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EDITORIAL<br />

Le sepsis est <strong>la</strong> cause sous-jacente de mortalité <strong>la</strong> plus fréquente<br />

au sein des unités de soins intensifs non cardiologiques, où le taux de<br />

mortalité peut atteindre 32 % en cas de sepsis sévère et 54 % en cas<br />

de choc septique.1 Il existe chaque année dans le monde plus de<br />

18 millions de cas de sepsis sévère et environ 1 400 patients en<br />

meurent chaque jour. 2,3<br />

Le diagnostic précoce du sepsis est essentiel pour instaurer un traitement<br />

spécifique qui permette l'amélioration du pronostic, le diagnostic<br />

reste un véritable défi clinique.<br />

L'accélération du rendu des résultats pour améliorer les soins<br />

apportés aux patients est <strong>la</strong> priorité numéro un de <strong>bioMérieux</strong><br />

et elle est particulièrement essentielle dans le cas du sepsis, l'un de<br />

nos domaines d’actions prioritaires. Notre société a développé une<br />

vaste gamme de solutions pour améliorer le diagnostic clinique, le<br />

pronostic et <strong>la</strong> prescription antibiotique pour <strong>la</strong> prise en charge du<br />

sepsis, notamment le dosage immunologique du biomarqueurs<br />

VIDAS ® PCT, le logiciel d'épidémiologie VIGIGUARD *, l'hémoculture<br />

automatisée BacT/ALERT ® , l'ID/AST avec VITEK ® 2 et désormais avec<br />

VITEK® MS intégrant <strong>la</strong> spectrométrie de masse MALDI-TOF.<br />

Dans ce numéro de One Microbiology World, le Dr Tim Drake,<br />

responsable du <strong>la</strong>boratoire de microbiologie du Grady Health System<br />

Hospital aux Etats-Unis, parle de l’évolution de leur <strong>la</strong>boratoire en un<br />

<strong>la</strong>boratoire de microbiologie entièrement automatisé, et de <strong>la</strong> manière<br />

dont ce<strong>la</strong> a aidé leur équipe et amélioré <strong>la</strong> pratique quotidienne<br />

du <strong>la</strong>boratoire. Plus de 400 personnes ont participé au symposium<br />

de <strong>bioMérieux</strong>, “Diagnostic des bactériémies : présent et avenir”,<br />

lors du récent Congrès européen de microbiologie clinique et de<br />

ma<strong>la</strong>dies infectieuses (ECCMID). Nous donnons ici des aperçus<br />

des présentations faites par d'éminents experts internationaux,<br />

le Pr Pierre-François Laterre, le Pr Emmanuelle Cambau, le Pr Stephan<br />

Harbarth et le Dr Patricia Munoz et examinons les nouvelles<br />

méthodes alternatives pour un diagnostic précoce du sepsis.<br />

Le Pr Emmanuelle Cambau, de l'Université Paris Diderot,<br />

Assistance Publique-Hôpitaux de Paris, donne également<br />

des recommandations pour optimiser les hémocultures.<br />

Notre objectif est d'être le partenaire des microbiologistes et<br />

des professionnels de santé, dans le monde entier pour <strong>la</strong><br />

lutte contre le sepsis. Nous tenons donc particulièrement<br />

à recevoir votre retour d'information sur ce numéro de<br />

One Microbiology World.<br />

Alexandre Mérieux,<br />

Vice-président, Unité Microbiologie<br />

1. Vincent J.L., et al.Crit Care Med. 2006;34:344-355<br />

2. Angus D.C., et al. Crit Care Med. 2001;29:1303-10<br />

3. Bone R.C., et al. Chest 1992;101:1644-55<br />

* Prière de consulter votre représentant<br />

<strong>bioMérieux</strong> local concernant <strong>la</strong> disponibilité<br />

du produit<br />

JUILLET 2011<br />

Dans ce numéro : > Diagnostic des bactériémies > Automatisation du <strong>la</strong>boratoire > ID/AST rapide > Forum IAS<br />

> Recherche de C.Difficile > Dépistage des GBS > Certificats de compatibilité<br />

Diagnostic des Bactériémies :<br />

pour aller de l’avant<br />

“Diagnostic des bactériémies : présent et avenir” était le thème du<br />

symposium intégré de <strong>bioMérieux</strong> lors du Congrès européen de<br />

microbiologie clinique et de ma<strong>la</strong>dies infectieuses (ECCMID), le 8 mai<br />

2011. Plus de 400 participants ont assisté aux présentations d'éminents<br />

experts internationaux, le Pr Pierre-François Laterre, le Pr Emmanuelle<br />

Cambau, le Pr Stephan Harbarth et le Dr Patricia Munoz.<br />

Malgré les progrès de <strong>la</strong> prise en charge des patients, le sepsis sévère demeure une affection qui<br />

engage le pronostic vital, avec des taux de mortalité de 20 à 40 % 1 . Le sepsis est l'un des défis<br />

majeurs à relever en soins intensifs et le diagnostic précoce est un élément décisif du pronostic.<br />

Une hémoculture, suivie de l'identification de l'agent pathogène et de son profil de résistance (ID/AST),<br />

reste l'exploration essentielle dans <strong>la</strong> recherche du sepsis. Toutefois, près de 30 à 50 % des cas septiques<br />

donnent des cultures négatives et le 1/3 des cultures positives sont dues à des contaminants. Par ailleurs,<br />

le dé<strong>la</strong>i moyen de rendu des résultats de 24 à 48 heures dans le cas de l'ID/AST dépasse actuellement<br />

<strong>la</strong> fourchette de temps critique pour instaurer le traitement initial, qui est de 1 à 24 heures.<br />

L'instauration précoce du traitement antimicrobien après l'apparition des signes cliniques du sepsis est<br />

associée à une amélioration de <strong>la</strong> survie des patients, avec une augmentation de 7 % de <strong>la</strong> mortalité<br />

