ANTIFONGIGRAMME :

ANTIFONGIGRAMME : 

Evaluation de la carte AST-YSO1® 

Gloor Ariane 

ICHV , laboratoire de bactériologie, Sion 

Travail de diplôme 

2008-2009 

sur l’automateVitek2 ® 

Responsable de Stage : 

Mme Lysiane Tissières Lovey

Comparaison de méthode de deux antifongigrammes : ATB FUNGUS 3 ® et Carte Vitek AST-YS01® 

Table des matières 

1. Sommaire / Summary............................................................................................. 4 

2. Généralités ............................................................................................................. 5 

2.1 Bref historique ................................................................................................ 5 

2.2 Caractéristiques générales ............................................................................ 6 

2.3 Les Candida..................................................................................................... 7 

2.3.1 Candida albicans........................................................................................ 8 

2.3.2 Candida tropicalis..................................................................................... 10 

2.3.3 Candida glabrata ...................................................................................... 10 

2.3.4 Candida parapsilosis ................................................................................ 11 

2.3.5 Candida krusei.......................................................................................... 11 

2.3.6 Candida lusitaniae.................................................................................... 12 

2.3.7 Candida kefyr ........................................................................................... 13 

2.3.8 Candida guilliermondii .............................................................................. 13 

2.4 Les Cryptococcus......................................................................................... 14 

2.4.1 Cryptococcus neoformans........................................................................ 14 

2.5 Épidémiologie ............................................................................................... 15 

2.6 Clinique.......................................................................................................... 15 

2.7 Diagnostic...................................................................................................... 18 

2.7.1 Prélèvement ............................................................................................. 18 

2.7.2 Examen direct .......................................................................................... 18 

2.7.3 Culture...................................................................................................... 18 

2.7.4 Identification ............................................................................................. 18 

2.7.5 Antifongigramme ...................................................................................... 18 

2.8 Traitements.................................................................................................... 18 

3. Travail pratique......................................................................................................22 

3.1 Introduction ................................................................................................... 22 

3.2 Situation du travail dans son environnement ............................................ 22 

3.3 Objectifs......................................................................................................... 22 

3.4 Matériel et méthodologie.............................................................................. 23 

3.4.1 Matériel..................................................................................................... 23 

3.4.2 Présentation des techniques .................................................................... 24 

3.4.2.1 ATB FUNGUS 3 ®................................................................................ 24 

3.4.2.2 Carte Vitek AST-YS01®..................................................................... 27 

Gloor Ariane 2/62 



2008-2009


3.5 Analyse des résultats .................................................................................................. 30 

3.5.1 Premiers essais et actions correctives ..................................................... 30 

3.5.2 Explications des tableaux de résultats...................................................... 30 

3.6 Tableaux des résultats ................................................................................. 31 

3.7 Interprétation................................................................................................. 41 

3.7.1 Pourcentages de concordance et discordance entre l’ATB FUNGUS 3 ® et 

la Carte Vitek AST-YS01® ....................................................................... 41 

3.7.2 Pourcentages de concordance et discordance entre nos résultats et ceux 

obtenus dans l’étude précédente ............................................................. 44 

3.7.3 Reproductibilité......................................................................................... 44 

3.8 Discussion..................................................................................................... 45 

3.8.1 Avantages et inconvénients de l’ATB FUNGUS 3 ® ................................... 45 

3.8.2 Avantages et inconvénients de la carte Vitek AST-YS01®....................... 46 

3.9 Conclusion et synthèse................................................................................ 46 

3.10 Perspectives................................................................................................ 47 

4. Remerciements .....................................................................................................48 

5. Glossaire ...............................................................................................................48 

6. Bibliographie..........................................................................................................51 

6.1 Livre ............................................................................................................... 51 

6.2 Brochure ........................................................................................................ 51 

6.3 Supports de cours, documents non publiés .............................................. 51 

6.4 Internet........................................................................................................... 52 

7. Annexes.................................................................................................................53 

7.1 Procédure pour l’ATB FUNGUS 3 ®............................................................... 53 

7.2 Feuille de résultat pour l’ATB FUNGUS 3 ® .................................................. 54 

7.3 Résultats de l’étude précédente .................................................................. 55 




2008-2009


1. Sommaire 

Ces vingt dernières années, le nombre croissant de patients immunodéficients a 

généré une forte augmentation d’infections fongiques. Ces infections sont 

diagnostiquées de plus en plus précocement et traitées à l’aide de nouveaux 

antifongiques moins toxiques et mieux tolérés. La sensibilité des levures aux 

antifongiques doit être déterminée rapidement au moyen d’une méthode fiable. 

L’objectif de cette étude est d’évaluer la carte AST-YS01 ® sur l’automate Vitek2 ® et 

de comparer les résultats obtenus avec l’ATB FUNGUS 3® qui est la méthode utilisée 

actuellement. Nous avons testé 50 souches de Candida ainsi que 2 souches de 

référence ATCC. Ces souches avaient été testées dans une étude similaire. 

46/50 souches ont donné des résultats identiques avec les deux méthodes. 4 

souches ont donné des discordances mineures (2 avec le fluconazole, et 2 avec la 

flucytosine). Aucune discordance majeure n’a été observée. 

La carte AST-YS01 ® ne contient que 4 antifongiques et l’itraconazole n’est pas 

présent. Les CMI obtenues ont une meilleure précision ainsi qu’une bonne 

reproductibilité et sont interprétées par un automate. Le coût est légèrement plus 

élevé que celui de la galerie ATB FUNGUS 3® . La simplicité et la rapidité de 

préparation de l’analyse font que cette méthode est la plus adaptée au travail de 

routine d’un grand laboratoire de bactériologie. Cependant, l’ATB FUNGUS 3® reste 

une bonne alternative pour un laboratoire non automatisé. 

1. Summary 

These last twenty years, the growing number of immunodeficients patients generated 

a significant increase of fungal infections. These infections are diagnosed earlier and 

treated with new antifungal less toxic and better tolerated. The yeast sensibility for 

the antifungal must be fast determined by a sure method. 

The objectives of this study is to assess the AST-YS01 ® card on the automat Vitek2 ® 

and to compare results acquired with the ATB FUNGUS 3® which is the method used 

nowadays. We tested 50 strains of yeast as well as 2 reference ATCC strains. These 

strains had already been tested in a previous study. 

46/50 strains gave identical results with both methods. 4 strains gave minor 

discrepancies (2 with the fluconazol, and 2 with the flucytosine). No major 

discrepancy was observed. 

The AST-YS01 ® card contains only 4 antifungals and the itraconazol is not present. 

Acquired MIC has a better precision as well as a good reproducibility and is 

interpreted by an automat. The cost is a slightly higher then the other method. 

Simplicity and fastness of the preparation make this method more suitable for our 

laboratory. However, the ATB FUNGUS 3® is a good choise for a not automated 

laboratory. 




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2. Généralités 

Ces vingt dernières années, la mycologie médicale s’est fortement transformée avec 

une explosion d’infections fongiques. Chaque année, la liste des « nouveaux 

champignons » isolés s’allonge. C’est la conséquence du nombre croissant de 

patients immunodéficients. 

Ces changements ont entraîné des progrès majeurs dans la connaissance 

épidémiologique et physiopathologique des infections ainsi que de nouvelles 

possibilités diagnostiques et thérapeutiques. 

De plus, il existe de nouveaux antifongiques comme le voriconazole, la caspofongine 

ou le posaconazole. 

2.1 Bref historique 

Si aujourd’hui les champignons constituent un règne bien individualisé, il n’en a pas 

toujours été ainsi. On les a longtemps assimilés au règne végétal de part leur 

morphologie (thalle, spores, etc.), de part leur absence de mobilité et leur nutrition 

(absorption). 

Au 18 ème siècle, le monde vivant était partagé en 2 règnes : le végétal et l’animal. Le 

règne végétal regroupait les plantes et les algues, qui sont des espèces 

photosynthétiques, les bactéries et les champignons. Le règne animal, quant à lui, 

était composé à la fois d’êtres unicellulaires, c’est-à-dire les Protozoaires et des 

Métazoaires. 

Selon D. Chabasse, Cl. Guiguen. N. Contet-Audonneau (1999) : 

En 1866, le naturaliste et philosophe allemand Haeckel proposa d’y ajouter un 

troisième règne, celui des Protistes, ce que Copeland transformera plus tard en 

Protoctistes pour y regrouper la plupart des unicellulaires c’est-à-dire des 

bactéries, les Protozoaires, les Myxomycètes et autres protistes fongoïdes en 

raison de leur similitude avec les Rhizopodes. Les champignons et les algues 

sont quant à eux restés encore longtemps associés au règne végétal. (p.3) 

C’est en 1969 que l’américain Wittaker propose un système taxinomique à 5 règles 

soit les monomères (bactéries), les protistes, les végétaux, les champignons et les 

animaux. 




2008-2009


2.2 Caractéristiques générales 

Les champignons, que l’on appelle également mycètes, sont des organismes 

eucaryotes uni- ou pluricellulaires, dépourvus de chlorophylle, ce qui les distingue 

des végétaux. 

Il s’agit d’un organisme hétérotrophe qui se nourrit par absorption et non par 

phagocytose. Les champignons, contrairement aux végétaux, sont dépourvus de 

pigment chlorophyllien et ainsi ne peuvent pas incorporer directement le carbone 

minéral dans leurs cellules. C’est pourquoi ils dépendent de matières organiques 

préformées, c’est-à-dire déjà présentes et produites par d’autres organismes vivants. 

C’est la raison pour laquelle, dans la nature, les champignons colonisent les 

organismes morts ou en décomposition, trouvant ainsi dans cette source les 

nutriments essentiels à leur vie soit du carbone, de l’azote, des sels minéraux, etc. 

La reproduction se fait selon un mode asexué mais qui peut être sexué dans 

certaines conditions. 

Les champignons sont des êtres immobiles mais qui produisent un nombre 

considérable de spores habituellement non flagellées pour pallier à ce handicap. 

La partie constitutive est désignée sous le nom de thalle ou mycélium. Leur paroi est 

constituée de chitine (comme chez les insectes), ce qui leur procure une sorte de 

résistance face aux contraintes du milieu extérieur. Les champignons possèdent un 

noyau avec une membrane nucléaire, des nucléoles et le plasmalemme composé de 

glycoprotéines, phospholipides et d’ergostérol qui correspond au cholestérol de 

toutes les autres cellules. Cette particularité donne une cible idéale pour les 

antifongiques qui seront très spécifiques, sans action sur les autres cellules. 

Selon D. Chabasse, Cl. Guiguen. N. Contet-Audonneau (1999) : 

Le pouvoir pathogène du champignon n’est pas uniquement dû à son 

parasitisme ou à son développement chez l’homme ou l’animal. Il peut, en 

produisant des toxines issues de son mycélium, être directement à l’origine 

d’intoxication alimentaire, ou bien, par l’accumulation de ses toxines libérées 

dans des végétaux consommés, être un agent de mycotoxinoses chez 

l’homme ou l’animal. (p.2) 

Les levures, quant à elles, possèdent un thalle unicellulaire. Il s’agit d’un mycète 

unicellulaire qui ne possède qu’un seul noyau et qui se reproduit soit de façon 

asexuée par bourgeonnement, soit de façon sexuée par formation de spores. 

Chaque bourgeon qui se sépare va développer une nouvelle levure, certains restent 

groupés et forment de nouvelles colonies. 

Les levures sont plus grandes que les bactéries, elles sont généralement sphériques 

ou ovoïdes. 




2008-2009


Ci-dessous, vous trouvez un schéma de la fréquence des principales espèces de 

levures appartenant au genre Candida, isolées en France : 

11% 

Fréquence des divers espèces de levures appartenant au genre Candida 

1% 

1% 

4% 

4% 

2% 

2% 

C.albicans 

C.glabrata 

C.tropicalis 

C.parapsilosis 

C.krusei 

C.kefyr 

C.guilliermondii 

Autres 

Cette étude à été réalisée par GEMO : Groupe d’étude des mycoses opportunistes, 

auprès de 25 laboratoires de mycologie. 

En comparaison, voici les résultats obtenus au département de bactériologie de 

l’ICHV, Sion (2008). 

Comme nous pouvons le constater, il y a environ 75% de Candida albicans. 

3% 

1% 

1% 

1% 

1% 

15% 

2.3 Les Candida 




2008-2009 

75% 

Pourcentages des divers espèces de levures isolées 

1% 

1% 

76% 

C. albicans 

C. glabrata 

C. kefyr 

C. krusei 

C. lus itaniae 

C. paraps ilos is 

Candida sp 

C. tropic alis 

Autres 

Les levures du genre Candida sont des champignons unicellulaires mesurant de 4 à 

6 μm de long. Elles se multiplient par bourgeonnement ou éventuellement sous 

forme de pseudomycélium ou mycélium. 

