Curriculum Vitae - ESA - Escola Superior Agrária Bragança ...

Nome:
Altino Branco Choupina
Curriculum Vitae
Naturalidade:
Serapicos-Bragança- Portugal
Data de Nascimento:
06/11/1961
Nacionalidade:
Portuguesa
Morada:
Escola Superior Agrária de Bragança, Quinta de Santa Apolónia, apartado 172
5300 Bragança, Portugal
Telefone: 351 273 331570 Fax: 351 273 25405
E-mail: albracho@ipb.pt
Área Científica de Interesse:
Biologia Molecular de fungos
Outras Áreas Científicas de Interesse:
Tecnologia enzimática
Formação Académica:
Doutor em Biotecnologia pela Universidade Técnica de Lisboa, 2001
Investigador pela Universidade de Salamanca, 1995
Mestre em Biotecnologia pela Universidade Técnica de Lisboa, 1994
Licenciatura em Biologia e Geologia pela Universidade dos Açores, 1986
Carreira Profissional:
Director da Escola Secundária de Oleiros, 1988
Assistente da Escola Superior Agrária de Bragança, 1989
Professor Adjunto da Escola Superior Agrária de Bragança, 1996
Prémios:
Instituto Politécnico de Bragança, 1990
Actividade pedagógica:
Foi responsável pela leccionação das disciplinas: Biologia, Ecologia e Bioquímica no
Instituto Jean Piaget de 1995 a 2001.
Leccionou na Escola Superior Agrária de Bragança as disciplinas de Biologia,
Bioquímica, Ecologia, Microbiologia e Química.
É, neste momento, Professor responsável pelas disciplinas de Biologia Molecular e
Engenharia Genética da licenciatura em Engenharia Biotecnológica na Escola
Superior Agrária de Bragança.
Participa nos Órgãos de Gestão da ESAB:

Assembleia de Representantes (Vice-Presidente)
Conselho Científico
Conselho Pedagógico
Conselho Consultivo
Comissão de Curso de Engenharia Biotecnológica
Projectos de Investigação em curso:
É responsável e coordenador cientifico do projecto COMBATINTA- Combate à doença
da Tinta do castanheiro e outras culturas regionais por padrões moleculares.-
SP2.P11/02” INTERREG III A.
Projectos de Investigação submetidos à FCT como investigador responsável:
-POCTI/AGR/58316/2004- Diagnóstico e identificação de espécies de Phytophthora por
PCR , clonagem e analise de genes que codificam proteínas na doença da tinta.
- POCTI/BIA-BDE/60090/2004- Bioecologia e genética de Unio pictorum (Bivalvia,
Unionidae) das bacias dos Rios Tua e Sabor (Trás - os - Montes, NE Portugal).
Colaboração com empresas:
-Colaborou com a empresa da indústria de cerveja, Unicer - Bebidas de Portugal,
SGPS, SA, no desenvolvimento de um método de identificação rápida de Lactobacillus
contaminantes do processo de fabrico.
-Colabora ao abrigo de um protocolo, no “Screening” de uma livraria de cDNA de
Trichoderma, com a empresa de biotecnologia NEWBIOTECHNIC,, S.A. (NBT).
Organização de Jornadas e seminários:
“Protecção vegetal por aplicação de Trichoderma”. Maio de 2001, na ESAB.
“Expressão de proteínas heterólogas em leveduras não convencionais”
Junho de 2002, na ESAB.
“Bioinformática aplicada à Agrobiologia” . Janeiro de 2004, na ESAB.
Comissão Organizadora das 11 as Jornadas de Biologia de Leveduras “Professor
Nicolau Van Uden” que decorreram em 29, 30 e 31 de Maio de 2003, na
ESAB.
Orientação de Estágios Profissionais:
Miguel M. Pinto – Desenvolvimento de sondas de ADN para identificação de espécies
de Phytophthora.2002/2003
Cármen Marisa Carvalho- Isolamento e caracterização do gene Ura3 em fungos e
leveduras. 2002/2003
Isabel Fernanda de Oliveira Pinhel -“Identificação de Lactibacillus por Técnicas de
Biologia Molecular ”. 2002/2003
Direcção de Trabalhos de fim de Licenciatura 2002/2003:

Aluno do Curso de Engenharia Biotecnológica, Ricardo Sousa Correia, trabalho
de fim de curso intitulado “ Proteómica de leveduras Industriais- Estudo Proteómico
de Yarrowia lipolytica e Kluyveromyces lactis”.
Aluna do Curso de Engenharia Biotecnológica, Rita Patrícia de Sousa Rodrigues
trabalho de fim de curso intitulado “ Identificação e Caracterização de Proteínas
reguladoras da PP1 em Testículo Humano”.
Aluna do Curso de Engenharia Biotecnológica, Isabel Fernanda de Oliveira Pinhel,
trabalho de fim de curso intitulado “Identificação de Lactibacillus por Técnicas de
Biologia Molecular ”. Estágio financiado pela empresa UNICER-Porto.
Aluna do Curso de Engenharia Biotecnológica, Sílvia Azenheira Calado, trabalho de
fim de curso intitulado “A Genética Molecular na Identificação e no Controlo de
Filiação de Equinos”.
Aluno do Curso de Engenharia Biotecnológica, Narciso Miguel Freitas Ferreira,
trabalho de fim de curso intitulado “ Remodelação da Cromatina em Cândida
albicans. Análise do Transcriptoma” .
ORIENTAÇÃO DE DOUTORAMENTOS
Orienta um trabalho de doutoramento a defender na Universidade de Salamanca-
Espanha, no âmbito da Protecção vegetal e Genómica de Trichoderma
JÚRI DE TESES DE DOUTORAMENTO
Foi membro do júri da tese de doutoramento de Lorena Beatriz Ruiz Pavón, intitulada
“Partícula de reconocimiento de la sinal en Y. lipolytica: Caracterizacion del gene
YISRP72 y analisis del péptido senal”, no dia 6 de Febreiro de 2004 na Universidade
de Salamanca.
Publicações:
Choupina A., Lopes-da-Silva M. F. (1992) - A Importância Alimentar da Castanha.
Revista Portuguesa de Nutrição do Centro de Estudos de Nutrição do Instituto
Nacional de Saúde Dr. Ricardo Jorge. Vol. IV, Nº3, Pág 31-35. Lisboa
Choupina A., Lopes-da-Silva M. F., Beirão-da-Costa M. L. (1993) - Utilização da
Farinha de Castanha na Produção de Extrudidos . Jornadas Ibéricas da Castanha.
Trancoso.
Choupina, A. (1994) - Possibilidade de Utilização de Farinha de Castanha na Produção
de Extrudidos - Avaliação de Modificações Físico-Químicas. Dissertação apresentada
para obtenção do grau de Mestre em Ciência e Tecnologia de Alimentos na
Universidade Técnica de Lisboa. Pág. 1-116. Lisboa.
Choupina, A. (1996) - Expressão de genes
Brotéria genética Nº3:69-74 Lisboa.
-amilase em Saccharomyces cerevisiae.

Choupina A., F. González, M. Morín, F. Burguillo, E. Fermiñan e A. Dominguez. -
Utilización de promotores regulados para a secreción de proteínas hetrólogas en
leveduras no convencionales. II Reunión de la Red Espanola de Leveduras. Madrid.
Domínguez A., Fermiñán E., Sánchez M., González Francisco J., Pérez-Campo
M.F., García S.,Herrero A.B; San Vicente A.,cabello J., Prado M.,Iglesias F.J.,
Choupina A, Burguillo F.J., Fernandez-Lago l., López M.C. (1998).Nonconventional
yeast as host for heterologus protein production. Internatl. Microbiol.
1:131-142.
Choupina A., Lopes-da-Silva M. F., Beirão-da-Costa M. L. (1994) - Extrusion of
Castanea sativa.. Developments in Food Engeneering . Proceedings 6th International
Congress on Engineering and Food. Blackie Academic & Professional, London: 882 -
884.
Choupina A., Lopes-da-Silva, M. F., Beirão-da-Costa, M. L. (1993) - Utilização de
Farinha de Castanha na Produção de Extrudidos. Floresta e Ambiente - Revista de
Divugação Técnica. Nº 23:19-21
Choupina A., F. González M., Morín, F. Burguillo, E. Fermiñan e A. Dominguez.
(1999) The lipase system of Yarrowia lipolytica. Curr. Genet. 35:297.
Domínguez A., García S., Choupina A. (1999) -Utilização en biotecnologia de
Yarrowia lipolytica , una levadura con alta capacidad secretora. III Latin American
Mycological Congress. Venezuela. Livro de actas pág. 88-89
Morín M., Choupina A., Dominguez A. (1999) - Isolation and Characterization of two
Lipases from the Dimorphic Yaest Yarrowia lipolytica. Second Yarrowia lipolytica
International meeting, Spain. Livro de actas pág: 63
Choupina A., F. González, M. Morín, F. Burguillo, e A. Dominguez (2001). –
Characterization of the Yarrowia lipolytica lipase sistem. 21st International Specialized
Symposium on Yeasts (ISSY 2001) “ Biochemistry, Genetics, Biotechnology and
Ecology of Non-conventional Yeasts (NCY)”. Lviv, Ukraine. Act. Pág: 24
Choupina, A. (2001)- Contributo para a caracterização do sistema de lipases de
Yarrowia lipolytica: Isolamento e caracterização do gene YILIP3. Tese de
doutoramento. Universidade Técnica de Lisboa.
Choupina, A. (2001)- Sistema de resposta ao ácido oleico em Saccharomyces
cerevisiae
Brotéria Genética nº 2-3.73-79 Lisboa
Borga, J. Correia, R e Choupina, A. (2001)- Bioinformática: uma lista de recursos
disponíveis. Brotéria Genética nº 1-3:80-92 Lisboa
Gouveia E.M., Coelho V., Correia R.S., Choupina A.B. (2001) Phytophthora
cambivora 5.8S rRNA gene, ITS1 and ITS2. PCA438991 AJ438991
European Molecular Biology Laboratory (EMBL ) and NCBI (National Centre for
Biotechnology Information) Databases