à chaque heure de report du traitement2 . Cette urgence conduit souvent à <strong>la</strong> prescription précoce<br />

d'antibiotiques à <strong>la</strong>rge spectre, une situation qui peut déboucher sur un traitement non spécifique<br />

prolongé et sur le développement de multirésistance. On a aujourd'hui besoin de nouveaux outils qui<br />

fournissent une ID/AST plus rapide afin d'ajuster précocement les décisions thérapeutiques pour un<br />

meilleur impact sur le pronostic. (page 5)<br />

En Direct du Laboratoire<br />

Grady Health System est l'un des systèmes de santé<br />

publique les plus importants aux Etats-Unis. Composé<br />

du Grady Memorial Hospital qui compte 953 lits, avec<br />

6 centres de santé voisins, du Crestview Health &<br />

Rehabilitation Center et du Children's Healthcare of<br />

At<strong>la</strong>nta at Hughes Spalding, des actions cohérentes<br />

et efficaces sont essentielles au succès de son<br />

organisation et à <strong>la</strong> qualité des soins et des services<br />

offerts à ses patients. (page 2)


En Direct du Laboratoire<br />

Le <strong>la</strong>boratoire de microbiologie de l'hôpital, qui reçoit et teste environ<br />

600 échantillons par jour, est confronté à une pression importante pour fournir<br />

des résultats d'examens de <strong>la</strong> plus haute qualité possible dans le dé<strong>la</strong>i le plus<br />

court, compte tenu en particulier de l'augmentation rapide des bactéries<br />

multirésistantes, de <strong>la</strong> liste toujours croissante des super microbes responsables<br />

d'infections potentiellement fatales et de <strong>la</strong> diminution du personnel qualifié<br />

en microbiologie. Le <strong>la</strong>boratoire de microbiologie du Grady Health System<br />

utilise les technologies PREVI Iso<strong>la</strong>, PREVI Color Gram, BacT/ALERT ® , VITEK ®<br />

2 et Etest ® de <strong>bioMérieux</strong> pour relever les défis actuels auxquels est confronté<br />

le <strong>la</strong>boratoire de microbiologie et pour fournir aux médecins une information<br />

exacte, rapide et exploitable pour une meilleure prise en charge des patients.<br />

Le VITEK ® Mass Spec est actuellement en cours d'évaluation<br />

(à des fins de recherche uniquement).<br />

Vous trouverez, ci-dessous, un entretien avec Tim Drake, responsable du<br />

<strong>la</strong>boratoire de microbiologie du Grady Health System.<br />

Intégrer un <strong>la</strong>boratoire de microbiologie<br />

entièrement automatisé est un grand pas,<br />

pourquoi ce changement ?<br />

Tim Drake: Le Grady teste environ 600 cultures par jour, ce qui fait un grand<br />

nombre de boîtes. Et bien sûr on insiste aussi beaucoup sur <strong>la</strong> nécessité<br />

de fournir rapidement les résultats. L'hôpital héberge une vaste structure<br />

d'enseignement et l'information doit être dirigée vers plusieurs lieux différents.<br />

Avec toutes ces demandes et les difficultés quotidiennes, nous avons réalisé<br />

que les solutions <strong>bioMérieux</strong> amélioreraient réellement notre flux de travail.<br />

Quel était l'objectif du Grady lorsqu'il a envisagé<br />

un changement de <strong>la</strong> prise en charge<br />

des examens de <strong>la</strong>boratoire ?<br />

TD: L'idée était de rationaliser notre flux de travail afin d'obtenir des résultats plus<br />

rapides avec une plus grande efficacité pour un meilleur traitement des patients. Plus<br />

vite nous pouvons remettre l'information entre les mains des professionnels de<br />

santé, meilleures seront les décisions qu'ils prendront pour le traitement de<br />

leurs patients.<br />

Optimiser nos ressources était une autre de nos<br />

préoccupations. Notre capacité à obtenir des<br />

financements supplémentaires pour de nouvelles<br />

ressources destinées à gérer <strong>la</strong> charge de travail est<br />

limitée en raison d’une fréquentation élevée de<br />

patients défavorisés.Nous voulons nous assurer<br />

que nos patients reçoivent des soins de qualité et<br />

notre capacité à rapporter à nos médecins <strong>la</strong><br />

bonne information au bon moment est essentielle<br />

pour une prise en charge aussi efficace que<br />

possible de nos patients.<br />

Nous pensons que l'automatisation nous permet de<br />

réaffecter notre personnel sur des projets différents. Par exemple,<br />

PREVI Iso<strong>la</strong> nous donne de meilleurs ensemencements nous<br />

permettant d'isoler davantage de colonies sur <strong>la</strong> gélose. En aval, ce<strong>la</strong> évite aux<br />

techniciens des repiquages supplémentaires et leur permet de consacrer leur<br />

temps à l'identification et à l'antibiogramme (ID/AST). Eviter les repiquages<br />

économise une journée dans le rendu des résultats aux médecins.<br />

Pourquoi avez-vous choisi les solutions <strong>bioMérieux</strong> ?<br />

TD: Un avantage avec <strong>bioMérieux</strong>, c'est qu'ils ont l'intégralité de <strong>la</strong> solution<br />

d'automatisation. BioMérieux est le seul fournisseur qui propose l'ensemble et<br />

lorsque vous avez une solution, ce<strong>la</strong> aide pour <strong>la</strong> communication et <strong>la</strong> gestion des<br />

problèmes éventuels qui pourraient se poser. Traiter avec une seule société<br />

contribue à réduire le nombre de problèmes que vous avez à traiter tout au<br />

long de <strong>la</strong> journée.<br />

Comment votre personnel a géré<br />

le processus de transition ?<br />

TD: Le changement peut faire peur, notamment lorsqu'il s'agit d'introduire des<br />

solutions automatisées. On peut se dire : “Si cet instrument va faire cette tâche,<br />

alors moi, qu'est-ce que je vais faire ?”.<br />

Mais l'objectif de <strong>la</strong> direction du Grady n'a jamais été de réduire nos effectifs,<br />

l'idée était d'utiliser l'automatisation pour faciliter l'allocation des ressources<br />

afin d'augmenter <strong>la</strong> capacité de travail. En réalité, avec le nouveau <strong>la</strong>boratoire,<br />

les techniciens en microbiologie sont désormais volontaires pour<br />

apprendre à faire de nouvelles choses et à travailler sur des projets spécifiques.<br />

