17.07.2013 Views

Anaerobe bakterier, isolation og identifiaktion

Anaerobe bakterier, isolation og identifiaktion

Anaerobe bakterier, isolation og identifiaktion

SHOW MORE
SHOW LESS

You also want an ePaper? Increase the reach of your titles

YUMPU automatically turns print PDFs into web optimized ePapers that Google loves.

Anaerob dyrkning <strong>og</strong> identifikation. Tage Justesen<br />

ANAEROBE<br />

BAKTERIER<br />

ISOLATION OG IDENTIFIKATION<br />

I DET KLINISK MIKROBIOLOGISKE LABORATORIUM<br />

Tage Justesen, nov. 2002<br />

19-06-03 T. Justesen 1


Anaerob dyrkning <strong>og</strong> identifikation. Tage Justesen<br />

Indledning<br />

Identifikationsskemaerne omfatter anaerobe bakteriearter af human oprindelse eller af betydning<br />

for sygdom hos mennesker. Bakterier af animalsk <strong>og</strong> anden oprindelse er kun sporadisk nævnt.<br />

De fleste arter, som isoleres i det klinisk mikrobiol<strong>og</strong>iske laboratorium, stammer oprindeligt fra<br />

et eller flere af menneskets normalfloraområder: Mundhule, Tarmkanal, Vagina <strong>og</strong> Hud, <strong>og</strong> det<br />

overvejende antal er apat<strong>og</strong>ene eller lavpat<strong>og</strong>ene opportunister.<br />

Det er vigtigt, at et bakteriefund ses i sammenhæng med den kliniske tilstand, når fundets<br />

betydning skal vurderes. I det følgende er nævnt faktorer af betydning for valg af<br />

identifikationsniveau i det daglige arbejde.<br />

Fund af anaerobe <strong>bakterier</strong> i præsterile områder som blod, spinalvæske, ledvæske, pleuraexsudat<br />

etc.er altid betydningsfulde. Renkulturer fra infektiøse processer er næsten altid betydningsfulde<br />

<strong>og</strong> dominerende arter i blandingsflora ligeledes.<br />

Prøver med blandingsflora fra steder med kommunikation til normalfloraområderne må<br />

imidlertid altid vurderes kritisk.<br />

De hyppigst isolerede arter i relevant prøvemateriale er Bacteroides, Prevotella, Fusobacterium,<br />

Peptostreptococcus <strong>og</strong> Clostridium arter.<br />

N<strong>og</strong>le anaerobe <strong>bakterier</strong> giver anledning til særlige sygdomsbilleder.<br />

Visse Actinomycesarter samt Propionibacterium propionicum (tidl. Arachnia) kan forårsage<br />

actinomycose. Blandt Clostridierne giver n<strong>og</strong>le af de toxin<strong>og</strong>ene arter, hyppigst C. perfringens,<br />

anledning til nekrotiserende infektioner (gasgangræn o.l.) <strong>og</strong> toxindannende C. difficile stammer<br />

kan undertiden medføre pseudomembranøs enterocolitis. Disse <strong>og</strong> andre clostridier isoleres d<strong>og</strong><br />

oftest fra andre prøvetyper,hyppigt i blandinger, hvor de ikke kan tillægges n<strong>og</strong>en specifik<br />

betydning. C. tetani <strong>og</strong> C.botulinum er årsager til karakteristiske kliniske sygdomsbilleder, men<br />

isoleres næsten aldrig fra klinisk prøvemateriale.<br />

F. necrophorum forårsager nekrobacillose eller postanginøs sepsis <strong>og</strong> findes her i<br />

bloddyrkninger. Propionibacterium acnes er et eksempel på en hyppigt forekommende<br />

forurening fra huden i bloddyrkninger <strong>og</strong> bør derfor kunne genkendes med sikkerhed.<br />

Definitiv identifikation af anaerobe isolater er langt fra altid mulig, dels fordi fænotypiske træk<br />

ikke er tilstrækkelig diskriminerende <strong>og</strong> dels fordi endnu ikke beskrevne arter kan dukke op.<br />

N<strong>og</strong>le af de lige nævnte arter er forholdsvis let genkendelige <strong>og</strong> Bacteroides, Prevotella,<br />

Fusobacterium <strong>og</strong> de mikroaerofile anaerobe gram negative stave bør kunne adskilles på<br />

slægtsniveau <strong>og</strong> i visse tilfælde artsbestemmes. Hos visse arter er det mikroskopiske billede<br />

næsten diagnostisk f.eks. F. nucleatum, Leptotrichia buccalis, C. perfringens <strong>og</strong> C.<br />

clostridioforme.<br />

Nærværende manual består af et afsnit om metoder, medier <strong>og</strong> procedurer samt en samling<br />

identifikationsskemaer bestående parvis af en dikrotom nøgle <strong>og</strong> et “endeligt”<br />

identifikationsskema.<br />

19-06-03 T. Justesen 2


Anaerob dyrkning <strong>og</strong> identifikation. Tage Justesen<br />

Langt den overvejende del af betydningsfulde anaerobe isolater til hører gruppen af moderat<br />

anaerobe eller aerotolerant anaerobe <strong>bakterier</strong> (se næste side).<br />

19-06-03 T. Justesen 3


Anaerob dyrkning <strong>og</strong> identifikation. Tage Justesen<br />

Mikroorganismers forhold til ILT.<br />

1) Vækstbetingelser til rådighed i laboratoriet (det fysiske<br />

miljø):<br />

Anaerobt : iltfrit<br />

Aerobt : Ilt i atmosfærisk koncentration<br />

Mikroaerobt ell. mikroaerofilt : Ilt i subatmosfærisk koncentration (~ 5%)<br />

CO2 atmosfære : Ca. 10% CO2 i atmosfærisk luft.<br />

2) Mikroorganismernes stofskifte (det genotypiske):<br />

Anaerob organisme: Kan ikke udnytte ilt til vækst <strong>og</strong> formering, men får energi ved<br />

fermentering. Væksten er maximal under iltfri forhold.<br />

Fakultativ anaerob organisme: Kræver ikke ilt til vækst <strong>og</strong> formering, men kan udnytte ilt selv<br />

i atmosfæriske koncentrationer - har både fermentativt <strong>og</strong> oxydativt potentiale.<br />

Aerob organisme : Kræver ilt til vækst <strong>og</strong> formering - rent oxydativt stofskifte.<br />

