Membranen sladrer om membranpumpers funktion - Memphys
Membranen sladrer om membranpumpers funktion - Memphys
Membranen sladrer om membranpumpers funktion - Memphys
You also want an ePaper? Increase the reach of your titles
YUMPU automatically turns print PDFs into web optimized ePapers that Google loves.
Emneord: Biofysik og membranpumper<br />
<strong>Membranen</strong> <strong>sladrer</strong> <strong>om</strong> <strong>membranpumpers</strong> <strong>funktion</strong><br />
Na + /K + -pumpen findes i alle cellemembraner fra dyr og holder styr på fordelingen af natrium og<br />
kalium på hver side af membranen. Når den pumper, påvirker den membranen på en måde, s<strong>om</strong><br />
<strong>sladrer</strong> <strong>om</strong> detaljer i pumpens <strong>funktion</strong>.<br />
Af Hélène Bouvrais, Flemming Cornelius, John H. Ipsen & Ole G. Mouritsen<br />
Alle celler er begrænset af en cellemembran, s<strong>om</strong> <strong>om</strong>slutter cellen og sikrer, at cellens indre er<br />
beskyttet fra <strong>om</strong>givelserne. Forskellige celletyper har forskellige slags membraner, men fælles for<br />
dem alle er, at de er opbygget af et dobbeltlag af lipidmolekyler, hvori der er indbygget en lang<br />
række forskellige proteiner. Desuden er der på membranens yderside en skov af kulhydrater, og på<br />
indersiden er membranen forankret på en skelet af polymerer, det såkaldte cytoskelet, s<strong>om</strong> er med<br />
til at give cellen form.<br />
Proteinerne i membranen er cellens arbejdsheste. De udfører de mange forskellige<br />
<strong>funktion</strong>er, s<strong>om</strong> er nødvendige, for at cellen kan opretholde sine livs<strong>funktion</strong>er (h<strong>om</strong>eostase). Nogle<br />
proteiner transporterer næringsstoffer ind i cellen og affaldsstoffer ud. Andre virker s<strong>om</strong> en slags<br />
antenner, der kan opfange signaler eller sende signaler mellem cellens og dens <strong>om</strong>givelser. Andre<br />
igen sikrer cellen forankringspunkter til andre celler eller de overflader, s<strong>om</strong> cellen måtte binde sig<br />
til.<br />
Nogle af de allervigtigste membranproteiner er ionpumperne, s<strong>om</strong> sikrer og<br />
kontrollerer små ladede molekylers transport over cellemembranen, så cellen opretholder det rette<br />
kemiske miljø indeni og opbygger de nødvendige elektriske felter, der kan virke s<strong>om</strong> drivkraft for<br />
cellens <strong>funktion</strong>er fx for nervecellers aktivitet.<br />
Én af disse pumper er natrium-kalium (Na + /K + ) pumpen, s<strong>om</strong> blev opdaget af den<br />
danske forsker Jens Chr. Skou i 1957, en opdagelse han blev hædret for med Nobelprisen i kemi i<br />
1997. Na + /K + -pumpen virker både s<strong>om</strong> en ionpumpe og s<strong>om</strong> et enzym, dvs. en katalysator, s<strong>om</strong><br />
<strong>om</strong>sætter cellens kemiske brændstof ATP (adenosin-trifosfat) til den energi, der medgår til at<br />
pumpe 3 natriumioner (Na + ) ud af cellen og 2 kaliumioner (K + ) ind i cellen for hvert ATP molekyle,<br />
der hydrolyseres. Na + /K + -pumpen findes udelukkende hos dyreceller, og den er livsvigtig for<br />
opretholdelse af et konstant volumen. Hvis vand trænger ind i cellen, og den derved svulmer,<br />
sprænges cellen, da den ’bløde’ cellemembran ikke kan modstå et overtryk. Dette er i modsætning<br />
til planteceller, der udenpå cellemembranen har en cellulose cellevæg, s<strong>om</strong> kan modstå meget store<br />
overtryk i cellen.<br />
Hvordan snakker proteinerne og membranen sammen?<br />
En vigtig bestanddel af membranen er lipider, der er såkaldt amfifile molekyler, dvs. at de i den ene<br />
ende tiltrækkes af vand (de er hydrofile, − de elsker vand), og i den anden ende er de s<strong>om</strong> olie, der<br />
skyr vand (de er hydrofobe, − vandskyende). Det er derfor, at de i vand helt af sig selv slutter sig<br />
sammen i lipiddobbeltlag, s<strong>om</strong> kan danne lukkede kugleskaller med vand på begge sider. Sådanne<br />
lukkede skaller kaldes lipos<strong>om</strong>er. Et lipos<strong>om</strong> er den simpleste model af en celle, s<strong>om</strong> dog ikke kan<br />
udføre andre <strong>funktion</strong>er end at holde det indre adskilt fra det ydre.
