Oefenopdracht DNA en aminozuurvolgorde - Biologiepagina
Oefenopdracht DNA en aminozuurvolgorde - Biologiepagina
Oefenopdracht DNA en aminozuurvolgorde - Biologiepagina
You also want an ePaper? Increase the reach of your titles
YUMPU automatically turns print PDFs into web optimized ePapers that Google loves.
Aminozuurvolgorde in eiwitt<strong>en</strong><br />
Doel: het bepal<strong>en</strong> van de <strong>aminozuurvolgorde</strong> in e<strong>en</strong> klein eiwit<br />
Achtergrondinformatie:<br />
Enzym<strong>en</strong> zijn eiwitt<strong>en</strong>. Om hun functie exact uit te voer<strong>en</strong>, is de volgorde van de aminozur<strong>en</strong> heel<br />
belangrijk. Het <strong>DNA</strong> in de cel, is de bepal<strong>en</strong>de factor voor de <strong>aminozuurvolgorde</strong>. Ribosom<strong>en</strong> <strong>en</strong><br />
mRNA spel<strong>en</strong> e<strong>en</strong> belangrijke rol bij de vorming van het eiwit. In het <strong>DNA</strong>, e<strong>en</strong> specifieke volgorde<br />
van drie ope<strong>en</strong>volg<strong>en</strong>de bas<strong>en</strong> (triplet code), komt overe<strong>en</strong> met e<strong>en</strong> specifiek aminozuur.<br />
Opdracht<strong>en</strong>:<br />
Bekijk het volg<strong>en</strong>de <strong>DNA</strong> segm<strong>en</strong>t. Dit is 1 zijde van het <strong>DNA</strong> molecuul. Dit is de str<strong>en</strong>g die straks<br />
gebruikt gaat word<strong>en</strong> voor de transcriptie. Deze str<strong>en</strong>g noem<strong>en</strong> we de matrijs of template str<strong>en</strong>g. (De<br />
str<strong>en</strong>g die niet afgelez<strong>en</strong> wordt noem<strong>en</strong> we de coder<strong>en</strong>de str<strong>en</strong>g).<br />
T A C A C A C G G A A T G G G T A A A A A A C T<br />
1) Bepaal de volgorde van het mess<strong>en</strong>ger RNA (mRNA) die correspondeert met de bov<strong>en</strong><br />
getek<strong>en</strong>de matrijs-str<strong>en</strong>g.<br />
2) Deel de mRNA code van links<br />
naar rechts in groep<strong>en</strong> van drie<br />
bas<strong>en</strong>. Deze groep<strong>en</strong> van drie<br />
bas<strong>en</strong> noem<strong>en</strong> we de codons.<br />
3) Rechts zie je e<strong>en</strong> tabel met<br />
mess<strong>en</strong>ger RNA codons. De<br />
drieletterige code in de tabel<br />
geeft aan welk aminozuur<br />
overe<strong>en</strong>komt met de codon.<br />
Schrijf de exacte<br />
<strong>aminozuurvolgorde</strong> hieronder:<br />
<strong>Biologiepagina</strong>.nl
4) Uit hoeveel aminozur<strong>en</strong> bestaat het eiwit op de vorige pagina?<br />
5) Wanneer niet de originele matrijs <strong>DNA</strong> str<strong>en</strong>g werd gebruikt, maar juist de<br />
teg<strong>en</strong>overligg<strong>en</strong>de (coder<strong>en</strong>de) <strong>DNA</strong> str<strong>en</strong>g, zou je dan nog steeds hetzelfde eiwit krijg<strong>en</strong>?<br />
6) Wat zou er gebeur<strong>en</strong> als door e<strong>en</strong> puntmutatie de vierde base (ad<strong>en</strong>ine) in de originele<br />
str<strong>en</strong>g was veranderd in thymine?<br />
7) Wat zou er gebeur<strong>en</strong> als door e<strong>en</strong> puntmutatie de zesde base (ad<strong>en</strong>ine) in de originele str<strong>en</strong>g<br />