Mikroaerofil organisme : Kræver ilt til vækst <strong>og</strong> formering, men tåler ikke ilt i atmosfæriske<br />

koncentrationer (optimum 2 - 10% ilt). Fakultativt mikroaerofile organismer kan <strong>og</strong>så vokse<br />

under iltfri forhold.<br />

3)Mikroorganismens præsentation (det fænotypiske):<br />

Obligat anaerobe: Organismer som kun gror under anaerobe forhold (< 5% ilt), ikke<br />

mikroaerofilt, i CO2-atmosfære eller aerobt. Kan underinddeles i:<br />

Strikt anaerobe : Organismer som kun gror i < 0,5% ilt.<br />

Moderat anaerobe : Organismer som kan gro i op til ca. 5% ilt.<br />

Aerotolerant eller ilttolerant anaerob: Organisme som har anaerobt stofskifte, men som kan<br />

vokse i atmosfæriske iltkoncentrationer (+CO2) (ex. Streptokokker, Lactobaciller, C. tertium)<br />

Mikroaerotolerant: Organisme som vokser bedst anaerobt men kan tolerere en vis mængde ilt<br />

(ca. 5 - 15%) (+CO2).<br />

Fakultativ: Organisme som ikke kræver ilt, men kan udnytte ilt (vokser lige godt med eller uden<br />

ilt).<br />

Obligat aerob: Organisme som kræver > 15% ilt for maximal vækst.<br />

Capnofile: Organismer som kræver eller stimuleres i væksten af kuldioxyd.<br />

Hydr<strong>og</strong>enofile: Organismer som kræver eller stimuleres af hydr<strong>og</strong>en.<br />

19-06-03 T. Justesen 4


Anaerob dyrkning <strong>og</strong> identifikation. Tage Justesen<br />

Opsamling <strong>og</strong> transport af klinisk materiale<br />

Klinikerne må altid opfordres til at tage rigeligt materiale fra til bakteriol<strong>og</strong>isk undersøgelse. Jo<br />

mere materiale desto bedre beskyttelse af alle slags <strong>bakterier</strong>.<br />

De fleste klinisk betydningsfulde anaerobe <strong>bakterier</strong> (<strong>og</strong> andre <strong>bakterier</strong> for den sags skyld) vil<br />

overleve i mange timer i n<strong>og</strong>le få ml pus i et almindeligt tilproppet sterilt prøverør, som<br />

transporteres ved omgivelsestemperatur.<br />

Anvend ikke podepinde hvis pus, væske eller væv kan opsamles da disse materialer kan<br />

anvendes til direkte mikroskopi <strong>og</strong> give umiddelbart brugbare oplysninger om en infektion.<br />

Afkøling øger alt andet lige iltmængden i prøvematerialet, men for praktiske formål vil en<br />

midlertidig opbevaring i køleskab være acceptabel.<br />

Hvis anvendelse af podepind ikke kan undgås skal den transporteres i Stuart’s transportagar,<br />

som kan opbevares køligt inden selve transporten.<br />

Prøvebehandling i laboratoriet bør foregå uden unødig forsinkelse med anvendelsen af egnede<br />

medier <strong>og</strong> udsåede plader skal bringes under anaerobe forhold umiddelbart efter tilsåningen.<br />

<strong>Anaerobe</strong> betingelser kan opnås på forskellige måder. Anaerobkammeret er efterhånden<br />

foretrukket her i landet da den nødvendige gasforsyning kan etabeltres.Lufttætte krukker kan<br />

evakueres med en pumpe <strong>og</strong> efterfyldes med en gasblanding, som regel 80% N2 + 10% H2 +<br />

10% CO2. En katalysator i krukken er nødvendig for at fjerne de sidste rester af ilt.<br />

Forskellige typer af forseglede breve indeholdende kemikalier, som udvikler H2 <strong>og</strong> CO2 eller er<br />

iltabsorberende efter tilsætning af vand, findes, men er betydelig dyrere i længden end de to<br />

førstnævnte metoder. Hertil kommer at anaerobe forhold opnås næsten med det samme med<br />

kammer <strong>og</strong> pumpemetoden medens betydelig længere tid kan forløbe inden de kemiske metoder<br />

er effektive. “Anaer<strong>og</strong>en” fra Oxoid er fundet bedst i en sammenlignende undersøgelse med<br />

adskillige andre fabrikater <strong>og</strong> har den fordel at den ikke kræver vedligeholdelse af en katalysator<br />

(J Clin Microbiol 1996;34:1646).<br />

Agarmedier til anaerob dyrkning.<br />

En chokoladeplade (“laked blood agar”) suppleret med K-vitamin <strong>og</strong> cystein (SSI’s anaerob<br />

plade) anbefales som standardmedium. En almindelig chokoladeplade kan <strong>og</strong>så bruges i langt de<br />

fleste tilfælde.<br />

På anaerobpladen vil de fleste klinisk relevante anaerobe <strong>bakterier</strong> vokse frem efter 1 - 2 dages<br />

inkubering. Chokoladepladetypen understøtter (i modsætning til en blodpladen) udviklingen af<br />

pigment, fluorescens <strong>og</strong> katalaseproduktion. Pladen kan anvendes både som primærplade,<br />

rendyrkningsplade <strong>og</strong> resistensplade.<br />

De hyppigst forekommende Bacteroides <strong>og</strong> Clostridiumarter vil vokse lige så godt på almindelig<br />

5% blodagar, der d<strong>og</strong> ikke kan anbefales som standdardmedium, men som supplement. 10%<br />

blodagarplade er ikke dokumenteret bedre end 5%.<br />

(En diplomopgave som sammenlignede medier fandt 10% blod underlegent i forhold til øvrige<br />

afprøvede medier.)<br />

<strong>Anaerobe</strong> gram positive ikke sporedannende stave stave f.eks. Actinomyces, som ikke har<br />

særlige vækstkrav vokser lige så godt på en 5% blodplade som på en anaerob chokoladeplade.<br />

Undertiden kan kolonierne <strong>og</strong>så være lettere at kende på en blodplade.<br />

19-06-03 T. Justesen 5


Anaerob dyrkning <strong>og</strong> identifikation. Tage Justesen<br />

Primær udsåning af prøvemateriale.<br />

Følgende fremgangsmåde kan anbefales, idet den giver mulighed for hurtigt at se om der er<br />

“ægte” anaerobe <strong>bakterier</strong> tilstede (hæmningszone omkring metronidazoldisken) samtidig med,<br />

at der kommer god separation af kolonier. Omkring kanamycindisken vil mange fakultative<br />

<strong>bakterier</strong> (entero<strong>bakterier</strong>, stafylokokker) hæmmes medens hyppigt forekommende anaerobe<br />