Fordi det indre af lipiddobbeltlaget er s<strong>om</strong> olie, er det meget vanskeligt for specielt<br />
vandopløselige stoffer, s<strong>om</strong> for eksempel uorganiske salte med natrium- eller kaliumioner, at<br />
trænge gennem laget. Af samme grund skal proteiner og specielt ionkanaler og ionpumper have en<br />
helt særlig opbygning for at kunne befindes sig indlejret i membraner: de skal have et midterstykke,<br />
s<strong>om</strong> er olieagtigt, men med ender, s<strong>om</strong> er opløselige i vand. Vi siger, at membranproteinerne er<br />
hydrofobisk tilpasset lipidmembranen.<br />
Denne hydrofobe tilpasning udgør en slags mekanisme, med hvilken membranen og<br />
de indlejrede proteiner gensidig kan påvirke hinanden. Vi taler <strong>om</strong> lipid-protein vekselvirkninger.<br />
Der er mange andre mekanismer; for eksempel kan proteinerne have en ge<strong>om</strong>etrisk form eller<br />
elektriske ladninger, s<strong>om</strong> påvirker lipiderne og dermed membranen. Lipid-proteinvekselvirkninger<br />
er af stor betydning for proteinernes <strong>funktion</strong>er. På den ene side kan ændringer i lipidmembranen,<br />
der for eksempel skyldes kemiske stoffer (bl.a. visse lægemiddelstoffer) eller ydre påvirkninger<br />
(bl.a. stress og surhedsgrad), medvirke til, at proteinets <strong>funktion</strong> påvirkes. På den anden side kan<br />
proteinet, mens det udfører sin <strong>funktion</strong>er, påvirke lipidmembranen, for eksempel hvis proteinet<br />
ændrer form eller hydrofob tilpasning.<br />
Modeller viser vejen<br />
I et forsøg på at afklare, hvordan proteiner og lipidmembraner gensidigt påvirker hinanden, bruger<br />
forskerne forskellige modelsystemer, s<strong>om</strong> er tilstrækkeligt simple til, at man kan foretage<br />
kvantitative målinger af lipid-proteinvekselvirkningerne, men samtidig tilstrækkeligt realistiske til,<br />
at de kan lede til ny indsigt. Et sådant lipid-protein modelsystem er lipos<strong>om</strong>er opbygget af nogle få<br />
forskellige slags lipidmolekyler, der kan danne lipos<strong>om</strong>er. I disse lipos<strong>om</strong>er indbygges så proteiner,<br />
s<strong>om</strong> opremses fra levende celler.<br />
Det er muligt at oprense Na + /K + -pumper fra forskellige celle- og vævstyper. Her<br />
benytter vi os af, at naturen allerede har opkoncentreret Na + /K + -pumper i visse væv og organer. Det<br />
gælder f.eks. hjerne og nyre, der er meget rige på Na + /K + -pumper (meget aktive organer). Vi bruger<br />
også saltkirtler fra pighajer, der hjælper hajen med at k<strong>om</strong>me af med det NaCl, den indtager, når<br />
den har spist. Saltkirtlerne er på størrelse med en lillefinger og indeholder næsten 50% Na + /K + -<br />
pumper. Disse proteiner kan indbygges i små lipos<strong>om</strong>er bestående af to slags lipidmolekyler, hvoraf<br />
den ene slags er kolesterol, s<strong>om</strong> er en vigtig k<strong>om</strong>ponent i alle cellemembraner. Lipos<strong>om</strong>erne er ca.<br />
100nm i diameter, og man kan ved biokemiske analyser vise, at pumperne forsat er enzymatisk<br />
aktive i lipos<strong>om</strong>erne. Disse små lipos<strong>om</strong>er, s<strong>om</strong> er meget mindre end, hvad man kan se i et<br />
