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EDITORIAL<br />
Le sepsis est <strong>la</strong> cause sous-jacente de mortalité <strong>la</strong> plus fréquente<br />
au sein des unités de soins intensifs non cardiologiques, où le taux de<br />
mortalité peut atteindre 32 % en cas de sepsis sévère et 54 % en cas<br />
de choc septique.1 Il existe chaque année dans le monde plus de<br />
18 millions de cas de sepsis sévère et environ 1 400 patients en<br />
meurent chaque jour. 2,3<br />
Le diagnostic précoce du sepsis est essentiel pour instaurer un traitement<br />
spécifique qui permette l'amélioration du pronostic, le diagnostic<br />
reste un véritable défi clinique.<br />
L'accélération du rendu des résultats pour améliorer les soins<br />
apportés aux patients est <strong>la</strong> priorité numéro un de <strong>bioMérieux</strong><br />
et elle est particulièrement essentielle dans le cas du sepsis, l'un de<br />
nos domaines d’actions prioritaires. Notre société a développé une<br />
vaste gamme de solutions pour améliorer le diagnostic clinique, le<br />
pronostic et <strong>la</strong> prescription antibiotique pour <strong>la</strong> prise en charge du<br />
sepsis, notamment le dosage immunologique du biomarqueurs<br />
VIDAS ® PCT, le logiciel d'épidémiologie VIGIGUARD *, l'hémoculture<br />
automatisée BacT/ALERT ® , l'ID/AST avec VITEK ® 2 et désormais avec<br />
VITEK® MS intégrant <strong>la</strong> spectrométrie de masse MALDI-TOF.<br />
Dans ce numéro de One Microbiology World, le Dr Tim Drake,<br />
responsable du <strong>la</strong>boratoire de microbiologie du Grady Health System<br />
Hospital aux Etats-Unis, parle de l’évolution de leur <strong>la</strong>boratoire en un<br />
<strong>la</strong>boratoire de microbiologie entièrement automatisé, et de <strong>la</strong> manière<br />
dont ce<strong>la</strong> a aidé leur équipe et amélioré <strong>la</strong> pratique quotidienne<br />
du <strong>la</strong>boratoire. Plus de 400 personnes ont participé au symposium<br />
de <strong>bioMérieux</strong>, “Diagnostic des bactériémies : présent et avenir”,<br />
lors du récent Congrès européen de microbiologie clinique et de<br />
ma<strong>la</strong>dies infectieuses (ECCMID). Nous donnons ici des aperçus<br />
des présentations faites par d'éminents experts internationaux,<br />
le Pr Pierre-François Laterre, le Pr Emmanuelle Cambau, le Pr Stephan<br />
Harbarth et le Dr Patricia Munoz et examinons les nouvelles<br />
méthodes alternatives pour un diagnostic précoce du sepsis.<br />
Le Pr Emmanuelle Cambau, de l'Université Paris Diderot,<br />
Assistance Publique-Hôpitaux de Paris, donne également<br />
des recommandations pour optimiser les hémocultures.<br />
Notre objectif est d'être le partenaire des microbiologistes et<br />
des professionnels de santé, dans le monde entier pour <strong>la</strong><br />
lutte contre le sepsis. Nous tenons donc particulièrement<br />
à recevoir votre retour d'information sur ce numéro de<br />
One Microbiology World.<br />
Alexandre Mérieux,<br />
Vice-président, Unité Microbiologie<br />
1. Vincent J.L., et al.Crit Care Med. 2006;34:344-355<br />
2. Angus D.C., et al. Crit Care Med. 2001;29:1303-10<br />
3. Bone R.C., et al. Chest 1992;101:1644-55<br />
* Prière de consulter votre représentant<br />
<strong>bioMérieux</strong> local concernant <strong>la</strong> disponibilité<br />
du produit<br />
JUILLET 2011<br />
Dans ce numéro : > Diagnostic des bactériémies > Automatisation du <strong>la</strong>boratoire > ID/AST rapide > Forum IAS<br />
> Recherche de C.Difficile > Dépistage des GBS > Certificats de compatibilité<br />
Diagnostic des Bactériémies :<br />
pour aller de l’avant<br />
“Diagnostic des bactériémies : présent et avenir” était le thème du<br />
symposium intégré de <strong>bioMérieux</strong> lors du Congrès européen de<br />
microbiologie clinique et de ma<strong>la</strong>dies infectieuses (ECCMID), le 8 mai<br />
2011. Plus de 400 participants ont assisté aux présentations d'éminents<br />
experts internationaux, le Pr Pierre-François Laterre, le Pr Emmanuelle<br />
Cambau, le Pr Stephan Harbarth et le Dr Patricia Munoz.<br />
Malgré les progrès de <strong>la</strong> prise en charge des patients, le sepsis sévère demeure une affection qui<br />
engage le pronostic vital, avec des taux de mortalité de 20 à 40 % 1 . Le sepsis est l'un des défis<br />
majeurs à relever en soins intensifs et le diagnostic précoce est un élément décisif du pronostic.<br />
Une hémoculture, suivie de l'identification de l'agent pathogène et de son profil de résistance (ID/AST),<br />
reste l'exploration essentielle dans <strong>la</strong> recherche du sepsis. Toutefois, près de 30 à 50 % des cas septiques<br />
donnent des cultures négatives et le 1/3 des cultures positives sont dues à des contaminants. Par ailleurs,<br />
le dé<strong>la</strong>i moyen de rendu des résultats de 24 à 48 heures dans le cas de l'ID/AST dépasse actuellement<br />
<strong>la</strong> fourchette de temps critique pour instaurer le traitement initial, qui est de 1 à 24 heures.<br />
L'instauration précoce du traitement antimicrobien après l'apparition des signes cliniques du sepsis est<br />
associée à une amélioration de <strong>la</strong> survie des patients, avec une augmentation de 7 % de <strong>la</strong> mortalité<br />
à chaque heure de report du traitement2 . Cette urgence conduit souvent à <strong>la</strong> prescription précoce<br />
