Jahresbericht 2012 - Institut für Pathologie - Universität Bern

Institut für Pathologie
www.pathology.unibe.ch
Jahresbericht 2012

2 Institut für Pathologie

Institut für Pathologie > Inhalt 3
>>> Inhalt
Editorial 5
Dienstleistung 6
1 Klinische Pathologie 7
1.1 Histopathologie 7
1.2 Autopsie 8
1.3 Neuropathologie 9
2 Molekularpathologie 10
2.1 Molekularpathologie 10
2.2 Immunhistochemie 11
2.3 FISH 13
3 Zytopathologie 13
4 Fachgruppen der Klinischen Pathologie 15
5 Dienstleistungsstatistiken 16
Forschung 18
1 Forschungsberichte 19
1.1 Abteilung für Experimentelle Pathologie 19
1.2 Translationale Forschung 29
(Translational Research Unit – TRU)
2 Akademische Grade 34
2.1 intern 34
2.2 extern 34
3 Publikationen 35
3.1 Originalarbeiten In-House 35
3.2 Originalarbeiten Kollaborationen 36
3.3 Übrige Publikationen 38
4 Vorträge 39
5 Zuschüsse 41
6 Preise, Ernennungen, Auszeichnungen 41
7 Patente 41
Lehre 42
1 Ausbildung 43
2 Weiterbildung 43
3 Fortbildung 43
Im Fokus 46

4 Institut für Pathologie > Geschäftsleitung, Organigramm
Von links nach rechts: Prof. A. Perren, Institutsleiter; Prof. Ch. Müller, PhD, Leiter Experimentelle Pathologie; G. Suter, Klinikmanager;
Prof. A. Lugli, Leiter Klinische Pathologie.
Institut für Pathologie
Prof. A. Perren
Sekretariat C. Wirz
Lehre
Forschung
Dienstleistung
Koordination
Prof. Ch. Müller
PD Dr. R. Langer
Experimentelle
Pathologie
Prof. Ch. Müller
Translational
Research Unit
Prof. A. Perren
Koord. PD Dr. I. Zlobec
Molekularpathologie
PD Dr. E. Vassella
Prof. A. Perren
Klinische
Pathologie
Prof. A. Lugli
Zytopathologie
Dr. A. Schmitt
Zentrale Dienste
G. Suter
Informatik
Dr. A. Kappeler
Medizinstudium
Immunpathologie
1
Prof. Ch. Müller
Endokrine
Pathologie
Prof. A. Perren
Immunhistochemie
Labor
Dr. A. Kappeler
Histopathologie
Dr. C. Tapia
Zytopathologie
Dr. A. Schmitt
Informatik,
Imaging
Master Medizin
Doktoranden
Medizin
Immunpathologie
2
PD Dr. N. Corazza
Viszerale
Pathologie
Prof. A. Lugli
PCR-Labor
PD Dr. E. Vassella
Autopsie
Prof. A. Fleischmann
Sekretariat
U. Hack
Personalwesen
Studium
phil. nat.
Master phil. nat.
Doktoranden
phil. nat.
Immunpathologie
3
Dr. P. Krebs
Entzündungspathologie
Prof. V. Niggli
Brust- u. Gynäkopathologie
Dr. C. Tapia
Uropathologie
Prof. A. Fleischmann
FISH-Labor +
Elektronenmikroskopie
PD Dr. E. Vassella
Neuropathologie
Dr. I. Vajtai
Labor
Dr. B. Leuenberger
Labor
B. von Gunten
Empfang
Hausdienst,
Technik
Tumorpathologie
1
Prof. J.-C. Reubi
Lungenpathologie
Dr. S. Schäfer
Sekretariat,
Archiv
Dr. St. Schäfer
Materialverwaltung
Tumorpathologie
2
PD Dr. M. Tschan
Neuropathologie
Dr. I. Vajtai
Debitorenbuchhaltung
Tumorpathologie
3
PD Dr. E. Vassella
Hämatopathologie
Dr. Y. Banz

Institut für Pathologie > Editorial 5
>>> Editorial
Liebe Leserin, lieber Leser
Ich freue mich, dass Sie sich die Zeit nehmen, einen Blick in
den Jahresbericht des Institutes für Pathologie der Universität
Bern zu werfen.
Unser Ärzteteam ist nach dem Prinzip der Soft-Spezialisierung
in Fachgruppen eingeteilt, welche auf Seite 15 aufgelistet
sind. Im Jahr 2012 hat die Fachgruppe Gynäkopathologie
unter der Leitung von Frau Dr. Coya Tapia als Partner des Inselspitals
die Zertifizierung als Mamma-/Gynäkoonkologisches
Zentrum erfolgreich abgeschlossen.
Für uns als Institut für Pathologie steht der Dienst an unserem
Kunden im Mittelpunkt. Zur Verbesserung unserer Durchlaufzeiten
haben wir im Laborbereich der Abteilung Klinische
Pathologie 2012 das Projekt der Betriebsoptimierung nach
«Lean Management»-Prinzipien abgeschlossen. Der Übergang
der gesamten Labortätigkeiten in einen 1-Stunden-Takt hat zu
einer kompletten Neuorganisation des Labors einerseits, aber
auch der ärztlichen Tätigkeit am Mikroskop und der Sekretariate
andererseits geführt. Diese Umstellung des Ablaufes,
zusammen mit der Einführung einer modernen Schnellentwässerung
mit einem Sakura-Xpress-Automaten, hat zu einer
deutlichen und konstanten Reduktion unserer Turnaround-
Zeit geführt: Unsere Operationspräparate haben wir jetzt im
Schnitt in weniger als zwei Tagen mit einem Erstbericht beurteilt.
Details zu diesem grossen Projekt finden Sie im letzten
Abschnitt «Im Fokus».
Was zu einer weiteren Verkürzung der Übermittlungszeit der
Befunde beiträgt, ist die seit einem Jahr angebotene Befundübermittlung
mittels gesicherter E-Mail (HIN). Mit der Chirurgischen
Klinik des Inselspitals haben wir jetzt den ersten
grossen Kunden, der von diesem Service Gebrauch macht, und
durchgehend positive Rückmeldungen. Gestützt auf unser
neues Pathologiesystem PathoWin+, haben wir auch die Prozesse
in der Abrechnung optimieren können. So werden jetzt
die Rechnungen bereits zwei Wochen nach Abschluss des
Berichtes an die Spitäler und Patienten versandt.
Als «Nebenprodukt» der Lean-Optimierung haben wir Platzressourcen
freispielen können, welche jetzt unserer neu gegründeten
Translational Research Unit (TRU) zur Verfügung
stehen. Hier werden für klinische und translationale Projekte
gewebebasierte Untersuchungen durchgeführt. Als erstes
Labor in Europa verfügt unsere TRU über einen Roboter zur
Konstruktion von «tissue microarrays» (TMAs). Dieser Roboter
wird sowohl für die Konstruktion von TMAs für unsere Forschungsprojekte
als auch für externe Kunden im Rahmen des
Projektes «next generation TMA» (www.ngtma.com) eingesetzt.
Es ist möglich, von extern über virtuelle Mikroskopie
Annotationen zu setzen. Aus den uns zugesandten Blöcken
kann die Abteilung für TRU dann gemäss Auftrag TMAs durch
den Roboter stanzen lassen.
Die Abteilung Experimentelle Pathologie wurde 2012 durch
PD Dr. Mario Tschan als Gruppenleiter verstärkt. Er bringt ein
breites Wissen und Methodenspektrum mit den Schwerpunkten
Autophagie und miRs ins Institut für Pathologie.
Auch in der Lehre haben wir mittels Digitalisierung von Histologieschnitten
einen weiteren Meilenstein erreicht. Im Herbstsemester
2012 haben wir zum ersten Mal unsere Histologiekurse
den Studierenden nicht nur mittels Präparaten auf Glas,
sondern auch mittels virtueller Schnitte zur Verfügung gestellt.
Somit kann jeder Student, von jedem PC aus, weltweit
histologische Schnittpräparate virtuell mikroskopieren und
sich auf die Kurse vorbereiten.
Für 2013 steht im Bereich der Klinischen Pathologie ein Jahr
der Konsolidierung an. Die Lean-Optimierung wird in den
Labors Molekularpathologie und Immunhistochemie fortgesetzt,
sodass wir auch in diesen Bereichen unseren Service
in Zukunft weiter verbessern können.
Im vorliegenden Jahresbericht sind die wichtigsten Ereignisse
und Kennzahlen unseres Institutes aufgeführt. Weitere Informationen
finden Sie auf unserer Website www.pathology.
unibe.ch.
Ich wünsche Ihnen viel Vergnügen bei der Lektüre.
Ihr Aurel Perren

6 Institut für Pathologie > Dienstleistung

Institut für Pathologie > Dienstleistung 7
>>> Dienstleistung
1 Klinische Pathologie
Abteilungsleiter: Prof. Dr. med. Alessandro Lugli
1.1 Histopathologie
Leiter: Dr.med. Coya Tapia
Die Abteilung Klinische Pathologie ist organisatorisch in drei
Einheiten (Ärzteschaft, Labor und Befundsekretariat/Archiv)
unterteilt.
Die Ärzteschaft ist nach Fachgebieten strukturiert. Jeweils
2–5 Fachärztinnen und Fachärzte sind einem Spezialgebiet
zugeordnet und sind Hauptansprechpersonen für die klinischen
Partner. Im Sinne des Prinzips der Soft-Spezialisierung
diagnostiziert jede Fachärztin und jeder Facharzt auf dem
gesamten Gebiet der Pathologie. Schwierige Fälle und alle
malignen Befunde werden nach dem Vieraugenprinzip einem
Fachgruppenvertreter gezeigt. Diese vertreten die Pathologie
an den zahlreichen wöchentlichen und zweiwöchentlichen
Tumorboards/Fallbesprechungen innerhalb und ausserhalb
des Inselspitals. Die Fachgruppen arbeiten ebenfalls auf den
Gebieten der Lehre und Forschung, indem das Fachwissen
durch Analyse der aktuellen Literatur sowie durch das Besuchen
nationaler und internationaler Kongresse auf dem neuesten
Stand gehalten wird. Die angewandte Forschungstätigkeit
der Ärzte in ihren Fachgebieten wird organisatorisch
und technologisch durch die Einheit «Translational Research
Unit (TRU)» unterstützt.
Im Labor der Klinischen Pathologie wurden im Jahre 2012
33 805 Einsendungen aus 61 015 Lokalisationen untersucht.
Neben der diagnostischen Tätigkeit wurden gemäss Lean-
Prinzip die Arbeitsprozesse im gesamten Labor sowie die
Schnittstellen zur Ärzteschaft und zum Befundsekretariat
optimiert. Insbesondere wurde die Gewebeverarbeitung
durch die Einführung der neuen Entwässerungsmaschine Sakura-Xpress
und eine Taktung sämtlicher Prozesse im Stundenrhythmus
deutlich beschleunigt. Für die optimale Koordination
der KPath-Arbeitsprozesse ist ein neu geschaffener Stab
verantwortlich, welcher aus 7 Mitgliedern besteht (Leiter
KPath, Sekretärin KPath, 3 Vertreter der Ärzteschaft, Laborleiter
und Befundssekretariatsleiterin). Die Durchlaufzeiten für
Biopsien konnten dadurch im Schnitt weiter auf 34 Stunden
und für die Klein- und Grossexzidate auf 48 Stunden gesenkt
werden. Die Zeit für die durchgeführten 1792 Schnellschnitte
betrug im Schnitt 19,5 Minuten pro Patient. Im Rahmen des
Ziels, die Durchlaufzeiten für Biopsien auf 24 Stunden und
für Operationspräparate auf 48 Stunden weiter zu senken,
sind folgende Projekte für das Jahr 2013 definiert worden:
1) Reorganisation der Arbeitsplätze für das Befundsekretariat/
Archiv und die Assistenzärzteschaft nach dem 5-S-Prinzip
(Sortieren, Setzen und Anordnen, Sauberkeit, Standardisierung,
Selbstdisziplin); 2) Einführung von vier professionell
ausgestatteten Diagnostikräumen mit dem Ziel, die Dienstleistung
von den Tätigkeiten in Forschung und Lehre zu entflechten,
die Kommunikation zu steigern und die Aus- und
Weiterbildung weiter zu optimieren.
TAT (h) = turnaround time (Durchlaufzeit)
100
90
80
70
60
50
40
30
0
➊
10
➋
20
30
➌
➊ Beginn der TAT-Messung nach Einführung Lean-Management (11.2011)
➋ Neue Führungsstruktur Labor (01.2012)
➌ Einsatz Sakura-Xpress im Routinebetrieb (04.2012)
40
Mittlere TAT
50
60
70 Wochen
51
Xpress 34 Blöcke A , S Färben Ausgabe
Xpress 34 Blöcke A , S Färben Ausgabe
Fixator
Xpress 34 Blöcke A , S Färben Ausgabe
Xpress 34 Blöcke A , S Färben Ausgabe
Fixator
Xpress 34 Blöcke A , S Färben Ausgabe
Fixator
Xpress 34 Blöcke A , S Färben Ausgabe
Fixator
Xpress 34 Blöcke A , S Färben Ausgabe
Fixator
Xpress 34 Blöcke A , S Färben Ausgabe
6.00 7.00 8.00 9.00 10.00 11.00 12.00 13.00 14.00 15.00 16.00 17.00 18.00
10 min
10 min
10 min
10 min
10 min
10 min
10 min
10 min
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10 min
10 min
10 min
10 min
10 min
10 min
10 min
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10 min
10 min
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10 min
10 min
10 min
10 min
10 min
10 min
10 min
10 min
10 min
10 min
10 min
10 min
10 min
10 min
10 min
10 min
10 min
10 min
10 min
10 min
10 min
10 min
10 min
10 min
10 min
10 min
10 min
10 min
10 min
10 min
10 min
10 min
10 min
10 min
10 min
10 min
10 min
10 min
10 min
10 min
10 min
10 min
10 min
10 min
10 min
Work-Load-Exzisate Xpress

8 Institut für Pathologie > Dienstleistung
1.2 Autopsie
Leiter: Prof. Dr. med. Achim Fleischmann
Im Jahr 2012 konnten wir erstmals seit 7 Jahren die Autopsierate
wieder steigern. Es wurden 195 Autopsien durchgeführt,
was einer Steigerung von 15% gegenüber dem Vorjahr entspricht.
Über die Ursache hierfür kann nur spekuliert werden,
allerdings dürften die verbesserte Qualität der Autopsieberichte,
eine schnellere Befundmitteilung und zahlreiche von
uns in verschiedenen kantonalen Spitälern gehaltene Vorträge
über «Sinn und Nutzen von Autopsien» hierzu beigetragen
haben. Zudem stossen die von uns regelmässig an auswärtigen
Spitälern durchgeführten klinisch-pathologischen Konferenzen
bei den klinischen Kunden auf grosses Interesse und sensibilisieren
für die Qualitätssicherung durch die Autopsie.
Die Autopsieberichte sind nun den Bedürfnissen unserer
Kunden stärker angepasst und gruppieren die autoptisch erfassten
Erkrankungen nach ätiologischen und pathophysiologischen
Gesichtspunkten. Die vorläufigen Autopsieberichte
werden mittlerweile innerhalb von wenigen Arbeitstagen
versandt, der Zeitgewinn bei den definitiven Berichten ist
noch nicht signifikant. Die in der Regel beigelegte Fotodokumentation
der autoptischen Befunde wird von den Klinikern
sehr geschätzt.
Als einziges Institut in der Schweiz bieten wir im Rahmen
der Herzsektion die histologische Aufarbeitung von Stents
in Herzkranzgefässen an. Diese Möglichkeit kann sowohl in
klinischen Sektionen wie auch im Rahmen von mehreren
Forschungskooperationen mit dem Inselspital deutliche Vorteile
bieten.
400
350
300
250
200
150
100
2000 2002 2004 2006 2008 2010 2012
Anzahl der durchgeführten Autopsien von 2000 bis 2012.

