1 TEMA 1: LA CÈL!LULA COM A UNITAT ESTRUCTURAL I ...
1 TEMA 1: LA CÈL!LULA COM A UNITAT ESTRUCTURAL I ...
1 TEMA 1: LA CÈL!LULA COM A UNITAT ESTRUCTURAL I ...
You also want an ePaper? Increase the reach of your titles
YUMPU automatically turns print PDFs into web optimized ePapers that Google loves.
<strong>TEMA</strong> 1: <strong>LA</strong> <strong>CÈL</strong>!LU<strong>LA</strong> <strong>COM</strong> A <strong>UNITAT</strong> <strong>ESTRUCTURAL</strong> I FUNCIONAL<br />
DELS SISTEMES VIUS<br />
Un ésser viu diem que és un organisme que reuneix tres<br />
característiques bàsiques:<br />
- És un sistema obert. Sempre hi ha intercanvi d’informació (entrada,<br />
sortida o transport) amb l’entorn. Capta energia i matèria del medi per tal<br />
de mantenir una estructura organitzada.<br />
- És un sistema d’alta complexitat molecular. Està format per un nombre<br />
elevat de molècules diferents i que a més són d’un alt pes molecular (ex.<br />
proteïnes, àcids nucleïcs...)<br />
- És un sistema amb capacitat de reproducció autònoma. Poden generar<br />
còpies idèntiques d’ells mateixos. Tot i que s’han de tenir en compte les<br />
mutacions que fan que existeixi la variabilitat entre individus.<br />
La biologia és la ciència que estudia als éssers vius.<br />
Els sistemes vius són cèl!lules o agrupacions de cèl·lules. Aquestes<br />
cèl·lules tenen unes característiques concretes:<br />
- Guarden la informació hereditària en el mateix codi químic (el DNA)<br />
- Repliquen la informació hereditària mitjançant una polimerització sobre<br />
un motlle.<br />
- Transcriuen part de la informació present en el DNA en un mateix tipus<br />
de molècula (RNA)<br />
- Utilitzen proteïnes com a catalitzadors<br />
- Tradueixen el RNA a proteïna.<br />
- Funcionen com factories bioquímiques que utilitzen els mateixos blocs<br />
moleculars bàsics.<br />
- Estan envoltades d’una membrana plasmàtica per la qual han de passar<br />
els nutrients i els residus.<br />
Hi ha dos grans grups de cèl·lules:<br />
PROCARIOTES EUCARIOTES<br />
Senzilles Complexes<br />
Unicel·lulars o colonials Unicel·lulars o pluricel·lulars<br />
Entre 0.1 – 1 µm Entre 1µm – 1mm<br />
Formes poc variades Formes variades<br />
Genoma (DNA) amb menys<br />
informació, un únic cromosoma<br />
circular sense histones que es<br />
codifica per poques proteïnes i<br />
sense separació de la resta del<br />
citoplasma.<br />
Genoma (ADN) amb més informació, ADN<br />
lineal organitzat en cromosomes que<br />
modulen el grau de condensació de la<br />
cromatina i que contenen gens fragmentats<br />
(exons i introns). Es troba envoltat per la<br />
membrana nuclear.<br />
Pocs orgànuls Nucli, cloroplast, mitocondri, etc.<br />
Sense comparimentació<br />
intracel·lular, és a dir, sense<br />
orgànuls membranosos.<br />
Compartimentació intracel·lular: tenen nucli<br />
diferenciat que emmagatzema la<br />
informació i complexos com el reticle<br />
endoplasmàtic, l’aparell de Golgi...Això els<br />
permet realitzar el transport vesicular a<br />
través dels diferents compartiments.<br />
1
Tenen microtúbuls de flagel·lina Els cilis i flàgels estan formats per<br />
microtúbuls de tubulina.<br />
Presenten citoesquelet: filaments que<br />
No fan l’endocitosi ni cap digestió<br />
intracel·lular. No existeixen els<br />
corrents citoplàsmatics.<br />
donen mobilitat i la forma a la cèl·lula.<br />
La membrana plasmàtica els permet<br />
realitzar l’endocitosi i l’exocitosi. Tenen<br />
corrents citoplasmàtics i realitzen una<br />
digestió intracel·lular.<br />
Reproducció sexual o asexual, existeix la<br />
Reproducció asexual (mitosi) per<br />
bipartició simple o per espores. mitosi i la meiosi (formació de gàmetes)<br />
Organització cel·lular: principalment Organització cel·lular: principalment<br />
unicel·lular<br />
pluricel·lular amb diferenciació de les<br />
cèl·lules (també hi ha de unicel·lulars).<br />
Bacteris, cianofícies, micoplasmes. Protistes, fongs, plantes i animals<br />
Existeix una determinada classificació dels éssers vius, que ha anat<br />
evolucionant al llarg del temps fins a la classificació d’avui en dia. Des de la<br />
primera classificació només dels organismes microscòpics en vegetals i<br />
animals fins l’actual. Al llarg dels anys han sorgit diversos problemes com quan<br />
es va descubrir que els fongs, inicialment classificats com a vegetals, no ho<br />
eren perquè no tenen cloroplasts, les seves parets són de quitina enlloc de<br />
cel·lulosa i són organismes colonials, no pluricel·lulars.<br />
2
I més actual ha estat el debat sobre la classificació dels virus que han<br />
quedat exclosos de la classificació ja que són “éssers vius” que no tenen<br />
complexitat estructural ni tampoc tenen funcions de nutrició ni de relació,<br />
només de reproducció.<br />
Així, finalment la classificació actual dels 5 regnes és la següent:<br />
3
<strong>TEMA</strong> 2: EVOLUCIÓ PREBIÒTICA<br />
Hi ha moltes teories sobre l’origen de la vida, però cap deu ser<br />
considerada com totalment certa ja que cap aporta proves definitives i totes<br />
posseeixen defectes i llacunes<br />
Fins al segle XVII hi havia una acceptació general de les teories<br />
creacionistes: els éssers vius van ser creats en un moment determinat per un<br />
ser superior, però encara es poden anar creant a partir de la matèria inanimada<br />
per la intervenció d’aquest ser superior (generació espontània). Es creia que<br />
els éssers vius venien d’altres éssers vius sense canvi morfogenètic. Un<br />
experiment clàssic que demostrava aquesta teoria.<br />
L’any 1862 el concepte de generació espontània queda totalment<br />
descartat pels experiments de Louis Pasteur. Pasteur va demostrar que en un<br />
recipient que contenia nutrients no apareixien microbis si es mantenia estéril.<br />
L’esterilitat es podia aconseguir simplement allargant la boca del recipient, de<br />
manera que els microbis de l’aire no poguessin arribar als nutrients, o també es<br />
podien eliminar els microorganismes bullint les substàncies.<br />
A partir d’aquest moment, els científics de l’època es van començar a<br />
qüestionar com devia ser el inici de la terra. Amb el descobriment d’Amèrica es<br />
va trobar una gran diversitat d’espècies i amb el posterior descobriment i estudi<br />
de fòssils es comença a parlar de història i evolució dels éssers vius.<br />
En aquell instant, s’enfronten les teories creacionistes amb les<br />
anomenades materialistes:<br />
- Creacionistes: els éssers vius van ser creats per un ser superior<br />
- Materialistes: els éssers vius apareixen a partir de la síntesi abiòtica de<br />
molècules orgàniques a partir de molècules inorgàniques existents a la<br />
terra primitiva.<br />
La comunitat científica es decanta per les teories materialistes.<br />
1. TEORIA D’OPARIN<br />
L’any 1922 el científic rus A.I.Oparin va postular que la vida havia<br />
aparegut com a conseqüència d’un procés d’evolució química, l’anomenada<br />
evolució prebiòtica (de matèria inorgànica a matèria orgànica).<br />
Postulava que la radiació ultraviolada del Sol o les descàrregues<br />
lluminoses que es produïen a la Terra primitiva provocaren que les molècules<br />
de l’atmosfera reductora existent reaccionessin per a formar compostos<br />
orgànics senzills, tals com els aminoàcids, les bases nitrogenades i els sucres.<br />
Oparin va realitzar un experiment que corroborà aquesta teoria i que va<br />
permetre demostrar com es varen poder sintetitzar les primeres substàncies<br />
orgàniques a partir de substàncies inorgàniques.<br />
4
2. SÍNTESI ABIÒTICA DE <strong>COM</strong>POSTOS ORGÀNICS A <strong>LA</strong> TERRA<br />
PRIMITIVA. ORIGEN DE <strong>LA</strong> PRIMERA <strong>CÈL</strong>!LU<strong>LA</strong><br />
DATA ESDEVENIMENT<br />
20.000 ma S’origina l’Univers.<br />
15.000 ma Big Bang<br />
4.500 ma Formació de la Terra<br />
4.300 ma Aparició de l’atmosfera primitiva<br />
3.800 ma Va aparèixer la primera cèl·lula, els primers microfòssils<br />
(procariotes molt senzills) trobats a la Terra.<br />
1.900 ma Primera cèl·lula eucariota<br />
700-600 ma Primers vertebrats<br />
570 ma Període càmbric (període actiu en la proliferació d’espècies)<br />
4,5 ma Primer homínid.<br />
Fa 4.500 milions d’anys es formà la Terra a partir de la condensació de<br />
núvols de gasos estel·lars. Entre els 4.000 i els 3.800 milions d’anys. La Terra<br />
s’ha refredat i és una massa coberta d’aigua i envoltada d’una atmosfera que<br />
probablement contenia:<br />
CH4, H2, N2, SH2, NH3, CO2 i vapor d’H2O (no hi ha oxigen lliure)<br />
Per a la evolució química de la vida a la Terra primitiva es necessitaven<br />
quatre requeriments:<br />
- Absència total d’oxigen lliure, ja que al ser molt reactiu hagués oxidat<br />
les molècules orgàniques que són essencials per a la vida.<br />
- Una font d’energia, la Terra primitiva era un lloc caracteritzat per la<br />
presència de vulcanisme generalitzat, tempestes elèctriques,<br />
bombardeig de meteorits i intensa radiació, especialment ultraviolada<br />
(degut a la manca de capa d’ozó).<br />
- Substàncies químiques, que funcionessin com “blocs de construcció<br />
químics”: aigua, minerals inorgànics i gasos (els anomenats<br />
anteriorment, CH4, H2, N2, SH2, NH3, CO2 i vapor d’H2O)<br />
- Temps: l’edat de la Terra es calcula en 4.500 milions d’anys i els<br />
vestigis de vida més antics daten de 3.800 milions d’anys de manera que<br />
la “vida” va trigar uns 700 milions d’anys en formar-se.<br />
Fins a finals del segle XVIII es pensava que els compostos orgànics<br />
només podien formar-se per l’acció dels éssers vius, la síntesi en el laboratori<br />
de la urea (un compost orgànic), va acabar amb aquesta creença.<br />
En 1952, Stanley Miller i Urey (també el va realitzar Joan Oró) van<br />
dissenyar un experiment destinat a corroborar la hipòtesi d’Oparin, que<br />
considerava com condicions de partida la presència en l’atmosfera primitiva<br />
dels següents gasos: H2, N2, CO2, H2O, NH3, CH4.<br />
5
Miller va fer passar descàrregues<br />
elèctriques a través de la barreja de<br />
gasos que simularia la atmosfera<br />
primordial. En un recipient d’aigua<br />
que representava l’oceà primitiu,<br />
Miller va recupera aminoàcids.<br />
Posteriors modificacions a<br />
l’atmosfera produïren precursors de<br />
les 4 classes de macromolècules<br />
orgàniques (aminoàcids, sucres,<br />
lípids i àcids nucleics).<br />
Varen demostrar, doncs, amb aquest<br />
experiment que les descàrregues<br />
elèctriques sobre una mescla de<br />
gasos com la que devia ésser a<br />
l’atmosfera primitiva originava<br />
molècules com àcid nítric,<br />
formaldehid, àcid acètic, glicina, àcid<br />
làctic, alanina urea, àcid<br />
aspàrtic...indispensables per a<br />
qualsevol organisme viu.<br />
Les molècules obtingudes en els primers experiments de Miller són:<br />
6
El pas següent va ser la formació de macromolècules per polimerització<br />
de les petites, la polimerització. La interacció entre les molècules així<br />