d'antibiotiques à <strong>la</strong>rge spectre, une situation qui peut déboucher sur un traitement non spécifique<br />
prolongé et sur le développement de multirésistance. On a aujourd'hui besoin de nouveaux outils qui<br />
fournissent une ID/AST plus rapide afin d'ajuster précocement les décisions thérapeutiques pour un<br />
meilleur impact sur le pronostic. (page 5)<br />
En Direct du Laboratoire<br />
Grady Health System est l'un des systèmes de santé<br />
publique les plus importants aux Etats-Unis. Composé<br />
du Grady Memorial Hospital qui compte 953 lits, avec<br />
6 centres de santé voisins, du Crestview Health &<br />
Rehabilitation Center et du Children's Healthcare of<br />
At<strong>la</strong>nta at Hughes Spalding, des actions cohérentes<br />
et efficaces sont essentielles au succès de son<br />
organisation et à <strong>la</strong> qualité des soins et des services<br />
offerts à ses patients. (page 2)
En Direct du Laboratoire<br />
Le <strong>la</strong>boratoire de microbiologie de l'hôpital, qui reçoit et teste environ<br />
600 échantillons par jour, est confronté à une pression importante pour fournir<br />
des résultats d'examens de <strong>la</strong> plus haute qualité possible dans le dé<strong>la</strong>i le plus<br />
court, compte tenu en particulier de l'augmentation rapide des bactéries<br />
multirésistantes, de <strong>la</strong> liste toujours croissante des super microbes responsables<br />
d'infections potentiellement fatales et de <strong>la</strong> diminution du personnel qualifié<br />
en microbiologie. Le <strong>la</strong>boratoire de microbiologie du Grady Health System<br />
utilise les technologies PREVI Iso<strong>la</strong>, PREVI Color Gram, BacT/ALERT ® , VITEK ®<br />
2 et Etest ® de <strong>bioMérieux</strong> pour relever les défis actuels auxquels est confronté<br />
le <strong>la</strong>boratoire de microbiologie et pour fournir aux médecins une information<br />
exacte, rapide et exploitable pour une meilleure prise en charge des patients.<br />
Le VITEK ® Mass Spec est actuellement en cours d'évaluation<br />
(à des fins de recherche uniquement).<br />
Vous trouverez, ci-dessous, un entretien avec Tim Drake, responsable du<br />
<strong>la</strong>boratoire de microbiologie du Grady Health System.<br />
Intégrer un <strong>la</strong>boratoire de microbiologie<br />
entièrement automatisé est un grand pas,<br />
pourquoi ce changement ?<br />
Tim Drake: Le Grady teste environ 600 cultures par jour, ce qui fait un grand<br />
nombre de boîtes. Et bien sûr on insiste aussi beaucoup sur <strong>la</strong> nécessité<br />
de fournir rapidement les résultats. L'hôpital héberge une vaste structure<br />
d'enseignement et l'information doit être dirigée vers plusieurs lieux différents.<br />
Avec toutes ces demandes et les difficultés quotidiennes, nous avons réalisé<br />
que les solutions <strong>bioMérieux</strong> amélioreraient réellement notre flux de travail.<br />
Quel était l'objectif du Grady lorsqu'il a envisagé<br />
un changement de <strong>la</strong> prise en charge<br />
des examens de <strong>la</strong>boratoire ?<br />
TD: L'idée était de rationaliser notre flux de travail afin d'obtenir des résultats plus<br />
rapides avec une plus grande efficacité pour un meilleur traitement des patients. Plus<br />
vite nous pouvons remettre l'information entre les mains des professionnels de<br />
santé, meilleures seront les décisions qu'ils prendront pour le traitement de<br />
leurs patients.<br />
Optimiser nos ressources était une autre de nos<br />
préoccupations. Notre capacité à obtenir des<br />
financements supplémentaires pour de nouvelles<br />
ressources destinées à gérer <strong>la</strong> charge de travail est<br />
limitée en raison d’une fréquentation élevée de<br />
patients défavorisés.Nous voulons nous assurer<br />
que nos patients reçoivent des soins de qualité et<br />
notre capacité à rapporter à nos médecins <strong>la</strong><br />
bonne information au bon moment est essentielle<br />
pour une prise en charge aussi efficace que<br />
possible de nos patients.<br />
Nous pensons que l'automatisation nous permet de<br />
réaffecter notre personnel sur des projets différents. Par exemple,<br />
PREVI Iso<strong>la</strong> nous donne de meilleurs ensemencements nous<br />
permettant d'isoler davantage de colonies sur <strong>la</strong> gélose. En aval, ce<strong>la</strong> évite aux<br />
techniciens des repiquages supplémentaires et leur permet de consacrer leur<br />
temps à l'identification et à l'antibiogramme (ID/AST). Eviter les repiquages<br />
économise une journée dans le rendu des résultats aux médecins.<br />
Pourquoi avez-vous choisi les solutions <strong>bioMérieux</strong> ?<br />
TD: Un avantage avec <strong>bioMérieux</strong>, c'est qu'ils ont l'intégralité de <strong>la</strong> solution<br />
d'automatisation. BioMérieux est le seul fournisseur qui propose l'ensemble et<br />
lorsque vous avez une solution, ce<strong>la</strong> aide pour <strong>la</strong> communication et <strong>la</strong> gestion des<br />
problèmes éventuels qui pourraient se poser. Traiter avec une seule société<br />
contribue à réduire le nombre de problèmes que vous avez à traiter tout au<br />
long de <strong>la</strong> journée.<br />
Comment votre personnel a géré<br />
le processus de transition ?<br />
TD: Le changement peut faire peur, notamment lorsqu'il s'agit d'introduire des<br />
