23.07.2013 Views

Membranen sladrer om membranpumpers funktion - Memphys

Membranen sladrer om membranpumpers funktion - Memphys

Membranen sladrer om membranpumpers funktion - Memphys

SHOW MORE
SHOW LESS

You also want an ePaper? Increase the reach of your titles

YUMPU automatically turns print PDFs into web optimized ePapers that Google loves.

Emneord: Biofysik og membranpumper<br />

<strong>Membranen</strong> <strong>sladrer</strong> <strong>om</strong> <strong>membranpumpers</strong> <strong>funktion</strong><br />

Na + /K + -pumpen findes i alle cellemembraner fra dyr og holder styr på fordelingen af natrium og<br />

kalium på hver side af membranen. Når den pumper, påvirker den membranen på en måde, s<strong>om</strong><br />

<strong>sladrer</strong> <strong>om</strong> detaljer i pumpens <strong>funktion</strong>.<br />

Af Hélène Bouvrais, Flemming Cornelius, John H. Ipsen & Ole G. Mouritsen<br />

Alle celler er begrænset af en cellemembran, s<strong>om</strong> <strong>om</strong>slutter cellen og sikrer, at cellens indre er<br />

beskyttet fra <strong>om</strong>givelserne. Forskellige celletyper har forskellige slags membraner, men fælles for<br />

dem alle er, at de er opbygget af et dobbeltlag af lipidmolekyler, hvori der er indbygget en lang<br />

række forskellige proteiner. Desuden er der på membranens yderside en skov af kulhydrater, og på<br />

indersiden er membranen forankret på en skelet af polymerer, det såkaldte cytoskelet, s<strong>om</strong> er med<br />

til at give cellen form.<br />

Proteinerne i membranen er cellens arbejdsheste. De udfører de mange forskellige<br />

<strong>funktion</strong>er, s<strong>om</strong> er nødvendige, for at cellen kan opretholde sine livs<strong>funktion</strong>er (h<strong>om</strong>eostase). Nogle<br />

proteiner transporterer næringsstoffer ind i cellen og affaldsstoffer ud. Andre virker s<strong>om</strong> en slags<br />

antenner, der kan opfange signaler eller sende signaler mellem cellens og dens <strong>om</strong>givelser. Andre<br />

igen sikrer cellen forankringspunkter til andre celler eller de overflader, s<strong>om</strong> cellen måtte binde sig<br />

til.<br />

Nogle af de allervigtigste membranproteiner er ionpumperne, s<strong>om</strong> sikrer og<br />

kontrollerer små ladede molekylers transport over cellemembranen, så cellen opretholder det rette<br />

kemiske miljø indeni og opbygger de nødvendige elektriske felter, der kan virke s<strong>om</strong> drivkraft for<br />

cellens <strong>funktion</strong>er fx for nervecellers aktivitet.<br />

Én af disse pumper er natrium-kalium (Na + /K + ) pumpen, s<strong>om</strong> blev opdaget af den<br />

danske forsker Jens Chr. Skou i 1957, en opdagelse han blev hædret for med Nobelprisen i kemi i<br />

1997. Na + /K + -pumpen virker både s<strong>om</strong> en ionpumpe og s<strong>om</strong> et enzym, dvs. en katalysator, s<strong>om</strong><br />

<strong>om</strong>sætter cellens kemiske brændstof ATP (adenosin-trifosfat) til den energi, der medgår til at<br />

pumpe 3 natriumioner (Na + ) ud af cellen og 2 kaliumioner (K + ) ind i cellen for hvert ATP molekyle,<br />

der hydrolyseres. Na + /K + -pumpen findes udelukkende hos dyreceller, og den er livsvigtig for<br />

opretholdelse af et konstant volumen. Hvis vand trænger ind i cellen, og den derved svulmer,<br />

sprænges cellen, da den ’bløde’ cellemembran ikke kan modstå et overtryk. Dette er i modsætning<br />

til planteceller, der udenpå cellemembranen har en cellulose cellevæg, s<strong>om</strong> kan modstå meget store<br />