<strong>bakterier</strong> er kanamycinresistente <strong>og</strong> derfor vil blive selekteret i zonen (se envidere under<br />

aflæsning af zonerne).<br />

1) Materialet (en dråbe pus eller podepind) udstryges<br />

i zig-zak på et ca. 2 - 3 cm bredt område<br />

i pladens ene side. Det er en almindelig<br />

fejl, at første strøg tilsås for tæt.<br />

) Med en øsken spredes videre<br />

vinkelret på første strøg til<br />

pladens midtlinje.<br />

3) Øskenen vendes, <strong>og</strong> resten<br />

af pladen tilsås nu vinkelret på<br />

2.strøg så hele pladen udnyttes.<br />

4) En metronidazoldisk på 5 µg<br />

<strong>og</strong> en kanamycindisk på 1000 µg<br />

(1 mg) anbringes som vist på figuren.<br />

Metronidazol<br />

Inkuber ved 35 -37° under anaerobe forhold, sædvanligvis i 2 døgn.<br />

Kanamycin<br />

Figur 1.<br />

Udsåning af prøvemateriale på agarmedie<br />

Primærplader anbefales reinkuberet sammen med rendyrkninger <strong>og</strong> omsåninger, som bør<br />

anbringes anaerobt umiddelbart.<br />

Ved mistanke om anaerob vækst i bloddyrkninger eller f.eks. hvis der kun er vækst i anaerob<br />

kolberne eller hvis særlige morfol<strong>og</strong>iske træk umiddelbart kan ses ved mikroskopi<br />

(kasseformede gram positive stave, sporedannelse, pleomorfe- eller fusiforme gramnegative<br />

stave), bør den anaerobe primærudsåning udvides med:<br />

5% blodplade, EYA-plade, <strong>og</strong> en ekstra anaerobplade med en galde-, vancomycin- <strong>og</strong><br />

colistindisk (se under trin 2 identifikation).<br />

19-06-03 T. Justesen 6


Anaerob dyrkning <strong>og</strong> identifikation. Tage Justesen<br />

Foreløbig identifikation - se algoritme side 6a<br />

Aflæsning på primærpladen, enkelte direkte tests samt mikroskopi er ofte tilstrækkelige til at<br />

stille en klinisk meningsfuld diagnose.<br />

Metronidazolaflæsningen<br />

1) Selektivitet:<br />

Metronidazolfølsomhed = “ægte” anaerob bakteriestamme.<br />

2) Identifikation:<br />

Metronidazolresistens ses hos medlemmer af bakterieslægter, som ikke sædvanligvis regnes for<br />

anaerobe, men som evt. især ved primær<strong>isolation</strong> kun eller overvejende vokser under anaerobe<br />

forhold, som Streptococcus <strong>og</strong> Lactobacillus. Actinomyces <strong>og</strong> Propionibacterium er <strong>og</strong>så<br />

resistente <strong>og</strong> vil sv. hertil vokse i alm. CO2 skab efter n<strong>og</strong>le dages inkubation.<br />

Ægte mikroaerofile <strong>bakterier</strong> varierer i metronidazolfølsomhed.<br />

3) Resistensbestemmelse: Metronidazolfølsomhed (zone ≥ 10 mm sv.t. MIC ≤ 8mg/l) på<br />

primærpladen indikerer at dette stof kan overvejes til behandling.<br />

Kanamycinaflæsningen<br />

Stafylokokker <strong>og</strong> Enterobacteriaceae hæmmes af kanamycin, så zonen kommer til at virke som<br />

selekterende område for de hyppigst forekommende anaerobe gram negative stave: Bacteroides,<br />

Prevotella, Porphyromonas.<br />

Denne Kanamycinresistens er af central betydning for den foreløbige identifikation af<br />

Gram negative stave.<br />

Andre gram negatie stave er meget Kanamycinfølsomme.<br />

Clostridiumarter er <strong>og</strong>så følsomme men ofte med en lidt mindre zone.<br />

De ovennævnte følsomheder for metronidazol <strong>og</strong> kanamycin må ikke mistolkes som<br />

resistens, hvis der i tilfælde med meget stort inoculum forekommer genvækst i zonen<br />

efterhånden som antibiotikakoncentrationen falder centralt pg.a. fortsat diffusion.<br />

Koloni<br />

Beskrives med den sædvanlige terminol<strong>og</strong>i.<br />

Størrelsen af kolonien bør angives evt. som meget lille, små eller store f.eks. e. 2 døgn.<br />

Spredning omkring kolonien <strong>og</strong>/eller sværm noteres.<br />

Farve kan angives (grålig, gullig, grønlig, brunlig, sort, rødlig ect.).<br />

Sort pigmentering er et vigtigt karakteristikum hos medlemmer af Pophyromonas- <strong>og</strong> n<strong>og</strong>le<br />

medlemmer af Prevotellaslægten <strong>og</strong> fremkommer hurtigst <strong>og</strong> tydeligst på chokoladaagar.<br />

En del andre anaerobe <strong>bakterier</strong> vil efter mere end to dages inkubation på anaerob pladen<br />

efterhånden <strong>og</strong>så kunne antage mørke brunlige toner, Actinomyceter er et eksempel herpå.<br />

N<strong>og</strong>le anaerobe <strong>bakterier</strong> giver anledning til dannelsen af en tydelig rødfarvning af<br />

chokoladeagaren omkring kolonierne især efter at pladerne lige er fjernet fra de anaerobe<br />

dyrkningsbetingelser. Dette skyldes formentlig dannelsen af hæmokrom<strong>og</strong>en ved en<br />

reduktionsproces forårsaget af bakterievæksten. Farven fader som regel efter udsættelse for ilt.<br />

Ingen diagnostisk betydning.<br />

19-06-03 T. Justesen 7


Anaerob dyrkning <strong>og</strong> identifikation. Tage Justesen<br />

Små huller i agaren ses hos visse stammer af “B.ureolyticus” <strong>og</strong> Campylobacter spp., såkaldt<br />

"pitting" (pit = grube). Disse arter kan <strong>og</strong>så undertiden lave en lille fin sværm lige omkring<br />

selve kolonien - et slør eller "haze". En positiv oxydasereaktion kan bestyrke mistanken.<br />

Fluorescens<br />

Undersøges bedst i helt mørkelagt rum med en UV-lampe med en bølgelængde på 366 nm.<br />

Prevotella spp. som ikke er pigmenterede fluorescerer ofte rubinrødt. Hvis pigmentering<br />

indtræder ophører fluorescensen i takt hermed !<br />

Bacteroides fragilis gruppen har normalt ikke fluorescens, men lejlighedsvis kan koralrød <strong>og</strong><br />

svag grønligt fluorescens forekomme.<br />

Fusobacterium spp. fluorescerer kraftigt gul-grønt, "chartreuse", ligesom visse<br />

