AISLAMIENTO DE SECUENCIAS EXPRESADAS ... - cgiar

LISTA DE TABLAS
Tabla 1: Tiempos de colecta de material (hojas) infestadas con A. socialis para la
construcción de la librería sustractiva y los microarreglos, de acuerdo al ciclo de vida del
insecto (una colecta por cada estadío). 75
Tabla 2: Comparaciones utilizadas para la sustracción, entre los diferentes tiempos de colecta.
“Ecu” corresponde a MEcu 72 (resistente) infestado, “ESI” corresponde a MEcu 72 sin
infestar y “CMC” corresponde a CMC 40 (suceptible) infestado. 76
Tabla 3: Condiciones de amplificación por PCR de los clones de las librerias sustractivas. 80
Tabla 4: Hibridizaciones realizadas, las cuales fueron 12 por cada una de las tres réplicas
biológicas para un total de 36 en el Cassava Unigene Microarray. 83
Tabla 5: Nombre de las librerías sustractivas construidas con los métodos DSC y SSH, cada
una corresponde a una placa de cultivo de 384 pozos, para un total de 3072clones. 96
Tabla 6: Mejores hit encontrados en GenBank utilizando el algoritmo MEGABLAST de las
secuencias obtenidas en las librerías sustractivas y mapeadas en el genoma de yuca. 99
Tabla 7: Listado de genes regulados por A. socialis en yuca, clasificados por categorías
funcionales diferencialmente expresados en el Cassava Unigene Microarray. 118