10.03.2015 Views

dr.sc. Jasna Peter-Katalinić

dr.sc. Jasna Peter-Katalinić

dr.sc. Jasna Peter-Katalinić

SHOW MORE
SHOW LESS

Create successful ePaper yourself

Turn your PDF publications into a flip-book with our unique Google optimized e-Paper software.

Zivotopis<br />

1. Ime<br />

<strong>Jasna</strong> <strong>Peter</strong>-Katalinić<br />

2. Obrazovanje<br />

Habilitacija: “Mass spectrometric investigations on glycoconjugates”, Institute for


Physiological Chemistry, University of Bonn, 1996<br />

Doktorat: “Sigmatropic rearrangements of strained tricyclic systems”, Institute for<br />

Organic Chemistry, University of Zürich (Switzerland) 1968-1973, magna cum<br />

laude.<br />

3. Zaposlenja (u obrnutom kronoloskom redu)<br />

- Voditelj laboratorija za sistemsku glikomiku na biotehnoloskom odjelu Sveucilista u Rijeci (2009)<br />

- Full Professor of Molecular Medicine and Biochemistry and Director of the Mass Spectrometry<br />

Core Facility (part-time) Medical College of Georgia, Augusta, Ga., USA (2001-2003)<br />

- Associate Professor of Biophysics (C3) at the University of Muenster (Germany) 1996-2008<br />

- Research Scientist and Habilitant at the University of Bonn (Germany) 1978-1980 and 1982-<br />

1996<br />

- Postdoc and lecturer at Texas A+M Univ. College Station (Texas, USA) 1973-1976<br />

- Graduate student and research associate at University of Zürich (Switzerland) 1968-1973<br />

4. Profesionalna, znanstvena i akademska dostignuca<br />

a. Znanstveni projekti kao voditelj:<br />

Znanstveni projekti financirani iz javnih sredstava od godine 2000 do sada: 16<br />

Sveukupna financijska davanja u projektima iz javnih sredstava od 2000 do sada: 3,6<br />

Mio €<br />

Znanstvene teme i projekti se nalaze na po<strong>dr</strong>ucju strukturne biokemije i biofizike u istrazivanju<br />

structure i funkcije ugljicnih hi<strong>dr</strong>ata u zivim organizmima. Ta su usmjerena prema otkrivanju i<br />

validiranju specificnih molekula, koje se ili aberantno stvaraju ili akumuliraju u klinicki<br />

evidentnim bolestima, koje nastaju zbog nasljednih defekata metabolizma ugljicnih hi<strong>dr</strong>ata. I u<br />

tumorskim bolestima ima nakupljenih specificnih ugljicnih hi<strong>dr</strong>ata, koji se smatraju tumorskim<br />

antigenima, tako da kroz istrazivanja proteomike i glikoproteomike raka se ti antigeni mogu<br />

kvalitativno i kvantitativno o<strong>dr</strong>editi da sluze za dizajn tocnije dijagnoze ili kao baza za razvitak<br />

novih terapeutskih lijekova. U ljudskim bolestima poput bakterijskih infekata,<br />

muskuloskeletalnih bolesti i raznih upala igraju ugljicni hi<strong>dr</strong>ati vazne uloge kod etiologije tih<br />

bolesti. Moj laboratorij je od 2000 do danas aplicirao za niz projekata, od kojih je 16 u ukupnoj<br />

vrijednosti od 3,6 miliona € bilo odobreno. 50% tih sredstava je bilo upotrijebljeno za nabavku<br />

modernih analitickih instrumenata za spektrometriju masa i njihovu periferiju. Ostalih 50% je<br />

upotrijebljno za financiranje studenata i postdoktora, koji su radili na tim projektima. Najveci<br />

dio financiranja iz javnih sredstava je stigao iz njemackog fonda za znanstvena istrazivanja<br />

(Deut<strong>sc</strong>he For<strong>sc</strong>hungsgemein<strong>sc</strong>haft, DFG), evropske unije (EU), i fonda za inovativna<br />

medicinska istrazivanja sveucilista u Münsteru (University of Münster Innovative Medical<br />

Research (IMF)). Broj znastvenika u laboratoriju, ukljucujuci osobe s habilitacijom, doktoratom<br />

i diplomom iznosio je 2006 20 osoba, a broj osoba u svim vlastitim i kolaborativnim projektima<br />

s industrijskim poduzecima, sveucilistima I <strong>dr</strong>ugim znanstvenim institucijama je bio oko 50.<br />