Il s’agit de levures blanches, opaques, de formes ovoïdes, Gram positif et non 

encapsulées avec une petite protubérance à une extrémité.


Les Candida poussent sur une gélose Sabouraud contenant des antibiotiques 

antibactériens à 25°C ou 37°C selon l’origine du prélèvement. Les colonies de 

levures sont visibles en 24 à 48 heures. 

En ce qui concerne la morphologie, elle est assez pauvre. L’identification se fait en 

grande partie grâce à des tests biochimiques. Le thalle est fait de levures très 

allongées qui restent attachées les unes aux autres, formant des pseudo-filaments 

qui sont caractéristiques du genre. 

Il existe plusieurs espèces de Candida dont voici les plus fréquentes. 

2.3.1 Candida albicans 

http://www.microbelibrary.org/microbelibrary/files/ccImages 

/Articleimages/Buxton/07%20Spt%20fungi/Candida%20albi 

cans%20fig2.jpg 

2001, William McDonald, M.D. 

Revised: 31 December 2000 

Il s’agit de l’espèce la plus fréquemment isolée, 60-80% des cas. 

Candida albicans est une levure cosmopolite, commensale des muqueuses oropharyngées, 

gastro-intestinales et génito-urinaires. Elle peut occasionnellement 

coloniser la peau. 

Elle fait partie de la famille des Deuteromycètes. 

Levures ovalaires ou rondes au microscope, sur gélose, elles sont blanches, 

crémeuses, lisses, formant des « pattes », des colonies étoilées qui permettent de 

les identifier sur les géloses Columbia (COS) et Chocolat PolyVitex. (PVX). 




2008-2009


http://labmed.ucsf.edu/education/residency/f 

ung_morph/fungal_site/thumbnails/calbicans-on-cnaofw4.jpg 

En vieillissant, elles forment un pseudomycélium : filaments avec des zones 

rétrécies. 

La raison pour laquelle les colonies de Candida albicans forment des sortes de 

pattes est qu’ils forment des tubes germinatifs grâce au sérum contenu dans les 

géloses (test de blastèse). 

Un autre moyen permettant de les identifier est d’isoler les levures sur un milieu 

chromogène comme par exemple Albicans ID produit par bioMérieux® SA. La 

couleur bleue est caractéristique des colonies de C. albicans. Elle est liée à 

l’hydrolyse spécifique d’un substrat chromogène d’hexosaminidase. 

L’inhibition de la flore bactérienne est obtenue par l’association de 2 antibiotiques : le 

chloramphénicol et la gentamicine. Ce milieu est tamponné afin de faciliter la 

croissance des levures et d’optimiser l’expression de la réaction enzymatique. 

http://www.biomerieux.fr/upload/Candida 

2_thumb2_thumb.jpg 




2008-2009


2.3.2 Candida tropicalis 

Candida tropicalis représente 25% des isolats de levures de ce genre en pathologie 

humaine. Son pouvoir pathogène est comparable à celui du Candida albicans. 

Candida tropicalis est isolé dans la nature, le sol, les végétaux et l’eau. 

Cette levure est apparentée aux Ascomycètes. 

Elle a une forme variable, ronde à allongée et ces colonies poussent rapidement. 

Elles sont crémeuses, blanches, lisses ou légèrement plissées. Elles sont souvent 

associées à un pseudomycélium. 

Un milieu chromogène (Albicans ID) permet de les identifier, les colonies sont de 

couleur rose. 

2.3.3 Candida glabrata 

http://www.labmed.ch/doc/doc_download.cfm? 

uuid=36309A76D9D9424C4F9520A5E21C82 

8F&&IRACER_AUTOLINK&& 

Candida glabrata représente environ 8% des isolats de levures du genre Candida 

isolées de prélèvements cliniques. 

Cette espèce est apparentée aux Ascomycètes. 

Il s’agit de levures de forme ronde ou allongée et de petite taille. Elles sont blanches, 

crémeuses, plates, brillantes. Le pseudomycélium est parfois absent, rudimentaire 

ou abondant. Au microscope, nous voyons de petites levures qui ne filamentent pas. 

Candida glabrata est souvent retrouvé au niveau des muqueuses génitales. 

https://www.hardydirefphotoagnostics. 

com/catalog2/hugo//g301_hccandida_ 

cglabrata_66032_hugo.jpg 




2008-2009


2.3.4 Candida parapsilosis 

Candida parapsilosis est une levure saprophyte, responsable d’environ 7% des 

infections dues aux levures du genre Candida. Cette levure fait partie de la flore 

normale de la peau chez l’homme. 

Il s’agit d’une espèce apparentée aux Ascomycètes. 

Elle a une forme variable, ronde à ovale. Les colonies croissent rapidement, sont 

blanches, crémeuses, lisses ou plissées. Cette levure est parfois associée à un fin 

pseudomycélium. 

Candida parapsilosis est le deuxième Candida responsable de septicémies après le 

Candida albicans. Chez les personnes immunodéprimées, il provoque des infections 

profondes. 

Ci-dessous, un graphique représentant les pourcentages de diverses espèces de 

Candida responsables de septicémies. Ces statistiques proviennent du laboratoire 

de bactériologie de l’ICHV, de Sion (2007-2008). 

Pourcentages des divers espèces de levures 

responsables de septicémies 

2% 

3% 

2.3.5 Candida krusei 

10% 

http://iph.fgov.be/ClinBiol/bckb33/activities/e 

xternal_quality/rapports/ATLAS/Mycology/Y 

easts_fichiers/slide0034_image022.jpg 




2008-2009 

85% 

C.albicans 

C.glabrata 

C.parapsiolosis 

C.tropicalis 

Candida krusei est une levure saprophyte qui représente 4% des isolats de levures 

du genre Candida obtenus à partir de prélèvements cliniques.


Il s’agit de levures appartenant aux Ascomycètes. 

Elles sont allongées, ovales à cylindriques. Sur la gélose, elles ont un aspect blanc, 

mat et « poilu ». 

Le pseudomycélium peut être absent, rudimentaire ou abondant. 

Ces levures ne sont pas retrouvées dans la nature, mais elles ont été isolées de 

divers aliments comme par exemple des produits laitiers ou de la bière. 

Elles sont responsables de diarrhées entre autres pathologies. 

Le Candida krusei est résistant au Fluconazole. 

2.3.6 Candida lusitaniae 

https://www.hardydiagnostics.com/catalo 

g2/hugo/refphoto/g301_hccandida_ckrus 

ei_14243_hugo.jpg 

Candida lusitaniae est une levure de la flore normale de la peau, de l’appareil génitourinaire 

et de l’appareil respiratoire de l’homme. 

Initialement, cette levure a été isolée du tractus digestif des animaux à sang chaud. 

Ce Candida est essentiellement responsable d’infections viscérales profondes. 

Il s’agit d’une espèce s’apparentant aux Ascomycètes. 

De forme ronde à allongée et d’aspect blanc, lisse et crémeux, cette levure est 

brillante sur la gélose. 

Elles sont parfois associées à un fin pseudomycélium. 

http://scielo.isciii.es/img/revistas/aseo/v82n6/f09-01.jpg 




2008-2009


2.3.7 Candida kefyr 

Chez l’homme, Candida kefyr est une levure saprophyte de la muqueuse 

respiratoire. Il est peu retrouvé sur la peau. Cette levure peut être isolée des produits 

laitiers. 

Il s’agit de levures appartenant à la famille des Lipomycetaceae. Son synonyme 

usuel est Candida pseudotropicalis. 

Elles sont de forme variable rondes à allongées. Ces levures se reproduisent par 

bourgeonnement multilatéral. Le pseudomycélium peut être absent, rudimentaire ou 

abondant. Parfois, il y a présence d’un vrai mycélium. 

C’est une levure rarement impliquée en pathologie. Cependant elle peut être 

responsable d’infections pulmonaires et de septicémies chez l’homme, ainsi que de 

lésions superficielles de la peau. 

2.3.8 Candida guilliermondii 

http://www.medmicro.wisc.edu/resources/im 

agelib/mycology/images/c_kefyr.jpg 

Candida guilliermondii est une levure très répandue dans la nature. Elle est présente 

chez la plupart des animaux ainsi que chez l’homme. Cette levure peut provoquer 

des onyxis, des intertrigos, des infections cutanées, des infections urinaires, etc. Ce 

Candida peut être à l’origine de septicémies chez les personnes immunodéprimées. 

Il s’agit de levures appartenant à la famille des Ascomycètes. 

Elles sont de forme variable rondes à allongées. Ces levures se reproduisent par 

bourgeonnement multilatéral. Le pseudomycélium peut être absent, rudimentaire ou 

abondant. Parfois, il y a présence d’un vrai mycélium. 

http://microbiology.mtsinai.on.ca/mig/yeasts 

/index.shtml 




2008-2009


2.4 Les Cryptococcus 

2.4.1 Cryptococcus neoformans 

Le Cryptococcus neoformans est une levure très répandue dans la nature 

notamment dans l’air, sur les fruits, les plantes, le lait de vache, le bois et certains 

aliments. 

Il s’agit de levures appartenant à la famille des Basidiomycètes. 

Le Cryptococcus neoformans est un hôte du tube digestif du pigeon chez qui il ne 

provoque aucune maladie ; le principal réservoir est la fiente d’oiseaux séchée, en 

particulier celle du pigeon. 

Cette levure est également un saprophyte de l’homme. La contamination, quant à 

elle, est surtout aérienne, mais elle peut être orale ou cutanée. Le Cryptococcus 

neoformans peut provoquer des méningites sub-aiguës ou une primo infection 

pulmonaire le plus souvent latente chez les personnes immunodéprimées, en 

particulier chez les sidéens (chez 10% des patients VIH+ environ). Lorsque l’on 

découvre un Cryptococcus, une recherche d’immunosuppression (VIH,…) s’impose 

systématiquement. 

Des localisations osseuses et des septicémies ont également été signalées. 

Ces levures sont de forme variable rondes à allongées, encapsulées. Il n’y a pas de 

pseudomycélium. Elles se reproduisent par bourgeonnement multilatéral. Elles sont 

pigmentées en beige à ocre. 

La mise en évidence de la capsule se fait grâce à l’encre de chine. 

Quant au traitement, il est long et difficile. 

http://microbiology.mtsinai.on.ca/mig/yeasts/index.shtml 




2008-2009


2.5 Épidémiologie 

Il n’y a que le Candida albicans et le Candida glabrata qui vivent en commensaux 

dans le tube digestif, la bouche et les voies génitales de l’homme et de la femme. 

Quant aux autres espèces, elles sont le plus souvent issues du milieu extérieur. Ces 

dernières sont aussi saprophytes et peuvent se retrouver quelquefois sur la peau et 

les muqueuses. 

En effet, les Candida sont des levures opportunistes, profitant d’un affaiblissement 

du système immunitaire ou d’autres facteurs favorisants pour provoquer une 

candidose. Il est important de bien séparer les divers facteurs favorisants qui 

peuvent être liés soit à l’hôte, c’est-à-dire des facteurs intrinsèques, soit à des 

facteurs extrinsèques ou exogènes le plus souvent occasionnés par un traitement. 

De plus, il existe la possibilité d’un colportage surtout en milieu hospitalier. 

Il semblerait que de nouvelles espèces de Candida émergent comme par exemple le 

Candida dubliniensis, qui est proche du Candida albicans et qui apparaît depuis 

l’arrivée et la propagation du VIH. 

En ce qui concerne les Cryptococcus neoformans, il s’agit de champignons 

saprophytes dans le milieu extérieur, opportunistes. La cryptococcose survient le 

plus souvent chez les sujets immunodéprimés. 

2.6 Clinique 

Les Candida ne provoquent pas de maladie chez les personnes saines. Les autres 

microorganismes inhibent leur développement ; ce n’est que lors d’un état 

d’immunodépression ou d’une multiplication exagérée qu’il devient pathogène. 

Les candidoses sont des affections cosmopolites causées par un Candida. Leur 

pathogénicité dépend de plusieurs facteurs : de leurs localisations très variées, de 

l’espèce et de leur quantité. 

Le pouvoir pathogène des Candida est principalement lié au potentiel invasif de sa 

forme filamenteuse. 

Il existe divers facteurs favorisant les candidoses dont voici quelques exemples : 

• Facteurs favorisants généraux 

- Âge : prématuré, personne âgée 

- Thérapeutiques : antibiotiques, immunosuppresseurs, etc. 

- États pathologiques : diabète, SIDA 

- États physiologiques : grossesse 

• Facteurs favorisants locaux 

- Humidité, Macération 

- Acidité 

- Radiothérapie 




2008-2009


Il existe différents types de candidoses comme par exemple les candidoses 

superficielles, les candidoses génito-urinaires, les candidoses profondes, et les 

candidoses allergiques. 

Candidoses cutanées et unguéales 

Intertrigo : Au niveau de tous les replis cutanés 

chauds et humides, les plis de l’aine, 

sous-mammaires, axillaires et 

interfessiers. Il existe également 

l’intertrigo palmaire et plantaire. 

