Klinikai mikrobiológiai laboratóriumok Magyarországon (Dr. Füzi ...
Klinikai mikrobiológiai laboratóriumok Magyarországon (Dr. Füzi ...
Klinikai mikrobiológiai laboratóriumok Magyarországon (Dr. Füzi ...
Create successful ePaper yourself
Turn your PDF publications into a flip-book with our unique Google optimized e-Paper software.
<strong>Klinikai</strong> <strong>mikrobiológiai</strong> <strong>laboratóriumok</strong><br />
<strong>Magyarországon</strong><br />
(<strong>Dr</strong>. <strong>Füzi</strong> Miklós)<br />
• Laboratóriumok száma: 76 (jelenleg<br />
hivatalosan nyilvántartott)<br />
• Budapesten müködik: 33<br />
• A <strong>laboratóriumok</strong> valódi száma az ismertnél<br />
magasabb /a pontos szám csak az OEP adatok<br />
alapján lesz megállapítható/<br />
<strong>Klinikai</strong> <strong>mikrobiológiai</strong> <strong>laboratóriumok</strong><br />
besorolása<br />
• Minimum feltételek: 15/2004 ESZCSM rendelet<br />
• Minimális anyagszám: 10.000<br />
• 1.fokozat: - vegyes vizsgálati anyag aerob (anaerob)<br />
tenyésztése<br />
- serológia<br />
- alapvető parazitológiai vizsgálatok<br />
• 2. fokozat: - enterális diagnosztika<br />
- tipizálás<br />
- STD diagnosztika<br />
- TBC diagnosztika<br />
- vírustenyésztés<br />
• 3. fokozat: - molekulárbiológiai vizsgálatok
A hazai klinikai <strong>mikrobiológiai</strong><br />
<strong>laboratóriumok</strong> fokozat szerinti megoszlása<br />
• Fokozat: kórházi <strong>laboratóriumok</strong> túlnyomó többsége<br />
• Fokozat: „kiszervezett” ÁNTSZ <strong>laboratóriumok</strong>;<br />
Korányi TBC és Pulmonológiai Int.<br />
• Fokozat: egyetemek<br />
Országos Epidemiológiai Központ<br />
regionális ÁNTSZ <strong>laboratóriumok</strong><br />
ProDia – Genodia<br />
László Kórház<br />
Nem sorolható be: kizárólag molekulárbiológiai<br />
vizsgálatokat végző <strong>laboratóriumok</strong><br />
A hazai klinikai <strong>mikrobiológiai</strong><br />
<strong>laboratóriumok</strong> felszereltsége<br />
Jól felszerelt <strong>laboratóriumok</strong>:<br />
- 3. fokozatba tartozó <strong>laboratóriumok</strong><br />
- magán <strong>laboratóriumok</strong><br />
Átlagos felszereltség:<br />
- általában a nagyobb kórházi<br />
<strong>laboratóriumok</strong><br />
Gyenge felszereltség:<br />
- általában a kisebb kórházi <strong>laboratóriumok</strong>
Legfontosabb müszerek a klinikai<br />
<strong>mikrobiológiai</strong> laboratóriumban<br />
• Széndioxid termosztát /hiányában számos fontos<br />
kórokozó ritkábban kerül izolálásra/<br />
• Anaerob tenyésztéshez szükséges felszerelés<br />
• Haemocultúra automata<br />
• MIC meghatározáshoz Etest, vagy automata<br />
• Serológiai automata<br />
• Megfelelő informatikai háttér<br />
A budapesti klinikai <strong>mikrobiológiai</strong><br />
<strong>laboratóriumok</strong> felszereltsége<br />
• Laboratóriumok száma: 33<br />
• Jól felszerelt lab.: - Semmelweis Egyetem Mikrob. Int.<br />
- Orsz. Epidemiológiai Központ<br />
- ProDia, Genodia<br />
- László Kórház<br />
- Genoid<br />
- SE Transzplantációs Klinika<br />
• Haemocultura automata müködik: 17 laboratóriumban<br />
• Identifikáló automata müködik: 9 laboratóriumban
Hiányosságok a budapesti klinikai<br />
<strong>mikrobiológiai</strong> <strong>laboratóriumok</strong>ban<br />
• Nincs széndioxid termosztát: 12 laboratórium<br />
• Nem végez anaerob tenyésztést: 7 (?) laboratórium<br />
• Nem megfelelő gyakorisággal végez MIC<br />
meghatározást: ? (a <strong>mikrobiológiai</strong> surveillance-ban<br />
részt nem vevő <strong>laboratóriumok</strong> esetében nem<br />
állapítható meg)<br />
