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Mejoramiento del diagnóstico molecular de la distrofia miotónica ...

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<strong>Mejoramiento</strong> <strong><strong>de</strong>l</strong> diagnóstico <strong>molecu<strong>la</strong>r</strong> <strong>de</strong> <strong>la</strong> <strong>distrofia</strong> miotónica<br />

tipo 1 mediante el estudio <strong><strong>de</strong>l</strong> mosaicismo somático<br />

Investigadora principal <strong>de</strong>s<strong>de</strong> julio 2007 hasta marzo <strong><strong>de</strong>l</strong> 2009<br />

Patricia Eugenia Cuenca Berger.<br />

Magíster Scienteae en Biología <strong>de</strong> <strong>la</strong> Universidad <strong>de</strong> Costa Rica.<br />

Doctora en Ciencias Naturales <strong>de</strong> <strong>la</strong> Universidad <strong>de</strong> Hamburgo, Alemania<br />

Profesora <strong>de</strong> <strong>la</strong> Escue<strong>la</strong> <strong>de</strong> Medicina.<br />

Investigador principal marzo 2009-2010<br />

Fernando Alberto Morales Montero.<br />

Magíster Scienteae en Biología <strong>de</strong> <strong>la</strong> Universidad <strong>de</strong> Costa Rica.<br />

Doctor en Genética Molecu<strong>la</strong>r Humana <strong>de</strong> <strong>la</strong> Universidad <strong>de</strong> G<strong>la</strong>sgow,<br />

Escocia, Reino Unido.<br />

Profesor <strong>de</strong> <strong>la</strong> Escue<strong>la</strong> <strong>de</strong> Medicina.<br />

Investigadores asociados:<br />

Roberto Brian Gago, Médico, Neurólogo Infantil, Hospital Nacional <strong>de</strong> Niños. Profesor <strong>de</strong> <strong>la</strong><br />

Escue<strong>la</strong> <strong>de</strong> Medicina, UCR.<br />

Mauricio Sittenfeld Appel, Neurólogo, Hospital San Juan <strong>de</strong> Dios. Profesor <strong>de</strong> <strong>la</strong> Escue<strong>la</strong> <strong>de</strong><br />

Medicina, UCR.<br />

Huberth Fernán<strong>de</strong>z Morales, Neurólogo, Hospital Cal<strong>de</strong>rón Guardia.<br />

Melissa Vásquez Cerdas, Magíster Scienteae en Biología con énfasis en Genética y Biología<br />

Molecu<strong>la</strong>r.<br />

Unidad <strong>de</strong> Investigación<br />

Instituto <strong>de</strong> Investigaciones en Salud (INISA), Universidad <strong>de</strong> Costa Rica.<br />

La <strong>distrofia</strong> miotónica tipo 1 (DM1) es consi<strong>de</strong>rada <strong>la</strong> enfermedad muscu<strong>la</strong>r hereditaria más<br />

común en adultos jóvenes, sin embargo afecta también otros sistemas en grado variable a los<br />

diferentes pacientes, <strong>de</strong> tal manera que algunos individuos afectados pue<strong>de</strong>n presentar diabetes<br />

tipo 2, atrofia <strong>de</strong> los testículos, cataratas, calvicie frontal, problemas <strong>de</strong> aprendizaje o abortos a<br />

repetición en el caso <strong>de</strong> <strong>la</strong>s mujeres. Se caracteriza por ser <strong>de</strong>generativa y tener un patrón <strong>de</strong><br />

herencia autosómico dominante, lo cual significa que <strong>la</strong>s personas afectadas por <strong>la</strong> enfermedad<br />

tienen un 50% <strong>de</strong> riesgo <strong>de</strong> heredar<strong>la</strong> a cada uno <strong>de</strong> sus hijos. La edad en que se empiezan a<br />

manifestar los primeros síntomas también es muy variable, <strong>la</strong> forma leve pue<strong>de</strong> iniciar su<br />

manifestación en los adultos mayores, <strong>la</strong> forma clásica en adultos jóvenes, <strong>la</strong> forma pediátrica en


niños y adolescentes y <strong>la</strong> forma congénita <strong>de</strong>s<strong>de</strong> el nacimiento.<br />

La mutación o alteración a nivel <strong>de</strong> <strong>la</strong> molécu<strong>la</strong> <strong>de</strong> ADN consiste en una expansión<br />

anormal <strong>de</strong> <strong>la</strong> repetición <strong>de</strong> un trinucleótido CTG: Citosina, Timina, Guanina; localizada en uno <strong>de</strong><br />

los extremos <strong><strong>de</strong>l</strong> gen que codifica para <strong>la</strong> proteína-quinasa <strong>de</strong> <strong>la</strong> <strong>distrofia</strong> miotónica (DMPK). Los<br />

pacientes afectados presentan entre 50 y más <strong>de</strong> 2000 repeticiones CTG. El diagnóstico <strong>molecu<strong>la</strong>r</strong><br />