solutions automatisées. On peut se dire : “Si cet instrument va faire cette tâche,<br />
alors moi, qu'est-ce que je vais faire ?”.<br />
Mais l'objectif de <strong>la</strong> direction du Grady n'a jamais été de réduire nos effectifs,<br />
l'idée était d'utiliser l'automatisation pour faciliter l'allocation des ressources<br />
afin d'augmenter <strong>la</strong> capacité de travail. En réalité, avec le nouveau <strong>la</strong>boratoire,<br />
les techniciens en microbiologie sont désormais volontaires pour<br />
apprendre à faire de nouvelles choses et à travailler sur des projets spécifiques.<br />
Quel impact les changements ont-ils eu<br />
sur vos pratiques de <strong>la</strong>boratoire quotidiennes ?<br />
TD: Il y a eu un effet positif sur l'efficacité du <strong>la</strong>boratoire. Il est étonnant<br />
de voir le temps que l'équipement a permis de faire gagner à chacun pour lui<br />
permettre de faire autre chose. Grâce à l'introduction de <strong>la</strong> seule technologie<br />
Iso<strong>la</strong>, nous observons une économie de temps d'environ 8 heures par semaine.<br />
Cette technologie permet d’obtenir des colonies extrêmement bien isolées,<br />
avec un même profil de stries avec le temps, ce qui améliore le flux de travail<br />
de nos techniciens. Ceux-ci peuvent rapidement aller à l’endroit de <strong>la</strong> gélose où<br />
ils peuvent trouver des colonies isolées ; ce<strong>la</strong> leur permet de passer à l'étape<br />
suivante du processus sans retard d'un jour occasionné par le repiquage.<br />
Chaque culture réalisées sur PREVI Iso<strong>la</strong> nous fait gagner du temps que nous<br />
pouvons consacrer à autre chose. Pourquoi payer quelqu'un pour rester assis<br />
à faire une tâche routinière quand nous pouvons utiliser un instrument qui<br />
accomplit cette tâche de <strong>la</strong> même façon à chaque fois ? Il vaut mieux affecter<br />
nos ressources spécialisées à l'ID/AST et à l’examen des résultats obtenus pour<br />
les rapporter aux médecins.<br />
Avez-vous observé une amélioration du flux<br />
d'information en direction des médecins ?<br />
TD: Le point essentiel en microbiologie, c'est que <strong>la</strong> plupart des médecins<br />
veulent savoir “qu'est-ce qui va réussir à tuer le microbe ?”. Pour savoir ce qui<br />
va tuer le microbe, nous devons savoir qui est "le microbe". Avec les résultats<br />
d'identification rapides et les analyses de tendance que nous générons au sein<br />
du Grady sur les profils de résistance aux<br />
antibiotiques concernant tel ou tel organisme,<br />
nous pouvons contribuer à réduire le temps<br />
pour mettre le patient sous le traitement le plus<br />
approprié. Donner ce niveau d'information aux<br />
médecins représente déjà plus de <strong>la</strong> moitié du<br />
chemin.<br />
Que pensez-vous<br />
du fonctionnement actuel du<br />
<strong>la</strong>boratoire de microbiologie du Grady ?<br />
TD: Jusqu’à ce jour, les attentes des cliniciens du Grady en terme de<br />
service, par le <strong>la</strong>boratoire de microbiologie n’étaient pas très fortes. En effet, <strong>la</strong><br />
plupart des médecins exerçant en Georgie ont fait leur internat au Grady mais<br />
peu d’internes se forment réellement à <strong>la</strong> microbiologie sauf ceux spécialisés<br />
en ma<strong>la</strong>dies infectieuses.<br />
Et si l'on parle de microbiologie, nous utilisons désormais au Grady des<br />
systèmes de test qui sont à <strong>la</strong> pointe de l'art. Et plus vite nous pouvons<br />
apporter aux cliniciens l'information dont ils ont besoin, plus utiles nous<br />
pouvons être pour eux.<br />
Tim Drake,<br />
Responsable du <strong>la</strong>boratoire de microbiologie du Grady Health System.
Réduire le dé<strong>la</strong>i de rendu des résultats et fournir aux cliniciens l'information<br />
dont ils ont besoin pour gérer le traitement des patients tout en réduisant les<br />
dépenses de santé est une priorité essentielle des <strong>la</strong>boratoires de microbiologie.<br />
Les cliniciens comptent de plus en plus sur les informations en provenance du<br />
<strong>la</strong>boratoire de microbiologie car <strong>la</strong> résistance aux antibiotiques a rendu les<br />
décisions thérapeutiques plus difficiles. Pour répondre à ces besoins, de<br />
nouvelles technologies et solutions automatisées ont, ces dix dernières années,<br />
sensiblement réduit le temps nécessaire pour fournir aux cliniciens des résultats<br />
exploitables. <strong>bioMérieux</strong> a été à <strong>la</strong> pointe de ce développement, offrant aux<br />
microbiologistes des solutions novatrices. Aujourd'hui, <strong>bioMérieux</strong> a développé<br />
<strong>la</strong> solution <strong>la</strong> plus intégrée, <strong>la</strong> plus rapide pour des tests d'ID/AST fiables,<br />
une identification en quelques minutes et un antibiogramme le jour même,<br />
grâce à VITEK ® MS* et VITEK ® 2, connectés par le logiciel My<strong>la</strong>.<br />
Lancé en mai en Europe, le VITEK ® MS est un instrument de spectrométrie<br />
de masse et une solution logicielle conçus pour l'identification rapide des<br />
micro-organismes sur <strong>la</strong> base de <strong>la</strong> technologie MALDI-TOF (Matrix Assisted<br />
Laser Desorption Ionization – Time Of Flight). L'identification microbienne<br />