lysmikroskop, kan nu tvinges til at smelte sammen i meget store lipos<strong>om</strong>er ved at udsætte dem for<br />
svingende elektriske felter. Hermed dannes kæmpestore lipos<strong>om</strong>er, s<strong>om</strong> typisk er 20-40µm i<br />
diameter og derfor synlige i et lysmikroskop.<br />
Det er meget småt og hele tiden i bevægelse<br />
Problemet med at studere ting, s<strong>om</strong> er meget små, for eksempel molekyler og ultratynde<br />
lipidmembraner, er, at de hele tiden er i bevægelse. Molekylerne udfører, hvad vi kalder Brownske<br />
bevægelser, s<strong>om</strong> skyldes, at vandmolekyler hele tiden støder ind i dem, så proteinerne k<strong>om</strong>me til at<br />
opføre en tilfældig dans. Desuden er lipidmembraner ofte så bløde, at de også k<strong>om</strong>mer til at udføre<br />
en slags Brownske bevægelser. De ændrer simpelthen form på en tilfældig måde, når<br />
vandmolekylerne støder ind i dem. Disse tilfældige bevægelser er mere volds<strong>om</strong>me, jo højere<br />
temperaturen er.<br />
Det kan derfor synes s<strong>om</strong> en stor ulempe for næremere studier, at membranerne<br />
udfører disse uregelmæssige, såkaldt termiske bevægelser. Imidlertid kan man udnytte de termiske<br />
bevægelser til at lære noget <strong>om</strong> membranernes mekaniske egenskaber. Ved at analysere, hvorledes<br />
lipos<strong>om</strong>erne ændrer form gennem tiden, kan man for eksempel bestemme membranens stivhed.<br />
2<br />
Bouvrais, Cornelius, Ipsen & Mouritsen: <strong>Membranen</strong> <strong>sladrer</strong> <strong>om</strong> <strong>membranpumpers</strong> <strong>funktion</strong>
Stivheden er et udtryk for, hvor meget energi, der skal til for at deformere membranen. Lipos<strong>om</strong>er,<br />
der fluktuerer meget i form, er bløde, hvorimod lipos<strong>om</strong>er, s<strong>om</strong> fluktuerer meget lidt og næsten er<br />
perfekt kugleformede hele tiden, er stive.<br />
Vi skal nu se på, hvordan man ved analyse af lipos<strong>om</strong>ers termiske fluktuationer kan<br />
lære noget <strong>om</strong>, hvordan Na + /K + -pumper påvirker membranen, mens de pumper ioner over<br />
membranen. Desuden skal vi se, at denne analyse afslører, at membranerne <strong>sladrer</strong> <strong>om</strong> pumperne.<br />
Vi kan helt uden at studere pumperne direkte alligevel kan lære <strong>om</strong> deres <strong>funktion</strong> ved at lave<br />
eksperimenter, der afslører, hvordan aktive pumper påvirker membranens stivhed og<br />
fluktuationsmøster i tid og rum. Disse eksperimenter er for nemheds skyld udført under forhold,<br />
hvor Na + /K + -pumpen kun pumper natriumioner over membranen, dvs. ekstracellulært K + erstattes<br />
af Na + .<br />
Hvad membranernes fluktuationer fortæller<br />
Eksperimenterne er i princippet simple, men dog teknisk meget krævende både i laboratoriet og<br />
specielt i den efterfølgende matematiske analyse af de eksperimentelle data. For at lykkes kræver et<br />
sådant projekt et tæt samarbejde mellem på den ene side teoretiske fysikere og på den anden side<br />
eksperimentelle fysisk-kemikere og biokemikere med forstand på enzymers <strong>funktion</strong>.<br />
