Einsatz von DICOM-SR in der Pathologie - Schoech.de
Einsatz von DICOM-SR in der Pathologie - Schoech.de
Einsatz von DICOM-SR in der Pathologie - Schoech.de
Erfolgreiche ePaper selbst erstellen
Machen Sie aus Ihren PDF Publikationen ein blätterbares Flipbook mit unserer einzigartigen Google optimierten e-Paper Software.
<strong>DICOM</strong> Structured<br />
Report<strong>in</strong>g <strong>in</strong> <strong><strong>de</strong>r</strong><br />
<strong>Pathologie</strong><br />
Vortrag auf <strong><strong>de</strong>r</strong> 53. GMDS-Jahrestagung, 16.9.2008<br />
W<strong>in</strong>fried Schöch<br />
Harald Hatje<br />
PD Dr. Josef Ingenerf<br />
schoech@<strong>in</strong>formatik.uni-luebeck.<strong>de</strong><br />
Inst. für <strong>Pathologie</strong>, UK-SH Campus Lübeck<br />
Inst. für Mediz<strong>in</strong>ische Informatik, Universität zu Lübeck
E<strong>in</strong>bettung <strong>in</strong> Forschungsprojekt<br />
1.<br />
2. <strong>DICOM</strong>-<strong>SR</strong><br />
3. Decision Support<br />
4. Bearbeitung, Freigabe<br />
W. Schöch et al., IMI und <strong>Pathologie</strong> <strong><strong>de</strong>r</strong> Universität zu Lübeck<br />
2
Standardisierte Dokumentation mit <strong>DICOM</strong>-<strong>SR</strong><br />
W. Schöch et al., IMI und <strong>Pathologie</strong> <strong><strong>de</strong>r</strong> Universität zu Lübeck<br />
3
Standardisierte Dokumentation mit <strong>DICOM</strong>-<strong>SR</strong><br />
W. Schöch et al., IMI und <strong>Pathologie</strong> <strong><strong>de</strong>r</strong> Universität zu Lübeck<br />
4
Kontr. Vokabular XML<br />
<br />
<br />
<br />
<br />
<br />
<br />
W. Schöch et al., IMI und <strong>Pathologie</strong> <strong><strong>de</strong>r</strong> Universität zu Lübeck<br />
5
Kontr. Vokabular XML<br />
W. Schöch et al., IMI und <strong>Pathologie</strong> <strong><strong>de</strong>r</strong> Universität zu Lübeck<br />
6
„Inhalts-<br />
Baum“<br />
„Inhaltselement“<br />
„Relation“<br />
W. Schöch et al., IMI und <strong>Pathologie</strong> <strong><strong>de</strong>r</strong> Universität zu Lübeck<br />
7
GENRE – Baumansicht<br />
• Re<strong>in</strong>es Java Plattformunabhängig<br />
W. Schöch et al., IMI und <strong>Pathologie</strong> <strong><strong>de</strong>r</strong> Universität zu Lübeck<br />
8
GENRE – Baumansicht <strong>de</strong>utsch<br />
• Erstellen, Löschen, Verschieben <strong>von</strong> Knoten<br />
• „In-Place“-Bearbeitung<br />
W. Schöch et al., IMI und <strong>Pathologie</strong> <strong><strong>de</strong>r</strong> Universität zu Lübeck<br />
9
E<strong>in</strong>gabehilfen<br />
Datum<br />
Gleitkommazahl<br />
Personenname<br />
W. Schöch et al., IMI und <strong>Pathologie</strong> <strong><strong>de</strong>r</strong> Universität zu Lübeck<br />
10
Editor für <strong>DICOM</strong>-Metadaten<br />
W. Schöch et al., IMI und <strong>Pathologie</strong> <strong><strong>de</strong>r</strong> Universität zu Lübeck<br />
11
HTML-<br />
Export<br />
W. Schöch et al., IMI und <strong>Pathologie</strong> <strong><strong>de</strong>r</strong> Universität zu Lübeck<br />
12
