TP 12 - modification..
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1 ère S, SVT, 05-06 1/2<br />
1. situation dans le cours et but du <strong>TP</strong><br />
<strong>TP</strong> <strong>12</strong><br />
Les conditions de l’activité enzymatique<br />
Une enzyme permet de réaliser une catalyse biologique, c'est-à-dire d’accélérer une réaction :<br />
Enzyme<br />
Substrats<br />
Produits<br />
L’étude de l’amylase pancréatique (<strong>TP</strong> 11) a permis de mettre en évidence cette propriété de catalyseur d’une enzyme. De<br />
plus, on a pu noter dans ce cas une influence de la température : la réaction a été catalysée à 35°C, mais pas à 0°C.<br />
On peut donc se demander quelles conditions peuvent influer sur l’activité d’une enzyme.<br />
2. enzyme et principes du <strong>TP</strong><br />
On se propose d’étudier par ExAO (Expérimentation Assistée par Ordinateur) l’activité de la peroxydase du raifort :<br />
- cette enzyme est présente en grande quantité dans le raifort, ou radis noir ; on utilise donc un extrait de radis noir<br />
dilué ;<br />
- cette enzyme agit à température ambiante ;<br />
- elle catalyse la réaction suivante, permettant d’éliminer le peroxyde d’hydrogène (« eau oxygénée »), composé<br />
potentiellement dangereux pour les composés cellulaires :<br />
H 2 O 2 H 2 O + ½ 0 2<br />
Pour mesurer l’activité de la peroxydase, on utilise une réaction colorimétrique : la présence de dioxygène induit la<br />
formation d’un composé coloré, en présence de gaïacol :<br />
0 2 + gaïacol (incolore) gaïacoquinone (rouge)<br />
Grâce à un colorimètre, on mesure le passage d’un faisceau lumineux à travers la solution :<br />
- en présence de gaïacol, incolore, 100% du faisceau lumineux traverse la solution ;<br />
- en présence de gïacoquinone, rouge, 0% du faisceau lumineux traverse la solution.<br />
Le colorimètre est relié à une interface ExAO, qui permet de tracer la courbe obtenue en fonction du temps sur l’ordinateur.<br />
Principales fonctions du logiciel :<br />
réglage des paramètres de l’expérience<br />
vumètre : affichage des valeurs mesurées<br />
début de la mesure<br />
arrêt des mesures (à faire obligatoirement à la fin de chaque mesure, une fois le temps écoulé)<br />
Par défaut, les courbes d’expérience successives sont superposées. On peut effacer les courbes de l’écran en cliquant avec<br />
le bouton droit de la souris, et en choisissant « effacer les données ».<br />
3. matériel disponible<br />
Interface Orphy GTS II, module colorimétrique et PC<br />
9 tubes à essai<br />
6 pipettes de 2 mL, 1 pipette de 5 mL et propipettes<br />
8 cuve colorimétriques<br />
au bureau :<br />
H2O2 à 1%<br />
H2O2 à 3%<br />
Peroxydase 1X<br />
Peroxydase en milieu acide 1X<br />
Peroxydase en milieu basique 1X<br />
Gaïacol 1‰<br />
4. préparation du matériel informatique<br />
Allumer l’interface ExAO (Orphy GTS II)<br />
Ouvrir le logiciel « Visuel Orphy »<br />
Choisir « mesures directes »<br />
Choisir comme capteur : « colorimètre 100% »<br />
Brancher le module colorimétrique suivant les indications fournies par le logiciel ; positionner le bouton sur<br />
« bleu »<br />
Choisir « temporel », puis cliquer sur poursuivre jusqu’à arriver sur le graphe vide.<br />
Dans les paramètres, indiquer un temps de mesure de <strong>12</strong>0 secondes, avec environ 1 mesure toutes les 1,2 secondes.<br />