<strong>de</strong> <strong>la</strong> DM1 se realiza por medio <strong>de</strong> un método bioquímico (hibridación <strong>de</strong> Southern) que mi<strong>de</strong> el<br />

tamaño <strong>de</strong> los fragmentos <strong>de</strong> ADN don<strong>de</strong> se localiza <strong>la</strong> expansión. Estos fragmentos provienen <strong>de</strong><br />

miles <strong>de</strong> célu<strong>la</strong>s obtenidas <strong>de</strong> <strong>la</strong> sangre periférica <strong>de</strong> los pacientes. La expansión <strong>de</strong> <strong>la</strong> repetición<br />

CTG ocurre a diferente ritmo y pue<strong>de</strong> ser <strong>de</strong> diferente tamaño en <strong>la</strong>s diferentes célu<strong>la</strong>s <strong>de</strong> un<br />

mismo paciente, por lo cual se dice que esta enfermedad presenta mosaicismo somático. Esto<br />

provoca que cuando se lee el resultado <strong>de</strong> <strong>la</strong>s pruebas <strong>de</strong> <strong>la</strong>boratorio, aparezca una banda difusa<br />

(mancha) en lugar <strong>de</strong> una banda <strong>de</strong>finida, como ocurre normalmente cuando se analizan<br />

muestras <strong>de</strong> personas normales (Ver figura 1). Debido a esto, <strong>la</strong> costumbre ha sido medir el<br />

punto medio <strong>de</strong> <strong>la</strong> mancha y reportar este tamaño como el resultado <strong><strong>de</strong>l</strong> análisis <strong><strong>de</strong>l</strong> <strong>la</strong>boratorio<br />

Figura 1: Autorradiografía <strong>de</strong> una hibridación <strong>de</strong> Southern para el gen DMPK en pacientes afectados con<br />

<strong>distrofia</strong> miotónica tipo 1 y una persona normal. De izquierda a <strong>de</strong>recha: en el primer carril se observan dos bandas<br />

<strong>de</strong> ADN pertenecientes a una persona sana, una <strong>de</strong> 9.800 pares <strong>de</strong> bases (pb) y otra <strong>de</strong> 8.600. El segundo carril muestra<br />

el gen <strong>de</strong> un paciente afectado, con una banda normal <strong>de</strong> 9.800 pb y una banda con expansión <strong>de</strong> 12.000 pb. En el tercer<br />

carril <strong>la</strong> banda normal es <strong>de</strong> 8.600 pb y <strong>la</strong>s expansiones <strong>de</strong> diferente tamaño provocan una mancha en lugar <strong>de</strong> una banda<br />

<strong>de</strong>finida, por lo que se reporta el tamaño promedio, en este caso 14.000 pares <strong>de</strong> bases. Lo mismo ocurre con el paciente


cuyo ADN se muestra en el último carril, <strong>la</strong> expansión forma una mancha cuyo tamaño promedio es <strong>de</strong> 12.000 pb.<br />

que se envía al médico tratante. Este dato se ha usado por parte <strong>de</strong> los científicos para tratar <strong>de</strong><br />

enten<strong>de</strong>r <strong>la</strong>s diferencias clínicas que presentan los pacientes con re<strong>la</strong>ción al tamaño <strong>de</strong> <strong>la</strong><br />

expansión que portan, así como para tratar <strong>de</strong> pre<strong>de</strong>cir a que edad los portadores podrían<br />

empezar a manifestar los primeros síntomas <strong>de</strong> <strong>la</strong> enfermedad. En términos generales se ha<br />

observado que mientras más repeticiones CTG posea el paciente, más temprano en <strong>la</strong> vida<br />

manifestará <strong>la</strong> enfermedad y en forma más severa. Sin embargo, <strong>de</strong>finir el tamaño <strong>de</strong> <strong>la</strong> mutación<br />

como el promedio <strong><strong>de</strong>l</strong> tamaño <strong>de</strong> todas <strong>la</strong>s célu<strong>la</strong>s que aportaron el ADN a <strong>la</strong> muestra <strong><strong>de</strong>l</strong> paciente<br />

no ha sido <strong>de</strong> ayuda para que los médicos puedan establecer <strong>la</strong> edad <strong>de</strong> inicio ni tampoco el<br />