Grammatikgeführter E<strong>in</strong>gabeassistent<br />
W. Schöch et al., IMI und <strong>Pathologie</strong> <strong><strong>de</strong>r</strong> Universität zu Lübeck<br />
13
Diskussion und Ausblick<br />
• Standardisierung<br />
„Virtual Sli<strong>de</strong>s“ im <strong>DICOM</strong>-Format<br />
Übersetzung+Erweiterung <strong>DICOM</strong>-Vokabular<br />
Transformation nach HL7-CDA<br />
• GENRE<br />
Standard-Konformität schwierig<br />
ermögl. telemed. Anwendungen<br />
Mehr E<strong>in</strong>gabehilfen, Export nach Word/PDF<br />
• Anwendung<br />
Erstellung weiterer E<strong>in</strong>gabegrammatiken<br />
Spracherkennung<br />
W. Schöch et al., IMI und <strong>Pathologie</strong> <strong><strong>de</strong>r</strong> Universität zu Lübeck<br />
14
Vielen Dank für die Aufmerksamkeit!<br />
Weitere Informationen unter<br />
http://www.schoech.<strong>de</strong>/diploma/<br />
W. Schöch et al., IMI und <strong>Pathologie</strong> <strong><strong>de</strong>r</strong> Universität zu Lübeck<br />
15
Zusammenfassung<br />
• Kontrolliertes Vokabular XML<br />
• Erweiterung e<strong>in</strong>es <strong>DICOM</strong>-Toolkits<br />
• GENRE-Editor für Inhaltsbäume<br />
Plattformunabhängig, benutzerfreundlich<br />
Erzeugung <strong>von</strong> Testdaten, Lehre<br />
• E<strong>in</strong>gabeassistent für Rout<strong>in</strong>ee<strong>in</strong>satz<br />
flexibler Ansatz, leicht erweiterbar<br />
W. Schöch et al., IMI und <strong>Pathologie</strong> <strong><strong>de</strong>r</strong> Universität zu Lübeck<br />
16
Typen für<br />
Inhaltselemente<br />
• CONTAINER<br />
• TEXT<br />
• DATE/TIME/DATETIME<br />
• PNAME<br />
• CODE<br />
• NUM<br />
• IMAGE<br />
• SCOORD<br />
• …<br />
Relationen<br />
• CONTAINS<br />
• HAS CONCEPT MOD<br />
• HAS PROPERTIES<br />
• INFERRED FROM<br />
• SELECTED FROM<br />
• HAS OBS CONTEXT<br />
• HAS ACQ CONTEXT<br />
W. Schöch et al., IMI und <strong>Pathologie</strong> <strong><strong>de</strong>r</strong> Universität zu Lübeck<br />
17
Modultabelle <strong>DICOM</strong>-<strong>SR</strong><br />
W. Schöch et al., IMI und <strong>Pathologie</strong> <strong><strong>de</strong>r</strong> Universität zu Lübeck<br />
18
<strong>DICOM</strong>scope<br />
W. Schöch et al., IMI und <strong>Pathologie</strong> <strong><strong>de</strong>r</strong> Universität zu Lübeck<br />
19
<strong>DICOM</strong>scope<br />
W. Schöch et al., IMI und <strong>Pathologie</strong> <strong><strong>de</strong>r</strong> Universität zu Lübeck<br />
20
Vorteile <strong>DICOM</strong>-<strong>SR</strong><br />
• Nutzung bestehen<strong><strong>de</strong>r</strong> <strong>DICOM</strong>-Infrastruktur<br />
(PACS, Signatur,…)<br />
• Standard kostenlos erhältlich und<br />
e<strong>in</strong>setzbar<br />
W. Schöch et al., IMI und <strong>Pathologie</strong> <strong><strong>de</strong>r</strong> Universität zu Lübeck<br />
21
E<strong>in</strong>fache Attribut-Wert-Paare<br />
• (0x0008,0x0016) SOPClassUID VR= <br />
(0x0008,0x0018) SOPInstanceUID VR= <br />
• (0x0010,0x0010) PatientName VR= <br />
(0x0010,0x0030) PatientBirthDate VR= <br />
(0x0010,0x0040) PatientSex VR= <br />
Patient<br />
