistema, determinant la seva localització definitiva en la<br />

cèl·lula, estan contingudes en la seqüència d’aminoàcids<br />

de la proteïna.<br />

El viatge comença amb la síntesi d’una proteïna<br />

sobre un ribosoma i acaba quan s’ha aconseguit el destí<br />

final. En cada una de les estacions intermitges es pren<br />

una decisió sobre si la proteïna serà retinguda en el<br />

compartiment o bé continuarà el viatge. Tot i que en<br />

principi es requereix un senyal determinat per retenir la<br />

proteïna o no retenir-la, el transport vesicular de proteïnes<br />

des del ER, a través de l’aparell de Golgi, fins la<br />

superfície cel·lular sembla no necessitar cap senyal<br />

específic. Els senyals de retenció específics es<br />

necessiten per a retenir les proteïnes en el ER i en<br />

l’aparell de Golgi.<br />

41


Des de regions especialitzades del ER, emergeixen les vesícules<br />

destinades a l’aparell de Golgi i transporten qualsevol proteïna des del ER a<br />

l’aparell de Golgi. Existeix, però, un requeriment essencial perquè una proteïna<br />

surti del ER: ha d’estar correctament plegada i formada. Les proteïnes que<br />

no tenen la forma correcta o que són incomplertes són retenides i finalment<br />

degradades. Així, la sortida des del ER pot ser considerada com un control de<br />

qualitat.<br />

Com ja hem dit, hi ha proteïnes sintentitzades pel ER que han de<br />

romandre allà (ex. KDEL). Per això, hi ha un mecanisme utilitzat per retenir les<br />

proteïnes residents en el ER. Les proteïnes residents en el ER que s’escapen<br />

cap a la xarxa del cis Golgi són retornades al ER mitjançant el transport<br />

vesicular. Un receptor de membrana en la xarxa cis Golgi capta les proteïnes i<br />

les condueix, en vesícules de transport, cap el ER. Les condicions iòniques<br />

presents en el ER separen les proteïnes del seu receptor, de manera que el<br />

receptor retorna a la xarxa del cis Golgi per a ser reutilitzat.<br />

3.2. Formació de proteïnes GPI a partir de proteïnes transmembrana<br />

Algunes proteïnes de membrana canvien la<br />

seva cua transmembra terminal carboxil per<br />

un glucosilfosfatidilinositol (GPI) unit de<br />

forma covalent. Aquesta unió es forma en la<br />

llum del ER i afegeix a la proteïna un<br />

anclatge de GPI que conté 2 àcids grassos.<br />

En el mateix procés s’elimina el segment<br />

transmembrana de les proteïnes. Un enzim<br />

del ER retalla la proteïna, lliurant-la del seu<br />

extrem carboxil terminal, que la unia a la<br />

membrana, i simultàniament la uneix el nou<br />

extrem carboxil terminal a un grup amino<br />

d’un intermediari GPI. Amb aquest anclatge<br />

lipídic al que s’uneix de forma covalent, la<br />

proteïna roman unida a la membrana.<br />

42


<strong>TEMA</strong> 10: L’APARELL DE GOLGI<br />

L’aparell de Golgi és una estructura que es<br />

troba a prop del nucli cel·lular i a prop del<br />

centrosoma als animals. Quan la cèl·lula<br />

entra en mitosi es disgrega. Està format per<br />

un conjunt de cisternes (normalment 9 o<br />

10) limitades per una membrana i de forma<br />

aplanada i està polaritzat.<br />

Cada conjunt de sis cisternes constitueix<br />

una estructura anomenada dictiosoma.<br />

El nombre de dictiosomes varia segons el tipus de cèl·lula i, si hi ha més d’un,<br />

estan interconnectats. Associades a als dictiosomes trobem petites vesícules<br />

agrupades a la cara contigua al reticle endoplasmàtic, i al llarg dels anells<br />

dilatats de cada cisterna. Són vesícules de transport de proteïnes i de lípids<br />

que van sent modificats. En una mateixa cèl·lula, hi pot haver més d’un<br />

complex de Golgi que estan interconnectats.<br />

Els dictiosomes del Golgi tenen dues cares diferents: cara cis (cara<br />

d’entrada) i cara trans (cara de sortida). Ambdues cares estan connectades a<br />

uns compartiments especials, formats per estructures tubulars i cisternes que<br />