pronóstico <strong>de</strong> <strong>la</strong> enfermedad. El tamaño observado <strong>de</strong> <strong>la</strong> mutación con el método usado en <strong>la</strong><br />

actualidad <strong>de</strong>pen<strong>de</strong> <strong>de</strong> <strong>la</strong> edad; mientras más edad tenga el paciente más gran<strong>de</strong> <strong>la</strong> mancha, con<br />

ten<strong>de</strong>ncia a <strong>la</strong> <strong>de</strong>saparición <strong>de</strong> los fragmentos <strong>de</strong> ADN con tamaños más pequeños; el tipo <strong>de</strong><br />

tejido (sangre, piel o músculo por ejemplo) y <strong>la</strong> ten<strong>de</strong>ncia a <strong>la</strong> expansión <strong><strong>de</strong>l</strong> mosaicismo somático<br />

presente en los pacientes. Con el fin <strong>de</strong> contribuir a <strong>de</strong>terminar el tamaño real <strong>de</strong> <strong>la</strong> mutación que<br />

cada paciente heredó <strong>de</strong> su progenitor afectado, con <strong>la</strong> mínima interferencia <strong>de</strong> los factores<br />

asociados, en este proyecto se aplicó una metodología diagnóstica más precisa que podría brindar<br />

más información al médico tratante, conocida como, <strong>la</strong> small-pool PCR (SP-PCR). Este<br />

procedimiento permite resolver <strong>la</strong> mancha observada mediante <strong>la</strong> hibridación <strong>de</strong> Southern en<br />

célu<strong>la</strong>s individuales, permitiendo así, estudiar y cuantificar más <strong>de</strong>tal<strong>la</strong>damente, el mosaicismo<br />

somático (o los niveles <strong>de</strong> inestabilidad) en cada paciente. A<strong>de</strong>más, mediante este procedimiento,<br />

es factible estimar el tamaño que tenía <strong>la</strong> expansión CTG en <strong>la</strong> célu<strong>la</strong> progenitora (óvulo o<br />

espermatozoi<strong>de</strong>), así como también estudiar en <strong>de</strong>talle como ocurren <strong>la</strong>s expansiones en <strong>la</strong>s<br />

célu<strong>la</strong>s <strong>de</strong> sangre periférica (ver Fig. 2 y Fig. 3).


Figura 2. La SP-PCR consiste en diluir el ADN purificado <strong>de</strong> cada paciente hasta alcanzar una concentración equivalente<br />

al ADN <strong>de</strong> una o unas cuantas célu<strong>la</strong>s, y luego someterlo a amplificación mediante <strong>la</strong> reacción en ca<strong>de</strong>na <strong>de</strong> <strong>la</strong> polimerasa<br />

bajo condiciones especiales, <strong>de</strong> tal manera que en <strong>la</strong>s autorradiografías se pue<strong>de</strong>n observar bandas que correspon<strong>de</strong>n al<br />

tamaño <strong>de</strong> una única molécu<strong>la</strong> <strong>de</strong> ADN. Este figura muestra los resultados <strong>de</strong> <strong>la</strong> SP-PCR en tres pacientes con DM1 que<br />

manifestaron <strong>la</strong> enfermedad a eda<strong>de</strong>s diferentes, en don<strong>de</strong> aparecen tres tamaños medidos: S=tamaño medido por medio<br />

<strong>de</strong> <strong>la</strong> hibridación <strong>de</strong> Southern; I=tamaño <strong><strong>de</strong>l</strong> alelo progenitor medido por medio <strong>de</strong> <strong>la</strong> SP-PCR; N=tamaño normal medido<br />

por medio <strong>de</strong> <strong>la</strong> SP-PCR. El tamaño <strong><strong>de</strong>l</strong> alelo progenitor es el que estamos usando para establecer <strong>la</strong>s corre<strong>la</strong>ciones clínicas<br />

en <strong>la</strong> DM1.<br />

Los datos obtenidos mediante este método pue<strong>de</strong>n mejorar mucho <strong>la</strong> información predictiva<br />

que se le brinda a los pacientes sobre su enfermedad.<br />

El objetivo principal <strong>de</strong> este proyecto fue implementar <strong>la</strong> SP-PCR con el fin <strong>de</strong> <strong>de</strong>terminar el<br />

tamaño <strong>de</strong> <strong>la</strong> mutación heredada <strong><strong>de</strong>l</strong> progenitor y su re<strong>la</strong>ción con <strong>la</strong> variación <strong>de</strong> tamaño <strong>de</strong> <strong>la</strong><br />