Pinto M.M., Afonso F.M.M., Correia R.S., Fernandes M.L.M., Choupina
A.B.(2001) Rhodotorula mucilaginosa 26S rRNA gene.
RMU437347,RMU437347AJ437347 European Molecular Biology Laboratory
(EMBL) and NCBI (National Centre for Biotechnology Information) Databases
Afonso F.M.M., Pinto M.S., Correia R.S., Choupina A.B., Fernandes M.L.M.
(2001) Saccharomyces cerevisiae partial 26S rRNA gene. SCE437312 AJ437312
European Molecular Biology Laboratory (EMBL) and NCBI (National Centre for
Biotechnology Information) Databases
Choupina A. (1999) Yarrowia lipolytica lip3 gene for carboxylesterase/lipase type B.
YLI24975, AJ249751 European Molecular Biology Laboratory (EMBL) and NCBI
(National Centre for Biotechnology Information) Databases
Choupina A.B., Borga J.N., Gouveia E. (2001) Phytophthora cinnamomi 5.8S rRNA
gene, internal transcribed spacer 1 (ITS1) and internal transcribed spacer 2 (ITS2).
PCI421265 AJ421265
European Molecular Biology Laboratory (EMBL) and NCBI (National Centre for
Biotechnology Information) Databases
Matías Morín, Francisco J. Gonzalez, Altino Choupina, F Burguillo and A.
Domínguez (2002) Lipase assay in Yarrowia lipolytica
Chapter in the book
“Lab manual on Non-conventional yeast. Genetics, Biochemistry, Molecular Biology
and Biotechnology”. Springer Company (berlin-Heilderberg-new York).
Calhelha, R.; Marques, J.; Estevinho, I.; Barbosa, S.; Choupina, A. e Estevinho, L.
(2003). Estudo do comportamento de leveduras isoladas do mel. 11 as Jornadas de
Biologia de Leveduras “Professor Nicolau Van Uden” . livro de actas pg. 24-A.
Carvalho, C. M.; Pinhel, I; Rocha, A .; Estevinho, L. e Choupina, A. (2003).
Bioquimical and Molecular Classification of Yeast Strains of Trás-os-Montes Honey.
Congresso Nacional de Microbiologia.Tomar.
Afonso,F.M.M., Estevinho,M.M.F., Pinto,M.M.S. and Choupina,A.(2003).
Uncultured saccharomycete partial 26S rRNA gene. ACCESSION AJ550988.
AJ249751 European Molecular Biology Laboratory (EMBL) and NCBI (National
Centre for Biotechnology Information) Databases.
Choupina,A., Pinto,M.A.M.S., Fernandes,M. and Pinhel,I.(2003. Filobasidiella
neoformans partial 26S rRNA gene, from honey.
ACCESSION AJ550544 European Molecular Biology Laboratory (EMBL) and NCBI
(National Centre for Biotechnology Information) Databases.
Pinto,M.A.M.S.,Estevinho,M.L.M.,Choupina,A.B.and
Afonso,F.M.M.(2003)Cryptococcus humicola partial 26S rRNA gene.
ACCESSION AJ555161 European Molecular Biology Laboratory (EMBL) and NCBI
(National Centre for Biotechnology Information) Databases.

Estevinho,M.M.F., Choupina,A., Pinto,M.M.S. and Carvalho,M.
(2003)Schizosaccharomyces pombe partial 26S rRNA gene, from honey. ACCESSION
AJ550639 European Molecular Biology Laboratory (EMBL) and NCBI (National
Centre for Biotechnology Information) Databases.
Pinto,M.M.S., Afonso,F.M.M., Choupina,A. and Estevinho,M.M.F. (2003.
Candida magnoliae partial 26S rRNA gene. ACCESSION AJ550624 European
Molecular Biology Laboratory (EMBL) and NCBI (National Centre for Biotechnology
Information) Databases.
Foi bolseiro do governo Espanhol
Foi bolseiro das medidas Praxis XXI
Foi bolseiro das medidas Prodep
É membro da Sociedade Portuguesa de Genética