dr.sc. Jasna Peter-KataliniÄ
dr.sc. Jasna Peter-KataliniÄ
dr.sc. Jasna Peter-KataliniÄ
Create successful ePaper yourself
Turn your PDF publications into a flip-book with our unique Google optimized e-Paper software.
Zivotopis<br />
1. Ime<br />
<strong>Jasna</strong> <strong>Peter</strong>-Katalinić<br />
2. Obrazovanje<br />
Habilitacija: “Mass spectrometric investigations on glycoconjugates”, Institute for
Physiological Chemistry, University of Bonn, 1996<br />
Doktorat: “Sigmatropic rearrangements of strained tricyclic systems”, Institute for<br />
Organic Chemistry, University of Zürich (Switzerland) 1968-1973, magna cum<br />
laude.<br />
3. Zaposlenja (u obrnutom kronoloskom redu)<br />
- Voditelj laboratorija za sistemsku glikomiku na biotehnoloskom odjelu Sveucilista u Rijeci (2009)<br />
- Full Professor of Molecular Medicine and Biochemistry and Director of the Mass Spectrometry<br />
Core Facility (part-time) Medical College of Georgia, Augusta, Ga., USA (2001-2003)<br />
- Associate Professor of Biophysics (C3) at the University of Muenster (Germany) 1996-2008<br />
- Research Scientist and Habilitant at the University of Bonn (Germany) 1978-1980 and 1982-<br />
1996<br />
- Postdoc and lecturer at Texas A+M Univ. College Station (Texas, USA) 1973-1976<br />
- Graduate student and research associate at University of Zürich (Switzerland) 1968-1973<br />
4. Profesionalna, znanstvena i akademska dostignuca<br />
a. Znanstveni projekti kao voditelj:<br />
Znanstveni projekti financirani iz javnih sredstava od godine 2000 do sada: 16<br />
Sveukupna financijska davanja u projektima iz javnih sredstava od 2000 do sada: 3,6<br />
Mio €<br />
Znanstvene teme i projekti se nalaze na po<strong>dr</strong>ucju strukturne biokemije i biofizike u istrazivanju<br />
structure i funkcije ugljicnih hi<strong>dr</strong>ata u zivim organizmima. Ta su usmjerena prema otkrivanju i<br />
validiranju specificnih molekula, koje se ili aberantno stvaraju ili akumuliraju u klinicki<br />
evidentnim bolestima, koje nastaju zbog nasljednih defekata metabolizma ugljicnih hi<strong>dr</strong>ata. I u<br />
tumorskim bolestima ima nakupljenih specificnih ugljicnih hi<strong>dr</strong>ata, koji se smatraju tumorskim<br />
antigenima, tako da kroz istrazivanja proteomike i glikoproteomike raka se ti antigeni mogu<br />
kvalitativno i kvantitativno o<strong>dr</strong>editi da sluze za dizajn tocnije dijagnoze ili kao baza za razvitak<br />
novih terapeutskih lijekova. U ljudskim bolestima poput bakterijskih infekata,<br />
muskuloskeletalnih bolesti i raznih upala igraju ugljicni hi<strong>dr</strong>ati vazne uloge kod etiologije tih<br />
bolesti. Moj laboratorij je od 2000 do danas aplicirao za niz projekata, od kojih je 16 u ukupnoj<br />
vrijednosti od 3,6 miliona € bilo odobreno. 50% tih sredstava je bilo upotrijebljeno za nabavku<br />
modernih analitickih instrumenata za spektrometriju masa i njihovu periferiju. Ostalih 50% je<br />
upotrijebljno za financiranje studenata i postdoktora, koji su radili na tim projektima. Najveci<br />
dio financiranja iz javnih sredstava je stigao iz njemackog fonda za znanstvena istrazivanja<br />
(Deut<strong>sc</strong>he For<strong>sc</strong>hungsgemein<strong>sc</strong>haft, DFG), evropske unije (EU), i fonda za inovativna<br />
medicinska istrazivanja sveucilista u Münsteru (University of Münster Innovative Medical<br />
Research (IMF)). Broj znastvenika u laboratoriju, ukljucujuci osobe s habilitacijom, doktoratom<br />
i diplomom iznosio je 2006 20 osoba, a broj osoba u svim vlastitim i kolaborativnim projektima<br />
s industrijskim poduzecima, sveucilistima I <strong>dr</strong>ugim znanstvenim institucijama je bio oko 50.<br />
Rezultati znanstvenih istrazivanja su objavljeni u casopisima i knjigama, gdje je momentalan<br />
broj izaslih radova u citiranim casopisima 286. Taj broj ukljucuje i nekoliko preglednih clanaka i<br />
priloga knjigama. Djelovala sam i kao gost editor za casopise „Biological Chemistry“: Highlight<br />
Glycobiology (February 2001) i „Electrophoresis“: CE-MS (July 2004), i kao koeditor<br />
monografije: „A Practical guide to MALDI-MS“ (Wiley, 2008) zajedno s kolegom Franzom<br />
Hillenkampom.<br />
U sedam vec dovrsenih industrijskih projekata su se obradjivale primijenjene teme<br />
proteomike i glikoproteomike, a jedan patent je bio prijavljen i odobren. Ukupno 35<br />
experimentalnih diplomskih I doktorskih radnji je bilo obradjeno i obranjeno pod<br />
mojim vodstvom.<br />
b. Tutorstvo diplomskih i doktorskih radova: 35<br />
c. Suradnja<br />
Medicinski fakultet sveucilista u Münsteru:<br />
Berdel, interna medicina/onkologija; Senninger, kirurgija; Bruckner, fizioloska kemija.
