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Objectifs A) Apprendre à faire des groupements à liens simples à liens complets UPGMA B) Matrice cophénétique C) Test de Mantel
A1) Groupement à lien simple 1. Calculez la matrice de ressemblance Site 2 Site 3 Site 4 Site 5 Site 1 0,464 0,675 0,524 0,566 Site 2 0,640 0,868 0,840 Site 3 0,693 0,730 Site 4 0,773 2. Mettre similarité en ordre décroissant Paire Site 2 - Site 4 Site 2 - Site 5 Site 4 - Site 5 Site 3 - Site 5 Site 3 - Site 4 Site 1 - Site 3 Site 2 - Site 3 Site 1 - Site 5 Site 1 - Site 4 Site 1 - Site 2 Similarité 0,868 0,840 0,773 0,730 0,693 0,675 0,640 0,566 0,524 0,464
Page 1: Laïus 10 : Groupements et test de
Page 5 and 6: A1) Groupement à lien simple 3. Gr
Page 7 and 8: A2) Groupement à lien complet 2. M
Page 9 and 10: A3) Groupement (UPGMA) 1. Joindre o
Page 11 and 12: A3) Groupement (UPGMA) Site 2 - sit
Page 13 and 14: A3) Groupement (UPGMA) Site 2 - sit
Page 15 and 16: C ) Test de Mantel Corrélation ent
Page 17 and 18: Exemple d’une permutation Tribu 2
Page 19 and 20: Exemple d’une permutation Tribu 2

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