La méthode de Maximum Likelihood
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LBA, <strong>de</strong> la parcimonie à la vraisemblance<br />
Comment se distribuent les sites autapomorphiques?<br />
sites <strong>de</strong> type ((A,D),(B,C)) > sites <strong>de</strong> type ((A,B),(C,D))<br />
A A A A A G A T C<br />
B A A C A A A A A<br />
C A T A T A A A A<br />
D A T A A A C G C<br />
Cas 1 :<br />
Les différents types <strong>de</strong><br />
sites variables non informatifs<br />
ont plus ou moins<br />
tous la même fréquence<br />
A<br />
D<br />
B<br />
C
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