Onyxis et périonyxis : Au niveau de la sertissure de l’ongle. 

Candidoses digestives 

Candidose buccale ou muguet : Il s’agit d’un enduit blanchâtre 

recouvrant la langue, la face interne 

des joues, le voile du palais ainsi que 

le pharynx. Cette pathologie est 

fréquente chez les nouveau-nés et les 

patients immunodéprimés. 

http://parasito.montpellierwired.com/myco/muguet_bebe.jpg 

Candidose oesophagienne : Pathologie fréquente chez les sidéens. 

Candidose gastro-intestinale 

et anale : S’accompagne souvent d’un intertrigo 

périanal avec envahissement du sillon 

interfessier et des plis génito-cruraux 

(correspond aux organes génitaux et 

aux cuisses) et même du siège chez 

les nourrissons. 

Candidoses génito-urinaires 

Vulvo-vaginite: Caractérisée par une leucorrhée 

abondante, grumeleuse blanchâtre, 

avec un prurit vulvaire, les muqueuses 

sont recouvertes d’un enduit 

blanchâtre. 

Il s’agit d’une complication du diabète, 

de l’emploi de contraceptifs, d’une 

grossesse. 




2008-2009


Balano-posthite: Caractérisée par une irritation intense 

de la muqueuse avec un enduit 

blanchâtre. Il s’agit d’une infection de la 

muqueuse du gland et du prépuce. 

Candidoses profondes 

Candidoses septicémiques 

et disséminées : Il s’agit d’une altération de l’état 

général, d’origine endogène (avec un 

foyer digestif) ou exogène (à partir d’un 

traumatisme vasculaire, cathéter). La 

symptomatologie est maigre. Le patient 

présente une fièvre inexpliquée, ne 

cédant pas aux antibiotiques. 

Les sites de dissémination sont les 

reins, le cœur, les poumons, le foie, les 

yeux, le système nerveux et la peau. 

Candidoses allergiques 

Elle est due à une allergie aux métabolites des Candida. Les foyers peuvent être 

cutanés ou respiratoires. 

Cryptococcose pulmonaire 

Celle-ci correspond à la primo-infection qui est presque toujours asymptomatique. 

Cryptococcose méningo-encéphalique 

Le Cryptococcus neoformans a un tropisme pour le système nerveux central. Le 

patient est pris de nausées, de céphalées, de fièvre peu importante, etc. Il ressent 

une hypertension intracrânienne. Il présente des troubles du caractère, de la 

mémoire et du sommeil. 

Cryptococcose cutanée 

Celle-ci résulte d’une dissémination hématogène sous forme de papules 

acnéiformes, d’ulcérations sur le visage et les extrémités. 

Cryptococcose généralisée 

Cette pathologie est fréquente chez les sidéens. Cette levure est retrouvée dans les 

urines, les lavages broncho-alvéolaires, le L.C.R, les hémocultures, etc. 




2008-2009


2.7 Diagnostic 

2.7.1 Prélèvement 

En premier lieu, un prélèvement est effectué. Celui-ci peut être sous forme 

d’hémoculture, d’une biopsie ou d’un frottis lors de lésions cutanées et cutanéomuqueuses. 

2.7.2 Examen direct 

L’examen direct montre des levures bourgeonnantes avec ou sans filaments. 

2.7.3 Culture 

Un milieu Sabouraud est ensemencé. Cette gélose comprend des antibiotiques 

antibactériens. Selon l’origine du prélèvement, la gélose est placée dans une étuve à 

30°C. Les colonies poussent en 24 à 48 heures. 

2.7.4 Identification 

Le Candida albicans est facilement identifiable grâce à sa morphologie en étoile sur 

les géloses COS et PVX. Pour les autres espèces, elles seront identifiées par un 

repiquage sur un milieu chromogène et des tests biochimiques au moyen de galeries 

ou de cartes Vitek YST de bioMérieux® SA. 

2.7.5 Antifongigramme 

Ci-dessous, voici les techniques disponibles pour l’antifongigramme : 

• La technique de culture en cupules avec des concentrations critiques 

d’antifongiques. Il s’agit d’une méthode standardisée qui permet de déterminer 

la sensibilité des Candida sp et Cryptococcus neoformans à 5 antifongiques 

de concentrations différentes. 

• La technique en carte Vitek est une méthode standardisée, automatisée et 

rapide. Cette méthode utilise 4 antifongiques à 4 concentrations différentes. 

2.8 Traitements 

Il faut avant tout diminuer voire supprimer les facteurs favorisants. Ensuite, un 

traitement est administré au patient. Ce traitement est délicat car on utilise des 

produits devant être actifs sur le métabolisme de la cellule, d’où le nombre réduit 

d’antifongiques à disposition. 




2008-2009


Selon la Conférence de consensus commune (13.05.2004) : 

Les cibles antifongiques sont : la paroi de la cellule fongique (échinocandine) ; 

sa membrane cytoplasmique, en bloquant l’incorporation (polyènes) ou la 

synthèse (azolés) de l’ergostérol ; la biosynthèse des acides nucléiques 

(flucytosine). 

In vitro, l’amphotéricine B est fongicide, le voriconazole est fongistatique sur le 

Candida sp., la caspofungine est fongicide sur Candida sp. La pertinence 

clinique de ces données expérimentales n’est pas établie. (p.8) 

Pour les candidoses superficielles, on utilisera un antifongique topique et pour les 

profondes un antifongique systémique. 

Les principaux antifongiques sont les suivants : 

Amphotéricine B 

Il s’agit actuellement du traitement de choix pour les infections fongiques 

systémiques, comme les candidoses profondes et les infections neuroméningées ou 

pulmonaires dues au Cryptococcus neoformans. 

Son utilisation est délicate du fait de sa néphrotoxicité. 

L’Amphotéricine B agit par stimulation de la consommation d’O2, la transformation de 

l’ATP en ADP et par la formation de complexes insolubles avec les stérols, ce qui 

aboutit à l’altération de la perméabilité cellulaire fongique. 

Elle a une activité fongistatique à faible concentration et fongicide à concentration 

élevée. 

Quelques rares cas de résistances primaires sur les Candida lusitaniae et tropicalis 

ont été signalés. 

Nom commercial : FUNGIZONE®, ABELCET® 

Flucytosine = Fluoro 5 Catosine = 5FC 

Il s’agit de l’un des antifongiques les plus anciens, son mode d’action est le suivant: 

Après pénétration dans les cellules fongiques, la 5 FC est transformée en 5 FU par la 

cytosine désaminase. 

Deux mécanismes antifongiques vont alors agir : 

Le premier implique la transformation du 5 FU en 5-fluorouracile triphosphate qui en 

s’incorporant à l’ADN fongique, va inhiber la synthèse protéique. 

Le second implique la transformation du 5 FU en 5-fluorodeoxyuridine qui est un 

inhibiteur de la thymidylate synthétase par conséquent de la synthèse d’ADN 

fongique. 




2008-2009


Le Candida tropicalis présente parfois une résistance à l’encontre de cet 

antifongique. 

La flucytosine est un médicament de réserve. Les médecins préfèrent prescrire 

d’autres antifongiques moins toxiques. 

Griséofulvine = Grisefulvine® 

Nystatine = Mycostatine® 

Les antifongiques azolés 

Nom commercial : ANCOTIL® 

Il s’agit de la classe la plus utilisée à ce jour. 

Ce sont des triazolés fongistatiques à effet systémique. 

Ils inhibent l’enzyme fongique (C14 déméthylase, cytochrome P 450-dépendante) qui 

est nécessaire à la formation du principal stérol, l’ergostérol, de la membrane 

cellulaire des champignons. 

Ils sont indiqués pour le traitement des Candida, Aspergillus, Blastomyces, 

Histoplasma, Coccidiodes, Trichophyton et Cryptococcus neoformans. 

• Fluconazole 

Son spectre d’activité préférentiel est le Candida albicans et le 

Cryptococcus neoformans. 

En revanche, cet antibiotique est inactif sur les Candida krusei et 

dubliniensis ainsi que quelques rares Candida glabrata, car ils 

possèdent une résistance primaire. 

Il est en général bien toléré, mais à fortes doses, une toxicité 

hépatique ou neurologique peut se développer. 

• Itraconazole 

Nom commercial : Diflucan® 

Cet antibiotique est utilisé avec succès dans les méningites à 

Cryptococcus à des concentrations très faibles voire 

indétectables, ceci parce qu’il s’accumule dans les cellules de 

l’hôte. 

Nom commercial : Sporanox® 




2008-2009


• Voriconazole 

Il s’agit d’un antifongique triazolé à large spectre d’action. C’est 

un inhibiteur de la synthèse d’ergostérol. Les indications du 

voriconazole sont les infections fongiques invasives à 

Aspergillus, Candida, Scedosporium, Fusarium. 

Le voriconazole est apparu plus efficace et mieux toléré que 

l’Amphotéricine B dans le traitement de l’aspergillose invasive. 

• Posaconazole 

Nom commercial : VFEND® 

Il s’agit d’un nouvel antifongique de la classe des azolés. Il s’agit 

d’un inhibiteur de biosynthèse de l’ergostérol, constituant de la 

membrane fongique. Il a une activité antifongique à large 

spectre. Il couvre les levures du genre Candida, les moisissures 

du genre Aspergillus, les zygomycètes et le Cryptococcus 

neoformans. 

Les échinocandines 

• Caspofungine 

Nom commercial : Noxafil® 

L’acétate de caspofungine inhibe la synthèse du bêta (1,3)-Dglucane, 

un constituant essentiel de la paroi cellulaire de 

nombreux champignons filamenteux et de nombreuses levures. 

Le bêta (1,3)-D-glucane n’est pas présent dans les cellules de 

mammifères. 

Aucune méthode standardisée pour la détermination de la 

sensibilité n’a été établie pour la nouvelle classe des 

échinocandines et les résultats d’études sur la sensibilité ne sont 

pas forcément corrélés aux observations cliniques. 

Nom commercial : Cancidas® 




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3. Travail pratique 

3.1 Introduction 

La partie pratique de cette étude a été réalisée au laboratoire de bactériologie de 

l’ICHV de Sion de juillet à août 2008. 

3.2 Situation du travail dans son environnement 

Ces vingt dernières années, la mycologie médicale s’est fortement transformée avec 

une explosion d’infections fongiques. Chaque année, le nombre d’espèces 

pathogènes identifiées augmente. De nouvelles résistances pour des espèces 

jusque là sensibles commencent à émerger. 

Il y a un nombre croissant de patients immunodéficients. La cause est l’utilisation de 

chimiothérapies plus agressives, les traitements immunosuppresseurs plus intenses 

chez les transplantés, l’utilisation d’une antibiothérapie à large spectre et le virus 

VIH. 

Il est impératif de pouvoir déterminer la sensibilité des levures aux antifongiques au 

moyen d’une méthode simple, rapide, fiable et standardisée. 

3.3 Objectifs 

L’objectif de cette étude est de comparer la nouvelle carte Vitek AST-YS01® avec 

une galerie commerciale ATB FUNGUS 3 ® toutes deux produites par bioMérieux® 

SA. Le but étant de définir la méthode la plus adaptée au laboratoire de bactériologie 

de l’ICHV de Sion. 

Pour ce faire, nous avons testé les espèces de Candida suivantes : 

C. albicans C. glabrata 

C. tropicalis C. krusei 

C. parapsilosis C. guilliermondii 

C. lusitaniae C. kefyr 

Cryptococcus neoformans 

Nous avons choisi ces espèces pour déterminer leur sensibilité aux divers 

antifongiques. Les résultats obtenus seront analysés puis comparés. Différents 

critères tels que la précision des CMI, la facilité d’utilisation et d’interprétation, ainsi 

que le coût, les avantages et inconvénients, les problèmes rencontrés, la durée de 

validité seront pris en compte. 

Le test qui répondra le mieux à ces critères sera introduit en routine au laboratoire de 

bactériologie à l’ICHV de Sion. 




2008-2009


Ci-dessous, voici les deux antifongigrammes utilisés pour réaliser cette étude : 

• ATB FUNGUS 3 ® de bioMérieux® SA (Réf. 14 204) 

• Carte Vitek AST-YS01® de bioMérieux® SA (Réf. 22 108) 

Les cinq antifongiques suivants seront pris en compte dans notre étude : 

• Flucytosine 

• Amphotéricine B 

• Fluconazole 

• Voriconazole 

• Itraconazole (présent uniquement dans l’ATB FUNGUS 3 ®) 

Deux souches ATCC de référence provenant de l’Institut Pasteur à Paris permettront 

de vérifier les techniques utilisées, de définir leur reproductibilité et de valider les 

résultats obtenus. 