• Nem rendelkezik megfelelő informatikai háttérrel:<br />
5 (?) laboratórium<br />
A molekulárbiológiai vizsgálatok feltételei<br />
• EU ajánlás: 4 helyiség; 3 laminar box<br />
- oldat készítés, negatív kontrol<br />
- pozitív kontrol<br />
- mintaelőkészítés, amplifikáció<br />
- elektroforézis<br />
• Hazai ajánlás: /Orsz. Lab. Int.; Orsz. Pathol. Int.<br />
Módszertani levele: EÜ Közlöny 2001, 26. szám/<br />
3 helyiség<br />
• Mindkét ajánlás: az egyes helyiségek eszközkészletét el<br />
kell különíteni
<strong>Klinikai</strong> <strong>mikrobiológiai</strong> vizsgálatok száma<br />
• A vizsgálatok legnagyobb része bakteriológiai (2004ben<br />
az ÁNTSZ <strong>laboratóriumok</strong> 976.985 bakteriológiai<br />
vizsgálatot végeztek)<br />
• Vírus vizsgálat: ÁNTSZ <strong>laboratóriumok</strong> (2004-ben<br />
311.678 vizsgálat); egyetemek<br />
• Parazitológia: ÁNTSZ <strong>laboratóriumok</strong> (2004-ben<br />
100298)<br />
• STD, TBC: külön-külön hálózatot képeznek; magán<br />
<strong>laboratóriumok</strong>ban<br />
• Legnagyobb probléma: haemocultura vizsgálatok<br />
alacsony száma (ÁNTSZ lab. 2004: 43.180)<br />
A klinikai <strong>mikrobiológiai</strong> <strong>laboratóriumok</strong><br />
tevékenységének ellenőrzése (1)<br />
Szakfelügyelet<br />
- Országos Szakfelügyeleti Módszertani Központ<br />
(OSZMK)<br />
- regionális szakfelügyelő főorvosok<br />
Jártassági körkísérletek<br />
- Országos Epidemiológiai Központ<br />
- QualiCont<br />
- NEQAS (National External Quality Assurance System)
A klinikai <strong>mikrobiológiai</strong> <strong>laboratóriumok</strong><br />
tevékenységének ellenőrzése (2)<br />
• Évi jelentések (OEK; szakfelügyelet)<br />
• Mikrobiológiai surveillance:<br />
- 29 laboratórium vesz részt (hazai vizsgálatok<br />
60-70%-a)<br />
- havonta elküldik valamennyi pozitív<br />
tenyésztési eredményüket az OEK<br />
bakteriológiai osztályának<br />
Mikrobiológiai surveillance<br />
• Adatgyüjtés célja:<br />
- fontos kórokozók előfordulásának nyomon követése<br />
- antibiotikum rezisztencia változásának monitorozása<br />
(egyes adatok továbbítása az EU surveillance-nak)<br />
- a <strong>laboratóriumok</strong> által elkövetett hibák felismerése,<br />
korrigálása<br />
• Feedback:<br />
- Mikrobiológiai Körlevél (negyedévenként)<br />
- OEK tudományos ülések<br />
- OEK honlap (www.oek.hu)
Mikrobiológiai surveillance<br />
Jelentősebb hibák, amelyeket a résztvevő<br />
<strong>laboratóriumok</strong>ban sikerült korrigálni:<br />
- MRSA törzsek beta-laktám érzékenységének kiadása<br />
- enterococcusok cephalosporin rezisztenciája<br />
aminoglikozid érzékenysége<br />
ampicillin érzékenysége<br />
- S. pneumoniae penicillin érzékenységének vizsgálata<br />
- ESBL termelés kimutatása, eredménykiadás<br />
- klebsiella és enterobacter törzsek elkülönítése<br />
Mikrobiológiai Surveillance<br />
A beküldött adatok alapján a legsúlyosabb<br />
problémák:<br />
- antibiotikum rezisztencia meghatározása<br />
- eredménykiadás<br />
Kiemelkedő fontosságú: MIC<br />
meghatározás (a klinikus számára<br />
nagyon fontos információ)
Minimális gátló koncentráció: MIC<br />
Az antibiotikum legkisebb mennyisége, amely 1 ml<br />
térfogatban gátolja egy bizonyos baktérium törzs<br />
szaporodását.<br />
Minimális baktericid koncentráció: MBC (Bakteriosztatikus hatású<br />
szerek esetében van jelentősége)<br />
MIC meghatározás:<br />
- E-test<br />
- agarhigítás<br />
- MH bouillon higítás<br />
- félautomata, automata rendszerek<br />
NCCLS - CLSI<br />
„Breakpoint”<br />
ATCC kontrol törzsek<br />
Breakpoint meghatározás<br />
CmaxΣxs Breakpoint MIC=<br />