est réalisée par l'obtention de l'analyse des spectres au moyen de <strong>la</strong> base de<br />
données VITEK ® MS. Les pics de ces spectres sont comparés au profil<br />
caractéristique d'une espèce, d'un genre ou d'une famille de micro-organismes,<br />
permettant ainsi l'identification des organismes. L'instrument intègre un poste<br />
et un logiciel de préparation garantissant à l'utilisateur un lien sécurisé pour les<br />
informations sur l'échantillon entre chaque dépôt de <strong>la</strong> cible et <strong>la</strong> position de<br />
<strong>la</strong> cassette VITEK ® 2 contenant <strong>la</strong> carte d'AST. Ce<strong>la</strong> permet l'intégration facile<br />
et sûre de l'identification par spectrométrie de masse avec le résultat de sensibilité<br />
rendu par VITEK ® 2. Le VITEK ® MS utilise des cibles jetables avec des codesbarres<br />
uniques et 48 positions par cible. Quatre cibles peuvent être p<strong>la</strong>cées en<br />
même temps dans l'instrument. La flexibilité et une solution d'ID/AST facile à<br />
utiliser permettent au microbiologiste de fournir les informations critiques aux<br />
bonnes personnes au bon moment.<br />
Le Laboratoire du Futur<br />
Tests d'ID/AST rapides :<br />
apporter plus vite <strong>la</strong> bonne information<br />
aux bonnes personnes<br />
VITEK ® MS<br />
Acquisition Station<br />
Operational visibility<br />
Practicality and ease of use<br />
VITEK ® MS<br />
Sample Prep Station<br />
Simple scanning steps Connecting<br />
VITEK ® MS ID and VITEK ® 2 AST<br />
My<strong>la</strong> server<br />
with MS-ID<br />
database<br />
VITEK ® 2<br />
Le VITEK ® MS et le VITEK ® 2 sont entièrement intégrés au logiciel My<strong>la</strong>,<br />
un middleware très flexible qui peut être mis en p<strong>la</strong>ce pour un accès multiutilisateurs<br />
à distance sur les divers terminaux du <strong>la</strong>boratoire. My<strong>la</strong> centralise<br />
les informations en provenance de plusieurs instruments sur un "tableau de<br />
bord" principal, utilisé par les microbiologistes pour suivre les tests depuis <strong>la</strong><br />
préparation des échantillons jusqu'au chargement de l'instrument, l'analyse<br />
des échantillons et <strong>la</strong> gestion des données. Il peut être consulté depuis des<br />
postes à distance, comme un ordinateur portable ou un iPad ® , et peut être<br />
directement relié aux systèmes d'information de hôpital pour un transfert<br />
rapide des résultats.<br />
La technologie VITEK ® 2 <strong>la</strong>rgement éprouvée fournit les résultats de l'AST le jour<br />
même et réduit les tâches de préparation et de standardisation de l'inoculum<br />
pour le microbiolgiste, en gérant les phases d'incubation et de lecture ainsi<br />
qu'en garantissant l'entière traçabilité au moyen de codes-barres pré-définis.<br />
Sa facilité d'utilisation et son entière automatisation permettent de limiter le<br />
temps d'instal<strong>la</strong>tion, ce qui en fait le seul système qui génère réellement les résultats<br />
le jour même. Le logiciel Advanced Expert System (AES), élément essentiel de <strong>la</strong><br />
technologie VITEK ® 2, est également unique en ce sens qu'il analyse les valeurs<br />
de CMI afin de déterminer les phénotypes de résistance. Al<strong>la</strong>nt au-delà des<br />
autres systèmes qui utilisent uniquement des interprétations de catégories –<br />
sensible, intermédiaire ou résistant – l'AES aide à détecter les résistances<br />
émergentes et les nouveaux phénotypes.<br />
Au p<strong>la</strong>n pratique, comment ça marche ? Après une mise en culture pendant une nuit<br />
entière, les iso<strong>la</strong>ts sont passés simultanément sur le VITEK ® 2 et sur le VITEK ® MS.<br />
Des feuilles de travail électroniques sont générées de manière automatique<br />
par My<strong>la</strong>, garantissant l'entière traçabilité de l'échantillon du début à <strong>la</strong> fin.<br />
En environ 2 minutes, le VITEK ® MS fournit l'identification des organismes ; des<br />
informations qui peuvent être immédiatement transmises au médecin comme<br />
aide au diagnostic. Les résultats de l'antibiogramme sur VITEK ® 2 peuvent être<br />
disponibles au bout de 5 heures seulement, c'est-à-dire, du fait du temps minimal<br />
de mise en œuvre, en une seule équipe. My<strong>la</strong> connecte les deux instruments,<br />
reliant automatiquement le résultat d'identification fourni par le VITEK ® MS<br />
avec le résultat de l'antibiogramme fourni par le VITEK ® 2, ce qui permet de<br />
donner plus vite <strong>la</strong> bonne information aux bonnes personnes.<br />
Présentation c<strong>la</strong>ire et structurée des résultats dans le tableau de bord My<strong>la</strong><br />
Facilite <strong>la</strong> validation des résultats car toutes les informations utiles sont accessibles en temps<br />
réel, même en travail<strong>la</strong>nt à distance.<br />
* La disponibilité commerciale dépend de l'achèvement réussi des essais cliniques<br />
et des enregistrements conformément aux réglementations locales
Diagnostic des Bactériémies :<br />
pour aller de l’avant<br />
L'amélioration des taux de positivité des hémocultures grâce à <strong>la</strong> mise en p<strong>la</strong>ce<br />
de meilleures pratiques est certainement l'une des façons d’aller de l’avant (voir l'interview<br />
du Pr E. Cambau sur “Les 5 meilleures pratiques pour des hémocultures optimisées”). Lors<br />
