à rsrapport 2012 - skousgaard

Årsrapport 2012 | laboratoriet
laboratoriet | årsrapport 2012
Molekylærbiologi
Det molekylærbiologiske område omfatter alle de nukleinsyrebaserede
teknikker, fraset Chlamydia trachomatis
der kører særskilt. De fleste analyser er baseret
på PCR og analyseres på real-time instrumenter, hvor
der afgives kvalitative svar. Der køres en blanding af
in-house assays og kommercielle kit. Luftvejsanalyserne
omfatter Influenza A/B, Respiratorisk Syncy-
Statens Seruminstitut (SSI) modtager indberetninger
angående Chlamydia trachomatis fund fra alle Regionerne.
På landsplan var positive raten i 2011 på 7,8
% i de analyserede prøver.
Positivraten i Region Nordjylland ligger højere end i
resten af landet (2011: 11,4 %, 2012: 10,5 %).
tial Virus (RSV), Human metapenumovirus (hMPV)
foruden de atypiske pneumonier – Legionella pneumophila,
Chlamydia pneumophila og Mycoplasma
pneumoniae. Desuden undersøges for Herpes Simplex
Virus (HSV), Enterovirus og Varicella Zoster Virus
(VZV). Tabellen viser hvordan prøvetallet har fordelt
sig mellem de forskellige analyser de sidste tre år.
Procent
25
20
15
10
5
0
Positive C. trachomatis Region Nordjylland
2009 2010 2011 2012
Årstal
Ialt Mænd(U+urin) Kvinder(U+C)
Analyser 2010 2011 2012
Atypisk pneumoniae (PCR) 719 1096 1010
Chlamydophila pneumoniae 312 451 189
Enterovirus 126 182 205
Herpes Simplex Virus (HSV) 1 og 2 1646 2017 2389
Influenza A OG B Virus 260 1494 328
Legionella pneumophila 20 50 53
Metapneumovirus 112 68 62
Mycoplasma pneumoniae 3241 9697 6833
Resp. Syncytial Virus (RSV) 552 770 726
Varicella Zoster Virus (VZV) 416 548 686
Antal positive prøver i procent fordelt på prøvekategorier og køn for årene 2009 til 2012.
Total 7404 16373 12481
Parasitologi
I 2012 blev der i alt rekvireret 2879 parasitologiske
prøver, hvilket er 245 (8,9 %) flere prøver end i 2011.
Hyppigste rekvirerede prøver er fortsat:
• mikroskopi for cyster og ormeæg (n=2223)
• mikroskopi for malaria (n=348)
• mikroskopi for æg af E. vermicularis (n=235)
Området er som forventet præget af en lav positiv
rate, der hele året vedvarende ligger på 2-4 % samlet
for alle prøvekategorier. For patienter med positive
prøver er der en betydelig rejseassociation.
Et af fokus områderne i parasitologi laboratoriet har
i 2012 været DDKM akkreditering, hvor der i 2012 og
i 2013 vil være fokus på revision af samtlige parasitologiske
laboratorieinstrukser.
Som noget nyt blev der i maj 2012 opstartet en molekylærbiologisk
metode til detektion af toksinproducerende
Clostridium difficile. Analysen indeholder
både detektion af genet for toksin B, det binære
toksin og en markør for ribotype 027. Denne analyse
kører på GeneXpert systemet, der er et fuldautomatisk
apparatur, hvor både nukleinsyreoprensning,
amplification og detektion sker i en og samme kassette.
Af prioriteringshensyn undersøges prøver fra
hospitalsindlagte patienter primært med PCR analysen,
mens prøver fra ikke-indlagte patienter dyrkes og
efterfølgende undersøges konfirmatorisk med PCR.
Analysen for enterovirus på spinalvæsker er ligeledes
omlagt til GeneXpert PCR.
34 Årsrapport 2012 | Klinisk Mikrobiologisk Afdeling | Aalborg Universitetshospital
Årsrapport 2012 | Klinisk Mikrobiologisk Afdeling | Aalborg Universitetshospital 35