Gene set enrichment
Gene set enrichment
Gene set enrichment
Create successful ePaper yourself
Turn your PDF publications into a flip-book with our unique Google optimized e-Paper software.
Testowanie grupowe<strong>Gene</strong> <strong>set</strong> <strong>enrichment</strong>• Sposób: sprawdzenie znaczenia biologicznego dla listy interesującychgenów poprzez analizę nadreprezentacji• Krok 1: analiza pojedynczych genów (np. różnicowa ekspresja)Krok 2: Ocena grupy genów poprzez wzbogacenie (zawsze wporównaniu do wszystkich genów)• Cel: Znaleźć grupy genów, które się składają z wielu interesującychgenów• Fisher-test, GSEAPodejście holistyczne• Sposób: Patrzenie bezpośrednio na grupy genów i pytanie czy sąznaczące biologicznie pod względem różnicowej ekspresji• Globalna analiza różnicowej ekspresji dla grupy genów (bez brania jakoreferencji wszystkich genów)• Cel: Znalezienie grupy genów które zawierają przynajmniej jedeninteresujący gen, lub wiele genów o umiarkowanej różnorodności• Kategoria, globaltest, GlobalAncova
Change language