Quel impact les changements ont-ils eu<br />

sur vos pratiques de <strong>la</strong>boratoire quotidiennes ?<br />

TD: Il y a eu un effet positif sur l'efficacité du <strong>la</strong>boratoire. Il est étonnant<br />

de voir le temps que l'équipement a permis de faire gagner à chacun pour lui<br />

permettre de faire autre chose. Grâce à l'introduction de <strong>la</strong> seule technologie<br />

Iso<strong>la</strong>, nous observons une économie de temps d'environ 8 heures par semaine.<br />

Cette technologie permet d’obtenir des colonies extrêmement bien isolées,<br />

avec un même profil de stries avec le temps, ce qui améliore le flux de travail<br />

de nos techniciens. Ceux-ci peuvent rapidement aller à l’endroit de <strong>la</strong> gélose où<br />

ils peuvent trouver des colonies isolées ; ce<strong>la</strong> leur permet de passer à l'étape<br />

suivante du processus sans retard d'un jour occasionné par le repiquage.<br />

Chaque culture réalisées sur PREVI Iso<strong>la</strong> nous fait gagner du temps que nous<br />

pouvons consacrer à autre chose. Pourquoi payer quelqu'un pour rester assis<br />

à faire une tâche routinière quand nous pouvons utiliser un instrument qui<br />

accomplit cette tâche de <strong>la</strong> même façon à chaque fois ? Il vaut mieux affecter<br />

nos ressources spécialisées à l'ID/AST et à l’examen des résultats obtenus pour<br />

les rapporter aux médecins.<br />

Avez-vous observé une amélioration du flux<br />

d'information en direction des médecins ?<br />

TD: Le point essentiel en microbiologie, c'est que <strong>la</strong> plupart des médecins<br />

veulent savoir “qu'est-ce qui va réussir à tuer le microbe ?”. Pour savoir ce qui<br />

va tuer le microbe, nous devons savoir qui est "le microbe". Avec les résultats<br />

d'identification rapides et les analyses de tendance que nous générons au sein<br />

du Grady sur les profils de résistance aux<br />

antibiotiques concernant tel ou tel organisme,<br />

nous pouvons contribuer à réduire le temps<br />

pour mettre le patient sous le traitement le plus<br />

approprié. Donner ce niveau d'information aux<br />

médecins représente déjà plus de <strong>la</strong> moitié du<br />

chemin.<br />

Que pensez-vous<br />

du fonctionnement actuel du<br />

<strong>la</strong>boratoire de microbiologie du Grady ?<br />

TD: Jusqu’à ce jour, les attentes des cliniciens du Grady en terme de<br />

service, par le <strong>la</strong>boratoire de microbiologie n’étaient pas très fortes. En effet, <strong>la</strong><br />

plupart des médecins exerçant en Georgie ont fait leur internat au Grady mais<br />

peu d’internes se forment réellement à <strong>la</strong> microbiologie sauf ceux spécialisés<br />

en ma<strong>la</strong>dies infectieuses.<br />

Et si l'on parle de microbiologie, nous utilisons désormais au Grady des<br />

systèmes de test qui sont à <strong>la</strong> pointe de l'art. Et plus vite nous pouvons<br />

apporter aux cliniciens l'information dont ils ont besoin, plus utiles nous<br />

pouvons être pour eux.<br />

Tim Drake,<br />

Responsable du <strong>la</strong>boratoire de microbiologie du Grady Health System.


Réduire le dé<strong>la</strong>i de rendu des résultats et fournir aux cliniciens l'information<br />

dont ils ont besoin pour gérer le traitement des patients tout en réduisant les<br />

dépenses de santé est une priorité essentielle des <strong>la</strong>boratoires de microbiologie.<br />

Les cliniciens comptent de plus en plus sur les informations en provenance du<br />

<strong>la</strong>boratoire de microbiologie car <strong>la</strong> résistance aux antibiotiques a rendu les<br />

décisions thérapeutiques plus difficiles. Pour répondre à ces besoins, de<br />

nouvelles technologies et solutions automatisées ont, ces dix dernières années,<br />

sensiblement réduit le temps nécessaire pour fournir aux cliniciens des résultats<br />

exploitables. <strong>bioMérieux</strong> a été à <strong>la</strong> pointe de ce développement, offrant aux<br />

microbiologistes des solutions novatrices. Aujourd'hui, <strong>bioMérieux</strong> a développé<br />

<strong>la</strong> solution <strong>la</strong> plus intégrée, <strong>la</strong> plus rapide pour des tests d'ID/AST fiables,<br />

une identification en quelques minutes et un antibiogramme le jour même,<br />

grâce à VITEK ® MS* et VITEK ® 2, connectés par le logiciel My<strong>la</strong>.<br />

Lancé en mai en Europe, le VITEK ® MS est un instrument de spectrométrie<br />

de masse et une solution logicielle conçus pour l'identification rapide des<br />

micro-organismes sur <strong>la</strong> base de <strong>la</strong> technologie MALDI-TOF (Matrix Assisted<br />