generades es va incrementar a mesura que la seva concentració augmentava.<br />
Aquesta acumulació seria el que actualment anomenem “sopa d cultiu<br />
primitiu”. A partir d’aquesta sopa podria haver sorgit la primera forma de vida,<br />
ja que la polimerització va donar lloc a molècules més complexes com<br />
polipèptids (proteïnes) o polinucleòtids (RNA) essencials per a l’aparició de la<br />
primera cèl·lula. El polinucleòtids actuen com a patrons de polimerització,<br />
aquest fet és possible gràcies a que es produeix un enllaç preferencial entre<br />
parells de nucleòtids, mitjançant enllaços relativament febles. Malgrat tot, calien<br />
catalitzadors per a que tinguessin lloc aquestes polimeritzacions. S’han trobat<br />
diversos elements i minerals que hi havia que podien haver realitzar aquesta<br />
funció, per exemple, ions, minerals, el mateix RNA i, fins i tot, argila.<br />
No obstant, per tal de poder construir una cèl·lula o sistema biològic,<br />
aquest ha de tenir les següents propietats:<br />
- Un material de partida informatiu capaç d’autoreplicar-se que permeti ser<br />
construït i transmetre la informació a la generació següent<br />
- Un cert nivell de metabolisme que permeti captar matèria i energia del<br />
medi per al seu manteniment i per a la transmissió de la vida.<br />
- Possibilitat de mutacions o canvis que permeti al sistema progressar cap<br />
a la complexitat.<br />
A les cèl·lules vives actuals la informació genètica s’emmagatzema en el<br />
DNA, el qual transcriu el missatge al RNA finalment pot traduir aquesta<br />
informació en proteïnes que actualment són les encarregades de la gran<br />
majoria de les funcions cel·lulars.<br />
En canvi, les primeres cèl·lules no tenien DNA com a magatzem de la<br />
informació genètica, sinó que tenien RNA. El RNA era capaç d’emmagatzemar<br />
la informació genètica i catalitzar les reaccions químiques en les cèl·lules<br />
primitives. D’aquesta etapa d’autoreplicació molecular, s’anomena el món<br />
del RNA. Posteriorment, el DNA es va convertir en el material genètic i les<br />
proteïnes en els principals components catalítics i estructurals de les cèl·lules.<br />
Com es produïa aquesta autoreplicació del RNA?<br />
El mateix RNA pot actuar com a catalitzador (Ribozima).<br />
S’han identificat ribozimes amb acitivitats catalítiques molt diferents, inclosa la<br />
polimerització del RNA.<br />
Els RNAs tenien, doncs, capacitat informativa i capacitat catalítica. Dels RNAs<br />
amb activitat replicativa, s’haurien anat seleccionant aquells més estables<br />
(l’estabilitat depèn de l’estructura tridimensional del RNA).<br />
7
A la primera i segona imatge veiem el procés de replicació del RNA catalitzat per les<br />
ribozimes. Mentre que el esquema de la dreta representa com aglunes ribozimes<br />
podien catalitzar no només la replicació d’altres RNAs, sinó també la seva pròpia.<br />
El pas de món de RNA a DNA va<br />
seguir diferents passos. Les cèl·lules<br />
més primitives amb pre-RNA, que<br />
combinaven funcions genètiques,<br />
catalítiques i estructurals van ser<br />
reemplaçades gradualment pel RNA,<br />
que van evolucionar per poder dur a<br />
terme la síntesi de proteïnes. La<br />
aparició de molècules de DNA i<br />
l’evolució posterior d’algunes proteïnes<br />
(enzims) que podien replicar el DNA i<br />
fer copies de RNA a partir d’ell van<br />
reemplaçar definitivament el RNA per<br />
DNA. El DNA és més estable que el<br />
RNA i va resultar essencial quan les<br />
cèl·lules varen ser més complexes i<br />
necessitaven més informació.<br />
Però perquè tots aquests processos<br />
(autoreplicació, etc.) es produeixin<br />
necessitaven una alta concentració de RNA.<br />
Això es va aconseguir quan es van formar<br />
bicapes lipídiques quan els lípids entraven en<br />
contacte amb l’aigua. La primera cèl·lula,<br />
doncs, apareix quan una bicapa (miscel·la) és<br />
capaç d’incorporar en el seu interior molècules<br />
de RNA<br />
8
Ànnex: TEORIES EVOLUCIONISTES<br />
A partir de la refutació de la teoria de la generació espontània i del<br />
descobriment dels fòssils, es va començar a parla per primera vegada de la<br />
història i l’evolució del éssers vius. Les primeres teories evolucionistes<br />
intentaven demostrar que els éssers vius havien anat evolucionant amb el<br />
temps.<br />
Lammark, al 1801, va ser el primer en enuncià una teoria sobre<br />
l’evolució anomenada: teoria de l’evolució, o també coneguda com a teoria<br />
de l’herència dels caràcters adquirits que postulava que totes les espècies<br />
provenen d’altres menys desenvolupades; totes tenen un ancestre comú. Les<br />
idees bàsiques de la seva teoria eren:<br />
- La funció crea a l’òrgan, és a dir, l’adaptació es fa per necessitat<br />
(actualment s’està totalment en contra d’aquest punt).<br />
- Els òrgans o caràcters adquirits durant la vida s’hereten. Postulava que<br />
s’heretaven aquelles estructures que eren útils per a l’espècie, ja que<br />
duien a terme una funció important (també considerada com a falsa ja<br />
que els caràcters adquirits durant la vida no es poden heretar).<br />
Entre 20 i 30 anys després, Darwin va desenvolupar els seus estudis.<br />
Va estar 5 anys viatjant i estudiant les petites diferències entre espècies.<br />
Finalment, va realitzar una altra teoria, més completa, que es basava també en<br />
què les espècies ancestral, però que es recolzava en tres punts bàsics.<br />
- L’existència de variabilitat és el motor de l’evolució.<br />
- Les diferències entre els individus d’una mateixa espècie són degudes a<br />
mutacions, produïdes a l’atzar.<br />
- L’entorn s’encarrega de seleccionar als individus millor dotats: selecció<br />
natural.<br />
9
<strong>TEMA</strong> 3: EVOLUCIÓ CEL!LU<strong>LA</strong>R<br />
Les primeres cèl·lules es daten, segons el registre fòssil, fa 3.800 milions<br />
d’anys. Aquestes cèl·lules eren procariotes (no tenien nucli diferenciat),<br />
heteròtrofes (s’alimentaven de la sopa primitiva) i anaeròbies (no hi ha oxigen<br />
lliure, per tant, tenien un metabolisme poc eficient).<br />
Aquesta cèl·lula tenia un cicle cel·lular molt curt, que li permetia una<br />
reproducció constant i molt ràpida (per bipartició). Al anar-se’n reproduint tant<br />
ràpidament, es va anar incrementant en nombre considerablement, produint<br />
així una crisi d’aliments, ja que s’esgotava la matèria orgànica (crisi dels<br />
aliments).<br />
Degut a aquesta situació extrema i l’acumulació de mutacions en el<br />
material genètic es van seleccionar cèl·lules capaces d’obtenir energia de la<br />
llum solar i d’utilitzar el poc diòxid de carboni atmosfèric per a realitzar un<br />
procés fotosintètic. Apareix, per tant, la FOTOSÍNTESI. Les cèl·lules<br />
fotosintetitzadores podien convertir l’aigua i el diòxid de carboni en compostos<br />
orgànics i alliberaven oxigen a l’atmosfera.<br />
Simultàniament, també es seleccionaren cèl·lules amb capacitat de<br />
fagocitar i que, per tant, s’alimentaven d’altres cèl·lules. Gràcies a la fagocitosi<br />
es van anar incorporant uns organismes dins d’uns altres establint relacions de<br />
simbiosi.<br />
Tal com apareix a l’esquema, l’aparició de cèl·lules fotosintetitzadores<br />
que alliberaven oxigen al medi va provocar una segona crisi, la crisi aeròbica.<br />
Fa uns 2.000 milions d’anys, les cèl·lules fotosintetitzadores havien produït<br />
suficient oxigen per a modificar l’atmosfera terrestre substancialment.<br />
Molt pocs organismes eren capaços d’aprofitar l’oxigen alliberat al medi<br />
i, de fet, per la gran majoria aquest oxigen resultava tòxic. Aquests anaeròbics<br />
obligats varen desaparèixer o van quedar restringits a àrees sense contacte<br />
amb l’oxigen. No obstant, els pocs que podien aprofitar-lo van evolucionar<br />
desenvolupant una via respiratòria que utilitzava l’O2 per obtenir més energia<br />
dels aliments i transformar-la en ATP. La respiració aeròbia s’incorpora, així, al<br />
procés anaerobi ja existent de la glucòlisi.<br />
10
A més a més, gràcies a aquest oxigen alliberat es va formar la capa<br />
d’ozó (O3) que envolta la Terra impedint l’arribada de les radiacions<br />
ultraviolades a la Terra.<br />
L’ORIGEN DE LES <strong>CÈL</strong>!LULES EUCARIOTES.<br />
Per tal d’evolucionar de cèl·lules procariotes a cèl·lules eucariotes, les cèl·lules<br />
han hagut d’adquirir al menys dos propietats bàsiques.<br />
- Estructures especialitzades en la respiració (mitocondri). A més els<br />
autotròfics requerien sistemes fotosintetitzadors (cloroplasts).<br />
- Un sistema intracel·lular de membranes (generarien nucli cel·lular)<br />
1.1. L’origen del nucli<br />
Les cèl·lules fagocitaries tenien una membrana molt flexible, fet que va<br />
afavorir al desenvolupament d’un sistema intracel·lular de membranes que<br />
finalment va donar lloc als orgànuls típics de les cèl·lules eucariotes, entre ells<br />
el nucli (coberta nuclear té dos membranes).<br />
11
1.2. L’origen dels mitocondris i els cloroplasts<br />
L’origen dels mitocondris i cloroplasts es data entre 1.500 i 700 milions<br />
d’anys. L’any 1980 Lynn Margulis va proposar la teoria de la endosimbiosi<br />
(teoria endosimbiòtica) per tal d’explicar l’origen dels mitocondris i dels<br />
cloroplasts. D’acord amb aquesta idea, un procariota fagocitari va envoltar un<br />
procariota aerobi (considerat el mitocondri) o a un procariota fotosintetitzador<br />
(considerat el cloroplast).<br />
Això explica perquè tant els mitocondris com els cloroplasts tenen dos<br />
membranes i DNA propi.<br />
Podem dir que els mitocondris eren originàriament bacteris aeròbics.<br />
Tenen una mida i una forma semblant i tenen DNA circular sense associar-se a<br />
histones, sintetitzen proteïnes, es reprodueixen per bipartició, tenen ribosomes<br />
de 70s i posseeixen a la seva membrana enzims per a realitzar la respiració,<br />
sent els responsables de la respiració cel·lular.<br />
Pel que fa als cloroplasts, eren originàriament cianobacteris, ja que<br />
capten la llum solar en la clorofil·la, unida a les membranes, tenen una mida i<br />
una forma semblant, es reprodueixen per bipartició i tenen un DNA amb una<br />
seqüència de nucleòtids pràcticament idèntica a la de fragments del<br />
cromosoma bacterià.<br />
12
Així, la simbiosi entre espècies va donar lloc a nous organismes:<br />
EVOLUCIÓ DELS UNICEL!LU<strong>LA</strong>RS ALS PLURICEL!LU<strong>LA</strong>RS<br />
Requisits bàsics per a l’evolució:<br />
- Un medi intern que aporti nutrients a totes les cèl·lules i un sistema de<br />
transport per a aquest medi. (Això ocasiona la sortida de la vida de<br />
l’aigua per trobar aliment)<br />
- Una especialització funcional de les cèl·lules del organisme<br />
(diferenciació cel·lular: totes les cèl·lules tenen la mateixa informació<br />
genètica, però cadascuna expressa una informació concreta).<br />
13
Evolució d’organismes unicel·lulars a organismes pluricel·lulars.<br />
