I Programmi di calcolo e di elaborazione statistica - Age.Na.S.

I Programmi
di calcolo e di
elaborazione
statistica
http://www.qualityindicators.ahrq.gov/
downloads.htm

I Programmi disponibili per la
costruzione degli indicatori:
•Versione SAS
I Programmi SAS:
•Versione SPSS
Inpatient Quality Indicators

LA FILOSOFIA DEI PGM SAS
1. Programmi per il calcolo degli indicatori
2. File esterni per la gestione dei criteri di inclusione ed
esclusione
3.File di supporto per aggiustamento e smoothing
I Programmi
CONTROL.SAS Gestisce informazioni generali
IQSAS1.SAS Applica i criteri di inclusione
per ogni indicatore a tutti i
pazienti
IQSASP2.SAS Calcola gli indicatori grezzi
IQSASP3.SAS Calcola gli indicatori aggiustati
e “smooothed”
IQFMTS.SAS Contiene tutti i formati che
definiscono i criteri di
inclusione/esclusione

I files di supporto
MSXIQP02.TXT Contiene valori per la centratura
delle covariate
COVIQP02.TXT Contiene i valori dei parametri di
aggiustamento stimati su una
popolazione standard
QICTY02.TXT Contiene dati di popolazione
(USA)
MSXP00.TXT Contiene i valori dei coefficienti
per gli indicatori “smoothed”
1
Schema
3
2
SDO

control.sas deve essere personalizzato dall’utente
* --------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- ;
* --- All Programs --- ;
* ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------;
LIBNAME LIBRARY 'c:\pathname'; *

iqfmts.sas
Definisce i criteri di inclusione/esclusione per ogni
indicatore .
Se si devono variare i criteri di inclusione è sufficiente
modificare l’elenco dei codici ICD IX riportati nei formati.
NB: I programmi di calcolo non devono
più essere modificati
/* ----------------------------------------------- */
/* Acute Myocardial Infarction Mortality (MRTAMI) */
/* Mortality Indicator / IQI #15 */
/* ----------------------------------------------- */
/* Acute Myocardial Infarction */
/* ICD-9-CM Diagnosis Codes: */
VALUE $MRTAMID
'41001' = '1' /* AMI ANTEROLATERAL, INIT */
'41011' = '1' /* AMI ANTERIOR WALL, INIT */
'41021' = '1' /* AMI INFEROLATERAL, INIT */
'41031' = '1' /* AMI INFEROPOST, INITIAL */
'41041' = '1' /* AMI INFERIOR WALL, INIT */
'41051' = '1' /* AMI LATERAL NEC, INITIAL */
'41061' = '1' /* TRUE POST INFARCT, INIT */
'41071' = '1' /* SUBENDO INFARCT, INITIAL */
'41081' = '1' /* AMI NEC, INITIAL */
'41091' = '1' /* AMI NOS, INITIAL */
OTHER = '0' ;
iqfmts.sas
Esempio
formato per
TPIQ15

*=================================================================;
FILENAME CONTROL 'c:\pathname\CONTROL_IQI.SAS'; *

* --- IN-HOSP IN HOSP MORT AMI Richiama la macro MDX1 con il
Parametro MRTAMID
--- ;
Per cui il SAS legge così:
IF (AGE >= 18) AND %MDX1($MRTAMID.) THEN DO;
TPIQ15 = 0;
IF DISP = 20 THEN DO;
TPIQ15 = 1;
END;
denominatore
numeratore
Dataset in input
%MACRO MDX1 ($MRTAMID);
((PUT(DX1 ($MRTAMID)= '1'))
%MEND;
Modalità di dimissione
Deceduto
Struttura rigida ben definita
1. Deve contenere tutte le variabili richieste nominate
come indicato nel manuale AHRQ
2. I formati per tutte le variabili devono essere quelli
indicati nel manuale AHRQ