Clostridium spp. bl.a. C. difficile <strong>og</strong> C. innocuum.<br />

Katalase<br />

Udføres efter de samme retningslinjer som for aerobt voksende <strong>bakterier</strong>.<br />

Anaerobpladen fremmer dannelsen af katalaseenzymet (porfyrinrinholdigt) hos de katalase<br />

positive arter (visse "B. fragilis", Propioni<strong>bakterier</strong>, A. viscosus). Undertiden er det nødvendigt<br />

at eksponere kulturen for ilt i ca. en time før reaktionen fremkommer eller tilsætte brintoverilte<br />

direkte til en flydende kultur.<br />

Anaerobpladen kan undertiden være svagt katalase positiv (batchafhængigt, hvis ikke al<br />

enzymaktivitet er varmedestrueret), så undgå at få agar med.<br />

Alle Clostridier er katalase negative i modsætning til Bacillusarter !<br />

Lugt.<br />

Anvend helst en frisk udtaget pladekultur da de flygtige fede syrer efterhånden fordamper.<br />

Lugten af smørsyre er ikke til at tage fejl af <strong>og</strong> f.eks. Cl. perfringens <strong>og</strong> Fusobacterium sp. skal<br />

lugte kraftigt af smørsyre.<br />

B. fragilis gruppens medlemmer lugter ikke af smørsyre, men af en blanding af propionsyre,<br />

isosmørsyre <strong>og</strong> isovalerianesyre, som lugter ubehageligt sødlig-surt.<br />

Behagelig aromatisk lugt som af syrnede mælkeprodukter eller karamel findes især hos<br />

Bifidobacterium spp.<br />

Lugten af "hestestald" (?) skyldes dannelse af paracresol, <strong>og</strong> bruges ofte til at karakterisere C.<br />

difficile, men dannes <strong>og</strong>så af andre Clostridium spp. samt bl.a. “B. ureolyticus”.<br />

Stikkende syrlig lugt af eddikesyre eller propionsyre kan <strong>og</strong>så undertiden tydelig fornemmes hos<br />

Propionibacterium sp.<br />

Mikroskopi af Grampræparat.<br />

Ikke-sporedannende gram positive stave er oftest tydeligt gram positive.<br />

Visse gram-negative kokker (Veillonella spp.) kan være gramvariable især i unge kulturer.<br />

N<strong>og</strong>le clostridier med subterminale sporer danner mange frie sporer, der ses som blåligrøde<br />

ringe med farveløst indhold.<br />

Hovedproblemet ved gramfarvning af anaerobe <strong>bakterier</strong> er at visse Clostridium spp. er<br />

ensartet gram-negative <strong>og</strong> uden synlige sporer. Mobiluncus er <strong>og</strong>så oftest gram negativ<br />

Vancomycinfølsomhed <strong>og</strong> Colistinresistens viser her den gram positive natur af disse<br />

stammer ! (se næste afsnit)<br />

19-06-03 T. Justesen 8


Anaerob dyrkning <strong>og</strong> identifikation. Tage Justesen<br />

Regelmæssige stave har ensartet tykkelse eller form (f. eks. Clostridium, Lactobacillus,<br />

Bacteroides, Fusobacterium ect.) <strong>og</strong> kan være mere eller mindre krumme eller tilspidsede <strong>og</strong><br />

lejret i par- <strong>og</strong> kædedannelse. Længden er varierende. Helhedsbilledet er ofte ensartethed.<br />

Uregelmæssige stave har varierende tykkelse <strong>og</strong> ofte forgreninger, kølleformer, y-former etc.<br />

(Actinomyces, Bifidobacterium, Propionibacterium). Helhedsbilledet er oftest pleomorfi.<br />

Mikroskopi af fugtigt præparat:<br />

Bevægelighed<br />

Bevægelighed ophører ofte indenfor minutter efter udsættelse for ilt <strong>og</strong> afkøling til<br />

stuetemperatur. Bevægelighed bevares længst under midten af dækglasset, hvor iltningen er<br />

mindst ! (Pasteur: "La vie sans air").<br />

Lav evt. flere præparater for bevægelighed fra forskellige kulturer inkl. positive forgæringsglas.<br />

Sporer<br />

Anaerobt voksende sporedannere er identiske men Clostridium sp.<br />

Sporer ses som stærkt lysbrydende legemer med kun en i hver celle, <strong>og</strong> bør kunne skelnes fra<br />

inklusionslegemer (ofte flere i hver celle) <strong>og</strong> "pseudosporer" som ses når <strong>bakterier</strong>ne ligger på<br />

tværs af hinanden eller "vender enden" til beskueren. Sporeformen er ikke diagnostisk men<br />

lejringen er vigtig.<br />

Terminale sporer ses i præparatet kun i den terminale position hos sporebærende <strong>bakterier</strong>.<br />

Bakterier med terminale sporer er slanke stave <strong>og</strong> sporen opsvulmer bakterielegemet.<br />

Subterminale sporer kan ses i alle positioner i bakterielegemet. Bakterier med denne type sporer<br />

er tykke stave <strong>og</strong> sporener på tykkelse med bakterielegemet.<br />

Proteolyse<br />

Kan ses på EYA- <strong>og</strong> anaerobpladen (chokoladeplade) <strong>og</strong> består i en zone af opklaring i agaren<br />

omkring kolonien set i modlys.<br />

Denne reaktion er normalt ensbetydende med at stammen <strong>og</strong>så er gelatinesmelter.<br />

OBS ! Erytrocytter i chokoladeplader er langtfra altid totalthæmolyserede <strong>og</strong> derfor kan en<br />

eventuel "resthæmolyse" forveksles med proteolyse.<br />

Slutbemærkninger.<br />

Algoritmens kriterier skal være opfyldt for at anvende de foreløbige eller tentative<br />

diagnoser anført i kursiv.<br />

19-06-03 T. Justesen 9


Anaerob dyrkning <strong>og</strong> identifikation. Tage Justesen<br />

Identifikation - trin 2 <strong>og</strong> rendyrkning<br />

A) Generelle tests <strong>og</strong> procedurer<br />

Fra renkulturer <strong>og</strong> isolerede enkeltkolonier på primærpladen<br />

Gentag undersøgelser som ikke er faldet klart ud ved primæraflæsningen - rendyrk !<br />

1) Identifikationsdisks med Vancomycin, Colistin <strong>og</strong> galde.<br />