t x e<br />
Cmax : az antibiotikumnak a vérben elért csúcskoncentrációja<br />
(általában a szer beadása után 1 órával)<br />
Σ: a fehérjekötődés mértékét megadó faktor (1-0,2)<br />
t: a fertőzési időt kifejező faktor (2-0,5)<br />
e: faktor, amely megadja, hogy a Cmax hányszorosa legyen a MIC-nek<br />
(általában 4-szeres)<br />
s: szorzószám, amely a vizsgált baktérium poziciójának MIC eloszlásától<br />
függ. Ez a szorzószám lehet 1, >1, vagy
Antibiotic<br />
Penicillin G<br />
Ceftriaxone /<br />
Cefotaxime<br />
Ciprofloxacin<br />
Erythromycin<br />
Antibicrobial susceptibility testing breakpoints for<br />
Streptococcus pneumoniae used in EARSS<br />
S ≤<br />
0,06<br />
0,06<br />
0,12<br />
0,12<br />
0,5<br />
0,5<br />
1<br />
4<br />
0,12<br />
0,25<br />
1<br />
0,25<br />
0,5<br />
0,5<br />
1<br />
1<br />
R ≥<br />
-<br />
2<br />
2<br />
2<br />
2<br />
4<br />
2<br />
32<br />
4<br />
4<br />
4<br />
1<br />
1<br />
2<br />
4<br />
8<br />
National<br />
breakpoint<br />
committees<br />
NCCLS<br />
Mensura, CA-SFM<br />
SRGA, BSAC, CRG<br />
DIN<br />
SRGA<br />
NCCLS<br />
CA-SFM<br />
BSAC<br />
CRG, DIN<br />
SRGA<br />
NWGA<br />
CRG, DIN,<br />
MENSURA<br />
NCCLS<br />
BSAC, SRGA<br />
MENSURA<br />
CRG, NWGA<br />
DIN, CA-SFM<br />
Range of breakpoints<br />
S ≤<br />
0,06 – 0,12<br />
0,12 - 4<br />
0,12 - 1<br />
0,25 - 1<br />
R ≥<br />
2<br />
2 - 32<br />
MRSA előfordulása S. aureus törzsek között<br />
invazív mintákban <strong>Magyarországon</strong> 2001-2005<br />
(OEK – EARSS)<br />
2001 2002 2003 2004 2005 I. félév<br />
MRSA<br />
aránya 4.7 9.0 14.9 16.7 19.4<br />
(%)<br />
4<br />
1 - 8
Ceftazidim és cefotaxim rezisztencia alakulása<br />
<strong>Magyarországon</strong> invazív mintából izolált Klebsiella<br />
pnemoniae törzsek között (Mikrobiológiai Surveillance)<br />
2004 2005 I. félév<br />
Ceftazidim 14.4% 32.2%<br />
Cefotaxim 17.5% 29.3%<br />
Elektronikus eredmény kiadás<br />
Alapvető követelmény kell legyen.<br />
Optimális formája: biztonságos on-line<br />
kapcsolat<br />
Email: védett kellene legyen; ha nem<br />
oldható meg, szelektív elektronikus<br />
eredményközlés (?)
Orvosi <strong>mikrobiológiai</strong> <strong>laboratóriumok</strong><br />
száma<br />
Magyarország: 90-100<br />
Hollandia: 20<br />
Németország: 75<br />
Svédország: 25<br />
Belgium: kb. 100<br />
Általában összefüggés van a <strong>laboratóriumok</strong> mérete és<br />
munkájának minősége között<br />
A nagy mintaszámmal dolgozó<br />
<strong>mikrobiológiai</strong> <strong>laboratóriumok</strong> előnyei<br />
• széles vizsgálati spektrum<br />
• nagyteljesítményü gépek; modern felszerelés<br />
• gyorsabb eredmény kiadás<br />
• minden területnek külön szakembere van<br />
• eredményeit több intézmény hasznosítja; jobban kell<br />
ügyeljen a minőségre<br />
• képes hétvégeken, ünnepnapokon ügyeletet adni<br />
Hátrány: hosszabb szállítás
Minőségbiztosítási rendszerek (1)<br />
ISO: a müködés formáját vizsgálja<br />
Akkreditáció: a tevékenység minőségét<br />
szakmailag is vizsgálja<br />
Magyaországon: Nemzeti Akkreditációs<br />
Testület (NAT)<br />
Referencia <strong>laboratóriumok</strong> (1)<br />
• Enterális kórokozók<br />
• Campylobacter<br />
• Veszélyes kórokozók<br />
• Anaerob kórokozók<br />
• Methicillin-rezisztens<br />
Staphylococcus aureus<br />
• Szélesspektrumú<br />
ß-laktamáz term. kórok.<br />
• Chlamydia<br />
• Legionella<br />
• Helicobacter pylori<br />
OEK<br />
ÁNTSZ Csongrád m. Intézet<br />
OEK<br />
SzTE ÁOK KMDI<br />
OEK<br />
OEK<br />
SzTE ÁOK KMDI<br />
OEK<br />
ÁNTSZ Labor. Kft Fejér<br />
megye