Variable
name
KEY
AGE
RACE
SEX
HOSPID
Variable
DRG
MDC
DX1 –
DX30
DISP
Description
Sequence number.
Unique case identifier.
Age in years at
admission
Race of patient.
Sex of patient
Data Source hospital
number
Description
Diagnosis Related
Group
Major Diagnostic
Category
ICD-9-CM diagnosis
codes. DX1 is the
principal diagnosis,
DX2-DX30 are
secondary diagnoses.
Disposition of patient
Format
Numeric
Numeric
Numeric
1
2
3
4
5
6
Numeric
1
2
Numeric
Format
Numeric
Numeric
String, 5
characte
r
Numeric
1
2
3
4
5
6
7
20
Value description
User defined unique
numeric identifier for
each discharge
record
Age in years
White
Black
Hispanic
Asian or Pacific
Island
Native American
Other
Male
Female
Hospital identification
number
Value description
DRG from federal
(CMS) DRG Grouper
MDC from federal
(CMS) DRG grouper
Diagnosis codes
Routine
Short-term hospital
Skilled nursing facility
Intermediate care
Another type of
facility
Home health care
Against medical
advice
Died in the hospital
Comments
Not used by the QI
programs, but should be
present to facilitate
possible exploration;
allows user to link the
records from the
IQSAS1.SAS program
output file back to the
original input data file.
If this data element is
missing the discharge
record will be excluded
from analysis.
The values of 1, 2, and 3
are used directly in the QI
software. All other
ethnicity codes are
mapped to an ‘other’
category.
If this data element is
missing the discharge
record will be excluded
from the analysis.
Used to facilitate data
exploration and possible
Comments
Users must specify the
number of diagnoses in the
parameter &NDX in
CONTROL_IQI.SAS
program.
The values 2 and 20 are
referenced by the QI code
(to identify transfers to
another short-term
hospital, and patients who
died in the hospital).

data a.sdo2002;set a.sdo2002_ (rename=(
diagn=dx1
cond1=dx2
cond2=dx3
cond3=dx4
cond4=dx5
cond5=dx6
interv=pr1
int1 =pr2
int2 =pr3
int3 =pr4
int4 =pr5
int5 =pr6
));
if cittad eq "100" then race = 1; else
if cittad lt "100" then race = .; else
race = 6;
Dataset in input
Ridenominazione variabili
Dataset in input
Passaggio critico di transcodifica: transcodifica effettuare scelte
per adattare le codifiche italiane alle codifiche USA
if modim eq "1" then disp = 1; else
if modim eq "3" then disp = 2; else
if modim eq "5" then disp = 3; else
if modim in ("7","8") then disp = 4; else
if modim in ("6","9") then disp = 6; else
if modim eq "2" then disp = 7; else
if modim eq "4" then disp =20;
if onere in ("1","2","7","N","D")
then pay1 =1; else
if onere in ("8","9","A" )
then pay1 =2; else
if onere in ("5","6" )
then pay1 =3; else
if onere eq "4"
then pay1 =4; else
if onere eq "3"
then pay1 =6;

TASSI
1. Identificare gli outcomes (numeratore
numeratore) nei record SDO
2. Identificare la popolazione a rischio (denominatore
denominatore)
3. Calcolare il tasso Osservato
4. Calcolare il tasso Atteso
numeratore
IQI =
denominato
re
5. Calcolare il tasso Aggiustato
6. Calcolare il tasso “Smoothed”
Tassi: numeratore
1. Identificare gli outcomes (numeratore
numeratore) nei record SDO
Per ogni indicatore si individuano i casi
Evento (decesso) & codici di diagnosi (principale)
Flag=1
Tassi: denominatore
2. Identificare la popolazione a rischio (denominatore
denominatore)
Per ogni indicatore si individua la popolazione a rischio
codici di diagnosi (principale) & criteri esclusione
Flag=0

Tassi: calcolo
3. Calcolare il tasso osservato
Per ogni ospedale:
1. Conteggio dei CASI
2. Conteggio della POPOLAZIONE A RISCHIO
3. Calcolo tasso
CASI
IQI
=
=
POPOLAZION E A RISCHIO
Dataset IQP2
numeratore denominatore
Ogni riga un ospedale
∑
∑ 0
1
& 1
tasso

Tassi: aggiustamento
4. Calcolare il tasso Atteso
Applicazione coefficienti di aggiustamento
5. Calcolare i tassi Aggiustati a partire dai tassi
Osservati ed Attesi
6. Calcolare i tassi Smoothed
(Particolare tecnica statistica che cerca di eliminare dalle stime
il “rumore” riducendo la variabilità entro struttura fra periodi.
Sono necessari dati relativi ad almeno 3 anni).
Dataset IQP3
Tasso aggiustato Tasso smoothed