overtryk i cellen.<br />

Hvordan snakker proteinerne og membranen sammen?<br />

En vigtig bestanddel af membranen er lipider, der er såkaldt amfifile molekyler, dvs. at de i den ene<br />

ende tiltrækkes af vand (de er hydrofile, − de elsker vand), og i den anden ende er de s<strong>om</strong> olie, der<br />

skyr vand (de er hydrofobe, − vandskyende). Det er derfor, at de i vand helt af sig selv slutter sig<br />

sammen i lipiddobbeltlag, s<strong>om</strong> kan danne lukkede kugleskaller med vand på begge sider. Sådanne<br />

lukkede skaller kaldes lipos<strong>om</strong>er. Et lipos<strong>om</strong> er den simpleste model af en celle, s<strong>om</strong> dog ikke kan<br />

udføre andre <strong>funktion</strong>er end at holde det indre adskilt fra det ydre.


Fordi det indre af lipiddobbeltlaget er s<strong>om</strong> olie, er det meget vanskeligt for specielt<br />

vandopløselige stoffer, s<strong>om</strong> for eksempel uorganiske salte med natrium- eller kaliumioner, at<br />

trænge gennem laget. Af samme grund skal proteiner og specielt ionkanaler og ionpumper have en<br />

helt særlig opbygning for at kunne befindes sig indlejret i membraner: de skal have et midterstykke,<br />

s<strong>om</strong> er olieagtigt, men med ender, s<strong>om</strong> er opløselige i vand. Vi siger, at membranproteinerne er<br />

hydrofobisk tilpasset lipidmembranen.<br />

Denne hydrofobe tilpasning udgør en slags mekanisme, med hvilken membranen og<br />

de indlejrede proteiner gensidig kan påvirke hinanden. Vi taler <strong>om</strong> lipid-protein vekselvirkninger.<br />

Der er mange andre mekanismer; for eksempel kan proteinerne have en ge<strong>om</strong>etrisk form eller<br />

elektriske ladninger, s<strong>om</strong> påvirker lipiderne og dermed membranen. Lipid-proteinvekselvirkninger<br />

er af stor betydning for proteinernes <strong>funktion</strong>er. På den ene side kan ændringer i lipidmembranen,<br />

der for eksempel skyldes kemiske stoffer (bl.a. visse lægemiddelstoffer) eller ydre påvirkninger<br />

(bl.a. stress og surhedsgrad), medvirke til, at proteinets <strong>funktion</strong> påvirkes. På den anden side kan<br />

proteinet, mens det udfører sin <strong>funktion</strong>er, påvirke lipidmembranen, for eksempel hvis proteinet<br />

ændrer form eller hydrofob tilpasning.<br />

Modeller viser vejen<br />

I et forsøg på at afklare, hvordan proteiner og lipidmembraner gensidigt påvirker hinanden, bruger<br />

forskerne forskellige modelsystemer, s<strong>om</strong> er tilstrækkeligt simple til, at man kan foretage<br />

kvantitative målinger af lipid-proteinvekselvirkningerne, men samtidig tilstrækkeligt realistiske til,<br />

at de kan lede til ny indsigt. Et sådant lipid-protein modelsystem er lipos<strong>om</strong>er opbygget af nogle få<br />

forskellige slags lipidmolekyler, der kan danne lipos<strong>om</strong>er. I disse lipos<strong>om</strong>er indbygges så proteiner,<br />

s<strong>om</strong> opremses fra levende celler.<br />

Det er muligt at oprense Na + /K + -pumper fra forskellige celle- og vævstyper. Her<br />

benytter vi os af, at naturen allerede har opkoncentreret Na + /K + -pumper i visse væv og organer. Det<br />

gælder f.eks. hjerne og nyre, der er meget rige på Na + /K + -pumper (meget aktive organer). Vi bruger<br />

også saltkirtler fra pighajer, der hjælper hajen med at k<strong>om</strong>me af med det NaCl, den indtager, når<br />

den har spist. Saltkirtlerne er på størrelse med en lillefinger og indeholder næsten 50% Na + /K + -<br />

pumper. Disse proteiner kan indbygges i små lipos<strong>om</strong>er bestående af to slags lipidmolekyler, hvoraf<br />

den ene slags er kolesterol, s<strong>om</strong> er en vigtig k<strong>om</strong>ponent i alle cellemembraner. Lipos<strong>om</strong>erne er ca.<br />