és la cara mitja on les proteïnes maduren i prenen les conformacions que els<br />

proporcionaran les funcions. Les proteïnes i lípids entren per la cara cis en<br />

vesícules de transport que provenen del ER i surten per la cara trans en<br />

vesícules de transport amb destins diferents, exocitosis constitutiva (membrana<br />

plasmàtica), exocitosis regulada (cap a membrana plasmàtica, però necessita<br />

regulació), sistemes endosòmics (endosomes, lisosomes).<br />

L’aparell de Golgi està polaritzat. Té cinc compartiments ordenats de la següent<br />

manera i que realitzen diferents funcions:<br />

- CGN (Cis Golgi Network): s’encarrega de la fosforilació dels oligosacàrids<br />

dels enzims lisosomals, provinents del reticle. Des del Golgi, aquests enzims<br />

aniran cap al lisosoma. Un altre funció del CGN és recuperar les proteïnes<br />

KDEL que s’hagin escapat del RE. Està format per una xarxa d’estructures<br />

tubulars i de cisternes.<br />

- Cis: es dóna l’eliminació de manoses, gràcies a la manosidasa I que talla<br />

residus de manosa. Està lligada amb una porció de transició del RE i les<br />

seves membranes són semblants a les del RE, fines.<br />

43


- Intermig: hi ha una eliminació de manoses i una addició de Nacetilglucosamina<br />

(GLCNAC) gràcias a la N-ascetilglucosamina<br />

transferasa I, cosa que permet que la manosidasa II elimini dos residus<br />

més de manosa.<br />

- Trans: es produeix l’addició de galactosa. Les seves membranes<br />

s’assemblen a la membrana plasmàtica, són gruixudes.<br />

- TGN (Trans Golgi Network): s’afegeix àcid siàlic i es dóna el sorting. La<br />

classificació i distribució de les proteïnes en vesícules que les transportaran<br />

als seus destins finals: lisosomes (via endosomes tardans), superfície<br />

cel·lular (secreció constitutiva) o vesícules secretores (secreció regulada).<br />

Els dos últims destins són exocitosis on hi ha fusions de vesícules amb la<br />

membrana plasmàtica. El TGN, com el CGN, està format per una xarxa<br />

d’estructures tubulars i de cisternes.<br />

Gràcies a aquests processos i al lleuger descens de PH (acidesa) que es produeix<br />

al llarg del Golgi, la proteïna surt madura i amb la conformació necessària per<br />

realitzar les funcions que li pertoquen.<br />

1. TRANSPORT DES DEL ER A L’APARELL DE GOLGI<br />

44<br />

El transport des del ER a<br />

l’aparell de Golgi i des d’aquest a<br />

la superficie cel·lular o a<br />

qualsevol altre lloc, mitjançant<br />

vesícules. Aquestes vesícules<br />

transfereixen les proteïnes d’una<br />

membrana a l’altra o d’un llum a<br />

l’altre mitjançant cicles de<br />

gemmació i fusió.


La via que va des del ER, passant pel complex de Golgi, fins la<br />

superfície cel·lular s’anomena via per defecte ja que les proteïnes no<br />

necessiten presentar senyals per seguir-la: qualsevol proteïna que entri en el<br />

ER (i es plegui correctament) serà transportada automàticament a través de<br />

l’aparell de Golgi cap a la superfície cel·lular si no conté senyals que l’aturin en<br />

algun compartiment de la ruta.<br />

L’aparell de Golgi és un important punt de síntesi glucídica i un lloc de<br />

classificació i distribució dels productes del ER. Molts dels polisacàrids<br />

cel·lulars són sintetitzats aquí i constitueix una zona de pas dels productes del<br />

ER de manera que una gran part dels glúcids que fabrica el Golgi s’uneixen<br />

com cadenes d’oligosacàrids a les proteïnes i lípids que el ER li envia. Alguns<br />

oligosacàrids actuen com senyals que dirigeixen determinades proteïnes cap<br />

a vesícules que les enviaran a altres parts de la cèl·lula.<br />

LES PROTEÏNES RESIDENTS EN EL ER SÓN SELECTIVAMENT<br />

RECUPERADES DE <strong>LA</strong> XARXA DEL CIS GOLGI<br />

Una proteïna ha d’estar correctament formada i plegada perquè pugui<br />

sortir del ER. Les proteïnes que no tenen la conformació correcta o que estan<br />

incompletes són retingudes o bé unides a la proteïna BIP (chaperona) o formen<br />

agregats i finalment són degradades. La sortida de proteïnes és un control de<br />

qualitat.<br />

Les proteïnes ben plegades no necessiten cap senyal específic per ser<br />

transportades fora del ER (segueixen la via per defecte) però aquelles que han<br />

de quedar-se en el ER sí que necessiten un senyal. És el senyal KDEL. Aquest<br />

senyal de retenció no és un ancoratge de les proteïnes residents en el llum del<br />