du symposium de l'ECCMID, plusieurs solutions diagnostiques alternatives, spectrométrie<br />
de masse, méthodes molécu<strong>la</strong>ires et biomarqueurs de <strong>la</strong> réponse de l'hôte ont également<br />
été discutées.<br />
Une approche basée sur <strong>la</strong> spectrométrie de masse, connue sous le nom de MALDI-TOF<br />
(Matrix Assisted Laser Desorption Ionization – Time Of Flight), est très prometteuse.<br />
Lorsqu'elle est utilisée sur des hémocultures positives, <strong>la</strong> méthode MALDI-TOF peut fournir<br />
une identification du genre et de l'espèce en quelques minutes, permettant des gains<br />
de temps significatifs par rapport aux méthodes d'identification traditionnelles.<br />
Des recherches sont en cours pour déterminer le potentiel de <strong>la</strong> spectrométrie de masse<br />
à fournir d'autres informations utiles pour le clinicien (génotypage, détermination des<br />
mécanismes de résistance et des facteurs de virulence).<br />
Les méthodes molécu<strong>la</strong>ires, appliquées aux hémocultures positives, peuvent également<br />
fournir des résultats très rapides (ID de l'agent pathogène en quelques minutes).<br />
La solution idéale, bien sûr, serait d'effectuer les tests molécu<strong>la</strong>ires directement sur les<br />
échantillons sanguins. Ce<strong>la</strong> reste difficile en raison de plusieurs facteurs, notamment une<br />
charge bactérienne insuffisante. En outre, ces méthodes molécu<strong>la</strong>ires nécessitent des<br />
essais cliniques robustes avant de pouvoir réellement être intégrées dans le processus de<br />
prise en charge du sepsis.<br />
Du point de vue de <strong>la</strong> réponse de l'hôte, on a c<strong>la</strong>irement besoin d'une nouvelle génération<br />
de biomarqueurs rapides et très précis pour contribuer à identifier les patients à haut<br />
risque d'infection de <strong>la</strong> circu<strong>la</strong>tion sanguine (ICS). Idéalement, un biomarqueur du sepsis<br />
devrait raccourcir le dé<strong>la</strong>i d'établissement du diagnostic, faciliter <strong>la</strong> différenciation entre les causes<br />
infectieuses/non infectieuses de l'inf<strong>la</strong>mmation et refléter l'efficacité de l’antibiothérapie.<br />
Des biomarqueurs récents fournissent déjà une valeur médicale ajoutée et un dé<strong>la</strong>i<br />
d'établissement du diagnostic plus rapide.<br />
La procalcitonine (PCT) a été évaluée de manière approfondie dans le cadre d'essais cliniques<br />
prospectifs à grande échelle3,4 et il a été démontré qu'elle jouait un rôle utile pour :<br />
- différencier les infections bactériennes des infections virales,<br />
- fournir des indications sur l'instauration, <strong>la</strong> durée et l'arrêt de l'antibiothérapie,<br />
- distinguer une contamination d'une ICS.<br />
L'adrénomédulline et <strong>la</strong> protéine du calcul pancréatique (PCP) sont deux autres biomarqueurs<br />
actuellement en cours d'évaluation. Des taux élevés sont retrouvés chez les patients atteints<br />
de sepsis et de choc septique (SIRS) et, comme <strong>la</strong> PCT, leurs taux p<strong>la</strong>smatiques sont corrélés<br />
aux scores de sévérité et peuvent contribuer à prédire l'évolution du choc septique5,6 .<br />
Plusieurs éléments de preuves suggèrent désormais que <strong>la</strong> mortalité liée au sepsis ou à une<br />
atteinte sévère est due à l'effet de différents mécanismes dans le temps. Initialement, après<br />
une infection sévère, les patients développent une forte réponse inf<strong>la</strong>mmatoire systémique,<br />
qui peut conduire à une défail<strong>la</strong>nce multiviscérale et à une mortalité précoce. Parallèlement,<br />
l'organisme développe des mécanismes anti-inf<strong>la</strong>mmatoires conduisant à un état<br />
d'immunosuppression persistant, un risque accru d'infections nosocomiales et une mortalité<br />
tardive. La stratification des patients sur <strong>la</strong> base de biomarqueurs du statut immunitaire<br />
avant l'instauration des traitements anti-inf<strong>la</strong>mmatoires ou de <strong>la</strong> stimu<strong>la</strong>tion immunitaire est<br />
donc une autre voie intéressante pour développer des soins personnalisés chez les patients<br />
de réanimation. Les biomarqueurs de <strong>la</strong> réponse de l'hôte, probablement associés à des<br />
marqueurs des agents pathogènes, constituent un domaine clé de recherche et l'on p<strong>la</strong>ce<br />
en eux de grands espoirs pour permettre de mieux prédire les complications du sepsis et<br />
son issue fatale chez les patients de réanimation.<br />
<strong>bioMérieux</strong> a organisé <strong>la</strong> 3e édition du World HAI<br />
Forum (Forum mondial sur les IAS) du 27 au 29 juin au<br />
centre de conférence Les Pensières de <strong>la</strong> Fondation<br />
Mérieux, à Annecy, France.<br />
Plus de 70 des plus éminents experts internationaux en médecine,<br />
ma<strong>la</strong>dies infectieuses, microbiologie et épidémiologie se sont<br />
rencontrés pour discuter de l'une des questions les plus pressantes<br />
auxquelles est confrontée <strong>la</strong> santé humaine aujourd'hui : <strong>la</strong><br />
résistance aux antibiotiques. Cette question a pris des proportions<br />
a<strong>la</strong>rmantes alors même que <strong>la</strong> recherche sur le développement de<br />
nouveaux antibiotiques marque le pas.<br />