Rezultati znanstvenih istrazivanja su objavljeni u casopisima i knjigama, gdje je momentalan<br />

broj izaslih radova u citiranim casopisima 286. Taj broj ukljucuje i nekoliko preglednih clanaka i<br />

priloga knjigama. Djelovala sam i kao gost editor za casopise „Biological Chemistry“: Highlight<br />

Glycobiology (February 2001) i „Electrophoresis“: CE-MS (July 2004), i kao koeditor<br />

monografije: „A Practical guide to MALDI-MS“ (Wiley, 2008) zajedno s kolegom Franzom<br />

Hillenkampom.<br />

U sedam vec dovrsenih industrijskih projekata su se obradjivale primijenjene teme<br />

proteomike i glikoproteomike, a jedan patent je bio prijavljen i odobren. Ukupno 35<br />

experimentalnih diplomskih I doktorskih radnji je bilo obradjeno i obranjeno pod<br />

mojim vodstvom.<br />

b. Tutorstvo diplomskih i doktorskih radova: 35<br />

c. Suradnja<br />

Medicinski fakultet sveucilista u Münsteru:<br />

Berdel, interna medicina/onkologija; Senninger, kirurgija; Bruckner, fizioloska kemija.


Matematicko prirodoslovni fakultet sveucilista u Münsteru:<br />

EU Nano2Life Network, kolaborativni znanstveni project 492 (Sonderfor<strong>sc</strong>hungsbereich, SFB):<br />

ekstracelularni matriks.<br />

Suradnja s nacionalnim institucijama, sveucilistima u Frankfurtu, Hamburgu, Münchenu i<br />

Kölnu.<br />

Internacionalna suradnja s grupama u Austriji, Engleskoj, Francuskoj, Hrvatskoj, Israelu, Italiji,<br />

Svedskoj, Svicarskoj i USA.<br />

d. Patenti<br />

Müthing J, <strong>Peter</strong>-Katalinić J, Langer M, Möckel B, Eck J (2003) Procedure for determination of<br />

responsivity of an individuum for mistletoe lectin. International Patent WO 2003/054544 A3<br />

(publication date: July 3, 2003).<br />

e. Nagrade i priznanja<br />

- 1 st Life Science Award from the German Society of Mass Spectrometry (DGMS) 2002<br />

- koordinator of Strategic Research Project "Nanobioanalytics" in Nano2Life EU Network<br />

- clan upravnog odbora u HUPO Human Glycoprotein Initiative (HGPI)<br />

- eksekutivni editor Journal of Proteomics<br />

- clan Advisory Board u Journal of the American Society of Mass Spectrometry, Journal of<br />

Proteome Research (do 2008)<br />

2005-danas: gostujuci profesor medicinskog fakulteta sveucilista u Zagrebu<br />

2007: gostujuci profesor u laboratoriju za organsku kemiju, Eidgenössi<strong>sc</strong>he<br />

Techni<strong>sc</strong>he Hoch<strong>sc</strong>hule (ETH), Zürich, Svicarska<br />

Novija pozivna predavanja:<br />

Osaka, Japan (HUPO: Human Glycoprotein Initiative, HGPI)<br />

Yokohama, Japan (Japan HUPO Meeting)<br />

Siena, Italy (6 th Proteomics Meeting)<br />

Vienna, Austria (Austrian Proteome Society)<br />

Lund, Sweden (Swedish Proteome Society)<br />

Seattle, USA (3 rd UPPCOM)<br />

Noordwijkhout, Holland (FEBS Special Meeting on Lipidomics)<br />

Stockholm, Sweden (Swedish MS Society 2008)<br />

Jena, Germany (2nd CEEPC)<br />

Milano, Italy (4 th ItPA)<br />

Hinxton/Cambridge, UK (6 th BSPR/EBI).<br />

Organizacija skupova i ljetnih tečaja:<br />

Summer Course “Mass Spectrometry in Biotechnology and Medicine, Dubrovnik, Croatia<br />

1 st Sept. 14-21, 2001<br />

2 nd July 7-14, 2007<br />

3 rd July 5-11, 2009<br />

November 2002: 13th Joint meeting of the German, Dutch, French and Belgian societies for<br />

Glycobiology, u dvorcu Raesfeld blizu Münstera.<br />

DGMS 7-10 ozujak 2003: godisnji kongres njemačkog <strong>dr</strong>ustva za spektrometriju masa<br />

(Deut<strong>sc</strong>he Gesell<strong>sc</strong>haft für Massenspektrometrie) u Münsteru<br />

