Agathe Guilloux - Lsta - Université Pierre et Marie CURIE

Agathe GuillouxLSTA - Université Pierre et Marie Curie (UPMC)Boîte courrier 1584 place Jussieu, 75252 Paris cedex 05email : agathe.guilloux@upmc.frwww : http ://www.lsta.upmc.fr/guilloux.phpNée à Paris le 28 août 1978Mariée, deux enfantsNationalité françaiseTel : 01 44 27 85 57Situation actuelleMaître de Conférences à l’UPMC (depuis Septembre 2005)Membre du Laboratoire de Statistique Théorique et Appliquée - UPMCMembre du Centre de Recherche Saint Antoine - UPMC (Equipe 13)Cursus universitaire et professionnelHabilitation à diriger les recherches. Soutenue le 9/12/2010 à l’UPMC.Contributions to nonparametric statistics for survival analysisJury : N. Keiding, V. Patilea, K. Tribouley, Z. Ying (Rapporteurs), L. Birgé (Président), G. Biau, F. Comte,J.Y. Dauxois (Examinateurs). Qualification en 26-ième section.Délégation CNRS. (Août 2010 à Février 2011) au MAP5 - UMR CNRS 8145 - Paris DescartesATER. (2004-2005) à l’IUT de Sceaux, Université Paris-SudThèse de doctorat. Soutenue le 11/10/2004 à l’Université de Rennes 1, Mention très honorableInférence non-paramétrique en Statistique des Durées de Vie sous biais de sélectionJury : M. Hoffman, I. Van Keilegom (Rapporteurs), P. Deheuvels (Président), J.Y. Dauxois, M. Delecroix(Directeurs), J. Deshayes, S.N.U.A. Kirmani (Examinateurs)Thèse financée par le CREST (Ministère de l’Economie et des Finances).DEA de Mathématiques. (2000-2001), spécialité Statistique à l’Université de Rennes 1.ENSAI. (1998-2001), spécialité Biostatistiques et Epidémiologie.Projet et distinctionsPorteur de l’ANR Prognostic. ANR-09-JCJC-010 (Octobre 2009 - Septembre 2012). Point processes : nonparametricinference, learning and applications. http ://www.lsta.upmc.fr/prognostic/index.phpMembres : G. Biau (LSTA - UPMC), O. Bouaziz (MAP5 - Univ. Paris Descartes), A. Duval (Equipe13, Centre de Recherche Saint Antoine - UPMC), S. Gaïffas (LSTA - UPMC), S. Geffray (IRMA - Univ.Strasbourg), G. Lecué (LAMA - Univ. Paris Est), O. Lopez (LSTA - UPMC), E. Roquain (LPMA - UPMC),P. Saint-Pierre (LSTA - UPMC), F. Villers (LPMA - UPMC). Budget : 90 000 euros.Titulaire de la PIR. Prime d’investissement recherche (équivalent PES, 2011-2015), et PEDR (2007-2011)Prix Laha. Jeune conférencier invité à l’IMS-Bernoulli, Barcelone (2004)DiversCompétences informatiques.– Languages : HTML, C, SQL– Logiciel de calcul : R, Matlab, Scilab– Logiciels statistiques : SAS, SPSS, SPAD, Statgraphics– Bases de données : SQL+, AccessLangues. Anglais (courant) et Allemand (scolaire)1

Responsabilités administrativesLiées à la recherche.A l’UPMC.– Membre élu du Conseil d’UFR (depuis 2009)– Coordinateur (rang B) du Groupe d’Experts de la 26-ième section (2009-2011), Vice-président de laCommission des Spécialistes 26-ième section (2007-2008, Membre 2005-2007)– Membre nommé de la Commission des Personnels (depuis 2009)– Membre nommé de la Commission pour l’attribution de la Prime d’Investissement Recherche (PIR)(2009-2010)– Membre nommé de la Commission d’Avancement des Maîtres de Conférences (depuis 2009)Recrutement.– Membre des Comités de Sélection de l’UPMC (postes fléchés Statistique) (2006, 2007, 2008, 2009, 2010).– Membre extérieur de Comités de Sélection : Lyon-1 et Ecole Centrale de Lyon (2012), Paris-Descartes(2010), Paris-Ouest (2009 et 2010)Liées à l’enseignement.