ER sinó una recuperació selectiva després que hagin estat transportades en<br />

vesícules i descarregades en la xarxa cis Golgi.<br />

Un receptor de membrana específic uneix totes les proteïnes que<br />

presenten el senyal de retenció i les empaqueta en vesícules de transport<br />

especials que els torna al ER. Les condicions iòniques presents en el ER<br />

separen les proteïnes del seu receptor, de manera que el receptor torna a la<br />

xarxa del cis Golgi per ser reutilitzat.<br />

Si es donés el cas que alguna partícula o receptor s’escapés serien<br />

detectats per una altre proteïna de coberta (COP I) que forma una vesícula de<br />

retorn al RE.<br />

45


MOLTES PROTEÏNES I LÍPIDS SÓN TRANSPORTATS AUTOMÀTICAMENT<br />

DES DEL ER I AL GOLGI A <strong>LA</strong> SUPERFÍCIE CEL·LU<strong>LA</strong>R<br />

En una cèl·lula capaç de realitzar secreció regulada, abans d’abandonar la<br />

xarxa del trans Golgi s’han de separar com a mínim tres tipus de proteïnes: les<br />

destinades a lisosomes (via endosomes tardans), les destinades a ser<br />

descarregades immediatament en la superfície cel!lular i les destinades a les<br />

vesícules de secreció. Les proteïnes destinades als lisosomes són<br />

seleccionades per al seu empaquetament en vesícules de transport<br />

específiques. La majoria de les altres proteïnes són transportades directament<br />

a la superfície cel·lular mitjançant una ruta per defecte no selectiva. Si les<br />

proteïnes del llum del ER no són específicament retingudes com residents del<br />

ER o de l’aparell de Golgi o no són seleccionades per les rutes que porten a la<br />

secreció regulada o als lisosomes, seran automàticament transportades a<br />

través del Golgi fins a la superfíce cel·lular mitjançant la via secretora<br />

constitutiva.<br />

Els processos de classificació de proteïnes en la xarxa del trans Golgi:<br />

- Les proteïnes marcades amb manosa-6-fosfat són dirigides cap als<br />

lisosomes (via endosomes tardans) mitjançant vesícules de transport<br />

recobertes de clatrina.<br />

- Les proteïnes que contenen senyals que les dirigeixen cap a vesícules<br />

de secreció són concentrades en grans vesícules recobertes de clatrina,<br />

que ràpidament perden el seu recobriment transformat-se en vesícules<br />

de secreció (un procés que únicament té lloc en cèl·lules secretores<br />

especialitzades).<br />

- Les proteïnes que no presenten característiques especials són<br />

transportades cap a la superfície cel·lular per defecte a través de la ruta<br />

de secreció constitutiva.<br />

46


LES VESÍCULES DE SECRECIÓ EMERGEIXEN PER GEMMACIÓ DES DE<br />

<strong>LA</strong> XARXA DEL TRANS GOLGI<br />

Les cèl·lules que estan especialitzades en secretar alguns dels seus<br />

productes en resposta a un senyal concreta, emmagatzemen aquests<br />

productes en vesícules de secreció. Aquestes es formen per gemmació de<br />

vesícules recobertes de clatrina, a partir de la xarxa del trans Golgi i alliberen el<br />

contingut a l’exterior cel·lular. Aquestes vesícules contenen proteïnes de<br />

membrana especials que poden actuar com a receptors unint el material<br />

agregat en la xarxa del trans Golgi. Després que les vesícules de secreció<br />

immadures sorgeixen de la xarxa del trans Golgi, la seva coberta de clatrina és<br />

eliminada i el seu contingut es condensa.<br />

47


<strong>TEMA</strong> 11: EXOCITOSIS<br />

Les vesícules de transport destinades a la membrana plasmàtica<br />

abandonen el trans Golgi seguint un flux constant. Les proteïnes de membrana<br />