• ATCC 6258 Candida krusei 

• ATCC 22019 Candida parapsilosis 

La plupart des souches avaient été testées par une autre étudiante à l’ICHV de Sion 

dans une étude précédente, ce qui permet d’avoir une comparaison des résultats. 

En annexe 7.3, vous trouverez les résultats de l’étude antérieure. 

3.4 Matériel et méthodologie 

3.4.1 Matériel 

Pour la réalisation de cette étude, 50 souches de Candida ont été sélectionnées 

dans la « souchothèque » du laboratoire de bactériologie de l’ICHV à Sion dont : 

30 C. albicans 4 C. glabrata 

2 C. tropicalis 7 C. krusei 

2 C. parapsilosis 1 C. guilliermondii 

1 C. lusitaniae 1 C. kefyr 

2 Cryptococcus neoformans 

1 souche ATCC 6258 Candida krusei 

1 souche ATCC 22019 Candida parapsilosis 




2008-2009


Chaque souche est traitée de la même manière et dans les mêmes conditions : 

• Le premier jour, la souche est décongelée et repiquée sur COS. 

• Elle va ensuite pousser lentement à 35°C pendant 24 heures 

• Le lendemain, la souche est repiquée pour la deuxième fois sur COS 

• Réincubation à 35°C pendant 24 heures 

• Puis, le jour suivant, la galerie sera inoculée et mise à l’étuve et la carte Vitek 

sera préparée en parallèle puis analysée sur l’automate Vitek2®. 

• Après 24 heures pour les Candida sp et 48 heures pour les Cryptococcus 

neoformans, la lecture des galeries est effectuée. 

En ce qui concerne la carte Vitek, nous obtenons des résultats après 13 

heures pour les Candida et après environ 20 heures pour les Cryptococcus 

neoformans. 

3.4.2 Présentation des techniques 

Principe : 

3.4.2.1 ATB FUNGUS 3 ® 

Il permet de déterminer la sensibilité des Candida et des Cryptococcus neoformans 

aux antifongiques en milieu semi-liquide dans des conditions très proches de la 

technique de référence de micro dilution. 

La galerie comporte 16 paires de cupules, la première sans antifongique servant de 

témoin de croissance. 

Les 15 paires suivantes contiennent 5 antifongiques à différentes concentrations 

permettant de déterminer des CMI. 

Pour déterminer cette CMI, on va rechercher et quantifier dans chaque cupule une 

croissance par lecture visuelle. L’appréciation peut différer d’une personne à l’autre. 

L’appréciation par lecture automatique n’est pas disponible au laboratoire. 

Matériel : 

Composition d’un kit : 

• 25 galeries en emballage individuel avec déshydratant 

• 25 couvercles d’incubation 

• 25 ampoules d’ATB F2 Medium 

• 25 fiches de résultats 

• 1 notice 

Matériel non fourni : 

• NaCl 0.85% 3 ml 

• Ecouvillons 

• Pipette électronique ATB 135 μl avec les embouts 

• Pipette calibrée 20 μl et les embouts 




2008-2009


Mode opératoire : 

• A partir d’une culture fraîche sur COS, prélever quelques colonies à l’aide d’un 

écouvillon stérile et les dissoudre dans une ampoule de 3 ml de NaCl 0.85%, 

afin de réaliser une suspension d’opacité équivalente à l’étalon 2 MacFarland. 

• Contrôler la pureté de l’inoculum en l’isolant sur une gélose non sélective. 

• Transférer 20 μl de cette suspension à l’aide d’une pipette calibrée dans l’ATB 

Medium 1, homogénéiser. 

• Inoculer la galerie en distribuant 135 μl de la dilution dans chaque cupule à 

l’aide de la pipette électronique ATB. La concentration est d’environ 4 x 10 3 

levures/cupule. 

• Mettre le couvercle 

• Incuber : - 24 heures à 35°C pour les Candida à l’étuve O2 

- 48 heures à 35°C pour les Cryptococcus neoformans à l’étuve 

O2 

Pour les Candida dont la croissance dans les cupules témoins est insuffisante, 

incuber dans les mêmes conditions pendant 24 heures. 

En annexe 7.1, vous trouverez la procédure pour l’ATB FUNGUS 3 ®. 

Lecture et interprétation : 

Pour faciliter la lecture, placer la galerie sur un fond noir. 

Pour chaque antifongique, commencer la lecture par la concentration la plus faible et 

noter un score de croissance pour chacune des cupules comparativement aux 

cupules témoins. L’absence de croissance dans l’une ou l’autre, ou les 2 cupules 

témoins invalide la galerie. 

Score 

Absence de réduction de croissance 4 

Légère réduction de croissance 3 

Réduction marquée de croissance 2 

Très faible croissance 1 

Absence de croissance 0 

Pour ce qui est de l’Amphotéricine B, la CMI correspond à la concentration 

d’antifongique la plus faible permettant d’obtenir un score de 0, donc une inhibition 

complète. 

Pour le Fluconazole, la Flucytosine, l’Itraconazole, le Voriconazole, du fait du 

phénomène de croissance résiduelle, la CMI correspond à la concentration 

d’antifongique la plus faible permettant d’obtenir un score de 2,1 ou 0. 

En annexe 7.2, vous trouverez une feuille de résultat pour l’ATB FUNGUS 3 ®. 




2008-2009


Concentrations critiques des CMI (en mg/l) recommandées pour les Candida sp. 

en catégories cliniques 

SENSIBLE INTERMEDIAIRE RESISTANTE 

FLUCYTOSINE ≤ 4 8 -16 ≥ 32 

AMPHOTERICINE B Une CMI ≥ 2 suggère une résistance 

FLUCONAZOLE ≤ 8 16 - 32 ≥ 64 

ITRACONAZOLE ≤ 0.125 0.25 – 0.5 ≥ 1 

VORICONAZOLE ≤ 1 2 ≥ 4 

Note : Le Candida krusei est une espèce intrinsèquement résistante au Fluconazole, 

le test doit être systématiquement interprété comme RESISTANT. 

Concentrations critiques des CMI (en mg/l) recommandées pour les Cryptococcus 

neoformans en catégories cliniques 


FLUCYTOSINE ≤ 4 8 - 16 ≥ 32 

AMPHOTERICINE B Une CMI ≥ 2 suggère une résistance 

FLUCONAZOLE ≤ 4 8 ≥ 16 

ITRACONAZOLE Non défini 

VORICONAZOLE Non défini 

Note : Les CMI habituellement obtenues pour le Cryptococcus neoformans sont 0.5 

et 1 mg/l. 

Ci-dessous, une galerie ATB FUNGUS 2 ® de bioMérieux® SA, modèle précédant 

l’ATB FUNGUS 3 ®. 

Galerie ATB FUNGUS 2 ®, bioMérieux SA 

Marchand S., (2004-2005) 

La principale différence entre ces deux générations de galerie ATB FUNGUS est la 

présence d’un cinquième antifongique pour l’ATB FUNGUS 3 ®, soit le voriconazole. 




2008-2009


L’automate : 

3.4.2.2 Carte Vitek AST-YS01® 

Le Vitek2® dispose d’un système automatisé capable de traiter la majorité des tests 

de routine avec un rendu des résultats fiable et rapide. Il détecte des résistances 

même faiblement exprimées. Plus de 330 espèces microbiennes peuvent être 

identifiées grâce à une base de données optimisée. Cet appareil est composé de 

différents éléments essentiels : 

La Station Compacte Satellite (SCS) 

Il s’agit d’un petit ordinateur destiné à récupérer les données suivantes : code à 

barre des différentes cartes, nom du germe, code à barre du prélèvement ou 

numéro du prélèvement, identité du technicien ayant effectué l’analyse permettant 

d’assurer une bonne traçabilité. 

La cassette 

La cassette comporte une puce mémoire utilisée pour connaître le contenu de la 

cassette. Cette cassette sert également au support des cartes. Le Vitek2® se 

charge automatiquement de la dilution à effectuer. 

La carte Vitek AST-YS01® 

La carte Vitek AST-YS01® comportant 64 cupules réactionnelles. 

Les cartes sont inoculées avec les diverses suspensions. Le module de 

remplissage utilise une chambre à vide et une pompe. Lorsqu’une cassette atteint 

ce stade la pompe évacue l’air de la chambre. Puis, le vide est lentement rompu. 

L’augmentation de la pression d’air dans la chambre pousse la suspension par le 

tube de transfert dans les canaux et les micro-cuves de la carte. Ensuite, les tubes 

de transfert sont scellés. La carte et son contenu sont ainsi hermétiquement 

fermés. 

Incubation et lecture 

Liste des produits 2007 bioMérieux 

(22.02.2009) 

Le système de transport place le porte-cassette de telle sorte qu’un mécanisme 

met chaque carte dans l’emplacement du carrousel, où elles restent pendant toute 

la durée de l’analyse. 

Le carrousel, qui a une capacité de 60 cartes, tourne toutes les 15 minutes de 

façon à placer chaque carte en position de lecture. La tête de lecture déplace la 




2008-2009


carte à travers les blocs optiques. Après la lecture, la carte reprendra sa place dans 

le carrousel ou l’incubation à 35,5°C se poursuit jusqu’à la lecture suivante. 

Principe : 

Cette technique permet également de déterminer la sensibilité des Candida et des 

Cryptococcus neoformans aux antifongiques en milieu semi-liquide. 

Cette carte comprend 64 cupules réactionnelles comprenant quatre antifongiques 

dont le fluconazole, le voriconazole, la flucytosine et l’amphotéricine B à quatre 

concentrations différentes. 

La lecture s’effectue à 660 nm. L’analyse du taux de croissance est effectuée toutes 

les 15 minutes en cinétique. Puis, pour chaque antibiotique, un algorithme spécifique 

convertit les valeurs brutes (RTU) en CMI calculée. Pour calculer les CMI, l’automate 

contrôle le remplissage des cupules, puis vérifie les valeurs brutes. Il élimine les 

valeurs brutes aberrantes liées au bruit de fond et aux souches difficiles à mettre en 

suspension. 

Ensuite, il détermine la durée d’incubation de la carte. Dans la cupule contrôle, il 

évalue la vitesse de croissance du germe. La lecture s’arrêtera si la croissance dans 

tous les puits est suffisante. Celle-ci sera considérée comme la plus haute pouvant 

être mesurée pour cet antibiotique. 

Pour finir les résultats de CMI sont interprétés en S-I-R en fonction des 

concentrations critiques spécifiques des différents comités. 

Matériel : 

Composition d’un kit : 

• 20 cartes en emballage individuel avec déshydratant 

• 1 notice 

Matériel non fourni : 

http://www.biomerieux.ch/upload/vitek2_sm 

artcarrierstation1_thumb1.jpg 

• NaCl 0.85% 

• Tube en plastique stérile pour la dilution 

• Ecouvillons 




2008-2009


Mode opératoire : 

• A partir d’une culture fraîche sur COS, prélever quelques colonies à l’aide d’un 

écouvillon stérile et les dissoudre dans environ 3 ml de NaCl 0.45%, afin de 

réaliser une suspension d’opacité équivalente à l’étalon 2 MacFarland. 

• Contrôler la pureté de l’inoculum en l’isolant sur une gélose non sélective. 

• Tout d’abord, il faut placer le portoir sur la station satellite qui est un poste de 

travail nous permettant de programmer les analyses à effectuer, le nom du 

germe etc. Le tube contenant la suspension est alors placé sur le portoir. Le 

code barre de la carte AST-YS01® est scanné, puis la carte est introduite 

dans le tube. 

• Un tube vide est ajouté à côté du tube contenant la suspension. Le Vitek2® 

se charge automatiquement de la dilution à effectuer avec du NaCl 0.45%. Il 

homogénéise la suspension par aspiration et refoulement, puis il inocule les 

cartes. Pour finir, les cartes sont isolées de l’extérieur et l’analyse commence. 

Il n’y a ainsi pas de risque de contamination pour le personnel. 

• BioMérieux® assure des résultats dans les 13 heures pour les Candida et 20 

heures pour les Cryptococcus neoformans. 

Lecture et interprétation : 




2008-2009


Ci-dessus, voici un rapport de laboratoire. Nous voyons qu’il s’agit d’un Candida 

albicans et qu’il est sensible aux quatre antifongiques. Nous remarquons également 

les différentes CMI. Pour finir, l’automate interprète les résultats. 

Nous constatons également que l’analyse a duré environ 13 heures. 


AMPHOTERICINE B 1 2 4 

FLUCONAZOLE ≤ 8 16 - 32 ≥ 64 

FLUCYTOSINE ≤ 4 8 -16 ≥ 32 

VORICONAZOLE ≤ 1 2 ≥ 4 

3.5 Analyse des résultats 

3.5.1 Premiers essais et actions correctives 

Les Candida glabrata poussent plus lentement que les autres espèces. De ce fait, 

les galeries ATB FUNGUS 3 ® doivent être incubées 1 jour de plus. 