Laser Desorption Ionization – Time Of Flight). L'identification microbienne<br />

est réalisée par l'obtention de l'analyse des spectres au moyen de <strong>la</strong> base de<br />

données VITEK ® MS. Les pics de ces spectres sont comparés au profil<br />

caractéristique d'une espèce, d'un genre ou d'une famille de micro-organismes,<br />

permettant ainsi l'identification des organismes. L'instrument intègre un poste<br />

et un logiciel de préparation garantissant à l'utilisateur un lien sécurisé pour les<br />

informations sur l'échantillon entre chaque dépôt de <strong>la</strong> cible et <strong>la</strong> position de<br />

<strong>la</strong> cassette VITEK ® 2 contenant <strong>la</strong> carte d'AST. Ce<strong>la</strong> permet l'intégration facile<br />

et sûre de l'identification par spectrométrie de masse avec le résultat de sensibilité<br />

rendu par VITEK ® 2. Le VITEK ® MS utilise des cibles jetables avec des codesbarres<br />

uniques et 48 positions par cible. Quatre cibles peuvent être p<strong>la</strong>cées en<br />

même temps dans l'instrument. La flexibilité et une solution d'ID/AST facile à<br />

utiliser permettent au microbiologiste de fournir les informations critiques aux<br />

bonnes personnes au bon moment.<br />

Le Laboratoire du Futur<br />

Tests d'ID/AST rapides :<br />

apporter plus vite <strong>la</strong> bonne information<br />

aux bonnes personnes<br />

VITEK ® MS<br />

Acquisition Station<br />

Operational visibility<br />

Practicality and ease of use<br />

VITEK ® MS<br />

Sample Prep Station<br />

Simple scanning steps Connecting<br />

VITEK ® MS ID and VITEK ® 2 AST<br />

My<strong>la</strong> server<br />

with MS-ID<br />

database<br />

VITEK ® 2<br />

Le VITEK ® MS et le VITEK ® 2 sont entièrement intégrés au logiciel My<strong>la</strong>,<br />

un middleware très flexible qui peut être mis en p<strong>la</strong>ce pour un accès multiutilisateurs<br />

à distance sur les divers terminaux du <strong>la</strong>boratoire. My<strong>la</strong> centralise<br />

les informations en provenance de plusieurs instruments sur un "tableau de<br />

bord" principal, utilisé par les microbiologistes pour suivre les tests depuis <strong>la</strong><br />

préparation des échantillons jusqu'au chargement de l'instrument, l'analyse<br />

des échantillons et <strong>la</strong> gestion des données. Il peut être consulté depuis des<br />

postes à distance, comme un ordinateur portable ou un iPad ® , et peut être<br />

directement relié aux systèmes d'information de hôpital pour un transfert<br />

rapide des résultats.<br />

La technologie VITEK ® 2 <strong>la</strong>rgement éprouvée fournit les résultats de l'AST le jour<br />

même et réduit les tâches de préparation et de standardisation de l'inoculum<br />

pour le microbiolgiste, en gérant les phases d'incubation et de lecture ainsi<br />

qu'en garantissant l'entière traçabilité au moyen de codes-barres pré-définis.<br />

Sa facilité d'utilisation et son entière automatisation permettent de limiter le<br />

temps d'instal<strong>la</strong>tion, ce qui en fait le seul système qui génère réellement les résultats<br />

le jour même. Le logiciel Advanced Expert System (AES), élément essentiel de <strong>la</strong><br />

technologie VITEK ® 2, est également unique en ce sens qu'il analyse les valeurs<br />

de CMI afin de déterminer les phénotypes de résistance. Al<strong>la</strong>nt au-delà des<br />

autres systèmes qui utilisent uniquement des interprétations de catégories –<br />

sensible, intermédiaire ou résistant – l'AES aide à détecter les résistances<br />

émergentes et les nouveaux phénotypes.<br />

Au p<strong>la</strong>n pratique, comment ça marche ? Après une mise en culture pendant une nuit<br />

entière, les iso<strong>la</strong>ts sont passés simultanément sur le VITEK ® 2 et sur le VITEK ® MS.<br />

Des feuilles de travail électroniques sont générées de manière automatique<br />

par My<strong>la</strong>, garantissant l'entière traçabilité de l'échantillon du début à <strong>la</strong> fin.<br />

En environ 2 minutes, le VITEK ® MS fournit l'identification des organismes ; des<br />

informations qui peuvent être immédiatement transmises au médecin comme<br />

aide au diagnostic. Les résultats de l'antibiogramme sur VITEK ® 2 peuvent être<br />

disponibles au bout de 5 heures seulement, c'est-à-dire, du fait du temps minimal<br />

de mise en œuvre, en une seule équipe. My<strong>la</strong> connecte les deux instruments,<br />

reliant automatiquement le résultat d'identification fourni par le VITEK ® MS<br />

avec le résultat de l'antibiogramme fourni par le VITEK ® 2, ce qui permet de<br />

donner plus vite <strong>la</strong> bonne information aux bonnes personnes.<br />

Présentation c<strong>la</strong>ire et structurée des résultats dans le tableau de bord My<strong>la</strong><br />

Facilite <strong>la</strong> validation des résultats car toutes les informations utiles sont accessibles en temps<br />

réel, même en travail<strong>la</strong>nt à distance.<br />

* La disponibilité commerciale dépend de l'achèvement réussi des essais cliniques<br />

et des enregistrements conformément aux réglementations locales


Diagnostic des Bactériémies :<br />

pour aller de l’avant<br />

L'amélioration des taux de positivité des hémocultures grâce à <strong>la</strong> mise en p<strong>la</strong>ce<br />

de meilleures pratiques est certainement l'une des façons d’aller de l’avant (voir l'interview<br />

du Pr E. Cambau sur “Les 5 meilleures pratiques pour des hémocultures optimisées”). Lors<br />

du symposium de l'ECCMID, plusieurs solutions diagnostiques alternatives, spectrométrie<br />

de masse, méthodes molécu<strong>la</strong>ires et biomarqueurs de <strong>la</strong> réponse de l'hôte ont également<br />