Bør udføres rutinemæssigt<br />

Formål:<br />

1. Foretage primær differentiering indenfor gruppen af Gram negative stave (sammen med<br />

kanamycin- <strong>og</strong> galderesultatet)<br />

2. Endegyldig placering af bakteriestammen som gram negativ eller positiv.<br />

Hyppigste fejltagelse i identifikationsprocessen er rubriceringen af affarvede gram positive<br />

<strong>bakterier</strong> som gram negativ.<br />

Udførelse:<br />

Tilsåning af en agarplade som til resistensbestemmelse - pas på for stort inoculum.<br />

Anbring en disk med VANCOMYCIN 5µg, COLISTIN 10µg <strong>og</strong> ROSCO-tablet "Oxgall" på<br />

pladen <strong>og</strong> inkuber anaerobt.<br />

Aflæsning:<br />

Vancomycin Zone ≥10 mm = FØLSOM, zone < 10mm = R.<br />

Colistin Zone ≥10 mm = FØLSOM, zone < 10mm = R, partiel hæmning = S<br />

Galde Vækst helt ind til tabletten = R, hvilken som helst zone = S<br />

Aflæsningen omkring galdetabletten kræver evt. anvendelse af lup for at se om der er vækst<br />

eller ej helt ind til tabletten, idet den koncentriske galdesyreudfældning omkring tabletten<br />

fejlagtigt kan tolkes som zonedannelse <strong>og</strong> dermed følsomhed.<br />

Tolkning:<br />

Tolkning: se <strong>og</strong>så oversigten side 15.<br />

1) Bacteroidesarterne <strong>og</strong> de fleste Prevotellaarter er colistin R<br />

<strong>og</strong> de er altid vancomycin R (<strong>og</strong> kanamycin R)<br />

2) Ellers gælder om hovedregel at ægte gram negative <strong>bakterier</strong> er Vancomycin R <strong>og</strong><br />

Colistin S <strong>og</strong> ægte gram positive <strong>bakterier</strong> er Vancomycin S <strong>og</strong> Colistin R.<br />

Visse Clostridium sp. <strong>og</strong> Mobiluncus er uniformt gram negative efter almindelig gramfarvning .<br />

C. innocuum <strong>og</strong> visse Lactobacillus sp. kan være vancomycin R, men er næsten altid tydeligt<br />

gram positive.<br />

3) B. fragilis gruppen er galderesistente. Visse sjældnere gram negative stave kan <strong>og</strong>så være det,<br />

men de er kanamycinfølsomme. Galderesistens er et udtryk for naturlig forekomst i tarmen.<br />

Fejlkilder: Diskenes antibiotikaindhold er kritisk - resistensdisks dur ikke !<br />

Tilså thi<strong>og</strong>lucollat, halvflydende- samt serumbouillon.<br />

Det anbefales at der på et tidligt tidspunkt i identifikationsforløbet fremstilles et stik i en<br />

halvflydende agar fra en renkultur af stammen.<br />

Inkuberes under aerobe forhold i 1 - 2 døgn <strong>og</strong> anbringes herefter ved stuetp.<br />

19-06-03 T. Justesen 10


Anaerob dyrkning <strong>og</strong> identifikation. Tage Justesen<br />

Glasset tjener dels til vurdering af vækst i forhold til ilt, evt. luftdannelse <strong>og</strong> som opbevaring for<br />

stammen.<br />

Visse Prevotella spp. <strong>og</strong> Porphyromonas spp. vokser ikke i SSI´s thi<strong>og</strong>lucollatglas.<br />

Væksten af f.eks. Actinomyces spp. er ofte god <strong>og</strong> karakteristisk i serumbouillon med dannelse af<br />

små klumper eller fnug af bakteriehobe langs med glassets indside.<br />

Luftdannelse<br />

Aflæses sædvanligvis i glucoseglassets Durhamrør. Erfaringen viser at SSI’s Halvflydende agar<br />

<strong>og</strong>så retinerer luft i form af små luftbobler (f.eks. hos n<strong>og</strong>le non-sakkarolytiske stammer) i<br />

modsætning til thi<strong>og</strong>lucollat, hvor luftbobler hurtigt forsvinder.<br />

5% blodplade<br />

5% blodplade tilsås. Vigtig ved hurtig konfirmation af diagnosen Fusobacterium necrophorum<br />

som har β-hæmolyse efter et døgns anaerob inkubation.<br />

Grampositive ikke sporedannende metronidazolresistente stave som kan være Actinomyces,<br />

Propionibacterium, Lactobacillus bør udsås på blodplade da kolonien her ofte er karakteristisk.<br />

Indolproduktion - tryptophanasetesten.<br />

Tryptophanbuffer (SSI). Opslemning til synlig uklarhed.<br />

Inkubation i alm. termostat i op til 24 timer.<br />

Udrystning med Xylol eller "Micro-Clear" (ca. ½ ml) før tilsætning af indolreagens.<br />

Positiv = rød.<br />

Ureasetest.<br />

Ureabuffer (SSI). Opslemning til synlig uklarhed.<br />

Aflæsning i op til maximalt 24 timer efter inkubation i alm. termostat.<br />

Positiv = rød.<br />

ONPG.<br />

En β-galactosidase test med ONPG-substrat (SSI). Opslemning til synlig uklarhed.<br />

Aflæsning i op til maximalt 24 timer efter inkubation i alm. termostat.<br />

Anaerob inkubation tilrådes ved tvivl om resultatet.<br />

Positiv = gul.<br />

19-06-03 T. Justesen 11


Anaerob dyrkning <strong>og</strong> identifikation. Tage Justesen<br />

Identifikation - trin 3 - Specielle tests<br />

EYA (Egg Yolk Agar)-plade til påvisning af Lecitinase- <strong>og</strong> lipasedannelse<br />

(Clostridium, Fusobacterium, evt. Prevotella)<br />

Tilså kun den ene pladehalvdel med et stort inoculum <strong>og</strong> lav et par punktinokulationer på den<br />

anden halvdel. Inkuberes i 1døgn for lecitinase evt. 3-5 døgn for lipase.<br />

Aflæsning:<br />

Lecitinaseaktivitet viser sig ved at agaren bliver hvid <strong>og</strong>så udenfor koloniens rand medens selve<br />

kolonien ikke ændres. Den diffusible lecitinase spalter lecitin så der sker en udfældning af<br />

uopløselige diglycerider i agaren.<br />

Lipaseaktivitet er resultatet af en nedbrydning af triglycerider til glycerol <strong>og</strong> frie fedtsyrer.<br />

