Protection contre l'Esca, une maladie du bois de la vigne, par ...

Protection contre l’Esca, une maladie du bois de la vigne, par utilisation de
l’oomycète Pythium oligandrum
Lieu du stage : INRA BORDEAUX Aquitaine, UMR Santé et Agroécologie du
Vignoble
71 av E. Bourlaux, 33883 Villenave d’Ornon
Durée du stage : 7 mois (mars à septembre)
Encadrants : Patrice Rey (PR ENITAB) et Jonathan Gerbore (Biovitis),
Indemnités : 417 €/mois
Contexte : Il est actuellement estimé qu’environ 11% du vignoble français est
improductif suite aux pathologies affectant le bois des ceps. L’Esca, qui est la
principale de ces maladies, est en progression dans les différents vignobles français
mais aussi dans ceux de plusieurs pays européens. L’Esca serait provoqué par un
complexe de micro-organismes (essentiellement des champignons des genres,
Botryosphaeria, Chlamydospora, Phaeoacremonium, Phaeomoniella) dont les rôles
respectifs restent mal connus. Cette maladie est préoccupante car il n’existe aucun
traitement efficace depuis l’interdiction de l’arsénite de sodium en 2001. Dans ce
contexte, l’UMR Santé et Agroécologie du Vignoble (SAVE) a développé un
programme de recherche dont l’objectif est de mettre au point une stratégie de lutte
biologique contre l’Esca par utilisation de l’oomycète Pythium oligandrum. Notre
choix s’est porté sur P. oligandrum, car (i) la littérature scientifique concernant les
relations agents pathogènes / plante / P. oligandrum est abondante (Benhamou et al.,
1997; Le Floch et al., 2005; Rey et al., 1998; Wulff et al., 1998), (ii) il possède
plusieurs modes d’actions, i.e. mycoparasitisme, antibiose, promotion de croissance
et stimulation des défenses naturelles et (iii) il produit trois protéines élicitrices
nommées : oligandrine, POD1 et POD2 qui ont été identifiées et purifiées. Cet
oomycète a également été décrit comme étant capable de protéger la vigne contre
les infections par Botrytis cinerea, l’agent de la pourriture grise.
Descriptif du stage :
Le (la) stagiaire collaborera avec un doctorant (J. Gerbore) qui travaille sur ce sujet
et qui a purifié et caractérisé des souches de P. oligandrum à partir d’échantillons de
racines de vigne prélevés de plusieurs vignobles du Bordelais. Il a montré que
l’application de P. oligandrum au niveau du système racinaire des ceps induisait une
induction de résistance efficace pour limiter les attaques par un champignon impliqué
dans l’Esca, Phaeomoniella chlamydospora.
L’objectif du stage sera de:
(i) Caractériser des protéines élicitrices (type élicitines) émises par P.
oligandrum selon le groupe génétique des souches, (dosage HPLC et
SDS-page)
(ii) Utiliser les molécules produites lors d’un essai de protection en serre
contre un agent pathogène impliqué dans l’Esca (P. chlamydospora).
(iii) Etudier les mécanismes de défense induits lors de l’interaction
plante/pathogène/éliciteurs de P. oligandrum par RT-PCRq.
L’étudiant(e) aura des qualités d’autonomie et d’organisation pour gérer des
expérimentations en serre et au laboratoire afin de réaliser des analyses de

iochimie et de biologie moléculaire. Des bases en statistiques sont également
requises.
Contact : Patrice Rey, UMR SAVE INRA / Bordeaux Sciences Agro. E-mail :
prey@bordeaux.inra.fr
Tel. 05 57 12 26 36