Marcadores moleculares asociados a la calidad de la canal y ... - Inia
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<strong>Marcadores</strong> <strong>molecu<strong>la</strong>res</strong><br />
<strong>asociados</strong> a <strong>la</strong> <strong>calidad</strong> <strong>de</strong> <strong>la</strong><br />
<strong>canal</strong> y <strong>la</strong> carne<br />
Lic. Eileen Armstrong, MSc. PhD.<br />
Área Genética<br />
Facultad <strong>de</strong> Veterinaria
ADN<br />
molécu<strong>la</strong> que contiene <strong>la</strong> información genética<br />
En TODAS <strong>la</strong>s célu<strong>la</strong>s <strong>de</strong>l individuo<br />
(cromosomas).<br />
No cambia a lo <strong>la</strong>rgo <strong>de</strong> <strong>la</strong> vida <strong>de</strong>l animal.<br />
Contiene los GENES.<br />
Gen: porción <strong>de</strong>l ADN con <strong>la</strong> información necesaria para<br />
generar una <strong>de</strong>terminada proteína.<br />
Genoma: conjunto <strong>de</strong> ADN (con todos los genes) <strong>de</strong> una<br />
especie.
• Polimorfismo <strong>de</strong> un solo<br />
nucleótido.<br />
SNP<br />
• Cambia una base <strong>de</strong>l ADN.<br />
• Genera variantes para un<br />
mismo gen.<br />
• Pue<strong>de</strong>n estar <strong>de</strong>ntro <strong>de</strong> genes<br />
o en otras regiones <strong>de</strong>l ADN.<br />
• Marcador genético.
• Se conocen ya varios genes y SNPs re<strong>la</strong>cionados al<br />
<strong>de</strong>sarrollo y metabolismo <strong>de</strong>l músculo y tejidos<br />
<strong>asociados</strong> (adiposo, conectivo).<br />
• Especialmente en bovinos, suinos y aves, pero también<br />
en ovinos.<br />
• Línea <strong>de</strong> investigación en Área Genética <strong>de</strong> <strong>la</strong> Facultad<br />
<strong>de</strong> Veterinaria: genética molecu<strong>la</strong>r <strong>de</strong> <strong>la</strong> <strong>calidad</strong> <strong>de</strong> <strong>la</strong><br />
carne bovina y ovina.<br />
• Objetivos:<br />
– contribuir a <strong>de</strong>tectar esos genes y SNPs.<br />
– analizar cómo interactúan y cómo se asocian a<br />
características productivas.<br />
– posibilitar <strong>la</strong> selección <strong>de</strong> animales que tengan <strong>la</strong>s<br />
mejores variantes genéticas.
Para eso se necesitan:<br />
• muestras <strong>de</strong><br />
ADN <strong>de</strong> los<br />
animales<br />
Mediante análisis<br />
estadísticos se<br />
<strong>de</strong>tectan<br />
asociaciones<br />
• datos<br />
productivos<br />
(peso vivo, área<br />
<strong>de</strong>l ojo <strong>de</strong>l bife,<br />
peso <strong>de</strong> <strong>canal</strong>,<br />
% <strong>de</strong> grasa,<br />
terneza, etc…)
Proyecto “Asociación <strong>de</strong> SNPs <strong>de</strong> genes candidatos con<br />
caracteres <strong>de</strong> <strong>calidad</strong> <strong>de</strong> <strong>la</strong> carne y <strong>la</strong> <strong>canal</strong> en ovinos”<br />
• Análisis <strong>de</strong> 30<br />
SNPs en genes<br />
específicos<br />
(análisis primario)<br />
Mediante análisis<br />
estadísticos se<br />
<strong>de</strong>tectan<br />
asociaciones<br />
Proyecto en ejecución. Financiación: ANII<br />
• Datos tomados<br />
<strong>de</strong> <strong>la</strong> Prueba <strong>de</strong><br />
Progenie y<br />
Evaluación<br />
Genética<br />
Pob<strong>la</strong>cional <strong>de</strong><br />
Texel, así como<br />
<strong>de</strong> otras<br />
pob<strong>la</strong>ciones<br />
ovinas.
Animales:<br />
Raza TEXEL:<br />
• 494 cor<strong>de</strong>ros<br />
(generaciones 2008, 2009 y 2010)<br />
• 42 carneros<br />
• 282 madres<br />
Otras razas y cruzas <strong>de</strong> razas carniceras:<br />
• 546 cor<strong>de</strong>ros <strong>de</strong> EEMAC
Características medidas en los cor<strong>de</strong>ros:<br />
Pre faena:<br />
• -ganancia diaria <strong>de</strong> peso<br />
• -pesos a diferentes eda<strong>de</strong>s y peso final vivo<br />
• -estado corporal<br />
• -área <strong>de</strong>l ojo <strong>de</strong>l bife y espesor <strong>de</strong> grasa por ultrasonido<br />
Post mortem:<br />
• -conformación <strong>de</strong> carcasa, medidas y compacidad<br />
• -peso <strong>de</strong> <strong>la</strong> <strong>canal</strong> caliente y fría<br />
• -dimensiones <strong>de</strong>l L. dorsi y área <strong>de</strong>l ojo <strong>de</strong> bife medidos en el rack<br />
• -espesor <strong>de</strong> grasa subcutánea<br />
• -peso cortes con hueso<br />
• -terneza instrumental<br />
• -panel <strong>de</strong> <strong>de</strong>gustación (terneza, sabor, aceptabilidad)<br />
• -pH<br />
• -color <strong>de</strong> <strong>la</strong> carne y <strong>la</strong> grasa<br />
• -cantidad <strong>de</strong> grasa intramuscu<strong>la</strong>r<br />
Base <strong>de</strong> datos muy valiosa para <strong>la</strong> investigación!