Institut für Pathologie > Dienstleistung 9
1.3 Neuropathologie
Leiter: Dr. med. Istvan Vajtai
Mit 1110 neurochirurgischen Biopsien und Resektaten von
864 PatientInnen, 266 intraoperativen Schnelluntersuchungen
sowie 78 Muskel- und Nervenbiopsien verzeichnete der intra
vitam diagnostische Eingang der Arbeitsgruppe einerseits auf
hohem Niveau stabile Anzahl von Proben. Hervorzuheben ist,
andererseits, ein sehr markanter Zuwachs hirnautoptischer
Untersuchungsaufträge (132) – einschliesslich zahlreicher
forensisch-neuropathologischer Konsilien – im Vergleich zum
Vorjahr: Diese Entwicklung spiegelt eine steigende favorable
Wahrnehmung der neuropathologischen Autopsie als integraler
Bestandteil der klinischen Diagnostik und der Qualitätssicherung
wider. Die diagnostische Leistungsfähigkeit
der Gruppe wurde und wird aktiv gefördert durch die aktuell
in der Organisationsphase befindliche Einrichtung einer zusätzlichen,
geteilten Facharztstelle im Rahmen der «Allianz
Bern-Basel» sowie die Aufnahme einer strukturierten Neuropathologierotation
(Kategorie A) in das Curriculum der hausinternen
Facharztausbildung.
Auf der wissenschaftlichen Ebene stellt die organisatorische
Einbindung der neuropathologischen Subspezialität in die
2011 gegründete «Translationale Forschungseinheit» (Translational
Research Unit/TRU) eine wesentliche Neuerung dar.
Die Partizipation an dieser sowohl innerhalb des Instituts als
auch extramural intensiv vernetzten wissenschaftlichen Plattform
bietet einerseits einen transparenten Zugang zum verfügbaren
technischen Instrumentarium («Facilities»), andererseits
ermöglichen die von der TRU koordinierten Forschungstreffen,
Komplementaritäten zwischen den Interessen bzw.
dem jeweiligen Fachwissen der einzelnen Gruppen – so auch
der Neuropathologie – aufzudecken.
Die wissenschaftlich-publizistische Tätigkeit der Gruppe (siehe
Publikationsliste) ist klinisch-pathologisch ausgerichtet und
befasst sich mit der integrativen Charakterisierung (mittels
Immunhistochemie, Elektronenmikroskopie sowie Molekulargenetik)
besonders komplexer – und infolge ihrer Seltenheit
schwer zugänglicher – Entitäten. Hinzu kommen Beiträge
zu Forschungsprojekten von Partnerinstituten auf dem
Gebiet der angewandten Nanowissenschaft (Institut für
Angewandte Physik der Universität Bern), der zerebrovaskulären
Erkrankungen (Neurologische Universitätsklinik und
Departement für Diagnostische und Interventionelle Neuroradiologie,
Inselspital) sowie der neurochirurgisch-bioptischen
Lokalisatonstechnik (Neurochirurgische Universitätsklinik,
Inselspital).
Auf dem Gebiet der fachspezifischen Weiterbildung bzw. der
biomedizinisch-technischen Lehre engagierte sich die Neuropathologie
als Gastgeberin der «Session Around the Microscope»
der Schweizerischen Gesellschaft für Neuropathologie
sowie als federführende Referentin des «Neuropathologie-
Workshops» von SwissHistotech.

10 Institut für Pathologie > Dienstleistung
2 Molekularpathologie
2.1 Molekularpathologie
Wissenschaftlicher Leiter: PD Dr. pharm. Erik Vassella
Medizinischer Leiter: PD Dr. med. Mathias Gugger
Gegenüber dem Vorjahr blieb die Zahl der im Molekularpathologie-Labor
durchgeführten Tests nahezu unverändert.
Lediglich der HPV-Nachweis aus zytologischem Material verzeichnete
einen Rückgang, der sich jedoch kaum auf die Gesamtzahl
der durchgeführten Analysen auswirkte.
Alle im Molekularpathologie-Labor durchgeführten Tests sind
Polymerase-Kettenreaktion-(PCR-)basierend; zum Nachweis
von Mutationen wird anschliessend eine Sequenzierung durchgeführt.
Die HPV-Typisierung erfolgt mittels eines automatisierten
Arrays. Unser Analysenspektrum beinhaltet Tests im Rahmen
der Lymphomdiagnostik für die Klonalitätsanalyse von B-
und T-Zellen für den Nachweis von Mikrosatelliteninstabilität,
Mutationen von Tumorgenen (z.B. k-RAS, EGFR, BRAF), Heterozygotie-Verlust,
epigenetischen Veränderungen (MGMT-
Pro-moter-Methylierung) und von verschiedenen bakteriellen
und viralen Erregern. Die Tests haben entweder diagnostische
oder prädiktive Implikation und können an Formalin-fixiertem
und Paraffin-eingebettetem Gewebe durchgeführt werden.
Im Bereich der Sequenzierung wurden im vergangenen Jahr
intensive Entwicklungsarbeiten getätigt. Einzelne Schritte der
zeitaufwändigen Methode der Sanger-Sequenzierung wurden
umgestellt. Dies hat zu einer deutlichen Verkürzung
der Analysezeit geführt und erlaubt die Verarbeitung einer
grösseren Zahl an Samples. Zudem wurde die Methode der
Pyrosequenzierung zum Nachweis von «Hot-Spot Mutations»
in den Genen k-RAS, n-RAS, BRAF und IDH1/IDH2 im Labor
etabliert, was zu einer höheren Sensitivität des Nachweises
von Mutationen und zudem zu einer deutlichen Verkürzung
der Analysezeit geführt hat.
Als weitere Errungenschaft des Molekularpathologie-Labors
ist die Etablierung der Methode des «Next-Generation Sequencing»,
die mit einem Ion-Torrent ® -Gerät (Life Technologies)
durchgeführt wird. Diese Methode erlaubt den gleichzeitigen
Nachweis von Mutationen in einer Vielzahl unterschiedlicher
Gene. Diese Methode wird ab 2013 insbesondere für den
Nachweis therapierelevanter Mutationen des Lungenkarzinoms,
des Kolonkarzinoms oder des Melanoms eingesetzt.
Ein solches Gerät steht uns im DKF zur Verfügung.
Im Weiteren diente das Molekularpathologie-Labor als Ausbildungsstätte
für die Erlangung des FMH-Subtitels in Molekularpathologie
eines an unserem Institut tätigen Pathologen
sowie eines Gastpathologen. Beide Pathologen haben
die Prüfung erfolgreich bestanden. Eine Assistenzärztin
wurde im Rahmen ihrer Ausbildung in Molekularpathologie
unterrichtet.
Auch das Molekularpathologie-Labor nimmt im Rahmen der
Qualitätssicherung regelmässig an Ringversuchen teil.

Institut für Pathologie > Dienstleistung 11
2.2 Immunohistochemie
Leiter: Dr. phil. nat. Andreas Kappeler
Das Auftragsvolumen des Immunhistochemie-Labors erfuhr
im Berichtsjahr nach mehreren Jahren des praktisch kontinuierlichen
Anstiegs einen deutlichen Rückgang. Mit gut
60 400 Färbungen für Diagnostik, Qualitätssicherung und
Entwicklung gegenüber rund 70 000 im Vorjahr wurden
knapp 14% weniger Präparate gefärbt. Die Anzahl untersuchter
Fälle lag mit 6692 ebenfalls gut 10% unter dem Vorjahreswert.
Im Mittel wurden pro untersuchten Fall 6,5 Antikörper
eingesetzt; dies ist etwas weniger als 2011 mit 6,8.
Ein Teil des registrierten Rückgangs ist auch auf die veränderte
Zählweise zurückzuführen: Bis 2011 wurden Statistiken
manuell geführt, womit auch Färbungen registriert wurden,
die in der restriktiven Zählweise des Laborinformationssystems
PathoWin+ nicht gezählt werden. Neben gut 43 400
Färbungen an Formalin-fixiertem Paraffinmaterial für diagnostische
Zwecke wurden weitere 14 100 Färbungen für
Forschungsprojekte, zur Etablierung und Evaluation neuer
Antikörper und Testverfahren sowie im Rahmen der Qualitätsprüfung
und -sicherung durchgeführt. Die Nierendiagnostik
mittels Immunfluoreszenz an Gefrierschnitten bewegte sich
mit gut 2800 Färbungen in einem ähnlichen Bereich wie in
den Vorjahren. Die Zahl der für die Diagnostik auf Paraffinmaterial
eingesetzten Antikörper wurde 2012 bereinigt und
auf rund 250 reduziert. Gut 400 Schnittpräparate wurden
mittels In-situ-Hybridisierung untersucht.
Das Labor nimmt seit 1997 4-mal jährlich an den internationalen
Ringversuchen von UK-NEQAS teil, die in 8 Modulen
verschiedene Gebiete der diagnostischen Pathologie abdecken.
Im Jahresmittel der verschiedenen Module schloss
das Labor in der Gruppe «externe Präparate» 4-mal in der
höchsten und 4-mal in der zweithöchsten von 4 Kategorien
ab. In der Gruppe «eigene Präparate» lagen 7 Platzierungen
in der höchsten und 1 in der zweithöchsten Kategorie.

12 Institut für Pathologie > Dienstleistung

Institut für Pathologie > Dienstleistung 13
2.3 FISH
Leiter: PD Dr. med. Mathias Gugger
Die Lungenadenokarzinome haben auch im Jahr 2012 die Auftragslage
im FISH-Labor geprägt, einerseits durch den fortgesetzten
Wegfall der EGFR-Amplifikations-Untersuchungen
und den Beginn der ALK-Translokation-Untersuchungen. So
führte das Labor 2012 insgesamt 304 diagnostische FISH aus
Lungenkarzinomen, Non-Hodgkin-Lymphomen, Leukämien,
Mammakarzinomen, Magenkarzinomen und Sarkomen
durch. Dies entspricht einer Abnahme von 14% im Vergleich
zu 354 Untersuchungen im Jahr 2011. 2% der Hybridisierungen
wurden an zytologischem Material (Ausstriche, Zellblöcke)
und 98% an Formalin-fixiertem Gewebe durchgeführt.
In 95% der Untersuchungen liess sich ein valables Resultat
erheben, in 5% der Analysen war die Qualität des untersuchten
Materials nicht ausreichend für eine Befundung.
Das FISH-Labor hat im Jahr 2012 erfolgreich an vier Ringversuchen
von UK-NEQAS teilgenommen und alle bestanden.
3 Zytopathologie
Leiterin: Dr. med. A. Schmitt
Die Abteilung gewährleistet eine schnelle und professionelle
Diagnostik des zytologischen Einsendegutes. Dies widerspiegelt
sich in stabilen Einsendezahlen (2012: 16 942, 2011:
16 996, 2010: 16 541) mit einer Zunahme sowohl der gynäkologischen
Vorsorgeabstriche (2012: 8724, 2011: 8697) als
auch der aus zytologischen Proben angefertigten Zellblöcke
(2012: 1830 Zellblöcke, 2011: 1705 Zellblöcke).
Seit Ende des Jahres verfügt die Abteilung über ein eigenes
FACS-Gerät zur Durchführung durchflusszytometrischer
Untersuchungen. Bei steigendem Kostendruck ermöglicht
die FACS-Untersuchung bei gleichzeitiger Kostenbewusstheit
eine erweiterte und verfeinerte Lymphomdiagnostik am
Feinnadelaspirat. Zur weiteren Verbesserung des Dienstleistungsangebots
wird zurzeit der Betrieb des eigenen
Punktionsambulatoriums zur Durchführung von Feinnadelpunktionen
gezielt ausgebaut werden.
Neben den Aufgaben aus den Bereichen Diagnostik und
Dienstleistung nimmt die Abteilung Aufgaben in den Bereichen
Ausbildung (Zytotechnik) und Weiterbildung (Facharztsubtitel
Zytologie FMH) wahr: 2012 schloss eine Schülerin
der Berner Laborschule ihr Praktikum erfolgreich ab, und
zwei Pathologinnen begannen die Ausbildung zur Erlangung
des FMH-Subtitels Zytopathologie, welche sie Ende Februar
2013 abschliessen werden.

14 Institut für Pathologie > Dienstleistung

Institut für Pathologie > Dienstleistung 15
4 Fachgruppen der Klinischen Pathologie
Stand März 2013
Dermatopathologie Endokrinopathologie Gastrointestinalpathologie
A. Fleischmann
031 632 87 65
A. Perren
031 632 32 22
A. Lugli
031 632 99 58
I. Vajtai
031 632 32 10
A. Schmitt
031 632 32 48
E. Diamantis
031 632 87 68
R. Zenklusen
031 632 99 51
A. Fleischmann
031 632 87 65
R. Langer
031 632 32 47
M. Montani
031 632 32 67
Mamma- und Gynäkopathologie Hämatopathologie Herz- und Gefässsowie
Rheumapathologie
C. Tapia
031 632 87 63
Y. Banz
031 632 88 75
Y. Banz
031 632 88 75
A. Fleischmann
031 632 87 65
E. Hewer
031 632 32 76
E. Diamantis
031 632 87 68
E. Hewer
031 632 32 76
A. Perren
031 632 32 22
M. Montani
031 632 32 67
M. Montani
031 632 32 67
A. Schmitt
031 632 32 48
S. Schäfer
031 632 99 22
S. Schäfer
031 632 99 22
HNO-Pathologie Leberpathologie Lungenpathologie
E. Diamantis
031 632 87 68
M. Montani
031 632 32 67
S. Schäfer
031 632 99 22
Y. Banz
031 632 88 75
E. Diamantis
031 632 87 68
Y. Banz
031 632 88 75
E. Hewer
031 632 32 76
R. Langer
031 632 32 47
B. Berger
031 632 86 75
A. Fleischmann
031 632 87 65
Nephropathologie Neuropathologie Ophthalmopathologie
E. Diamantis
031 632 87 68
I. Vajtai
031 632 32 10
A. Schmitt
031 632 32 48
R. Langer
031 632 32 47
E. Hewer
031 632 32 76
I. Vajtai
031 632 32 10
Pädopathologie Pankreaspathologie Uropathologie
S. Schäfer
031 632 99 22
E. Diamantis
031 632 99 58
A. Fleischmann
031 632 87 65
A. Fleischmann
031 632 87 65
R. Langer
031 632 32 47
B. Berger
031 632 86 75
C. Tapia
031 632 32 76
M. Montani
031 632 32 67
E. Diamantis
031 632 87 68
A. Perren
031 632 32 22
M. Montani
031 632 32 67
S. Schäfer
031 632 99 22
Weichteil- und
Knochenpathologie
Autopsie
R. Langer
031 632 32 47
A. Fleischmann
031 632 87 65
S. Schäfer
031 632 99 22
A. Lugli
031 632 99 58
A. Schmitt
031 632 32 48
I. Vajtai
031 632 32 10

16 Institut für Pathologie > Dienstleistung
5 Dienstleistungsstatistiken
Histopathologie
70 000
60 000
50 000
40 000
30 000
20 000
10 000
0
2009 2010 2011 2012
Lokalisationen 58 926 59 291 61 693 61 015
Einsendungen 34 319 34 532 35 001 33 805
Schnellschnitte 2715 2049 2937 1792
Einsenden für Tumorbank 698 880 803 799
Autopsie
250
200
150
100
50
0
2009 2010 2011 2012
Durchgeführte Autopsien 223 198 170 195
Zytopathologie
40 000
35 000
30 000
25 000
20 000
15 000
10 000
5000
0
2009 2010 2011 2012
Einsendungen
Klinische Zytologie
7670 7844 8849 8218
Einsendungen
Gynäkologische Zytologie
8821 8697 8697 8724
Ausstriche Objektträger 33 471 33 782 35 214 31 897
Zellblöcke 272 1216 1705 1830

Institut für Pathologie > Dienstleistung 17
Immunhistochemie
60 000
50 000
40 000
30 000
20 000
10 000
0
2009 2010 2011 2012
Fälle Diagnostik 7149 6777 7472 6692
Färbungen Diagnostik 53 950 48 613 50 535 43 436
Immunzytologie am Ausstrich 681 388 359 302
Molekularpathologie
3000
2500
Immunfluoreszenz
Nierenbiopsien
Lymphome
(lgH-/TCR-Rearrangement)
Mutationsanalysen
(EGFR, k-RAS, BRAF, IDH1)
2000
1500
1000
500
0
2009 2010 2011 2012
2808 2712 2820 2844
217 139 200 171
279 361 511 521
Erreger 181 134 122 112
Methylierungsnachweis 177 133 156 155