100nm i diameter, og man kan ved biokemiske analyser vise, at pumperne forsat er enzymatisk<br />

aktive i lipos<strong>om</strong>erne. Disse små lipos<strong>om</strong>er, s<strong>om</strong> er meget mindre end, hvad man kan se i et<br />

lysmikroskop, kan nu tvinges til at smelte sammen i meget store lipos<strong>om</strong>er ved at udsætte dem for<br />

svingende elektriske felter. Hermed dannes kæmpestore lipos<strong>om</strong>er, s<strong>om</strong> typisk er 20-40µm i<br />

diameter og derfor synlige i et lysmikroskop.<br />

Det er meget småt og hele tiden i bevægelse<br />

Problemet med at studere ting, s<strong>om</strong> er meget små, for eksempel molekyler og ultratynde<br />

lipidmembraner, er, at de hele tiden er i bevægelse. Molekylerne udfører, hvad vi kalder Brownske<br />

bevægelser, s<strong>om</strong> skyldes, at vandmolekyler hele tiden støder ind i dem, så proteinerne k<strong>om</strong>me til at<br />

opføre en tilfældig dans. Desuden er lipidmembraner ofte så bløde, at de også k<strong>om</strong>mer til at udføre<br />

en slags Brownske bevægelser. De ændrer simpelthen form på en tilfældig måde, når<br />

vandmolekylerne støder ind i dem. Disse tilfældige bevægelser er mere volds<strong>om</strong>me, jo højere<br />

temperaturen er.<br />

Det kan derfor synes s<strong>om</strong> en stor ulempe for næremere studier, at membranerne<br />

udfører disse uregelmæssige, såkaldt termiske bevægelser. Imidlertid kan man udnytte de termiske<br />

bevægelser til at lære noget <strong>om</strong> membranernes mekaniske egenskaber. Ved at analysere, hvorledes<br />

lipos<strong>om</strong>erne ændrer form gennem tiden, kan man for eksempel bestemme membranens stivhed.<br />

2<br />

Bouvrais, Cornelius, Ipsen & Mouritsen: <strong>Membranen</strong> <strong>sladrer</strong> <strong>om</strong> <strong>membranpumpers</strong> <strong>funktion</strong>


Stivheden er et udtryk for, hvor meget energi, der skal til for at deformere membranen. Lipos<strong>om</strong>er,<br />

der fluktuerer meget i form, er bløde, hvorimod lipos<strong>om</strong>er, s<strong>om</strong> fluktuerer meget lidt og næsten er<br />

perfekt kugleformede hele tiden, er stive.<br />

Vi skal nu se på, hvordan man ved analyse af lipos<strong>om</strong>ers termiske fluktuationer kan<br />

lære noget <strong>om</strong>, hvordan Na + /K + -pumper påvirker membranen, mens de pumper ioner over<br />

membranen. Desuden skal vi se, at denne analyse afslører, at membranerne <strong>sladrer</strong> <strong>om</strong> pumperne.<br />

Vi kan helt uden at studere pumperne direkte alligevel kan lære <strong>om</strong> deres <strong>funktion</strong> ved at lave<br />

eksperimenter, der afslører, hvordan aktive pumper påvirker membranens stivhed og<br />

fluktuationsmøster i tid og rum. Disse eksperimenter er for nemheds skyld udført under forhold,<br />

hvor Na + /K + -pumpen kun pumper natriumioner over membranen, dvs. ekstracellulært K + erstattes<br />

af Na + .<br />

Hvad membranernes fluktuationer fortæller<br />

Eksperimenterne er i princippet simple, men dog teknisk meget krævende både i laboratoriet og<br />

specielt i den efterfølgende matematiske analyse af de eksperimentelle data. For at lykkes kræver et<br />

sådant projekt et tæt samarbejde mellem på den ene side teoretiske fysikere og på den anden side<br />

eksperimentelle fysisk-kemikere og biokemikere med forstand på enzymers <strong>funktion</strong>.<br />