5. Značajna dostignuća u znanosti<br />

U bioloskoj spektrometriji masa (MS) razvitak instrumenata i njihova primjena na istrazivanja<br />

ljudskih bolesti predstavljaju u zadnjih 20 godina najveci znanstveni izazov. Na tom po<strong>dr</strong>ucju<br />

djelujem kao jedan od osnivaca te di<strong>sc</strong>ipline, gdje nam se paznja fokusira na razvitak i<br />

primjenu biofizikalnih i biokemijskih aspekata za o<strong>dr</strong>edjivanja struktura molekula, koje igraju<br />

mogucu ulogu u ljudskim bolestima. Kroz razvitak novih metoda analize i znacajne skretnice u<br />

misljenju, tj. vidljive promjene nacina stvaranja hipoteza, sistemska biologija se integrira u<br />

matematicke bioinformaticke sisteme, koji se mogu adaptirati za strukturnu analizu<br />

kompleksnih mjesavina. Uloga biofizike u strukturnoj sistemskoj biologiji se narocito o<strong>dr</strong>azava<br />

u razvitku metoda spektrometrije masa za molekularnu detekciju i identifikaciju. Ionizacija i


detekcija u plinskoj fazi je tako unapredovala, da se s MALDI-TOFom, ESI-QTOFom and FT-<br />

MSom, mogu u brzim procesima uz pomoc mikrofluidike i cipova obradjivati komplicirani<br />

proteomski i glikomski sistemi iz bioloskog materijala. Tehnologija cipova i generiranje novih<br />

algoritama za automatsku asignaciju molekularne structure direktno iz eksperimentalnih<br />

spektara je izuzetno znacajna za efikasnost u otkrivanju i validaciji biomarkera. Mi smo uveli<br />

pred 5 godina novu metodu integracije chip/MS sistema, koji znatno podizu osjetljivost<br />

detekcije i pozitivno rjesavaju problem potiskivanja ionizacije u smjesama velikog dinamickog<br />

opsega, i time omogucavaju o<strong>dr</strong>edjivanja u kratkim vremenskim jedinicama, tj. “high<br />

throughput”, HTP. Dodatni efekt pritom je mogucnost o<strong>dr</strong>zavanja nativne strukturne arhitekture<br />

molekula i njihovih, cesto labilnih, strukturnih modifikacija. Time je stvorena baza za<br />

identifikaciju i sekvenciranje svih pojedinih molekula, koje su prisutne u slozenim bioloskim<br />

mjesavinama i u visokim i u niskim kolicinama. U svrhu identifikacije i sekvenciranja peptidnih i<br />

ugljikohi<strong>dr</strong>atnih oligomera implementirali smo u zadnjih deset godina pojedine nove ucinkovite<br />

metode fragmentiranja (CID, ECD, IRMPD), a te su bile moguce samo na temelju osnovih<br />

istrazivanja oko ionizacije i stvaranja fragmentnih iona u plinskoj fazi, te o<strong>dr</strong>edjivanja njihove<br />

stabilnosti. Za preseparaciju uzoraka, potrebnu za visi stupanj identifikacije u proteomima i<br />

glikomima spektrometrijom masa, implementirali smo mikro- i nano LC/MS i MS/MS za on-line<br />

o<strong>dr</strong>edjivanja. Istrazili smo i mogucnost robotizacije/automatizacije i primjene cipova za visi<br />

stupanj ionizacije u nanosprayu.<br />

U najnaprednijim najnovijim istrazivanja na pomicnosti iona u plinskoj fazi pomocu sistema<br />

“Ion mobility MS” na time-of-flight (TOF) MS analizatoru povezuju se mjerenja na taj nacin, da<br />

se ostvari odjeljivanje iona u dvije dimenzije: u vremenu i u m/z vrijednosti. Visoki potencijal te<br />

metode za smanjivanje kompleksnosti struktura ugljicnih hi<strong>dr</strong>ata smo istrazili na primjeru<br />

ljudskog glikourinoma, kod congenital disorders of glycosylation (CDG). Tu metodu sada<br />

povezujemo s novim algoritmima u smislu glikomike uz software za automatsko asigniranje<br />

spektara, koje obecava znacajni pomak u metodici glikomike kod klinicke primjene<br />

o<strong>dr</strong>edjivanja profila biomarkera kod ljudskih bolesti.<br />

Kljucni pojmovi: spektrometrija masa, strukturna sistemska biologija i<br />

glikobiologija, biomedicinska analiza, molekularna medicina, automatska klinicka<br />

proteomika i glikomika ljudskih bolesti.

Hooray! Your file is uploaded and ready to be published.

Saved successfully!

Ooh no, something went wrong!