Locandina - Medicina e Chirurgia

Corso di Perfezionamento inBIOINFORMATICA APPLICATAALL’EVOLUZIONE MOLECOLARE EFILOGENESI DEGLI AGENTI INFETTIVICoordinatore: Prof. Massimo GalliMilano, 13-17 giugno 2011Dipartimento di Scienze Cliniche L. SaccoObiettivo: Il Corso si propone l’obiettivo di preparare i discenti alla conoscenza delle basistatistiche e matematiche e all’impiego delle tecniche bioinformatiche di base per l’analisifilogenetica applicata allo studio dell’epidemiologia molecolare e dell’evoluzione molecolare degliagenti causa di infezione.A chi è rivolto? Destinatari del Corso sono i laureati in materie scientifiche che operano ointendono operare nel campo della salute umana o animale, in ambiente pubblico o privato,interessati alla conoscenza e alla applicazione dell’analisi filogenetica allo studiodell’epidemiologia (ad esempio: ricostruzione di genotipi e sottotipi, riconoscimento dell’origine diepidemie), prevenzione (studio dei mutanti “escape”, studio di epitopi microbici), diagnosi(identificazione di varianti specifiche patogene) e trattamento (identificazione di mutanti resistentiai farmaci) delle malattie infettive.Il numero massimo di iscritti è di 20 persone.Titolo di studio richiesto: il corso è aperto a tutti coloro che sono in possesso di Laurea indiscipline biologiche, biotecnologiche, agrarie, per l’ambiente e la natura, zootecniche e Laureaspecialistica in medicina, veterinaria, farmacia (vedere il bando).Sede del corso: POLO DIDATTICO DI VIALBA (aula didattica 4 e aula computer A) -DIPARTIMENTO DI SCIENZE CLINICHE “L.SACCO” , VIA G.B. GRASSI, 74. MILANO.Sito Internet: Informazioni importanti, annunci aggiornati e collegamenti utili relativi al Corsodi Perfezionamento si trovano nel sito “Phylovir” all’indirizzo http://sites.google.com/site/phylovir/Durata: Il corso avrà luogo dal 13 al 17 Giugno 2011 e si articolerà, per un totale di 45 ore, in20 ore di lezioni frontali e 25 ore di esercitazioni pratiche.Prova finale: questionario a risposte multiple

Segreteria scientifica: Chi fosse interessato ad avere ulteriori informazioni sul Corso, puòinviare una e-mail a: Dott. Gianguglielmo Zehender o Dott.ssa Alessia Lai - Dipartimento diScienze Cliniche “L.Sacco” – Sezione di Malattie Infettive - Via G.B. Grassi, 74. 20157 - Milano.TEL: 0250319776; FAX: 0250319768 – e-mail (per informazioni e per l’invio dei CV):gianguglielmo.zehender@unimi.it; alessia.lai@unimi.itPer iscriversi: Le domande di partecipazione dovranno essere presentate esclusivamenteonline compilando l’apposito modulo che sarà disponibile sul sito Internet dell’Ateneo(www.unimi.it) in data da destinarsi. Contestualmente dovrà essere inviato presso la segreteriascientifica dell’evento (Dott. Gianguglielmo Zehender o Dott.ssa Alessia Lai), il Curriculum vitae(CV) e la copia dell’avvenuta iscrizione online.La selezione sarà effettuata sul CV presentato dai candidati. L’elenco degli ammessiconsultabile presso il sito Internet dell’Università.Quota di iscrizione e agevolazioni: La quota di iscrizione è fissata a 500 €. Per ulterioriinformazioni contattare la Segreteria Scientifica.Crediti ECM: è stata inoltrata domanda al Ministero della Salute per consentire ai partecipantil’acquisizione di crediti formativi. Inoltre si ricorda che, secondo le norme vigenti, è esoneratodall’obbligo dell’ECM il Personale Sanitario che frequenta corsi di perfezionamento propridella categoria di appartenenza, per tutto il periodo di formazione (anno di frequenza).Segreteria organizzativa : TMT srl - Divisione Congressi. Via Mecenate 12, 20138Milano. Tel.: 0258012822, FAX.: 0258028245; e-mail: congress@tmtworld.itsarà

- Programma del Corso -Lunedì 13 GiugnoOra9:00-9:15 Benvenuto ai partecipanti eintroduzione al Corso9:15-11:00 Storia evolutiva e sociale dellemalattie infettive11:00-12:30 Pandemia influenzale e vacciniprepandemici12:30-14:00 La variabilità di HIV nellascelta della terapia14:00-15.00 Pausa15:00-17:00 Fondamenti di EvoluzioneMolecolare - Evoluzionemolecolare dei virus17:00-18:00 Interrogazione Banche dati,BLAST (Teoria) e algoritmi diallineamentoDocente/iM. GalliM. GalliA.R. ZanettiM. AndreoniG. Zehender, M. CiccozziM. Ciccozzi, A. Lo PrestiMartedì 14 GiugnoOra9:00-10:30 Modelli statistici in evoluzionemolecolare (calcolo delledistanze)10:30-12:00 Costruzione e analisi di AlberiFilogenetici I: metodi basatisulle distanze12:00-13:00 Studio della diffusione deisottotipi non B di HIV-1:implicazioni patogenetiche,diagnostiche e cliniche13:00-14:00 Pausa14:00-15:00 Sessione Pratica Banche dati eallineamento (Bioedit, NCBI)15:00-18:00 Sessione pratica sullacostruzione alberi basati sulledistanze e sul loro calcolo(Phylip, Mega)Docente/iM. CiccozziG. ZehenderC.BalottaE. Ebranati, A. Lai, A. Lo PrestiE. Ebranati, A. Lai, A. Lo PrestiMercoledì 15 GiugnoOraDocente/i9:30-11:30 Costruzione e analisi di Alberi G. ZehenderFilogenetici II: metodi discreti(massima parsimonia e massimaverosimiglianza, metodiBayesiani)11:30-12:30 Modelli evolutivi: metodi per la M. Ciccozzi, G. Zehenderselezione del modello12:30-13:30 Orologi Molecolari (Teoria) G. Zehender

13:30-14:30 Pausa14:30-16:30 Sessione pratica: selezione delmodello e Maximum likelihood(PAUP)16:30-18:30 Sessione pratica orologimolecolari (TreePuzzle, Paup)E. Ebranati, A. Lai, A. Lo PrestiE. Ebranati, A.Lai, A. Lo PrestiGiovedì 16 GiugnoOra9:00-11:00 Analisi di ricombinazione:bootscanning e splitdecomposition11:00-14:00 Costruzione e analisi di AlberiFilogenetici III: i metodiBayesiani14:00-15:00 Pausa15:00-16:00 Sessione pratica: analisiricombinanti medianteSIMPLOT , SPLITTREE16:00-18:00 Sessione pratica metodiBayesianiDocente/iA. Lai, M. CiccozziG. ZehenderE. Ebranati, A. Lai, A. Lo PrestiE. Ebranati, A. Lai, A. Lo PrestiVenerdì 17 GiugnoOra9:00-12:00 Lettura: “Evoluzione: storia,concetti, conflitti”12:00-13:00 Caratteristiche dell'evoluzioneintra-ospite di HIV-1 env valutateattraverso studi di sequenza efunzione13:00-14:00 Applicazioni della bioinformaticaalla sanità animale14:00-14:30 Chiusura dei lavori,autovalutazione e consegna deicertificati di partecipazioneDocente/iA. SiccardiF. CanducciC. LuzzagoG. Zehender, M. Ciccozzi, M.Galli