HPC Life Sciences - TF

LIFE SCIENCES
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Life Sciences – les
sciences de la vie
Actuellement, la recherche fondamentale dans le domaine des
sciences de la vie et de la médecine n‘est plus réalisable sans
soutien de systèmes de calcul performants.
Tout récemment, la recherche sur les pathologies cardiovasculaires
a conduit à considérer l’écoulement sanguin dans les vaisseaux
comme un modèle fluide-structure. Conduisant ainsi à un
besoin croissant en solutions de calcul hautes performances
pour avoir des résultats de simulation de plus en plus fidèles à
la réalité avec des temps de calcul raisonnables.
Biochimie
Chimie théorique
Bio-informatique
Chimie physique
Biologie moléculaire
Dynamique moléculaire
Chimie quantique
Visualisation
Arrimage moléculaire
Recherche génétique
Séquençage nouvelle génération
Repliement de protéines
Structures moléculaires
Anticorps artificiels
Hartree-Fock
Théorie de la fonctionnelle de la densité
Structures orbitales
Équation de Schrödinger
transtec dispose de la gamme complète de solutions permettant de répondre à toute la
chaine de simulation, allant du pré-traitement (avec nos partenaires de logiciels de maillages)
jusqu’au post-traitement (avec nos solutions de visualisation et stockage de données)
en passant par nos clusters de calculs intégrant les toutes dernières et plus puissantes
technologies. Nous sommes également disponibles à répondre à vos besoins en
termes de librairies parallèles (OpenMPI, MPICH, OpenMP, GPU) avec les outils du génie logiciel
parallèle qui vont avec (debuggers, profilers, analyseurs de performances...). Nos experts
systèmes sont aussi en mesure de vous conseiller, de vous aiguiller sur les dernières
versions de systèmes d’exploitation adaptées à vos solutions HPC et d’assurer leurs installations,
configurations et mises à jour.

Sur des systèmes transtec destinés au domaine des
sciences de la vie, nos clients calculent :
BarraCUDA
SOAP3 et SOAP3-dp
SeqNFind
VASP
AMBER
CHARMM
ESPResSO
GROMACS
LAMMPS
NAMD
GAMESS
Gaussian
LATTE
VMD
et bien plus encore…
Précisément pour les exigences spéciales en termes
de rendu 3D dans le contexte des sciences de la vie, le
logiciel NICE DCV combiné au portail de travail Engin-
Frame joue un rôle important et a pour objectif premier
de transmettre les graphiques d’applications 3D ou
OpenGL de façon performante via des liaisons WAN ou
Internet avec une faible bande passante et une latence
élevée. Outre une meilleure exploitation de l’ensemble
du matériel IT, le client profite aussi d’une solution optimisée
de collaboration entre différents sites et de gestion
centrale de données.
Nous intégrons toutes les applications dans un workload
manager comme le client l’entend et les rendons
disponibles aux utilisateurs par le biais de scripts Submit
confortables ou sur un portail Web. Une puissance
de calcul maximale et une utilisation simple sont ainsi
réunies en une solution globale qui procure au client
une productivité supérieure.
Une solution de transtec sous-entend également : suivi
et service octroyés au client de A à Z. Depuis le conseil
individuel jusqu’aux prestations d’assistance aux opérations
et services gérés sans oublier une assistance
technique complète. Chez transtec, vous obtenez un
programme complet de prestations, entièrement auprès
d’un seul partenaire.
transtec conçoit et implémente des solutions configurées
individuellement pour le post-traitement à distance
afin de procurer au client une optimisation globale
du workflow et une consolidation des données.

transtec360-Services
en un coup d‘œil
Conseil compétent et personnalisé
Conception de la solution HPC spécifique à l’application
Test Burn-In de 24 heures des systèmes
Installation et configuration par des ingénieurs HPC chevronnés
Assistance complète à l’exploitation et services gérés
Aide rapide et flexible
Compétence – Professionnalisme – Fiabilité – tout auprès d’un seul partenaire
transtec S.A.R.L
www.transtec.fr
transtec.fr@transtec.fr