<strong>TP</strong> 11
1 ère S, SVT, 05-06 2/2<br />
5. protocole des mesures (commun à toutes les expériences)<br />
- dans une cuve colorimétrique, déposer 1,5 mL de gaïacol et 1,5 mL de solution de peroxydase<br />
- placer la cuve dans le colorimètre, et préparer une seringue avec 1 mL de substrat<br />
- lancer la mesure (qui dure 2 minutes)<br />
- après 20 à 30 secondes, injecter le substrat à travers l’adhésif (il ne faut surtout pas ouvrir l’enceinte, ni faire de<br />
bulles : injecter doucement !)<br />
- une fois l’expérience terminée (<strong>12</strong>0 secondes), arrêter les mesures.<br />
Rincer tout de suite les cuves de colorimétrie, et les placer dans la bassine prévue à cet effet.<br />
6. expériences communes à réaliser<br />
Expérience « conditions témoins » :<br />
Réaliser une expérience avec la solution de peroxydase 1X et l’eau oxygénée à 1%.<br />
Enregistrer le graphe dans le répertoire élève, sous le nom : 3BINOME1.grf (avec « BINOME » = initiales des membres du<br />
binôme)<br />
Ne pas effacer les données avant l’expérience suivante !<br />
Expériences « pH » :<br />
Réaliser deux expériences, avec l’eau oxygénée à 1% et :<br />
- la solution de peroxydase en milieu acide (pH = ……)<br />
- la solution de peroxydase en milieu basique (pH = ……)<br />
Enregistrer le graphe dans le répertoire élève, sous le nom : 3BINOME2.grf<br />
Effacer les données de l’écran : clic droit avec la souris, et « effacer les données ».<br />
7. expériences par demi-groupe<br />
Selon les instructions du professeur, réaliser l’expérience A ou l’expérience B.<br />
Expérience A :<br />
Préparer trois dilutions de l’enzyme : 2 fois (0,5 X), 10 fois (0,1 X) et 100 fois (0,01 X). (prévoir 5 à 10 mL de solution<br />
diluée, pour pouvoir effectuer plusieurs fois les mesures si nécessaire)<br />
Réaliser quatre expériences, avec l’eau oxygénée à 1% et les quatre solutions de peroxydase (1 X ; 0,5 X ; 0,1 X ; 0,01 X).<br />
Enregistrer le graphe dans le répertoire élève, sous le nom : 3BINOMEA.grf<br />
Expérience B :<br />
Préparer 3 dilutions de l’eau oxygénée à partir de la solution à 1% : diluée 200 fois, diluée 500 fois et diluée 1000 fois.<br />
Réaliser quatre expériences, avec la peroxydase 1X et les quatre solutions d’eau oxygénée (1, 1/200, 1/500, 1/1000).<br />
Enregistrer le graphe dans le répertoire élève, sous le nom : 3BINOMEB.grf<br />
Si vous avez assez de temps (à voir selon l’avancement de votre compte-rendu), réaliser l’expérience (A ou B) non<br />
réalisée.<br />
8. Bilan et compte-rendu<br />
Quelles conditions expérimentales semblent influer sur l’activité enzymatique de la peroxydase <br />
Rédiger un compte-rendu, intégrant :<br />
- Une introduction, rappelant en particulier le problème à résoudre<br />
- Les différentes conditions expérimentales réalisées<br />
- Les résultats obtenus<br />
- L’interprétation des résultats obtenus<br />
- Une conclusion, réalisant une synthèse de ces interprétations, et la réponse à la question posée<br />
Avant de partir : ramener les tubes et pipettes sales dans le seau prévu à cet effet, ramener les cuves colorimétriques dans<br />
le seau prévu à cet effet, fermer Visuel Orphy et éteindre l’interface, débrancher le module colorimétrique. Vérifier que<br />
vous laisser une paillasse propre pour le groupe suivant ou la classe suivante !<br />
<strong>TP</strong> 11