Fremgangsmåden <strong>om</strong>fatter sammenlignende studier af (1) lipos<strong>om</strong>er uden pumper, (2)<br />

lipos<strong>om</strong>er med pumper s<strong>om</strong> ikke er aktive, dvs. uden ATP tilstede, og (3) lipos<strong>om</strong>er med pumper,<br />

s<strong>om</strong> er aktive pga. tilstedeværelsen af ATP.<br />

Det første resultat viser, at membranernes fluktuationer ikke er forskellige uden<br />

pumper i forhold til med pumper, s<strong>om</strong> ikke er aktive. Det betyder, at ved de meget små<br />

koncentrationer af pumper, vi benytter, er membranens stivhed ikke ændret. Men så snart pumperne<br />

aktiveres ved at tilsætte ATP, ændrer lipos<strong>om</strong>ets fluktuationer sig. Ændringen kan ikke observeres<br />

med det blotte øje i mikroskopet, men den matematiske analyse viser det tydeligt: membranerne<br />

bliver <strong>om</strong>kring 30% blødere.<br />

Tilsyneladende har den aktive pumpe, mens den pumper ioner hen over membranen,<br />

en effekt på membranen, muligvis fordi Na + /K + -pumpen ændrer form,. Disse formændringer vil så<br />

mekanisk påvirke lipidmolekylerne i membranen, s<strong>om</strong> derved bliver mere uordnet og blød.<br />

Samtidig sker der noget meget overraskende med det tidslige forløb af<br />

membranfluktuationerne. De bliver meget stærkere korreleret, dvs. membranen synes at have en<br />

huk<strong>om</strong>melse gennem længere tid <strong>om</strong>, hvad den foretog sig tidligere. Sådanne tidsmæssige<br />

korrelationer kan analyseres matematisk og føre til tal for, hvad der er karakteristiske tider, såkaldt<br />

tidskonstanter, for det observerede fæn<strong>om</strong>en. Disse tidskonstanter er normalt afhængige af detaljer,<br />

for eksempel lipos<strong>om</strong>ets størrelse og graden af indre spændinger i lipos<strong>om</strong>et. Men det har vist sig,<br />

at der i analysen af mange forskellige lipos<strong>om</strong>er med indbyggede aktive pumper fremk<strong>om</strong>mer en<br />

tidskonstant, s<strong>om</strong> er robust og ikke afhænger af detaljer ved det aktuelle lipos<strong>om</strong>.<br />

Den fundne tidskonstant er <strong>om</strong>kring 0,5sec. Det er lidt af et mirakel, at det praktisk<br />

har vist sig muligt at isolere en sådan robust tidsskala for et så k<strong>om</strong>plekst eksperiment, der her er<br />

tale <strong>om</strong>. Det var umuligt at kunne sige noget <strong>om</strong> på forhånd. Det kunne lige så godt have vist sig, at<br />

systemets mekaniske egenskaber ikke kunne afsløre netop denne tidsskala. Spørgsmålet er så, hvad<br />

de 0,5sec fortæller os <strong>om</strong>.<br />

<strong>Membranen</strong> <strong>sladrer</strong><br />

For at svare på det spørgsmål skal vi have fat i den viden, s<strong>om</strong> biokemikere, der har arbejdet med<br />

Na + /K + -pumpen gennem mange år, har erfaret ved analyse af pumpen s<strong>om</strong> et enzym. Deres arbejde<br />

viser, at det langs<strong>om</strong>ste, og dermed tidsbegrænsende trin i den reaktionscyklus, s<strong>om</strong> pumpen<br />

gennemgår, <strong>om</strong>fatter afgivelsen af en fosfatgruppe. Dette trin kan man ved biokemiske forsøg vise<br />

Bouvrais, Cornelius, Ipsen & Mouritsen: <strong>Membranen</strong> <strong>sladrer</strong> <strong>om</strong> <strong>membranpumpers</strong> <strong>funktion</strong><br />