Referencia <strong>laboratóriumok</strong> (2)<br />
• Gastroenterális vírusok<br />
• HIV<br />
• Influenza és légúti vírus<br />
• Enterovírusok<br />
• Hepatitis vírusok<br />
• Kiütéses vírusbetegségek<br />
• Virális zoonozisok<br />
• Humán papillomavírus<br />
• Hazánkban nem<br />
endémiás mikózisok<br />
• Parazitózisok<br />
ÁNTSZ Baranya m. Intézet<br />
OEK<br />
OEK<br />
OEK<br />
OEK<br />
OEK<br />
OEK<br />
DEOEC<br />
OEK<br />
OEK<br />
A <strong>mikrobiológiai</strong> <strong>laboratóriumok</strong><br />
biztonsági besorolása (CDC)<br />
• BSL 1 (Biosafety 1): rutin <strong>mikrobiológiai</strong><br />
laboratóriumnak felel meg<br />
• BSL 2: laminar box-szal is rendelkezik<br />
• BSL 3; BSL 4: építészetileg, valamint a<br />
védőruházatot illetően alapvetően<br />
különböznek a BSL 1 és 2-től
A BSL 3 laboratórium fontosabb jellemzői<br />
• a laboratóriumot az épület többi részétől elzártan<br />
kell kialakítani<br />
• bejutás zsilipen keresztül védőruha, cipő váltással (kettős<br />
önmüködően záródó ajtó kötelező)<br />
• a felületek résmentesek kell legyenek; álljanak<br />
ellen a fertőtlenítőszereknek<br />
• az eszközök sterilizálását a laboratóriumon belül kell megoldani;<br />
légmentesen zárt csomagban elszállítani<br />
• a légáramlás szabályozott: a levegő a tiszta helyiségek felől a<br />
szennyezettek irányába áramlik<br />
• az elszívott levegő csak HEPA filteren keresztül juthat ki<br />
A BSL 4 laboratórium fontosabb jellemzői<br />
• a személyzet be- és kilépése kizárólag zuhanyozón keresztül<br />
történik (kijövetelkor fertőtlenítő zuhanyozás kötelező; a használt<br />
ruhát külön helyiségben autoklávban kell dekontaminálni)<br />
• eszközök bejuttatása: minden használat után fertőtlenített zsilipen<br />
keresztül<br />
• eszközök kijuttatása: kizárólag átadó autoklávon keresztül<br />
• védőruházat: túlnyomásos szkafander<br />
• kizárólag a 3. osztályba (Class III) tartozó laminár boxok<br />
használhatók<br />
• mind a bejutó, mind a távozó levegő HEPA filteren keresztül<br />
áramlik
A mikróbák biztonsági fokozat szerenti<br />
besorolása (CDC)<br />
• BS 1: minden mikróba, amely nem egyértelmüen (”consistently”)<br />
veszélyes egészséges emberre<br />
• BS 2: obligát human pathogének (Neisseria meningitidis; Brucella<br />
abortus; Mycobacterium tuberculosis; E. coli O157, HBV, HCV,<br />
HIV stb..)<br />
• BS 3: - valamennyi BS 2 pathogén, amennyiben aerosol képződése<br />
várható (Mycobacterium tuberculosis!);<br />
- Bacillus anthracis spora;<br />
- legveszélyesebb gombafajok (Histoplasma capsulatum,<br />
Coccidioides immitis stb..),<br />
- egyes vírusok (West Nile, kullancsencephal., vírus, stb..);<br />
• BS 4: legveszélyesebb vírusok (Ebola vírus, Marburg vírus, Lassa<br />
vírus, poliovírus stb..)<br />
A laminar air flow rendszerek fontosabb<br />
típusai (CDC)<br />
Légáramlás Minta védelem BSL<br />
Class I: elől nyitott; a levegő elölről nincs 2,3<br />
hátra, vagy felfelé áramlik;<br />
kivezetésnél HEPA filter<br />
Class II: - a levegő különböző mértékben van 2,3<br />
recirkulál HEPA filteren<br />
keresztül<br />
- egyes típusoknál levegő elvezető<br />
és csökkentett nyomás<br />
Class III: mind a bejövő, mind a távozó van 4<br />
levegő kettős HEPA filteren<br />
keresztül megy
BSL 3 és BSL 4 <strong>mikrobiológiai</strong><br />
<strong>laboratóriumok</strong> <strong>Magyarországon</strong><br />
• BSL 3: - Országos Epidemiológiai Központ<br />
- ELTE Mikrobiológiai Tanszék<br />
- Országos Állategészségügyi<br />
Intézet<br />
- ÁNTSZ Borsod m.-i Intézet<br />
• BSL 4: Országos Epidemiológiai Központ