Totes les cèl·lules precursores són protistes que formen un grup molt heterogeni<br />
Així, després del pas de unicel·lulars a pluricel·lulars la distribució dels<br />
organismes va quedar tal i com la coneixem avui en dia.<br />
14
<strong>TEMA</strong> 4: MÈTODES PER A L’ESTUDI DE LES <strong>CÈL</strong>!LULES<br />
1. TÈCNIQUES MICROSCÒPIQUES<br />
La cèl·lula no té color i, per tant, no té contrast. Sota el microscopi no es<br />
veu res. Per poder estudiar a fons la cèl·lula hem de processar-la mitjançant<br />
diferents tècniques.<br />
Hem de saber quines són les mides que volem estudiar i escolir la millor.<br />
Per això, ens cal saber el límit de resolució que es calcula de la següent<br />
manera:<br />
LR = (0,61*") / (n*pen#) = (0,61*") / AN<br />
n = índex de refracció = 1-1,4. Indica el material que hi ha entre l’objectiu i<br />
l’objecte (aire, aigua, oli...)<br />
pen! = el dóna el fabricant (mesura entre l’objectiu i l’objecte)<br />
AN= apertura numérica<br />
" = longitud d’ona de la llum emprada. (és aprox. 500nm)<br />
El límit de resolució d’un microscopi òptic és de 0,2µm = 200nm. Dos punts<br />
situats més a prop de 200nm, no els podriem distingir com dues estructures<br />
separades.<br />
Per augmentar la " podem canviar el tipus de llum. Això fa augmentar la<br />
resolució. La llum ultraviolada (UV) té una " de 260nm. En aquest cas, el límit<br />
de resolució d’un microscopi òptic és de 0,25µm = 250nm.<br />
La " en el microscopi electrònia és extremadament més baixa. Fa servir<br />
electrons accelerats a 100.000V ! "= 0.004nm.<br />
15
El límit de resolució d’un microscopi electrònic amb els electrons accelerats a<br />
100.000V és d’entre 0,1 i 0,2 nm. Podem veure molècules o àtoms. Tamé<br />
podem veure detalls de la cèl·lula (mitocondris, etc.)<br />
Un altre concepte relacionat és el contrast. Hem de preparar adequadament<br />
les mostres per poder-les visualitzar a través del microscopi.<br />
1.1. Preparació de mostres<br />
Té quatre punts molt importants:<br />
- Fixació: aturar de cop els processos metabòlics i bioquímics de la<br />
cèl·lula. Hem de garantir, però, que la cèl·lula morta sigui el més<br />
semblant possible a la viva. Pot ser:<br />
" Fixació química: mitjançant fixadors (formol, alcohol...). Moltes<br />
vegades aquest procés és massa llarg i no ens interessa<br />
" Fixació física: Congelació amb nitrogen o heli. És immediat<br />
- Inclusió del teixit fixat (en fixacions químiques). Quan congelem el<br />
teixit està dur i el podem tallar, però si hem fet una fixació química cal<br />
que l’endurim per tallar-lo. S’inclou el teixit en un altre material (plàstic,<br />
parafina...). El material impregna el teixit i el podem tallar.<br />
- Tallar seccions. Per al microscopi òptic els talls han de ser d’entre 6-<br />
10µm. Amb aquest gruix la llum pot traspassar la mostra. Els talls es fan<br />
amb el micròtom. Per al microscòpi electrònic els talls han de ser<br />
ultrafins perquè els electrons tenen un poder de traspàs molt baix. Talls<br />
entre 50-100µm.<br />
Actualment, els microscopis òptics porten càmeres digitals i pots capturar la<br />
imatge.<br />
Fa 10-15 anys van aparèixer una sèrie de tècniques que empraven filtres o<br />
llum UV i que van revolucionar l’ús dels mircroscopi. Aquestes tècniqeues<br />
milloraven la visió i són principalment:<br />
- Microscòpia de contrast de fase: És el que dóna millor informació<br />
sobre les cèl·lules vives. Permeten obtenir un contrast més elevat. Hi ha<br />
una sèrie de filtras que fan que la llum incideixi sobre un altre angle i no<br />
directament sobre la mostra<br />
- Filtres diferencials<br />
- Tècniques de camp fos<br />
1.1.1. Microscòpia confocal i de fluorescència<br />
S’ha emprat des dels anys 80-85. Ha permès obtenir informació que mai<br />
no es podria haver captat per mètodes tradcionals. Podem analitzar estructures<br />
i veure com estan composades a la cèl·lula.<br />
16
Aquestes molècules fluorescents estan associades als anticossos i als<br />
antígens. Un anticòs només concorda amb un antígen. Podem veure el que<br />
marquen anticossos i antígens.<br />
La microscòpia confocal mostra imatges molt nítides perquè enfoquem<br />
un pla.<br />
Utilitzarem llum UV per estudiar molècules fluorescents de la cèl·lula. Si<br />
això li sumem la tècnica confocal tenim imatge més nítides.<br />
Idea bàsica de la microscòpia confocal i de fluorescència.<br />
Excitar una molècula fluorescent dins la cèl·lula amb llum Uv. Si hi ha<br />
cèl·lules que tenen estructures fluorescents dins de la seva estructura les<br />
podem excitar amb llum UV. Si la cèl·lula no té molècules fluorescents n’hem<br />
d’induir. Un dels sistemes és induir anticossos. Els marquem fluorescentment i<br />
els introduïm a la cèl·lula. Ex. anticossos d’antiactina! marcaran les molècules<br />
d’actina.<br />
Problema de la microscòpia de fluorescència.<br />
Hi ha soroll de fons que embruta la imatge (distorsió). El pla focal és pla<br />
hi ha moltes molècules fluorescents a diferents nivell que no les sabríem<br />
col·locar. Això provocar distorsió.<br />
Si enlloc de fer servir llum UV fem servir un làser, el pla focal és d’un<br />
punt. Així, desapareix el soroll. Això és una tècnica confocal. El problema del<br />
pla confocal és que perdem informació de l’estructura que estem observant.<br />
Els microscopis confocals, però, incorporen sistemes d’escaneig que capten<br />
diferents imatges de l’estructura de la cèl·lula per no perdre informació. Totes<br />
les imatges que escaneja el microscopi les reconstrueix i ens mostra tota la<br />
imatge de la cèl·lula.<br />
1.1.2. Microscòpia electrònica<br />
Hi ha dos tipus:<br />
- Microscòpia electrònica de transmissió (TEM):<br />
La llum travessa la mostra. Hi h electrons en un camp elèctri i les lents<br />
són camps electromagnètics. La imatge final serà el resultat d’una sèrie<br />
de contrastos. També podem digitalitzar la imatge.<br />
En el microscopi electrònic de transmissió els talls de la mostra han de<br />
ser molt petits perquè els electrons pugui traspassar.<br />
Ens trobem amb el mateix problema que amb la microscòpia confocal.<br />
Per solucionar el problema podem fer talls seriats i reconstruir la imatge.<br />
Això és complicat tècnicament. Una altra solució per estructures<br />
senzilles (ex Mitocondris) és fa servir el TEM d’alt voltatge (TEM normal:<br />
100.000V / TEM alt voltatge: 1.000.000V). Amb això aconseguim que<br />
augmenti el nivell de penetració. Només hi ha dos TEM d’alt voltatge.<br />
La microscòpia de transmissió és en B/N i requereix treballar amb els<br />
50/100nm.<br />
17
- Microscòpia electrònica de rastreig (SEM): la trajectòria de la llum és<br />
diferent. Hi ha un filament d’electrons que passen a través d’una lent<br />
electromagnètica. Els electrons no travessen la mostra, sinó que reboten<br />
i van a parar a una pantalla que reprodueix la imatge. Perquè això<br />
funcioni, cal que pintem la superfície de la mostra amb sals de metalls<br />
pesats.<br />
Ens dóna una imatge només de la superfície de la mostra (ex. una<br />
cèl·lula sencera, un teixit, un insecte). La resolució és més baixa que el<br />
TEM.<br />
TEM = 0,1 nm<br />
SEM= 10nm<br />
MO=200nm<br />
Ens mostra imatges que ens ajuden a entendre la morfologia a nivell de<br />
les cèl·lules d’un teixit.<br />
1.1.3. Criofactura.<br />
Tècnica emprada en la visualització de mostres biològiques mitjançant el<br />
microscopi electrònic, especialment en estudis de la membrana cel·lular,<br />
consistent a congelar l’espècimen amb nitrogen líquid i fracturar-lo amb un<br />
micròtom<br />
1.2. Tècniques de fraccionament i cultius cel!lulars<br />
A pràctiques.<br />
Temes 7 i 9<br />
1.3. Tècniques de localització i quantificació de molècules<br />
A pràctiques.<br />
18
<strong>TEMA</strong> 5: PROTEÒMICA<br />
Hem passat de l’època del genoma a l’època post-genòmica: època<br />
proteòmica ! l’expressió dels gens. Per entendre les funcions dels gens hem<br />
d’entendre els seus productes.<br />
Fins ara es creia:<br />
GEN (DNA) ! RNA ! proteïnes<br />
Ara se sap que un GEN té més d’un RNA que pot donar lloc a<br />
estructures diferents.<br />
Ens interessa doncs, saber què fan les proteïnes. Quan falla quelcom al<br />
cos hem de saber quina molècula ha fallat i, per tant, necessitem saber quines<br />
funcions desenvolupen les proteïnes.<br />
A una proteïna no se li pot assignar una sola funció, sinó que la<br />
funció d’una proteïna depèn del lloc i del temps on estigui.<br />
La proteïna està dins d’un compartiment i al llarg del temps va passant<br />
d’un compartiment a un altre. A cada compartiment interacciona amb altres<br />
molècules i aquestes interaccions determinen les seves funcions. Això fa que<br />
una proteïna tingui diferents funcions (poden no ser molt diferents,però ho són).<br />
Proteoma: conjunt de proteïnes d’una espècie.<br />
Hi ha diferents tècniques per estudiar el proteoma:<br />
- Electroforesi bidimensional. Separar les proteïnes segons el seu pes<br />
molecular (en un pes elèctric). A la llarga les proteïnes es van barrejant<br />
19
Pot passar que més d’una proteïna tingui el mateix pes molecular, per<br />
tant, aquest sistema no serveix. Ens cal un segon criteri que ens permeti<br />
spearar totalment les proteïens<br />
Criteri 1: separa les proteïnes pel seu punt isoelèctric (característica<br />
única de cada proteïna que està relacionat amb la càrrega elèctica. La<br />
càrrega depèn dels aminoàcids que són diferents per cada proteïna).<br />
Criteri 2: el pes molecular.<br />
- Espectromètria de masses. Retallem cada proteïna en condicions<br />
estèrils (perquè no es contamini la mostra). L’espectòmetre ens donarà<br />
la seva massa i ens seqüènciara la proteïna o part de la proteïna<br />
(desxifra els aminoàcids). Els espectòmetres estan connectats a una<br />
base de dades online que et permet veure si aquella proteïna està<br />
identificada o no.<br />
20
<strong>TEMA</strong> 6: <strong>COM</strong>PARTIMENTALITZACIÓ<br />
La cèl·lula eucariota està subdividida en compartiments envoltats per una<br />
membrana i que mantenen la seva pròpia estructura i funció. Cada<br />
compartiment o orgànul té:<br />
- Enzims propis.<br />
- Molècules especialitzades.<br />
- Sistema de distribució que transporta els compostos d’un orgànul a<br />
l’altre.<br />
Les proteïnes tenen un paper molt important a la compartimentalització, ja que:<br />
- Catalitzen les reaccions de cada orgànul<br />
- Són marcadors específics en la superfície que marquen el destí de<br />
proteïnes i lípids a l’orgànul adequat.<br />
- Són sintetitzades al citosol i són transportades allà on són necessitades.<br />
- S’encarreguen del transport selectiu de dins i fora del compartiment. La<br />
bicapa lipídica dels orgànuls de membrana és impermeable a la majoria<br />
de les molècules hidrofíliques; així, cada membrana ha de tenir<br />
proteïnes transportadores que s’encarreguin de l’entrada i sortida de<br />
metabòlits.<br />