Matematicko prirodoslovni fakultet sveucilista u Münsteru:<br />
EU Nano2Life Network, kolaborativni znanstveni project 492 (Sonderfor<strong>sc</strong>hungsbereich, SFB):<br />
ekstracelularni matriks.<br />
Suradnja s nacionalnim institucijama, sveucilistima u Frankfurtu, Hamburgu, Münchenu i<br />
Kölnu.<br />
Internacionalna suradnja s grupama u Austriji, Engleskoj, Francuskoj, Hrvatskoj, Israelu, Italiji,<br />
Svedskoj, Svicarskoj i USA.<br />
d. Patenti<br />
Müthing J, <strong>Peter</strong>-Katalinić J, Langer M, Möckel B, Eck J (2003) Procedure for determination of<br />
responsivity of an individuum for mistletoe lectin. International Patent WO 2003/054544 A3<br />
(publication date: July 3, 2003).<br />
e. Nagrade i priznanja<br />
- 1 st Life Science Award from the German Society of Mass Spectrometry (DGMS) 2002<br />
- koordinator of Strategic Research Project "Nanobioanalytics" in Nano2Life EU Network<br />
- clan upravnog odbora u HUPO Human Glycoprotein Initiative (HGPI)<br />
- eksekutivni editor Journal of Proteomics<br />
- clan Advisory Board u Journal of the American Society of Mass Spectrometry, Journal of<br />
Proteome Research (do 2008)<br />
2005-danas: gostujuci profesor medicinskog fakulteta sveucilista u Zagrebu<br />
2007: gostujuci profesor u laboratoriju za organsku kemiju, Eidgenössi<strong>sc</strong>he<br />
Techni<strong>sc</strong>he Hoch<strong>sc</strong>hule (ETH), Zürich, Svicarska<br />
Novija pozivna predavanja:<br />
Osaka, Japan (HUPO: Human Glycoprotein Initiative, HGPI)<br />
Yokohama, Japan (Japan HUPO Meeting)<br />
Siena, Italy (6 th Proteomics Meeting)<br />
Vienna, Austria (Austrian Proteome Society)<br />
Lund, Sweden (Swedish Proteome Society)<br />
Seattle, USA (3 rd UPPCOM)<br />
Noordwijkhout, Holland (FEBS Special Meeting on Lipidomics)<br />
Stockholm, Sweden (Swedish MS Society 2008)<br />
Jena, Germany (2nd CEEPC)<br />
Milano, Italy (4 th ItPA)<br />
Hinxton/Cambridge, UK (6 th BSPR/EBI).<br />
Organizacija skupova i ljetnih tečaja:<br />
Summer Course “Mass Spectrometry in Biotechnology and Medicine, Dubrovnik, Croatia<br />
1 st Sept. 14-21, 2001<br />
2 nd July 7-14, 2007<br />
3 rd July 5-11, 2009<br />
November 2002: 13th Joint meeting of the German, Dutch, French and Belgian societies for<br />
Glycobiology, u dvorcu Raesfeld blizu Münstera.<br />
DGMS 7-10 ozujak 2003: godisnji kongres njemačkog <strong>dr</strong>ustva za spektrometriju masa<br />
(Deut<strong>sc</strong>he Gesell<strong>sc</strong>haft für Massenspektrometrie) u Münsteru<br />
5. Značajna dostignuća u znanosti<br />
U bioloskoj spektrometriji masa (MS) razvitak instrumenata i njihova primjena na istrazivanja<br />
ljudskih bolesti predstavljaju u zadnjih 20 godina najveci znanstveni izazov. Na tom po<strong>dr</strong>ucju<br />
djelujem kao jedan od osnivaca te di<strong>sc</strong>ipline, gdje nam se paznja fokusira na razvitak i<br />
primjenu biofizikalnih i biokemijskih aspekata za o<strong>dr</strong>edjivanja struktura molekula, koje igraju<br />
mogucu ulogu u ljudskim bolestima. Kroz razvitak novih metoda analize i znacajne skretnice u<br />
misljenju, tj. vidljive promjene nacina stvaranja hipoteza, sistemska biologija se integrira u<br />
