Enzymes de restriction - Promega
Enzymes de restriction - Promega
Enzymes de restriction - Promega
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Décembre 2011<br />
Faites 45% d’économies dans la<br />
quantification <strong>de</strong> vos ADNdb<br />
avec une nouvelle alternative<br />
au PicoGreen®<br />
Clonage PCR<br />
Astuces techniques<br />
Des solutions intégrées<br />
automatisées pour réussir<br />
vos analyses<br />
Gagnez du temps<br />
<strong>Enzymes</strong> <strong>de</strong> <strong>restriction</strong><br />
1
2<br />
Sommaire<br />
APPLICATION & ASTUCE TECHNIQUE<br />
▶ Gagnez du temps dans vos<br />
digestions<br />
QUANTIFIER VOS ADNdb<br />
▶ Une alternative à PicoGreen®<br />
Faites 45% d’économies<br />
ACTUALITÉS SCIENTIFIQUES<br />
▶ Actualisez vos connaissances<br />
Articles techniques, vidéos et<br />
bien plus encore<br />
FOCUS TECHNIQUE<br />
▶ Clonage PCR : astuces<br />
techniques<br />
Améliorez l'efficacité <strong>de</strong> vos<br />
clonages !<br />
SOLUTIONS INTÉGRÉES<br />
▶ Des solutions clées<br />
L’analyse cellulaire com<br />
l’ingénierie <strong>de</strong> détectio<br />
JEU CONCOURS MENSUE<br />
▶ Gagnez un Ipod shuffl<br />
ETES-VOUS EN POSSESSIO<br />
ANCIEN LUMINOMÈTRE D<br />
▶ Le gagnant est ...<br />
Retrouvez la liste <strong>de</strong>s plu<br />
luminomètres<br />
RAPPEL INNOVATIONS 20<br />
▶ Produits phares 201<br />
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populaires <strong>de</strong> l’année<br />
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…avant le 31 décembre<br />
2011.<br />
3
4<br />
Réduire<br />
la durée<br />
du clonage<br />
<strong>Enzymes</strong> <strong>de</strong> <strong>restriction</strong><br />
<strong>Promega</strong> est historiquement connu et reconnu<br />
comme producteur d’enzymes <strong>de</strong>puis plus <strong>de</strong><br />
30 ans. <strong>Promega</strong> continue à innover dans ce<br />
domaine et à i<strong>de</strong>ntifier <strong>de</strong>s propriétés enzyma-<br />
tiques permettant <strong>de</strong> réduire le temps passé à<br />
faire du clonage. Utilisez notre gui<strong>de</strong> «<strong>Enzymes</strong><br />
<strong>de</strong> <strong>restriction</strong>» pour sélectionner rapi<strong>de</strong>ment la<br />
ou les meilleures enzymes <strong>de</strong> <strong>restriction</strong> pour<br />
vos travaux et vos applications. Voici quelques<br />
unes <strong>de</strong>s caractéristiques que nous avons<br />
testées pour vous ai<strong>de</strong>r à gagner du temps.<br />
*Isopropyl-β-d-thiogalactopyranosi<strong>de</strong> (IPTG) est un inducteur du promoteur lac, et le 5-bromo-4-chloro-3-indolyl-β-d-galactosid<br />
Flexi, GoTaq et HaloTag sont <strong>de</strong>s marques déposées et Helix est une marque <strong>de</strong> <strong>Promega</strong> Corporation.