3


er karakteriseret af en tidsskala på <strong>om</strong>kring 0,4sec, dvs. meget tæt på det, s<strong>om</strong><br />

membranfluktuationerne rapporterer <strong>om</strong>. Det er derfor nærliggende at slutte, at netop dette trin, s<strong>om</strong><br />

også fra strukturelle studier vides at <strong>om</strong>fatte en ændring af pumpens molekylære form, er det, der er<br />

ansvarlig for ændringer i membranens fluktuationer.<br />

Hermed har vi lært noget <strong>om</strong> en molekylær egenskab ved et k<strong>om</strong>plekst molekyle, dvs.<br />

noget der karakteriserer den mikroskopiske verden, ved med biofysiske teknikker at studere<br />

fluktuationer og mekanik af en membran, dvs. noget der karakteriserer den makroskopiske verden.<br />

Det er en dyb viden.<br />

Nu kunne man så sige, at vi har fundet et resultat, man kendte i forvejen. Men<br />

perspektiverne af dette resultat er selvfølgelig, at man på denne baggrund kan gå videre og studere<br />

Na + /K + -pumpen med de biofysiske teknikker under <strong>om</strong>stændigheder, hvor man ikke kender<br />

resultatet, for eksempel for pumper, s<strong>om</strong> er defekte (ved visse sygd<strong>om</strong>me), eller s<strong>om</strong> er påvirket af<br />

lægemiddelstoffer (for eksempel kemoterapeutiske stoffer). Endelig foreligger der den mulighed at<br />

bruge membranfluktuationer til at studere <strong>funktion</strong>en af membranproteiner, <strong>om</strong> hvis <strong>funktion</strong> vi<br />

endnu ingen viden har.<br />

4<br />

Bouvrais, Cornelius, Ipsen & Mouritsen: <strong>Membranen</strong> <strong>sladrer</strong> <strong>om</strong> <strong>membranpumpers</strong> <strong>funktion</strong>


Om forfatterne<br />

Hélène Bouvrais er PhD og postdoc ved Institut de Génétique et Développement de Rennes<br />

(IGDR), Rennes, Frankrig<br />

Tel: +33 2 23 23 47 16<br />

E-mail: helene.bouvrais@univ-rennes1.fr<br />

Flemming Cornelius er dr.scient. og lektor i biofysik ved Institut for Bi<strong>om</strong>edicin-Fysiologi og<br />

Biofysik, Aarhus Universitet<br />

Tel: 8716 7746<br />

E-mail: fc@biophys.au.dk<br />

John H. Ipsen er PhD og lektor i fysik ved Institut for Fysik, Kemi og Farmaci, Syddansk<br />

Universitet<br />

Tlf.: 6550 2560<br />

E-mail: ipsen@memphys.sdu.dk<br />

Ole G. Mouritsen er dr. scient. og professor i biofysik ved Institut for Fysik, Kemi og Farmaci,<br />

Syddansk Universitet.<br />

Tlf.: 6550 3528<br />

E-mail: ogm@memphys.sdu.dk<br />

Vil du vide mere<br />

Bouvrais, Cornelius, Ipsen & Mouritsen: <strong>Membranen</strong> <strong>sladrer</strong> <strong>om</strong> <strong>membranpumpers</strong> <strong>funktion</strong><br />

5


Bouvrais H, F Cornelius, JH Ipsen & OG Mouritsen. 2012. Intrinsic reaction-cycle time scale of<br />

Na + ,K + -ATPase manifests itself in the lipid-protein interactions of non-equilibrium membranes.<br />

Proc. Natl. Acad. Sci. USA XX, xxxx-xxxx.<br />

Forslag til forsideillustration<br />

Fluktuerende lipos<strong>om</strong> (diameter = 35µm) med aktive Na + /K + -pumper. Fluktuationerne skyldes<br />