Les présentations faites lors du Forum ont été les suivantes :<br />
“Comment le CDC gère-t-il l'augmentation des KPC”, par<br />
Arjun Srinivasan, Directeur associé pour les programmes de<br />
prévention des infections associées aux soins, division pour <strong>la</strong><br />
promotion de <strong>la</strong> qualité des soins, Centers for Disease Control<br />
Prêts pour un monde sans antibiotiques ?<br />
and Prevention (Etats-Unis).<br />
“Le point de vue du politique”, par John Ryan, Chef de l'unité<br />
Health Threats, DG SANCO, Commission Européenne<br />
(Belgique).<br />
“Que nous a appris <strong>la</strong> NDM-1 ?” et “La perspective indienne”, par<br />
Patrice Nordmann, Chef du service de microbiologie, hôpital<br />
Bicêtre, faculté de médecine Paris-Sud, et responsable de l'unité de<br />
recherche U914 de l'INSERM “Mécanismes émergents de<br />
résistances aux antibiotiques”, K-Bicêtre (France) ; Timothy Walsh,<br />
Professeur de médecine, département d'infectiologie, immunité &<br />
biochimie, faculté de médecine de l'université de Cardiff (Royaume-<br />
Uni) ; Abdul Ghafur, Docteur, consultant en ma<strong>la</strong>dies infectieuses<br />
et microbiologie clinique aux hôpitaux Apollo (Inde).<br />
Nous devons protéger les antibiotiques comme nous<br />
protégeons l'environnement.<br />
L'un des objectifs du Forum de cette année était de susciter une<br />
L'ajustement précoce de l'antibiothérapie, permettant une amélioration du pronostic,<br />
<strong>la</strong> diminution des taux de mortalité et <strong>la</strong> réduction de <strong>la</strong> multirésistance sont les bénéfices<br />
essentiels que ces nouvelles solutions diagnostiques visent à obtenir.<br />
Comme les experts présents au symposium en ont convenu, d'autres études sont<br />
nécessaires pour établir c<strong>la</strong>irement leur impact sur <strong>la</strong> prise en charge précoce des patients<br />
et leur intégration dans le processus de prise des décisions cliniques.<br />
Références: 1. Schaaf et al. Eur Respir J. 2007;30:517-524 2. Kumar et al. CCM 2006;34(6):1589-1596 3. Christ-Crain M et al.<br />
Am J Respir Crit Care Med. 2006;174:84-93 4. Bouadma L. et al. Lancet 2010 ;375 :463-474 5. Christ-Crain M. et al. Crit Care<br />
2005;9:816-824 6. Keel M. et al. Crit Care Med. 2009;37:1642-1648<br />
Les 5 meilleures pratiques<br />
pour des hémocultures optimisées<br />
Nous avons demandé au Pr Emmanuelle Cambau, de l'Université Paris Diderot,<br />
Assistance Publique-Hôpitaux de Paris, France, ses 5 meilleures pratiques pour<br />
optimiser les performances et les taux de positivité des hémocultures.<br />
1 Volume de sang prélevé pour <strong>la</strong> culture : au moins 30-40 ml par épisode<br />
Le volume de sang prélevé est l'aspect le plus important de l'hémoculture. Quatre f<strong>la</strong>cons<br />
de 10 ml donnent le volume le plus efficient et le plus coût-efficace. La formation au<br />
prélèvement du bon volume est également importante car les techniques de prélèvement<br />
diffèrent selon que l'on utilise une aiguille et une seringue ou un kit de prélèvement.<br />
2 Une antisepsie adéquate de <strong>la</strong> peau<br />
Il est important de réaliser une bonne antisepsie de <strong>la</strong> peau : <strong>la</strong>ver avec un savon<br />
antiseptique, rincer, sécher et appliquer de <strong>la</strong> povidone iodée ou de <strong>la</strong> chlorhexidine<br />
diluée dans de l'alcool. Le savoir-faire de l'infirmière, sa formation et l'utilisation de gants<br />
sont tout aussi importants. Toutefois, même avec <strong>la</strong> meilleure antisepsie, il est difficile de<br />
réduire le taux de contamination à moins de 2 %. 3 à 4 % des contaminations représentent<br />
environ 30 % de tous les résultats positifs, soit un taux élevé de faux positifs. Des taux de<br />
contamination supérieurs à 5 % sont inacceptables.<br />
3 Réduire le temps entre <strong>la</strong> ponction veineuse et l'incubation<br />
Un échantillon de sang doit être incubé dès son prélèvement, sinon vous commencez à perdre<br />
des micro-organismes viables qui ne peuvent pas survivre<br />
à température ambiante. Le temps pendant lequel un f<strong>la</strong>con<br />
reste non incubé peut dépendre de nombreux facteurs tels<br />
que l'organisation globale, les heures travaillées et <strong>la</strong> distance<br />
d'avec le <strong>la</strong>boratoire. Idéalement, l'échantillon doit être<br />
incubé dans les 2 à 3 heures qui suivent son prélèvement.<br />
4 Prélever deux trains d'hémocultures, à 15-30 minutes d'intervalle<br />
Un contaminant sera généralement présent dans un seul f<strong>la</strong>con d'un train de f<strong>la</strong>cons<br />
d'hémoculture, contrairement à une véritable infection du sang, c'est pourquoi il faut<br />
toujours prélever deux trains d'hémocultures. Ils doivent être prélevés au niveau de sites<br />
anatomiques distincts et rapidement l'un après l'autre.<br />
5 Respecter l'ordre des f<strong>la</strong>cons aérobies et anaérobies<br />
L'introduction d'air dans le f<strong>la</strong>con en fait un f<strong>la</strong>con "aérobie". Si l'on utilise une aiguille et<br />
une seringue, commencer par le f<strong>la</strong>con anaérobie, puis, si l'on utilise un kit de prélèvement<br />
avec ailette, remplir d'abord le f<strong>la</strong>con aérobie. Si l'on utilise un cathéter, il y a déjà de l'air<br />
