doc. dr. Janja Trček 1
Predstavitev_JanjaTrcek.pdf
Predstavitev_JanjaTrcek.pdf
You also want an ePaper? Increase the reach of your titles
YUMPU automatically turns print PDFs into web optimized ePapers that Google loves.
<strong>doc</strong>. <strong>dr</strong>. <strong>Janja</strong> <strong>Trček</strong><br />
Univerza v Mariboru<br />
Fakulteta za naravoslovje in matematiko<br />
Oddelek za biologijo<br />
E-mail: janja.trcek@uni-mb.si<br />
Raziskovalna po<strong>dr</strong>očja:<br />
Splošna mikrobiologija<br />
Uporabna mikrobiologija<br />
Mikrobna biotehnologija<br />
Vsebina predstavitve<br />
1. Mikroorganizmi kot predmet raziskovanja<br />
2. Povezava z gospodarstvom<br />
3. Predlagane povezave s programsko skupino na FKKT<br />
1
Objekt raziskovanja<br />
Ocetnokislinske bakterije<br />
A. Bogat nabor dehi<strong>dr</strong>ogenaz, pomembnih za<br />
proizvodnjo biotehnoloških proizvodov.<br />
B. Tvorba ekstracelularnih polisaharidov.<br />
C. Simbionti žuželk.<br />
D. Fiksatorji N 2 (spodbujevalci rasti rastlin).<br />
A.<br />
B.<br />
Yersinia enterocolitica<br />
• Študij sekrecijskega sistema tip III.<br />
• Funkcijska genomika: izražanje genov, ki kodirajo adhezine in invazine.<br />
Pseudomonas aeruginosa<br />
• Študij ekoloških izolatov.<br />
• Disekcija genetskega otoka, ki je vključen v adaptacijo na različne<br />
pogoje rasti pri kroženju P. aeruginosa med različnimi ekološkimi<br />
nišami (človek, voda …).<br />
2
Molekularno-biološki pristopi za karakterizacijo/identifikacijo<br />
mikroorganizmov<br />
A. Preiskovanje plazmidnih profilov.<br />
B. Verižna reakcija s polimerazo v kombinaciji s kloniranjem in sekveniranjem.<br />
C. Uporaba fluorescenčno označenih začetnih oligonukleotidov v kombinaciji<br />
s fluorescenčnim mikroskopom in pretočno citometrijo.<br />
A. B.<br />
C.<br />
Odgovor celic na stresne faktorje okolja<br />
A. Morfološke spremembe ocetnokislinskih bakterij<br />
Izpostavitev bakterij<br />
Ga. europaeus in A.<br />
pasteurianus<br />
različnim konc.<br />
ocetne kisline.<br />
Vrstične elektronske<br />
mikrografije, daljica<br />
prikazuje 1 μm.<br />
3
Rastne karakteristike in funkcijska genomika<br />
Rastne karakteristike<br />
Ga. europaeus Ga. intermedius A. pasteurinus<br />
A<br />
Acidity (%)/Ethanol (%)/Glucose (g/L)<br />
6<br />
400<br />
350<br />
5<br />
300<br />
4<br />
250<br />
3<br />
200<br />
150<br />
2<br />
100<br />
1<br />
50<br />
0<br />
0<br />
0 2 4 6 8 10 12 14 16 18 20<br />
Time (days)<br />
Growth (Klett units)<br />
B<br />
Acidity (%)/Ethanol (%)/Glucose (g/L)<br />
6<br />
180<br />
160<br />
5<br />
140<br />
4<br />
120<br />
100<br />
3<br />
80<br />
2<br />
60<br />
40<br />
1<br />
20<br />
0<br />
0<br />
0 2 4 6 8 10 12 14 16 18 20<br />
Time (days)<br />
Growth (Klett Units)<br />
C<br />
Acidity (%)/Ethanol (%)/Glucose (g/L)<br />
6<br />
100<br />
90<br />
5<br />
80<br />
70<br />
4<br />
60<br />
3<br />
50<br />
40<br />
2<br />
30<br />
20<br />
1<br />
10<br />
0<br />
0<br />
0 2 4 6 8 10 12 14 16 18 20<br />
Time (days)<br />
Growth (Klett Units)<br />
Legend: acidity % (w/v) glucose (g/L)<br />
Klett Units<br />
ethanol % (v/v)<br />
Uporaba reporterskih genov Dommel et al., 2010<br />
Povezave s programsko skupino FKKT<br />
Kemijski pristopi za<br />
fenotipizacijo mikroorganizmov<br />
- FT-IR spektroskopija<br />
- Masna spektrometrija (MALDI-TOF/MS)<br />
Karakterizacija ekstracelularnih<br />
polisaharidov ocetnokislinskih<br />
bakterij<br />
- Antimikrobne lastnosti<br />
- Adsorbcijske karakteristike<br />
- Poroznost<br />
- Iskanje specifičnih lastnosti<br />
glede na biotehnološko aplikacijo.<br />
FTIR-spekter<br />
4
Hvala za pozornost!<br />
Gluconacetobacter europaeus<br />
5
Change language