– Membre élu du Conseil de Direction de l’ISUP (depuis 2006)– Membre du Jury d’admission sur titre de l’ISUP (depuis 2009)– Membre du Jury de l’ISUP - UPMC (depuis 2006)– Co-responsable des stages du M2 de Statistique (2008-2011)Animation scientifiqueSociété Française de Statistique. Membre élu du bureau du Groupe “Statistique Mathématique” de la SFDSWorkshop SAM. Membre du comité d’organisation de SAM (“The statistical analysis of multi-outcomedata”) qui aura lieu à l’UPMC les 9 et 10 juillet 2012.Rapport sur articles. Annals of Statistics, Journal of Multivariate Analysis, Bernoulli, Electronic Journal ofStatistics, Journal of Statistical Planning and Inference, Scandinavian Journal of Statistics, Life Time DataAnalysis, Comptes Rendus de l’Académie des Sciences.Encadrement scientifiqueThèses.– Co-encadrement de la thèse de Sarah Lemler avec Marie-Luce Taupin (UEVE)Sujet : Réduction de dimension en analyse de survie. Application en statistique génétique et génomique.(depuis septembre 2011)– Co-encadrement de la thèse de Ségolen Geffray (dirigée par Paul Deheuvels, LSTA -UPMC), soutenue le3 novembre 2006. Sujet : Estimation non-paramétrique de données censurées dans un cadre multi-états.Mémoires de M2.– Co-encadrement (2012) du mémoire de Weidong Hua avec Etienne Roquain (LPMA-UPMC) : Quellesméthodes pour la sélection de variables en grande dimension dans le modèle linéaire ?– Co-encadrement (2011) du mémoire de Sarah Lemler avec Marie-Luce Taupin (UEVE) : Modèle de Coxen grande dimension.TER.– Encadrement (2012) du mémoire de Damien Fontanes (M1 Maths UPMC) : Modèles paramétriquespour les données de comptages, application aux données ”count RNA-Seq”.– Encadrement (2010) du mémoire de Siegfried Fotso (M1 Maths UPMC) : Bootstrap pour la régressionlinéaire.– Encadrement (2009) du mémoire de Noury Sin (M1 Maths UPMC) : Statistique dans le diagramme deLexis.

EnseignementsIntitulé Type Public Volume v PériodeSimulations avec R (*) Cours ISUP CS1 a 30 2005-2012Modèle linéaire sous SAS (*) Cours/TP ISUP CS2 b 18 2011-2012Introduction à la Statistique (*) Cours M1 Maths 30 2010-2012Bootstrap et applications (*) Cours/TP ISUP CS2 b 30 2005-2012Bootstrap et applications Cours/TP M2 Stat. 30 2005-2012Concours GE2 I.O. e BCPST 18 2011-2012Stages Admin. c M2 Stat. 10 2008-2011Statistique Mathématique TD en FOAD d M1 Maths 10 2007-2010Processus et simulations TD L3 Maths 24 2009-2010Statistique Mathématique TD M1 Maths 10 2007-2009Analyse des durées de vie Cours M2 Stat. 36 2005-2009Probabilités TD ISUP CS1 a 50 2005-2007Statistique avec R TP ISUP CS1 a 24 2005-2006Séries temporelles TD M1 Maths 36 2005-2006Statistique Cours M2 Phys. 36 2005-2006Mathématiques générales TD IUT Sceaux Univ. Paris 11 192 2004-2005Mathématiques générales I.O. e ECS1,ECE1,ECE2 100 2001-2005Analyse des durées de vie Cours DESS Stat Univ. Rennes 2. 18 2003-2004Contrôle de la qualité Cours DESS Stat Univ. Rennes 2. 18 2003-2004Statistique inférentielle TD ENSAI 1A 30 2002-2004Analyse des durées de vie TD/TP ENSAI 2A 10 2003-2004Mesure et probabilités TD ENSAI 1A 30 2001-2003Séries temporelles TD ENSAI 1A 30 2001-2003a ISUP CS1 = L3 Mathsb ISUP CS2 = M1 Mathsc Administrationd FOAD = Formation à distancee I.O. = interrogations oralesv en HETD par an(*) Voir description ci-dessousExposés et séjours de rechercheConférences.– Nordic conference on Mathematical Statistics. Learning for counting processes. Juin 2010.– Congrès de la SFDS. Estimation non-paramétrique de la densité en présence de biais et de censure.Juin 2006.– European Seminar, Limassol, Cyprus. Estimation with unknown selection bias and censoring. Mai 2006