1. <strong>COM</strong>PARTIMENTS MÉS IMPORTANTS <strong>COM</strong>UNS A TOTES LES<br />
<strong>CÈL</strong>!LULES EUCARIOTES<br />
- Nucli: conté el genoma principal i es produeix la síntesi d’ADN i ARN.<br />
- Citoplasma: format pel citosol i els orgànuls suspesos en ell.<br />
- Citosol: es produeix la síntesi de proteïnes i és on es desenvolupen la<br />
majoria de reaccions del metabolisme cel·lular (síntesi i degradació de<br />
molècules).<br />
- Reticle endoplasmàtic (ER) (llis i rugós): (fàbrica de la cèl·lula)<br />
presenta molts ribosomes units a la seva superfície citoplasmàtica, els<br />
quals sintetitzen proteïnes integrals de membrana i proteïnes solubles<br />
destinades a ser segregades o a ser transportades a altres orgànuls.<br />
Produeix també lípids i emmagatzema Ca 2+ .<br />
21
- Aparell de Golgi: conjunt de compartiments organitzats en forma de<br />
sacs discoïdals (forma de disc) anomenats cisternes de Golgi. Rep<br />
proteïnes i lípids del RE i les distribueix cap a diferents destins<br />
intracel·lulars, generalment modificant-les (maduren aquí) també.<br />
- Mitocondris: respiració cel·lular i generació d’ATP.<br />
- Lisosomes: tenen enzims digestius que degraden orgànuls morts i<br />
molècules captades per endocitosi.<br />
- Endosomes: compartiments per on passen les partícules endocitades<br />
abans d’entrar als lisosomes.<br />
- Peroxisomes: petits compartiments vesicualrs que contenen enzims de<br />
diverses reaccions.<br />
En la majoria de les cèl·lules,<br />
l’aparell de Golgi és pròxim al nucli<br />
mentre que el ER s’exten a partir<br />
del nucli per tot el citosol. L’interior<br />
dels orgànuls es comuniquen entre<br />
si i amb l’exterior de la cèl·lula<br />
mitjançant la via de vesícules de<br />
transport que apareixen per<br />
gemmació d’un orgànul i es<br />
fusionen amb un altre.<br />
Els orgànuls limitats per membrana no estan distribuïts a l’atzar, sinó que<br />
adopten unes posicions estratègiques i específiques.<br />
Quan la cèl·lula es reprodueix per divisió, ha de duplicar els seus<br />
compartiments intracel·lulars. Generalment, les cèl·lules duen a terme aquest<br />
procediment augmentant la mida dels seus orgànuls ja existents i incorporant<br />
noves molècules en ells; els orgànuls ja augmentats es divideixen i es<br />
distribueixen entre les dues cèl·lules filles. Cada cèl·lula filla hereta de la cèl·lula<br />
mare un joc complet de membranes cel·lulars. Aquesta herència és essencial<br />
perquè la cèl·lula no pot formar les membranes de nou.<br />
2. LES PROTEÏNES PODEN DESP<strong>LA</strong>ÇAR-SE ENTRE<br />
<strong>COM</strong>PARTIMENTS DE DIVERSES MANERES<br />
Totes les proteïnes comencen a ser<br />
sintetitzades als ribosomes en el citosol. El<br />
seu destí següent depèn de la seva<br />
seqüència d’aminoàcids, que pot presentar<br />
senyals de classificació que proporcionen<br />
diferents destins específics per a les<br />
proteïnes, fora del citosol. Moltes proteïnes<br />
no tenen aquests senyals, així que han de<br />
restar al citosol. Altres tenen senyals de<br />
“sorting” que les dirigeixen en el seu<br />
repartiment al nucli, al RE, al mitocondri, als<br />
cloroplasts o als peroxisomes.<br />
22
Hi ha 3 sistemes fonamentals diferents mitjançant els quals les proteïnes es<br />
desplacen des d’un compartiment a l’altre.<br />
1) Transport regulat o de comporta (gated transport): es dóna entre el<br />
citolsol i el nucli a través dels porus nuclears que funcionen com a<br />
comportes selectives que permeten activar el transport específic de<br />
macromolècules, encara que també està permesa la difusió de petites<br />
molècules.<br />
2) Transport transmembrana: Les proteïnes que estan al citosol per<br />
entrar als compartiments hauran de traspassar les seves membranes,<br />
per això necessiten mecanismes específics (translocadors proteïcs units<br />
a la membrana) que dirigeixen el transport específic de proteïnes.<br />
3) Transport vesicular: les vesícules de<br />
transport carreguen proteïnes des d’un<br />
compartiment a l’altre. A mesura que la<br />
membrana d’un compartiment produeix<br />
vesícules per gemmació, aquestes<br />
vesícules capten molècules del lumen del<br />
compartiment. Després del transport i la<br />
fusió amb la membrana de l’altre<br />
compartiment, aquestes vesícules<br />
descarreguen el seu carregament en<br />
l’interior d’aquest altre compartiment.<br />
Cada un d’aquests mecanismes de transport és dirigit per senyals de<br />
sorting continguts a les seqüències aminoàcides de les proteïnes, que són<br />
reconeguts per receptors complementaris de la proteïna al orgànul.<br />
El viatge de les proteïnes comença amb la seva síntesi als ribosomes i<br />
finalitza quan s’ha arribat al destí final. A cada estació intermitja (boxes) es<br />
decideix si la proteïna és retinguda o transporta.<br />
Hi ha dos tipus de senyals de sorting a les proteïnes:<br />
A- Seqüències senyal. És un tram continuu de la seqüència<br />
d’aminoàcids que normalment trobem a un dels extrems, generalment a<br />
l’amino. Aquest senyal acostuma a ser eliminat per una proteïna peptidasa<br />
especialitzada un cop el procés de sorting ha finalitzat.<br />
23
B- Dominis senyal: Es pot formar una regió senyal mitjançant la<br />
juxtaposició d’aminoàcids procedents de regions que es trobaven físicament<br />
separades abans que aquesta es plegués. Són una col·locació específica i<br />
tridimensional dels àtoms al llarg de la superfície de la proteïna. Els residus<br />
d’aminoàcids que comprenen aquest domini senyal poden estar separats els<br />
uns dels altres a la seqüència aminoàcida i resten a l’extrem final de la<br />
proteïna. Aquests dominis només es poden observar quan la proteïna adopta<br />
una configuració tridimensional que pot ser reconeguda per altres molècules.<br />
(ex. manosa-6-fosfat)<br />
Per entrar als orgànuls, les vesícules necessiten ser molt hidrofòbiques.<br />
Aquesta és la raó per què la majoria de seqüències senyal són molt<br />
hidrofòbiques (ex. Leucina i lisina són aminoàcids molt comuns i molt<br />
hidrofòbics).<br />
En el citosol quan es comença a sintetitza la proteïna es fan dues coses:<br />
- si té seqüència senyal anirà al reticle endoplasmàtic<br />
- si no té seqüència senyal no podrà entrar al reticle endoplasmàtic.<br />
24
<strong>TEMA</strong> 7: ESTRUCTURES DE LES MEMBRANES<br />
Les membranes cel·lulars són essencials per a la vida cel·lular. La<br />
membrana plasmàtica envolta la cèl·lula definint la seva extensió i mantenint<br />
les diferències entre el contingut de la cèl·lula i el seu entorn. Les membranes<br />
del ER, aparell de Golgi, mitocondris i altres orgànuls delimitats per membrana<br />
mantenen les diferències característiques entre els continguts de cada orgànul i<br />
el citosol. La membrana conté també proteïnes que actuen com sensors de<br />
senyals externs.<br />
Les bicapes lípidiques són altament<br />
impermeables a la majoria de molècules<br />
polars. No obstant, qualsevol molècula<br />
acabarà penetrant la bicapa lipídica lliure de<br />
proteïna amb temps suficient. La velocitat amb<br />
què es produeix la difusió depén del tamany<br />
de la molècula i de la solubilitat en lípids. Com<br />
més petita i més hidrofòbica o apolar, millor i<br />
més ràpidament es difon en la bicapa. Les<br />
bicapes lipídiques són altament impermeables<br />
a ions malgrat el seu tamany ja que la seva<br />
càrrega i el grau d’hidratació eviten la<br />
penetració. Algunes molècules entraran,<br />
doncs, per transport passiu o difusió facilitada a favor de gradient electroquímic<br />
sense despesa d’ATP, mentre que d’altres entraran per transport actiu amb<br />
consum d’ATP gràcies a les anomenades bombes.<br />
Les membranes estan formades per lípids, proteïnes i carbohidrats i són<br />
estructures dinàmiques, ja que la majoria de les seves molècules són capaces<br />
de desplaçar-se en el pla de la membrana. A més a més, la bicapa és<br />
asimètrica, diferenciant-se una cara externa i una cara citosòlica o<br />
protoplasmàtica. Cada cara té una composició i una càrrega diferent i, per tant,<br />
cada una tindrà unes funcions específiques. L’any 1972, Singer i Nicolson van<br />
proposar el model del mosaic fluid, basant-se en aquest dinamisme.<br />
1. <strong>LA</strong> MEMBRANA P<strong>LA</strong>SMÀTICA<br />
La membrana plasmàtica és la membrana que envolta totes les cèl·lules,<br />
definit la seva extensió i mantenint les diferències essencials entre el contingut<br />
de la cèl·lula i el seu entorn.<br />
No és una membrana uniforme, de tant en tant es veuen uns dominis<br />
d’uns 70nm de diàmetre anomenats Rafts, que tenen una composició i unes<br />
funcions diferents a les de la resta de la membrana. Aquests rafts són més<br />
amples degut a que la seva composició lipídica és diferent. Tenen més<br />
colesterol i una concentració d’esfingolípids més elevada. Són rígids i no<br />
permeten els moviments de les molècules fàcilment. A més hi ha una<br />
disminució de la permeabilitat. La seva existència és molt important perquè són<br />
regions que concentren moltes proteïnes receptores de senyals externes.<br />
25
També s’hi troben molècules com el Ras (oncogènica, regulada per<br />
caveolina que fa que estigui inactiva, en estat actiu es troba en molts càncers) i<br />
proteïnes que s’han de transportar a altres membranes cel·lulars. Restringeixen<br />
també les interaccions de les proteïnes de la membrana amb molècules<br />
extracel·lulars i, en canvi, potencien les interaccions amb el citoesquelet. El<br />
microdominis (Rafts) es classifiquen per si tenen caveolina o no, en caveolars o<br />
no caveolars.<br />
Els caveolars formen part d’una invaginació recorberta de caveolina, en<br />
canvi els no caveolars tenen la superfície plana. Els rafts tenen molta<br />
importància degut a que s’ha descobert que són els anclatges per l’entrada del<br />
virus de la SIDA o de la toxina del Còlera.<br />
La claveolina té dominis transmembrana amb molta afinitat pel<br />
colesterol. S’encarrega de la regulació del transport de colesterol, té la<br />
capacitat d’unir moltes proteïnes i intervé en la relaxació arterial.<br />
2. ELS LÍPIDS DE <strong>LA</strong> MEMBRANA<br />
Els lípids de membrana són molècules<br />
amfipàtiques (tenen un extrem hidrofílic i un<br />
extrem hidrofòbic) que formen bicapes. Les<br />
molècules lipídiques són insolubles en aigua però<br />
es dissolen fàcilment en dissolvents orgànics.<br />
2.1. Fosfolípids<br />
Els lípids més abundants de les<br />
membranes són els fosfolípids. Els<br />
fosfolípids tenen un cap polar i dues<br />
cadenes hidrofòbiques (àcids grassos).<br />
Normalment una de les dues cues presenta<br />
un o més dobles enllaços (cadena<br />
insaturada) i l’altra normalment no té dobles<br />
enllaços (cadena saturada).<br />
26<br />
LÍPIDS DE<br />
MEMBRANA<br />
FOSFOLÍPIDS COLESTEROL GLUCOLÍPIDS
La membrana plasmàtica no és homogènia, hi ha subdominis. Els<br />