18 Institut für Pathologie > Forschung

Institut für Pathologie > Forschung 19
>>> Forschung
1 Forschungsberichte
1.1 Abteilung für Experimentelle Pathologie
Leitung: Prof. Christoph Müller, PhD
Administrative Unterstützung: Christine Feller, Christa Hagert
Anfang 2012 bestand die Abteilung für Experimentelle
Pathologie aus sechs Forschungsgruppen. Ihre Laboratorien
befinden sich auf drei Stockwerken (3., 4. und 5. Stock) des
Institutes für Pathologie. Thematisch befasst sich die Abteilung
mit zwei Forschungsschwerpunkten:
– Immunpathologie, Entzündung
– Experimentelle Tumorpathologie und Tumorbiologie
Anfang September 2012 wurde PD Dr. Mario Tschan als Nachfolger
von Prof. Jean-Claude Reubi als unabhängiger Forschungsgruppenleiter
in die Abteilung für Experimentelle
Pathologie aufgenommen. Mario Tschan hat in Bern seine Dissertation
als PhD in Molekularbiologie am Institut für Medizinische
Onkologie unter der Supervision von Prof. Martin Fey
und Prof. Andreas Tobler abgeschlossen. Anschliessend hat er
im Labor von Bruce E. Torbett am Scripps Research Institut sein
Post-Doc absolviert. Dabei wurde er während zweier Jahre
durch den SNF und während eines Jahrs durch die Schweizerische
Krebsliga unterstützt. 2005 kam Herr Tschan als Forschungsgruppenleiter
ans Institut für Medizinische Onkologie
in Bern zurück und führte seine Forschung in den Räumlichkeiten
des Departementes Klinische Forschung fort. 2009 wurde
ihm durch die Medizinische Fakultät die «Venia Docendi» in
Molekular- und Zellbiologie verliehen. Gleichzeitig können wir
uns glücklich schätzen, dass sich Prof. Jean-Claude Reubi entschieden
hat, auch nach seiner Emeritierung seine erfolgreiche
Forschungstätigkeit an unserem Institut fortzuführen.
Die Forschungsschwerpunkte der Gruppen der Abteilung für
Experimentelle Pathologie liegen in der Erforschung grundlegender
Mechanismen der Zellbiologie und der Ätiopathogenese
neoplastischer oder entzündlicher Erkrankungen. Zusätzlich
werden auch translationale Forschungsaktivitäten
wahrgenommen, z.B. die Verbesserung und Neuentwicklung
von nuklearmedizinischen Tracern (Gruppe Reubi) und die
Suche nach Serummarkern bei Patienten mit chronisch-entzündlichen
Darmerkrankungen, welche die Krankheitsaktivität
widerspiegeln (Gruppe Müller). So ist die Forschungsgruppe
von Prof. Reubi teilfinanziert durch Lizenzeinnahmen
aus Patenten im Gebiet des Peptid-Rezeptor-Targetings bei
unterschiedlichen Tumortypen.
Die Forschungsaktivitäten sind sowohl national wie auch
international gut integriert, zum Beispiel im Rahmen der
«Swiss IBD»-Kohortenstudie. Bei ihren experimentellen
Arbeiten können die Forschungsgruppen auf institutsinterne
Facilities, z.B. «Laser Capture Microdissection» und konfokale
Mikroskopie zurückgreifen, daneben haben wir auch
Zugang zu den Core Facilities des Departements für Klinische
Forschung (DKF) mit der FACS Core Facility und der neuen Genomics
Core Facility (u.a. mit Zugang zu einem Ion-Torrent ® -
Gerät). Diese beiden DKF-Facilities sind innerhalb des Gebäudes
des Instituts für Pathologie lokalisiert. Ausserhalb
des Instituts haben die Forschungsgruppen auch Zugang zum
interfakultären Mikroskopiezenter (MIC) mit Zugang zu Geräten
für konfokale Mikroskopie, einschliesslich der Einrichtungen
für «live cell imaging» und «2-photon microscopy»,
sowie zur neuen Proteomics Core Facility der Medizinischen
Fakultät. Wir sind ebenfalls Mitglied der interfakultären Bioinformatikeinheit
und haben uneingeschränkten Zugang zur
«Deep-Sequencing»-Plattform der Universität Bern, ausgerüstet
mit einem Roche GS Junior und einem Illumina HiSeq
2000. Einige unserer Forschungsgruppen benutzen die zentralen
Einrichtungen der Medizinischen Fakultät für Versuchstiere,
einschliesslich der neuen «Clean Mouse Facility»
mit keimfreien und gnotobiotischen Mäusen.
Über Kollaborationen haben wir ebenfalls Zugang zu weiteren
«state-of-the-art facilities» anderer Hochschulen, wie beispielsweise
zum «Functional Genomics Center» der Universität
und ETH Zürich (fgcz) oder zur Nanostrings ® -Plattform
des NCCR (Frontiers in Genetics) an der Universität Genf.
Das breite Spektrum der in der Abteilung für Experimentelle
Pathologie etablierten Technologien umfasst die konfokale
Mikroskopie, einschliesslich FRET-Analyse; die Fluoreszenzin-situ-Hybridisierung;
die Laser-Capture-Mikrodissektion von
Formalin-fixierten Paraffin- und auch schockgefrorenen Gewebeschnitten;
der Autoradiographie von Gewebeschnitten,
einschliesslich kombinierter Immunhistochemie/Rezeptorautoradiographie;
aber auch das gesamte Spektrum der durchflusszytometrischen
Zellsortierung und Mehrfarbenanalyse.
Hochmoderne Methoden zur Identifikation von microRNAs
(miRs) und ihren Zielsequenzen in normalem und erkranktem
Gewebe sind etabliert, einschliesslich Lentivirus-basierter
Transduktionssysteme und mRNA Profiling von kleinen Zellzahlen
und mikrodissezierten Geweben. Mehrere unserer
Forschungsgruppen haben eine langjährige Expertise in Isolation
und Kultur von Primärzellen, insbesondere von Immun-

20 Institut für Pathologie > Forschung
zellen und mesenchymalen Zellen, lebersinusoidalen Endothelzellen
und epithelialen Zellen von Patienten wie auch von
Versuchstieren. Experimentelle Protokolle zur Erforschung
der funktionellen Eigenschaften und Fähigkeiten dieser Zellen
ex vivo und in vitro sind etabliert.
Administrative Tätigkeiten
Dr. Philippe Krebs hat 2012 die Aufgabe des «Biosafety Officers»
des Institutes für Pathologie übernommen. Er hat sowohl
für diagnostische Labors wie auch für Forschungslabors
Richtlinien für den Umgang mit biologischen Proben erarbeitet
und implementiert.
Mehrere Forschungsgruppenleiter der Abteilung für Experimentelle
Pathologie haben 2012 ausserhalb des Institutes freiwillige
Aufgaben übernommen: Frau Prof. Verena Niggli hat
das Ernennungs- und Habilitationskomitee der Medizinischen
Fakultät Bern präsidiert und hat die Medizinische Fakultät in
der universitären Gleichstellung von Frauen und Männern vertreten.
Verena Niggli ist auch Mitglied der Fachkommission
Biological Systems der Graduate School for Cellular and Biomedical
Sciences und Mitglied der Kommission des Microscopy
Imaging Center. Bis August 2012 war Prof. Christoph Müller
Vizedekan Forschung der Medizinischen Fakultät, und hat ex
officio den Ausschuss für Forschung der Medizinischen Fakultät
präsidiert. Zusätzlich war er Mitglied des Scientific Advisory
Board des ARTORG Center for Biomedical Engineering Research
der Universität Bern. Christoph Müller war Mitglied
der Programmleitung des Studiengangs «Certified Advanced
Studies in Research Management» der Universität Bern und Adhoc-Forschungsratsmitglied
beim «Ambizione»-Programm
des SNF. Er war Vorstandsmitglied und Quästor der Schweizerischen
Gesellschaft für Allergologie und Immunologie und
Mitglied des Subkomitees «Experimentelle Immunologie»
dieser Gesellschaft. Des Weiteren war er Mitglied des Executive
Board und Scientific Board der vom SNF unterstützten
Swiss-IBD-Kohortenstudie. PD Dr. Mario Tschan war Mitglied
der Expertenkommission Zellbiologie und des interfakultären
PhD-Komitees der Graduate School for Cellular and Biomedical
Sciences. Seit 2012 ist auch Philippe Krebs Mitglied dieser
Expertenkommission der Graduate School.
Gruppe Nadia Corazza, PhD
Christoph Lauer, Post-Doc (bis März 2012)
Regula Stuber, Laborantin
Anastasia Badmann, PhD-Studentin
Julien McEvoy, Master-Student
Zusammenfassung der Forschungsaktivität
Die Leber ist ein zentrales Organ des gastrointestinalen Systems.
Ihre Hauptaufgabe ist die Aufnahme von Nährstoffen,
deren Speicherung und kontrollierte Freisetzung in die Zirkulation.
Deshalb ist die Leber konstant schädlichen Substanzen
wie Medikamentenmetaboliten und Toxinen aus der Zirkulation
ausgesetzt. Die Leber wird ebenfalls mit zahlreichen
Antigenen aus Nahrungsmitteln und mit potenziell pathogenen
Keimen aus dem Darmtrakt konfrontiert. Aus diesen
Gründen verfügt die Leber über ein komplexes Immunsystem,
welches unter Minimierung des Schadens für das Organ schnell
eine Immunantwort gegen potenziell schädliche Antigene
aufbauen kann. Eine unangebrachte Aktivierung von Immunzellen
der Leber führt in verschiedenen Formen der Lebererkrankung
zu unerwünschten Konsequenzen. Der klinische
Verlauf der Virushepatitis ist z.B. sehr stark abhängig von der
zytotoxischen Aktivität von T-Zellen. Normalerweise schützen
aktivierte zytotoxische T-Zellen gegen eine persistente Virusinfektion
durch Elimination Virus-infizierter Zellen. Wenn jedoch
die zytotoxischen T-Zellen nicht innert notwendiger
Frist ausreichend aktiviert werden, kann die Ausbreitung des
Virus nicht limitiert werden und die Virusinfektion wird persistent,
in dieser Situation werden die zytotoxischen T-Zellen
schwerwiegend zum Schaden auch des nicht infizierten Gewebes
beitragen. Da aktivierte Immunzellen TRAIL exprimieren
und TRAIL in der Entstehung von verschiedenen Lebererkrankungen
involviert ist, untersuchen wir in einem Projekt
die Rolle von TRAIL in der viralen Hepatitis.
Die Mechanismen, welche zum Absterben von Hepatozyten
führen, wurden in der Vergangenheit intensiv erforscht.
Neuere Daten zeigen jedoch, dass nicht nur Hepatozyten
während Lebererkrankungen geschädigt werden. Aufgrund
ihrer exponierten mikroanatomischen Position im Rahmen
der Barrierefunktion zwischen Blut und Hepatozyten sind
sinusoidale Endothelzellen der Leber häufig als erste gegenüber
Immunzellen und toxischen Substanzen im Blutstrom
exponiert. Ein früher Schaden von Endothelzellen könnte die
Ursache dafür sein, dass viele Lebererkrankungen mit hämorrhagischen
Veränderungen assoziiert sind. Deshalb untersuchen
wir die Sensitivität von sinusoidalen Endothelzellen
der Leber gegenüber verschiedenen Stimuli, welche eine
Apoptose auslösen. Die intrazellulären Mechanismen, welche
die Apoptose von sinusoidalen Endothelzellen der Leber
steuern, stehen im Zentrum dieses zweiten Projektes.
Externe Zusammenarbeit
• Thomas Brunner, Universität Konstanz
• Thomas Kaufmann, Institut für Pharmakologie
der Universität Bern
• Deborah Stroka, Institut für Viszeralund
Transplantationschirurgie, Universität Bern
Drittmittelfinanzierung
• SNF (August 2009 –March 2012, total amount CHF 240‘000)
• Novartis Foundation for medical and biological research
(CHF 60 000, total amount for unrestricted time)

Institut für Pathologie > Forschung 21
Gruppe von Philippe Krebs, PhD
Gruppenmitglieder:
Lukas Mager, MD, PhD-Student
Ludivine Odoul, PhD-Studentin (seit September 2012)
Regula Stuber, technische Mitarbeiterin
Zusammenfassung der Forschungstätigkeiten
Es wird vermutet, dass bei Patienten mit chronisch-entzündlicher
Darmerkrankung (IBD – Inflammatory Bowel Disease)
oder mit bestimmten Formen von Krebserkrankungen eine
chronische Entzündung mikrobiellen Ursprungs die Ursache
ist. Wir gehen von der zentralen Hypothese aus, dass Mikroben,
darunter auch Kommensale bei genetisch empfänglichen
Patienten eine Hauptursache für eine durch eine Entzündung
herbeigeführte Immunpathologie darstellen. Vor diesem Hintergrund
verwenden wir zwei verschiedene Mausmutanten
mit definierten genetischen Veränderungen. Im Einzelnen
zielen wir darauf ab, eine detaillierte Analyse der an der mit
Mikroben in Verbindung stehenden Pathogenese beteiligten
molekularen und zellulären Prozesse in einem Modell der
myeloproliferativen Erkrankung und einem Modell der IBD zu
erstellen. Wir gehen davon aus, dass die geplanten Untersuchungen
nicht nur unseren derzeitigen Kenntnisstand bezüglich
der Rolle von Mikroorganismen als Auslöser von Entzündungskrankheiten
und Krebs erweitern – sie können uns
darüber hinaus dabei helfen, Behandlungsstrategien zu entwickeln,
die auf den klinischen Bereich übertragen werden
können. Unsere Analysen könnten auch neue genetische Marker
für die Anfälligkeit für bestimmte Krankheiten ergeben,
wodurch eine gezielte Prävention möglich wäre.
Ein weiteres Projekt umfasst eine Untersuchung der Interaktion
zwischen angeborenen und adaptiven Immuneffektoren
bei der Entwicklung von adaptiven Immunreaktionen.
Es werden hierbei infektiöse Entzündungen mit sterilen Entzündungen
verglichen.
Externe Kollaborationen
• Prof. Andrew MacPherson und Kathy McCoy, Bern, Schweiz
• Bruce Beutler, Center for Genetics of Host Defense,
UT Southwestern Medical Center, 5323 Harry Hines Boulevard,
8505, Suite NB9-202D, Dallas, TX, 75390, USA
• Daniel Popkin, Department of Dermatology,
Case Western Reserve University, 10900 Euclid Avenue,
Cleveland, OH 44106, USA
Drittmittelfinanzierung
• SNF (September 2012–August 2015); «Molecular dissection of
microbe-induced immunopathology»; principal investigator;
(36 months grant; CHF 377 366)
• Award from the Berne University Research Foundation
(CHF 16 090 for equipment)
• SNF R’Equip Grant (equipment grant); «Apparatus for Colonoscopy
and Endoscopic Manipulations in Mice»; (CHF 54 000 + CHF 54 000)

22 Institut für Pathologie > Forschung
Gruppe von Prof. Christoph Müller, PhD
Isabella Aebi, Laborantin (SIBDCS Biobank) (40%)
Jennifer Brasseit, MSc, PhD-Studentin
Antonia Bünter, MSc, PhD, Assistentin
(Post-Doc, bis Mai 2012)
Nina Dickgreber, PhD, Assistentin (Post-Doc)
Silvia Rihs, Laborantin (90%)
Leslie Saurer, PhD, wissenschaftliche Mitarbeiterin (60%)
Esther Steiner, DVM-PhD, Assistentin (Post-Doc)
Benjamin Weber, PhD, Assistent (Post-Doc, bis August 2012)
Daniel Zysset, MSc, PhD-Student
Zusammenfassung der Forschungstätigkeiten
Schwerpunkte unserer Forschungstätigkeit im Berichtsjahr
waren Untersuchungen über die immunregulatorischen Mechanismen
unter homöostatischen Bedingungen, die auch in
Anwesenheit einer ausserordentlichen Menge an zumeist
kommensalen Bakterien im Darmlumen die Entstehung einer
lokalen Entzündung in der Darmschleimhaut verhindern.
Ausserdem untersuchen wir die Beteiligung verschiedener
Immunzellen des adaptiven und des angeborenen Immunsystems
und von Entzündungsmediatoren bei der Pathogenese
chronisch-entzündlicher Darmerkrankungen.
Im Berichtsjahr haben wir die funktionelle Charakterisierung
einer unkonventionellen T-Zell-Population, der CD8- TCR-
T-Zellen, fortgesetzt. Unter homöostatischen Bedingungen
befinden sich diese T-Zellen nahezu ausschliesslich im Darmepithel,
insbesondere des Dünndarms. Wir haben nun zeigen
können, dass diese Zellen unter entzündlichen Bedingungen
im Epithel stark proliferieren, sogar an extraintestinalen Lokalisationen
auftreten und am intestinalen Entzündungsherd
akkumulieren. Zurzeit untersuchen wir die Mechanismen, die
es diesen CD8-TCR-T-Zellen erlauben, aus dem Epithel
auszuwandern, und analysieren, welche funktionellen Veränderungen
sie während einer Entzündung an intestinalen
und extraintestinalen Lokalisationen vollziehen.
Forschungsergebnisse verschiedener Gruppen haben indirekte
Hinweise geliefert, dass der Interferon--(IFN-)Produktion
durch sogenannte «Innate Lymphoid Cells» (ILCs) in der
Darmmukosa eine wesentliche Rolle bei der Entstehung einer
experimentellen Kolitis in der Maus zukommt. Wir haben
diese Frage nun direkt untersucht und dabei gesehen, dass
IFN für die Induktion einer Kolitis nicht entscheidend ist,
dass aber nicht hämatopoietischen Zellen bei der Induktion
einer immunvermittelten Entzündung im Darm eine zentrale
Rolle zukommt.