Fremgangsmåden <strong>om</strong>fatter sammenlignende studier af (1) lipos<strong>om</strong>er uden pumper, (2)<br />
lipos<strong>om</strong>er med pumper s<strong>om</strong> ikke er aktive, dvs. uden ATP tilstede, og (3) lipos<strong>om</strong>er med pumper,<br />
s<strong>om</strong> er aktive pga. tilstedeværelsen af ATP.<br />
Det første resultat viser, at membranernes fluktuationer ikke er forskellige uden<br />
pumper i forhold til med pumper, s<strong>om</strong> ikke er aktive. Det betyder, at ved de meget små<br />
koncentrationer af pumper, vi benytter, er membranens stivhed ikke ændret. Men så snart pumperne<br />
aktiveres ved at tilsætte ATP, ændrer lipos<strong>om</strong>ets fluktuationer sig. Ændringen kan ikke observeres<br />
med det blotte øje i mikroskopet, men den matematiske analyse viser det tydeligt: membranerne<br />
bliver <strong>om</strong>kring 30% blødere.<br />
Tilsyneladende har den aktive pumpe, mens den pumper ioner hen over membranen,<br />
en effekt på membranen, muligvis fordi Na + /K + -pumpen ændrer form,. Disse formændringer vil så<br />
mekanisk påvirke lipidmolekylerne i membranen, s<strong>om</strong> derved bliver mere uordnet og blød.<br />
Samtidig sker der noget meget overraskende med det tidslige forløb af<br />
membranfluktuationerne. De bliver meget stærkere korreleret, dvs. membranen synes at have en<br />
huk<strong>om</strong>melse gennem længere tid <strong>om</strong>, hvad den foretog sig tidligere. Sådanne tidsmæssige<br />
korrelationer kan analyseres matematisk og føre til tal for, hvad der er karakteristiske tider, såkaldt<br />
tidskonstanter, for det observerede fæn<strong>om</strong>en. Disse tidskonstanter er normalt afhængige af detaljer,<br />
for eksempel lipos<strong>om</strong>ets størrelse og graden af indre spændinger i lipos<strong>om</strong>et. Men det har vist sig,<br />
at der i analysen af mange forskellige lipos<strong>om</strong>er med indbyggede aktive pumper fremk<strong>om</strong>mer en<br />
tidskonstant, s<strong>om</strong> er robust og ikke afhænger af detaljer ved det aktuelle lipos<strong>om</strong>.<br />
Den fundne tidskonstant er <strong>om</strong>kring 0,5sec. Det er lidt af et mirakel, at det praktisk<br />
har vist sig muligt at isolere en sådan robust tidsskala for et så k<strong>om</strong>plekst eksperiment, der her er<br />
tale <strong>om</strong>. Det var umuligt at kunne sige noget <strong>om</strong> på forhånd. Det kunne lige så godt have vist sig, at<br />
systemets mekaniske egenskaber ikke kunne afsløre netop denne tidsskala. Spørgsmålet er så, hvad<br />
de 0,5sec fortæller os <strong>om</strong>.<br />
<strong>Membranen</strong> <strong>sladrer</strong><br />
For at svare på det spørgsmål skal vi have fat i den viden, s<strong>om</strong> biokemikere, der har arbejdet med<br />
Na + /K + -pumpen gennem mange år, har erfaret ved analyse af pumpen s<strong>om</strong> et enzym. Deres arbejde<br />
viser, at det langs<strong>om</strong>ste, og dermed tidsbegrænsende trin i den reaktionscyklus, s<strong>om</strong> pumpen<br />
gennemgår, <strong>om</strong>fatter afgivelsen af en fosfatgruppe. Dette trin kan man ved biokemiske forsøg vise<br />
Bouvrais, Cornelius, Ipsen & Mouritsen: <strong>Membranen</strong> <strong>sladrer</strong> <strong>om</strong> <strong>membranpumpers</strong> <strong>funktion</strong><br />
