Manuel Qualité Plateforme Transcriptomique - URGV - Inra

Manuel Qualité
Plateforme Transcriptomique
Selon la norme ISO 9001 version 2008
14 décembre 2011
Contact :
Equipe Génomique Fonctionnelle d’Arabidopsis
Plateforme Analyse Du Transcriptome
Sandrine Balzergue
Unité de Recherche en Génomique Végétale (URGV)
2 rue Gaston Crémieux
CP 5708
91057 Evry cedex
FRANCE
Tel: +33 1 60 87 45 28
balzerg@evry.inra.fr
http://www.versailles.inra.fr/urgv/microarray.htm

La plateforme Transcriptomique, créée en 2003, réalise des
projets d’étude du transcriptome en collaboration avec des
équipes de recherche. Notre mission est de mettre à la
disposition de la communauté scientifique le savoir-faire et
l’expertise d’une équipe pluridisciplinaire pour réaliser les
expériences et analyser les résultats produits.
Des milliers de données sont accessibles via la base de données
publique CATdb. Le transfert de données est facilité vers la base
de données internationale GEO.
Notre Equipe
Sandrine Balzergue / Etienne Delannoy
CATMA v5 & v6
Ludivine Soubigou-Taconnat
Stéphanie Pateyron (mi-temps)
Affymetrix
Stéphanie Huguet
José Caïus (mi-temps)
+ 2 CDD en moyenne / an
RNA seq
Nous développons actuellement notre expertise
dans l’analyse transcriptomique par séquençage
à haut débit sur séquenceurs Illumina
Roche-NimbleGen
- Tiling array Arabidopsis
- Puces à façon plantes cultivées
En moyenne (CATMA et Affymetrix)
800 hybridations / an
50 projets / an
11 publications / an, IF moyen de 5.
La caractérisation et la quantification des différents transcrits d’ un organisme ou d’un tissu donné, dans des
conditions déterminées, permettent d'identifier les gènes actifs, de caractériser les mécanismes de régulation
d'expression des gènes, de définir ces réseaux ou de découvrir de nouveaux gènes. Selon votre question biologique,
nous vous conseillerons au mieux sur la solution technologique la plus pertinente pour y répondre.

Accès à la plateforme
•Mise à disposition d’équipement : accès environné ou non
•Projets en collaboration (à financement propre au laboratoire)
•Projets en partenariat (ANR, Région, Européen, etc.)
•Formations des étudiants (écoles doctorales, master Pro et
Recherche, écoles d’ingénieurs, universités)
Nos Technologies
•CATMA (Complete Arabidopsis Transcriptome MicroArray)
•Affymetrix (plantes cultivées)
•NimbleGen (plantes cultivées (puces à façon) et Arabidopsis)
•RNA seq (en développement)
Le déroulement de votre projet
•Expertise de votre projet transcriptome
•Conceptiond’oligos pour les puces NimbleGen à façon
•Contrôle qualité et quantification des ARN
•Marquage des ARN
•Hybridation, acquisition des résultats bruts
•Analyses statistiques des résultats
•Soumission dans 2 bases de données
•Formation des utilisateurs sur demande
Afin de garantir le niveau de qualité des analyses transcriptomes, la
plateforme a mis en place un Système de Management de la Qualité
selon l'intégralité des exigences de la norme ISO9001:2008.

Domaine d’application
Le système de management de la qualité s’applique à toutes les activités de la plateforme transcriptome.
Il concerne les 4 technologies proposées sur la plateforme.
Nos atouts
Aide à l’élaboration des projets
Analyses statistiques des résultats
Aide à l’interprétation des données
Aide à la rédaction d’articles (M&M, figures …)
Prise en charge des soumissions dans les bases de données
Support Statistique
Support bioinformatique
Veille technologique
Possibilité d’accueil des collaborateurs
La qualité technique de nos prestations
Nos engagements
L’amélioration de la communication avec nos clients
La capacité d’offrir une solution complète de l’élaboration
des projets aux résultats analysés statistiquement

Mesure de la satisfaction clients
Réalisée grâce à des études de satisfaction
ciblées et périodiques. L’écoute client s’appuie
également sur les échanges, les discussions et
les rencontres notamment dans le cadre du
suivi des projets et également lors des journées
utilisateurs.
Revue de direction
Réagir
Planifier
Maîtrise de la documentation
Le système management qualité s'appuie sur la
traçabilité documentaire. Tous les documents
du SMQ suivent les règles de création,
d'approbation, de mise à jour et de diffusion
définies dans la procédure PRO-01 de
Gestion documentaire nous permettant de
garantir la disponibilité des bons documents au
bon endroit.
Planification générale
Réunions
Journées des utilisateurs
Métrologie
Audits
Revues de direction
L’évaluation périodique du
système de management de la
qualité par l’équipe de direction
Vérifier Faire
Envoie des enquêtes
permet de s’assurer qu’il demeure
pertinent, adéquat et efficace.
Les 6 procédures exigées par la norme ISO 9001.
Audits internes
Le suivi et l’amélioration du système de
management de la qualité de la plateforme sont
assurés par la réalisation régulière d’audits
qualité internes selon la procédure PRO-03
de gestion d’audit interne.
Non Conformités
La détection d’un dysfonctionnement ou d’un incident (avéré ou potentiel) est gérée selon la procédure
PRO-02 de gestion des anomalies et des actions préventives et correctives.
Maîtrise des enregistrements
Le tableau Inventaire des Enregistrements définit les modes d’identification, d’utilisation,
de classement et d’archivage des enregistrements de la plateforme.
Hygiène et Sécurité
Gestion des compétences
Le tableau de Suivi des compétences permet de connaître et d'optimiser les
compétences disponibles sur la plateforme.
Tout nouvel arrivant reçoit une formation en matière d’hygiène et de sécurité dispensé par notre Agent Chargé de la Prévention. La
plateforme et ses infrastructures dépendent du bâtiment d'accueil et de ses tutelles : le règlement intérieur et les procédures y sont
donc appliqués. L’évaluation des risques est retranscrite dans le document de l’Outils de Pilotage de la Prévention à l’INRA.

Notre équipe
De gauche à droite et de bas en haut:
•Claire Lurin
Responsable équipe,
Directrice de recherche
•Delphine Gey *
CDD Ingénieur
•Etienne Delannoy
Chercheur,
Responsable Scientifique
•Stephanie Huguet
Technicienne
•Eddy Blondet *
CDD Ingénieur
•Sandrine Arribat *
CDD Ingénieur
•Stephanie Pateyron
Technicienne (mi-temps)
•Ludivine Soubigou
Assistant ingénieur - RMQ
•Sandrine Balzergue
Responsible technique et
projets, Ingénieur
•José Caius
Adjoint technique (mi-temps)
* membres ayant quittés la plateforme en 2011