dans le cathéter, le f<strong>la</strong>con aérobie doit donc être utilisé en premier.<br />
Et enfin, des vidéos de formation et des audits de <strong>la</strong> pratique des hémocultures peuvent jouer<br />
un rôle important pour sensibiliser le personnel et améliorer <strong>la</strong> réalisation des hémocultures.<br />
Pour plus d'informations, voir les recommandations de l'ASM/CUMITECH et les Optimal<br />
testing parameters for blood cultures .<br />
1 - ASM/CUMITECH Guidelines. Baron, E.J., M.P. Weinstein, W.M. Dunne, Jr., P. Yagupsky, D.F. Welch, and D.M. Wilson. Cumitech 1C,<br />
Blood Cultures IV. Coordinating ed., E.J. Baron. ASM Press, Washington, D.C. 2005.<br />
2 Cockerill FR, Wilson JW, Vetter EA, et al. Optimal testing parameters for blood cultures. Clin Infect Dis. 2004;38:1724-1730.<br />
prise de conscience et un intérêt de manière à ce que les<br />
médecins et les patients utilisent les antibiotiques de manière plus<br />
responsable. Les participants au Forum ont fait des propositions<br />
de mesures concrètes qui seront incluses dans un Appel à l'action<br />
adressé aux autorités de santé et aux politiques du monde entier.<br />
Pour en savoir plus<br />
Retrouvez les interviews des experts et les débats autour de<br />
l'Appel à l'action sur : www.biomerieux.com/hai-resistance
La solution complète pour<br />
<strong>la</strong> recherche de C. difficile<br />
Le tout dernier produit de <strong>la</strong> gamme chromID cible<br />
un agent pathogène émergent, C. difficile,<br />
et fournit les résultats en un temps record.<br />
Autrefois considéré comme une nuisance<br />
clinique, C. difficile est désormais<br />
considéré comme une menace<br />
croissante pour <strong>la</strong> santé. L'émergence<br />
de souches hautement toxigènes et<br />
résistantes et l'augmentation de <strong>la</strong><br />
MACD (ma<strong>la</strong>die associée à C. difficile)<br />
acquise dans <strong>la</strong> communauté ont conduit<br />
les organisations sanitaires nationales et<br />
internationales à appeler à des mesures de<br />
détection et de contrôle plus strictes.<br />
La culture reste <strong>la</strong> méthode diagnostique <strong>la</strong> plus sensible,<br />
essentielle pour évaluer les patients souffrant de ma<strong>la</strong>die<br />
sévère ou compliquée et l'unique méthode qui<br />
permet <strong>la</strong> réalisation d'études épidémiologiques et<br />
d'antibiogrammes. ChromID C. difficile, récemment<br />
<strong>la</strong>ncé par <strong>bioMérieux</strong>, est le premier milieu chromogène<br />
pour l'isolement et l'identification de C. difficile en tout<br />
juste 24 heures. Il est rapide et fiable, facile à utiliser et<br />
ne nécessite aucun savoir-faire particulier pour <strong>la</strong> lecture.<br />
Avec un taux de détection de 96 à 99 % après 24 heures<br />
et une sensibilité jusqu'à 30 % supérieure à celle des milieux<br />
conventionnels, il facilite les décisions thérapeutiques et les<br />
mesures de contrôle nosocomiales en fournissant des<br />
résultats plus rapides.<br />
Avec chromID C. difficile, <strong>bioMérieux</strong> offre une solution<br />
complète pour <strong>la</strong> recherche de C. difficile. Le test entièrement<br />
automatisé VIDAS ® C. difficile Toxine A&B fournit une solution<br />
standardisée et des résultats en tout juste 75 minutes,<br />
ce qui permet <strong>la</strong> prise de décisions thérapeutiques plus<br />
rapides et des mesures d'isolement des patients.<br />
VITEK ® 2 permet une identification microbienne et un<br />
antibiogramme rapides et fiables. Etest ® est un outil<br />
coût-efficace pour obtenir les CMI (concentrations<br />
minimales inhibitrices). Les galeries API ® & ATB ® contribuent<br />
à l'identification de l'infection à C. difficile et aident à<br />
surveiller l'émergence d'une antibiorésistance<br />
(ex : au métronidazole ou à <strong>la</strong> vancomycine). Et enfin,<br />
le système DiversiLab ® offre un génotypage microbien<br />
automatisé pour <strong>la</strong> surveil<strong>la</strong>nce et le typage des souches<br />
en 4 heures environ et le logiciel de surveil<strong>la</strong>nce<br />
épidémiologique VIGIGUARD assure un suivi efficace.<br />
Une gamme exhaustive pour le<br />
dépistage et le diagnostic des SGB<br />
Les infections néonatales à streptocoques du groupe B (SGB)<br />
restent une cause majeure d'infection néonatale dans<br />
les pays industrialisés, avec une apparition précoce<br />
généralement au cours des 24 premières heures de vie,<br />
débouchant souvent sur un sepsis fulminant, une pneumonie<br />
ou une méningite associées à une morbidité et mortalité<br />
élevées. La stratégie <strong>la</strong> plus efficace pour diminuer l'incidence<br />
de SGB chez le nouveau-né repose actuellement sur le<br />
dépistage prénatal universel de toutes les femmes enceintes<br />
à 35-37 semaines de gestation au moyen de méthodes<br />
basées sur des cultures afin de déterminer <strong>la</strong> nécessité<br />
Direct access to Home Page:<br />
www.biomerieux-diagnostics.com<br />
©2010 <strong>bioMérieux</strong> S.A. All rights reserved.<br />
<strong>bioMérieux</strong> S.A. 69280 Marcy l’Étoile - France<br />
d'une antibioprophy<strong>la</strong>xie intrapartum. Des organismes<br />
officiels tels que les CDC (voir les nouvelles recommandations<br />
2010 révisées des CDC sur <strong>la</strong> prévention des infections<br />