Qualifié pour le clonage bleu/blanc<br />
Pour aller au-<strong>de</strong>là <strong>de</strong> la pureté et <strong>de</strong><br />
l'activité spécifique, nous avons testé<br />
nos enzymes <strong>de</strong> <strong>restriction</strong> dans <strong>de</strong>s réactions<br />
<strong>de</strong> sous-clonage afin <strong>de</strong> nous assurer<br />
qu'il n'y avait aucune interférence. Le test<br />
<strong>de</strong> clonage bleu/blanc réduit au minimum<br />
l'inci<strong>de</strong>nce <strong>de</strong>s faux positifs dans les expériences<br />
<strong>de</strong> clonage. Ce test mime une expérience<br />
<strong>de</strong> clonage et permet <strong>de</strong> détecter la<br />
perte d'un seul nucléoti<strong>de</strong> à l'extrémité d'un<br />
plasmi<strong>de</strong> linéarisé. Des bactéries transformées<br />
avec succès donneront <strong>de</strong>s colonies<br />
blanches sur <strong>de</strong>s plaques indicatrices<br />
X-Gal + IPTG, alors que les bactéries<br />
transformées avec un plasmi<strong>de</strong><br />
recircularisé, dépourvue d’inserts,<br />
donneront <strong>de</strong>s colonies<br />
bleues.<br />
Conçues pour une<br />
digestion rapi<strong>de</strong><br />
Les réactions <strong>de</strong><br />
digestion par<br />
<strong>de</strong>s enzymes<br />
Enzyme <strong>de</strong><br />
<strong>restriction</strong><br />
<strong>de</strong> <strong>restriction</strong> à haute efficacité nécessitent<br />
typiquement 1 µl d'enzyme pour digérer 1<br />
µg d'ADN en 1-3 heures. Avec <strong>de</strong>s enzymes<br />
<strong>de</strong> <strong>restriction</strong>, cette durée d'incubation peut<br />
être réduite à 5-15 minutes, permettant le<br />
criblage rapi<strong>de</strong> <strong>de</strong> clones ou l'obtention<br />
rapi<strong>de</strong> <strong>de</strong> produits <strong>de</strong> digestion d'ADN pour<br />
<strong>de</strong>s applications ultérieures. Il existe 27<br />
enzymes <strong>de</strong> <strong>restriction</strong> populaires assurant<br />
une digestion rapi<strong>de</strong> qui vous permettront<br />
<strong>de</strong> réduire vos durées <strong>de</strong> clonage.<br />
Compatible avec le tampon GoTaq®<br />
Passez directement d'une réaction d'amplification<br />
GoTaq® à la digestion par <strong>de</strong>s<br />
enzymes <strong>de</strong> <strong>restriction</strong> qui ont une activité<br />
efficace dans les tampons GoTaq® Green et<br />
PCR Master Mix. Préparez <strong>de</strong>s fragments<br />
<strong>de</strong> PCR qui sont prêts à être insérés dans<br />
les vecteurs Flexi®, les vecteurs HaloTag®<br />
Flexi ou dans tout autre vecteur non-T.<br />
Augmentez encore la polyvalence <strong>de</strong> votre<br />
clonage en choisissant la ou les enzymes <strong>de</strong><br />
<strong>restriction</strong> qui correspon<strong>de</strong>nt à vos besoins<br />
en matière <strong>de</strong> vecteur.<br />
Aptitu<strong>de</strong> à<br />
la digestion<br />
rapi<strong>de</strong><br />
Compatible<br />
avec le tampon<br />
GoTaq®<br />
Recevez le<br />
Gui<strong>de</strong> complet<br />
e (X-Gal) est un agent qui produit une coloration bleue lorsqu'il est hydrolysé par la β-galactosidase.<br />
Qualifié pour le<br />
clonage bleu/<br />
blanc<br />
AATII + +<br />
ACC65I +<br />
Exemple tiré du gui<strong>de</strong> <strong>de</strong>s enzymes <strong>de</strong> <strong>restriction</strong>, caractéristiques<br />
visibles au premier coup d'oeil<br />
5
6<br />
QUANTIFIER VOS ADNdb<br />
Economisez 45%<br />
avec une nouvelle alternative au Pi<br />
Le nouveau système QuantiFluor pour ADN double brin offre à<br />
votre labo une sensibilité équivalente au PicoGreen® avec en prime<br />
<strong>de</strong> grosses économies sur la quantification <strong>de</strong> l'ADNdb :<br />
Economique : 45% d’économie par rapport à PicoGreen®.<br />
Sensible : Même sensibilité que PicoGreen® ; sensibilité accrue<br />
sur l'absorbance (par ex., métho<strong>de</strong> NanoDrop®).<br />
