En bioinformatisk genjakt I - Nationellt resurscentrum för biologi och ...
En bioinformatisk genjakt I - Nationellt resurscentrum för biologi och ...
En bioinformatisk genjakt I - Nationellt resurscentrum för biologi och ...
Create successful ePaper yourself
Turn your PDF publications into a flip-book with our unique Google optimized e-Paper software.
Studera en av kromosomerna närmare<br />
Klicka på bilden på kromosom 1 <strong>och</strong> välj Chromosome summary i den lilla rutan som visar sig i<br />
anslutning till kromosomen. Du får nu upp en <strong>för</strong>storad bild över kromosomen med en mängd<br />
ny information.<br />
<strong>En</strong> bild av kromosomen finns längst till vänster. Bilden visar bandningsmönster <strong>och</strong> positioner.<br />
Därefter följer kolumnen Genes – Known genes. Kolumnen visar gene density = “gentäthet”, det<br />
vill säga hur många gener det finns i varje region (Kom ihåg att det är bara små delar av genomet<br />
som innehåller gener). Den röda delen visar <strong>för</strong>hållandet mellan antalet kända <strong>och</strong> <strong>för</strong>utsagda<br />
gener. Notera att det finns områden med många gener <strong>och</strong> områden nästan utan.<br />
Nästa kolumn visar procenandelen repeterade sekvenser <strong>och</strong> den röda kurvan procentandelen<br />
av kvävebaserna G <strong>och</strong> C (GC).<br />
Den blå kolumnen visar hur stor variation det är av nukleotider i de olika regionerna, dvs.<br />
Single Nucleotide Polymorphism<br />
(SNPs är t.ex. viktiga<br />
markörer <strong>för</strong> att identifiera<br />
sjukdomsanlag).<br />
Nedan<strong>för</strong> figuren kan du hitta<br />
annan information om den<br />
här kromosomen. Det finns<br />
till exempel 2,013 “Known<br />
Proteincoding Genes”, <strong>och</strong><br />
21 ”Novel Protein-Coding<br />
genes”, på kromosom 1.<br />
Nu går vi vidare <strong>och</strong> jäm<strong>för</strong><br />
den här kromosomen med<br />
andra djurs kromosomer.<br />
Var finns samma genetiska<br />
innehåll hos andra djur?
Change language