22.11.2014 Views

Boris Kryštufek Univerza na Primorskem ... - VideoLectures

Boris Kryštufek Univerza na Primorskem ... - VideoLectures

Boris Kryštufek Univerza na Primorskem ... - VideoLectures

SHOW MORE
SHOW LESS

Create successful ePaper yourself

Turn your PDF publications into a flip-book with our unique Google optimized e-Paper software.

VRSTA<br />

<strong>Boris</strong> Kryštufek<br />

<strong>Univerza</strong> <strong>na</strong> <strong>Primorskem</strong><br />

Prirodoslovni muzej Slovenije


Vrsta je v biologiji e<strong>na</strong> temeljnih<br />

enot, po pomenu primeljiva s<br />

konceptom ge<strong>na</strong>, celice, ekološke<br />

niše itd.


“species mean many things to<br />

many people”<br />

Agapow P-M. 2005. Species: demarcation and diversity. In: Prvis A et al. (eds)<br />

Phylogeny and Conservation. Cambridge Univ. Press: 57-75.


Karl Linne


Tipološki koncept


Charles Darwin in Alfred R. Wallace


Filetska speciacija


Filetska speciacija


Filetska speciacija


Filetska speciacija<br />

Divergent<strong>na</strong> speciacija


Biološka vrsta<br />

skupi<strong>na</strong> <strong>na</strong>ravnih<br />

populacij, ki se med<br />

seboj dejansko ali<br />

potencialno<br />

razmnožujejo, ki pa<br />

so reproduktivno<br />

izolirane od drugih<br />

takšnih skupin<br />

Ernst Walter Mayr


Vrsta je kolektiv<strong>na</strong> kategorija<br />

• Prostorska dimenzija<br />

• Časov<strong>na</strong> dimenzija


Simpatrija


Simpatrija<br />

Alopatrija


Parapatrija<br />

Spalax ehrenbergi


Vlažno<br />

52 54 58 60<br />

Suho


• Ekološki koncept<br />

• Kohezijski koncept<br />

• Filogenetski (kladistični) koncept<br />

• Evolucijski koncept<br />

• Genetska definicija<br />

• Koncept prepoz<strong>na</strong>vnosti<br />

• Nomi<strong>na</strong>listični koncept


de Queiroz (2007)<br />

• Konceptualni nivo<br />

• Operativni nivo<br />

De Queiroz, K. 2007. Species concept and species delimitation. Syst. Biol. 56: 879-886.


Konceptualno<br />

Species are separately<br />

evolving (segments of)<br />

metapopulation<br />

lineages


Genetski koncept vrste<br />

“Genetska vrsta” je skupi<strong>na</strong> genetsko<br />

kompatibilnih <strong>na</strong>ravnih populacij, ki so<br />

genetsko izolirane od drugih podobnih skupin.<br />

Baker, R.J., Bradley, R.D. 2006. Speciation in mammals and the genetic species concept.<br />

J. Mammalogy 87: 643-662.


Do genetske izolacije pride, ko se dva genoma<br />

razideta do točke, v kateri sta genetsko<br />

različ<strong>na</strong> in nič več ne delita skupne evolucijske<br />

usode.


Genetska variabilnost<br />

Znotraj vrst<br />

Med vrstami<br />

Spermophilus 0.0 – 4.0 1.3 – 11.3<br />

Microtus 0.2 – 4.4 4.3 – 11.1<br />

Baker, R.J., Bradley, R.D. 2006. Speciation in mammals and the genetic species<br />

concept. J. Mammalogy 87: 643-662.


Mus macedonis skupi<strong>na</strong><br />

mt DNA kontrol<strong>na</strong> regija<br />

Macholan M, Vyskočilova M, Bonhomme T, Kryštufek B, Orth A, Vohralik V. 2007. Genetic<br />

variation and phylogeography of free-living mouse species ... Mol. Ecol. 16: 4774-4788.


M. macedonicus macedonicus Balkan, A<strong>na</strong>tolija<br />

M. macedonicus “spretoides” Izrael<br />

M. cypriacus Ciper<br />

M. macedonicus M. cypriacus


Bayesian<br />

consensus tree<br />

TrN (%)<br />

M. cypriacus<br />

Ciper<br />

4.52<br />

M. macedonicus<br />

macedonicus<br />

Balkan, A<strong>na</strong>tolija<br />

7.28<br />

8.77<br />

2.19<br />

M. spicilegus<br />

M. macedonicus<br />

“spretoides”<br />

Izrael


Apodemus (cyt. b)<br />

Michaux, J. R., Mag<strong>na</strong>nou, E., Paradis, E., Nieberding, C., Libois, R. 2003. Mitochnodrial phylogeography of<br />

the woodmouse (Apodemus sylvaticus) in the Western Palearctic region. Mol. Ecol., 12: 685-697.<br />

Michaux, J. R., Libois, R., Paradis, E., Filippucci, M. G. 2004. Phylogeographic history of the yellow-necked<br />

fieldmouse (Apodemus flavicollis) in Europe and in the Near and Middle East. Mol. Phyl. Evol., 32: 788-798.


Apodemus sylvaticus<br />

W, C, N Europa / Italia + Balkans 1.5 – 1.6 Mya<br />

Italy / Balkans<br />

0.8 – 0.9 Mya<br />

Apodemus flavicollis<br />

Europa / Bližnji vzhod<br />

2.2 – 2.4 Mya<br />

Mus macedonicus / M. cypriacus<br />

0.4 – 0.6 Mya


200<br />

Število vrst<br />

# Species<br />

150<br />

100<br />

50<br />

0<br />

1750 1800 1850 1900 1950 2000<br />

Year


200<br />

Število vrst<br />

# Species<br />

150<br />

100<br />

50<br />

0<br />

1750 1800 1850 1900 1950 2000<br />

Year


200<br />

Število vrst<br />

# Species<br />

150<br />

100<br />

50<br />

0<br />

1750 1800 1850 1900 1950 2000<br />

Year


200<br />

Število vrst<br />

# Species<br />

150<br />

100<br />

50<br />

0<br />

1750 1800 1850 1900 1950 2000<br />

Year


Jaccard's Coefficient Similarity<br />

1,0<br />

0,5<br />

0,0<br />

0 25 50 75 100<br />

Time distance (years)<br />

r = -0.91<br />

p < 0.00001<br />

1912 / 2005


Hvala

Hooray! Your file is uploaded and ready to be published.

Saved successfully!

Ooh no, something went wrong!