Fedtsyrer med smeltepunkt over 37° kan ikke diffundere <strong>og</strong> udfældning af disse sker derfor i<br />

overfladen af agaren sv.t. selve kolonien <strong>og</strong> meget tæt på denne. Kolonien bliver hvid med et<br />

iridicerende skær. Evt. opklaring i selve agaren omkring kolonierne skyldes proteolyse. Ved<br />

tvivl geninkuberes pladen så det karakteristiske perlemorsagtige skær kan udvikles <strong>og</strong> iagttages<br />

efter 3 - 5 døgn.<br />

Fejlkilder:<br />

Hvis pladen tilsås med alm. spredning vil en kraftig lecitinasedanner kunne gøre hele pladen<br />

ensartet positiv, så aflæsningen tolkes som negativ.<br />

Undersøgelse for sporer .<br />

Mange clostridiumarter danner først synlige sporer efter n<strong>og</strong>le dages forløb.<br />

Sporedannelsen hos Clostridium spp. kan fremmes ved at inkubere kulturen i ca. 3 - 5 døgn<br />

under anaerobe forhold gerne på flere forskellige medier herunder EYA-plade.<br />

Clostridiumarter, især de slanke <strong>og</strong> Gramvariable, danner ofte så få sporer, at de overses ved<br />

mikroskopi.<br />

Det er en almindelig misforståelse, at udsættelse af anaerobe <strong>bakterier</strong> for ilt fremmer<br />

sporedannelsen. Ilt slår anaerobe <strong>bakterier</strong> ihjel, <strong>og</strong> så danner de ikke n<strong>og</strong>et som helst !!<br />

Ved ingen synlige sporer <strong>og</strong> mistanke om Clostridium laves:<br />

Sporeprøven udføres ved at der fremstilles en suspension med synlig uklarhed i ca. 1/2 ml dest.<br />

vand eller saltvand. Det er vigtigt ikke at berøre glassets sider med øjenålen. Tilsæt 1/2 ml ren<br />

etanol - den fra gramfarvningen) <strong>og</strong> lad denne "half and half" blanding stå ved stuetemperatur i 1<br />

time. Herefter udsås en dråbe til spredning på en anaerob plade til anaerob inkubering v. 35°.<br />

Vækst på pladen = sporedannelse.<br />

Ilttolerance <strong>og</strong> CO2 krav<br />

Inkuber ensartet tilsåede plader samtidig ved de fire dyrkningsbetingelser som er tilstede:<br />

Almindelig aerobt, CO2 termostat, mikoaerofilt (ca. 5% ilt) <strong>og</strong> anaerobt<br />

1. Aerobt + CO2<br />

Actinomyces spp., Propionibacterium spp., visse ægte streptokokker <strong>og</strong> lactobaciller er<br />

alle metronidazolresistente <strong>og</strong> vokser langsomt frem efter n<strong>og</strong>le dage.<br />

C. tertium (<strong>og</strong> C. carnis) kan vokse i CO2 inkubator men danner ikke spore<br />

Sporedannelse <strong>og</strong> metronidazolfølsomhed under anaerobe forhold.<br />

19-06-03 T. Justesen 12


Anaerob dyrkning <strong>og</strong> identifikation. Tage Justesen<br />

2. Mikroaerofilt (5% ilt + CO2 )<br />

Campylobacter spp, Helicobacter spp. <strong>og</strong> ” B. ureolyticus”.<br />

<strong>og</strong> evt. andre mikroaerofile gram negative stave<br />

Actinomyces spp. har CO2 krav, hvis de skal kunne vokse ved ilttilstedeværelse.<br />

Sammenlign defor <strong>og</strong>så vækst aerobt med <strong>og</strong> uden CO2<br />

Desulfoviridintest.<br />

(Desulfovibrio <strong>og</strong> Desulfomonas spp. samt ofte Bilophila)<br />

Påvisning af sulfitreductase. Kraftig ubehagelig svovlagtig lugt fra kulturen.<br />

En enkelt dråbe 2 N NaOH afsættes direkte på en anaerob plade med tæt vækst <strong>og</strong> betragtes<br />

straks i UV-lys (365 nm).<br />

Positiv: Rød fluorescens sv.t. dråben. Negativ: Ingen fluorescens.<br />

Svovlbrintedannelse.<br />

Svovlbrinte eller H2S dannelse påvises ved at tilså et TSI-skråagar (Tri-Sugar-Iron) med<br />

sædvanlig teknik.<br />

Inkubation skal ske under anaerobe forhold for at reaktionen fremkommer !<br />

Ved fjernelse af glasset fra kammeret kan sortfarvningen forsvinde helt efter n<strong>og</strong>le få timer, så<br />

aflæsningen skal foretages med det samme !<br />

Svovlbrintedannelse er nyttig i Campylobacter/B. ureolyticus diagnostikken.<br />

Øvrige direkte enzymtests for præformerede enzymer.<br />

Testene anvendes i forskellige sammnehænge. Se de enkelte skemaers anvisninger.<br />

Direkte enzymtests: α-glucosidase, β-glucosidase, α-galactosidase α-fucosidase, β-N-acetylglucosaminidase,<br />

alkalisk fosfatase m.fl.<br />

Anvend Rosco`s tabletter efter forskriften (opslemning til synlig uklarhed i 1/4 ml saltvand.<br />

Tilsætning af tablet. Aflæsning efter højst 1 døgn v. 35°under alm. aerobe forhold.<br />

Ved<br />

Positiv = gul (N-acety-glucosaminidase: Kun stærk gul er positiv) Negativ = farveløs - svag gul.<br />

Specielt for <strong>Anaerobe</strong> gram positive kokker<br />

En ROSCO tablet m. SPS anbringes på en tilsået plade. Aflæsning: S ≥ 12 mm =<br />

Peptostreptococcus anaerobius er som den eneste ægte anaerobe gram positive kok der er<br />

følsom. SPS er en forkortelse af Sodium Polyanethol Sulfonat (<strong>og</strong>så kendt som LIQUOID der er<br />

tilsat bloddyrkningskolber som antikoagulans).<br />

Nitrattest. se under Co-kulturbeskrivelsen<br />

Gelatine smeltning se under Co-kulturbeskrivelsen<br />

Esculinhydrolyse se under Co-kulturbeskrivelsen<br />

Sukkerforgæringer se under Co-kulturbeskrivelsen<br />

FORGÆRINGERNE I DET FØLGENDE KAN UDFØRES MED CO-<br />

KULTURPRINCIPPET<br />

Reaktioner, som kræver vækst af <strong>bakterier</strong>ne sammen med substratet (sukkerforgæringer,<br />

gelatinesmeltning, nitratreduktionsprøven etc.), kan med fordel udføres som "Co-kultur", d.v.s.<br />

at den anaerobe bakteriestamme udsås sammen med en i de nævnte henseender inaktiv stamme<br />

af typen Acinetobacter eller "B. anitratum". Ved vækst af denne bakterie fjernes ilt i tilstrækkelig<br />