• (0x0020,0x000d) StudyInstanceUID VR= <br />
(0x0020,0x000e) SeriesInstanceUID VR= <br />
Study<br />
• (0x0020,0x0011) SeriesNumber VR= VL= <br />
(0x0020,0x0013) InstanceNumber VR= VL= <br />
Series<br />
• (0x0040,0xa491) CompletionFlag VR= VL= <br />
(0x0040,0xa493) VerificationFlag VR= VL= <br />
W. Schöch et al., IMI und <strong>Pathologie</strong> <strong><strong>de</strong>r</strong> Universität zu Lübeck<br />
22
Aufbau <strong>von</strong><br />
<strong>DICOM</strong>-Objekten<br />
W. Schöch et al., IMI und <strong>Pathologie</strong> <strong><strong>de</strong>r</strong> Universität zu Lübeck<br />
23
Inhaltselemente<br />
Name<br />
•Ko<strong>de</strong>wert<br />
•Kodierungsschemabezeichner<br />
•Ko<strong>de</strong>be<strong>de</strong>utung<br />
Wert<br />
z.B.:<br />
• (M-02550, <strong>SR</strong>T, „Diameter“) = 1.5 cm<br />
• (121071, DCM, „F<strong>in</strong>d<strong>in</strong>g“) =<br />
(D3-29021, <strong>SR</strong>T, „Aortic Stenosis“)<br />
W. Schöch et al., IMI und <strong>Pathologie</strong> <strong><strong>de</strong>r</strong> Universität zu Lübeck<br />
24
<strong>DICOM</strong>-Dienste<br />
• Versand <strong>von</strong> Objekten<br />
• Suche nach Objekten<br />
• Drucken<br />
• Langzeitarchivierung<br />
• Digitale Signatur<br />
• …<br />
W. Schöch et al., IMI und <strong>Pathologie</strong> <strong><strong>de</strong>r</strong> Universität zu Lübeck<br />
25
<strong>E<strong>in</strong>satz</strong> <strong>von</strong> <strong>DICOM</strong><br />
Nach W. Eichelberg Schöch et M. al., IMI und <strong>Pathologie</strong> <strong><strong>de</strong>r</strong> Universität zu Lübeck<br />
26
<strong>DICOM</strong>-<strong>SR</strong><br />
W. Schöch et al., IMI und <strong>Pathologie</strong> <strong><strong>de</strong>r</strong> Universität zu Lübeck<br />
27
Abstraktionsebenen für die<br />
Erzeugung <strong>von</strong> <strong>DICOM</strong>-<strong>SR</strong><br />
W. Schöch et al., IMI und <strong>Pathologie</strong> <strong><strong>de</strong>r</strong> Universität zu Lübeck<br />
28
W. Schöch et al., IMI und <strong>Pathologie</strong> <strong><strong>de</strong>r</strong> Universität zu Lübeck<br />
29
<strong>DICOM</strong>-Toolkits<br />
PixelMed Java <strong>DICOM</strong> Toolkit:<br />
• Parsen und Anzeige <strong>von</strong> <strong>DICOM</strong>-<strong>SR</strong> <br />
Neu:<br />
• Konstruktoren für Inhaltselemente<br />
• Set-Metho<strong>de</strong>n<br />
• …<br />
W. Schöch et al., IMI und <strong>Pathologie</strong> <strong><strong>de</strong>r</strong> Universität zu Lübeck<br />
30
Intuitive Baumansicht<br />
• Mehrzeilige Darstellung <strong>von</strong> Knoten<br />
• Löschen & Verschieben möglich<br />
• Englische & <strong>de</strong>utsche GUI<br />
W. Schöch et al., IMI und <strong>Pathologie</strong> <strong><strong>de</strong>r</strong> Universität zu Lübeck<br />
31
Untersuchung<br />
e<strong>in</strong>es<br />
Beckenkamm-<br />
Trepanats<br />
bei Verdacht auf<br />
Plasmozytom<br />
W. Schöch et al., IMI und <strong>Pathologie</strong> <strong><strong>de</strong>r</strong> Universität zu Lübeck<br />
32
Change language