Filogenia y clasificación

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Métodos discretos: Máxima parsimonia (ver caso en cladismo). Busca el árbol de menor número de pasos que explique nuestros datos. Máximum likelihood A partir de los datos que le damos, calcula el árbol de mayor verosimilitud, es decir, calcula el árbol con mayor probabilidad de explicar los datos que observamos.
Ejercicio: Hacer filogenia de un grupo de datos. 1.- Buscar una secuencia útil de algún bicho.http://www.ncbi.nlm.nih.gov/ 2.- Buscar secuencias homólogas mediante la herramienta Blast (descargar o en http://www.ncbi.nlm.nih.gov/) 3.- Descargar las secuencias homólogas (u obtener en lab) 4.- Establecer correspondencia de homología base por base mediante el método de alineación. (Mediante el programa BioEdit: ( http://www.mbio.ncsu.edu/BioEdit/BioEdit.html) 5.- Estimar filogenia mediante algún método y con el programa MEGA (
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