Pour les cartes Vitek le temps d’incubation reste le même que pour les autres 

espèces soit environ 13 h. 

Lors de discordances majeures (S-R ou R-S) entre les deux tests, la souche est à 

nouveau testée. 

3.5.2 Explications des tableaux de résultats 

Dans les tableaux des pages suivantes, les résultats sont exprimés de la manière 

suivante : 

CMI : Plus faible dilution d’antifongique montrant une 

inhibition de croissance de 80 à 100% par rapport 

à un contrôle de pousse sans antifongique (cupule 

contrôle). 

Sensible (S) : Il s’agit de souches pour lesquelles la probabilité 

de succès thérapeutique, dans le cas d’un 

traitement à dose habituelle est acceptable. 

La quantité d’antibiotique se trouvant dans les 

cupules est suffisante pour inhiber la croissance de 

la souche in vitro. 

Intermédiaire (I) : Il s’agit de souches pour lesquelles le succès 

thérapeutique est imprévisible. 

L’action de l’antifongique sur la souche n’est pas 

garantie. 

Résistante (R) : Il s’agit de souches pour lesquelles il existe une 

forte probabilité d’échec thérapeutique. 

L’antifongique n’inhibe pas la croissance de la 

souche in vitro. 




2008-2009


Les résultats des 50 souches et des souches ATCC obtenus avec les différents tests 

ont été comparés et interprétés de la manière suivante : 

Concordance : Les résultats obtenus par les deux tests sont 

identiques ou identiques à ceux obtenus par 

l’étudiante précédente. 

Discordance : Les résultats obtenus par les deux tests sont 

différents l’un de l’autre ou différents de ceux 

obtenus par l’étudiante précédente. 

Nous considérons trois discordances différentes : 

Discordance « very major »: Elle correspond à une différence de CMI de plus de 

2 dilutions. C’est le cas lorsque nous rendons un 

résultat S à la place de R. Il s’agit d’un faux 

sensible. Cela peut mettre la vie du patient en 

danger ! 

Discordance majeure: Elle correspond à une différence de CMI de 

maximum 2 dilutions. C’est le cas lorsque nous 

rendons un résultat R à la place de S. Il s’agit d’un 

faux résistant. Cette erreur de mettra personne en 

danger puisque le résultat est résistant donc le 

médecin ne prescrira pas ce traitement. 

Discordance mineure : Elle correspond à une différence de CMI de 

maximum 1 dilution, soit à un S à la place d’un I ou 

à un I à la place d’un R et inversement. 

3.6 Tableaux des résultats 

Sur les pages suivantes, vous trouverez les tableaux de résultats détaillés. 




2008-2009

Résultats: Candida albicans 

ATB FUNGUS 3® Vitek 2 AST-YS01® 

Flucytosine 

Amphotéricine 

B Fluconazole Itraconazole 

≤0.125/ 0.25-0.5 / 

Voriconazole Flucytosine Amphotéricine B Fluconazole Voriconazole 

≤4 / 8-16 / ≥32 ≤2 = S / ≥2 = R ≤8 / 16-32 / ≥64 ≥1 ≤1 / 2 / ≥4 ≤4 / 8-16 / ≥32 ≤2 = S / ≥ 2 = R ≤8 / 16-32 / ≥64 ≤1 / 2 / ≥4 

No Localisation CMI Résultat CMI Résultat CMI Résultat CMI Résultat CMI Résultat CMI Résultat CMI Résultat CMI Résultat CMI Résultat 

8 Hémoculture ≤4 S ≤2 S 1 S 0,125 S 0,06 S ≤1 S 0,5 S ≤1 S ≤0.12 S 

9 Sp ≤4 S ≤2 S 8 S 0,125 S 0,06 S ≤1 S ≤0.25 S 8 S ≤0.12 S 

10 Gorge ≤4 S ≤2 S 64 R 1 R 1 S ≤1 S ≤0.25 S ≥64 R ≤0.12 S 

11 Gorge ≤4 S ≤2 S 8 S 0,125 S 0,06 S ≤1 S ≤0.25 S 2 S ≤0.12 S 

12 Gorge ≤4 S ≤2 S 64 R 0,25 I 0,5 S ≤1 S ≤0.25 S 32 I ≤0.12 S 

13 Sp ≤4 S ≤2 S ≥128 R 0,125 S 1 S ≤1 S ≤0.25 S ≥64 R 0,25 S 

14 Hémoculture ≤4 S ≤0.5 S 1 S 0,125 S 0,06 S ≤1 S ≤0.25 S ≤1 S ≤0.12 S 

15 Hémoculture ≤4 S ≤0.5 S 1 S 0,125 S 1 S ≤1 S ≤0.25 S ≤1 S ≤0.12 S 

16 Pl. profonde ≤4 S ≤0.5 S 1 S 0,125 S 1 S ≤1 S ≤0.25 S ≤1 S ≤0.12 S 





21 Hémoculture ≤4 S ≤0.5 S ≤1 S 0,125 S 0,06 S ≤1 S ≤0.25 S ≤1 S ≤0.12 S 

22 Hémoculture ≤4 S ≤0.5 S 1 S 0,125 S 0,06 S ≤1 S 0,5 S ≤1 S ≤0.12 S 

23 Pus profond ≤4 S ≤0.5 S 1 S 0,125 S 0,06 S ≤1 S 0,5 S ≤1 S ≤0.12 S 




2008-2009

Souches ATCC Discordance majeure Discordance « very major » 

Discordance mineure Souche testée 2 x (contaminations, discordance ?) Interprétable 

Réincuber 1 jour de plus 

Résultats: Candida albicans suite 


Flucytosine Amphotéricine B Fluconazole Itraconazole Voriconazole Flucytosine Amphotéricine B Fluconazole Voriconazole 

≤4 / 8-16 / ≥32 ≤2 = S / ≥2 = R ≤8 / 16-32 / ≥64 ≤0.125/ 0.25-0.5 / ≥1 ≤1 / 2 / ≥4 ≤4 / 8-16 / ≥32 ≤2 = S / ≥ 2 = R ≤8 / 16-32 / ≥64 ≤1 / 2 / ≥4 


24 L. Pleural ≤4 S ≤0.5 S ≤1 S 0,125 S 0,06 S ≤1 S 0,5 S ≤1 S ≤0.12 S 

25 Lèvre ≤4 S ≤0.5 S ≤1 S 0,125 S 0,06 S ≤1 S ≤0.25 S ≤1 S ≤0.12 S 


27 Hémoculture ≤4 S ≤0.5 S 1 S 0,125 S 0,06 S ≤1 S 0,5 S ≤1 S ≤0.12 S 

28 Urine sondée ≤4 S ≤0.5 S 1 S 0,125 S 0,06 S ≤1 S ≤0.25 S ≤1 S ≤0.12 S 



31 Expectoration ≤4 S ≤0.5 S ≤1 S 0,125 S 0,06 S ≤1 S ≤0.25 S ≤1 S ≤0.12 S 

32 Gorge ≤4 S ≤0.5 S ≤1 S 0,125 S 0,06 S ≤1 S 0,5 S ≤1 S ≤0.12 S 



35 Bouche ≤4 S ≤0.5 S ≤1 S 0,125 S 0,06 S ≤1 S ≤0.25 S ≤1 S ≤0.12 S 

36 Gorge ≤4 S ≤0.5 S ≤1 S 0,125 S 0,06 S ≤1 S ≤0.25 S ≤1 S ≤0.12 S 





2008-2009

Résultats: Candida tropicalis 



≤4 / 8-16 / ≥32 ≤2 = S / ≥2 = R ≤8 / 16-32 / ≥64 ≤0.125/ 0.25-0.5 / ≥1 ≤1 / 2 / ≥4 ≤4 / 8-16 / ≥32 ≤2 = S / ≥ 2 = R ≤8 / 16-32 / ≥64 ≤1 / 2 / ≥4 


47 Expectoration ≤4 S ≤2 S ≤1 S ≤0.125 S ≤0.06 S ≤1 S ≤0.25 S ≤1 S ≤0.12 S 

48 Expectoration ≥32 R ≤2 S 1 S 0,125 S ≤0.06 S ≥64 R ≤0.25 S ≤1 S ≤0.12 S 

Résultats: Candida glabrata 



≤4 / 8-16 / ≥32 ≤2 = S / ≥2 = R ≤8 / 16-32 / ≥64 ≤0.125/ 0.25-0.5 / ≥1 ≤1 / 2 / ≥4 ≤4 / 8-16 / ≥32 ≤2 = S / ≥ 2 = R ≤8 / 16-32 / ≥64 ≤1 / 2 / ≥4 


40 Vagin ≤4 S ≤0.5 S ≤1 S ≤0.125 S 0,06 S ≤1 S 0,5 S ≥64 R ≤0.12 S 

40 Vagin ≤4 S ≤0.5 S ≤1 S ≤0.125 S 0,06 S ≤1 S 0,5 S 32 I ≤0.12 S 

41 Aspiration 4 S ≤0.5 S 4 S 0,5 I 0,25 S 4 S 0,5 S 8 S ≤0.12 S 

42 Hémoculture ≤4 S ≤2 S 2 S 0,25 I 0,06 S ≤1 S 0,5 S 4 S ≤0.12 S 

43 Hémoculture ≤4 S ≤0.5 S ≤1 S ≤0.125 S 0,06 S ≤1 S 0,5 S 4 S ≤0.12 S 


Discordance mineure Souche testée 2 x Interprétable 





2008-2009

Résultats: Candida parapsilosis 



≤4 / 8-16 / ≥32 ≤2 = S / ≥2 = R ≤8 / 16-32 / ≥64 ≤0.125/ 0.25-0.5 / ≥1 ≤1 / 2 / ≥4 ≤4 / 8-16 / ≥32 ≤2 = S / ≥ 2 = R ≤8 / 16-32 / ≥64 ≤1 / 2 / ≥4 


44 ≤4 S ≤2 S 1 S 0,125 S 0,06 S ≤1 S ≤0.25 S 2 S ≤0.12 S 

45 Biop.fémur ≤4 S ≤2 S 1 S 0,125 S 0,06 S ≤1 S ≤0.25 S ≤1 S ≤0.12 S 







2008-2009

Résultats: Candida krusei 



≤4 / 8-16 / ≥32 ≤2 = S / ≥2 = R ≤8 / 16-32 / ≥64 ≤0.125/ 0.25-0.5 / ≥1 ≤1 / 2 / ≥4 ≤4 / 8-16 / ≥32 ≤2 = S / ≥ 2 = R ≤8 / 16-32 / ≥64 ≤1 / 2 / ≥4 


1 ≤4 S ≤2 S 8 R 0,125 S 0,25 S 16 I 0,5 S 8 R ≤0.12 S 

2 Urotube ≤4 S ≤2 S 8 R 0,25 I 0,125 S 4 S 1 S 2 R ≤0.12 S 

3 Urine ≤4 S ≤2 S 8 R 0,5 I 0,25 S 4 S 0,5 S 8 R ≤0.12 S 

4 Cathéter CQ 16 I ≤2 S 8 R 0,125 S 0,25 S 8 I 0,5 S 8 R ≤0.12 S 

5 Gorge ≤4 S ≤2 S 32 R 0,125 S 0,5 S ≤1 S 0,5 S ≥64 R 0,25 S 

6 AB 16 I ≤2 S 8 R 0,5 I 0,25 S 8 I 0,5 S 8 R ≤0.12 S 

7 Cathéter ≤4 S ≤2 S 8 R 0,125 S 0,125 S 8 I ≤0.25 S 8 R ≤0.12 S 







2008-2009

Résultats: Candida lusitaniae 



≤4 / 8-16 / ≥32 ≤2 = S / ≥2 = R ≤8 / 16-32 / ≥64 ≤0.125/ 0.25-0.5 / ≥1 ≤1 / 2 / ≥4 ≤4 / 8-16 / ≥32 ≤2 = S / ≥ 2 = R ≤8 / 16-32 / ≥64 ≤1 / 2 / ≥4 


46 Expectoration ≥32 R ≤0.5 S ≤1 S ≤0.125 S ≤0.06 S 32 R ≤0.25 S ≤1 S ≤0.12 S 

Résultats: Candida kefyr 



≤4 / 8-16 / ≥32 ≤2 = S / ≥2 = R ≤8 / 16-32 / ≥64 ≤0.125/ 0.25-0.5 / ≥1 ≤1 / 2 / ≥4 ≤4 / 8-16 / ≥32 ≤2 = S / ≥ 2 = R ≤8 / 16-32 / ≥64 ≤1 / 2 / ≥4 


49 ≤4 S ≤0.5 S ≤1 S ≤0.125 S ≤0.06 S ≤1 S 0,5 S ≤1 S ≤0.12 S 







2008-2009

Gloor Ariane 



2008-2009 

Résultats: Candida guilliermondii 



≤4 / 8-16 / ≥32 ≤2 = S / ≥2 = R ≤8 / 16-32 / ≥64 ≤0.125/ 0.25-0.5 / ≥1 ≤1 / 2 / ≥4 ≤4 / 8-16 / ≥32 ≤2 = S / ≥ 2 = R ≤8 / 16-32 / ≥64 ≤1 / 2 / ≥4 