OUTPUT
IQ1 data set contenente i record di tutti i pazienti con
indicatore di esito (0, 1, missing)
IQP2 data set contenente i valori degli indicatori grezzi
calcolati a livello di ospedale
IQP3 data set contenete i valori degli indicatori aggiustati
per il rischio, attesi e smoothed
Sintesi IQI
1. Scaricare i programmi dal sito AHRQ
2. Apportare le modifiche necessarie ai programmi di
elaborazione scaricati (control.sas)
3. Adattare i dati agli standard richiesti dall’AHRQ
4. Predisporre i file con i parametri di aggiustamento
5. Calcolare gli indicatori grezzi,attesi, aggiustati e
smoothed

I Programmi SAS:
Patient Safety Indicators
Come per gli indicatori IQI la struttura dei Programmi
SAS per i PSI è simile:
1. Programmi per il calcolo degli indicatori
2. File esterni per la gestione dei criteri di inclusione ed
esclusione
CONTROL.SAS Gestisce informazioni generali
PSFMTS.SAS Definisce i formati per i criteri di
inclusione/esclusione per ogni indicatore .
PSSAS1.SAS Applica i criteri di inclusione
per ogni indicatore a tutti i pazienti
PSSASP2.SAS Calcola gli indicatori grezzi

* --- FAILURE TO RESCUE --- ;
IF (%MDX2($FTR1DX.) AND
NOT (%MDX1($FTR1DX.) OR %MDX1($FTR1EX.) OR %MDX1($AMIID.) OR %MDX1($CARDRID.) OR
%MDX1($CARDIID.) OR %MDX1($HEMORID.) OR %MDX1($GASTRID.) OR %MDX1($SHOCKID.) OR
%MDX1($TRAUMID.) OR %MDR($TRAUMDR.)))
OR
(%MDX2($FTR2DX.) AND
NOT (%MDX1($FTR2DX.) OR %MDX1($OBEMBOL.)))
OR
(%MDX2($FTR3DX.) AND
NOT (%MDX1($FTR3DX.) OR %MDX1($FTR3EXA.) OR %MDX($FTR3EXB.) OR %MDX($IMMUNID.) OR
%MPR($IMMUNIP.) OR MDC IN (4)))
OR
(%MDX2($FTR4DX.) AND
NOT (%MDX1($FTR4DX.) OR %MDX($IMMUNID.) OR %MPR($IMMUNIP.) OR
%MDX1($INFECID.) OR %MDR($INFECDR.) OR LOS > 3)) OR
OR
((%MDX2($FTR5DX.) OR %MPR($FTR5PR.)) AND
NOT (%MDX1($FTR5DX.) OR %MDX1($FTR5EX.) OR %MDX1($HEMORID.) OR %MDX1($TRAUMID.) OR
%MDR($TRAUMDR.) OR %MDX1($GASTRID.) OR MDC IN (4,5)))
OR
(%MDX2($FTR6DX.) AND
NOT (%MDX1($FTR6DX.) OR %MDX1($FTR6EX.) OR %MDX1($TRAUMID.) OR %MDR($TRAUMDR.) OR
%MDX1($ALCHLSM.) OR MDC IN (6,7)))
THEN DO;
TPPS04 = 0;
IF DISP IN (20) THEN TPPS04 = 1;
denominatore
IF AGE >= 75 OR ASOURCE IN (2,3) OR DISP IN (2) OR MDC IN (15) THEN TPPS04 = .;
END;
pz. trasferito da Osp. Pubblico o pz. trasferito da struttura privata
accreditata o pz. trasferito da struttura privata non accreditata o pz.
trasferito da altro regime o tipologia di ricovero (day hospital -ricovero
ordinario – riabilitazione o lungodegenza), all'interno dello stesso
Istituto;
Se la modalità di dimissione è
“deceduto” va al numeratore
TRASFERIMENTO AD
ALTRO ISTITUTO PER
ACUTI.

OUTPUT PS1