dominis ordenats (fosfolípids sense insaturacions en ela seus àcids grassos) i<br />
dominis desordenats (àcids grassos amb insaturacions).<br />
Els fosfolípids es mouen en la membrana plasmàtica. Hi distingim la<br />
difusió lateral, la difusió translocacional i la difusio rotacional, que són<br />
espontànies, i la difusió transmembranal (flip-flop), que és molt lenta<br />
TIPUS MOVIMENT LÍPIDS<br />
DIFUSIÓ <strong>LA</strong>TERAL<br />
Els fosfolípids són sintetitzats només en una de els monocapes de la<br />
membrana, normalment en la monocapa citosòlica del ER.<br />
Si cap d’aquestes molècules recentment formades pogués migrar capa l’altra<br />
meitat de la bicapa lípidica no es podria formar més bicapa. Per a solucionar<br />
aquest problema hi ha un enzim translocador de fosfolípids encarregat de<br />
catalitzar un ràpid flip-flop de fosfolípids específics des de la monocapa on han<br />
estat sintetitzats fins a la monocapa oposada.<br />
Hi ha quatre grups bàsics de<br />
fosfolípids: la fosfatidiletanolamina, la<br />
fosfaditil serina (carregada<br />
negativament), la fosfatidilcolina i<br />
l’esfingomielina. També existeixen els<br />
fosfolípids d’inositol que són<br />
funcionalment importants, però es<br />
troben en quantitats petites.<br />
2.2. Colesterol<br />
DIFUSIÓ TRANSLOCACIONAL<br />
DIFUSIÓ ROTACIONAL<br />
DIFUSIÓ TRANSMEMBRANAL<br />
La fluïdesa de les membranes cel·lulars és molt important ja que alguns<br />
processos de transport i algunes activitats enzimàtiques poden aturar-se quan<br />
la viscositat de la bicapa augmenta.<br />
La fluïdesa d’una capa lípidica depèn de:<br />
- La seva composició, més lípids insatutrats més fluïdesa.<br />
- La seva temperatura, a temperatures més baixes més fluïdesa<br />
- La longitud de les cadenes dels fosfolípids: més curtes, més fluïdesa (les<br />
cues hidrocarbonades disminueixen les seves interaccions).<br />
27
28<br />
Però, una bicapa lipídica conté<br />
no només fosfolípids i glucolípids, sinó<br />
també quantitats elevades de<br />
colesterol. Les molècules de<br />
colesterol reforcen el caràcter<br />
permeable de la bicapa lipídica (més<br />
colesterol més fluïdes) i donen més<br />
estabilitat mecànica a la bicapa.<br />
Els seus grups hidroxil s’orienten pròxims als caps polars dels<br />
fosfolípids, els seus anells esteroides interactuen i inmmobilitzen les regions de<br />
les cadenes hidrocarbonades (àcids grassos) més pròxims als caps polars,<br />
deixant la resta de la cadena més flexible. En disminuir la mobilitat dels primers<br />
CH2 dels àcids grassos, el colesterol fa més rígida la bicapa lipídica en aquesta<br />
regió però la resta és més flexible. A més, disminueix la permeabilitat de la<br />
bicapa i facilita els canvis en la forma de la membrana que requereixen que les<br />
dues cares de la bicapa es retreguin o s’estenguin. També impedeix que les<br />
cadenes hidrocarbonades s’ajuntin i cristal·litzin, inhibint possibles canvis<br />
d’estat.<br />
3. PROTEÏNES DE MEMBRANA<br />
L’estructura bàsica de les membranes està determinada per la bicapa<br />
lipídica, però la majoria de les seves funcions específiques estan<br />
desenvolupades per proteïnes.<br />
Les proteïnes de membrana poden estar associades a la bicapa lípidica<br />
de diverses maneres:<br />
• Moltes proteïnes de membrana atravessen la bicapa lipídica, són les<br />
anomenades proteïnes transmembrana. Són amfipàtiques, tenen<br />
regions hidrofòbiques i hidrofíliques. Les regions hidrofòbiques es situen<br />
a l’interior de la membrana i es relacionen amb les molècules lipídiques<br />
de l’interior de la bicapa. Les regions hidrofíliques es troben exposades<br />
al medi aquós d’ambdós costats de la membrana. Una proteïna<br />
transmembrana (hèlix !) travessa la membrana un o més cops, pot<br />
formar canals (hèlix #) o estructures hair pin. (1, 2, 3 i 4)
• Proteïnes integrals d’origen citosòlic. Estan ancorades a la bicapa per<br />
la cara citoplasmàtica a través de la unió covalent amb una cadena<br />
d’àcid gras modificat amb un grup prenyl o a través una hèlix !<br />
amfipàtica exposada en la superfície de la proteïna.<br />
• Proteïnes integrals que posseixen un ancoratge GPI<br />
(glicosilfosfatidilinositol) amb la cara no citoplasmàtica. La proteïna està<br />
unida per unió covalent a la bicapa per una unió covalent via un<br />
oligosàcarid específic. Aquesta modificació GPI és un senyal que indica<br />
a la proteïna on s’ha de dirigir en la cèl·lula, influint en la seva funció.<br />
• Proteïnes perifèriques: estan associades a la membrana sense ocupar<br />
el seu interior hidrofòbic, ja que estan unides a una de les dues cares de<br />
la bicapa (a la citosòlica o a la extracel·lular) mitjançant interaccions no<br />
covalents amb altres proteïnes de membrana.<br />
Les proteïnes no es distribueixen uniformement, hi ha proteïnes amb<br />
afinitat pels dominis ordenats i d’altres pels desordenats, per exemple les<br />
proteïnes GPI tenen afinitat pels dominis ordenats als quals es poden unir tot i<br />
no tenir domini hidrofòbic gràcies al grup GPI al que estan associats. Les<br />
proteïnes transmembrana, en canvi, si que tenen dominis hidrofòbics rics en<br />
leusina. Si en aquests dominis hidrofòbics apareix una prolina es produeix una<br />
torsió que fa que la proteïna torni a entrar en la bicapa i la torni a travesar.<br />
En les imatges següents, la primera representa en verd fosc els dominis<br />
hidrofòbics (valors positius) i en verd clar els dominis hidrofílics (valors<br />
negatius) i la segona imatge és un exemple d’un domini transmembrana.<br />
4. <strong>LA</strong> SUPERFÍCIE CEL!LU<strong>LA</strong>R ESTÀ COBERTA AMB RESIDUS DE<br />
SUCRE<br />
En la superfície de totes les membranes plasmàtiques hi ha glucolípids.<br />
Les proteïnes de membrana tampoc acostumen a sobresortir despullades a<br />
l’exterior cel·lular sinó que són cobertes per carbohidrats. Aquests carbohidrats<br />
es troben en forma d’oligosacàrdids units covalentment a les proteïnes de<br />
membrana (glucoproteïnes) i a lípids (glucolípids).<br />
També hi ha proteoglicans integrals de membrana, que són llargues<br />
cadenes de polisacàrids unides covalentment a un nucli proteïc que s’extén a<br />
través de la la llarga bicapa lipídica mitjançant un glucosilfosfatidilinositol (GPI).<br />
29
Els grups de sucre són afegits a les proteïnes (comença al reticle<br />
endoplasmàtic) o als lípids en l’aparell de Golgi. Els glúcids, independentment<br />
a què estiguin associats, se situen a la cara externa de la membrana<br />
plasmàtica, al lumen, mai capa al citosol.<br />
Els set glúcids que podem trobar formant<br />
part de proteïnes i lípids són: manosa,<br />
galactosa, N-acetilgalactosamina, glucosa, Nacetilglucosamina,<br />
fucosa i àcid siàlic. I no tots<br />
els aminoàcids poden ser glucosilat, només la<br />
serina, la treonina i l’àcid aspàrtic.<br />
30<br />
La coberta cel·lular o<br />
glucocàlix és la zona de la<br />
superfície cel·lular rica en hidrats<br />
de carboni. Aquesta està formada<br />
per cadenes d’oligosacàrids dels<br />
glucolípids i de les glucoproteïnes<br />
integrals de membrana. El<br />
glicocàlix és el responsable de<br />
protegir la cèl·lula de possibles<br />
atacs i d’actuar en processos de<br />
reconeixement cel·lular (ex.<br />
sucres de l’òvul són reconegudes<br />
per l’espermatozou).<br />
Els glucolípids són molècules molt<br />
importants per l’organisme. Un exemple és que<br />
en el cas de la seva pèrdua en resulten greus<br />
malalties, com és el cas de l’Alzheimer que és<br />
degut a la pèrdua dels glucolípids de les<br />
neureones.<br />
Els glucolípids tenen diverses funcions essencials:<br />
- Els que tenen càrrega tenen una importància fonamental gràcies als<br />
seus efectes elèctrics: la seva presència altera el camp elèctric a través<br />
de la membrana i la concentració d’ions en la superfície externa.<br />
- Realitzen un paper important en l’aïllament elèctric, ja que es troben en<br />
gran quantitat en la meitat no citoplasmàtica de la bicapa de la<br />
membrana mielínica, que aïlla elèctricament els axons de les cèl·lules<br />
nervioses.<br />
- Realitzen funcions de reconeixement cel·lular.<br />
Procés de rolling: amb aquest procés les citotoxines avisen a les<br />
cèl·lules endotelials per a que segreguin una proteïna transmembrana<br />
implicada en el reconeixement dels carbohidrats dels neutròfils, els quals<br />
quedaran ancorats a les cèl·lules endotelials i s’aniran desplaçant rodant<br />
cap al lloc de la infecció, on seran capturats per proteïnes integrines i<br />
expulsats cap al lloc infectat.
La membrana plasmàtica és troba unida al citoesquelet. El citoesquelet<br />
és ric en filaments d’actina que s’uneixen a la bicapa lípidica.<br />
5. DOMINIS DE MEMBRANA<br />
Moltes cèl·lules tenen sistemes que els permeten limitar les seves<br />
proteïnes de membrana en dominis específics de la bicapa lipídica. Es creu que<br />
la separació de proteïnes i lípids es manté per les barreres formades per un<br />
tipus d’unions intercel·lulars.<br />
Les proteïnes poden moure’s en el seu domini però no poden entrar en<br />
un altre degut a la unió cel·lular anomenada unió estreta. Així, les molècules<br />
lipídiques de la membrana apical (té proteïnes GPI) no poden anar a la<br />
membrana basal de la cèl·lula.<br />
Però, apart de les unions estretes existeixen més restriccions dels<br />
moviments de proteïnes per la membrana, degudes a:<br />
- La formació d’agregats de proteïnes, adquirint més pes i volum.<br />
- La unió de proteïnes de membrana amb components de la matriu<br />
extracel·lular<br />
- La unió de proteïnes de membrana al citoesquelet.<br />
No obstant, existeixen dos tipus de moviments demostrats de les<br />
proteïnes: la difusió lateral i la rotació, on les proteïnes giren al voltant d’un eix<br />
aproximadament perpendicular al pla de la bicapa.<br />
TEMES 8 I 9: RETICLE ENDOP<strong>LA</strong>SMÀTIC I MAQUINÀRIA BIOSINTÈTICA<br />
RETICLE RUGÓS<br />
31
Els cicles de gemmació i fusió permeten que qualsevol orgànul es<br />
comuniqui amb qualsevol altre i l’exterior cel·lular. Les fletxes blaves indiquen la<br />
direcció de sortida del tràfic de vesícules des del ER fins al complex de Golgi i<br />
la membrana plasmàtica (o lisosomes).<br />
Totes les cèl·lules eucariotes tenen un reticle endoplasmàtic, la<br />
membrana del qual constitueix normalment més de la meitat del total de la<br />
membrana de la cèl·lula. Està organitzat en forma d’una xarxa laberíntica de<br />
túbuls ramificats i de sàculs aplanats interconnectats amb el nuclis i que<br />
s’estenen per tot el citoplasma. El lumen del RE queda amb contacte amb<br />
l’espai perinuclear (espai entre la membrana nuclear externa i la interna).<br />
La membrana del reticle està constituïda bàsicament per una doble capa<br />
de fosfolípids amb proteïnes inserides. A més, hi ha petites quantitats de<br />
colesterol, esfingomielina, glicolípids i glicoproteïnes.<br />