Institut für Pathologie > Forschung 23
Unsere Untersuchungen in experimentellen Mausmodellen
einer Kolitis werden durch Untersuchungen an Blutproben
und Biopsien von Patienten mit Morbus Crohn oder Kolitis
ulzerosa (Inflammatory Bowel Diseases, IBD) ergänzt. Diese
Arbeiten werden im Rahmen der Schweizerischen IBD-Kohorte
(SIBDCS) durchgeführt, die vom Schweizerischen Nationalfonds
(SNF) unterstützt wird. In einem dieser Projekte
wird untersucht, ob das verminderte Auftreten von MAIT-
Zellen (Mucosal-Associated-Invariant-T-cells) im Blut von
IBD-Patienten mit einer verstärkten Entzündungsreaktion in
der Darmwand (und einer dortigen Akkumulation der MAIT-
Zellen) korreliert, sodass die Bestimmung der Frequenz der
MAIT-Zellen im Blut als Surrogatmarker für die Aktivität der
Erkrankung bei IBD-Patienten verwendet werden könnte.
Die Resultate unserer Bestimmungen an wenigen Patienten
haben in der Tat ergeben, dass die Häufigkeit der MAIT-Zellen
in Blutproben von Patienten mit aktivem Morbus Crohn
oder Kolitis ulzerosa vermindert ist und die MAIT-Zellen von
Patienten in aktiven Stadien der Erkrankung einen veränderten
Phänotyp aufweisen.
Anfang 2012 konnten die Arbeiten im Rahmen eines Sinergia-
Projekts des SNF zur Charakterisierung der zellulären und
molekularen Veränderungen, die mit einer Remission einer
immunvermittelten Entzündung einhergehen, begonnen
werden. In dieser Zusammenarbeit mit den Labors von Prof.
Andrew MacPherson (Gastroenterologie, Bern), Prof. Daniela
Finke (Universität Basel) und Prof. Wolf-Dieter Hardt (ETH
Zürich) konnten wir erfolgreich ein Mausmodell etablieren,
das reproduzierbar die Induktion einer klinischen und histopathologischen
Remission in Tieren mit einer aktiven, immunvermittelten
Kolitis erlaubt. Aktuell untersuchen wir den Beitrag
spezifischer Mediatoren und Zellpopulationen bei dieser
mukosalen Heilung im Kolon.
In früheren Arbeiten konnte in unserer Forschungsgruppe
gezeigt werden, dass ein aktivierender Rezeptor (TREM1) auf
myeloiden Zellen (Granulozyten, Makrophagen) bei Patienten
mit IBD und bei experimenteller Kolitis in zwei Mausmodellen
die lokale Entzündungsreaktion entscheidend fördert, wodurch
schwere Gewebeschäden auftreten. Wir haben aufgrund
dieser Befunde nun eine Mauslinie generiert, bei der
spezifisch das Gen für TREM1 inaktiviert worden ist. Mithilfe
dieser Mauslinie wird es möglich sein, die Auswirkungen einer
TREM1-vermittelten Verstärkung einer Immunreaktion auch
bei weiteren Erkrankungen zu untersuchen, insbesondere bei
Infektionskrankheiten und bei chronischen Entzündungsreaktionen.
Erste Ergebnisse haben ergeben, dass TREM1 oft
nicht notwendig für die Kontrolle der Erregerausbreitung ist,
dass aber durch das Fehlen von TREM1 die bei einem chronischen
Verlauf einer Infektion oder Entzündung auftretenden
Gewebeschäden massiv reduziert werden. Diese Befunde
könnten auch mögliche neue Formen der Therapie solcher
Erkrankungen aufzeigen, zum Beispiel durch eine selektive
Blockade von TREM1 durch spezifische Inhibitoren. Wir werden
diese Untersuchung unter Verwendung der uns zur Verfügung
stehenden neuen Technologien, wie «Laser Capture
Microdissection», auch an Gewebeschnitten von Patienten
mit Infektionskrankheiten und chronischen Entzündungserkrankungen
fortsetzen.
Externe Kollaborationen
Universität Bern
• Sigi Hapfelmeier, ifik
• Andrew MacPherson, Gastroenterologie/DKF (Sinergia)
• Pascal Juillerat, Gastroenterologie
• Kathy McCoy, Gastroenterologie/DKF
• Thomas Kaufmann, Pharmakologie
• Adrian Ochsenbein, Onkologie
• Carsten Riether, Onkologie
• Christian Schürch, Onkologie/Pathologie
• Willy Hofstetter, DKF
• Luregn Schlapbach, Kinderklinik
Schweiz
• Hans Acha-Orbea, Lausanne
• Daniela Finke, Universität Basel (Sinergia)
• Stefan Freigang, ETH Zürich
• Wolf-Dieter Hardt, ETH Zürich (Sinergia)
• Manfred Kopf, ETH Zürich
• Annette Oxenius, ETH Zürich
• Walter Reith, Genf
• Fabienne Tacchini-Cottier, Lausanne
• Swiss IBD Cohort Study (SIBDCS)
International
• Adrian Hayday, King’s College, London, UK
• Markus P. Radsak, Mainz, Deutschland
Drittmittelfinanzierung
• SNF 310030_138392 /1, CHF 623 000.– (3 Jahre)
• SNF CRSII3_136286 / 1 (Sinergia), CHF 399 000.– (3 Jahre)
• SNF 33CS30_134274 / 1 (SIBDCS), CHF ca. 65 000.– (pro Jahr)
• SNF 33CS30_134274 / 1, CHF 40 000.– (2 Jahre), «nested project»
im Rahmen der SIBDCS, verantwortlich: Dr. Leslie Saurer

24 Institut für Pathologie > Forschung

Institut für Pathologie > Forschung 25
Gruppe von Prof. Verena Niggli, PhD
Sarah Affentranger, MSc, Laborantin
Tommy Baumann, PhD, Post-Doc
Sibylla Martinelli, PhD, Post-Doc (bis April 2012)
Lucia Mathis, BSc, Master-Studentin (bis Mai 2012)
Zusammenfassung der Forschungstätigkeiten
Unsere Forschung konzentriert sich auf die Rolle von Membranmikrodomänen
bei der signalabhängigen Reorganisation des
Zytoskeletts, der Polarisierung und Migration von Leukozyten.
Membranmikrodomänen entsprechen der lokalen Anreicherung
von spezifischen Proteinen und Lipiden in der Plasmamembran.
Solche Domänen könnten wesentlich sein für die
lokale Aktivierung spezifischer Signalkaskaden und Adhäsionsmoleküle.
Wir untersuchen die Rolle der Mikrodomänenassoziierten
Proteine Flotillin-1 und -2 bei der Zellmigration. Die
Kappenbildung von Flotillinen ist ein sehr früher Vorgang bei
der Polarisierung neutrophiler Granulozyten und T-Lymphozyten.
Bei der Stimulation von Zellen konzentrieren sich diese
Proteine an der Position der späteren Uropode. Diese neuen
Forschungsergebnisse legen nahe, dass Flotilline eine bedeutende
Rolle bei der Uropodbildung und der Organisation von
Rezeptoren, Zytoskelettproteinen und Signalmolekülen im
Uropod spielen.
Im Jahr 2012 untersuchten wir die Reorganisation von Flotillinen
während der Chemokin-induzierten Polarisierung humaner
T-Zellen mithilfe des Fluoreszenz-Resonanz-Energietransfers
(FRET). Wir konnten die Chemokin-vermittelte Koaleszenz
vorgeformter Flotillin-1- und -2-Heterooligomere im Uropod
nachweisen (Baumann et al. 2012). Des Weiteren untersuchten
wir die Beziehung zwischen den Aktin-Membran-Linkerproteinen
Ezrin und Moesin, die sich ebenfalls im Uropod konzentrieren,
und den Flotillinen. Wir konnten nachweisen, dass
diese Proteine wechselseitig ihre Kappenbildung im T-Zellen-
Uropod erhöhen (Martinelli et al., zur Veröffentlichung eingereicht).
In Zusammenarbeit mit Prof. A. Huttenlocher (Madison,
USA) untersuchten wir darüber hinaus die Rolle des Enzyms
Phosphatidylinositol-4-Phosphat-5-Kinase Typ I 90 (PIPKI90)
bei der T-Zellen-Uropodbildung. Unsere Ergebnisse legen
nahe, dass PIPKI90 eine Rolle bei der Uropodablösung von
Substrat während der Fortbewegung von T-Lymphozyten
spielt (Mathis et al., in Vorbereitung).
Externe Kollaborationen
• Prof. Anna Huttenlocher, Madison, USA
• Dr. Janis K. Burkhardt, Philadelphia, USA
Drittmittelfinanzierung
• SNF Grant No. 3100A_129655
(May 1, 2012–April 30, 2013; CHF 233 236)
• Gottfried und Julia Bangerter-Rhyner Stiftung
(January 1, 2010–April 30, 2013; CHF 140 000)
Gruppe von Prof. Jean-Claude Reubi, MD
Diana Born, MD, Pathologin
Renzo Cescato, PhD
Beatrice Waser, technische Mitarbeiterin
Meike Körner, MD, Pathologin
Achim Fleischmann, MD, Pathologe
Internationale Kollaborationspartner
Zusammenfassung der Forschungstätigkeiten
Der Forschungsgegenstand dieses Langzeitprojekts lautet
«Peptidrezeptoren als Targets für die Tumordiagnose und -therapie».
Dies wird derzeit auf 3 verschiedenen Ebenen untersucht:
1) Definition des Targets, 2) Hilfsmittel zum Nachweis,
3) klinische Anwendungen. Im Berichtsjahr haben wir uns auf
die nachstehenden Peptidrezeptoren konzentriert: Somatostatin-Rezeptoren,
Gastrin-releasing-Peptide-Rezeptoren,
GLP-1-Rezeptoren, Cholecystokinin-Rezeptoren und glukoseabhängige
insulintrope Polypeptid-(GIP-)Rezeptoren.
ad 1) Die Definition des Targets umfasst die Identifizierung
humanpathologischer Gewebe in bestimmten Tumoren,
die Peptidrezeptoren überexprimieren. Eines der faszinierendsten
Ergebnisse ist die massive Überexpression
von GIP-Rezeptoren in den meisten neuroendokrinen
Darm- und Lungentumoren, insbesondere den Somatostatin-Rezeptoren-negativen
Tumoren. Diese GIP-
Rezeptoren könnten daher ein interessantes, neues Invivo-Target
darstellen. Weitere aktuelle Projekte umfassen
die Identifizierung von Spleissvarianten von CCK-2-Rezeptoren
in Lungen- und gastrointestinalen Tumoren.
Darüber hinaus konnten wir erstmalig GLP-2-Rezeptoren
in menschlichen Krebsformen, insbesondere in
gastrointestinalen Stromatumoren (GIST), nachweisen.
Schliesslich identifizierte eine kombinierte immunhistochemische
Rezeptor-Autoradiographiestudie einen
neuen sst2-monoklonalen Antikörper, der für die normale
Immunhistochemie bei neuroendokrinen Tumoren
(NET) geeignet ist. Während unbehandelte Patienten
membranöse nicht phosphorylierte sst2 aufweisen,
weisen mit Octreotid behandelte Patienten internalisierte,
phosphorylierte sst2 auf.
ad 2) Zahlreiche Hilfsmittel wurden im Berichtsjahr in Zusammenarbeit
mit Chemikern zur Verwendung als Zielwirkstoffe
(«Targeting Agents») bei Krebspatienten definiert
und charakterisiert: Verschiedene Somatostatin-
Rezeptor-Agonisten und -Antagonisten; neue Minigastrin-CCK-2-Radioliganden
für eine gezielte Tumorbehandlung;
neue GRP-Rezeptor-Agonisten und -Antagonisten,
die für die translationale nuklearmedizinische
Bildgebung entwickelt wurden.
ad 3) Klinische Anwendungen der neu entwickelten Hilfsmittel
umfassten die klinische Evidenz dafür, dass der

26 Institut für Pathologie > Forschung
Somatostatin-Rezeptor PET/CT einen Nachweis der
diffusen parenchymalen Lungenerkrankung (DPLP –
Diffuse Parenchymal Lung Disease) ermöglicht.
Externe Kollaborationen
• E. Christ, Universitätsspital Bern, CH
• D. Wild, Universitätsspital Basel, CH
• N. Pellegata, Helmholtz-Zentrum, München, D
• von Guggenberg, C. Decristoforo, Medizinische
Hochschule Innsbruck, A
• H. Mäcke, Nuklearmedizin, Universität Freiburg, D
• T. Maina, Demokritos, Athen, GR
• A. Groves, P. Ell, UCL, London, UK
• M. de Jong, Nuklearmedizin, Universität Rotterdam, NL
• D. Fourmy, INSERM, Toulouse, F
• A. Schonbrunn, UTMS, Houston, TX, USA
Drittmittelfinanzierung
• Desirée and Niels Yde Foundation 2009
• Cost action BM 0607
• Juvenile Diabetes Research Foundation 37-2012-4
• Desirée and Niels Yde Foundation 383-12
• Patent licence fees
Gruppe von Mario Tschan, PhD
Daniel Brigger, PhD-Student
Elena A. Federzoni, PhD-Studentin
Aladin Haimovici, PhD-Student
Katarina Jagic, Master-Studentin, BMA
(Dezember 2012 bis Mai 2013)
Fabienne Knörr, Master-Studentin, BMA
(Dezember 2012 bis Mai 2013)
Anna Schläfli, PhD-Studentin
Deborah Shan, technische Mitarbeiterin
Julian Wampfler, MD, PhD-Student
Zusammenfassung der Forschungstätigkeiten
Meine Gruppe konzentriert sich derzeit auf die Untersuchung
der Funktion der Autophagie im Zellüberlebensprozess in der
Pathogenese der akuten myeloischen Leukämie (AML), der
Neutrophilendifferenzierung und der Resistenzmechanismen
für eine Chemo- oder zielgerichtete Therapie bei Lungenkrebs.
Darüber hinaus wird die Regulierung Autophagie-assoziierter
(ATG-)Gene durch Transkriptionsfaktoren und microRNAs
während dieser Prozesse untersucht.