Polyvalent : S'utilise sur n'importe quel instrument à microplaques<br />
ou à tubes séparés.<br />
Fluorescence (UFR)<br />
200,000<br />
180,000<br />
160,000<br />
140,000<br />
120,000<br />
100,000<br />
80,000<br />
60,000<br />
40,000<br />
20,000<br />
0<br />
0<br />
31,937<br />
Colorant QuantiFluor dsDNA<br />
Colorant PicoGreen ®<br />
34,488<br />
159,771<br />
130,949<br />
200 400 600 800 1,000 1,200<br />
Concentration d'ADN Lambda (ng/ml)<br />
Comparaison <strong>de</strong>s métho<strong>de</strong>s colorimétriques <strong>de</strong> quantification <strong>de</strong><br />
l'ADNdb<br />
Les <strong>de</strong>ux colorants pour ADNdb ont <strong>de</strong>s gammes dynamiques comparables<br />
et saturent vers 1000 ng/ml dans le volume <strong>de</strong> 200 μl, au format 96 puits.<br />
9437MB
coGreen®<br />
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8<br />
Actualités<br />
scientifiques<br />
NOUVEAU PROTOCOLE EN VIDÉO<br />
Aperçu <strong>de</strong>s kits simplyRNA pour l'instrument Maxwell® 16
ARTICLES TECHNIQUES DU PUBHUB<br />
PubHub<br />
PubHub<br />
Bioluminescent assays for <strong>de</strong>tection of lysine<br />
<strong>de</strong>acetylase activities<br />
Comparison of luciferases as ATP sensors in the<br />
presence of inhibitors: CellTiter-Glo® Assay shows<br />
less compound interference than the PerkinElmer<br />
ATPlite 1Step assay<br />
PROFILS ADN<br />
Forensic DNA profiles crossing bor<strong>de</strong>rs in Europe<br />
(implementation of the Treaty of Prüm)<br />
BLOG PROMEGA<br />
Screening for drug-drug interactions with PXR and<br />
CYP3A4 activation<br />
Sequencing the black <strong>de</strong>ath is a window to the past<br />
ATPlite est une marque <strong>de</strong> PerkinElmer, Inc. CellTiter-Glo et Maxwell sont <strong>de</strong>s marques déposées <strong>de</strong> <strong>Promega</strong> Corporation.<br />
9<br />
9
10<br />
jeu<br />
concours<br />
Gagnez un<br />
Ipod Schuffle !<br />
Pour participer, répon<strong>de</strong>z aux questions ci-<strong>de</strong>ssous. Vous trouverez les<br />
réponses en parcourant ce numéro.<br />
1. Avant <strong>Promega</strong>, quelle était la société qui<br />
commercialisait le Fugene®?<br />
2. Quel luminomètre (la marque) a été sélectionné<br />
comme étant «le plus vieux luminomètre<br />
d’Europe»?<br />
Conditions<br />
Soumettez<br />
vos réponses
Avez-vous le plus vieux<br />
Luminométre d’Europe?<br />
<strong>Promega</strong> vous remercie pour votre participation.<br />
UN gagnant a été sélectionné grâce à son<br />
luminomètre : LKB Wallac datant <strong>de</strong> 1975 !<br />
Vous pouvez à tout moment consulter le panel<br />
<strong>de</strong>s plus vieux luminomètres d›Europe qui ont<br />
été proposés :<br />
Gallerie photos <strong>de</strong>s plus vieux luminomètres<br />
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• 96 échantillons par run !<br />
• Economie <strong>de</strong> réactifs (comparé aux techniques en tube)<br />
• Support technique performant<br />
• Plus <strong>de</strong> 50 tests luminescents intégrés !<br />
11
FOCUS TECHNIQUE<br />
12<br />
Améliorez le ren<strong>de</strong>ment <strong>de</strong> vos clonages<br />
Astuces pour le clonage PCR<br />
Les systèmes <strong>de</strong> vecteur pGEM®-T et pGEM®-T Easy autorisent le<br />
clonage direct <strong>de</strong>s produits <strong>de</strong> PCR dans <strong>de</strong>s vecteurs linéaires, munis<br />
d’extrémités cohésives <strong>de</strong> thymidine (T) en 3', correspondant aux<br />
résidus adénine (A) en 5' <strong>de</strong> l'amplicon. Rien n'est plus simple que<br />
d'i<strong>de</strong>ntifier les recombinants : il suffit <strong>de</strong> reprendre les colonies<br />
blanches parmi les colonies bleues <strong>de</strong> la plaque <strong>de</strong> référence. Améliorez<br />
votre taux <strong>de</strong> succès avec ces quelques astuces utiles.<br />
pGEM et GoTaq sont <strong>de</strong>s marques déposées <strong>de</strong> <strong>Promega</strong> Corporation.