La seva membrana del RE és el lloc de producció de totes les proteïnes<br />
transmembrana, de les proteïnes que han de ser secretades i lípids de la<br />
majoria dels orgànuls cel·lular (el mateix ER, aparell de Golgi, lisosomes,<br />
endosomes...). Totes les proteïnes són inicialment transportades al RE.<br />
Algunes de les proteïnes transmembrana produïdes al RE s’hi queden, però<br />
moltes altres estan destinades a altres orgànuls (hidrosolubles) o a la<br />
membrana plasmàtica. Totes aquestes proteïnes, independentment del seu<br />
destí, són dirigides a la membrana del ER. La cèl·lula tindrà un volum de reticle<br />
endoplasmàtic més o menys grans en funció del seu poder transcripcional (molt<br />
poder transcripcional voldrà dir molta síntesi de proteïnes, per tant, molt RE).<br />
Hi ha dos tipus de reticle endoplasmàtic: el RE llis i el RE rugós, aquest<br />
últim té enganxats a la seva membrana ribosomes.<br />
1. EL RETICLE ENDOP<strong>LA</strong>SMÀTIC LLIS. FUNCIONS.<br />
Les regions del ER que no tenen ribosomes units es denominen reticle<br />
endoplasmàtic llis. Les seves cavitats tenen una estructura més tubular i no<br />
presenten ribosomes enganxats.<br />
Dins d’aquestes cavitats i a nivell de membrana trobem enzims<br />
responsables de la síntesi dels lípids, i els enzims implicats en els processos de<br />
detoxificació de substàncies liposolubles.<br />
32
En una gran majoria de les cèl·lules, L’ER llis és escàs i només existeix<br />
una petita regió del ER que és parcialment llisa i rugosa que s’anomena reticle<br />
endoplasmàtic de transició (o elements transicionals), i representen una<br />
regió especialitzada del reticle endoplasmàtic a partir de la qual es formen les<br />
vesícules portadores de lípids i proteïnes, molècules recentment sintetitzades<br />
que van a l’aparell de Golgi.<br />
Malgrat això, hi ha cèl·lules especialitzades en que aquest tipus de<br />
reticle és molt abundant. En:<br />
- Cèl·lules musculars, on s’anomena reticle sarcoplasmàtic, i<br />
s’encarrega de segrestar Ca 2+ del citosol per afavorir la contracció<br />
muscular.<br />
- Cèl·lules de Leydig, encarregades en la síntesi d’hormones esteroïdees<br />
derivades del colesterol.<br />
- Cèl·lules hepàtiques, ja que l’RE llis conté els enzims responsables de la<br />
detoxificació de drogues, alcohols i altres compostes liposolubles.<br />
Així, doncs, les funcions del reticle endoplasmàtic llis són:<br />
- Metabolisme dels lípids: Els fosfolípids i el colesterol es sintetitzen en<br />
les membranes del reticle endoplasmàtic llis. Excepte els àcids grassos i<br />
dos tipus de fosfolípids mitocondrials, la resta de lípids produïts a la<br />
cèl·lula se sintetitzen aquí. El fosfolípid més important és la<br />
fosfatidilcolina format a partir de dos àcids grassos, un glicerol, un fosfat<br />
i una colina. Al reticle hi ha d’haver algun mecanisme que generi<br />
moviments de les molècules lipídiques, ja que aquestes han d’anar fins<br />
la cara del lumen a la cara citoplasmàtica (flip-flop de fosfolípids)<br />
perquè passi a membranes d’altres orgànuls mitjançant la vesiculació.<br />
Es creu que la responsable és una proteïna específica translocadora de<br />
fosfolípids (flipases).<br />
Formació de la fosfatidilcolina<br />
33
- Síntesi i producció de lipoproteïnes.<br />
- Emmagatzemar intracel!lularment Ca 2+<br />
- Síntesi d’hormones esteroïdees.<br />
- Funció de detoxificació: En la detoxificació, els compostos pateixen<br />
una alteració metabòlica que els fa més hidrosolubles. D’aquesta<br />
manera són més fàcilment excretables pels ronyons o per l’intestí o de<br />
ser degradats pels lisosomes. Això s’aconsegueix mitjançant la<br />
hidroxilació de compostos aromàtics i alifàtics i la conjugació d’aquests<br />
derivats hidroxilats amb àcid glucurònic, sulfat, glicina o taurina. És un<br />
procés que permet transformar substàncies insolubles en aigua i que<br />
d’acumular-se a la membrana ocasionarien greus perjudicis a la cèl·lula.<br />
Gràcies a enzims com el citocrom p450 es catalitzen aquestes reaccions<br />
de detoxificació.<br />
2. RETICLE ENDOP<strong>LA</strong>SMÀTIC RUGÓS<br />
Aquest reticle està organitzat en piles de sacs aplanat, anomenats<br />
sàculs, que pel cantó citoplasmàtic estan recoberts per ribosomes distribuïts<br />
asimètricament. Aquesta diferència en la distribució entre els dos cantons del<br />
reticle (citoplasmàtic i luminar) és imprescindible per a les funcions de<br />
biosíntesi. Com ja hem dit, la membrana d’aquest reticle és una continuació de<br />
la membrana nuclear externa que també està entapissada per ribosomes.<br />
Els ribosomes es mantenen sobre la membrana a través de les cadenes<br />
polipeptídiques en creixement, que travessen la membrana a mesura que són<br />
sintetitzades. A més, hi ha zones d’unió especials entre els ribosomes i la<br />
membrana. El punt d’unió del ribosoma es troba a la subunitat major i s’uneix a<br />
dues glicoproteïnes específiques del reticle, denominades riboforines.<br />
Trobem RE rugós a totes les cèl·lules nucleosades, excepte en els<br />
espermatozous, i és molt abundant a les cèl·lules especialitzades en la secreció<br />
de proteïnes (cèl·lules acinars pancreàtiques, cèl·lules secretores<br />
d’anticossos...).<br />
Les funcions del reticle endoplasmàtic rugós són:<br />
- Síntesi proteica. Es sintetitzen:<br />
" Totes les proteïnes de secreció que seran exportades<br />
" Totes les proteïnes de membrana, incloent-hi les seves pròpies.<br />
" Les proteïnes dels mitocondris i els cloroplasts.<br />
" Algunes proteïnes dels peroxisomes.<br />
- Funcions de transport de les substàncies recentment sintetitzades<br />
- Emmagatzemar substàncies recentment sintetitzades, que en un<br />
primer moment són emmagatzemades i, posteriorment, seran<br />
transportades.<br />
- Control de qualitat. Procés post-traduccional perquè les proteïnes<br />
surtin del reticle.<br />
34
3. <strong>LA</strong> MAQUINÀRIA BIOSINTÈTICA DEL RETICLE ENDOP<strong>LA</strong>SMÀTIC<br />
RUGÓS<br />
Per tal de què comenci la síntesi de proteïnes es necessita que l’RNAm,<br />
sintetitzat al nucli s’associï als ribosomes, començant la traducció, que pot tenir<br />
lloc:<br />
- Al citosol, en els ribosomes lliures que sintetitzen les proteïnes<br />
citosòliques. Quan la proteïna està totalment traduïda és transportada<br />
cap al seu lloc de funcionament. Aquest procés és el que s’anomena<br />
síntesi post-traduccional.<br />
- Al RE rugós, la cara citosòlica hi estan adherits els ribosomes units a la<br />
membrana. Es sintetitzen proteïnes de secreció i de membrana. Les<br />
proteïnes mateix temps que es tradueixen van entrant en el reticle.<br />
Aquest procés s’anomena síntesi contraduccional.<br />
Els ribosomes units a la membrana i els ribosomes liures són estructural<br />
i funcionalment idèntics, només es diferencien en les proteïnes que sintetitzen.<br />
Quan un ribosoma comença a fabricar una proteïna amb un pèptid senyal per<br />
la unió amb la membrana del ER, la mateixa senyal dirigeix el ribosoma a la<br />
membrana del ER. Com molts ribosomes poden unir-se a una mateixa<br />
molècula d’ARNm, es forma un poliribosoma. Si una molècula d’ARNm<br />
codifica una proteïna que no té pèptid senyal per al ER, el poliribosoma roman<br />
al citosol lliure o la proteïna producte és alliberada en el propi citosol. Així,<br />
només s’uneixen a les membranes rugoses del ER els ribosomes units a les<br />
molècules d’ARNm que codifiquen proteïnes que tenen un pèptid senyal.<br />
35
Aquest senyal pèptid no només dirigeix les proteïnes cap al reticle, sinó<br />
que depèn del tipus de senyal la proteïna serà dirigida a altres orgànuls. La<br />
hipòtesi de la senyal diu que la seqüència líder actua de pèptid senyal dirigint<br />
la proteïna de secreció fins la membrana del RE rugós. Un cop a la membrana,<br />
i abans que la cadena polipeptídica estigui completa, el pèptid és hidrolitzat per<br />
una peptidasa de senyal de la membrana de RE rugós. La sequüència senyal,<br />
que només serveix per entrar al reticle endoplasmàtic, acostuma a ser<br />
hidrofòbica.<br />
Una partícula de reconeixement de senyal SRP (Signal Recognition<br />
Particle) dirigeix el pèptid senyal per al RE a un receptor específic de la<br />
membrana del RE. El pèptid senyal és dirigit a la membrana del ER per dos<br />
components com a mínim:<br />
- Una partícula de reconeixement de la senyal (SRP) que s’uneix al<br />
pèptid senyal i al ribosoma, consumint energia GTP mentre viatja entre<br />
la membrana i el citosol.<br />
- Un receptor SRP, una proteïna integral de la membrana del reticle que<br />
es troba a la seva superfície citosòlica.<br />
A mesura que el pèptid va emergent del ribosoma, la SRP es va unint al<br />
pèptid senyal. Això provoca una pausa en la síntesi proteica per poder donar al<br />
ribosoma temps suficient per a unir-se a la membrana del ER abans que es<br />
completi la síntesi de la cadena polipeptídica assegurant així que no és<br />
alliberada al citosol. La SRP és alliberada deixant el ribosoma sobre la<br />
membrana del ER. Llavors, un aparell de translocació (o translocon, gràcies<br />
al qual la proteïna entra al lumen) de la membrana del ER format per diverses<br />
subunitats proteiques inserta la cadena polipeptídica en la membrana i la<br />
transfereix a través de la bicapa lipídica.<br />
Mecanisme cotraduccional (mentre es sintetitza)<br />
36
La proteïna també pot entrar un cop ja formada, no sempre entrarà<br />
mentre s’esta produint la seva síntesi, d’aquest mecanisme se’n diu síntesi<br />
post-traduccional.<br />
37<br />
Sec 62, 63, 71, 73 complex:<br />
ajuden a entrar a la proteïna un<br />
cop ja està formada.<br />
Sec 61 complex: el que<br />
anomenem translocador (porus)<br />
BiP: chaperona que ajuda a<br />
plegar la proteïna, requereix<br />
consum d’ATP<br />
El porus del translocador està tapat amb la cadena polípeptídica que es<br />
troba en trànsit a través de la membrana. Permet el pas d’una cadena<br />
desplegada i es tanca quan el ribosoma és eliminat de la membrana. Així, el<br />
porus sembla ser una estructura dinàmica, obrint-se pas quan un ribosoma<br />
amb una cadena polipeptídica s’uneix a la membrana i tancant-se quan el<br />
ribosoma s’allibera després que la síntesi de la proteïna hagi acabat.<br />
Per les proteïnes de secreció, la seqüencia senyal, situada en l’extrem<br />
amino terminal, té dues funcions:<br />
- Dirigir el pèptid senyal a la membrana del RE<br />
- Actuar com a senyal d’inici de transferència, romanent unint al<br />
translocon, mentre que la resta de la proteïna va travessant la<br />
membrana formant un gran bucle a la llum del RE. Una vegada l’extrem<br />
carboxil hagi travessat la membrana, hi ha un aminoàcid de la proteïna<br />
que reconeix una peptidasa, que hidrolitza el pèptid senyal i allibera la<br />
proteïna de la membrana deixant-la lliure al lumen. Després, la mateixa<br />
peptidasa s’encarrega de degradar el pèptid senyal.