was veranderd in guanine?<br />
8) Wat zou er gebeur<strong>en</strong> als door e<strong>en</strong> deletie de zev<strong>en</strong>de base (cytosine) in de originele str<strong>en</strong>g<br />
was verwijderd?<br />
9) Wat is de rol van het eerste <strong>en</strong> laatste triplet code in het originele <strong>DNA</strong> molecuul?<br />
10) Noem drie verschill<strong>en</strong> tuss<strong>en</strong> <strong>DNA</strong> <strong>en</strong> RNA.<br />
11) Uit hoeveel aminozur<strong>en</strong> bestaat e<strong>en</strong> eiwit dat gevormd wordt uit onderstaande <strong>DNA</strong>-matrijs?<br />
C C G G T A C C C G G A A T A T G G G A A C C T T A T C G G T A A<br />
12) Wat is het verschil tuss<strong>en</strong> de onderstaande begripp<strong>en</strong>:<br />
<strong>DNA</strong> transcriptie =<br />
<strong>DNA</strong> translatie =<br />
<strong>DNA</strong> replicatie =<br />
13) Geef van bov<strong>en</strong>staande drie process<strong>en</strong> aan in welk onderdeel van de cel deze plaats vind<strong>en</strong>.<br />
<strong>Biologiepagina</strong>.nl
ANTWOORDEN<br />
1) AUG / UGU / GCC / UUA / CCC / AUU / UUU / UGA<br />
2) .<br />
3) AUG = start; UGU = cysteine; GCC = alanine; UUA = leucine; CCC = proline; AUU =<br />
isoleucine; UUU = ph<strong>en</strong>ylalanine; UGA = stop<br />
4) 7 startcodon = methionine dus wel e<strong>en</strong> aminozuur, stop is ge<strong>en</strong> aminozuur<br />
5) Nee, er onstaan dan andere triplett<strong>en</strong> dus e<strong>en</strong> heel andere <strong>aminozuurvolgorde</strong><br />
6) UGU wordt nu AGU, dus i.p.v. cysteine onstaat er serine<br />
7) ACA wordt ACG, met als RNA codon UGC. Dit is nog steeds cysteine.<br />
8) De derde triplet wordt dan GGA, met de codon CCU (proline). Ook de volg<strong>en</strong>de triplett<strong>en</strong><br />
verander<strong>en</strong> daardoor. Ook het stopcodon bevat nu nog maar twee letters. Dit eiwit kan<br />
dus niet normaal functioner<strong>en</strong><br />
9) Deze codes bepal<strong>en</strong> de l<strong>en</strong>gte van het eiwit door het start<strong>en</strong> <strong>en</strong> stop<strong>en</strong> van de synthese<br />
van het molecuul, waardoor het eiwit het juiste aantal aminozur<strong>en</strong> krijgt.<br />
10) <strong>DNA</strong> is dubbelstr<strong>en</strong>gs, RNA <strong>en</strong>kelstr<strong>en</strong>gs. Ribose in RNA <strong>en</strong> desoxyribose in <strong>DNA</strong>. RNA<br />
heeft Uracil i.p.v. Thymine.<br />
11) T A C C C G G A A T A T G G G A A C C T T A T C is leesbare code. 8 triplett<strong>en</strong>, maar<br />
stopcodon is ge<strong>en</strong> aminozuur.<br />
12) <strong>DNA</strong> transcriptie = Mak<strong>en</strong> van mRNA afschrift van <strong>DNA</strong><br />
<strong>DNA</strong> translatie = Aflez<strong>en</strong> van mRNA door ribosoom waarbij eiwit gevormd<br />
wordt door aminozur<strong>en</strong> aan elkaar te koppel<strong>en</strong><br />
<strong>DNA</strong> replicatie = Kopiër<strong>en</strong> van het <strong>DNA</strong><br />
13) Transcriptie <strong>en</strong> replicatie in de celkern. Translatie gebeurt voornamelijk in het<br />
cytoplasma door de ribosom<strong>en</strong> die op het RER ligg<strong>en</strong>.<br />
<strong>Biologiepagina</strong>.nl