prénatales à streptocoques du groupe B :http://www.cdc.gov/<br />
groupbstrep/guidelines/guidelines.html) recommandent<br />
cette stratégie et elle est soit appliquée dans son intégralité<br />
soit adaptée aux besoins locaux dans <strong>la</strong> plupart des pays<br />
industrialisés. Les éléments de <strong>la</strong> gamme de dépistage<br />
et de diagnostic des SGB de <strong>bioMérieux</strong> sont conformes<br />
aux recommandations des CDC et peuvent être associés<br />
pour fournir des solutions aux différents<br />
besoins de <strong>la</strong>boratoire.<br />
Par exemple :<br />
Solution 1. Pour <strong>la</strong> recherche<br />
rapide de résultats positifs,<br />
avec identification directe en<br />
18-24 heures : bouillon diphasique<br />
Granada suivi d'un repiquage sur<br />
géloses Columbia ANC + 5 % sang de<br />
mouton ou chromID Strepto B.<br />
Solution 2. Pour <strong>la</strong> détection de<br />
souches non hémolytiques et <strong>la</strong> confirmation<br />
définitive des résultats négatifs : enrichissement<br />
sélectif en bouillon de Todd Hewitt suivi d'un repiquage<br />
sur géloses chromID Strepto B et test d'agglutination au<br />
<strong>la</strong>tex avec SLIDEX ® Strepto Plus Groupe B.<br />
<strong>bioMérieux</strong> a récemment <strong>la</strong>ncé <strong>la</strong> gélose bi-p<strong>la</strong>te au<br />
sang de mouton Granada/Columbia ANC, destinée à<br />
<strong>la</strong> prévention des SGB chez <strong>la</strong> femme enceinte et à<br />
l’identification des porteuses de streptocoques du<br />
groupe A. Elle permet une lecture plus rapide, un flux<br />
de travail rationalisé et une meilleure traçabilité des<br />
résultats avec l'avantage de <strong>la</strong> bi-p<strong>la</strong>te, à savoir une<br />
réduction de l'espace de stockage, du coût et des déchets.<br />
Certificats de compatibilité :<br />
vous rendre <strong>la</strong> vie quotidienne<br />
plus facile<br />
La mise en p<strong>la</strong>ce de l’accréditation peut être<br />
consommatrice de temps et d'argent. C'est pourquoi,<br />
dans le cadre de son offre globale, <strong>bioMérieux</strong> vérifie <strong>la</strong><br />
compatibilité de ses gammes de produits et fournit,<br />
à titre gracieux, des certificats de conformité.<br />
Le certificat de conformité est un document<br />
validé montrant <strong>la</strong> compatibilité d'un<br />
milieu avec des tests <strong>bioMérieux</strong><br />
complémentaires.<br />
A titre d'exemple, <strong>la</strong> gélose<br />
chromID CPS ® , milieu d'isolement<br />
pour les échantillons d'urine,<br />
est entièrement compatible avec<br />
23 réactifs d'identification et avec<br />
10 réactifs d'AST, dont les cartes<br />
VITEK ® 2, les galeries API ® , ATB et les<br />
tests rapides*.<br />
Nos études de compatibilité pour les nouveaux milieux<br />
font partie intégrante de leur processus de développement<br />
dans le cadre de l'Assurance Qualité, garantissant une<br />
entière traçabilité. Elles sont effectuées par une équipe<br />
de microbiologie de <strong>la</strong> R&D interne dédiée, conformément<br />
à un protocole de vérification standard. Pour chaque milieu,<br />
des études sont réalisées sur un panel de souches<br />
représentatives conformément à l'usage prévu du test,<br />
avec une gélose au sang ou un autre milieu approprié<br />
comme référence.<br />
Le certificat de compatibilité est un document prêt<br />
à l'emploi, qui peut facilement être téléchargé à partir<br />
du site internet de <strong>bioMérieux</strong>, Bibliothèque technique.<br />
Régulièrement actualisés en cas de modification des<br />
produits, 20 certificats de compatibilité concernant 36<br />
produits sont aujourd'hui disponibles sur le site internet<br />
de <strong>bioMérieux</strong>. D'autres sont en cours de réalisation et<br />
seront bientôt disponibles.<br />
<strong>bioMérieux</strong> fournit une gamme complète de documents<br />
en ligne pour aider nos clients à satisfaire à leurs<br />
exigences réglementaires :<br />
Notices<br />
Déc<strong>la</strong>rations de produits non dangereux<br />
Déc<strong>la</strong>ration de conformité de produits<br />
Déc<strong>la</strong>rations de choc thermique<br />
Certificats de contrôle qualité<br />
Certificats de compatibilité<br />
https://techlib.biomerieux.com<br />
*voir le mode d'emploi pour plus de détails.<br />
Que pensez-vous de ce bulletin ?<br />
Remplissez notre questionnaire et faites-nous le<br />
savoir ! Toutes les informations communiquées<br />
sont strictement anonymes et confidentielles.<br />
https://www.surveymonkey.com/s/newslettersatisfaction-survey<br />
09/2011 – <strong>bioMérieux</strong>, le logo bleu, API, ATB, Advanced Expert System, BACT/ALERT, CHROMID, CPS, DIVERSILAB, ETEST, MS, MYLA, PREVI, SLIDEX, VIDAS, VITEK et VIGIGUARD sont des marques utilisées, déposées et/ou enregistrées appartenant à <strong>bioMérieux</strong> S.A.<br />
ou à l’une de ses filiales / Les autres marques et noms de produits mentionnés dans ce document sont des marques commerciales de leurs détenteurs respectifs. La disponibilité des produits peut varier d'un pays à l'autre et est soumise à des exigences réglementaires<br />
diverses / Contacter votre représentant local pour connaître les disponibilités / Photos : C. GANET, Graphic Obsession / <strong>bioMérieux</strong> SA RCS Lyon 673 620 399 / THERA Conseil RCS Lyon B 398 160 242