50 CQ GB ≤4 S ≤0.5 S ≤1 S ≤0.125 S 0,06 S ≤1 S ≤0.25 S 2 S ≤0.12 S 

Résultats: Cryptococcus neoformans 



≤4 / 8-16 / ≥32 ≤2 = S / ≥2 = R ≤8 / 16-32 / ≥64 ≤0.125/ 0.25-0.5 / ≥1 ≤1 / 2 / ≥4 ≤4 / 8-16 / ≥32 ≤2 = S / ≥ 2 = R ≤8 / 16-32 / ≥64 ≤1 / 2 / ≥4 


38 LCR ≤4 S ≤2 S 1 S 0,125 S 0,06 S ≤1 S ≤0.25 S ≤1 S pas de résultat 

39 Hémoc ≤4 S 0,5 S 1 S 0,125 S 0,06 S ≤1 S ≤0.25 S ≤1 S pas de résultat 




38/62

Gloor Ariane 



2008-2009 

Discordances ATB FUNGUS 3 ® - carte Vitek 



≤4 / 8-16 / ≥32 ≤2 = S / ≥2 = R ≤8 / 16-32 / ≥64 ≤0.125/ 0.25-0.5 / ≥1 ≤1 / 2 / ≥4 ≤4 / 8-16 / ≥32 ≤2 = S / ≥ 2 = R ≤8 / 16-32 / ≥64 ≤1 / 2 / ≥4 


1 ≤4 S ≤2 S 8 R 0.125 S 0.25 S 16 I 0.5 S 8 R ≤0.12 S 

40 Vagin ≤4 S ≤0.5 S ≤1 S ≤0.125 S 0.06 S ≤1 S 0.5 S ≥64 R ≤0.12 S 

40 Vagin ≤4 S ≤0.5 S ≤1 S ≤0.125 S 0.06 S ≤1 S 0.5 S 32 I ≤0.12 S 

12 Gorge ≤4 S ≤2 S 64 R 0.25 I 0.5 S ≤1 S ≤0.25 S 32 I ≤0.12 S 

7 Cathéter ≤4 S ≤2 S 8 R 0.125 S 0.125 S 8 I ≤0.25 S 8 R ≤0.12 S 




50 souches testées 4 discordances entre ATB FUNGUS 3 ® - carte Vitek 

1 « very major » 

4 mineures 

Souche testées 2x puis donne 1 

discordance mineure 

Les résultats obtenus ont été comparé à ceux de l’étude précédente. Ci-dessous, voici les discordances observées. 

39/62

Gloor Ariane 



2008-2009 




50 souches testées 

Discordances entre mes résultats et les résultats de l’étude 

précédente 

1 « very major » 

31 discordances au 

3 majeures 

total 27 mineures 

40/62


3.7 Interprétation 

3.7.1 Pourcentages de concordance et discordance entre l’ATB FUNGUS 3 ® et 

la Carte Vitek AST-YS01® 

Gloor Ariane 



2008-2009 

Candida albicans 

Flucytosine Amphotéricine 

B 

Fluconazole Voriconazole 

Concordances 30/30 = 100% 30/30 = 100% 29/30 = ~97% 30/30 = 100% 

Discordances 

mineures 

- - 1/30 = ~3% - 

Discordances 

majeures 

- - - - 

Discordances 

very majeur 

- - - - 

Candida tropicalis 


B 


Concordances 2/2 = 100% 2/2 = 100% 2/2 = 100 2/2 = 100 

Discordances 

mineures 

- - - - 

Discordances 

majeures 

- - - - 

Discordances 

very majeur 

- - - - 

Candida glabrata 


B 


Concordances 4/4 = 100% 4/4 = 100% 3/4 = 75% 4/4 = 100% 

Discordances 

mineures 

- - 1/4 = 25% - 

Discordances 

majeures 

- - - - 

Discordances 

very majeur 

- - - - 

Candida parapsilosis 


B 


Concordances 2/2 = 100% 2/2 = 100% 2/2 = 100% 2/2 = 100% 

Discordances 

mineures 

- - - - 

Discordances 

majeures 

- - - - 

Discordances 

very majeur 

- - - - 

41/62


Candida krusei 


B 


Concordances 5/7 = ~71% 7/7 = 100% 7/7 = 100% 7/7 = 100% 

Discordances 

mineures 

2/7 = ~29% - - - 

Discordances 

majeures 

- - - - 

Discordances 

very majeur 

- - - - 

Candida lusitaniae 


B 


Concordances 1/1 = 100% 1/1 = 100% 1/1 = 100% 1/1 = 100% 

Discordances 

mineures 

- - - - 

Discordances 

majeures 

- - - - 

Discordances 

very majeur 

- - - - 

Candida kefyr 


B 


Concordances 1/1 = 100% 1/1 = 100% 1/1 = 100% 1/1 = 100% 

Discordances 

mineures 

- - - - 

Discordances 

majeures 

- - - - 

Discordances 

very majeur 

- - - - 

Candida guilliermondii 


B 


Concordances 1/1 = 100% 1/1 = 100% 1/1 = 100% 1/1 = 100% 

Discordances 

mineures 

- - - - 

Discordances 

majeures 

- - - - 

Discordances 

very majeur 

- - - - 




2008-2009


Cryptococcus neoformans 


B 


Concordances 2/2 = 100% 2/2 = 100% 2/2 = 100% ND 

Discordances 

mineures 

- - - - 

Discordances 

majeures 

- - - - 

Discordances 

very majeur 

- - - - 

D’après le fabriquant, le résultat en carte du voriconazole pour le Cryptococcus 

neoformans n’est pas disponible (ND). C’est la raison pour laquelle nous avons testé 

5 souches de Cryptococcus neoformans. Effectivement, nous n’avons obtenu aucun 

résultat. 

Nous voyons clairement que la majorité des discordances se situe au niveau des 

antifongiques Flucytosine pour les Candida krusei et le Fluconazole pour les Candida 

albicans et glabrata. 

Nous constatons également que le Cryptococcus neoformans et certaines espèces 

de Candida ont une concordance parfaite comme pour le C. guilliermondii, C. kefyr, 

C. lusitaniae, C. parapsilosis et le C. tropicalis. 

Pour le Candida albicans, nous notons 1 discordance mineure pour 30 souches 

testées, ce qui est tout à fait acceptable. 

Par contre, pour le Candida krusei, il y a 2 discordances sur 7 souches testées. Pour 

finir, nous constatons qu’il y a 1 discordance sur 4 souches testées pour le Candida 

glabrata. Il s’agit de la souche pour laquelle nous avons eu le plus de discordances. 

Comme nous pouvons le constater, il y a environ 25% de discordances pour le 

Fluconazole pour le Candida glabrata ce qui correspond aux données de la 

littérature. 

Le voriconazole est actuellement le traitement de choix pour cette espèce. 

Quant aux Candida krusei, le traitement de choix est le voriconazole et la 

caspofongine qui est un nouveau traitement. 




2008-2009


3.7.2 Pourcentages de concordance et discordance entre nos résultats et ceux 

obtenus dans l’étude précédente 

Résultat étude précédente ATB FUNGUS 2 ® – mes résultats 

Flucytosine 


B 

Fluconazole Itraconazole 

Concordances 12/15 = 80% 15/15 = 100% 11/15 = ~73% 5/15 = ~33% 

Discordances 

mineures 

3/15 = 20% - 2/15 = ~13% 8/15 = ~54% 

Discordances 

majeures 

- - 1/15 = ~7% 2/15 = ~13% 

Discordances 

very majeur 

- - 1/15 = ~7% - 

Remarques - - - - 

Résultat étude précédente FUNGITEST – mes résultats 

Flucytosine 


B 

Fluconazole Itraconazole 

Concordances 9/15 = 60% 11/13 = ~85% 6/15 = 40% 9/13 = ~69% 

Discordances 

mineures 

6/15 = 40% 2/13 = ~15% 9/15 = 60% 3/13 = ~23% 

Discordances 

majeures 

- - - 1/13 = ~8% 

Discordances 

very majeur 

- - - - 

Remarques - 2 ininterprétables - 2 ininterprétables 

Comme l’antifongique itraconazole n’est pas présent dans les cartes Vitek, nous 

avons comparé nos résultats avec ceux obtenus dans l’étude précédente. 

En comparant ces résultats, nous nous apercevons que c’est au niveau du 

fluconazole qu’il y a le plus de discordances. Il y a également peu de concordance 

au niveau de l’itraconazole. 

Nous constatons qu’il y a tout de même une meilleure correspondance avec les 

résultats de l’ATB FUNGUS 2 ® bien que le nombre de discordances soit relativement 

élevé. 

3.7.3 Reproductibilité 

La reproductibilité des deux méthodes est vérifiée grâce à 2 souches ATCC testées 

lors de chaque série. 

Pour la souche ATCC de Candida parapsilosis, la reproductibilité est excellente pour 

les 2 méthodes et les résultats obtenus correspondent à ceux attendus 

Pour la souche ATCC de Candida krusei, la reproductibilité est très bonne aussi, 

seule une fois les 2 méthodes ont donné une discordance mineure. Une erreur de 

manipulation en est sûrement la cause. 

Gloor Ariane 



2008-2009 

44/62


3.8 Discussion 

3.8.1 Avantages et inconvénients de l’ATB FUNGUS 3 ® 

Avantages 

Inconvénients 

- Le matériel dont on a besoin est fourni dans le kit, sauf le NaCl 

0.85% 

- Les CMI obtenues sont précises, grâce à plusieurs concentrations 

d’antifongiques différentes. 

- Interprétation des résultats facilitée par rapport à l’E-test. 

- Le prix est relativement bon marché, environ Fr. 140.95.- pour 25 

galeries soit Fr. 5.65.- par galerie 

- Préparation assez longue comprenant plusieurs étapes 

- La lecture de la quantification de la croissance est relativement 

difficile au début et peut varier selon les personnes. Le résultat 

dépend de notre jugement. 

- Parfois résultat peu clair. Le problème provenait certainement 

d’une mauvaise préparation ou d’une incubation inadéquate. 

- Le temps d’incubation est de 24 heures pour toutes les espèces, 

sauf le Candida glabrata (48 heures). 

- Après 48 heures, les cupules de la galerie sont parfois sèches et 

ininterprétables. 

- Le contenu d’un kit est de 25 galeries et la date de péremption est 

de 8 mois. Le kit ne sera certainement pas écoulé durant ce laps 

de temps. 




2008-2009


3.8.2 Avantages et inconvénients de la carte Vitek AST-YS01® 

Avantages 

Inconvénients 

- La préparation est simple et rapide. 

- Facilité de stockage et pour l’élimination des déchets. 

- Code barre individuel (reconnaissance du type de carte, 

traçabilité, carte périmée rejetée par le système). 

- Tout le matériel est fourni, soit la carte. Il manque juste le NaCl 

pour faire la suspension. 

- Les temps d’incubation prescrits sont plus ou moins corrects pour 

toutes les espèces de Candida ainsi que pour le Cryptococcus 

neoformans. 

- Résultats rapidement disponibles. 

- Méthode standardisée et automatisée. 

- Reproductibilité excellente. 

- Le contenu du kit est de 20 cartes et la date de péremption est de 

14 mois, donc adapté à la consommation en routine. 

- Le prix est plus élevé que pour l’ATB FUNGUS 3 ® : 

environ Fr. 173.40.- pour 20 cartes soit Fr. 8.65.- par carte. 

- Il manque l’itraconazole par rapport à la galerie ATB FUNGUS 3 ®. 

3.9 Conclusion et synthèse 

Personnellement, les deux antifongigrammes obtiennent des résultats plus ou moins 

équivalents. 

Cependant, les CMI obtenues avec la nouvelle carte Vitek AST-YS01® ont une 

meilleure précision ainsi qu’une bonne reproductibilité, car c’est l’automate qui définit 

la CMI et non l’œil du technicien. 

Après avoir étudié les différents avantages et inconvénients des deux méthodes, je 

pense que la nouvelle carte Vitek AST-YS01® est la méthode la plus intéressante 

pour un laboratoire tel que celui de l’ICHV de Sion. 




2008-2009


La carte Vitek AST-YS01® ne coûte pas tellement plus cher que les galeries ATB 

FUNGUS 3 ®. De plus, il est intéressant d’avoir des CMI précises. La méthode est 

automatisée et il y a donc une bonne reproductibilité et pas de variations suivant la 

personne qui doit rendre les résultats. 

Quant à l’aspect pratique, tout est compris dans le kit à part les tubes en plastique 

stériles, les écouvillons et le NaCl à 0.85% soit du matériel utilisé en routine donc 

n’engendrant pas de frais supplémentaires. 