Institut für Pathologie > Forschung 27
Autophagie und AML-Differenzierung: Ein wesentliches
Kennzeichen der AML ist eine Beeinträchtigung der normalen
myeloischen Differenzierung, die zu einer klonalen Expansion
früher, unreifer myeloischer Progenitoren führt. Diese
Blockade der Differenzierung wird vor allem durch Loss-of-
Function-Mutationen der hämatopoietischen Transkriptionsfaktoren
verursacht, die die geordnete Einbindung einer Zelle
in eine bestimmte hämatopoietische Linie steuern. Bei der
Autophagie handelt es sich um einen Abbaumechanismus,
der im Wesentlichen an der Rückgewinnung und dem Umsatz
von Zytoplasmabestandteilen beteiligt ist, der bspw. ein Überleben
bei Hungerzustand ermöglicht. Während der Autophagie
kommt es zur Sequestration eines Teils des Zytoplasmas
oder gesamter Organellen zu Doppelmembranvesikeln,
sogenannten Autophagosomen, die sich schliesslich mit Lysosomen
verbinden und ihren Inhalt abbauen. Bezüglich der
Rolle der Autophagie bei der hämatopoietischen Differenzierung
konnte dieser bei der Entwicklung von B- und T-Zellen
eine bedeutende Rolle zugeschrieben werden. Wir konnten
nachweisen, dass ungefähr zwei Drittel sämtlicher ATG-Gene in
primären AML-Blutproben von Patienten reprimiert werden,
und konnten zeigen, dass die Inhibition zentraler ATG-Gene
(ATG5, ATG7, GATE-16, WIPI-1) zu einer anomalen Neutrophilendifferenzierung
von AML-Zellen führte. Überraschenderweise
hatte die Ausschaltung des zentralen Autophagie-
Gens Beclin 1 keinen signifikanten Einfluss auf die Neutrophilendifferenzierung
von AML-Zellen, was darauf hinweist,
dass bei der Neutrophilendifferenzierung eine bestimmte
nicht kanonische Autophagie am Werk ist. In einem weiteren
Schritt konnten wir zeigen, dass mehrere an der Neutrophilendifferenzierung
beteiligte ATG-Gene direkt durch zentrale
myeloische Transkriptionsfaktoren wie PU.1 und CEBPA reguliert
werden.
Autophagie und Medikamentenresistenz bei Lungenkrebs:
Bei normalen Zellen trägt die Autophagie, bspw. der Abbau
beschädigter Mitochondrien, zur Tumorsuppression bei. Die
Autophagie hat aber bei fortgeschrittenem Krebs vor allem
eine onkogene Funktion, bei der sie diese Zellen vor Chemotherapeutika
schützt, und so das Überleben unter ungünstigen
Bedingungen, wie bspw. während der Metastasierung, ermöglicht.
Daher kann die Behandlung von Tumoren mit Chemotherapie
bei einer gleichzeitigen Inhibition der Autophagie
einen vielversprechenden neuen Ansatz bei bestimmten Krebstypen
darstellen. Andere interessante Akteure mit einer sich
entwickelnden neuen Rolle in der Medikamentenresistenz
sind microRNAs. MiRNAs regulieren die Genexpression auf
posttranskriptioneller Ebene über eine verringerte Translation
und/oder einen erhöhten Abbau der Ziel-mRNA. Diese sind
bei Krebs häufig dereguliert. Je nach Ziel-miR können diese
als tumorsuppressive und onkogene (OnkomiRs) miR klassifiziert
werden. Unsere vorläufigen Daten deuten auf eine
mögliche Rolle für die onkogene miR-17-Familie bei Autophagie-vermittelten
Resistenzmechanismen bei einer Behandlung
mit Src-Tyrosinkinase-Hemmern (TKI) hin. Bestimmte
Mitglieder der miR-17-Familie wie miR-106a zielen möglicherweise
nicht nur auf ein, sondern auf mehrere Autophagiegene
wie ULK1, p62, TP53INP1 und DAPK2. Unsere Hypothese
ist, dass ein Herunterregulieren von Mitgliedern der
miR-17-Familie, die während der Src-TKI-Behandlung beobachtet
werden, eine Induktion der zellschützenden Autophagie
ermöglicht.
Kollaborationen
• Prof. Aurel Perren, Pathologie, Universität Bern, Schweiz
• PD Dr. Erik Vassella, Pathologie, Universität Bern, Schweiz
• PD Dr. Rupert Langer, Pathologie, Universität Bern, Schweiz
• Prof. Thomas Kaufmann, Pharmakologie,
Universität Bern, Schweiz
• Prof. Hans-Uwe Simon, Pharmakologie,
Universität Bern, Schweiz
• PD Dr. Deborah Stroka, Viszerale und Transplantationschirurgie,
Universität Bern, Schweiz
• Prof. Bruce E. Torbett, TSRI, La Jolla, CA, USA
• Prof. Anne Simonsen, Dpt. of Biochemistry,
Universität Oslo, Oslo, Norwegen
• Prof. Tassula Proikas-Cezanne, Dpt. of Molecular Biology,
Universität Tübingen, Tübingen, Deutschland
• Dr. Nelson J. Dusetti, INSERM U1068, Marseille, France
• Prof. Mondira Kundu, St. Jude Children’s Research
Hospital, Memphis, TN, USA
• Prof. Gerhard Behre, Abt. für internistische Medizin,
Universitätsklinikum Leipzig, Leipzig, Deutschland
• Prof. Sharon McKenna, Biosciences Institute,
University College Cork, Cork, Irland
• PD Dr. Philipp Jost, Medizinische Klinik (Hämatologie
und Onkologie), TUM, München, Deutschland
• Prof. Peter J.M. Valk, Erasmus MC, University Medical
Center, Rotterdam, Niederlande
Drittmittelfinanzierung
• SNF 31003A_143739 (2012–2015), CHF 390 000.–
• Klinische Experimentelle Tumorforschung (2012–2013),
CHF 183 000.–
• Cancer Research Switzerland (2011–2012), CHF 263 000.–
• SNF 31003A_129702 (2011–2013), Co-PI, CHF 375 000.–

28 Institut für Pathologie > Forschung
Gruppe von Erik Vassella, Dr. pharm.
Stefan Hämmig, PhD-Student (seit April 2012)
Stephanie Langsch, PhD-Studentin (seit Mai 2012)
Astrid Glück, BSc, Master-Studentin
Elena Stübi-Bondarenko, BSc, Master-Studentin
(seit August 2012)
Ulrich Baumgartner, BSc, Master-Student
(seit September 2012)
Verena Kocher, technische Mitarbeiterin
(bis November 2012)
Karin Blaser, technische Mitarbeiterin
Claudia Zurbuchen, technische Mitarbeiterin
Cornelia Schlup, technische Mitarbeiterin (seit Juli 2012)
Zusammenfassung der Forschungstätigkeiten
Bei microRNAs handelt es sich um kurze regulatorische RNAs,
die auf posttranskriptioneller Ebene an einer Vielzahl von biologischen
Prozessen beteiligt sind, darunter auch der Proliferation,
der Differenzierung und der Apoptose. Wir sind an der
Rolle der microRNAs bei der Zellzyklusregulation, der Apoptose
und der Medikamentenresistenz interessiert. Dies untersuchen
wir bei zwei Tumorsystemen, dem nicht kleinzelligen
Lungenkarzinom (NSCL – Non-Small Cell Lung Cancer) und den
Gliomen. Wir haben bereits früher nachweisen können, dass
miR-15a, miR-16 und miR-34a zusammen dazu beitragen, einen
Zellzyklusarrest auf synergistische und Rb-abhängige Art und
Weise herbeizuführen, und haben physiologisch bedeutende
Zielgruppen dieser NSCLC-Zellen identifiziert (Bandi et al 2009,
Bandi et Vassella 2011). Derzeit untersuchen wir microRNAs,
die durch den EGFR-Signalübertragungsweg angeregt werden,
und untersuchen deren Rolle bei Chemoresistenz, Apoptose,
Invasion und Proliferation von NSCLC-Zellen. Dieses
Projekt wird derzeit von der Krebsliga Schweiz drittmittelfinanziert.
In einem zweiten Projekt werden microRNAs identifiziert,
die am NF-Kappa-Signalweg beteiligt sind. Diese
microRNAs werden weiterhin bezüglich ihrer Rolle bei der
Weiterleitung des antiapoptotischen Signals von Gliomzelllinien
untersucht und inwiefern dies die Resistenz gegenüber
Temozolomid beeinflusst. Dieses Projekt wird derzeit vom
Schweizerischen Nationalfonds zur Förderung der wissenschaftlichen
Forschung und von der Bernischen Krebsliga
drittmittelfinanziert.
Kollaborationen
• Jean-Louis Boulay und Luigi Mariani, Universitätsspital, Basel
• Mathias Gugger und Stephan Schäfer,
Institut für Pathologie, Universität Bern
• Rolf Jaggi, DKF, Bern
• Istvan Vajtai, Institut für Pathologie, Universität Bern
• Mario Tschan, Institut für Pathologie, Universität Bern
Drittmittelfinanzierung
• SNF #138129 (2012–2015), CHF 290 066.–
• Krebsliga Schweiz, Project KFS-2826-08-2011 (2012–2015),
CHF 204 400.–

Institut für Pathologie > Forschung 29
1.2 Translationale Forschung
(Translational Research Unit, TRU)
Prof. A. Perren, MD, Direktor
PD. I. Zlobec, PhD-Koordinatorin
Mitarbeiter:
Jacqueline Devincenti, administrative Unterstützung
Mary Economou, technische Mitarbeiterin
Caroline Hammer, technische Mitarbeiterin
Dr. Dominique Müller, Forschungsassistentin
Bei der Translational Research Unit (TRU) handelt es sich um
eine neu gegründete Forschungseinrichtung, die eine technische
Plattform für eine auf die Klinik ausgerichtete Forschung
bietet. Diese steht sowohl klinischen Pathologen, Grundlagenforschern
als auch Kollaborationspartnern und externen Kunden
zur Verfügung. Das Ziel dieses Labors ist die Förderung
einer wechselseitigen Beziehung zwischen klinischer und
Grundlagenforschung, d.h. Translation und reverser Translation.
Die TRU koordiniert auch die Forschungstätigkeit von
Forschungsgruppen der klinisch tätigen Pathologen.
Das TRU-Core-Labor umfasst zurzeit drei Labore und administrative
Büros sowie technische Mitarbeiter. Unsere Core-
Labor-Mitarbeiter sind auf histologische Techniken, Immunhistochemie
und PCR-basierte Methoden, darunter auch
Pyrosequenzierung, spezialisiert. Einige Beispiele für vor
Kurzem durchgeführte Analysen sind die Mutationsanalyse
von k-RAS und BRAF sowie eine grosse Vielzahl an CpG-
Methylatierungsassays. Die TRU bietet darüber hinaus Forschern
und ihren Projekten Unterstützung in biostatistischen
Analysen.
Die TRU hat 2012 «Next-Generation Tissue Microarrays
(ngTMAs)» eingeführt, einen Service, der Beratung und technische
Unterstützung bei der Erstellung von TMAs bietet. Wir
haben eine revolutionäre, auf Automatisierung und digitaler
Pathologie basierende Technologie mit unseren Kenntnissen
und Erfahrungen in der Histologie kombiniert. Dies ermöglicht
es Forschern weltweit, ihre eigenen TMAs auf ihren
Computern oder Tablet-PCs zu erstellen. Weitere Informationen
hierzu finden sich auf www.ngtma.com.

30 Institut für Pathologie > Forschung
Forschungsgruppe «Endokrine Pathologie»
Aurel Perren, MD, Direktor
Ilaria Marinoni, PhD, Post-Doc-Mitarbeiterin
Thomas Rudolph, technischer Mitarbeiter
Anja Schmitt, MD, Pathologin
Annika Blank, MD, Pathologin
Matthias Dettmer, MD (in Pittsburgh)
Fabio Hunger, BSc, Master-Student
Zusammenfassung der Forschungstätigkeiten
Der Schwerpunkt unserer Forschung liegt in der genetischen
Evolution von sporadischen und familiären neuroendokrinen
Pankreastumoren (pNET). Durch ihre Hormonproduktion können
diese Tumoren lebensbedrohliche Syndrome verursachen.
Es handelt sich nicht um eine homogene Tumorgruppe, sondern
um genetisch definierte Untergruppen. Der Forschungsansatz
der Gruppe besteht darin, Hilfsmittel der Grundlagenforschung,
darunter auch transgene In-vivo-Mausmodelle und
In-vitro-Zellkulturmodelle, mit aus humanen Tumorgeweben
gewonnenen Ergebnissen und Patientendaten zu verbinden.
Wir wollen dadurch unsere Forschung auf diejenigen molekularen
Signalwege konzentrieren, die für die Erkrankung
beim Menschen von Bedeutung sind. Dieser Ansatz spiegelt
sich in der Zusammensetzung der Gruppenmitarbeiter wider,
die sowohl Mediziner als auch Biologen umfasst. Die beiden
derzeitigen Hauptprojekte umfassen:
Analyse der Rolle von Daxx und Atrx bei pNET:
Vor Kurzem wurden Mutationen in DAXX und ATRX mit
einem Verlust der Expression der entsprechenden Proteine
bei fast 40% der sporadischen pNET nachgewiesen. Der
Schwerpunkt unserer Forschung liegt hier in der Erforschung
des zugrunde liegenden Mechanismus dieses neuen mit
Krebs verbundenen Signalwegs und in der Untersuchung der
molekularen und klinischen Eigenschaften DAXX/ATRX-mutierter
Tumoren.
Die Rolle von Hypoxiesignalen bei pNET
Ungefähr 10% der Patienten mit einem Von-Hippel-Lindau-
Syndrom leiden unter pNET. Diese Tumoren zeichnen sich
durch aktive Hypoxiesignalkaskaden aus. Wir haben in einer
Untergruppe von sporadischen pNET somatische VHL-Veränderungen
beschrieben, die auch mit Hypoxiesignalen und
mit einer schlechten Prognose in Zusammenhang stehen. Die
zugrunde liegenden Mechanismen werden bei pNET-Zelllinien
und in pNET-Geweben analysiert.
Die derzeitige Drittmittelfinanzierung umfasst
• Bernische Krebsliga, Grant to Anja Schmitt Kurrer (2012–2014)
• SNF Grant No. 310030_144236 to Aurel Perren (2012–2015)
Forschungsgruppe
«Brust- und gynäkologische Pathologie»
Coya Tapia, MD, Pathologin
Stephan Schaefer, MD, Pathologe
Katrin Pfaltz, MD, Assistenzärztin
Mafalda Trippel, MD, Assistenzärztin
Zusammenfassung der Forschungstätigkeiten
Die Forschungsgruppe «Brust- und gynäkologische Pathologie»
hat drei Hauptinteressengebiete. Hierzu gehören die
Validierung von Genen, die an zielgerichteten Brustkrebstherapien
beteiligt sind, die Untersuchung von an der Tumorprogression
und an der epithelial-mesenchymalen Transition
(EMT) beteiligten Gene sowie die Untersuchung der Tumorheterogenität.
Daher erstellt unsere Gruppe derzeit ein Tissue
Microarray (TMA) mit unserer Next-Generation-TMA-Plattform
(ngTMA), die neben Primärtumoren und entsprechenden
Lymphknotenmetastasen sowie Fernmetastasen auch lokale
Rezidive und Fernrezidive umfasst.
Externe Kollaborationen
Ein Projekt zur Erforschung von Endometriose wurde gemeinsam
mit den Forschungsgruppen von Prof. M. Müller
(Universitätsklinik für Frauenheilkunde, Inselspital Bern) und
Prof. N. Bersinger (Abteilung für klinische Forschung, Universität
Bern) ins Leben gerufen.
Studien zu primärem Brustkrebs und Metastasen im Gehirn
werden aktuell gemeinsam mit den Forschungsgruppen von
PD Dr. med. A. Günthert (Kantonsspital, Luzern), Prof. R. Jaggi
(Abteilung für klinische Forschung, Universität Bern), Prof. A.C.
Andres (Abteilung für klinische Forschung, Universität Bern),
Prof. B. Salhia, PhD (Translational Genomics Research Institute,
Phoenix, Arizona, USA) durchgeführt. In Zusammenarbeit
mit Dr. N. Cihroic und der Universität Belgrad arbeiten wir
an einer computergestützten Evaluierung von Fluoreszenzin-situ-Hybridisierungssignalen
(FISH) bei Brustkrebs.
Forschungsgruppe «Hämatopathologie»
Yara Banz, MD, PhD, Pathologin
Christian Schürch, MD, PhD, Assistenzarzt
Serena Galli, Master-Studentin (Medizin)
Zusammenfassung der Forschungstätigkeiten
Die Forschungsaktivitäten der Hämatopathologie-Gruppe
umfassen Kollaborationen mit klinischen Partnern im Bereich
der akuten Leukämie sowie der Lymphome. Unsere derzeitigen
Forschungen konzentrieren sich auf die Erstellung
eines Tissue Microarray der akuten myeloischen Leukämie
und der Erforschung von Prognose- und Diagnosefaktoren in
der Leukämiebiologie.