matematicke bioinformaticke sisteme, koji se mogu adaptirati za strukturnu analizu<br />
kompleksnih mjesavina. Uloga biofizike u strukturnoj sistemskoj biologiji se narocito o<strong>dr</strong>azava<br />
u razvitku metoda spektrometrije masa za molekularnu detekciju i identifikaciju. Ionizacija i
detekcija u plinskoj fazi je tako unapredovala, da se s MALDI-TOFom, ESI-QTOFom and FT-<br />
MSom, mogu u brzim procesima uz pomoc mikrofluidike i cipova obradjivati komplicirani<br />
proteomski i glikomski sistemi iz bioloskog materijala. Tehnologija cipova i generiranje novih<br />
algoritama za automatsku asignaciju molekularne structure direktno iz eksperimentalnih<br />
spektara je izuzetno znacajna za efikasnost u otkrivanju i validaciji biomarkera. Mi smo uveli<br />
pred 5 godina novu metodu integracije chip/MS sistema, koji znatno podizu osjetljivost<br />
detekcije i pozitivno rjesavaju problem potiskivanja ionizacije u smjesama velikog dinamickog<br />
opsega, i time omogucavaju o<strong>dr</strong>edjivanja u kratkim vremenskim jedinicama, tj. “high<br />
throughput”, HTP. Dodatni efekt pritom je mogucnost o<strong>dr</strong>zavanja nativne strukturne arhitekture<br />
molekula i njihovih, cesto labilnih, strukturnih modifikacija. Time je stvorena baza za<br />
identifikaciju i sekvenciranje svih pojedinih molekula, koje su prisutne u slozenim bioloskim<br />
mjesavinama i u visokim i u niskim kolicinama. U svrhu identifikacije i sekvenciranja peptidnih i<br />
ugljikohi<strong>dr</strong>atnih oligomera implementirali smo u zadnjih deset godina pojedine nove ucinkovite<br />
metode fragmentiranja (CID, ECD, IRMPD), a te su bile moguce samo na temelju osnovih<br />
istrazivanja oko ionizacije i stvaranja fragmentnih iona u plinskoj fazi, te o<strong>dr</strong>edjivanja njihove<br />
stabilnosti. Za preseparaciju uzoraka, potrebnu za visi stupanj identifikacije u proteomima i<br />
glikomima spektrometrijom masa, implementirali smo mikro- i nano LC/MS i MS/MS za on-line<br />
o<strong>dr</strong>edjivanja. Istrazili smo i mogucnost robotizacije/automatizacije i primjene cipova za visi<br />
stupanj ionizacije u nanosprayu.<br />
U najnaprednijim najnovijim istrazivanja na pomicnosti iona u plinskoj fazi pomocu sistema<br />
“Ion mobility MS” na time-of-flight (TOF) MS analizatoru povezuju se mjerenja na taj nacin, da<br />
se ostvari odjeljivanje iona u dvije dimenzije: u vremenu i u m/z vrijednosti. Visoki potencijal te<br />
metode za smanjivanje kompleksnosti struktura ugljicnih hi<strong>dr</strong>ata smo istrazili na primjeru<br />
ljudskog glikourinoma, kod congenital disorders of glycosylation (CDG). Tu metodu sada<br />
povezujemo s novim algoritmima u smislu glikomike uz software za automatsko asigniranje<br />
spektara, koje obecava znacajni pomak u metodici glikomike kod klinicke primjene<br />
o<strong>dr</strong>edjivanja profila biomarkera kod ljudskih bolesti.<br />
Kljucni pojmovi: spektrometrija masa, strukturna sistemska biologija i<br />
glikobiologija, biomedicinska analiza, molekularna medicina, automatska klinicka<br />
proteomika i glikomika ljudskih bolesti.