– European Seminar, Potsdam, Allemagne. Nonparametric density estimation in presence of bias andcensoring. Septembre 2005– Congrès de l’IMS-Bernoulli, Barcelone. Competing risks proportional hazards model under length-bias.Juillet 2004– International Conference on Statistics in Health Science. Incidence cumulative functions under lengthbias.Mai 2004– Congrès de la SFDS, Montpellier. Convergence faible des fonctions d’incidence cumulée. Mai 2004– Congrès de la SFDS, Lyon. Estimation dans un modèle à risques proportionnels pour durées de vie enconcurrence sous biais de longueur. Juin 2003Séminaires.– Séminaire AgroParisTech. Lasso pour des données censurées : le modèle des risques additifs. Mai 2011.– Séminaire Lille 1. Lasso pour des données censurées : le modèle des risques additifs. Janvier 2011.– Séminaire Reims. Modèles en grande dimension pour les processus de comptage avec covariables. Janvier2011.– Séminaire Orsay. Lasso pour des données censurées : le modèle des risques additifs. Mai 2011.– Séminaire Evry. Lasso dans le modèle d’Aalen pour les données de survie. Avril 2011.– Groupe de travail du MAP5. Modèles de survie avec covariables. Novembre 2010.– Nordic conference on Mathematical Statistics. Learning for counting processes. Juin 2010.– Groupe de travail du PMA. Régression adaptative pour des processus de comptage. Décembre 2008.– Les lundis de Saint-Antoine. Statistique pour des durées et applications en cancérologie. Novembre 2008.– Séminaire parisien de Statistique. Estimation adaptative pour des processus de comptage. Novembre2008.– Université de Nantes. Estimation adaptative de l’intensité conditionnelle de processus de comptagedépendant de covariables. Octobre 2008.– Journées MAS, Rennes. Estimation adaptative de l’intensité de processus de comptage marqués. Août2008.– Université de Franche Comté. Estimation adaptative de l’intensité de processus de comptage marqués.Mars 2008.– Université de Vigo, Espagne. Non-parametric estimation for censored lifetimes suffering from selectionbias. Juin 2007.– Séminaire parisien de Statistique. Échantillonnage en analyse des durées de vie et biais de sélection.Novembre 2005.– Université de Compiègne. Échantillonnage en analyse des durées de vie et biais de sélection.Octobre2005.– Université Paris 5. Estimation sous biais de sélection et fonction de poids inconnue. Avril 2005.– Séminaire du LSTA. Comparaison des fonctions d’incidence cumulée sous biais de longueur. Avril 2004.– Congrès des jeunes probabilistes et statisticiens, Aussois. Risques concurrents sous biais de longueur.Avril 2004.– Groupe de travail en Fiabilité (Université de Marne la Vallée). Convergence faible des fonctions d’incidencecumulée. Février 2004.– Séminaire de Processus Stochastiques (Université de Rennes 1). Convergence faible des fonctions d’incidencecumulée sous biais de longueur. Janvier 2004.Invitations et stages de recherche.– mai 2007 (une semaine). Université de Vigo (Espagne). Collaboration avec le Prof. J. de Una-Alvarez– avril 2002 (un mois). University of Northern Iowa (USA). Collaboration avec le Prof. S. Kirmani– 2001 (six mois). University of Northern Iowa (USA). Stage de DEA, directeur : Prof. S. Kirmani– 2000 (trois mois). Organisation Mondiale de la Santé, IARC (Lyon). Département d’ÉpidémiologieDescriptive. Stage de 2-ième année de l’ENSAI, directeurs : D.M. Parkin et R. Lambert