Brownske bevægelser. (Grafik: Jonas Drotner Mouritsen)<br />

Figur<br />

6<br />

Bouvrais, Cornelius, Ipsen & Mouritsen: <strong>Membranen</strong> <strong>sladrer</strong> <strong>om</strong> <strong>membranpumpers</strong> <strong>funktion</strong>


Cellemembraner består af forskellige fosfolipider (runde hoveder med to haler) arrangeret i et<br />

dobbeltlag, polysaccharider (grønne grene) og membranproteiner (sorte klumper). Cellemembraner<br />

indeholder typisk tusinder af forskellige slags lipid- og proteinmolekyler. På indersiden af<br />

membranen findes et polymerskelet, s<strong>om</strong> giver cellen form (røde slanger).<br />

Figur<br />

Lipidmolekyler er amfifile molekyler, s<strong>om</strong> har vandopløselige hoveder (runde kugler) og i dette<br />

tilfælde to fedtopløselige haler (fedtsyrer). Lipider i vand danner spontant lipiddobbeltlag, s<strong>om</strong> er<br />

membraner, der kun er ca. 5nm tykke. Dobbeltlagene lukker <strong>om</strong>kring sig selv og kan danne såkaldte<br />

vesikler eller lipos<strong>om</strong>er, der er små kugleskaller af lipider med vand på begge sider. I disse skaller<br />

kan man indbygge <strong>funktion</strong>elle membranproteiner, fx Na + /K + -pumper.<br />

Bouvrais, Cornelius, Ipsen & Mouritsen: <strong>Membranen</strong> <strong>sladrer</strong> <strong>om</strong> <strong>membranpumpers</strong> <strong>funktion</strong><br />

7


Figur<br />

Skitse af lipos<strong>om</strong> med indbyggede Na + /K + -pumper. Lipos<strong>om</strong>ets membran består af fosfolipider<br />

(gul) og kolesterol (rød). Pumpen kan enten være orienteret s<strong>om</strong> i cellen med ydersiden udad<br />

(right-side out, r-o) eller modsat (inside out, i-o). Ved at tilsætte ATP (adenosin-trifosfat) til<br />

ydermediet aktiveres alene i-o pumperne, hvor bindingstedet for ATP er eksponeret til ydersiden.<br />

ATP nedbrydes herved til ADP (adenosin-difosfat) og uorganisk fosfor (Pi). Hvis der er Mg 2+ , Na +<br />

og K + til stede, vil i-o pumperne transportere Na + ind i lipos<strong>om</strong>et og K + ud af lipos<strong>om</strong>et, modsat i<br />

cellen. ATP er et hydrofilt molekyle, og det kan derfor ikke kan trænge ind i lipos<strong>om</strong>et.<br />

Figur<br />

Mikroskopibilleder af et stort lipos<strong>om</strong> (diameter = 42µm), s<strong>om</strong> består af et lipiddobbeltlag, hvori<br />

der er indbygget Na + /K + -pumper. Lipos<strong>om</strong>et er observeret på seks forskellige tidspunkter med 40<br />

mikrosekunders interval. Da lipiddobbeltlaget kun er 5nm tykt, kan man ikke se selve laget, men<br />

kun kontrasten af <strong>om</strong>ridset. Tilsvarende er proteinerne alt for små til at kunne ses i et lysmikroskop.<br />

Lipos<strong>om</strong>et fluktuerer i form på grund af Brownske bevægelser, s<strong>om</strong> skyldes, at vandmolekylerne,<br />

s<strong>om</strong> diffunderer tilfældigt rundt, bestandig bumper ind i lipidmembranen. Når pumperne bliver<br />

aktive ved tilstedeværelse af ATP, forstærkes fluktuationerne, s<strong>om</strong> kan måles ved detaljerede<br />

analyser af lipos<strong>om</strong>ets <strong>om</strong>rids, og hvordan det varierer gennem tiden.<br />

8<br />

Bouvrais, Cornelius, Ipsen & Mouritsen: <strong>Membranen</strong> <strong>sladrer</strong> <strong>om</strong> <strong>membranpumpers</strong> <strong>funktion</strong>

Hooray! Your file is uploaded and ready to be published.

Saved successfully!

Ooh no, something went wrong!