Institut für Pathologie > Forschung 31
Kollaborationen
• Onkologie Inselspital: Adrian Ochsenbein; Thomas Pabst;
Urban Novak
• DKF / Kardiovaskuläre Forschung: Robert Rieben;
Thusitha Gajanayake; Florian Schönhoff; Nicolas Diehm
• Extern: Stephan Dirnhofer und Alexander Tzankov
(Pathologie Basel)
Forschungsgruppe «Neuropathologie»
Istvan Vajtai, MD, Pathologe
Ekkehard Hewer, MD, Pathologe
Sabina Berezowska, MD, Assistenzärztin
Zusammenfassung der Forschungstätigkeiten
Der Fachbereich Neuropathologie ist eine spezielle Untergruppe
innerhalb der Abteilung für klinische Pathologie, deren
Mitarbeiter sich vor allem der Diagnose und interdisziplinären
Erforschung von Läsionen des Nervensystems widmen.
Die Forschungsansätze basieren auf Kenntnissen und Wissen,
die aus neurochirurgischen und Autopsieproben sowie aus
neuromuskulären Biopsien gewonnen wurden und der forensischen
Neuropathologie sowie verschiedensten Konsultationsfällen
entstammen, wobei die letztgenannten auch Fälle
der veterinärmedizinischen Neuropathologie umfassen. Durch
die Anbindung an die Translationale Forschungseinheit sind
Mitarbeiter dieses Forschungsbereichs auch an verschiedenen
Forschungsprojekten beteiligt – sowohl intern wie
extern. Derzeit verfolgen wir folgende akademische Hauptziele:
(i) Genotyp-Phänotyp-Beziehungen des MGMT-Status
bei Hypophysenadenomen; (ii) Genotyp-Phänotyp-Beziehungen
bei Oligodendrogliomen und (iii) die deskriptive
Charakterisierung neu entstehender Tumorentitäten. Die interne
Zusammenarbeit mit der von PD Erik Vassella geleiteten
Gruppe konzentriert sich auf die Erstellung von microRNA-
Profilen bei infiltrierenden Gliomen. Die Hauptschwerpunkte
des wissenschaftlichen Austausches mit externen Partnern
bestehen in der Erforschung (i) von pathologischen Korrelaten
der Bildgebung bei neurodegenerativen Erkrankungen (Abteilung
für Diagnostische und Interventionelle Neuroradiologie);
(ii) der prädiktiven Bildgebung eines arteriosklerotischen
Karotisverschlusses (Abteilungen für Neurologie und Neurochirurgie)
und (iii) die neuropathologische Validierung der
zielgerichteten stereotaktischen/navigierenden Behandlung
von Hirntumoren mittels Biofluoreszenz (Abteilung für Neurochirurgie).
Zu den hier zu nennenden bemerkenswerten Forschungsergebnissen
der Gruppe gehören die Dokumentation
von immunologischen Eigenschaften von follikulostellaten
Zellen bei Hypophysenadenomen, ein Beitrag zur Histogenese
von Spindelzellenonkozytomen und die Präzisierung
der Phänomenologie mehrerer zuvor unbekannter Untergruppen
von Hirn-, Hypophysentumoren und Tumoren des
peripheren Nervensystems.
Weiter- und Fortbildungsveranstaltungen
(Organisation/Moderation/Vorträge)
• «Session Around the Microscope» of the
Swiss Society of Neuropathology, 15. Dezember 2012,
Institut für Pathologie der Universität Bern
• Swiss Histotech Neuropathology-Workshop,
29. November–1. Dezember 2012, Institut für Pathologie
der Universität Bern
Forschungsgruppe «Uropathologie»
Achim Fleischmann, Prof. MD, Pathologe
Vera Genitsch, MD, Assistenzärztin
Zusammenfassung der Forschungstätigkeiten
Unsere Forschungsinteressen liegen im Bereich der prognostischen
und prädiktiven molekularen Marker bei urologischen
Tumoren, insbesondere bei Prostata- und Blasenkrebs. Diese
Marker umfassen Gene, microRNAs und Proteine. In diesem
Bereich arbeiten wir mit nationalen und ausländischen Einrichtungen
zusammen.
Drittmittelfinanzierung
• Bernische Krebsliga und Novartis
Forschungsgruppe «Viszerale Pathologie –
unterer Gastrointestinaltrakt»
Alessandro Lugli, Prof. MD, Leiter Klinische Pathologie,
Pathologe
Inti Zlobec, PD, PhD
Heather Dawson, MD, Assistenzärztin
Viktor Kölzer, MD, Assistenzarzt
Melina Helbling, Master-Studentin (Medizin)
Zusammenfassung der Forschungstätigkeiten
Der Schwerpunkt der Forschungstätigkeiten unserer Gruppe
liegt in der molekularen Pathogenese von Darmkrebs, der Erkennung
und Standardisierung histomorphologischer, immunhistochemischer
und molekularer Biomarker bei der Behandlung
von Darmkrebspatienten. Das «Tumor Budding», die
Tumor-Mikroumgebung, die Tumorimmunologie sowie spezifische
molekulare Veränderungen bei Patienten, die einen
hochgradigen «Tumor-Budding»-Phänotyp aufweisen, sind
hier von primärem Interesse.
Wir untersuchen im Rahmen fortlaufender molekularpathologischer
Projekte den CpG-Island-Methylator-Phänotyp
(CIMP), die Mismatch-Reparaturproteine, den k-RAS- und
BRAF-Status, CDX2 sowie die nachgeordneten Ras-Moleküle
und den Wnt-Signalweg.

32 Institut für Pathologie > Forschung

Institut für Pathologie > Forschung 33
Im Jahr 2008 haben wir bereits das Protein RHAMM als einen
stark negativen und unabhängigen Prognosefaktor identifiziert.
Derzeit führen wir ein revers-translationales Projekt zu
RHAMM durch, um seine funktionellen Eigenschaften bei
Darmkrebs und seine Auswirkung auf die Genexpression
mithilfe von frischen Humanproben sowie In-vitro- und Invivo-Methoden
zu untersuchen.
Im Bereich der klinischen Pathologie liegt der Schwerpunkt
unserer Forschung auf dem «Tumor Budding», dem histologischen
Kennzeichen einer epithelial-mesenchymalen Transition
(EMT). Wir untersuchen die Reproduzierbarkeit verschiedener
Scoring-Systeme einschliesslich unseres eigenen,
basierend auf 10-HPF, und bewerten die Auswirkungen der
Anwendung der «Intratumoralen Buddings (ITB)» auf präoperative
Biopsien der Klinik.
Darüber hinaus setzen wir unsere Studien der Mikroumgebung
von «Tumor-Budding»-Zellen fort. Ein Schwerpunktthema
sind Anoikis und Anoikis-Resistenzmechanismen.
Laufende Projekte umfassen des Weiteren die immunhistochemische
Untersuchung von Immunmarkern und den Immunscore
(CD3/CD8/CD45RO).
Externe Kollaborationen
• G. Iezzi, Universität Basel
• K. Heinimann, Universität Basel
• D. Kienle, Onkologie, St. Gallen
• M. Frattini, Pathologie, Locarno
• P. Quirke, Leeds, UK
• U. Stein, Charité, Universität Berlin
• G. Puppa, Pathologie, Verona
• J. Galon, INSERM, Paris
• I. Nagtegaal, Radboud University Medical Center, Nijmegen
• K. Baker, Brigham and Women’s Hospital, Boston
• C. Saucier, University of Sherbrooke, Montreal
• A. Hartmann, Universität Erlangen
• P. Minoo, University of California, San Diego
• O. Sieber, Ludwig Institute for Cancer Research, Melbourne
• I. Tomlinson, Wellcome Trust Centre for Human
Genetics, Oxford
• R. Genta, UT Southwestern Medical Center, Dallas
• R. Riddell, University of Toronto
• B. Bonavida, UCLA, Los Angeles
• S. André und H.-J. Gabius,
Ludwig-Maximilians-Universität, München
• G. Masucci, Karolinska Institutet, Stockholm
• P. Ascierto, Istituto Nazionale Tumori, Napoli
• F. Marincola, NIH, Bethesda
Drittmittelfinanzierung
• SNF Grant No. 310030_133114/bernische Krebsliga/
Novartis Stiftung Nr.11B46
Forschungsgruppe
«Viszerale Pathologie – Pankreas»
Eva Diamantis, MD, Pathologin
Diana Born, MD, Assistenzärztin
Beat Gloor, MD, Chirurgie
Zusammenfassung der Forschungstätigkeiten
Das Hauptinteresse der Gruppe besteht in der Untersuchung
des duktalen Pankreasadenokarzinoms (PDAC). Im Einzelnen
liegt der Schwerpunkt der Forschungen der Gruppe auf der
(a) Identifizierung der molekularen Veränderungen, die eine
epithelial-mesenchymale Transition (EMT) und Krebsstammzellmerkmale
(CSC) begünstigen, und der (b) Bestimmung
der Rolle von microRNAs und PTEN-Signalwegveränderungen
bei der PDAC-Progression und der Identifizierung charakteristischer
microRNA-Profile und PTEN-Alterationen in Bezug
auf die EMT in Form von «Tumor Budding» sowie die klinischen
Ergebnisse, das Ansprechen auf eine adjuvante Therapie und
das Überleben der Patienten.
Drittmittelfinanzierung
• Fondation Johanna Dürmüller-Bol, CHF 20 000.– (2013)
Forschungsgruppe «Viszerale Pathologie –
oberer Gastrointestinaltrakt»
Rupert Langer, PD, MD, Pathologe
Svenja Thies, MD, Assistenzärztin
Zusammenfassung der Forschungstätigkeiten
Wir untersuchen die histomorphologischen und molekularen
Eigenschaften von Tumoren des oberen Gastrointestinaltrakts,
insbesondere von Speiseröhrenkrebs. Es handelt sich
um die Analyse biologischer und klinischer Faktoren, die ein
Ansprechen auf die Behandlung (z.B. neoadjuvante Chemotherapie)
und die Prognose vorhersagen können. Ein besonderer
Schwerpunkt liegt hierbei auf zellulären Stressproteinen,
insbesondere auf Heatshock-Proteinen und glukoseregulierten
Proteinen. Zusätzlich zu immunhistochemischen
Untersuchungen führen wir auch quantitative Proteinexpressionsanalysen
durch.
Kollaborationen
Die Forschungsgruppe «Viszerale Pathologie – oberer Gastrointestinaltrakt»
arbeitet eng mit den Arbeitsgruppen von
Prof. Alessandro Lugli und PD Mario Tschan, mit Christian
Seiler und Dino Kröll (Inselspital, Bern) und extern mit Arbeitsgruppen
des Instituts für Pathologie der Technischen
Universität München (Dr. Julia Slotta-Huspenina und Prof.
Karl-Friedrich Becker) zusammen.

34 Institut für Pathologie > Forschung
Forschungsgruppe «Viszerale Pathologie – Leber»
Matteo Montani, MD, Pathologe
Martina Kuster, Master-Studentin (Medizin)
Zusammenfassung der Forschungstätigkeiten
Der Forschungsschwerpunkt ist die Untersuchung von Genen
und Signalwegen, die zum Tumorrezidiv und zur Metastasierung
bei Patienten mit hepatozellulärem Karzinom führen.
Darüber hinaus interessieren wir uns aufgrund der guten
Einbindung unseres Instituts in das Lebertransplantationszentrum
des Inselspitals für die Mechanismen, die zu einer
nicht neoplastischen Lebererkrankung, insbesondere der
nicht alkoholischen Fettlebererkrankung, führen sowie für
deren nicht invasive radiologische Diagnose.
Kollaborationen
In diesem Rahmen arbeiten wir derzeit mit der Gruppe von
Prof. Dr. med. Felix Stickel, PD Dr. med. Nasser Semmo (UVCM
Hepatologie, Inselspital Bern), PD Dr. rer. nat. Deborah Stroka,
Dr. med. Vanessa Banz, MDphd und Prof. Dr. med. Guido Beldi
(UVCM Viszerale Chirurgie, Inselspital Bern), PD Dr. med. A.
Christe und PD Dr. med. S. Puig (Institut für Radiologie, Inselspital
Bern) und der Gruppe von Prof. Markus Stoffel (Institut
für Molekulare Systembiologie, ETH Zürich) und den Dres.
Hans Scheffel und Michael Fischer (Institut für Diagnostische
und Interventionelle Radiologie, Universitätsspital Zürich)
zusammen.
2 Akademische Grade
2.1 Akademische Grade intern
Birrer Michèle Andrea, MD-Thesis
Establishing and Optimizing an ELISA assay to detect and
quantify sTREM-1 in serum samples from patients with IBD
Dissertationsleiter: Prof. Dr. C. Müller
Federzoni Elena, PhD
HK3, CORO1A and c-Flip: characterization of novel PU.1
targets involved in myeloid differentiation and cell survival.
Supervisor: PD Dr. phil. nat. M.P. Tschan
Künzi Lisa, PhD
Responses of Lung Cells to Realistic Exposure of Primary
and Aged Carbonaceous Aerosols
Hauptbetreuer: Prof. Dr. phil. nat. Ch. Müller
Langsch Stephanie, Msc.
Characterisation of liver sinusoidal endothelial cell death
Hauptbetreuer: PD Dr. phil. nat. N. Corazza
Mathis Lucia, Msc.
Phosphatidylinositol-4-phosphate 5-kinase in human
T cells – reorganization and functional role in migration
Hauptbetreuer: Prof. Dr. phil. nat. V. Niggli
McEvoy Julien, Msc
The Role of Triggering Receptor Expressed on Myeloid
Cells-1 (TREM-1) in the Pathogenesis of Liver Diseases
Hauptbetreuer: PD Dr. phil. nat. N. Corazza
Muri Lukas, Bsc.
Differential expression of TREM-1 and TREM-2 on human
macrophage subsets
Hauptbetreuer: Prof. Dr. phil. nat. Ch. Müller
Schürch Christian MD, PhD
Immune surveillance of cancer stem cells in chronic
myeloid leukemia
Supervisor: Prof. Adrian Ochsenbein, Onkologie/DKF
Betreuer: Prof. T. Brunner
2.2 Akademische Grade extern
Bührer Emanuel, Dr. med.
Identification of microRNAs involved in Acute
Myeloid Leukemia
Supervisor: Prof. Dr. med. M.F. Fey
Betreuer: PD Dr. phil. nat. M.P. Tschan
Wyler Kurt
Involvement of miR-181a in intestinal epithelial cell
differentiation and colorectal cancer
Betreuer: PD Dr. pharm. E. Vassella
Fellmann Marc, Msc.
Potential Role for Triggering Receptor Expressed on Myeloid
cells-1 in the Pathogenesis of Artheriosclerosis
Hauptbetreuer: Prof. Dr. phil. nat. Ch. Müller
Humbert Magalie, PhD
Role and regulation of Krüppel-Like Factor 5 (KLF5) and
Death-Associated Protein Kinase 2 (DAPK2) in
differentiation of acute myeloid leukemia blasts.
Hauptbetreuer: PD Dr. phil. nat. M.P. Tschan