BANCO DE ADN<br />
• Extracción <strong>de</strong> ADN genómico <strong>de</strong> sangre y<br />
músculo.<br />
• Banco: en el Área Genética <strong>de</strong> F.Vet y en INIA<br />
• 1322 muestras <strong>de</strong> ADN (en procesamiento)<br />
• A<strong>de</strong>más: muestras <strong>de</strong> carne conge<strong>la</strong>da y en<br />
alcohol (respaldos).<br />
• Cada muestra perfectamente i<strong>de</strong>ntificada con el<br />
ID <strong>de</strong>l animal y sus datos.
Genes a analizar en esta etapa<br />
• CAPN1 (calpaína; proteólisis <strong>de</strong> fibras muscu<strong>la</strong>res, terneza)<br />
• LEPTINA (hormona <strong>de</strong>l apetito; engor<strong>de</strong>)<br />
• GH y GHR (hormona <strong>de</strong> crecimiento y receptor; <strong>de</strong>sarrollo corporal)<br />
• CAST (calpastatina; proteólisis <strong>de</strong> fibras muscu<strong>la</strong>res, terneza)<br />
• FABP9 (fatty acid binding protein 9; metabolismo lipídico y engor<strong>de</strong>)<br />
• FABP4 (fatty acid binding protein 4; metabolismo lipídico y engor<strong>de</strong>)<br />
• IGF1 (insulin growth factor 1; <strong>de</strong>sarrollo corporal y engor<strong>de</strong>)<br />
• GDF8 (growth differentiation factor 8; miostatina, <strong>de</strong>sarrollo muscu<strong>la</strong>r)<br />
• (entre otros)<br />
• Selección <strong>de</strong> SNPs en estos genes, basándonos en datos<br />
<strong>de</strong> <strong>la</strong> secuenciación <strong>de</strong>l genoma ovino.
Base <strong>de</strong> datos Genoma Ovino<br />
• Genoma <strong>de</strong> referencia: Texel
Ya contamos con:<br />
• Fenotipos (mediciones en los animales)<br />
• Muestras <strong>de</strong> ADN <strong>de</strong> 814 animales<br />
(banco, el cual sigue aumentando)<br />
Próximamente: genotipado <strong>de</strong> SNPs en los<br />
genes mencionados en el total <strong>de</strong><br />
muestras <strong>de</strong>l banco y análisis estadísticos<br />
<strong>de</strong> asociación genotipo-fenotipo.
Resultados esperados:<br />
• Detección <strong>de</strong> genes <strong>asociados</strong> a <strong>calidad</strong> <strong>de</strong> <strong>la</strong><br />
carne y <strong>la</strong> <strong>canal</strong> ovina.<br />
• Validación <strong>de</strong> marcadores (genes) presentes en<br />
kits comerciales.<br />
• Posibilidad <strong>de</strong> implementar Selección Asistida<br />
por <strong>Marcadores</strong> para aumentar progreso<br />
genético.
Proyecciones<br />
• Genotipado masivo <strong>de</strong>l genoma (mismos animales <strong>de</strong>l<br />
banco <strong>de</strong> ADN, con datos fenotípicos).<br />
• Chip 700k (aprox. 700.000 SNPs; en construcción)<br />
• Estudio global <strong>de</strong> genes <strong>asociados</strong> a <strong>calidad</strong> <strong>de</strong> <strong>la</strong> carne.<br />
• Generar información útil para posible selección<br />
genómica?<br />
Objetivos finales:<br />
• Mejorar <strong>calidad</strong> <strong>de</strong> <strong>la</strong> <strong>canal</strong> y <strong>la</strong> carne ovina.<br />
• Aumentar valor agregado <strong>de</strong>l producto y <strong>de</strong> los<br />
reproductores.
“Asociación <strong>de</strong> SNPs <strong>de</strong> genes candidatos con caracteres <strong>de</strong><br />
<strong>calidad</strong> <strong>de</strong> <strong>la</strong> carne y <strong>la</strong> <strong>canal</strong> en ovinos”<br />
Facultad <strong>de</strong> Veterinaria<br />
INIA<br />
SUL<br />
Facultad <strong>de</strong> Agronomía<br />
Scottish Agricultural College<br />
Sociedad <strong>de</strong> Criadores <strong>de</strong> Texel <strong>de</strong>l Uruguay<br />
Financiación: Fondo InnovAgro - Agencia Nacional <strong>de</strong><br />
Investigación e Innovación (ANII), INIA.<br />
Duración: febrero 2011 a febrero 2013.
gracias!!!