été discutées.<br />

Une approche basée sur <strong>la</strong> spectrométrie de masse, connue sous le nom de MALDI-TOF<br />

(Matrix Assisted Laser Desorption Ionization – Time Of Flight), est très prometteuse.<br />

Lorsqu'elle est utilisée sur des hémocultures positives, <strong>la</strong> méthode MALDI-TOF peut fournir<br />

une identification du genre et de l'espèce en quelques minutes, permettant des gains<br />

de temps significatifs par rapport aux méthodes d'identification traditionnelles.<br />

Des recherches sont en cours pour déterminer le potentiel de <strong>la</strong> spectrométrie de masse<br />

à fournir d'autres informations utiles pour le clinicien (génotypage, détermination des<br />

mécanismes de résistance et des facteurs de virulence).<br />

Les méthodes molécu<strong>la</strong>ires, appliquées aux hémocultures positives, peuvent également<br />

fournir des résultats très rapides (ID de l'agent pathogène en quelques minutes).<br />

La solution idéale, bien sûr, serait d'effectuer les tests molécu<strong>la</strong>ires directement sur les<br />

échantillons sanguins. Ce<strong>la</strong> reste difficile en raison de plusieurs facteurs, notamment une<br />

charge bactérienne insuffisante. En outre, ces méthodes molécu<strong>la</strong>ires nécessitent des<br />

essais cliniques robustes avant de pouvoir réellement être intégrées dans le processus de<br />

prise en charge du sepsis.<br />

Du point de vue de <strong>la</strong> réponse de l'hôte, on a c<strong>la</strong>irement besoin d'une nouvelle génération<br />

de biomarqueurs rapides et très précis pour contribuer à identifier les patients à haut<br />

risque d'infection de <strong>la</strong> circu<strong>la</strong>tion sanguine (ICS). Idéalement, un biomarqueur du sepsis<br />

devrait raccourcir le dé<strong>la</strong>i d'établissement du diagnostic, faciliter <strong>la</strong> différenciation entre les causes<br />

infectieuses/non infectieuses de l'inf<strong>la</strong>mmation et refléter l'efficacité de l’antibiothérapie.<br />

Des biomarqueurs récents fournissent déjà une valeur médicale ajoutée et un dé<strong>la</strong>i<br />

d'établissement du diagnostic plus rapide.<br />

La procalcitonine (PCT) a été évaluée de manière approfondie dans le cadre d'essais cliniques<br />

prospectifs à grande échelle3,4 et il a été démontré qu'elle jouait un rôle utile pour :<br />

- différencier les infections bactériennes des infections virales,<br />

- fournir des indications sur l'instauration, <strong>la</strong> durée et l'arrêt de l'antibiothérapie,<br />

- distinguer une contamination d'une ICS.<br />

L'adrénomédulline et <strong>la</strong> protéine du calcul pancréatique (PCP) sont deux autres biomarqueurs<br />

actuellement en cours d'évaluation. Des taux élevés sont retrouvés chez les patients atteints<br />

de sepsis et de choc septique (SIRS) et, comme <strong>la</strong> PCT, leurs taux p<strong>la</strong>smatiques sont corrélés<br />

aux scores de sévérité et peuvent contribuer à prédire l'évolution du choc septique5,6 .<br />

Plusieurs éléments de preuves suggèrent désormais que <strong>la</strong> mortalité liée au sepsis ou à une<br />

atteinte sévère est due à l'effet de différents mécanismes dans le temps. Initialement, après<br />

une infection sévère, les patients développent une forte réponse inf<strong>la</strong>mmatoire systémique,<br />

qui peut conduire à une défail<strong>la</strong>nce multiviscérale et à une mortalité précoce. Parallèlement,<br />

l'organisme développe des mécanismes anti-inf<strong>la</strong>mmatoires conduisant à un état<br />

d'immunosuppression persistant, un risque accru d'infections nosocomiales et une mortalité<br />

tardive. La stratification des patients sur <strong>la</strong> base de biomarqueurs du statut immunitaire<br />

avant l'instauration des traitements anti-inf<strong>la</strong>mmatoires ou de <strong>la</strong> stimu<strong>la</strong>tion immunitaire est<br />

donc une autre voie intéressante pour développer des soins personnalisés chez les patients<br />

de réanimation. Les biomarqueurs de <strong>la</strong> réponse de l'hôte, probablement associés à des<br />

marqueurs des agents pathogènes, constituent un domaine clé de recherche et l'on p<strong>la</strong>ce<br />

en eux de grands espoirs pour permettre de mieux prédire les complications du sepsis et<br />

son issue fatale chez les patients de réanimation.<br />

<strong>bioMérieux</strong> a organisé <strong>la</strong> 3e édition du World HAI<br />

Forum (Forum mondial sur les IAS) du 27 au 29 juin au<br />

centre de conférence Les Pensières de <strong>la</strong> Fondation<br />

Mérieux, à Annecy, France.<br />

Plus de 70 des plus éminents experts internationaux en médecine,<br />

ma<strong>la</strong>dies infectieuses, microbiologie et épidémiologie se sont<br />

rencontrés pour discuter de l'une des questions les plus pressantes<br />

auxquelles est confrontée <strong>la</strong> santé humaine aujourd'hui : <strong>la</strong><br />

résistance aux antibiotiques. Cette question a pris des proportions<br />

a<strong>la</strong>rmantes alors même que <strong>la</strong> recherche sur le développement de<br />

nouveaux antibiotiques marque le pas.<br />

Les présentations faites lors du Forum ont été les suivantes :<br />

“Comment le CDC gère-t-il l'augmentation des KPC”, par<br />

Arjun Srinivasan, Directeur associé pour les programmes de<br />

prévention des infections associées aux soins, division pour <strong>la</strong><br />

promotion de <strong>la</strong> qualité des soins, Centers for Disease Control<br />