3
er karakteriseret af en tidsskala på <strong>om</strong>kring 0,4sec, dvs. meget tæt på det, s<strong>om</strong><br />
membranfluktuationerne rapporterer <strong>om</strong>. Det er derfor nærliggende at slutte, at netop dette trin, s<strong>om</strong><br />
også fra strukturelle studier vides at <strong>om</strong>fatte en ændring af pumpens molekylære form, er det, der er<br />
ansvarlig for ændringer i membranens fluktuationer.<br />
Hermed har vi lært noget <strong>om</strong> en molekylær egenskab ved et k<strong>om</strong>plekst molekyle, dvs.<br />
noget der karakteriserer den mikroskopiske verden, ved med biofysiske teknikker at studere<br />
fluktuationer og mekanik af en membran, dvs. noget der karakteriserer den makroskopiske verden.<br />
Det er en dyb viden.<br />
Nu kunne man så sige, at vi har fundet et resultat, man kendte i forvejen. Men<br />
perspektiverne af dette resultat er selvfølgelig, at man på denne baggrund kan gå videre og studere<br />
Na + /K + -pumpen med de biofysiske teknikker under <strong>om</strong>stændigheder, hvor man ikke kender<br />
resultatet, for eksempel for pumper, s<strong>om</strong> er defekte (ved visse sygd<strong>om</strong>me), eller s<strong>om</strong> er påvirket af<br />
lægemiddelstoffer (for eksempel kemoterapeutiske stoffer). Endelig foreligger der den mulighed at<br />
bruge membranfluktuationer til at studere <strong>funktion</strong>en af membranproteiner, <strong>om</strong> hvis <strong>funktion</strong> vi<br />
endnu ingen viden har.<br />
4<br />
Bouvrais, Cornelius, Ipsen & Mouritsen: <strong>Membranen</strong> <strong>sladrer</strong> <strong>om</strong> <strong>membranpumpers</strong> <strong>funktion</strong>
Om forfatterne<br />
Hélène Bouvrais er PhD og postdoc ved Institut de Génétique et Développement de Rennes<br />
(IGDR), Rennes, Frankrig<br />
Tel: +33 2 23 23 47 16<br />
E-mail: helene.bouvrais@univ-rennes1.fr<br />
Flemming Cornelius er dr.scient. og lektor i biofysik ved Institut for Bi<strong>om</strong>edicin-Fysiologi og<br />
Biofysik, Aarhus Universitet<br />
Tel: 8716 7746<br />
E-mail: fc@biophys.au.dk<br />
John H. Ipsen er PhD og lektor i fysik ved Institut for Fysik, Kemi og Farmaci, Syddansk<br />
Universitet<br />
Tlf.: 6550 2560<br />
E-mail: ipsen@memphys.sdu.dk<br />
Ole G. Mouritsen er dr. scient. og professor i biofysik ved Institut for Fysik, Kemi og Farmaci,<br />
Syddansk Universitet.<br />
Tlf.: 6550 3528<br />
E-mail: ogm@memphys.sdu.dk<br />
Vil du vide mere<br />
Bouvrais, Cornelius, Ipsen & Mouritsen: <strong>Membranen</strong> <strong>sladrer</strong> <strong>om</strong> <strong>membranpumpers</strong> <strong>funktion</strong><br />
5
Bouvrais H, F Cornelius, JH Ipsen & OG Mouritsen. 2012. Intrinsic reaction-cycle time scale of<br />
Na + ,K + -ATPase manifests itself in the lipid-protein interactions of non-equilibrium membranes.<br />
Proc. Natl. Acad. Sci. USA XX, xxxx-xxxx.<br />
Forslag til forsideillustration<br />
Fluktuerende lipos<strong>om</strong> (diameter = 35µm) med aktive Na + /K + -pumper. Fluktuationerne skyldes<br />
Brownske bevægelser. (Grafik: Jonas Drotner Mouritsen)<br />
Figur<br />
6<br />