Un autre point positif est le gain de temps par rapport à l’autre méthode. Ceci est 

intéressant pour le médecin afin de prescrire un traitement adéquat rapidement. 

Pour ce qui est des résultats, nous rendons ceux obtenus par l’automate. Un autre 

point positif est la longue échéance de la date de péremption qui est de 14 mois par 

rapport à 8 mois pour les galeries. 

Les points négatifs seraient l’absence d’itraconazole par rapport à la galerie ATB 

FUNGUS 3 ®, ainsi que la présence des 4 antifongiques présents dans la carte. Il n’y 

pas de possibilités de tester d’autres antifongiques. 

En ce qui concerne cette galerie il s’agit d’une bonne méthode également. 

Cependant, le nombre de manipulations pour la préparation est plus important que 

pour la méthode en carte. De plus, les résultats sont moins fiables au niveau des 

CMI. 

Pour ces raisons, les galeries sont moins bien adaptées à un laboratoire de routine 

tel que l’unité de bactériologie de l’ICHV de Sion. 

En revanche, le prix est plus intéressant et il y a un antifongique de plus. 

3.10 Perspectives 

Il serait intéressant de tester en parallèle d’autres méthodes d’antifongigrammes 

produits par différents fournisseurs comme par exemple Eurobio ou Biorad. 

Ceci permettrait de comparer de manière élargie toutes les techniques actuellement 

sur le marché, ou de tester d’autres espèces de Candida comme le Candida 

dubliniensis, le C. norvegensis, le C. robusta ou le C. famata. 

Un autre point intéressant serait de tester de nouveaux antifongiques comme la 

caspofongine ou le posaconazole. 

Nous pourrions également tester plus de souches ce qui nous permettrait d’avoir un 

meilleur aperçu des capacités de cette nouvelle méthode. 




2008-2009


4. Remerciements 

Pour commencer, je souhaite remercier le Dr. Gérard Praz qui m’a permis de réaliser 

cette étude au sein du laboratoire de bactériologie de l’ICHV de Sion. 

Je remercie également toute l’équipe du laboratoire de bactériologie de l’ICHV pour 

leur disponibilité, leur bonne humeur et leur gentillesse. 

Je tiens à remercie tout particulièrement Mme Lysiane Tissières Lovey, laborantinecheffe, 

qui m’a consacré de son précieux temps et qui m’a guidée et conseillée ainsi 

que Dominique Constantin de m’avoir mis à disposition les souches ce qui m’a 

permis de réaliser cette étude. 

5. Glossaire 

• Antifongigramme : Technique de détermination de l’activité d’un ou 

plusieurs antifongiques face à un champignon 

(levure ou moisissure). 

• Antifongique : C’est une substance naturelle ou un médicament 

susceptible d’entraver le développement ou bien 

de détruire le champignon. 

• Ascomycètes : Subdivision des champignons dont le mode de 

reproduction sexuée est caractérisé par la 

formation d’asques et d’ascospores. 

• Ascospores : Spore sexuée des Ascomycètes formée à 

l’intérieur d’un asque. 

• Asexué : Se dit d’un mode de reproduction qui ne provient 

pas de l’union de deux champignons de sexes 

opposés, mais résulte d’une simple mitose. 

• Asque : Formation sexuée chez les Ascomycètes, soit 

arrondie, soit allongée avec une ou deux paroi (s). 

Elle renferme les ascospores (après méiose). 

• ATCC : American Type Culture Collection. Il s’agit de 

souches de référence provenant de l’Institut 

Pasteur à Paris permettant de vérifier les 

techniques utilisées, de définir leur reproductibilité 

et de valider les résultats obtenus. 

• Basidiomycètes : Subdivision des champignons dont la reproduction 

sexuée est caractérisée par la formation de spores 

externes (basidiospores) formés à l’extrémité des 

basides. 




2008-2009


• Bourgeonnement : Mode de propagation asexué rencontré souvent 

chez les levures. Cela aboutit à la production de 

cellules filles issues de la cellule initiale par 

séparation d’une excroissance de cette dernière 

appelée cellule mère. Le bourgeonnement 

multilatéral correspond à un bourgeonnement dans 

plusieurs directions. 

• Caséeux : Se dit d’une lésion qui a l’aspect et la consistance 

du fromage. 

• Chitine : C’est un composé polysaccharidique à base de Nacétyl-glucosamine, 

qui rentre dans la composition 

de la carapace des insectes et des crustacés. Il est 

aussi présent à des degrés divers, dans la paroi 

des champignons. 

• Cosmopolite : Se dit d’un organisme qui vit partout dans le 

monde. 

• Deutéromycètes : Subdivision regroupant l’ensemble des 

champignons dont la reproduction sexuée est 

inconnue. Ils comprennent 3 classes : les 

Hyphomycètes, les Coelomycètes et les 

Blastomycètes. 

• Eucaryotes : C’est l’ensemble des êtres vivants qui possèdent 

un vrai noyau. Ils se divisent en quatre règnes : les 

protistes, les mycètes, les plantes et les animaux. 

• Fongicide : Substance (ou médicament) qui est capable dans 

certaines conditions, de tuer le champignon. 

• Fongistatique : Substance (ou médicament) qui n’est capable que 

de ralentir ou d’inhiber la croissance des 

champignons sans les détruire. 

• Hétérotrophe : Mode nutritionnel des êtres vivants appartenant au 

règne animal et à celui des champignons qui pour 

se nourrir, utilisent des aliments organiques déjà 

produits par d’autres organismes vivants. 

• Hexosaminidase : Il s’agit d’une enzyme impliquée dans l’hydrolyse 

de plusieurs molécules contenant de l’hexose. 

• Hyphe : Chez les champignons, c’est l’élément constitutif 

du thalle, d’aspect tubulaire, septé ou non comme 

chez les Zygomycètes. L’ensemble des hyphes 

constituent le mycélium. Synonyme : filaments 

mycéliens. 




2008-2009


• Mac Farland : Unité de mesure d’un trouble produit par des 

bactéries dans une solution. 

• Métabolite : Se dit du produit de la transformation d’une 

substance de l’organisme. 

• Monomères : Il s’agit de molécules qui peuvent s’unir les unes 

aux autres pour former des polymères. 

• Mycélium : Ensemble d’hyphes qui constituent le thalle : 

élément végétatif des champignons. 

• Mycètes : Il s’agit d’un des cinq règnes du monde vivant 

selon la classification de Wittaker (1969) C’est un 

organisme eucaryote, hétérotrophe constitué d’un 

thalle unicellulaire ou filamenteux, qui vit en 

saprophyte ou parfois en parasite. Synonyme : 

champignon. 

• Mycotoxinose : Intoxication d’orginie alimentaire provoqué par un 

champignon microscopique qui s’est développé 

dans les aliments (céréales). 

• Plasmalemme : Il s’agit de la structure qui définit la cellule. C’est un 

constituant universel de toutes les cellules 

vivantes. 

• Rhizopode : Phylum regroupant les Protozoaires qui se 

déplacent et se nourrissent à l’aide d’expansions 

cytoplasmiques (exemple : amibes). 

• Sabouraud : Milieu de culture habituel en mycologie, il contient 

de la gélose (agar-agar), de peptone de soja, du 

glucose et de l’H2O distillée. On y additionne 

souvent des antibiotiques (gentamicine et 

chloramphénicol) et un antifongique pour inhiber la 

pousse de certaines moisissures et levures 

indésirables. 

• Saprophyte : Se dit d’un organisme vivant qui s’alimente dans la 

nature à partir de débris organiques en 

décomposition (matière morte). 

• Spore : Élément qui assure la dispersion et la reproduction 

des champignons. Elle provient d’une reproduction 

sexuée ou asexuée. Synonyme : propagule 

fongique. 




2008-2009


• Taxonomie : Science de la classification qui permet de 

regrouper les êtres vivants en taxons (genres, 

espèces) selon des critères bien définis. 

• Thalle : Ensemble de l’appareil végétatif et reproducteur 

d’un champignon. Il peut être unicellulaire (levure) 

ou filamenteux. 

• Topique Se dit d’un traitement qui s’applique localement, 

directement sur la peau et les muqueuses. Le but 

est d’agir localement et de diminuer les effets 

généraux des traitements. 

• Tropisme : Le fait d’être attiré vers. 

6. Bibliographie 

6.1 Livre 

• Chabasse,D., Guigen, Cl. & Contet-Audonneau, N. (1999). Mycologie 

médicale. Paris : MASSON 

• Grigoriu, D., Delacrétaz, J.& Borelli, D. (1984). Traité de mycologie médicale. 

Suisse : Payot 

6.2 Brochure 

• Conférence de consensus commune (2004). Prise en charge des candidoses 

et aspergilloses invasives de l’adulte. Paris : ELSEVIER MASSON 

• DANNAOUI, E. (31.05.2007). Principaux antifongiques systémiques : 

Mécanismes d’action et de résistance, spectre, indications. Centre National de 

Référence de la Mycologie et des Antifongiques, Institut Pasteur, Paris 

6.3 Supports de cours, documents non publiés 

• Chabasse, D., Bouchara, J.-P., de Gentile, L., Brun, S., Cimon, B., Penn, P. 

(2004). Cahier de Formation : Biologie médicale N°31 : Les dermatophytes. 

[Présentation Power Point]. Bioforma, France 

• Chabasse, D., Bouchara, J.-P., de Gentile, L., Brun, S., Cimon, B., Penn, P. 

(mars 2002). Cahier de Formation : Biologie médicale N°25 : Les moisissures 

d’intérêt médical. [Présentation Power Point]. Bioforma, France 

• Constantin, D. (20.09.2003). Classeur des stagiaires.[Polycopié]. Laboratoire 

de bactériologie, ICHV Sion 

• Freydière, A.-M. (14.06.2007). Méthodes de détermination de la sensibilité 

aux antifongiques. [Présentation Power Point]. Centre de Bioforma, France 




2008-2009


6.4 Internet 

• Bahji, M., Sbiti, M., Belmaki, A., Agoumi, A. (13.03.2009). Diagnostic 

Biologique et identification des levures du genre candida [Page Web]. Accès : 

http://www.medramo.ac.ma/fmp/revue_marocaine/ARTICLES/2003- 

1/diagnostic%20biologique%20des%20candida.pdf 

(Page consultée le 11.03.2009) 

• BIOMERIEUX.(06.03.2009). Products VITEK® 2 Antifungal Testing [Page 

Web]. Accès : 

http://www.biomerieux-diagnostics.com/servlet/srt/bio/clinicaldiagnostics/dynPage?doc=CNL_PRD_CPL_G_PRD_CLN_92 


• BIOMERIEUX.(06.03.2009). Produits ATB FUNGUS 3 [Page Web]. Accès : 

http://www.biomerieux.fr/servlet/srt/bio/france/dynPage?doc=FRN_CLN_PRD 

_G_PRD_CLN_4 (Page consultée le 01.12.2008) 

• Compendium Suisse des Médicaments. (2009). COMPENDIUM SUISSE DES 

MEDICAMENTS. [Page Web]. Accès : 

http://www.kompendium.ch/Search.aspx?lang=fr 


• LABMED. (12.11.2007). Sujets choisis de mycologie ; Levures : Candida 

[Page Web]. Accès : 

http://www.labmed.ch/doc/doc_download.cfm?uuid=36309A76D9D9424C4F9 

520A5E21C828F&&IRACER_AUTOLINK&& 


• Regents of the University of California.(29.01.2003). Yeasts [Page Web]. 