Prêts pour un monde sans antibiotiques ?<br />

and Prevention (Etats-Unis).<br />

“Le point de vue du politique”, par John Ryan, Chef de l'unité<br />

Health Threats, DG SANCO, Commission Européenne<br />

(Belgique).<br />

“Que nous a appris <strong>la</strong> NDM-1 ?” et “La perspective indienne”, par<br />

Patrice Nordmann, Chef du service de microbiologie, hôpital<br />

Bicêtre, faculté de médecine Paris-Sud, et responsable de l'unité de<br />

recherche U914 de l'INSERM “Mécanismes émergents de<br />

résistances aux antibiotiques”, K-Bicêtre (France) ; Timothy Walsh,<br />

Professeur de médecine, département d'infectiologie, immunité &<br />

biochimie, faculté de médecine de l'université de Cardiff (Royaume-<br />

Uni) ; Abdul Ghafur, Docteur, consultant en ma<strong>la</strong>dies infectieuses<br />

et microbiologie clinique aux hôpitaux Apollo (Inde).<br />

Nous devons protéger les antibiotiques comme nous<br />

protégeons l'environnement.<br />

L'un des objectifs du Forum de cette année était de susciter une<br />

L'ajustement précoce de l'antibiothérapie, permettant une amélioration du pronostic,<br />

<strong>la</strong> diminution des taux de mortalité et <strong>la</strong> réduction de <strong>la</strong> multirésistance sont les bénéfices<br />

essentiels que ces nouvelles solutions diagnostiques visent à obtenir.<br />

Comme les experts présents au symposium en ont convenu, d'autres études sont<br />

nécessaires pour établir c<strong>la</strong>irement leur impact sur <strong>la</strong> prise en charge précoce des patients<br />

et leur intégration dans le processus de prise des décisions cliniques.<br />

Références: 1. Schaaf et al. Eur Respir J. 2007;30:517-524 2. Kumar et al. CCM 2006;34(6):1589-1596 3. Christ-Crain M et al.<br />

Am J Respir Crit Care Med. 2006;174:84-93 4. Bouadma L. et al. Lancet 2010 ;375 :463-474 5. Christ-Crain M. et al. Crit Care<br />

2005;9:816-824 6. Keel M. et al. Crit Care Med. 2009;37:1642-1648<br />

Les 5 meilleures pratiques<br />

pour des hémocultures optimisées<br />

Nous avons demandé au Pr Emmanuelle Cambau, de l'Université Paris Diderot,<br />

Assistance Publique-Hôpitaux de Paris, France, ses 5 meilleures pratiques pour<br />

optimiser les performances et les taux de positivité des hémocultures.<br />

1 Volume de sang prélevé pour <strong>la</strong> culture : au moins 30-40 ml par épisode<br />

Le volume de sang prélevé est l'aspect le plus important de l'hémoculture. Quatre f<strong>la</strong>cons<br />

de 10 ml donnent le volume le plus efficient et le plus coût-efficace. La formation au<br />

prélèvement du bon volume est également importante car les techniques de prélèvement<br />

diffèrent selon que l'on utilise une aiguille et une seringue ou un kit de prélèvement.<br />

2 Une antisepsie adéquate de <strong>la</strong> peau<br />

Il est important de réaliser une bonne antisepsie de <strong>la</strong> peau : <strong>la</strong>ver avec un savon<br />

antiseptique, rincer, sécher et appliquer de <strong>la</strong> povidone iodée ou de <strong>la</strong> chlorhexidine<br />

diluée dans de l'alcool. Le savoir-faire de l'infirmière, sa formation et l'utilisation de gants<br />

sont tout aussi importants. Toutefois, même avec <strong>la</strong> meilleure antisepsie, il est difficile de<br />

réduire le taux de contamination à moins de 2 %. 3 à 4 % des contaminations représentent<br />

environ 30 % de tous les résultats positifs, soit un taux élevé de faux positifs. Des taux de<br />

contamination supérieurs à 5 % sont inacceptables.<br />

3 Réduire le temps entre <strong>la</strong> ponction veineuse et l'incubation<br />

Un échantillon de sang doit être incubé dès son prélèvement, sinon vous commencez à perdre<br />

des micro-organismes viables qui ne peuvent pas survivre<br />

à température ambiante. Le temps pendant lequel un f<strong>la</strong>con<br />

reste non incubé peut dépendre de nombreux facteurs tels<br />

que l'organisation globale, les heures travaillées et <strong>la</strong> distance<br />

d'avec le <strong>la</strong>boratoire. Idéalement, l'échantillon doit être<br />

incubé dans les 2 à 3 heures qui suivent son prélèvement.<br />

4 Prélever deux trains d'hémocultures, à 15-30 minutes d'intervalle<br />

Un contaminant sera généralement présent dans un seul f<strong>la</strong>con d'un train de f<strong>la</strong>cons<br />

d'hémoculture, contrairement à une véritable infection du sang, c'est pourquoi il faut<br />

toujours prélever deux trains d'hémocultures. Ils doivent être prélevés au niveau de sites<br />

anatomiques distincts et rapidement l'un après l'autre.<br />

5 Respecter l'ordre des f<strong>la</strong>cons aérobies et anaérobies<br />

L'introduction d'air dans le f<strong>la</strong>con en fait un f<strong>la</strong>con "aérobie". Si l'on utilise une aiguille et<br />

une seringue, commencer par le f<strong>la</strong>con anaérobie, puis, si l'on utilise un kit de prélèvement<br />

avec ailette, remplir d'abord le f<strong>la</strong>con aérobie. Si l'on utilise un cathéter, il y a déjà de l'air<br />

dans le cathéter, le f<strong>la</strong>con aérobie doit donc être utilisé en premier.<br />