Bouvrais, Cornelius, Ipsen & Mouritsen: <strong>Membranen</strong> <strong>sladrer</strong> <strong>om</strong> <strong>membranpumpers</strong> <strong>funktion</strong>
Cellemembraner består af forskellige fosfolipider (runde hoveder med to haler) arrangeret i et<br />
dobbeltlag, polysaccharider (grønne grene) og membranproteiner (sorte klumper). Cellemembraner<br />
indeholder typisk tusinder af forskellige slags lipid- og proteinmolekyler. På indersiden af<br />
membranen findes et polymerskelet, s<strong>om</strong> giver cellen form (røde slanger).<br />
Figur<br />
Lipidmolekyler er amfifile molekyler, s<strong>om</strong> har vandopløselige hoveder (runde kugler) og i dette<br />
tilfælde to fedtopløselige haler (fedtsyrer). Lipider i vand danner spontant lipiddobbeltlag, s<strong>om</strong> er<br />
membraner, der kun er ca. 5nm tykke. Dobbeltlagene lukker <strong>om</strong>kring sig selv og kan danne såkaldte<br />
vesikler eller lipos<strong>om</strong>er, der er små kugleskaller af lipider med vand på begge sider. I disse skaller<br />
kan man indbygge <strong>funktion</strong>elle membranproteiner, fx Na + /K + -pumper.<br />
Bouvrais, Cornelius, Ipsen & Mouritsen: <strong>Membranen</strong> <strong>sladrer</strong> <strong>om</strong> <strong>membranpumpers</strong> <strong>funktion</strong><br />
7
Figur<br />
Skitse af lipos<strong>om</strong> med indbyggede Na + /K + -pumper. Lipos<strong>om</strong>ets membran består af fosfolipider<br />
(gul) og kolesterol (rød). Pumpen kan enten være orienteret s<strong>om</strong> i cellen med ydersiden udad<br />
(right-side out, r-o) eller modsat (inside out, i-o). Ved at tilsætte ATP (adenosin-trifosfat) til<br />
ydermediet aktiveres alene i-o pumperne, hvor bindingstedet for ATP er eksponeret til ydersiden.<br />
ATP nedbrydes herved til ADP (adenosin-difosfat) og uorganisk fosfor (Pi). Hvis der er Mg 2+ , Na +<br />
og K + til stede, vil i-o pumperne transportere Na + ind i lipos<strong>om</strong>et og K + ud af lipos<strong>om</strong>et, modsat i<br />
cellen. ATP er et hydrofilt molekyle, og det kan derfor ikke kan trænge ind i lipos<strong>om</strong>et.<br />
Figur<br />
Mikroskopibilleder af et stort lipos<strong>om</strong> (diameter = 42µm), s<strong>om</strong> består af et lipiddobbeltlag, hvori<br />
der er indbygget Na + /K + -pumper. Lipos<strong>om</strong>et er observeret på seks forskellige tidspunkter med 40<br />
mikrosekunders interval. Da lipiddobbeltlaget kun er 5nm tykt, kan man ikke se selve laget, men<br />
kun kontrasten af <strong>om</strong>ridset. Tilsvarende er proteinerne alt for små til at kunne ses i et lysmikroskop.<br />
Lipos<strong>om</strong>et fluktuerer i form på grund af Brownske bevægelser, s<strong>om</strong> skyldes, at vandmolekylerne,<br />
s<strong>om</strong> diffunderer tilfældigt rundt, bestandig bumper ind i lipidmembranen. Når pumperne bliver<br />
aktive ved tilstedeværelse af ATP, forstærkes fluktuationerne, s<strong>om</strong> kan måles ved detaljerede<br />
analyser af lipos<strong>om</strong>ets <strong>om</strong>rids, og hvordan det varierer gennem tiden.<br />
8<br />
Bouvrais, Cornelius, Ipsen & Mouritsen: <strong>Membranen</strong> <strong>sladrer</strong> <strong>om</strong> <strong>membranpumpers</strong> <strong>funktion</strong>