Accès : 

http://labmed.ucsf.edu/education/residency/fung_morph/launchpage.html 





2008-2009


7. Annexes 

7.1 Procédure pour l’ATB FUNGUS 3 ® 




2008-2009


7.2 Feuille de résultat pour l’ATB FUNGUS 3 ® 




2008-2009


7.3 Résultats de l’étude précédente 

Résultats: Candida albicans 

Flucytosine 

≤4 / 8-16 / 32 ≥ 2 = R ≤8 / 16-32 / ≥64 

≤0.125/0.25-0.5/≥1 ≤ 2 - ≥ 32 ≤ 2 - ≥ 8 ≤ 8 - ≥ 64 ≤0.5 - ≥ 64 

No Localisation CMI Résultat CMI Résultat CMI Résultat CMI Résultat CMI Résultat CMI Résultat CMI Résultat CMI Résultat Remarques 

6 Hémoculture 0.5 S 0.5 S 0.5 S 0.125 S < 2 S < 2 S < 8 S < 0.5 S 

7 Hémoculture 0.5 S 0.5 S 0.25 S 0.125 S < 2 S < 2 S < 8 S < 0.5 S Flu: S 



23 Gorge 0.5 S 0.5 S 16 I 0.125 S < 2 S < 2 S < 8 S < 4 I 

38 Pus profond 0.5 S 0.5 S 1 S 0.125 S < 2 S < 2 S < 8 S < 0.5 S Incub.A:2j 

45 L.Pleural 0.5 S 0.5 S 0.25 S 0.125 S < 2 S < 2 S < 8 S < 0.5 S 

46 Lèvre 0.5 S 0.5 S 0.25 S 0.125 S < 2 S < 2 S < 8 S < 0.5 S 


55 Pl.profonde 0.5 S 0.5 S 4 S 0.25 I < 2 S < 2 S < 8 S < 0.5 S 

56 Urine sondée 0.5 S 0.5 S 0.25 S 0.125 S < 2 S < 2 S < 8 S < 0.5 S 



59 Hemoculture 0.5 S 0.5 S 1 S 0.125 S < 2 S < 2 S < 8 S < 0.5 S 

60 Hémoculture 0.5 S 0.5 S 1 S 0.125 S < 2 S < 2 S < 8 S < 0.5 S Flu: S 

61 Gorge 0.5 S 0.5 S 0.25 S 0.125 S < 2 S < 2 S < 8 S < 0.5 S 

62 Sputum 0.5 S 0.5 S 64 R 0.25 I < 2 S < 2 S < 64 I


Flucytosine 

≤4 / 8-16 / 32 ≥ 2 = R ≤8 / 16-32 / ≥64 ≤0.125/0.25-0.5/≥1 ≤ 2 - ≥ 32 ≤ 2 - ≥ 8 ≤ 8 - ≥ 64 ≤0.5 - ≥ 64 



84 Gorge 0.5 S 0.5 S 16 I 2 R < 2 S < 2 S < 64 I < 4 I Incub.A:3j 

98 Sputum 0.5 S 0.5 S 64 R 4 R < 2 S < 2 S < 64 I > 4 R Incub.A:2j 

99 Gorge 0.5 S 0.5 S 0.25 S 0.125 S < 2 S < 2 S < 8 S < 0.5 S Incub.A:2j 


101 Gorge 0.5 S 0.5 S 64 R 4 R < 2 S < 2 S > 64 R < 4 I Incub.A:2j 

102 Gorge 0.5 S 0.5 S 32 I 0.125 S < 2 S < 2 S < 64 I < 0.5 S Incub.A:2j 



105 0.5 S 0.5 S 0.5 S 0.125 S < 2 S < 2 S < 8 S < 0.5 S 

106 Sputum 0.5 S 0.5 S 0.5 S 1.125 S < 2 S < 2 S < 8 S < 0.5 S 



109 0.5 S 0.5 S 0.25 S 0.125 S < 2 S < 2 S < 8 S < 0.5 S 





Gloor Ariane 



2008-2009 

Souches ATCC 

Discordance mineure 

Discordance majeure 

Souche testée 2 x 

Résultats: Candida albicans suite 

ATB FUNGUS 2® 


Fluconazol 

Itraconazol 

Flucytosine 


Incub.A = Incubation ATB FUNGUS 

ITR = Itraconazol testé au CHUV 

FLU = Fluconazol testé au CHUV 

FUNGITEST® 

Fluconazol 

Itraconazol 

56/62


Flucytosine Amphotéricine B Fluconazol Itraconazol Flucytosine Amphotéricine B 

Fluconazol Itraconazol 

≤4 / 8-16 / 32 ≥ 2 = R ≤8 / 16-32 / ≥64 ≤0.125/0.25-0.5/≥1 ≤ 2 - ≥ 32 ≤ 2 - ≥ 8 ≤ 8 - ≥ 64 ≤0.5 - ≥ 64 


2 Vagin 0.5 S 0.5 S 1 S 0.125 S < 2 S < 2 S < 8 S < 0.5 S 

4 Hémoculture 0.5 S 0.5 S 1 S 0.125 S < 2 S < 2 S < 8 S < 0.5 S Incub.A:2 j./ Flu:S 

5 Hémoculture 0.5 S 0.5 S 0.25 S 0.125 S < 2 S < 2 S < 8 S ≥ 4 R Incub.A:2 j./ Flu:S/ Itr:I 

9 Hémoculture 0.5 S 0.5 S 2 S 0.5 I < 2 S < 2 S < 64 I 4 R Incub.A:2j./ Flu:I/ Itr:R 

14 Hémoculture 0.5 S 0.5 S 0.25 S 0.125 S < 2 S < 2 S < 8 S < 0.5 S Incub.A:3j./ Flu:S 

15 Aspiration 0.5 S 0.5 S 0.25 S 0.125 S < 2 S < 2 S < 8 S < 0.5 S Incub.A:2j 

17 Hémoculture 0.5 S 0.5 S 2 S 0.125 S < 2 S < 2 S < 64 I ≥ 4 R 

19 Hémoculture 0.5 S 0.5 S 16 I 1 R < 2 S < 2 S ≥ 64 R ≥ 4 R Incub.A:2j./ Flu:S/ Itr:I 

37 Aspiration 8 I 0.5 S 2 S 0.5 I < 32 I < 2 S < 8 S < 4 I Incub.A:2j 

39 Aspiration 0.5 S 0.5 S 2 S 0.125 S < 2 S < 2 S < 8 S < 0.5 S Incub.A:2j 

53 Lame 0.5 S 0.5 S 0.25 S 0.125 S < 32 I < 2 S < 8 S < 4 I Incub.A:2j 

54 Cathéter 2 S 0.5 S 2 S 0.25 I < 2 S < 2 S < 8 S < 4 I Incub.A:2j 

Gloor Ariane 



2008-2009 

Souches ATCC 




Résultats: Candida glabrata 

ATB FUNGUS 2® FUNGITEST® 




57/62


Flucytosine Amphotéricine B Fluconazol Itraconazol Flucytosine Amphotéricine B Fluconazol Itraconazol 

≤4 / 8-16 / 32 ≥ 2 = R ≤8 / 16-32 / ≥64 ≤0.125/0.25-0.5/≥1 

≤ 2 - ≥ 32 ≤ 2 - ≥ 8 ≤ 8 - ≥ 64 ≤0.5 - ≥ 64 


1 Ulcère 16 I 2 R 16 R 0.5 I < 32 I 32 R < 64 I 4 R 

24 Urotube 4 S 0.5 S 16 R 1 R < 32 I < 2 S < 64 I < 4 I 

25 Urine 16 I 1 S 32 R 1 R < 32 I < 8 I < 64 I < 4 I 

26 Cathéter cq 8 I 1 S 16 R 0.5 I < 32 I < 2 S < 64 I < 0.5 S 

28 16 I 0.5 S 16 R 0.5 I < 32 I < 2 S < 64 I



≤4 / 8-16 / 32 ≥ 2 = R ≤8 / 16-32 / ≥64 ≤0.125/0.25-0.5/≥1 

≤ 2 - ≥ 32 ≤ 2 - ≥ 8 ≤ 8 - ≥ 64 ≤0.5 - ≥ 64 


13 Hémoculture 32 R 1 S 1 S 0.25 I 32 R < 2 S < 8 S < 0.5 S 

27 Aspiration 0.5 S 0.5 S 0.5 S 0.125 S < 2 S < 2 S < 8 S < 4 I 

31 Sputum 64 R 0.5 S 2 S 0.25 I 32 R < 2 S < 8 S < 0.5 S 

32 LBA 0.5 S 0.5 S 1 S 0.125 S < 2 S < 2 S < 8 S < 0.5 S 

33 Sputum 32 R 0.5 S 0.25 S 0.125 S 32 R < 2 S < 8 S < 0.5 S 

36 Pus profond > 64 R 0.5 S 1 S 0.25 I > 32 R < 2 S < 8 S < 0.5 S 

42 Aspiration 64 R 1 S 2 S 0.25 I 32 R < 2 S < 8 S < 0.5 S 

43 Sputum 0.5 S 1 S 2 S 0.125 S < 2 S < 2 S < 8 S < 0.5 S 

44 Urine 0.5 S 0.5 S 0.25 S 0.125 S < 2 S < 2 S < 8 S < 0.5 S 

47 Aspiration 0.5 S 0.5 S 0.5 S 0.125 S < 2 S < 2 S < 8 S < 0.5 S 

78 Sputum 1 S 0.5 S 0.5 S 0.125 S < 32 I < 2 S < 8 S < 0.5 S 

88 Aspiration 32 R 0.5 S 2 S 0.125 S >32 R < 2 S < 8 S < 0.5 S 

91 Sputum 64 R 0.5 S 4 S 0.5 I > 32 R < 2 S < 8 S < 0.5 S 

96 Sputum 0.5 S 0.5 S 1 S 0.125 S < 2 S < 2 S < 8 S < 0.5 S 

Gloor Ariane 



2008-2009 

Souches ATCC Incub.A = Incubation ATB FUNGUS 




Résultats: Candida tropicalis 




59/62


Flucytosine Amphotéricine B Fluconazol Itraconazol 


≤4 / 8-16 / 32 ≥ 2 = R ≤8 / 16-32 / ≥64 ≤0.125/0.25-0.5/≥1 ≤ 2 - ≥ 32 ≤ 2 - ≥ 8 ≤ 8 - ≥ 64 ≤0.5 - ≥ 64 



10 0.5 S 0.5 S 2 S 0.125 S < 2 S < 2 S < 8 S < 0.5 S 


16 Pl.profonde 0.5 S 0.5 S 0.25 S 0.125 S < 2 S < 2 S < 8 S < 0.5 S 

18 Plaie 0.5 S 0.5 S 0.5 S 0.125 S < 2 S < 2 S < 8 S < 0.5 S 

21 0.5 S 0.5 S 2 S 0.125 < 2 S < 2 S < 8 S < 0.5 S 

29 Pied diabétique 0.5 S 0.5 S 0.5 S 0.125 S < 2 S < 2 S < 8 S < 0.5 S 

34 0.5 S 0.5 S 2 S 0.125 S < 2 S < 2 S < 8 S < 0.5 S 

48 L.Jackson 0.5 S 0.5 S 1 S 0.125 S < 2 S < 2 S < 8 S < 0.5 S Incub.A:2j 

49 Biopsiefémur 0.5 S 0.5 S 0.25 S 0.125 S < 2 S < 2 S < 8 S < 0.5 S Incub.A:2j 

51 0.5 S 0.5 S 2 S 0.125 S < 2 S < 2 S < 8 S < 0.5 S Incub.A:2j 

71 0.5 S 0.5 S 2 S 0.125 S < 2 S < 2 S < 8 S < 0.5 S 

73 0.5 S 0.5 S 0.25 S 0.125 S < 2 S < 2 S < 8 S < 0.5 S 

75 Urotube 0.5 S 0.5 S 0.25 S 0.125 S < 2 S < 2 S < 8 S < 0.5 S 

76 Urotube 0.5 S 0.5 S 0.25 S 0.125 S < 2 S < 2 S < 8 S < 0.5 S 

94 Oreille 0.5 S 0.5 S 1 S 0.125 S < 2 S < 2 S < 8 S < 0.5 S 

96 Hémoculture 0.5 S 0.5 S 1 S 0.125 S < 2 S < 2 S < 8 S < 0.5 S 

Gloor Ariane 



2008-2009 

Souches ATCC 




Résultats: Candida parapsilosis 





60/62



≤4 / 8-16 / 32 ≥ 2 = R ≤8 / 16-32 / ≥64 ≤0.125/0.25-0.5/≥1 

≤ 2 - ≥ 32 ≤ 2 - ≥ 8 ≤ 8 - ≥ 64 ≤0.5 - ≥ 64 


20 Aspiration 0.5 S 0.5 S 2 S 0.125 S < 2 S < 2 S < 64 I < 4 I 

22 Sputum 0.5 S 0.5 S 1 S 0.25 I < 2 S < 2 S < 8 S < 0.5 S 

77 Sputum 32 R 0.5 S 0.5 S 0.125 S < 32 I < 2 S < 8 S < 0.5 S 

87 cq ch 0.5 S 0.5 S 0.5 S 0.125 S < 2 S < 2 S < 8 S < 0.5 S 

90 Sputum 0.5 S 0.5 S 1 S 0.125 S < 2 S < 2 S < 8 S < 0.5 S 


97 Hémoculture 0.5 S 0.5 S 0.5 S 0.125 S < 2 S < 2 S < 8 S < 0.5 S Incub.A:2j 

Gloor Ariane 



2008-2009 





Résultats: Candida lusitaniae 




61/62




≤4 / 8-16 / 32 ≥ 2 = R ≤8 / 16-32 / ≥64 ≤0.125/0.25-0.5/≥1 ≤ 2 - ≥ 32 ≤ 2 - ≥ 8 ≤ 8 - ≥ 64 ≤0.5 - ≥ 64 


40 LCR 0.5 S 0.5 S 0.25 S 0.125 S < 32 I < 2 S < 8 S < 0.5 S 


Gloor Ariane 



2008-2009 





Résultats: Cryptococcus neoformans 




62/62

ANTIFONGIGRAMME :

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