Et enfin, des vidéos de formation et des audits de <strong>la</strong> pratique des hémocultures peuvent jouer<br />

un rôle important pour sensibiliser le personnel et améliorer <strong>la</strong> réalisation des hémocultures.<br />

Pour plus d'informations, voir les recommandations de l'ASM/CUMITECH et les Optimal<br />

testing parameters for blood cultures .<br />

1 - ASM/CUMITECH Guidelines. Baron, E.J., M.P. Weinstein, W.M. Dunne, Jr., P. Yagupsky, D.F. Welch, and D.M. Wilson. Cumitech 1C,<br />

Blood Cultures IV. Coordinating ed., E.J. Baron. ASM Press, Washington, D.C. 2005.<br />

2 Cockerill FR, Wilson JW, Vetter EA, et al. Optimal testing parameters for blood cultures. Clin Infect Dis. 2004;38:1724-1730.<br />

prise de conscience et un intérêt de manière à ce que les<br />

médecins et les patients utilisent les antibiotiques de manière plus<br />

responsable. Les participants au Forum ont fait des propositions<br />

de mesures concrètes qui seront incluses dans un Appel à l'action<br />

adressé aux autorités de santé et aux politiques du monde entier.<br />

Pour en savoir plus<br />

Retrouvez les interviews des experts et les débats autour de<br />

l'Appel à l'action sur : www.biomerieux.com/hai-resistance


La solution complète pour<br />

<strong>la</strong> recherche de C. difficile<br />

Le tout dernier produit de <strong>la</strong> gamme chromID cible<br />

un agent pathogène émergent, C. difficile,<br />

et fournit les résultats en un temps record.<br />

Autrefois considéré comme une nuisance<br />

clinique, C. difficile est désormais<br />

considéré comme une menace<br />

croissante pour <strong>la</strong> santé. L'émergence<br />

de souches hautement toxigènes et<br />

résistantes et l'augmentation de <strong>la</strong><br />

MACD (ma<strong>la</strong>die associée à C. difficile)<br />

acquise dans <strong>la</strong> communauté ont conduit<br />

les organisations sanitaires nationales et<br />

internationales à appeler à des mesures de<br />

détection et de contrôle plus strictes.<br />

La culture reste <strong>la</strong> méthode diagnostique <strong>la</strong> plus sensible,<br />

essentielle pour évaluer les patients souffrant de ma<strong>la</strong>die<br />

sévère ou compliquée et l'unique méthode qui<br />

permet <strong>la</strong> réalisation d'études épidémiologiques et<br />

d'antibiogrammes. ChromID C. difficile, récemment<br />

<strong>la</strong>ncé par <strong>bioMérieux</strong>, est le premier milieu chromogène<br />

pour l'isolement et l'identification de C. difficile en tout<br />

juste 24 heures. Il est rapide et fiable, facile à utiliser et<br />

ne nécessite aucun savoir-faire particulier pour <strong>la</strong> lecture.<br />

Avec un taux de détection de 96 à 99 % après 24 heures<br />

et une sensibilité jusqu'à 30 % supérieure à celle des milieux<br />

conventionnels, il facilite les décisions thérapeutiques et les<br />

mesures de contrôle nosocomiales en fournissant des<br />

résultats plus rapides.<br />

Avec chromID C. difficile, <strong>bioMérieux</strong> offre une solution<br />

complète pour <strong>la</strong> recherche de C. difficile. Le test entièrement<br />

automatisé VIDAS ® C. difficile Toxine A&B fournit une solution<br />

standardisée et des résultats en tout juste 75 minutes,<br />

ce qui permet <strong>la</strong> prise de décisions thérapeutiques plus<br />

rapides et des mesures d'isolement des patients.<br />

VITEK ® 2 permet une identification microbienne et un<br />

antibiogramme rapides et fiables. Etest ® est un outil<br />

coût-efficace pour obtenir les CMI (concentrations<br />

minimales inhibitrices). Les galeries API ® & ATB ® contribuent<br />

à l'identification de l'infection à C. difficile et aident à<br />

surveiller l'émergence d'une antibiorésistance<br />

(ex : au métronidazole ou à <strong>la</strong> vancomycine). Et enfin,<br />

le système DiversiLab ® offre un génotypage microbien<br />

automatisé pour <strong>la</strong> surveil<strong>la</strong>nce et le typage des souches<br />

en 4 heures environ et le logiciel de surveil<strong>la</strong>nce<br />

épidémiologique VIGIGUARD assure un suivi efficace.<br />

Une gamme exhaustive pour le<br />

dépistage et le diagnostic des SGB<br />

Les infections néonatales à streptocoques du groupe B (SGB)<br />

restent une cause majeure d'infection néonatale dans<br />

les pays industrialisés, avec une apparition précoce<br />

généralement au cours des 24 premières heures de vie,<br />

débouchant souvent sur un sepsis fulminant, une pneumonie<br />

ou une méningite associées à une morbidité et mortalité<br />

élevées. La stratégie <strong>la</strong> plus efficace pour diminuer l'incidence<br />