19-06-03 T. Justesen 13


Anaerob dyrkning <strong>og</strong> identifikation. Tage Justesen<br />

grad fra substratet til, at de fleste anaerobe stammer kan vokse, selv om det pågældende substrat<br />

inkuberes i en almindelig aerob termostat.<br />

De pågældende glas kan <strong>og</strong>så anbringes i anaerobkammer men tilstedeværelse af CO2 her<br />

vanskeliggør indikatoraflæsningerne.<br />

Metoden er ikke egenet til aerotolerante gram positive ikke sporedannende stave f. eks.<br />

Actinomyces. Tilsæt i stedet en dråbe hestecitratplasma til forgæringsglassene.<br />

Co-kulturprincippet.<br />

En bakteriestamme af typen Acinetobacter ("B. anitratum") som ikke kan forgære sukkerarter<br />

eller smelte gelatine anvendes <strong>og</strong> så den om rutinemæssigt ca. en gang om ugen, <strong>og</strong> lad den stå<br />

ved stuetp. f. eks. på blå plade så den altid er klar. (vi kalder vores stamme BANCO: B.<br />

ANitratum Co Kultur).<br />

Sukkerforgæringer.<br />

Forgæringsglas med sukkerarter fra SSI anvendes, således at den udvalgte række først tilsås med<br />

BANCO <strong>og</strong> herefter med den anaerobe bakteriestamme som ønskes undersøgt. Resultatet bliver<br />

bedst, hvis de anaerobe stammer udsås med et synligt inoculum. Brug altid en sukkerfri<br />

KONTROL.<br />

Bacteroides fragilis gruppen <strong>og</strong> Clostridiumarterne behøver ikke yderligere vækstfaktorer, men<br />

Prevotella spp. <strong>og</strong> Porphyromonas spp. kræver Hæmin + K vitamin, som kan tilsættes fra en<br />

koncentreret opløsning som en dråbe per forgæringsglas. Opløsningen kan fås på SSI.<br />

Aflæsning én gang dagligt for omslag til gul farve eller ændring mod gul i forhold til<br />

kontrolglasset.<br />

Hvis en anaerob bakteriestamme overhovedet er i stand til at forgære en sukkerart, drejer det sig<br />

praktisk talt altid om glucose. En positiv ONPG <strong>og</strong> en negativ glucose tolkes som manglende<br />

vækst i glucoseglasset <strong>og</strong> glucosen regnes så for positiv.<br />

OBS! N<strong>og</strong>le <strong>bakterier</strong> særlig visse clostridiearter er i stand til at reducere bromthymolblåt (0,2%)<br />

til en farveløs forbindelse, hvorved glassets indhold ofte får en strågul farve. For ikke at<br />

forveksle denne reaktion med forgæring, må 1 dråbe bromthymolblåtopløsning evt. tilsættes.<br />

Ved "ægte" forgæring forbliver glasset gult medens det bliver blåt igen, hvis det kun var en<br />

reduktion.<br />

Esculinhydrolyse.<br />

Esculin spaltes af n<strong>og</strong>le <strong>bakterier</strong> ved en hydrolyse til esculetin <strong>og</strong> glucose. Ved en effektiv<br />

spaltning dannes så meget glucose, at en glucoseforgæring <strong>og</strong>så kan foregå, så glasset slår om til<br />

gult som ved en almindelig forgæring med syredannelse.<br />

Selv små mængder esculetin kan imidlertid påvises, selv om der tilsyneladende ikke er sket en<br />

syredannelse (farven er stadig grønblå), ved at der tilsættes n<strong>og</strong>le dråber ferriammoniumcitrat<br />

1% i vandig opløsning. Sortfarvning = + Esculinhydrolyse.<br />

Gelatinesmeltning.<br />

Vigtig ved skelnen mellem proteolytiske <strong>og</strong> non-proteolytiske Clostridium spp.<br />

Desuden ved ikke- pigmenterede Prevotella spp..<br />

19-06-03 T. Justesen 14


Anaerob dyrkning <strong>og</strong> identifikation. Tage Justesen<br />

To typer gelatinase kan påvises <strong>og</strong> er begge et udtryk for at gelatinesmeltning er tilstede. Den<br />

ene type gelatinase spalter gelatinekæderne effektivt til aminosyrer <strong>og</strong> gelatinen er herefter<br />

flydende selv ved 4°.<br />

En anden type gelatinase spalter kun til polypeptidkæder så gelatinen ikke flyder ved 4°. Der<br />

skal derfor altid anvendes et kontrolgelatineglas ved udførelse af gelatinesmeltningsprøven.<br />

Udførelse:<br />

To gelatineglas (SSI) holdes under den varme hane til de bliver flydende. Begge glassene tilsås<br />

først med B. anitratum. Testglasset tilsås derpå med stammen, som ønskes undersøgt, det andet<br />

tjener som kontrolglas.<br />

Glassene anbringes sammen i alm. termostat v. 35°<strong>og</strong> aflæses herefter én gang i døgnet i op til en<br />

uge.<br />

Aflæsning:<br />

1) Først afkøles glassene i køleskab til kontrolgelatinen er stiv (v. 4° i ca.15 min).<br />

2) Testglasset vippes forsigtigt <strong>og</strong> en kraftig smeltning (++) vil kunne ses umiddelbart ved at<br />

indholdet i testglasset er blevet flydende.<br />

Hvis indholdet i begge glas er stift, opvarmes glassene langsomt med håndvarme til<br />

stuetemperatur idet de med korte mellemrum holdes i skrå stilling. Hvis der iagttages<br />

begyndende flydning i testglasset før<br />

kontrolglasset er dette <strong>og</strong>så gelatinesmeltning (+). (F.eks. Cl. difficile er en svag smelter der<br />

evt. først er positiv efter 3 døgn)<br />

3) Hvis begge gelatiner bliver flydende på samme tid, bør glassene inkuberes påny <strong>og</strong> aflæses på<br />

samme måde som beskrevet i op til en uge, før gelatinesmeltningen aflæses som negativ.<br />

Nitratreduktion.<br />

Nitratreduktionen kan udføres som co-kultur i halvflydende kaliumnitratsubstrat fra SSI.<br />