i els lípids d’aquestes vesícules aporten nous components a la membrana<br />

plasmàtica, mentre que les proteïnes solubles de la vesícula són secretades a<br />

l’espai extracel·lular.<br />

La fusió de les vesícules<br />

amb la membrana plasmàtica<br />

és l’exocitosi (en aquest cas<br />

és la ruta de secreció<br />

constitutiva, perquè les<br />

vesícules no necessiten cap<br />

senyal per fusionar-se amb la<br />

membrana plasmàtica).<br />

Un altre tipus d’exocitosi<br />

és la ruta de secreció<br />

regulada, en la què les<br />

proteïnes solubles i altres<br />

substàncies s’emmagatzemen<br />

primer en vesícules de secreció<br />

i es secreten més tard. Aquesta<br />

via es troba principalment en cèl·lules especialitzades en secretar ràpidament<br />

productes (per exemple: les hormones). Per tant, sabem que hi ha tres<br />

possibles vies que les proteïnes poden seguir (si no estan destinades a formar<br />

part de cap orgànul):<br />

- Via que segueixen proteïnes destinades a ser degradades (lisosomes,<br />

tema 13).<br />

- Via que destina les proteïnes a les vesícules de secreció per la secreció<br />

regulada.<br />

- Via que transporta les proteïnes i lípids automàticament a la superfície<br />

extracel·lular (per defecte).<br />

Existeix un procés, el Doking, que succeix quan les vesícules entren en<br />

contacte amb la membrana, però no arriben a fusionar-se.<br />

48


Les vesícules tindran diferents senyals de sorting segons on hagin d’anar a<br />

parar:<br />

- Clatrina: les molècules aniran a parar a la membrana plasmàtica o al<br />

lisosoma.<br />

Les cèl·lules especialitzades a secretar<br />

ràpidament productes en resposta a una<br />

senyal concentren aquests productes en<br />

vesícules de secreció (grànuls de<br />

secreció o vesícules de nucli dens), que<br />

es formen per gemmació de vesícules<br />

cobertes de clatrina i alliberen el contingut a<br />

l’exterior cel·lular en resposta a la senyal<br />

extracel·lular. El producte pot ser una<br />

molècula petita o una proteïna. Les<br />

proteïnes destinades a vesícules de<br />

secreció s’empaqueten en vesícules al trans<br />

Golgi i aquest mecanisme implica<br />

l’agregació selectiva de proteïnes de<br />

secreció. Quan les vesícules de secreció<br />

abandonen el Golgi, la coberta de clatrina és eliminada i el contingut es<br />

condensa molt a causa de l’acidificació del lumen de la vesícula, induïda<br />

per una bomba d’H+. Com que les vesícules són tan denses, la cèl·lula<br />

secretora allibera molt material per exocitosi quan és necessari.<br />

- Caveolina: les regions del TGN on hi ha caveolina fan que les proteïnes<br />

d’aquesta regió formin caveoles a la membrana plasmàtica.<br />

- COP1: és una proteïna que es troba a una determinada regió del TGN i<br />

que recobreix les vesícules que aniran cap a una regió específica del<br />

Golgi o del RE.<br />

[Moltes molècules secretades es sintetitzen com proteïnes precursores<br />

inactives, a partir de les quals s’alliberen les molècules actives per proteòlisi.<br />

Aquests polipèptids tenen, per exemple, una preseqüència que s’elimina abans<br />

de la secreció formant-se així la proteïna madura (abans era una preproteïna<br />

en la que la preseqüència és el pèptid senyal del ER que s’elimina al ER<br />

rugós). També pot ser que comencin sent sintetitzades com a poliproteïnes<br />

amb múltiples còpies de la mateixa seqüència aminoacídica.]<br />

Una vegada carregada, la vesícula<br />

secretora ha d’anar al lloc de secreció, on<br />

ha d’esperar fins que la cèl·lula rebi el<br />

senyal de secreció, Les vesícules utilitzen<br />

proteïnes motores unides a la seva<br />

superfície per a prpopulsar-se al llarg<br />

dels microtúbuls axonals.<br />

49


L’última etapa de la ruta secretora regulada és l’alliberació del producte<br />

per exocitosi. La senyal de secreció és sovint un missatger químic que s’uneix<br />