de SGB chez le nouveau-né repose actuellement sur le<br />

dépistage prénatal universel de toutes les femmes enceintes<br />

à 35-37 semaines de gestation au moyen de méthodes<br />

basées sur des cultures afin de déterminer <strong>la</strong> nécessité<br />

Direct access to Home Page:<br />

www.biomerieux-diagnostics.com<br />

©2010 <strong>bioMérieux</strong> S.A. All rights reserved.<br />

<strong>bioMérieux</strong> S.A. 69280 Marcy l’Étoile - France<br />

d'une antibioprophy<strong>la</strong>xie intrapartum. Des organismes<br />

officiels tels que les CDC (voir les nouvelles recommandations<br />

2010 révisées des CDC sur <strong>la</strong> prévention des infections<br />

prénatales à streptocoques du groupe B :http://www.cdc.gov/<br />

groupbstrep/guidelines/guidelines.html) recommandent<br />

cette stratégie et elle est soit appliquée dans son intégralité<br />

soit adaptée aux besoins locaux dans <strong>la</strong> plupart des pays<br />

industrialisés. Les éléments de <strong>la</strong> gamme de dépistage<br />

et de diagnostic des SGB de <strong>bioMérieux</strong> sont conformes<br />

aux recommandations des CDC et peuvent être associés<br />

pour fournir des solutions aux différents<br />

besoins de <strong>la</strong>boratoire.<br />

Par exemple :<br />

Solution 1. Pour <strong>la</strong> recherche<br />

rapide de résultats positifs,<br />

avec identification directe en<br />

18-24 heures : bouillon diphasique<br />

Granada suivi d'un repiquage sur<br />

géloses Columbia ANC + 5 % sang de<br />

mouton ou chromID Strepto B.<br />

Solution 2. Pour <strong>la</strong> détection de<br />

souches non hémolytiques et <strong>la</strong> confirmation<br />

définitive des résultats négatifs : enrichissement<br />

sélectif en bouillon de Todd Hewitt suivi d'un repiquage<br />

sur géloses chromID Strepto B et test d'agglutination au<br />

<strong>la</strong>tex avec SLIDEX ® Strepto Plus Groupe B.<br />

<strong>bioMérieux</strong> a récemment <strong>la</strong>ncé <strong>la</strong> gélose bi-p<strong>la</strong>te au<br />

sang de mouton Granada/Columbia ANC, destinée à<br />

<strong>la</strong> prévention des SGB chez <strong>la</strong> femme enceinte et à<br />

l’identification des porteuses de streptocoques du<br />

groupe A. Elle permet une lecture plus rapide, un flux<br />

de travail rationalisé et une meilleure traçabilité des<br />

résultats avec l'avantage de <strong>la</strong> bi-p<strong>la</strong>te, à savoir une<br />

réduction de l'espace de stockage, du coût et des déchets.<br />

Certificats de compatibilité :<br />

vous rendre <strong>la</strong> vie quotidienne<br />

plus facile<br />

La mise en p<strong>la</strong>ce de l’accréditation peut être<br />

consommatrice de temps et d'argent. C'est pourquoi,<br />

dans le cadre de son offre globale, <strong>bioMérieux</strong> vérifie <strong>la</strong><br />

compatibilité de ses gammes de produits et fournit,<br />

à titre gracieux, des certificats de conformité.<br />

Le certificat de conformité est un document<br />

validé montrant <strong>la</strong> compatibilité d'un<br />

milieu avec des tests <strong>bioMérieux</strong><br />

complémentaires.<br />

A titre d'exemple, <strong>la</strong> gélose<br />

chromID CPS ® , milieu d'isolement<br />

pour les échantillons d'urine,<br />

est entièrement compatible avec<br />

23 réactifs d'identification et avec<br />

10 réactifs d'AST, dont les cartes<br />

VITEK ® 2, les galeries API ® , ATB et les<br />

tests rapides*.<br />

Nos études de compatibilité pour les nouveaux milieux<br />

font partie intégrante de leur processus de développement<br />

dans le cadre de l'Assurance Qualité, garantissant une<br />

entière traçabilité. Elles sont effectuées par une équipe<br />

de microbiologie de <strong>la</strong> R&D interne dédiée, conformément<br />

à un protocole de vérification standard. Pour chaque milieu,<br />

des études sont réalisées sur un panel de souches<br />

représentatives conformément à l'usage prévu du test,<br />

avec une gélose au sang ou un autre milieu approprié<br />

comme référence.<br />

Le certificat de compatibilité est un document prêt<br />

à l'emploi, qui peut facilement être téléchargé à partir<br />

du site internet de <strong>bioMérieux</strong>, Bibliothèque technique.<br />

Régulièrement actualisés en cas de modification des<br />

produits, 20 certificats de compatibilité concernant 36<br />

produits sont aujourd'hui disponibles sur le site internet<br />

de <strong>bioMérieux</strong>. D'autres sont en cours de réalisation et<br />

seront bientôt disponibles.<br />

<strong>bioMérieux</strong> fournit une gamme complète de documents<br />

en ligne pour aider nos clients à satisfaire à leurs<br />

exigences réglementaires :<br />

Notices<br />

Déc<strong>la</strong>rations de produits non dangereux<br />

Déc<strong>la</strong>ration de conformité de produits<br />

Déc<strong>la</strong>rations de choc thermique<br />

Certificats de contrôle qualité<br />

Certificats de compatibilité<br />

https://techlib.biomerieux.com<br />

*voir le mode d'emploi pour plus de détails.<br />

Que pensez-vous de ce bulletin ?<br />

Remplissez notre questionnaire et faites-nous le<br />

savoir ! Toutes les informations communiquées<br />

sont strictement anonymes et confidentielles.<br />

https://www.surveymonkey.com/s/newslettersatisfaction-survey<br />

09/2011 – <strong>bioMérieux</strong>, le logo bleu, API, ATB, Advanced Expert System, BACT/ALERT, CHROMID, CPS, DIVERSILAB, ETEST, MS, MYLA, PREVI, SLIDEX, VIDAS, VITEK et VIGIGUARD sont des marques utilisées, déposées et/ou enregistrées appartenant à <strong>bioMérieux</strong> S.A.<br />

ou à l’une de ses filiales / Les autres marques et noms de produits mentionnés dans ce document sont des marques commerciales de leurs détenteurs respectifs. La disponibilité des produits peut varier d'un pays à l'autre et est soumise à des exigences réglementaires<br />

diverses / Contacter votre représentant local pour connaître les disponibilités / Photos : C. GANET, Graphic Obsession / <strong>bioMérieux</strong> SA RCS Lyon 673 620 399 / THERA Conseil RCS Lyon B 398 160 242

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