En les proteïnes transmembrana d’un únic pas, un pèptid senyal intern<br />
roman en la bicapa lipídica. El procés de translocació de les proteïnes<br />
destinades a romandre en la membrana és més complex que el de les<br />
proteïnes solubles ja que algunes zones de la cadena polipeptídica són<br />
translocades a través de la bicapa lipídica mentre que les altres no ho són.<br />
Un pèptid senyal amino terminal inicia la translocació igual que per a una<br />
proteïna soluble, però un segment addicional hidrofòbic de la cadena frena el<br />
procés de la transferència abans que tota la cadena polipeptídica s’hagi<br />
translocat. Aquest pèptid de parada de transferència atura la proteïna en la<br />
membrana després que el pèptid senyal del ER s’hagi eliminat. El pèptid d’atur<br />
de transferència forma un únic segment ! helicoïdal que travessa la membrana,<br />
amb l’extrem amino terminal de la proteïna en la cara llum de la membrana i<br />
l’extrem carboxil en la cara citosòlica.<br />
Però, també hi ha proteïnes transmembrana que travessen la membrana<br />
més d’un cop. Aquestes proteïnes, proteïnes multipas, necessiten una<br />
combinació de senyals d’inici i para de transferència determinada.<br />
En les proteïnes transmembrana de multipàs, la cadena polipeptídica<br />
travessa repetidament la bicapa lipídica. Un pèptid senyal intern com a senyal<br />
d’inici de transferència inicia la translocació, la qual continua fins que es troba<br />
un pèptid d’atur de transferència. La SRP busca els segments hidrofòbics de la<br />
cadena polipeptídica desplegada començant pel seu extrem aminoterminal i va<br />
progressant fins l’extrem carboxil terminal, en la mateixa direcció en la que es<br />
sintetitza la proteïna.<br />
La SRP reconeix el primer segment apropiat i per tant fixa la pauta de<br />
lectura: si s’ha iniciat la translocació el pròxim segment hidrofòbic serà<br />
reconegut com un pèptid d’atur de transferència, cosa que originarà que la<br />
regió de la cadena polipeptídica compresa entre ambdós segments hidrofòbics<br />
quedi insertada a través de la membrana i així successivament.<br />
38
Moltes proteïnes presents en la llum del ER estan només de pas, en<br />
ruta cap a altres destins. Altres, les proteïnes residents del ER, presenten en<br />
el sEU extrem carboxil terminal una senyal de retenció del ER que és<br />
responsable que la proteïna quedi retinguda en el ER. Aquesta senyal de<br />
residència està formada per 4 aminoàcids: KDEL (lisina, àcid aspàrtic, àcid<br />
glutàmic i leucina). Algunes d’aquestes proteïnes actuen com a catalitzadors<br />
que ajuden a altres moltes proteïnes que són translocades al ER a plegar-se i<br />
ajuntar-se correctament.<br />
3.1. La majoria de proteïnes sintetitzades en el RE rugós són<br />
glucosilades<br />
L’addició covalent de sucres a les proteïnes és una<br />
de les principals funcions del ER. La majoria de<br />
proteïnes solubles i unides a la membrana que són<br />
fabricades en el llum del ER (incloent les destinades<br />
a ser transportades al Golgi, lisosomes i espai<br />
extracel·lular) són glicoproteïnes.<br />
A la foto veiem l’estructura de l’oligosacàrid unit a<br />
asparagina que és afegit a la majoria de els proteïnes<br />
en la membrana del ER rugós. Els cinc residus de<br />
sucre mostrats en el requadre gris formen la regió<br />
central d’aquest oligosacàrid. En l’aparell de Golgi es<br />
produeix una profunda reordenació i eliminació<br />
d’aquests sucres i en moltes proteïnes només<br />
sobreviuen a aquest procés aquests cinc residus.<br />
39
La glucosilació d’una proteïna en el RE es<br />
produeix gairebé immediatament després que<br />
la cadena peptídica entri en la llum del RE. La<br />
glucosilació és un pas més que ha de fer el RE<br />
com a control de qualitat. Per poder sortir en<br />
condicions i ser funcionals al seu destí final, les<br />
proteïnes han de passar un control de qualitat:<br />
han de passar unes modificacions posttraduccionals<br />
que són:<br />
- Glucosilació<br />
- Plegament terciari, gràcies a la<br />
glucosilació o a chaperones.<br />
- Formació d’enllaços di-sulfur<br />
- Proteolisi. Trencament de la seqüencia<br />
senyal i a vegades d’altres parts.<br />
- Oligamerització. Olígomer: proteïnes<br />
formades per més d’una proteïna.<br />
40<br />
En el cas de glucosilació, a la<br />
proteïna se li afegeixen sucres<br />
perquè pugui interaccionar amb la<br />
calnexina que és una chaperona<br />
que s’engarrega de plegar el<br />
polipèptid per que passi a ser una<br />
proteïna.<br />
Si, finalment, la proteïna surt del RE mal plegada, en el citosol serà<br />
desglucosilada i marcada amb ubiquitina el que indicarà que s’ha de degradar.<br />
Quan s’ubiquitinitzades les proteïnes són enviades als proteosomes que<br />
s’encarreguen de degardar-les.<br />
No obstant, existeix un sistema per controlar cúmuls de proteïnes mal<br />
plegades.<br />
- Les proteïnes mal plegades en el ER envien una senyal que estimula la<br />
producció de més chaperones del ER, activant una quinasa<br />
transmembrana.<br />
- La quinasa activada assoleix activitat ribonucleasa.
- La endoribonucleasa talla molècules de RNAm específiques en dos<br />
llocs, eliminant l’intron<br />
- Els dos exons s’uneixen formant un RNAm actiu.<br />
- El RNAm es tradueix creant una proteïna reguladora de l’expressió<br />
gènica.<br />
- La proteïna regulació d’expressió gènica entra en el nucli i activa els<br />
gens que codifiquen chaperones del ER.<br />
- Les chaperones es sintetitzen en el ER on ajuden a plegar les proteïnes.<br />
Les proteïnes, un cop sintetitzades i ben formades, poden<br />
desplaçar-se d’un compartiment a un altre mitjançant un<br />
transport regulat (vermell), el transport transmembrana<br />
(blau) o el transport vesicular (verd). Els senyals que<br />
dirigeixen el camí d’una proteïna determinada a través del<br />
sistema, determinant la seva localització definitiva en la<br />
cèl·lula, estan contingudes en la seqüència d’aminoàcids<br />
de la proteïna.<br />
El viatge comença amb la síntesi d’una proteïna<br />
sobre un ribosoma i acaba quan s’ha aconseguit el destí<br />
final. En cada una de les estacions intermitges es pren<br />
una decisió sobre si la proteïna serà retinguda en el<br />
compartiment o bé continuarà el viatge. Tot i que en<br />
principi es requereix un senyal determinat per retenir la<br />
proteïna o no retenir-la, el transport vesicular de proteïnes<br />
des del ER, a través de l’aparell de Golgi, fins la<br />
superfície cel·lular sembla no necessitar cap senyal<br />
específic. Els senyals de retenció específics es<br />
necessiten per a retenir les proteïnes en el ER i en<br />
l’aparell de Golgi.<br />
41
Des de regions especialitzades del ER, emergeixen les vesícules<br />
destinades a l’aparell de Golgi i transporten qualsevol proteïna des del ER a<br />
l’aparell de Golgi. Existeix, però, un requeriment essencial perquè una proteïna<br />
surti del ER: ha d’estar correctament plegada i formada. Les proteïnes que<br />
no tenen la forma correcta o que són incomplertes són retenides i finalment<br />
degradades. Així, la sortida des del ER pot ser considerada com un control de<br />
qualitat.<br />
Com ja hem dit, hi ha proteïnes sintentitzades pel ER que han de<br />
romandre allà (ex. KDEL). Per això, hi ha un mecanisme utilitzat per retenir les<br />
proteïnes residents en el ER. Les proteïnes residents en el ER que s’escapen<br />
cap a la xarxa del cis Golgi són retornades al ER mitjançant el transport<br />
vesicular. Un receptor de membrana en la xarxa cis Golgi capta les proteïnes i<br />
les condueix, en vesícules de transport, cap el ER. Les condicions iòniques<br />
presents en el ER separen les proteïnes del seu receptor, de manera que el<br />
receptor retorna a la xarxa del cis Golgi per a ser reutilitzat.<br />
3.2. Formació de proteïnes GPI a partir de proteïnes transmembrana<br />
Algunes proteïnes de membrana canvien la<br />
seva cua transmembra terminal carboxil per<br />
un glucosilfosfatidilinositol (GPI) unit de<br />
forma covalent. Aquesta unió es forma en la<br />
llum del ER i afegeix a la proteïna un<br />
anclatge de GPI que conté 2 àcids grassos.<br />
En el mateix procés s’elimina el segment<br />
transmembrana de les proteïnes. Un enzim<br />
del ER retalla la proteïna, lliurant-la del seu<br />
extrem carboxil terminal, que la unia a la<br />
membrana, i simultàniament la uneix el nou<br />
extrem carboxil terminal a un grup amino<br />
d’un intermediari GPI. Amb aquest anclatge<br />
lipídic al que s’uneix de forma covalent, la<br />
proteïna roman unida a la membrana.<br />
42
<strong>TEMA</strong> 10: L’APARELL DE GOLGI<br />
L’aparell de Golgi és una estructura que es<br />
troba a prop del nucli cel·lular i a prop del<br />
centrosoma als animals. Quan la cèl·lula<br />
entra en mitosi es disgrega. Està format per<br />
un conjunt de cisternes (normalment 9 o<br />
10) limitades per una membrana i de forma<br />
aplanada i està polaritzat.<br />
Cada conjunt de sis cisternes constitueix<br />
una estructura anomenada dictiosoma.<br />
El nombre de dictiosomes varia segons el tipus de cèl·lula i, si hi ha més d’un,<br />
estan interconnectats. Associades a als dictiosomes trobem petites vesícules<br />
agrupades a la cara contigua al reticle endoplasmàtic, i al llarg dels anells<br />
dilatats de cada cisterna. Són vesícules de transport de proteïnes i de lípids<br />
que van sent modificats. En una mateixa cèl·lula, hi pot haver més d’un<br />
complex de Golgi que estan interconnectats.<br />
Els dictiosomes del Golgi tenen dues cares diferents: cara cis (cara<br />
d’entrada) i cara trans (cara de sortida). Ambdues cares estan connectades a<br />
uns compartiments especials, formats per estructures tubulars i cisternes que<br />
és la cara mitja on les proteïnes maduren i prenen les conformacions que els<br />
proporcionaran les funcions. Les proteïnes i lípids entren per la cara cis en<br />
vesícules de transport que provenen del ER i surten per la cara trans en<br />
vesícules de transport amb destins diferents, exocitosis constitutiva (membrana<br />
plasmàtica), exocitosis regulada (cap a membrana plasmàtica, però necessita<br />
regulació), sistemes endosòmics (endosomes, lisosomes).<br />
L’aparell de Golgi està polaritzat. Té cinc compartiments ordenats de la següent<br />
manera i que realitzen diferents funcions:<br />
- CGN (Cis Golgi Network): s’encarrega de la fosforilació dels oligosacàrids<br />
dels enzims lisosomals, provinents del reticle. Des del Golgi, aquests enzims<br />
aniran cap al lisosoma. Un altre funció del CGN és recuperar les proteïnes<br />
KDEL que s’hagin escapat del RE. Està format per una xarxa d’estructures<br />
tubulars i de cisternes.<br />
- Cis: es dóna l’eliminació de manoses, gràcies a la manosidasa I que talla<br />
residus de manosa. Està lligada amb una porció de transició del RE i les<br />
seves membranes són semblants a les del RE, fines.<br />
43
- Intermig: hi ha una eliminació de manoses i una addició de Nacetilglucosamina<br />
(GLCNAC) gràcias a la N-ascetilglucosamina<br />
transferasa I, cosa que permet que la manosidasa II elimini dos residus<br />
més de manosa.<br />
- Trans: es produeix l’addició de galactosa. Les seves membranes<br />
s’assemblen a la membrana plasmàtica, són gruixudes.<br />
- TGN (Trans Golgi Network): s’afegeix àcid siàlic i es dóna el sorting. La<br />
classificació i distribució de les proteïnes en vesícules que les transportaran<br />
als seus destins finals: lisosomes (via endosomes tardans), superfície<br />
cel·lular (secreció constitutiva) o vesícules secretores (secreció regulada).<br />
Els dos últims destins són exocitosis on hi ha fusions de vesícules amb la<br />
membrana plasmàtica. El TGN, com el CGN, està format per una xarxa<br />
d’estructures tubulars i de cisternes.<br />
Gràcies a aquests processos i al lleuger descens de PH (acidesa) que es produeix<br />
al llarg del Golgi, la proteïna surt madura i amb la conformació necessària per<br />
realitzar les funcions que li pertoquen.<br />
1. TRANSPORT DES DEL ER A L’APARELL DE GOLGI<br />
44<br />
El transport des del ER a<br />
l’aparell de Golgi i des d’aquest a<br />
la superficie cel·lular o a<br />
qualsevol altre lloc, mitjançant<br />
vesícules. Aquestes vesícules<br />
transfereixen les proteïnes d’una<br />
membrana a l’altra o d’un llum a<br />
l’altre mitjançant cicles de<br />
gemmació i fusió.