• Evitez d'introduire <strong>de</strong>s nucléases qui sont<br />
susceptibles <strong>de</strong> dégra<strong>de</strong>r les bouts collants<br />
T <strong>de</strong> votre vecteur. Utilisez <strong>de</strong> l'eau<br />
stérile, dépourvue <strong>de</strong> nucléases, dans<br />
vos réactions <strong>de</strong> ligation.<br />
• Utilisez une ADN polymérase qui ne soit<br />
pas <strong>de</strong> haute fidélité uniquement durant<br />
la PCR afin <strong>de</strong> garantir la présence d'une<br />
extrémité cohésive A sur votre fragment<br />
<strong>de</strong> PCR.<br />
• Si vous utilisez une ADN polymérase <strong>de</strong><br />
haute fidélité, ajoutez une extrémité<br />
cohésive. Purifiez le fragment <strong>de</strong> PCR et<br />
préparez une réaction d’adénylation (voir<br />
"Clonage <strong>de</strong>s produits <strong>de</strong> PCR ou A tailing<br />
à bouts francs" dans le manuel technique<br />
<strong>de</strong>s vecteurs pGEM®-T).<br />
• Optimisez le rapport insert/vecteur. La<br />
ligature <strong>de</strong> l'insert d'ADN témoin peut<br />
s'effectuer avec un rapport 1/1, alors<br />
qu'un autre insert peut s’insérer plus<br />
efficacement avec un rapport 3/1.<br />
• Utilisez <strong>de</strong>s cellules dont le ren<strong>de</strong>ment<br />
<strong>de</strong> transformation est d'au moins 1 ×<br />
10 8 cfu/μg d'ADN afin d'obtenir un<br />
nombre suffisant <strong>de</strong> colonies, car la ligation<br />
<strong>de</strong> fragments dont les extrémités<br />
cohésives ne comprennent qu'une seule<br />
base peut s'avérer inefficace.<br />
• Eviter d'exposer les produits <strong>de</strong> PCR à un<br />
rayonnement UV <strong>de</strong> courte longueur<br />
d'on<strong>de</strong>, lequel génère <strong>de</strong>s dimères <strong>de</strong><br />
pyrimidines. Placez une plaque en verre<br />
entre le gel et la source d'UV. Idéalement,<br />
le produit <strong>de</strong> PCR sera observé sous une<br />
lumière UV <strong>de</strong> gran<strong>de</strong> longueur d'on<strong>de</strong>.<br />
• Purifiez le fragment <strong>de</strong> PCR sur gel<br />
<strong>de</strong> façon à minimiser les inserts<br />
concurrents et éliminer les inhibiteurs<br />
éventuels <strong>de</strong> la réaction <strong>de</strong> ligation.<br />
• Evitez les températures élevées (>28°C)<br />
durant la ligation, et laissez la réaction<br />
se dérouler pendant la nuit <strong>de</strong> manière<br />
à améliorer le ren<strong>de</strong>ment <strong>de</strong> la transformation.<br />
Pour plus d’ai<strong>de</strong>, consultez le gui<strong>de</strong><br />
<strong>de</strong> résolution <strong>de</strong>s problèmes techniques<br />
pGEM-T et pGEM-T easy.<br />
Regar<strong>de</strong>z la vidéo<br />
13
TECHNIQUES DE DÉTECTION<br />
14<br />
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