Marcadores moleculares asociados a la calidad de la canal y ... - Inia

Marcadores moleculares
asociados a la calidad de la
canal y la carne
Lic. Eileen Armstrong, MSc. PhD.
Área Genética
Facultad de Veterinaria

ADN
molécula que contiene la información genética
En TODAS las células del individuo
(cromosomas).
No cambia a lo largo de la vida del animal.
Contiene los GENES.
Gen: porción del ADN con la información necesaria para
generar una determinada proteína.
Genoma: conjunto de ADN (con todos los genes) de una
especie.

• Polimorfismo de un solo
nucleótido.
SNP
• Cambia una base del ADN.
• Genera variantes para un
mismo gen.
• Pueden estar dentro de genes
o en otras regiones del ADN.
• Marcador genético.

• Se conocen ya varios genes y SNPs relacionados al
desarrollo y metabolismo del músculo y tejidos
asociados (adiposo, conectivo).
• Especialmente en bovinos, suinos y aves, pero también
en ovinos.
• Línea de investigación en Área Genética de la Facultad
de Veterinaria: genética molecular de la calidad de la
carne bovina y ovina.
• Objetivos:
– contribuir a detectar esos genes y SNPs.
– analizar cómo interactúan y cómo se asocian a
características productivas.
– posibilitar la selección de animales que tengan las
mejores variantes genéticas.

Para eso se necesitan:
• muestras de
ADN de los
animales
Mediante análisis
estadísticos se
detectan
asociaciones
• datos
productivos
(peso vivo, área
del ojo del bife,
peso de canal,
% de grasa,
terneza, etc…)

Proyecto “Asociación de SNPs de genes candidatos con
caracteres de calidad de la carne y la canal en ovinos”
• Análisis de 30
SNPs en genes
específicos
(análisis primario)
Mediante análisis
estadísticos se
detectan
asociaciones
Proyecto en ejecución. Financiación: ANII
• Datos tomados
de la Prueba de
Progenie y
Evaluación
Genética
Poblacional de
Texel, así como
de otras
poblaciones
ovinas.

Animales:
Raza TEXEL:
• 494 corderos
(generaciones 2008, 2009 y 2010)
• 42 carneros
• 282 madres
Otras razas y cruzas de razas carniceras:
• 546 corderos de EEMAC

Características medidas en los corderos:
Pre faena:
• -ganancia diaria de peso
• -pesos a diferentes edades y peso final vivo
• -estado corporal
• -área del ojo del bife y espesor de grasa por ultrasonido
Post mortem:
• -conformación de carcasa, medidas y compacidad
• -peso de la canal caliente y fría
• -dimensiones del L. dorsi y área del ojo de bife medidos en el rack
• -espesor de grasa subcutánea
• -peso cortes con hueso
• -terneza instrumental
• -panel de degustación (terneza, sabor, aceptabilidad)
• -pH
• -color de la carne y la grasa
• -cantidad de grasa intramuscular
Base de datos muy valiosa para la investigación!

BANCO DE ADN
• Extracción de ADN genómico de sangre y
músculo.
• Banco: en el Área Genética de F.Vet y en INIA
• 1322 muestras de ADN (en procesamiento)
• Además: muestras de carne congelada y en
alcohol (respaldos).
• Cada muestra perfectamente identificada con el
ID del animal y sus datos.

Genes a analizar en esta etapa
• CAPN1 (calpaína; proteólisis de fibras musculares, terneza)
• LEPTINA (hormona del apetito; engorde)
• GH y GHR (hormona de crecimiento y receptor; desarrollo corporal)
• CAST (calpastatina; proteólisis de fibras musculares, terneza)
• FABP9 (fatty acid binding protein 9; metabolismo lipídico y engorde)
• FABP4 (fatty acid binding protein 4; metabolismo lipídico y engorde)
• IGF1 (insulin growth factor 1; desarrollo corporal y engorde)
• GDF8 (growth differentiation factor 8; miostatina, desarrollo muscular)
• (entre otros)
• Selección de SNPs en estos genes, basándonos en datos
de la secuenciación del genoma ovino.

Base de datos Genoma Ovino
• Genoma de referencia: Texel

Ya contamos con:
• Fenotipos (mediciones en los animales)
• Muestras de ADN de 814 animales
(banco, el cual sigue aumentando)
Próximamente: genotipado de SNPs en los
genes mencionados en el total de
muestras del banco y análisis estadísticos
de asociación genotipo-fenotipo.

Resultados esperados:
• Detección de genes asociados a calidad de la
carne y la canal ovina.
• Validación de marcadores (genes) presentes en
kits comerciales.
• Posibilidad de implementar Selección Asistida
por Marcadores para aumentar progreso
genético.

Proyecciones
• Genotipado masivo del genoma (mismos animales del
banco de ADN, con datos fenotípicos).
• Chip 700k (aprox. 700.000 SNPs; en construcción)
• Estudio global de genes asociados a calidad de la carne.
• Generar información útil para posible selección
genómica?
Objetivos finales:
• Mejorar calidad de la canal y la carne ovina.
• Aumentar valor agregado del producto y de los
reproductores.

“Asociación de SNPs de genes candidatos con caracteres de
calidad de la carne y la canal en ovinos”
Facultad de Veterinaria
INIA
SUL
Facultad de Agronomía
Scottish Agricultural College
Sociedad de Criadores de Texel del Uruguay
Financiación: Fondo InnovAgro - Agencia Nacional de
Investigación e Innovación (ANII), INIA.
Duración: febrero 2011 a febrero 2013.

gracias!!!