Introduction : - GENET

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Changement rapide des protéines informationnelles dans la branche bactérienne. Eucaryotes Bactéries Bactéries Archaea Bactéries Eucaryotes Archaea Archaea Eucaryotes LUCA LUCA LUCA Protéines informationnelles de type archae-eucaryote 23 Figure I- 11.Les différentes racines possibles de l’arbre universel. En 2001 on disposait de • 28 génomes B complets • 10 génomes A complets • 5 génomes E complets. La génomique confirme l’existence des trois domaines avec des protéines spécifiques à chacun d’eux. Tous sont monophylétiques (ce qui élimine une hypothèse selon laquelle les A auraient été divisées en 2 EuryA (plus proches de B) et CrénoA (plus proches de E).
( ) Domaine Energie Information Classes Communication Hypothétique Total Universel ABE 178 103 20 23 324 Non eucaryote AB 264 94 32 132 522 Non bactérien AE 10 79 7 27 123 Archéen A 80 34 11 662 787 Total 532 310 70 844 1756 A ABE AE AB 21 Figure I- 12. Résultats de la comparaison des génomes complets des trois domaines On retrouve parmi les protéines appartenant à plusieurs domaines ABE, AB, AE et EB. Il a donc dû y avoir du transfert latéral de gène sans doute plus important qu’on ne le pense. En particulier entre organismes qui ont partagé le même environnement : • les bactéries hyperthermophiles Aquifex et Thermotoga ont plus de protéines de type archéen que de protéines de type bactérien mésophiles • l’ Archébactérie thermoacidophile Thermoplasma acidophilum (euryA) présente plus de protéines apparentées à Sulfolobus solfataricus (crénoA) qui vit dans le même milieu que de protéines de type Eurybactérien. • L’examen de l’arbre phylogénique de la réverse gyrase qui n’existe que chez les hyperthermophiles met également en évidence des transferts latéraux
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