Institut für Pathologie > Publikationen 35
3 Publikationen
3.1 Originalarbeiten In-House
• Badmann A., Langsch S., Keogh A., Brunner T., Kaufmann T.,
Corazza N.: TRAIL enhances paracetamol-induced liver sinusoidal
endothelial cell death in a Bim- and Bid-dependent manner.
Cell Death Dis 3: e447, 2012
• Banz Y., Hess O.M., Meier P., Korchagina E.Y., Gordeeva E.A.,
Robson S.C., Gajanayake T., Csizmadia E., Mettler D., Haeberli A.,
Bovin N.V., Rieben R.: Evaluation of multimeric tyrosine-O-sulfate
as a cytoprotectant in an in vivo model of acute myocardial
infarction in pigs. Cardiology 121(1): 59-70, 2012
• Bauer K., Nitsche U., Slotta-Huspenina J., Drecoll E., von Weyhern
C.H., Rosenberg R., Höfler H., Langer R.: High HSP27 and HSP70
expression levels are independent adverse prognostic factors in primary
resected colon cancer. Cell Oncol (dordr) 35(3): 197-205, 2012
• Baumann T., Affentranger S., Niggli V.: Evidence for chemokinemediated
coalescence of preformed flotillin hetero-oligomers in
human T-cells. J Biol Chem 287(47): 39664-72, 2012
• Becker K., Reim D., Novotny A., Zum Büschenfelde C.M., Engel J.,
Friess H., Höfler H., Langer R.: Proposal for a multifactorial prognostic
score that accurately classifies 3 groups of gastric carcinoma
patients with different outcomes after neoadjuvant chemotherapy
and surgery. Ann Surg 256(6): 1002-7, 2012
• Berezowska S., Tomoka T., Kamiza S., Milner D.A., Langer R.:
Surgical pathology in sub-Saharan Africa – volunteering in Malawi.
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A QA study of the Swiss Working Group of Breast- and Gynecopathologists.
Plos One 7(5): e37379, 2012
• von Guggenberg E., Rangger C., Sosabowski J., Laverman P.,
Reubi J.C., Virgolini I.J., Decristoforo C.: Preclinical Evaluation of
Radiolabeled DOTA-Derivatized Cyclic Minigastrin Analogs for
Targeting Cholecystokinin Receptor Expressing Malignancies.
Mol Imaging Biol 14(3): 366-75, 2012
• Wang Q., Domenighetti A.A., Schäfer S.C., Weber J., Simon A.,
Maillard M.P., Pedrazzini T., Chen J., Lehr H.A., Burnier M.: Impact
of salt on cardiac differential gene expression and coronary lesion
in normotensive mineralocorticoid-treated mice.
Am J Physiol-reg I 302(9): R1025-33, 2012
• Wang X., Fani M., Schulz S., Rivier J., Reubi J.C., Maecke H.R.:
Comprehensive evaluation of a somatostatin-based radiolabelled
antagonist for diagnostic imaging and radionuclide therapy.
Eur J Nucl Med Mol I 39(12): 1876-85, 2012
• Wang Y., Perentes J.Y., Schäfer S.C., Gonzalez M., Debefve E.,
Lehr H.A., van den Bergh H., Krueger T.: Photodynamic drug
delivery enhancement in tumours does not depend on leukocyteendothelial
interaction in a human mesothelioma xenograft model.
Eur J Cardio-thorac 42(2): 348-54, 2012
• Wingender G., Stepniak D., Krebs P., Lin L., McBride S., Wei B.,
Braun J., Mazmanian S.K., Kronenberg M.: Intestinal microbes
affect phenotypes and functions of invariant natural killer T cells in
mice. Gastroenterology 143(2): 418-28, 2012
• Win T., Screaton N.J., Porter J., Endozo R., Wild D., Kayani I., Dickson
J., Shortman R.I., Reubi J.C., Ell P.J., Groves A.M.: Novel positron
emission tomography/computed tomography of diffuse parenchymal
lung disease combining a labeled somatostatin receptor analogue
and 2-deoxy-2[¹?F]fluoro-D-glucose. Mol Imaging 11(2): 91-8, 2012
• Wulfkuhle J.D., Berg D., Wolff C., Langer R., Tran K., Illi J., Espina V.,
Pierobon M., Deng J., DeMichele A., Walch A., Bronger H., Becker I.,
Waldhör C., Höfler H., Esserman L., I-SPY 1 TRIAL Investigators,
Liotta L.A., Becker K.F., Petricoin E.F.: Molecular analysis of HER2
signaling in human breast cancer by functional protein pathway
activation mapping. Clin Cancer Res 18(23): 6426-35, 2012
• Zhang H., Abiraj K., Thorek D.L.J., Waser B., Smith-Jones P.M., Honer
M., Reubi J.C., Maecke H.R.: Evolution of bombesin conjugates for
targeted PET imaging of tumors. Plos One 7(9): e44046, 2012
• Zipp L., Schwartz K.M., Hewer E., Yu Y., Stippich C., Slopis J.M.:
Magnetic resonance imaging and computed tomography findings in
pediatric giant cell glioblastoma. Clin Neuroradiol 22(4): 359-63, 2012
• Zuercher E., Butticaz C., Wyniger J., Martinez R., Battegay M., Boffi
El Amari E., Dang T., Egger J.F., Fehr J., Mueller-Garamvögyi E.,
Parini A., Schaefer S.C., Schoeni-Affolter F., Thurnheer C., Tinguely
M., Telenti A., Rothenberger S., Swiss HIV Cohort Study: Genetic
diversity of EBV-encoded LMP1 in the Swiss HIV Cohort Study and
implication for NF-?b activation. Plos One 7(2): e32168, 2012
3.3 Übrige Publikationen
• Banz Y., Rieben R.: Role of complement and perspectives for intervention
in ischemia-reperfusion damage. Ann Med 44(3): 205-17, 2012
• Dubach P., Mantokoudis G., Banz Y., Caversaccio M., Senn P.:
Idiopathic External Ear Canal Cholesteatoma. Otol Neurotol , 2012
• Eicken S., Gugger M., Marti H.P.: [Glomerulonephritis and vasculitis
as causes of arterial hypertension]. Ther Umsch 69(5): 283-94, 2012
• Guevara C., Seidel U., Hewer E., Vajtai I.: Intraosseous traumatic
neuroma of the lumbar spine: a previously unrecognized form of
vertebral pseudotumor. Clin Neuropathol, 2012
• Komminoth A., Perren A.: Disseminiertes neuroendokrines
System. In: Pathologie. Böcker, Denk, Heitz, Moch (ed).
Urban & Fischer, 2012
• Komminoth P., Perren A.: Polyglanduläre Störungen. In: Pathologie.
Böcker, Denk, Heitz, Moch (ed). Urban & Fischer, 2012
• Komminoth P., Perren A.: Nebennieren. In: Pathologie.
Böcker, Denk, Heitz, Moch (ed). Urban & Fischer, 2012
• Körner M., Christ E., Wild D., Reubi J.C.: Glucagon-like peptide-1
receptor overexpression in cancer and its impact on clinical applications.
Front Endocrinol (lausanne) 3: 158, 2012
• Lehr H.A., Moch H., Christen B., Safret A., Gugger M., Rössle M.,
von Gunten M., Lemoine R., Kurt A.M., Caduff R., Walter A.,
Singer G., Luscieti P., Bannwart F., Genton C.Y.: Board examination
for anatomical pathology in Switzerland: two intense days to verify
professional competence. Virchows Arch 461(1): 87-92, 2012
• Lugli A., Karamitopoulou E., Zlobec I.: Tumour budding:
a promising parameter in colorectal cancer.
Brit J Cancer 106(11): 1713-7, 2012
• Müller C., Höfler G., Imhof B.A., Holländer G.A.: Pathologische
Immunreaktionen. In: Pathologie. Böcker W, Denk H, Heitz Ph, Höfler
G, Kreipe H, Moch H (ed). Elsevier (Urban & Fischer), 75-111, 2012
• Müller C., Höfler G., Imhof B.A., Holländer G.A.: Entzündung.
In: Pathologie. Böcker W, Denk H, Heitz Ph, Höfler G, Kreipe H,
Moch H (ed). Elsevier (Urban & Fischer), 43-73, 2012
• Öberg K., Knigge U., Kwekkeboom D., Perren A., ESMO Guidelines
Working Group: Neuroendocrine gastro-entero-pancreatic tumors:
ESMO Clinical Practice Guidelines for diagnosis, treatment and
follow-up. Ann Oncol 23 Suppl 7: vii124-30, 2012
• Obermann E.C., Eppenberger-Castori S., Tapia C.: [Assessment
of proliferation: core biopsy or resection specimen? Discrepancies in
breast cancer with low and high proliferation].
Pathologe 33(3): 245-50, 2012
• Pape U.F., Perren A., Niederle B., Gross D., Gress T., Costa F.,
Arnold R., Denecke T., Plöckinger U., Salazar R., Grossman A.,
Barcelona Consensus Conference participants: ENETS Consensus
Guidelines for the management of patients with neuroendocrine
neoplasms from the jejuno-ileum and the appendix including
goblet cell carcinomas. Neuroendocrinology 95(2): 135-56, 2012
• Perren A., Komminoth P.: Nebenschilddrüse. In: Pathologie.
Böcker, Denk, Heitz, Moch (ed). Urban & Fischer, 2012
• Perren A., Komminoth P.: Hypophyse. In: Pathologie.
Böcker, Denk, Heitz, Moch (ed). Urban & Fischer, 2012
• Perren A., Komminoth P., Schmid K.W.: Schilddrüse.
In: Pathologie. Böcker, Denk, Heitz, Moch (ed). Urban & Fischer, 2012
• Pfammatter C., Lindenmüller I.H., Lugli A., Filippi A., Kühl S.:
Metastases and primary tumors around dental implants: A literature
review and case report of peri-implant pulmonary metastasis.
Quintessence Int 43(7): 563-70, 2012
• Riether C., Schürch C., Ochsenbein A.F.: Modulating CD27 signaling
to treat cancer. Oncoimmunology 1(9): 1604-6, 2012
• Suter V.G.A., Zbären P., Borradori L., Schmitt A.M., Reichart P.A.,
Bornstein M.M.: Scarring and chronic ulceration of the floor of the
mouth. Oral Surg Oral Med Oral Pathol Oral Radiol , 2012
• Troeltzsch M., Stimmer H., Langer R., Troeltzsch M., Steiner T.,
Wolff K.D.: High-grade supraclavicular soft tissue sarcoma as
secondary malignancy after successful treatment of acute myeloid
leukemia: case report and literature review.
J Oral Maxil Surg 70(9): 2211-7, 2012
• Vajtai I., Hewer E.: Atypical Histologic Features and Patterns of
Malignant Evolution in Tanycytic Ependymoma. In: Tumors of the
Central Nervous System. Hayat MA (ed). Springer, 321-329, 2012
• Zlobec I., Borner M., Lugli A., Inderbitzin D.: Role of intra- and
peritumoral budding in the interdisciplinary management of rectal
cancer patients. Int J Surg Oncol 2012: 795945, 2012

Institut für Pathologie > Vorträge 39
4 Vorträge
Corazza Nadia
• Bern (CH), 30.08.2012, SAM 2012, Role of liver sinusoidal
endothelial cells in liver damage
• Genf CH), April 2012, SGAI Role of Bim and TRAIL in T cell mediated
liver disease
Diamantis-Karamitopoulou Eva
• Ioannina, (GR), 24.04.2012, Courses in Pathology,
«Fibrocystic Liver Disease»
• Ioannina, (GR), 25.04.2012, Courses in Pathology,
«Non-viral infections of the liver»
• Athen (GR), 06.10.2012, Postdoctoral Courses,
«Molekulargenetik und Pathologie des Pankreaskarzinoms»
• Athen (GR), 08.10.2012, Postdoctoral Courses,
«Prognostic and predictive factors in Pancreatic cancer»
Fleischmann Achim
• Bern (CH), 28.02.2012, Forschungstag Institut für Pathologie,
«Therapeutic Targets and Predictive Biomarkers in Bladder Cancer»
• Bern (CH), 29.03.2012, Swiss tumor board, «Histopathology of
Genitourinary Cancer»
• Burgdorf (CH), 24.04.2012, Fortbildung Medizinische Klinik,
«Ist die Autopsie noch zeitgemäss?»
• Bern (CH), 26.04.2012, Fortbildung Medizinische Klinik Spital
Tiefenau, «Autopsie heute»
• Bern (CH) 31.05.2012, Fortbildungsreihe Viszeralchirurgie,
«Relevanz der Autopsie»
• Vancouver (CDN), 31.05.12, USCAP, «Tumor regression after
neoadjuvant chemotherapy independently predicts survival in
bladder cancer patients»
• Bern (CH), 08.08.2012, Fortbildung Medizinische Klinik
Zieglerspital, «Autopsie heute»
• Bern (CH), 30.08.2012 Kardiovaskuläres Kolloquium,
«Das Berner Autopsie-Konzept»
• Prag (CZ), 12.09.2012, ESP, «Prevalence and prognostic significance
of TMPRSS2-ERG gene fusion in lymph node positive prostate cancer»
• Langenthal (CH), 19.09.2012 Fortbildung Medizinische Klinik,
«Autopsie heute»
• Bern (CH), 18.10.2012, Fortbildungsreihe Urologische Klinik,
«Warum autopsieren?»
• St. Gallen (CH), 09.11.2012, SGPath, «Tumor regression grade of
urothelial bladder cancer after neoadjuvant chemotherapy: A novel
and successful strategy to predict survival»
• Interlaken (CH), 04.12.2012, Fortbildungsreihe Medizinische Klinik,
«Ist die Autopsie noch zeitgemäss?»
Kölzer Viktor
• Bern (CH), 29.02.2012, 6. Tag der Forschung 2012 Universität Bern,
Schweiz, «Investigating Raf kinase inhibitor protein (RKIP) –
an interesting target in colorectal carcinoma?»
• Prag (CZ), 10.09.2012, Annual meeting of the European Society of
Pathology, «Geographic analysis of the protein expression
of metastasis suppressor gene RKIP and its clinical relevance in
colorectal cancer»
• Bern (CH), 18.10.2012, Business meeting of the Swiss Association
of Gastroenterology (SAGIP), «Evaluating tumor budding in CRC;
A SAGIP study?»

40 Institut für Pathologie > Vorträge
• St. Gallen (CH), 09.11.2012, 78 th Annual meeting of the Swiss
Society of Pathology, «Active host immunosurveillance
characterized by triple positive MHC-I/CD8/TIA1 expression is
associated with low frequency tumor budding and improved
outcome in colorectal cancer»
Körner Meike
• Vancouver, (CDN), 19.03.2012, USCAP Annual Meeting 2012,
«Somatostatin receptor subtype 2A immunohistochemistry using a
new monoclonal antibody selects tumors suitable for in vivo
somatostatin receptor targeting»
Krebs Philippe
• Bern (CH), 18.01.2012, Sitzung der kantonalen Tierschutzkommission,
«Animal models of inflammation and immunopathology»
• Unterwasser (CH), 23.–25.01.2012, Retreat of the Institute for
Immunobiology (at the Cantonal Hospital of St. Gallen), «Systematic
dissection of immune responses using ENU mutagenesis»
Langer Rupert
• Bern (CH), 18.10.2012, SAGIP meeting, «Regression Grade in
Gastrointestinal Tumors»
Lugli Alessandro
• Biel (CH), 25.01.2012, Swiss Eye Week 2012, «Fundamentals in
inflammation»
• Neapel (I), 13.02.2012, Workshop of the SITC, «The AJCC Classification
of Colorectal Cancer: a review»
• Zürich (CH), 28.04.2012, Symposium and Slide Seminar of the SSP,
«Update in Gastrointestinal Pathology»
• Bern (CH), 13.10.2012, Personalized Healthcare in Oncology,
«Molecular Classification of Colon Carcinoma»
• Bethesda (USA), 24.10.2012, Workshop and Annual Meeting of the
SITC, «The Impact of Immune Cell Infiltration on Patient Prognosis»
• Luzern (CH), 15.11.2012, 19. Luzerner Symposium Medizin und
Recht, «Klärung der Todesursache ohne Leiche: Der rätselhafte Tod
des Napoleon Bonaparte»
• Neapel (I), 05.12.12, Workshop of th SITC, «Proposal for a Supporting
Facility for Biomarker and Tumor Microenvironment Studies»
• Luzern (CH), 03.11.2012, Workshop of the SAMO, «KRAS: Pathway
and Biomarkers»
Müller Christoph
• Genf (CH), 16.06.2012, EACCI , «Chair person»
• Genf (CH), 17.06.2012, European Academy of Allergy and Clinical
Immunology (EACCI) «Maintaining local immune homeostasis in
the intestine»
• Genf (CH), 17.06.2012, EACCI, «Chair person (poster session xy)»
• Genf (CH), 16.02.2012, EACCI , «Member Local Organising
Committee»
• Ermattingen (CH), 02.–04.04.2012, Wolfsberg Swiss PhD Students
in Immunology Meeting «Chair person»
• Basel (CH), 04.05.2012, FALK Symposium, «DAMPS and IBD:
Is there a connection?»
• Basel (CH), 26.10.2012, Lecture Series in Advanced Immunology,
«Maintaining local immune homeostasis in the intestine»
Perren Aurel
• Berlin (D), 14.01.2012, 2. Interdisziplinäres Symposium, «Frühe
neuroendokrine Neoplasien und frühe GIST», «Frühe asympt. NET
des Pankreas, aus Sicht des Pathologen»
• Lausanne (CH), 19.01.2012, Symposium on Neuroendocrine Tumors,
«Classification of NEN and Potential Biomarkers»
• Basel (CH), 30.01.2012, Onko-Lunch, «Neuroendokrine Tumoren,
die Perspektive des Pathologen»
• Olten (CH), 03.02.2012, Fortbildung, «Neuroendokrine Tumoren –
es sind nicht alle gleich»
• München (D), 10.02.2012, Falk Symposium on colorectal cancer:
Chair «Histopathological work-up, carcinogenesis and tumor
dissemination»
• Kopenhagen (DK), 06.03.2012, 9 th Annual ENETS Conference,
«Vorstellung SwissNET»
• Kopenhagen (DK), 08.03.2012, Wahl in ENETS EC durch Generalversammlung
• Bern (CH), 19.04.2012, Fortbildung Hämatologie/Medizinische
Onkologie, «Biobanking in Bern und in der Schweiz»
• Ittingen (CH) 11.05.2012, 30 Jahre SHT, Symposium 2012 Ittingen,
«Effizienzsteigerung kann auch Spass machen: Lean Implementierung
im IFP Bern»
• Berlin (D), 02.06.2012, 96. Jahrestagung der DGP e.V.,
«Translat. Forschung und Diagnostik: Schilddrüsenkarzinom»
• Barcelona (E), 28.06,2012, ESMO 14 th World Congress on Gastrointestinal
Cancer, «Rare tumors: Neuroendocrine tumors and
gastrointestnal stromal tumors: What should a pathologist report
in a NET?»
• Bern (CH), 30.08.2012, Workshop, «OMICs Applications in Clinical
Practice», «The role of Biobanking»
• Prag (CZ), 09.09.2012, 24 th European Congressof Pathology, «Ki67
in digestive neuroendocrine tumors: diagnosis and prognosis»
• Athen (GR), 26.10.2012, ENETS Advisory Board, «Chair Guidelines
pulmonary NET»
• St. Gallen (CH), 08.11.2012, SGPath Jahrestagung,
«Scientific advisor»
• St. Gallen (CH), 10.11.2012, Schnittseminar, «Case Presentation
VHL associated pancreatic pathology»
• Berlin (D), 17.11.2012, 3 rd Masterclass in NET, «Plenary session II:
Practical approaches to NET»
Reubi Jean Claude
• Kopenhagen (DK), 13.06.2012, 19 th International Symposium on
Regulatory Peptides, «Somatostatin and incretin receptor
expression and trafficking in neuroendocrine tumors»
• Toulouse (F), 21.08.2012, Institut Louis Bugnard, INSERM,
«Somatostatin and incretin receptor expression and trafficking in
neuroendocrine tumors»
Schmitt Kurer Anja
• Biel (CH), 26.04.2012, FOSPED Biel, «Anything new about pancreatic
neuroendocrine tumors? Steps towards a molecular classification»
Tapia Coya
• Olten (CH), 19.01.2012, Symposium für Allgemeinmediziner und
Gynäkologen, «Die Molekularen Subtypen beim Mamma Karzinom»
• Basel (CH,) 22.05.2012, Friedrich Miescher Institute for Biolmedical
Research, «ING4 linker between Pathology and Research»
• Bern (CH), 11.12.2012, Klinisch-radiologische Gespräche,
«Tumorheterogenität beim Mammakarzinom»
• Bern (CH), 13.12.2012, Symposium des Brust-und Tumorzentrums
am Inselspital, «Mammakarzinom-Subtypen»
Zlobec Inti
• Basel (CH), 22.11.12, SAKK: Swiss Semi-Annual Meeting,
Gastro-intestinal Working Group Session, «Next-generation
tissue microarray (ngTMA): the future of biomarker research»
• Amsterdam (NL), 22.10.2012, United European Gastroenterology
Week (UEGW), Pathology Meets Endoscopy, «The Molecular
Pathogenesis of Colorectal Cancer»
• Paris (F), 14.06.2012, 1 st European Biopathology Symposium,
«Molecular Pathogenesis of Colorectal Cancer»
• Zürich (CH) 30.03.2012, Freitagsseminar, «Molecular Pathogenesis
of Colorectal Cancer: a Critical Review»
• Genf (CH) 02.11.2012, Montagsfortbildung, «Molecular Pathogenesis
of Colorectal Cancer: Past, Present and Future»