La via que va des del ER, passant pel complex de Golgi, fins la<br />
superfície cel·lular s’anomena via per defecte ja que les proteïnes no<br />
necessiten presentar senyals per seguir-la: qualsevol proteïna que entri en el<br />
ER (i es plegui correctament) serà transportada automàticament a través de<br />
l’aparell de Golgi cap a la superfície cel·lular si no conté senyals que l’aturin en<br />
algun compartiment de la ruta.<br />
L’aparell de Golgi és un important punt de síntesi glucídica i un lloc de<br />
classificació i distribució dels productes del ER. Molts dels polisacàrids<br />
cel·lulars són sintetitzats aquí i constitueix una zona de pas dels productes del<br />
ER de manera que una gran part dels glúcids que fabrica el Golgi s’uneixen<br />
com cadenes d’oligosacàrids a les proteïnes i lípids que el ER li envia. Alguns<br />
oligosacàrids actuen com senyals que dirigeixen determinades proteïnes cap<br />
a vesícules que les enviaran a altres parts de la cèl·lula.<br />
LES PROTEÏNES RESIDENTS EN EL ER SÓN SELECTIVAMENT<br />
RECUPERADES DE <strong>LA</strong> XARXA DEL CIS GOLGI<br />
Una proteïna ha d’estar correctament formada i plegada perquè pugui<br />
sortir del ER. Les proteïnes que no tenen la conformació correcta o que estan<br />
incompletes són retingudes o bé unides a la proteïna BIP (chaperona) o formen<br />
agregats i finalment són degradades. La sortida de proteïnes és un control de<br />
qualitat.<br />
Les proteïnes ben plegades no necessiten cap senyal específic per ser<br />
transportades fora del ER (segueixen la via per defecte) però aquelles que han<br />
de quedar-se en el ER sí que necessiten un senyal. És el senyal KDEL. Aquest<br />
senyal de retenció no és un ancoratge de les proteïnes residents en el llum del<br />
ER sinó una recuperació selectiva després que hagin estat transportades en<br />
vesícules i descarregades en la xarxa cis Golgi.<br />
Un receptor de membrana específic uneix totes les proteïnes que<br />
presenten el senyal de retenció i les empaqueta en vesícules de transport<br />
especials que els torna al ER. Les condicions iòniques presents en el ER<br />
separen les proteïnes del seu receptor, de manera que el receptor torna a la<br />
xarxa del cis Golgi per ser reutilitzat.<br />
Si es donés el cas que alguna partícula o receptor s’escapés serien<br />
detectats per una altre proteïna de coberta (COP I) que forma una vesícula de<br />
retorn al RE.<br />
45
MOLTES PROTEÏNES I LÍPIDS SÓN TRANSPORTATS AUTOMÀTICAMENT<br />
DES DEL ER I AL GOLGI A <strong>LA</strong> SUPERFÍCIE CEL·LU<strong>LA</strong>R<br />
En una cèl·lula capaç de realitzar secreció regulada, abans d’abandonar la<br />
xarxa del trans Golgi s’han de separar com a mínim tres tipus de proteïnes: les<br />
destinades a lisosomes (via endosomes tardans), les destinades a ser<br />
descarregades immediatament en la superfície cel!lular i les destinades a les<br />
vesícules de secreció. Les proteïnes destinades als lisosomes són<br />
seleccionades per al seu empaquetament en vesícules de transport<br />
específiques. La majoria de les altres proteïnes són transportades directament<br />
a la superfície cel·lular mitjançant una ruta per defecte no selectiva. Si les<br />
proteïnes del llum del ER no són específicament retingudes com residents del<br />
ER o de l’aparell de Golgi o no són seleccionades per les rutes que porten a la<br />
secreció regulada o als lisosomes, seran automàticament transportades a<br />
través del Golgi fins a la superfíce cel·lular mitjançant la via secretora<br />
constitutiva.<br />
Els processos de classificació de proteïnes en la xarxa del trans Golgi:<br />
- Les proteïnes marcades amb manosa-6-fosfat són dirigides cap als<br />
lisosomes (via endosomes tardans) mitjançant vesícules de transport<br />
recobertes de clatrina.<br />
- Les proteïnes que contenen senyals que les dirigeixen cap a vesícules<br />
de secreció són concentrades en grans vesícules recobertes de clatrina,<br />
que ràpidament perden el seu recobriment transformat-se en vesícules<br />
de secreció (un procés que únicament té lloc en cèl·lules secretores<br />
especialitzades).<br />
- Les proteïnes que no presenten característiques especials són<br />
transportades cap a la superfície cel·lular per defecte a través de la ruta<br />
de secreció constitutiva.<br />
46
LES VESÍCULES DE SECRECIÓ EMERGEIXEN PER GEMMACIÓ DES DE<br />
<strong>LA</strong> XARXA DEL TRANS GOLGI<br />
Les cèl·lules que estan especialitzades en secretar alguns dels seus<br />
productes en resposta a un senyal concreta, emmagatzemen aquests<br />
productes en vesícules de secreció. Aquestes es formen per gemmació de<br />
vesícules recobertes de clatrina, a partir de la xarxa del trans Golgi i alliberen el<br />
contingut a l’exterior cel·lular. Aquestes vesícules contenen proteïnes de<br />
membrana especials que poden actuar com a receptors unint el material<br />
agregat en la xarxa del trans Golgi. Després que les vesícules de secreció<br />
immadures sorgeixen de la xarxa del trans Golgi, la seva coberta de clatrina és<br />
eliminada i el seu contingut es condensa.<br />
47
<strong>TEMA</strong> 11: EXOCITOSIS<br />
Les vesícules de transport destinades a la membrana plasmàtica<br />
abandonen el trans Golgi seguint un flux constant. Les proteïnes de membrana<br />
i els lípids d’aquestes vesícules aporten nous components a la membrana<br />
plasmàtica, mentre que les proteïnes solubles de la vesícula són secretades a<br />
l’espai extracel·lular.<br />
La fusió de les vesícules<br />
amb la membrana plasmàtica<br />
és l’exocitosi (en aquest cas<br />
és la ruta de secreció<br />
constitutiva, perquè les<br />
vesícules no necessiten cap<br />
senyal per fusionar-se amb la<br />
membrana plasmàtica).<br />
Un altre tipus d’exocitosi<br />
és la ruta de secreció<br />
regulada, en la què les<br />
proteïnes solubles i altres<br />
substàncies s’emmagatzemen<br />
primer en vesícules de secreció<br />
i es secreten més tard. Aquesta<br />
via es troba principalment en cèl·lules especialitzades en secretar ràpidament<br />
productes (per exemple: les hormones). Per tant, sabem que hi ha tres<br />
possibles vies que les proteïnes poden seguir (si no estan destinades a formar<br />
part de cap orgànul):<br />
- Via que segueixen proteïnes destinades a ser degradades (lisosomes,<br />
tema 13).<br />
- Via que destina les proteïnes a les vesícules de secreció per la secreció<br />
regulada.<br />
- Via que transporta les proteïnes i lípids automàticament a la superfície<br />
extracel·lular (per defecte).<br />
Existeix un procés, el Doking, que succeix quan les vesícules entren en<br />
contacte amb la membrana, però no arriben a fusionar-se.<br />
48
Les vesícules tindran diferents senyals de sorting segons on hagin d’anar a<br />
parar:<br />
- Clatrina: les molècules aniran a parar a la membrana plasmàtica o al<br />
lisosoma.<br />
Les cèl·lules especialitzades a secretar<br />
ràpidament productes en resposta a una<br />
senyal concentren aquests productes en<br />
vesícules de secreció (grànuls de<br />
secreció o vesícules de nucli dens), que<br />
es formen per gemmació de vesícules<br />
cobertes de clatrina i alliberen el contingut a<br />
l’exterior cel·lular en resposta a la senyal<br />
extracel·lular. El producte pot ser una<br />
molècula petita o una proteïna. Les<br />
proteïnes destinades a vesícules de<br />
secreció s’empaqueten en vesícules al trans<br />
Golgi i aquest mecanisme implica<br />
l’agregació selectiva de proteïnes de<br />
secreció. Quan les vesícules de secreció<br />
abandonen el Golgi, la coberta de clatrina és eliminada i el contingut es<br />
condensa molt a causa de l’acidificació del lumen de la vesícula, induïda<br />
per una bomba d’H+. Com que les vesícules són tan denses, la cèl·lula<br />
secretora allibera molt material per exocitosi quan és necessari.<br />
- Caveolina: les regions del TGN on hi ha caveolina fan que les proteïnes<br />
d’aquesta regió formin caveoles a la membrana plasmàtica.<br />
- COP1: és una proteïna que es troba a una determinada regió del TGN i<br />
que recobreix les vesícules que aniran cap a una regió específica del<br />
Golgi o del RE.<br />
[Moltes molècules secretades es sintetitzen com proteïnes precursores<br />
inactives, a partir de les quals s’alliberen les molècules actives per proteòlisi.<br />
Aquests polipèptids tenen, per exemple, una preseqüència que s’elimina abans<br />
de la secreció formant-se així la proteïna madura (abans era una preproteïna<br />
en la que la preseqüència és el pèptid senyal del ER que s’elimina al ER<br />
rugós). També pot ser que comencin sent sintetitzades com a poliproteïnes<br />
amb múltiples còpies de la mateixa seqüència aminoacídica.]<br />
Una vegada carregada, la vesícula<br />
secretora ha d’anar al lloc de secreció, on<br />
ha d’esperar fins que la cèl·lula rebi el<br />
senyal de secreció, Les vesícules utilitzen<br />
proteïnes motores unides a la seva<br />
superfície per a prpopulsar-se al llarg<br />
dels microtúbuls axonals.<br />
49
L’última etapa de la ruta secretora regulada és l’alliberació del producte<br />
per exocitosi. La senyal de secreció és sovint un missatger químic que s’uneix<br />
als receptors de la superfície cel·lular. L’activació d’aquests genera senyals<br />
intracel·lulars (sovint, un increment de la concentració de calci al citosol). Es<br />
dispara l’exocitosi i les vesícules de secreció s’uneixen a la membrana<br />
plasmàtica i alliberen el seu contingut a l’espai extracel·lular.<br />
L’exocitosi regulada es pot produir per tota la<br />
superfície cel·lular (fig. A i B, a dalt) si es cultiven<br />
cèl·lules secretores en un medi que contingui un<br />
estimulant soluble, però normalment (en les cèl·lules<br />
de l’organisme) no és una resposta generalitzada de<br />
tota la cèl·lula sinó que queda restringida a la regió<br />
on la cèl·lula està en contacte amb el lligand (a la<br />
dreta).<br />
Quan una vesícula secretora es fusiona amb la<br />
membrana plasmàtica, la seva membrana passa a<br />
formar-ne part. Perquè l’àrea de la membrana<br />
plasmàtica no augmenti sense control, constantment<br />
són eliminats de la superfície cel·lular components de<br />
la membrana a través d’endocitosi, en un procés<br />
igual de ràpid que l’addició d’aquests per exocitosi.<br />
Aquests components que s’eliminen de la membrana<br />
plasmàtica poden ser utilitzades de nou, per tant aquest és un procés de<br />
reciclatge de membranes.<br />
Les cèl·lules nervioses utilitzen un altre tipus de vesícules de secreció:<br />
les vesícules sinàptiques (d’uns 50 nm de diàmetre), que emmagatzemen<br />
neurotransmissors petits que s’utilitzen en les sinapsis químiques perquè dues<br />
cèl·lules es comuniquin ràpidament. Aquestes són alliberades molt ràpid quan<br />
arriba un potencial d’acció al terminal nerviós. Aquestes vesícules no es<br />
generen a partir del Golgi sinó a partir dels endosomes, en el procés de<br />
reciclatge local de la membrana plasmàtica.<br />
50
Com que la majoria de les cèl·lules dels teixits estan polaritzades (i tenen<br />
dos o més dominis de membrana als que s’hi dirigeixen les vesícules<br />
secretores), es distingeixen dos tipus de membranes: l’apical, que dóna al<br />
lumen, i la basolateral, que comprén la resta de la cèl·lula.<br />
Els seus dominis són diferents: la regió apical està composta per glucolípids i<br />
per les proteïnes de la membrana plasmàtica que estan unides a la bicapa<br />
lipídica amb GPI (glucosilfosfatidilinositol). El senyal que fa que un cèl·lula sigui<br />
apical o basal és una regió de proteïna GPI, que es troba en algunes.<br />
Les proteïnes que estan destinades a cada una de les membranes hi poden<br />
arribar de dues maneres:<br />
- Directament des del Golgi<br />
(sorting directe). Les<br />
molècules destinades a la<br />
membrana apical s’envien a<br />
la membrana apical, i les<br />
destinades a la basolateral<br />
s’envien a la basolateral. (A)<br />
- Indirectament (sorting<br />
indirecte). El Golgi envia<br />
totes les proteïnes de<br />
membrana cap al mateix<br />
domini (en el cas de la<br />
imatge les envia totes a la<br />
membrana basolateral), i<br />
des d’allà les proteïnes<br />
destinades a l’altra<br />
membrana són enviades<br />
cap allà via endosomes (en un procés que es diu transcitosi). (B)<br />
51
6. SUBSTRATS DE LES CASPASES EFECTORES<br />
Els substrats de les caspases efectores seran proteïnes clau per al<br />
funcionament de la cèl·lula:<br />
-Proteïnes de la làmina nuclear: ja que d’aquesta manera es trencarà<br />
el nucli que la càl·lula necessita per a viure.<br />
-Proteïnes del citoesquelet: ja que d’aquesta manera la càl·lula perdrà<br />
la seua forma i es podrà trencar més fàcilment.<br />
-ICAD inhibidor de la desoxiribonucleasa CAD: CAD és el que fa<br />
tallar el DNA a trossets. Les caspases eliminen ICAD i així s’activa la<br />
nucleasa que talla el DNA.<br />
286