als receptors de la superfície cel·lular. L’activació d’aquests genera senyals<br />

intracel·lulars (sovint, un increment de la concentració de calci al citosol). Es<br />

dispara l’exocitosi i les vesícules de secreció s’uneixen a la membrana<br />

plasmàtica i alliberen el seu contingut a l’espai extracel·lular.<br />

L’exocitosi regulada es pot produir per tota la<br />

superfície cel·lular (fig. A i B, a dalt) si es cultiven<br />

cèl·lules secretores en un medi que contingui un<br />

estimulant soluble, però normalment (en les cèl·lules<br />

de l’organisme) no és una resposta generalitzada de<br />

tota la cèl·lula sinó que queda restringida a la regió<br />

on la cèl·lula està en contacte amb el lligand (a la<br />

dreta).<br />

Quan una vesícula secretora es fusiona amb la<br />

membrana plasmàtica, la seva membrana passa a<br />

formar-ne part. Perquè l’àrea de la membrana<br />

plasmàtica no augmenti sense control, constantment<br />

són eliminats de la superfície cel·lular components de<br />

la membrana a través d’endocitosi, en un procés<br />

igual de ràpid que l’addició d’aquests per exocitosi.<br />

Aquests components que s’eliminen de la membrana<br />

plasmàtica poden ser utilitzades de nou, per tant aquest és un procés de<br />

reciclatge de membranes.<br />

Les cèl·lules nervioses utilitzen un altre tipus de vesícules de secreció:<br />

les vesícules sinàptiques (d’uns 50 nm de diàmetre), que emmagatzemen<br />

neurotransmissors petits que s’utilitzen en les sinapsis químiques perquè dues<br />

cèl·lules es comuniquin ràpidament. Aquestes són alliberades molt ràpid quan<br />

arriba un potencial d’acció al terminal nerviós. Aquestes vesícules no es<br />

generen a partir del Golgi sinó a partir dels endosomes, en el procés de<br />

reciclatge local de la membrana plasmàtica.<br />

50


Com que la majoria de les cèl·lules dels teixits estan polaritzades (i tenen<br />

dos o més dominis de membrana als que s’hi dirigeixen les vesícules<br />

secretores), es distingeixen dos tipus de membranes: l’apical, que dóna al<br />

lumen, i la basolateral, que comprén la resta de la cèl·lula.<br />

Els seus dominis són diferents: la regió apical està composta per glucolípids i<br />

per les proteïnes de la membrana plasmàtica que estan unides a la bicapa<br />

lipídica amb GPI (glucosilfosfatidilinositol). El senyal que fa que un cèl·lula sigui<br />

apical o basal és una regió de proteïna GPI, que es troba en algunes.<br />

Les proteïnes que estan destinades a cada una de les membranes hi poden<br />

arribar de dues maneres:<br />

- Directament des del Golgi<br />

(sorting directe). Les<br />

molècules destinades a la<br />

membrana apical s’envien a<br />

la membrana apical, i les<br />

destinades a la basolateral<br />

s’envien a la basolateral. (A)<br />

- Indirectament (sorting<br />

indirecte). El Golgi envia<br />

totes les proteïnes de<br />

membrana cap al mateix<br />

domini (en el cas de la<br />

imatge les envia totes a la<br />

membrana basolateral), i<br />

des d’allà les proteïnes<br />

destinades a l’altra<br />

membrana són enviades<br />

cap allà via endosomes (en un procés que es diu transcitosi). (B)<br />

51


6. SUBSTRATS DE LES CASPASES EFECTORES<br />

Els substrats de les caspases efectores seran proteïnes clau per al<br />

funcionament de la cèl·lula:<br />

-Proteïnes de la làmina nuclear: ja que d’aquesta manera es trencarà<br />

el nucli que la càl·lula necessita per a viure.<br />

-Proteïnes del citoesquelet: ja que d’aquesta manera la càl·lula perdrà<br />

la seua forma i es podrà trencar més fàcilment.<br />

-ICAD inhibidor de la desoxiribonucleasa CAD: CAD és el que fa<br />

tallar el DNA a trossets. Les caspases eliminen ICAD i així s’activa la<br />

nucleasa que talla el DNA.<br />

286

Hooray! Your file is uploaded and ready to be published.

Saved successfully!

Ooh no, something went wrong!