Institut für Pathologie > Zuschüsse, Preise, Ernennungen, Auszeichnungen, Patente 41
5 Zuschüsse
Corazza Nadia
• SNF, 310000-120427, 01.07.2008–01.02.2012
• Novartis Stiftung für Medizinische Biologische Forschung,
01.03.2012–28.02.2014
Diamantis-Karamitoupoulou Eva
• Johanna Dürmüller-Bol Fondation, 01.01.2013–31.12.2013
Fleischmann Achim
• Novartis, 10B44, 01.01.2012– 1.06.2013
• SNF, 01.01.2011–31.12.2013
• BKL, 01.01.2012–31.12.2013
Körner Meike
• Desiree and Niels Yde-Stiftung, 383-12, 01.07.2012–30.06.2014
Krebs Philippe
• SNF, 310030_138188, 01.09.2012.–31.08.2015
• Award from the Berne University Research Foundation,
26/2012, 30.05.2012
Lugli Alessandro
• SNF, 310030_133114/1, 01.04.2011–31. 03 2014
Mager Lukas
• PhD Fellowship Boehringer Ingelheim Fonds,
01.05.2012–30.04.2014
Müller Christoph
• SNF, 310030_138392 /,1 01.11.2011– 31.10.2014
• SNF (Sinergia), 136286, 01.12.2011–30.11.2014
(Nebengesuchsteller)
• SNF (SIBDCS), 33CS30_134274 /1, 01.04.2011–31.03.2014
(Nebengesuchsteller)
• SNF (small nested project), 33CS30_134274 /1,
01.11.2011– 31.03.2014 (Nebengesuchsteller)
Niggli Verena
• Gottfried und Julia Bangerter-Rhyner Stiftung, Basel, Schweiz,
01.01.2010–30.04.2012
• SNF, 3100A_129655/1 01.04.2010–31.03.2012
Perren Aurel
• SNF DAXX, 01.12.2012–30.11.2015
• Krebsliga Hypoxie
Reubi Jean Claude
• Desirée and Niels YDE Stiftung, 383-12,
13.06.2012–12.06.2014
• Juvenile Diabetes Research Foundation, 37-2012-4,
01.01.2012–31.12.2014 (Nebengesuchsteller)
Sauer Leslie
• SNF (nested project), 33CS30_134274 /1
01.11.2011.–31.03.2014
Tschan Mario
• SNF , 31003A_129955, 04.01.2010–31.12.2012
• Klinische Experimentelle Tumorforschung, 02.01.2010–05.01.2012
• Cancer Research Switzerland, KFS-02486-08-2009,
SNF, 31003A,129702, 02.01.2010–31.12.2013
• Diverse kleinere Forschungskredite
Vasella Erik
• Bernische Krebsliga, 01.09.2009–31.08.2012
• Krebsliga Schweiz, KFS-2826-08-2011, 01.01.2012–31.12.2014
• SNF, 01.04.2012–31.03.2015
Zlobec Inti
• Bernische Krebsliga, 01.10.2011–30.09.2013
• Novartis Stiftung, 11B46, 10.01.2011–01.06.2013
6 Preise, Ernennungen,
Auszeichnungen
Berezowska Sabina
• St. Gallen (CH) 09.11.2012
SG-Path Annual Meeting: «Posterpreis»
Born Diana
• Prag (CZ) 12.09.12
24 th European Congress of Pathology: «Georg Tiniakos Award
for best Gastrointestinal Pathology Paper»
Brasseit Jennifer
• Genf (CH) Jahrestagung der Schweiz. Gesellschaft für
Allergologie und Immunologie (SGAI)
Best oral short presentation
Reubi Jean Claude
• Virginia (USA) 01.06.2012, J Nucl Med; June 2012, Society of Nuclear
Medicine: Alavi-Mandell Award, (Abirai, Reubi et al.)
• Virginia (USA) 01.06.2012 J Nucl Med; June 2012, Society of Nuclear
Medicine: Award for best basic science investigation
(Abirai, Reubi et al.)
Schürch Christian
• Bern (CH), 2012, Jährliche Preisverleihung der Graduate School:
«GCB Award for Best PhD Thesis 2012»
7 Patente
Langer Rupert
• Patent Nr.: EU 12194197.5, 26.11.2012
«method of judging risk of cancer recurrence and computer
program» (collaboration sysmex corporation)
Schäfer Stephan,
• Biobanque Suisse 01.01.2011–31.12.13
• SNF IZ32Z0_143017, A Swiss-Indonesian collaboration study
(Nebengesuchsteller)
Schmitt Kurer Anja
• Bernische Krebsliga, 01.10.2012–30.09.2014
Schürch Christian
• Oncosuisse, KLS-2879-02-2012, 01.09.2012–01.09.2015
• SwissLife Jubiläumsstiftung, 01.06.2012–31.05.2013

42 Institut für Pathologie > Lehre

Institut für Pathologie > Lehre 43
>>> Lehre
1 Ausbildung
Prof. A. Perren, PD Dr. M. Gugger
Das Fach Pathologie begleitet die Studierenden der Humanmedizin
vom 3. bis zum 6. Studienjahr. In systematischen
Frontalvorlesungen, strukturierten Histologie-Kursen und
Autopsie-Demonstrationen wird den Studierenden Verständnis
für Mechanismen, Zusammenhänge und Morphologie
von Erkrankungen vermittelt.
In den Histologie-Kursen vom 3. bis zum 5. Studienjahr
wurde unser neuer «virtueller histologischer Schnittkasten»
erstmalig erfolgreich eingesetzt. Dieser ermöglicht es den
Studierenden, sich auch ohne Mikroskop zu Hause am PC auf
die Kurse vorzubereiten.
Parallel zu den Histologie-Kursen werden Autopsie-Demonstrationen
durchgeführt. Durch neue Projektionstechnologie
können wir hier allen Anwesenden jetzt auch sehr kleine Befunde
wie Koronarthrombosen makroskopisch demonstrieren.
Der Schwerpunkt dieser Demonstrationen ist die aktive
Erarbeitung der pathophysiologischen Krankheitssequenz
anhand der postmortalen makroskopischen Befunde.
Als Abschluss der Studienreform wurde auch in der Pathologie
erstmalig der Schlusskurs 2 im 6. Studienjahr durchgeführt.
Anhand von zahlreichen Bildern werden in dieser Veranstaltung
in nur 6 Stunden durch Prof. A. Perren und Prof.
A. Lugli die wichtigsten Erkrankungen wiederholt.
Die Retraite Bachelorstudium Human- und Zahnmedizin vom
Mai 2011 im Hotel Appenberg in Zäziwil hat Kontakte zu im
vorklinischen Histologie-Unterricht tätigen Kollegen ergeben.
2012 wurden nach Vorbesprechungen unter der Leitung von
Frau PD Dr. Herrmann, Anatomisches Institut, und Dr. med.
U. Woermann, Institut für Medizinische Lehre, die dort verwendeten
histologischen Präparate auf dem Aperio-Scangerät in
unserem Institut digitalisiert und in das vorbestehende virtuelle
Umfeld gestellt. Die histologischen Lerninhalte der
Vorklinik und der Klinik können damit in Zukunft virtuell vermittelt
sowie untereinander vernetzt und optimiert werden.
2 Weiterbildung
Prof. Dr. med. Aurel Perren
Die Weiterbildung von Assistenzärzten zum Facharzt für
Pathologie ist eine zentrale Aufgabe einer universitären
Pathologie. 2012 waren 10 Weiterbildungsstellen zum Facharzt
für Pathologie sowie 2 Teilzeit-Weiterbildungsstellen mit
Schwerpunkt Zytopathologie besetzt. Zwei weitere Pathologen
haben die Weiterbildung mit Schwerpunkt Molekularpathologie
absolviert.
Im Rahmen der Prozessoptimierung der Abteilung klinische
Pathologie haben sich die Zeiten der Rapporte zwar verschoben,
doch die Assistenzärzte sind unverändert oder vermehrt
in die tägliche Routine eingebunden und wir können die organisatorischen
Voraussetzungen garantieren, sodass die
Weiterbildung in der vorgesehenen Zeit abgeschlossen werden
kann. 2012 haben zum ersten mal alle Assistenzärzte an
der amerikanischen Prüfung RISE (Resident in Service Examination)
teilgenommen. Dies erlaubt ihnen eine individuelle
Standortbestimmung im Vergleich zu allen Residents der
American Society of Clinical Pathology.
2013 werden «Sign-out Rooms» eingerichtet, in denen alle
Fälle des Routineeingangs mit dem Oberarzt besprochen
werden. Das Ziel ist eine Entflechtung von der Weiterbildungsaufgabe
der Fachärzte von ihren anderen Aufgaben in Lehre
und Forschung, um die Weiterbildungsvoraussetzungen weiter
zu verbessern.
3 Fortbildung
Prof. Dr. med. Aurel Perren
An drei Montagen im Monat organisieren wir eine öffentliche
Fortbildung. Diese ist im Rahmen der kontinuierlichen
Ärztebildung mit einem Kredit der SGPath akkreditiert und
findet in Ergänzung zur monatlichen «DKF Research conference»
der Universität Bern im Mikroskopiehörsaal statt.
Externe nationale und internationale Gäste wechseln sich mit
Forschungsgruppenleitern unseres Institutes ab und tragen
neue Erkenntnisse aus der histopathologischen Diagnostik
und der pathologienahen Forschung vor. Im Rahmen der
breiten Interessen im Institut für Pathologie finden sowohl
grundlagenorientierte wie auch klinisch orientierte Themen
Platz. Eine aktuelle Liste der Veranstaltungen ist im Internet
einsehbar.

44 Institut für Pathologie > Lehre

Institut für Pathologie > Lehre 45
Montagsseminar 2012
Titel
ReferentIn
16.01. «Non-Alcoholic Fatty Liver Disease» Prof. Dina Tiniakos,
Pathologie, Athen
23.01. «Diagnostische und therapeutische Herausforderungen bei chronisch
entzündlichen Darmerkrankungen»
Prof. F. Seibold,
Tiefenauspital, Bern
30.01. «Playing with the fire: plasmodium liver stage parasites induce» Prof. Volker Heussler,
Zellbiologie, Bern
13.02. «Identification of candidate regulators and effectors of glioma invasion» Dr. Jean-Louis Boulay,
Biocenter, Universität Basel
20.02. «Rectal Cancer and TME from the Pathologist‘s Point of View» Prof. Ph. Quirke,
Pathologie, Leeds, UK
27.02. «Impact of pathological analysis on treatment of patients with hepatic
colorectal metastases»
Prof. L. Rubbia-Brandt,
Pathologie, Genf
12.03. «Hereditary colorectal cancer: news from a genetically unstable world» PD Dr. K. Heinimann,
Genetik, Basel
26.03. «Role of signaling proteins and membrane microdomains in T-cell
polarization and migration»
16.04. «Intestinal dendritic cell subsets in the regulation of mucosal
immune responses»
Forschungsgruppe Niggli
Prof. Wiliam Agace,
Lund, Sweden
23.04. «Cytokine-driven functions of innate lymphoid cells» Prof. D. Finke, Universität Basel
30.04. «Mutation and methylation analysis using pyrosequencing» PD Dr. I. Zlobec,
Institut für Pathologie, Bern
14.05. «Signaling molecules in breast cancer and metastasis» Mohamed Bentires-Alj, PhD,
Friedrich Miescher Institut, Basel
21.05. «Micronavigating between Science + Art» M. Oeggerli, PhD,
Institut für Pathologie Basel
17.09. «Die Tücken der monochorialen Zwillinge» PD. Dr. L. Raio,
Frauenklinik, Bern
27.09. «Knorpeltumore-Übersicht und aktuelle Konzepte» PD Dr. Jozef Zustin, Hamburg
08.10. «Coupling intercellular adhesion to the nucleus via plakoglobin (-catenin)
and Wnt signaling»
Prof. E.J. Müller, Vetsuisse
Faculty, University of Bern
22.10. «Th17 cells and the liver: hope or hype?» Dr. V. Wüthrich Banz,
Viszeralchirurgie, Inselspital
29.10. «A fatty acid-induced pathway to IL-1 receptor-mediated cardiovascular
inflammation»
Dr. St. Freigang,
ETH Zürich
12.11. «Colorectal cancer: the surgeon‘s perspective» Prof. Daniel Inderbitzin,
Viszeralchirurgie, Inselspital
19.11. «The vulnerable newborn: new insights into neonatal immunology» Prof. Adrian Hayday,
Kings‘ College London, UK
26.11. «Next-generation Tissue Microarray (ngTMA):
The Future of Biomarker Research»
PD Dr. I. Zlobec,
Institut für Pathologie, Bern
17.12. «Immunoscore in Colorectal Cancer» Prof. Jerome Galon, Paris

46 Institut für Pathologie > Im Fokus
>>> Im Fokus
Lean-Reorganisation Klinische Pathologie
Das Labor Klinische Pathologie des Instituts für Pathologie der
Universität Bern hat sich dieser Herausforderung angenommen
und 2010 begonnen, seine Arbeitsprozesse neu, gemäss
Lean-Prinzipien, zu strukturieren. Dies beinhaltet fundamentale
Änderungen und neue Herausforderungen an Personal,
Maschinen und Aufbau des Labors. Ziel war es, einen Arbeitsprozess
zu entwickeln, der eine optimale Abstimmung
von Präparaten, Mitarbeitern und Maschinen ermöglicht.
Damit sollen Biopsiepräparate in 24 Stunden und Operationspräparate
in 48 Stunden befunden werden.
Der zeitaufwändigste Prozessschritt in der Gewebeverarbeitung
ist die Entwässerung von Exzidatmaterial, welcher in der
Regel 8–14 Stunden in Anspruch nimmt. Das Labor für klinische
Pathologie hat sich daher entschieden, durch den Einsatz
neuester Technologie (SakuraXpress 120, Sysmex, Horgen) ein
Entwässerungsautomaten einzusetzen, der es ermöglicht,
Exzidate innerhalb von 2 Stunden 10 Minuten zu entwässern.
Dieses Gerät wird kontinuierlich im 30-Minuten-Takt beladen.
Dies führt dazu, dass nun ein Grossteil der Proben in
kleineren Batches stetig durch die Prozesskette geführt werden
kann. Der Workload wird bei allen beteiligten Stationen
der Wertschöpfungskette homogener über den Tag verteilt
und effizienter.
Diese Umstellung hat sich auch auf die Arbeitsprozesse der
diagnostisch tätigen Pathologinnen und Pathologen ausgewirkt:
Zuvor konzentrierte sich die Hauptlast der Fallbearbeitung
auf einen Zeitraum, in dem alle Fälle sukzessive mikroskopiert,
diktiert und nach dem Erstellen des schriftlichen
Befundes unterschrieben und freigegeben wurden. Durch
die kontinuierlichere Ausgabe kleinerer Mengen der zu
befundenden Fälle kann nun die Arbeitssequenz Mikroskopieren–Diktieren–Befunderstellung
im Sekretariat–Unterschreiben
mehrmals täglich durchlaufen werden, was eine
Abnahme der «Spitzen» der täglichen Arbeitslast nach sich
zieht und ein gleichmässiges Arbeiten bewirkt. Auch im
Befundsekretariat sind die Arbeitsabläufe nun planbarer und
gleichmässiger über den Tag verteilt. Die durchschnittlichen
Umlaufzeiten der diagnostischen Fälle konnten durch diese
Massnahmen der letzten zwei Jahre um mehr als die Hälfte
verringert werden. Für bis zu 50% der eingesandten Exzidate
und Biopsien kann noch am selben Tag eine Diagnose an den
Kliniker und den Patienten übermittelt werden.
Start des «Express» im Takt.

Situationsplan
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Impressum
Konzept
Redaktion
Layout
Fotografie
Druck
Prof. Dr. med. A. Perren, Institut für Pathologie
Mitarbeiter Institut für Pathologie
Ines Badertscher, Institut für Pathologie
Manu Friedrich, freischaffender Fotograf
Geiger AG, Bern

Universität Bern
Institut für Pathologie
Murtenstrasse 31, CH-3010 Bern
Telefon +41 31 632 32 11/12
Fax +41 31 632 49 95
www.pathology.unibe.ch