expansión en diferentes célu<strong>la</strong>s (mosaicismo somático), así como analizar <strong>la</strong> re<strong>la</strong>ción que podría<br />

tener el tamaño progenitor con <strong>la</strong> severidad y progresión <strong>de</strong> <strong>la</strong> enfermedad en los pacientes<br />

estudiados.<br />

RESULTADOS<br />

El proyecto ha estudiado 210 pacientes pertenecientes a 65 familias no emparentadas. En<br />

este grupo <strong>de</strong> pacientes están representados todos los grados <strong>de</strong> severidad <strong>de</strong> <strong>la</strong> enfermedad,


leve, clásica, pediátrica y congénita.<br />

Utilizando el tamaño <strong><strong>de</strong>l</strong> gen heredado <strong><strong>de</strong>l</strong> progenitor afectado en lugar <strong><strong>de</strong>l</strong> tamaño obtenido<br />

por medio <strong>de</strong> <strong>la</strong> hibridación <strong>de</strong> Southern, se mejora significativamente <strong>la</strong> capacidad <strong>de</strong> pre<strong>de</strong>cir <strong>la</strong><br />

edad <strong>de</strong> inicio (se explica un 65% <strong>de</strong> <strong>la</strong> variación en <strong>la</strong> edad <strong>de</strong> inicio) y se pue<strong>de</strong> brindar una<br />

mejor información pronóstica a cada paciente afectado.<br />

A<strong>de</strong>más, el tamaño <strong><strong>de</strong>l</strong> gen heredado <strong><strong>de</strong>l</strong> progenitor afectado y <strong>la</strong> edad <strong><strong>de</strong>l</strong> paciente,<br />

contribuyen <strong>de</strong> manera importante al mosaicismo somático, o sea a los niveles <strong>de</strong> inestabilidad<br />

<strong>de</strong> esta mutación (estos dos factores explican un 65% <strong>de</strong> <strong>la</strong> variación en los niveles <strong>de</strong><br />

inestabilidad).<br />

Sin embargo, algunas veces <strong>la</strong> medida <strong><strong>de</strong>l</strong> tamaño <strong><strong>de</strong>l</strong> gen heredado <strong><strong>de</strong>l</strong> progenitor afectado<br />

pue<strong>de</strong> ser difícil, por lo cual estamos utilizando <strong>la</strong> SP-PCR para cuantificar los niveles <strong>de</strong><br />

inestabilidad en dos momentos diferentes <strong><strong>de</strong>l</strong> mismo paciente. En estos momentos tenemos<br />

resultados <strong>de</strong> un subgrupo <strong>de</strong> muestras <strong>de</strong> 60 pacientes en don<strong>de</strong> hemos estimado el alelo<br />

progenitor en una segunda toma <strong>de</strong> muestra <strong>de</strong> sangre, para algunos casos aún <strong>de</strong>spués <strong>de</strong> 10<br />

años <strong><strong>de</strong>l</strong> análisis <strong>de</strong> <strong>la</strong> primera muestra. En 11 <strong>de</strong> esos pacientes el tamaño <strong>de</strong> <strong>la</strong> mutación<br />

medido en los dos momentos fue diferente, lo que indica que en estos 11 pacientes <strong>la</strong> dinámica<br />

mutacional es mucho mayor que en los otros 49 pacientes (es <strong>de</strong>cir que <strong>la</strong> expansión aumenta<br />

más rápidamente). Una tercera toma <strong>de</strong> muestra en los mismos pacientes, permitiría analizar<br />

como el mosaicismo somático y <strong>la</strong> dinámica <strong>de</strong> <strong>la</strong> mutación DM1 influyen en <strong>la</strong> capacidad<br />

experimental <strong>de</strong> medir el alelo progenitor. De igual manera, permitiría confirmar si los factores<br />

que hasta ahora hemos i<strong>de</strong>ntificado como importantes, son realmente los que están<br />

<strong>de</strong>terminando los niveles <strong>de</strong> inestabilidad <strong>de</strong> <strong>la</strong> mutación en esta enfermedad.


Figura. 3 Del análisis por SP-PCR <strong><strong>de</strong>l</strong> ADN <strong>de</strong> unas 100 célu<strong>la</strong>s por cada paciente se logra cuantificar los niveles <strong>de</strong><br />

inestabilidad <strong>de</strong> <strong>la</strong> mutación, permitiendo usar esta información para encontrar <strong>la</strong> re<strong>la</strong>ción entre los niveles <strong>de</strong><br />

inestabilidad, <strong>la</strong> edad <strong>de</strong> manifestación <strong>de</strong> los primeros síntomas y progresión <strong>de</strong> <strong>la</strong> enfermedad.

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