PublicationsArticles publiés ou acceptés.[P1] Lambert R., Guilloux A, Oshima A, Pompe-Kirn V, Bray F, Parkin D.M., Ajiki W, Tsukuma H.(2002). Incidence and mortality from stomach cancer in Japan, Slovenia and USA. International Journalof Cancer 97 no.6, 811–8.[P2] Bray F., Guilloux A., Sankila R., Parkin D.M. (2002). Practical implications of imposing a new worldstandard population. Cancer Causes Control 13. no.2, 175–82.[P3] Dauxois J.-Y., Guilloux A. and Kirmani S.N.U.A. (2003) Estimation de la fonction de survie sousbiais de longueur pour des risques concurrents et proportionnels. C. R. Math. Acad. Sci. 337. no. 11,745–748.[P4] Dauxois J.-Y., Guilloux A. and Kirmani S.N.U.A. (2005). Nonparametric estimation from proportionalhazards competing risks data under selection bias. Journal of Nonparametric Statistics 17, no.6, 717–731.[P5] Geffray S. et Guilloux A. (2005). Estimation in a generalized Koziol-Green model. C. R. Math. Acad.Sci. 341 no. 1, 49–52.[P6] Guilloux A. (2006). Estimation sous biais de sélection et avec fonction de poids inconnue. C. R.Math. Acad. Sci. 342 no. 4, 275–278.[P7] Guilloux A. (2007). Non-parametric estimation for censored lifetimes suffering from an unknownselection bias. Mathematical Methods in Statistics 16, no. 3, 202–216[P8] Dauxois J.-Y. et Guilloux A. (2008). Nonparametric inference under competing risks and selectionbias sampling. Journal of Multivariate Analysis 99, no. 4, 589–605.[P9] Guilloux A. (2008). Estimation with unknown selection bias and censoring. Statistical models andmethods for biomedical and technical systems, Chap. 23, 213–224, edited by F.Vonta, M. Nikulin, N.Limnios and C. Huber, Birkhauser.[P10] Guilloux A. et Saint-Pierre P. (2008). Estimateur de la fonction de répartition bivariée avec censureà droite et à gauche. Pub. Inst. Stat. Univ. Paris 1-2, 157–164.[P11] Brunel E., Comte F., Guilloux A. (2008). Adaptive nonparametric strategies for censored lifetimeswith unknown sampling bias. Scandinavian Journal of Statistics 35, 3, 557–576.[P12] El-Bchiri J., Guilloux A., Dartigues P., Loire E., Mercier D., Buhard O., Sobhani I., de la GrangeP., Auboeuf D., Praz F., Fléjou J.F., Duval A. (2008). Nonsense-mediated mRNA decay impacts MSIdrivencarcinogenesis and anti-tumor immunity in colorectal cancers. PLoS ONE. 9 no.3(7) :e2583.[P13] Brunel E., Comte F., Guilloux A. (2010). Nonparametric density estimation in presence of bias andcensoring. Test. 18, no.1, 166-194.[P14] Zaanan A., Cuilliere-Dartigues P. , Parc Y., Louvet C., de Gramont A., Tiret E., Dumont S., GayetB., Validire P., Fléjou J.-F., Guilloux A., Duval A., Praz. F. (2010). Impact of microsatellite instabilityand p53 expression on stage III colon cancer disease-free survival in patients treated by fluorouracil andleucovorin with or without oxaliplatin. Annals of Oncology 21, 772-780.[P15] Comte F., Gaïffas S. et Guilloux A. (2011). Adaptive estimation of the conditional intensity ofmarker-dependent counting processes. Annales de l’IHP, Probability and Statistics 47,1171-1196.[P16] Geffray S. et Guilloux A. (2012) Maximum likelihood estimator for cumulative incidence functionsunder proportionality constraint. A paraître dans Sankhya Serie A.[P17] Gaïffas S. et Guilloux A. (2012). High-dimensional additive hazard models and the Lasso. A paraîtredans Electronic Journal of Statistics.Articles en révision et soumis, prépublications.[P18] Gaïffas S. et Guilloux A. (2010). Learning for marker-dependent counting processes. Soumis.http ://arxiv.org/pdf/0909.5342v1[P19] Bouaziz O., Comte F., et Guilloux A. (2011). Nonparametric estimation of the intensity functionof a recurrent event process. En révision. http ://hal.archives-ouvertes.fr/hal-00599714/fr/[P20] Dauxois J.-Y., Guilloux A., Kirmani, S.N.U.A. (2011). Estimation in a competing risks proportionalhazards model under length-biased sampling with censoring. Soumis.[P21] Brunel E., Comte F., Guilloux A. (2012). Nonparametric estimation for survival data with censoringindicators missing at random. Soumis.