(Alm. flydende nitratglas kan ikke anvendes !)<br />

Nitratreduktion er en vigtig egenskab hos en række mikroaerofile gram negative stave <strong>og</strong> en<br />

del uregelmæssige gram positive ikke-sporedannende stave.<br />

Substratet er tilberedt med serum som derfor ikke skal tilsættes for vækst.<br />

Tilsætning af sædvanlige nitratreagenser, når man er sikker på at der er god vækst i glasset. Ved<br />

undersøgelse af langsomt voksende <strong>bakterier</strong> kan en mindre portion evt. afpipetteres sterilt <strong>og</strong><br />

undersøges for nitrit så resten kan geninkuberes til senere undersøgelse - eller to glas kan<br />

fremstilles fra starten.<br />

Vækst i halvflydende nitrat af mikroaerofile nitratreducerende <strong>bakterier</strong> vil ofte være<br />

meget karakteristisk idet den er lokaliseret i en zone ½ - 1 cm under overfladen.<br />

19-06-03 T. Justesen 15


Anaerob dyrkning <strong>og</strong> identifikation. Tage Justesen<br />

Hovedgrupper efter følsomhed for primær id-disks.<br />

Metronidazol<br />

5 µg<br />

Kanamycin<br />

1000 µg<br />

Vancomycin<br />

5 µg<br />

Colistin<br />

10 µg<br />

Fluorescens<br />

Bacteroides fragilis<br />

gruppen<br />

S R R<br />

0<br />

(koralrød)<br />

Prevotella S R R V Rubinrød<br />

Porphyromonas S S R Rubinrød<br />

Fusobacterium S R S Grøngul<br />

B. ureolyticus gruppen S/R R S 0<br />

Desulfovibrio <strong>og</strong><br />

Desulfomonas<br />

S S R R<br />

RØD m.2%<br />

NaOH<br />

Veillonella S R S (rød)<br />

Peptostreptococcus spp.<br />

Clostridium<br />

S S 0<br />

S S<br />

Eubacterium<br />

S S<br />

rød)<br />

Bifidobacterium S/R S S R 0<br />

Actinomyces S/R 0<br />

Propionibacterium R S/R 0<br />

0 (C.ramosum evt.<br />

rød <strong>og</strong> C. difficile <strong>og</strong> C.<br />

innocuum gulgrøn)<br />

0 (E.lentum evt.<br />

Lactobacillus S/R S/R 0<br />

Clost. innocuum S S S/R gulgrøn<br />

<strong>Anaerobe</strong> <strong>bakterier</strong> <strong>og</strong> katalasereaktionen<br />

<strong>Anaerobe</strong> <strong>bakterier</strong> som<br />

kan være Katalase<br />

positive<br />

<strong>Anaerobe</strong> <strong>bakterier</strong><br />

som er<br />

Katalase negative<br />

Gram negative stave Gram positive stave uden Gram negative Forskellige gram<br />

sporer<br />

kokker<br />

positive<br />

Bacteroides fragilis Propionibacterium acnes Visse Veillonella Clostridium spp.<br />

<strong>og</strong> granulosum<br />

spp.<br />

Prevotella oulorum Actinomyces viscosus Peptostreptococcus<br />

spp.<br />

Bilophila Eubacterium lentum Bifidobacterium spp.<br />

Campylobacter<br />

Desulfovibrio<br />

Desulfomonas<br />

B. ureolyticus<br />

Pigmenterede arter fra<br />

dyr<br />

Bacteroides putredenis<br />

Lactobacillus spp.<br />

Defekte fakultative stave<br />

19-06-03 T. Justesen 16


Anaerob dyrkning <strong>og</strong> identifikation. Tage Justesen<br />

<strong>Anaerobe</strong> <strong>bakterier</strong><br />

som kan være<br />

UREASE positive<br />

Gram negative stave<br />

Bacteroides ureolyticus<br />

Gram positive stave u.<br />

sporer<br />

(Actinomyces naeslundii)<br />

Clostridium Gram positive kokker<br />

C. sordellii<br />

Bilophila wadsworthii Actinomyces viscosus (C. celatum)<br />

(Helicobacter sp) (Actinomyces meyerii)<br />

<strong>Anaerobe</strong> <strong>bakterier</strong><br />

som kan være<br />

INDOL positive<br />

(Peptostreptococcus<br />

prevotii/tetradius)<br />

Gram negative stave Gram positive stave<br />

u. sporer<br />

Clostridium Gram positive kokker<br />

Bacteroides ovatus Propionibacterium C. sordellii Peptostreptococcus<br />

acnes<br />

asaccharolyticus<br />

B. uniformis C. bifermentans (P. indolicus)<br />

B. thetaiotaomicron (Eubacterium tenue) C. cadaveris (P. hydr<strong>og</strong>enalis)<br />

(B. splancnicus) C. clostridioforme<br />

(B. stercoris) C. sphenoides<br />

(B. eggerthii) (C. tetani)<br />

(B. putredenis) (C. novyi B)<br />

(B. coagulans) (C. indolis)<br />

(C. ghonii)<br />

Prevotella intermedia (C. malenominatum)<br />

P. heparinolytica (C. mangenotii)<br />

Porphyromonas spp.<br />

Fusobacterium<br />

necrophorum<br />

F. nucleatum<br />

F. varium<br />

(F. naviforme)<br />

(F. gonidiaformans)<br />

19-06-03 T. Justesen 17


Anaerob dyrkning <strong>og</strong> identifikation. Tage Justesen<br />

KOKKER<br />

GRAM NEGATIVE<br />

STAVE<br />

ANAEROBE BAKTERIER<br />

SPOREDANNERE<br />

STAVE<br />

GRAM POSITIVE<br />

IKKE-SPOREDANNERE<br />

Veillonella spp. Bacteroides spp. Clostridium spp. Propionibacterium<br />

Prevotella spp. Actinomyces<br />

Porphyromonas spp.<br />

Bifidobacterium<br />

Fusobacterium spp. Lactobacillus<br />

Leptotrichia buccalis<br />

B.ureolyticus<br />

Bilophila wadsworthii<br />

Eubacterium<br />

KOKKER<br />

Peptostreptococcus<br />

[Acidaminococcus] Campylobacter spp. [Peptococcus]<br />

[Megasphera] Selenomonas spp. [Coprococcus]<br />

Helicobacter [Sarcina]<br />

[Mitsoukella mitsoukii]<br />

[Dialister pneumosintes]<br />

[Anarorhabdus furcosus]<br />

[B. coagulans]<br />

[B. putredinis]<br />

[B. forsythus]<br />

[Tisierella praeacuta]<br />

19-06-03 T. Justesen 18

Hooray! Your file is uploaded and ready to be published.

Saved successfully!

Ooh no, something went wrong!